5KCJB

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with gne6901
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
283
structure length
280
Chain Sequence
TRLKIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Positive Allosteric Modulators of GluN2A-Containing NMDARs with Distinct Modes of Action and Impacts on Circuit Function.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
total genus 82
structure length 280
sequence length 283
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-06-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5kcjB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5kcjB02
3IO6A 4BDLA 3PPPA 4R2BA 1OQGA 5FHNA 4YKKA 3DP8A 3MVWA 4LVQA 2I3VA 3DM0A 3ZSFA 4GXAA 2I4BA 1TT1A 1LBBA 2ABHA 1MY1A 5H8SA 3C32A 2Q8JA 2AYSA 1R9QA 4YAHX 1LAFE 4HCWA 4OXVA 1SI1A 1FQEA 3UK4A 1ZTYA 2Y7KA 4OEUA 2UXAA 1ZU0A 4JXIA 2OBGA 3VFJA 4DCYA 1B7ZA 3MVXA 1NH8A 3O6IA 4RY1A 2O7UA 1NMUA 5CI5A 2XD2A 2ZYNA 3N6UA 1B1XA 1FTOA 3IK6B 5EHSA 1Q1KA 2RCAA 2QS4A 3QXMA 4KD5A 5TPAA 3CFLA 3H03A 4THIA 2HAVA 1FQCA 4NF5B 3W15C 4DXUA 5KZTA 2Z22A 1SW2A 4Q8RA 4F1VA 3RLFE 1S7YA 1JW1A 3G3JA 1AIVA 3PMWA 1UIUA 4IY6A 4MFIA 1P99A 2GHAA 3TKDA 4G4PA 1B40A 4GD5A 4LQ5A 5ICTA 3L6HA 3DELB 3KEIA 3TQLA 3T96B 1OLCA 3TTRA 3V89B 3G3FA 4JB7A 3HPIA 4Z7EA 5I59B 3H06B 4F29A 1OLAA 3K6XA 1Y1ZA 5FHOA 4QSEA 4NF8A 5H8NB 4YKPA 2Y7RA 2QS3A 2NOOA 2DYXA 5CC2A 3TCFA 1MY2A 1B3GA 1TXFA 1P1UA 5M2VA 2VP1A 1I69A 1ELJA 3TTKA 5L9MA 3C34A 3FJGA 4OESA 2YLNA 4OFJA 4R9FA 3S9MC 2RINA 3TDJA 2Y7WA 5I57B 4IO4A 4P11A 3FASA 1URGA 4R9GA 3FXRA 2ALUA 1PB9A 4RJZA 3SEVA 1D9YA 1DMBA 4F3PA 1JW5A 2PT1A 4M4GA 1GTKA 4R74A 4ZEBA 3FJ7A 1WDNA 4AB5A 5BWJA 3HV1A 1MM6A 4JWYA 3TTNA 4YICA 4ZEKA 1LCFA 1A8FA 2Z8FA 4O3AA 1P1QA 4QFPA 4KCCA 2G93A 1BTJA 3VLUA 3MVZA 3GXAA 4LATA 1RYOA 1M5FA 4C1TA 3H6UA 1R6ZA 5H8FA 2I3WA 3USDA 1H76A 3HN0A 5HBCA 3VV5A 1HSEA 3KJTA 5I2NA 1P1NA 2F5XA 1MH3A 1ATGA 4TOZA 3FVOA 3HHGA 4WKMA 4IO2A 1LSTA 5HM4B 4U1ZA 3KN7A 1MG1A 1VFEA 2AL5A 1B2HA 1XOCA 3RGYA 3LC8A 4LZ7A 3LSXA 1H43A 1M5CA 4H8IA 2GRVA 2XXTA 4BDNA 4GQOA 4OQOA 4JSOA 2R71A 1GVCA 4NWCA 2DE2A 4O3BA 5HPQA 1ZLQA 1FTMA 1BLFA 4GFRA 1NNFA 3V8XB 5L9OA 3CR9A 3SETA 3GLBA 4F22A 1MXYA 3B6QA 3O6GA 4WEDA 1SW1A 4DDDA 1MXXA 4G68B 3PPRA 2XX7A 3Q26A 5AA4A 2F6PA 4OMBA 1VR5A 3K6WA 1B5JA 2F7BA 2H25A 4ZEDA 4GXSB 4X1BA 1QUJA 2I48A 3LBSA 4XXUA 1LFGA 1Y1MA 2I49A 1MY4A 4G8MA 1MS7A 4KFQA 4X1DA 1N7WA 3HHFA 3CG3A 4OYVA 1MDP1 5DT6A 1B58A 4F19A 3MPKA 4MLVA 2V3QA 1Y3NA 3C4MA 4IGTA 3LSFB 5IKBA 3EHTA 4UA8A 3QYTA 4NWDA 4R6KA 2DXYA 2X7QA 1XT8A 4EQ9A 4LQ2A 4U23A 1XC1A 1IXHA 5FHMA 2NWJA 1FTJA 4Q0CA 2VOZA 1FQFA 3TQWA 3HCQA 1OQHA 2F78A 2I0CA 2FNCA 3LUYA 5IAIA 4OFOA 3SERA 2O68A 3CIJA 4WEPA 2UVGA 1NNKA 1IEJA 3OENA 3RY3A 3A09A 4IO5A 5FTHA 1M5BA 1MPBA 3EF7A 2I4CA 4JSDA 4ELOA 5DEXB 1P1WA 3UIFA 3TPAA 1IITA 4ZZEA 1QKBA 3MJNA 2B65A 2OCUA 1FTLA 1QULA 1QUKA 1UTBB 2PT2A 1MQIA 1MQGA 4O3CA 1OMPA 2PYYA 2OWTA 1EU8A 4H65A 1SW4A 2QMWA 4ELRA 1FTKA 2QS2A 5DTBA 3FXQA 3N5LA 2XXPA 4GL8A 4YKIA 1OVTA 4TQUQ 1Y3PA 2P2AA 2OJTA 1TWYA 5H8QB 4FEDA 4ZZAA 3RPWA 3CFZA 3B7DA 3FV1A 5JTYA 3OO9A 4EXKA 1B1HA 1MXWA 5H8HB 3O2AA 4JWOA 4ZE8A 3TTMA 1ANFA 4P0GA 4P0IA 5CMKA 1FQBA 2XX9A 1B32A 1IXGA 3TYHA 4RPNA 1Y20A 2X26A 3BBRA 3M3KA 3U72A 3SEUA 1LB8A 1B3LA 2XHDA 3FIRA 4F3SA 3KOTA 3TFLA 2PVUA 3IAZA 3CRBA 2I0BA 4OVJA 2DQVA 5JK4A 3PGFA 1A55A 3Q28A 4GRKA 3KG2A 4NF6B 4QF9A 3ODBA 3S4UA 3MW0A 4G77A 1NNTA 3FXUA 5I56B 4YB7A 2CMOA 4E0WA 4OTEA 4KHZE 1LAXA 5L9SA 3FVGA 1II5A 2F34A 3RTFB 5DVFA 2ONKE 2ZYOA 3K6UA 5J1DA 3C9HA 1I6QA 2XXQA 3LSWA 4ZECA 1JQFA 3CG1A 3PUWE 4U1OA 3MZ9A 3KJ7A 1DTGA 4RNSA 1JETA 5ISUA 1F9BA 2VHAA 2I58A 3EN3A 3O66A 1MQHA 4GVOA 4HCYA 4LA9A 1URSA 5CMCA 2DS9A 4YMBA 1CE2A 3W9VA 1NNPA 3U93A 4MLQA 4DZ1A 3CVGA 3P7IA 4MH5A 3RN8A 2X7PA 1US4A 3ILTB 4K3FA 3O9PA 1EZ9A 4LZ5A 4QSDA 4U2RA 3PUZE 1HSJA 1I6AA 1MXUA 1QKAA 5AA2A 1I6BA 1N7XA 4FIMA 2UVIA 1MQJA 4I9DA 2NUVA 4PFYA 3D4GA 2QPQA 3KN8A 5TU0A 3FJMA 4QFKA 1O64A 2O51A 4KPTA 4L17A 3OEMA 2V93A 3T9XB 3DLNA 5H8FB 2Y84A 5CRYA 1VSOA 4ZEIA 4FATA 3K00A 1DTZA 4ESWA 4X9TA 2UVJA 3ECRA 3MP8A 3FVNA 5KDTB 4I8CA 4R72A 3KN3A 1SVXB 2F36A 3IOWA 3ZKKA 5AE4A 3C35A 1AMFA 2QL3A 3TCHA 3PD9A 3K4UA 2PMSA 2P0SA 4POWA 3H6VA 1SD3A 1AH5A 2DE4A 2QRYA 4C1UA 3K6VA 1H45A 4PFWA 4XTCQ 4NF4B 4YKJA 1JEUA 2LAOA 1A8EA 4H67A 1B3FA 2ZNUA 4ONYA 4BDOA 3QIMA 1LGBC 1B4HA 1MM7A 4E0XA 1JVYA 3TUSA 3FD3A 1PB7A 3JYRA 2QSXA 3MWBA 3KGCA 3SEXA 3KSXA 1H3DA 5ITOA 3PMVA 3S9LC 3SEWA 4H1XA 3S9EA 3H7MA 3UORA 2O1LA 5AA4B 1US5A 1MDQA 5I59A 3PV0E 1SW5A 4JBZA 1M5DA 3GZGA 2QMXA 2YPNA 1B05A 5H8NA 4NEDA 2UYFA 4FAJA 4OWDA 4YB5A 3C31A 1MY0A 1XVYA 2H5YA 3OSQA 1B4ZA 5I57A 5CMBA 1S50A 1LFHA 1LFIA 1XHYA 2DWAA 2KLFA 3IL1B 2DXRA 1RYXA 4EF1A 2IEEA 3DP6A 4RXLA 3JZJA 1MRPA 2PBWA 4R2FA 4U4SA 3C36A 2VD3A 3I3VA 3VXBA 2Z23A 2O7IA 1PBPA 3PUXE 3EHUA 4UACA 4N13A 2HCAA 2OLBA 4Q30B 4ISUA 2QJEA 1LBCA 3H4ZA 3TAJA 1M5EA 4H8JA 4Q5TA 3MZ1A 5BUUA 4MF3A 5TP9B 4IY5A 4EQBA 1QVSA 3PMXA 4PQJA 3N26A 4FORA 3K0VA 2XXYA 4F2OA 2RCBA 1USYE 1QW0A 4I1DA 4EQ7A 4QFLA 2I6EA 2Q88A 3MUQA 5K2YA 1IUDA 5I58A 3MBPA 2Q2CA 5L8DA 2YJPA 2D21A 4KCDA 1ZMGA 1DPEA 2HEUA 1EZPA 2BJJX 3ZS6A 2F7AA 4KR5A 2REJA 2OWSA 3AXFA 3O28A 1OIBA 2VD2A 3IB2A 1UTHB 4LP2B 1MPCA 4XKQA 3M3LA 1N0TA 2PX1A 1EZOA 3OEKA 3T9VA 2NXOA 4ND9A 5A5XB 1B0HA 1AL3A 1N84A 2XD3A 3KFMA 4ZE9A 4ELPA 3TCGA 1Q35A 1D9VA 1QJMA 1SYIA 2O6AA 4RK2A 1B5HA 1DPPA 4PETA 4GIZA 2Z8DA 1RKMA 1Z7NE 2GH9A 3DP4A 1P1OA 1XS5A 1SYHA 4AQ4A 3TMGA 2DOJA 2ZNTA 3N94A 4YU0A 2Y7PA 3EPEA 4RA1A 5AA3A 4DIGA 3MP6A 3PUVE 3E4RA 4RYAA 4LZ8A 4YZZA 3RT6B 1MQDA 4BDQA 3PPOA 1B46A 1GGGA 4DXCA 2P1SA 3OXNA 5KCJA 2A5TB 1UIVA 5ELVA 2XXHA 3LR1A 4NE4A 2M8CA 4N6PA 2B3BA 2XXVA 3D4CA 1S9TA 2D5WA 3O97A 4ZDMA 1FCKA 1PDAA 4KI0E 2XXXA 4M1VA 3TODA 2H9BA 4FJPA 3M3FA 3JV9A 2HZKA 4MBPA 1B6HA 3S9NC 2H4IA 1IXIA 3G7WA 3HO7A 5ICQA 4F39A 3E13X 2XXIA 3OD7A 2Q89A 1PB8A 5F7VA 3IOTA 2DWHA 1N3WA 3O6HA 1VE4A 5JEIA 4GL0A 1LB9A 3U94A 4R6HA 1D4NA 3MPLA 3T66A 4U4XA 3OO7A 4EXLA 1OVBA 4IO7A 4F1YA 1FQAA 1WVJA 4DLDA 4PFTA 4RK9A 3Q25A 5I2KA 3HSTA 2FYIA 5TPAB 2V25A 4QSCA 5DEXA 5F1QA 2E1SA 4WXJA 1SBPA 1B9JA 4DCXA 4ESXA 3G3KA 4IO3A 2Q9TA 3RNNA 4C0RA 4H5GA 4FEBA 3KSJA 2UVHA 1B51A 1MY3A 2HFBA 3Q29A 1JVXA 3MC2A 3UGWA 2ZMBA 2XXRA 4U21A 1T0KA 1IQ7A 4LUBA 1POY1 1URDA 4XKPA 1B52A 4NF8B 2V3UA 1SQYA 4R73A 5H8QA 3FUZA 4G2ZA 2RC9A 3M8UA 4XKRA 4G8HA 4QFOA 4F31B 4PE5B 4PFUA 2FA7A 3IX1A 3KZGA 5H8HA 1BKAA 2DE3A 3IOVA 1Z7ME 2ESNA 5K2XA 2HXWA 3WAFA 1N04A 3A3UA 3UA8A 2HAUA 5CM6A 4EUOA 3I5OA 2O84X 1TFAA 1A99A 1R1NA 3K2DA 3OO6A 2DSFA 3FV2A 1SDXA 1NFTA 2ANJA 4FE8A 3KBRA 5EYFA 3VLWA 4IO6A 2F8DA 4H6DA 5B7DA 5B70A 3WAEA 1A40A 3BKIB 3RTWB 3UN6A 4YB6A 4NF6A 2DWJA 2NVUB 3RT8A 2W7YA 1JEVA 4OHNA 3TZAA 1IZ1A 2DWIA 3S2VA 5I56A 3QUJA 4XKNA 3T93B 3OO8A 4F2QA 5I2NB 3G3GA 1YAEA 3TELA 4KYSA 2A5SA 3KOSA 3C33A 3T9HB 1ZIUA 4ELQA 1HSLA 3BFTA 1IIWA 3OELA 4NMYA 1FW0A 1Y9UA 1O63A 4XIGQ 2IA4A 1PC3A 3G3HA 3EHSA 2XXUA 4OZ9A 1MH4A 3PUYE 4OFLA 2DP8A 1Y4CA 2ZXTA 1JNFA 2HZLA 3SKPA 1R9LA 2RC7A 3H6WA 2F97A 1Y4TA 4NF5A 3PPQA 3ILUB 2V84A 5FTIA 1MXZA 2F6GA 1JW4A 4YMAA 4JDFA 4I62A 4GLIA 4F3BA 3A3CA 4HW8A 3MP1A 2V3TA 4H5FA 3IR1A 4F18A 2B3FA 3OMBA 1LCTA 1IXCA 3CFXA 1L5TA 3ZKLA 3H3GA 1QUIA 3BFUA 5LOMA 3K1MA 2CZLA 3TTLA 3VVEA 1B7HA 4IB2A 1DOTA 3E9XA 1D3KA 4HTGA 1ZKBA 2ZNSA 4HS7A 3MVYA 5I58B 4F3GA 3B6WA 4KYEA 4NTLA 5ITPA 4POXA 4FECA 5KDTA 2E0SA 3K02A 4EDPA 5CMMA 1ZJLA 3F11A 3SEYA 3THIA 1Y3QA 1KWHA 3FGSA 4GF8A 2GHBA 2ZYMA 4TLMB 3GBAA 2G29A 2AIXA 3MQ9A 4NF4A 3QK6A 1A7LA 4ZEFA 4U22A 1LAGE 4G8NA 2VGQA 1H44A 3W9WA 3GBBA 2RF1A 3RUMA 1AOVA 1POTA 1B7UA 1GV8A 1B3HA 2REGA 4TLLB 5AA2D 3PPNA 3Q27A 5EHMA 3R6UA 4R75A 4AB6A 5CBSA 2XXWA 3VLVA 5KCJB 1YPNA 4KQPA 3QSLA 1LLSA 2Y7IA 3RQTA 1YTVA 3FVKA 1GR2A 2QS1A 4IGRA 4LONB 4GOTA 1NKXA 1B3EA 3VDFA 3IB0A 3N6TA 4ECFA 3K01A 3PD8A 2Z8EA 2HQ0A 3G3IA 2DVCA 1MPDA 2H98A 3LSLA 3E3KA 3I6VA 3L6GA 1DSNA 3EQ1A 1J1NA 1VFDA 5AA1A 4RPOA 4F1UA 5JTYB 3R26A 2R6GE 3IJOB 4JWXA 3U1OA 3T9UA 3OOAA 5TP9A 1B5IA 4G68A 3K1NA 3IOUA 2D3IA 3IJXB 4OEVA 2ONSA 2AL4A 3CI8A 4R6YA 5I2KB 4BLAA 1N76A 3H6TA 2DVZA 1WODA 1FQDA 4OENA 1B0LA 2ONRA 4OERA 1BP5A 2F7CA 4H0WA 3QUFA 4G68C 4PP0A 2H99A 1USYH 3OSRA 4BDRA 3CSGA 1MXVA 2O69A 3U92A 4EF2A 3SDFA 4GWOA 4X48A 1UTHA 3VXCA 1YCJA 4ZS9A 3FATA 2F35A 2R9JA 5A5XA 5DVJA 4OETA 4Z0IA 2ZYKA 3K1PA 2OZZA 1LAHE 3CSBA 3SESA 5I84A 4DXBA 1PEBA 3ONMA 5CBRA 3U8QA 4N07A 3QAXA 2RKMA 2UYEA 2O1MA 1CB6A 1N3XA 3TEPA 3MZBA 1EH3A 5DYHA 2XX8A 3MAMA 3VE1B 3FZVA 1TFDA 3IORA 3PU5A 1BIYA 2THIA 4QFNA 2Q2AA 4DE8A 1PBQA 3V5AA 4KYDA 1NH7A 1XVXA 3IB1A 2GFEA 3T22A 2A5TA 3B6TA 3V83A 4BDMA 3R7XA 4QHQA 1SI0A 1A54A 1UQWA 2WKYA 3VVDA 4QRZA 1NL5A 3UP9A 2RC8A 1ZBMA 2OK2A 1O7TA 5DVIA 1UTBA 3VVFA 5AA2B 3IO4A 3O29A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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