5KCJB

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with gne6901
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
283
structure length
280
Chain Sequence
TRLKIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
publication title Positive Allosteric Modulators of GluN2A-Containing NMDARs with Distinct Modes of Action and Impacts on Circuit Function.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 82
structure length 280
sequence length 283
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-06-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5kcjB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5kcjB02
2I49A 4ZS9A 2XX9A 2CMOA 3EQ1A 4QF9A 1QVSA 2I4CA 2ONRA 1DSNA 2PYYA 4X9TA 4G8NA 4C1UA 5KDTB 3R7XA 3S9NC 3D4GA 1T0KA 4LUBA 2V25A 2REJA 3LBSA 3IO4A 1LCTA 4RNSA 4TQUQ 3KOSA 4Q0CA 1M5BA 1CE2A 1N3WA 2PVUA 4ZZEA 1ANFA 2AYSA 4ZEBA 1SD3A 1OQGA 2XXHA 2XXVA 3Q28A 4FEDA 4I62A 4FORA 5I59A 2RCAA 4LZ8A 3MUQA 3OEKA 2HZLA 1MDQA 2PT2A 3KEIA 3MZ9A 3MVZA 3U1OA 1FTKA 2XHDA 1DPPA 2P2AA 1I69A 5TPAA 3KJ7A 2NWJA 5BWJA 3DP4A 1R1NA 4POWA 5H8HA 3WAEA 1IQ7A 4GIZA 1SDXA 4KPTA 1B2HA 2DWJA 2Q2AA 2AL5A 4L17A 2XXPA 3THIA 2VHAA 3MBPA 1YPNA 3RNNA 3H3GA 5AA2A 2V3UA 2UVHA 3CVGA 3B6WA 4NF5B 1JNFA 3K6WA 4QSDA 3IL1B 1NNKA 2H99A 1MY4A 5K2XA 4RY1A 3VLVA 1JVXA 3K01A 1JEVA 2ESNA 5DTBA 1DMBA 3VE1B 4P0IA 1HSJA 3G3KA 4R75A 2DWIA 1AIVA 2O84X 4NWDA 3IK6B 5CMMA 2XX8A 4FAJA 3FIRA 4NF4B 3DLNA 4THIA 3QXMA 3IX1A 4ELRA 1USYE 4ESWA 1PBQA 2VD3A 1UTBA 4GFRA 3H6WA 1Y3NA 4F19A 3PPPA 4U23A 1BIYA 4OXVA 5DYHA 3FVOA 3V89B 1H45A 1OVBA 3KG2A 1B0HA 4BDOA 1NKXA 3O29A 3SEVA 4YMAA 3DP8A 3TQWA 3QSLA 1MH3A 3EN3A 2G29A 1B1HA 3M3FA 1UTHB 2DOJA 1LCFA 3C9HA 1URDA 5I57A 4MH5A 1LAFE 3PUYE 3E13X 4R9FA 4OYVA 2B3FA 1Y1ZA 3Q25A 4YB5A 5TP9B 3ZSFA 3LUYA 4ND9A 1N04A 3FUZA 1Y4CA 3ZKKA 4DIGA 3W9VA 2X7PA 3VLUA 2XXRA 3DM0A 4RJZA 4QFLA 2DXYA 2ANJA 3IB1A 4XXUA 3KSXA 5H8QB 3MVWA 4DCXA 5H8NB 1SVXB 3AXFA 3OO8A 3MPLA 1MXUA 2XXXA 3O97A 4FECA 2ZNSA 1CB6A 2GH9A 3RUMA 2O7IA 5AA2D 3A09A 2F5XA 3SEWA 4EUOA 1FTMA 3T66A 1FTOA 2REGA 2Z8FA 1Q1KA 2OZZA 4IGTA 3DELB 1EZ9A 1IZ1A 4JSDA 3N26A 4ZZAA 4OERA 4ISUA 5CRYA 4PFUA 1Y9UA 2OJTA 4KYSA 1SYIA 1P1QA 3PUVE 4PFWA 4F39A 1I6QA 4OEVA 3PMWA 4IO6A 2O7UA 4IGRA 1FQDA 3RT8A 3SDFA 2Q8JA 5F7VA 3UK4A 4GWOA 1HSLA 1B3GA 1B9JA 4BLAA 3CI8A 3KJTA 2AL4A 4H5FA 2ABHA 1M5EA 2HFBA 3VFJA 2QMXA 5FTHA 5A5XA 5I59B 4IB2A 3HN0A 2X7QA 4R73A 2FNCA 1NMUA 1MG1A 3C4MA 5H8SA 3TYHA 3CSBA 2Y7PA 3K0VA 1MPDA 1NNFA 3S9MC 1XOCA 2H9BA 3PMXA 2QS2A 4KFQA 2Z22A 3TTKA 2BJJX 4DE8A 3K6XA 3CSGA 5H8HB 4AB6A 4LATA 3TTLA 3FVKA 2DE4A 2RINA 2O1LA 3FZVA 4P11A 1MPCA 2I3VA 4JB7A 1B7UA 3O9PA 5I2KA 4H65A 4MLVA 3IO6A 4DDDA 4JXIA 4KYDA 4H8JA 3V5AA 4I9DA 5FHNA 4ZE9A 1NFTA 1FW0A 3KOTA 1B40A 1MS7A 2H25A 4LONB 1SI0A 1ELJA 3PMVA 2DSFA 3IOVA 1LSTA 3SETA 1GTKA 4I8CA 1OMPA 4OHNA 2I0BA 2ZNTA 4N13A 3GXAA 4OMBA 3FVGA 2XXIA 4EXLA 4PP0A 3GBAA 5CC2A 3HHFA 4HCYA 1FQFA 1Y3QA 1VFEA 2I6EA 4NF6B 5B70A 5CM6A 2QS3A 1Y4TA 3VXBA 2ONSA 5I56B 3TKDA 4ECFA 4ELOA 3K00A 1N0TA 2F7CA 4GXAA 1JW5A 1S50A 5FHMA 4R2BA 2OBGA 3CR9A 1LFHA 2B65A 1UTBB 5IAIA 5ITOA 1IEJA 1B51A 1Z7NE 4OFJA 1SW4A 1KWHA 4NF8A 3T9VA 2QSXA 4XKQA 5I58A 1D3KA 1LFIA 2XXWA 5HM4B 1D4NA 1B58A 2ALUA 1XHYA 2ZMBA 2ZYOA 3QUFA 4MBPA 2VD2A 2QL3A 5DEXA 1BKAA 2R71A 3TTMA 2NXOA 4R6YA 3L6HA 3FJ7A 3H06B 3LSWA 3OSQA 2RC9A 3VVDA 5I57B 5HBCA 4ZEDA 1TFDA 4ZE8A 3TUSA 3PUZE 3KN8A 3K6UA 3M8UA 2O69A 2HQ0A 3OO9A 4GL8A 4OETA 3EPEA 4ZEKA 1LGBC 4FE8A 5K2YA 1FTLA 2HXWA 3IAZA 3MJNA 3PPRA 1A8FA 3UORA 2ZYKA 4GVOA 2YPNA 3G3GA 3KGCA 1UIUA 2H5YA 4YKIA 1RYOA 1ZIUA 3TCGA 3QUJA 4U4SA 1AOVA 3OD7A 4KD5A 1QKBA 2F34A 4IY6A 5KCJB 3ONMA 1IITA 1SW2A 2Y7RA 1MM6A 4BDLA 4G68C 5FHOA 5BUUA 5M2VA 3B6QA 3GLBA 5I2NA 4ZEIA 1LFGA 1RKMA 4U22A 3CRBA 4YB6A 1FQBA 2OLBA 2Y7IA 1SBPA 5H8FA 3H4ZA 3UIFA 4OQOA 4OFLA 4LZ7A 1B3HA 1MRPA 4QSEA 1Y20A 3FXUA 1QW0A 2ONKE 3R6UA 3CFZA 3OO6A 3OEMA 3OOAA 4KCDA 2WKYA 2A5TA 3T9HB 3USDA 4GL0A 3BKIB 3BBRA 2DWAA 4Q8RA 4ONYA 1OLAA 5EHSA 5J1DA 1B3EA 3VVEA 5I84A 1XVXA 3QAXA 4NE4A 1TWYA 4YU0A 4XIGQ 3DP6A 2F78A 3QYTA 4I1DA 3RTWB 3RPWA 3C32A 1N76A 2YLNA 2ZNUA 1B7HA 5CMKA 1MY2A 2Q88A 4YKPA 4RK2A 2VGQA 1EU8A 3O6HA 1P99A 1H43A 3K1NA 3MWBA 5DVJA 2Z8DA 1P1UA 4U2RA 3OMBA 1D9YA 4GF8A 3K1PA 1EH3A 5AA3A 1ZKBA 4XTCQ 2YJPA 4DCYA 2M8CA 1LLSA 5L9SA 1MXZA 4QSCA 3KN7A 4JDFA 4NWCA 3EHTA 1XC1A 3MP1A 2Y7WA 2Z23A 4ESXA 4MF3A 4F1UA 1A99A 2NOOA 4F3BA 2DQVA 1OVTA 4TOZA 4UA8A 3PUWE 4F18A 2OWSA 4PFTA 3JV9A 5I2KB 1Q35A 3C33A 2F6PA 5JTYA 5CI5A 3MAMA 3SEYA 1ATGA 4YB7A 1ZMGA 1B4HA 4JWOA 3FJGA 3V83A 1VR5A 2HEUA 2DE2A 2UXAA 4LQ2A 4BDQA 3A3CA 3TODA 1AH5A 1US5A 5ELVA 4XKNA 2RCBA 4UACA 5KZTA 2XD3A 1SYHA 1MQGA 4E0WA 3UA8A 2HAVA 3IOTA 3PPNA 2V84A 5L9MA 3LC8A 1O7TA 3VV5A 3TAJA 3I5OA 4QFKA 4RPOA 4OEUA 1JW1A 2VP1A 1WDNA 2XXTA 2H4IA 4R6HA 4YMBA 3G3FA 1PEBA 4TLMB 2R9JA 4KYEA 1AL3A 3T93B 4Q30B 1L5TA 2XD2A 1WODA 1B3LA 3UGWA 4WEDA 4NF8B 1VFDA 4YZZA 3H7MA 2P1SA 1B0LA 4R9GA 3SEUA 4NF4A 3GZGA 1XT8A 4U4XA 3FJMA 3TQLA 3LR1A 1MY0A 3B6TA 1MXWA 1QJMA 1DOTA 3I6VA 3MP8A 1B1XA 5JEIA 1DTZA 4PE5B 2Y7KA 4C1TA 1MPBA 4R72A 1NH7A 3H6TA 4XKPA 3MC2A 2E0SA 1POTA 4G77A 2I4BA 4GLIA 1FQCA 3G3HA 3QK6A 3EF7A 3OO7A 4LVQA 1TXFA 4PQJA 4ZDMA 3FD3A 4RXLA 1UTHA 4FATA 5TPAB 1Y3PA 4EQ9A 1MQDA 4F22A 1Y1MA 1PB7A 4K3FA 3TTNA 2H98A 3KSJA 3FASA 2O51A 4O3BA 3G3IA 3PU5A 4H5GA 2G93A 5AA4A 3FXQA 4YICA 3P7IA 5TP9A 1IXCA 5AA2B 1BP5A 5L9OA 1PBPA 1USYH 4M1VA 5I2NB 4LQ5A 4EXKA 1SQYA 1MH4A 4JBZA 1VSOA 2QS4A 2F97A 3RN8A 1YCJA 3S2VA 5CBSA 5H8FB 1PDAA 4IO5A 3SKPA 1SW5A 1MY3A 3CFLA 5H8NA 2V3QA 4KR5A 1N84A 2F7AA 4TLLB 1NL5A 1QUKA 3RTFB 2OCUA 4IO3A 3TELA 4DXBA 1PC3A 2O6AA 2A5TB 4G4PA 3HHGA 4JWXA 1PB9A 1MY1A 2F36A 1YAEA 3HO7A 4BDNA 1GVCA 4LP2B 1ZLQA 1NH8A 4KHZE 3O6GA 2DVCA 2CZLA 2QS1A 5HPQA 5JK4A 1B52A 3K02A 3H6VA 3TMGA 3IOUA 2I3WA 3ZS6A 5EYFA 4HS7A 3JYRA 3IJXB 1MXYA 3FGSA 2QMWA 3H6UA 3C36A 4H67A 1IXHA 5ISUA 3BFUA 3SERA 3M3KA 1EZPA 1A7LA 2OK2A 4LA9A 4ELPA 2DYXA 3U94A 2THIA 1MQJA 2DVZA 2NVUB 2Q9TA 1B5HA 3CIJA 2Z8EA 3T9UA 2F35A 4OTEA 3KZGA 3MQ9A 2D5WA 1IXGA 2PT1A 3E9XA 2IEEA 1B3FA 5LOMA 1D9VA 4QFNA 2ZXTA 3B7DA 4H6DA 1A8EA 4ELQA 4HCWA 3TZAA 1M5FA 3S9EA 3N6TA 3WAFA 4G68A 3CG3A 2F6GA 4RA1A 3D4CA 1MM7A 3S9LC 1S7YA 1XS5A 1GV8A 3TTRA 4IO7A 3HPIA 1I6BA 4R2FA 3MP6A 3U72A 1S9TA 2R6GE 1H76A 4DLDA 3MZ1A 4MLQA 5CMCA 2GRVA 1LBBA 3ILUB 3FXRA 4RPNA 5DVIA 5JTYB 1B7ZA 3EHUA 2B3BA 3L6GA 1UQWA 1MXVA 4NMYA 4POXA 2GFEA 2FA7A 1FTJA 4OWDA 3S4UA 3U93A 3G3JA 2RC8A 4U1OA 4IO2A 3KFMA 3PPOA 3H03A 3O6IA 5EHMA 4EF1A 1GR2A 2F7BA 3IJOB 4EQBA 3K4UA 2PMSA 4G8HA 4EDPA 1ZU0A 3VDFA 1POY1 3F11A 3VVFA 4FIMA 2V93A 4H1XA 3UP9A 1B4ZA 1MXXA 1IXIA 4EF2A 2UVGA 3I3VA 2Q89A 1II5A 5DVFA 3O66A 5ICQA 4FJPA 4WEPA 5CBRA 4ZECA 3MVYA 3Q27A 3FV1A 1LAGE 4OENA 1B6HA 4N07A 4H8IA 3TEPA 1ZBMA 2ZYMA 1OQHA 4U1ZA 1N3XA 1US4A 4NF6A 4F3GA 4JWYA 1N7WA 1IUDA 3EHSA 3MPKA 3HSTA 4YKKA 2GHAA 1VE4A 5I56A 3SEXA 4QHQA 2RC7A 2DS9A 2P0SA 1QUJA 3E4RA 1OLCA 4Z0IA 4KI0E 1OIBA 3KBRA 4YKJA 3A3UA 2PBWA 2W7YA 4JSOA 3Q29A 4G2ZA 4F2OA 1H44A 4RK9A 5KDTA 5A5XB 1PB8A 2GHBA 3MVXA 3IB2A 4Z7EA 1URSA 2AIXA 3JZJA 3K6VA 3VXCA 3C35A 4MFIA 2UVJA 4R6KA 1O64A 1I6AA 3LSXA 3PPQA 1R9LA 3CG1A 2DXRA 1EZOA 1MDP1 4YAHX 1R9QA 4KQPA 2HAUA 4BDRA 1FQAA 1JEUA 1BTJA 2FYIA 3K2DA 3KN3A 3PD9A 1R6ZA 1ZTYA 2D21A 2O68A 2XXQA 1B05A 3PV0E 5AA4B 4F31B 3RY3A 4R74A 1F9BA 1YTVA 3ZKLA 2HZKA 4GQOA 1LB9A 2ZYNA 2DP8A 4RYAA 3IB0A 4LZ5A 3FVNA 4XKRA 4AB5A 3TFLA 2V3TA 5CMBA 1SI1A 4E0XA 4ZEFA 3RGYA 4WXJA 1NNTA 3R26A 3LSLA 1JW4A 1P1NA 3OSRA 2XXYA 2PX1A 1J1NA 4F3SA 1UIVA 3G7WA 5KCJA 4GRKA 3QIMA 2DWHA 2UVIA 4HTGA 2X26A 2OWTA 2Q2CA 4N6PA 5AA1A 5B7DA 4NF5A 4PETA 3C34A 1FCKA 4DZ1A 4X1BA 3VLWA 4BDMA 4QRZA 3M3LA 4DXUA 1URGA 3PUXE 1P1OA 1HSEA 2I58A 3O28A 1B32A 1LAHE 5ICTA 2UYFA 3GBBA 1DPEA 2I0CA 1BLFA 4QFOA 2NUVA 1QKAA 4OVJA 4IY5A 3ECRA 3U8QA 5I58B 1MQHA 3TPAA 2Y84A 4P0GA 4X48A 4OZ9A 3LSFB 2I48A 4KCCA 4M4GA 1JVYA 3TDJA 5DEXB 3N5LA 4GD5A 1B5IA 4HW8A 4F3PA 1B5JA 1QUIA 1B46A 3N94A 3MZBA 3OELA 4WKMA 3K1MA 4C0RA 3OENA 3T96B 4F2QA 1ZJLA 2DE3A 3RLFE 3W9WA 2VOZA 1DTGA 3RT6B 4GXSB 4F1YA 2QJEA 4G68B 5IKBA 3TCFA 2QPQA 1H3DA 1FQEA 3OXNA 3W15C 2IA4A 3PGFA 5TU0A 3IOWA 2F8DA 1XVYA 3T22A 3T9XB 1JETA 4NEDA 1QULA 2O1MA 3ODBA 1P1WA 2KLFA 4Q5TA 3C31A 2D3IA 3E3KA 3N6UA 2UYEA 4OESA 3UN6A 4X1DA 1M5CA 4PFYA 4IO4A 3MW0A 3RQTA 4U21A 4AQ4A 5DT6A 5AE4A 2HCAA 1TFAA 3TCHA 3Q26A 3FV2A 5F1QA 1AMFA 4QFPA 1O63A 4GOTA 2LAOA 1A55A 1Z7ME 3HCQA 3O2AA 1GGGA 1NNPA 5H8QA 1JQFA 2RKMA 1LAXA 1TT1A 5FTIA 4H0WA 4O3AA 1LBCA 1MQIA 4O3CA 1RYXA 2XX7A 2A5SA 2E1SA 3IR1A 4OFOA 1M5DA 4G8MA 3IORA 1WVJA 4FEBA 4F29A 3HV1A 1A54A 4EQ7A 1A40A 3PD8A 5ITPA 2QRYA 4NTLA 2RF1A 1LB8A 2XXUA 4DXCA 4F1VA 1IIWA 5L8DA 1SW1A 3FATA 1N7XA 3U92A 3CFXA 3ILTB 3BFTA 3V8XB 3SESA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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