5KDTA

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with gne0723
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
280
structure length
278
Chain Sequence
DNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGICH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Discovery of GluN2A-Selective NMDA Receptor Positive Allosteric Modulators (PAMs): Tuning Deactivation Kinetics via Structure-Based Design.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
total genus 82
structure length 278
sequence length 280
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-06-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5kdtA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5kdtA02
2RC9A 3B6QA 3L6HA 1R9QA 5CBSA 1B7ZA 5K2YA 4U4SA 4FATA 4FE8A 3D4GA 2DWAA 3B7DA 3FGSA 2WKYA 1M5EA 3IB2A 1FTKA 4GD5A 1EZ9A 3WAEA 3ZKKA 3S2VA 2GHAA 3TDJA 4WEDA 2P1SA 5I2KA 1B3GA 1JVYA 4IY6A 4ZEFA 1IQ7A 1SW4A 4DE8A 2UVJA 5F1QA 1Y3QA 2NUVA 1DPEA 4OFLA 3ZSFA 1Q1KA 3FJ7A 1LCTA 1MPDA 4HCYA 4NF6B 1TXFA 2V3UA 1JVXA 4QSEA 3KN3A 3Q26A 4R73A 4FEDA 4TQUQ 1MRPA 4X1DA 3RTFB 4LUBA 1OLAA 1NL5A 2H99A 3R7XA 4G77A 1N76A 2Q88A 4ISUA 3CR9A 4R2FA 4H8IA 2F6GA 3QYTA 4LZ5A 3IR1A 1NH7A 1Z7NE 1D9YA 4ZS9A 1AH5A 4I9DA 1IXIA 2F7BA 4ND9A 3UN6A 1I6AA 1XHYA 4OENA 4RXLA 4IO6A 1OMPA 1B0LA 3FV1A 3MUQA 4NF6A 2VOZA 1XVXA 2O68A 5AE4A 4WXJA 3TTLA 3MPKA 1GTKA 3N6TA 3IOVA 2AYSA 4H5GA 3LC8A 5ISUA 5I56B 3FZVA 2O69A 1N0TA 5H8FB 3M8UA 2UYEA 1N84A 4RK2A 4R74A 4YKPA 2XXXA 4U4XA 3EHSA 1JW1A 4DLDA 3PMVA 3T96B 4XTCQ 1B05A 4F1YA 3KOSA 3N6UA 4EQ9A 3K01A 4XKRA 3RQTA 3FVNA 2HZLA 2ALUA 3GBAA 3K1NA 5H8FA 4JBZA 2G93A 4C1UA 3KSXA 4NF5B 4RPOA 2XXQA 2HCAA 4XKQA 4F2OA 1NNPA 4QSDA 3T66A 5FTHA 1MQJA 1P1UA 1VSOA 3CSGA 1DOTA 3OEKA 2X7QA 2E1SA 3B6TA 4H65A 1Y1ZA 4KCDA 3T9XB 1Y9UA 5CMMA 5F7VA 4PFTA 3K0VA 4EDPA 4Q5TA 5KZTA 4NF5A 3A3CA 3OD7A 4C0RA 1S50A 2DWHA 1MY1A 2F7CA 4HW8A 5IAIA 3FJGA 3O6GA 2P0SA 2PT2A 1USYH 1S7YA 3K1MA 3ILTB 4BDMA 3JZJA 3HN0A 1MM7A 4FEBA 2V25A 4O3CA 2XXYA 2ABHA 3MP6A 2XXUA 3K4UA 5B70A 1QUJA 2A5TA 4IO4A 4NMYA 3U92A 3JYRA 5HPQA 2HAUA 2OJTA 3SDFA 2HFBA 1B3HA 4KI0E 1LSTA 4GWOA 4IO5A 1DSNA 1XS5A 3TEPA 3FVGA 3C35A 4JWOA 4E0WA 1PEBA 3K00A 1SYIA 3MP8A 4RY1A 1PBPA 1H45A 2DWJA 3OMBA 3H03A 4F3SA 2UXAA 3PPRA 1PDAA 1Y20A 1P1QA 2H25A 4KD5A 3O6IA 1ANFA 4X48A 4U2RA 1OLCA 3GLBA 4I8CA 1MG1A 1N3WA 5CBRA 4MFIA 3E9XA 3LSFB 4DXCA 2I49A 3QXMA 2OWSA 3C4MA 3S9LC 2HXWA 4OHNA 3PUZE 2IA4A 2QL3A 1SI1A 4YKJA 4MLVA 4G68B 3FXQA 1SW2A 3B6WA 3Q27A 4JDFA 2DVCA 2FNCA 4GLIA 1LCFA 2D21A 3MJNA 4ELQA 2ANJA 2CMOA 5DVIA 4L17A 4KYEA 4NWCA 2X26A 5HM4B 3TFLA 2DXRA 1NNTA 4K3FA 1MS7A 3MAMA 1MXUA 2NOOA 3THIA 1SD3A 3K02A 3RPWA 2Y7PA 3H6TA 2REGA 3SERA 1TWYA 3FJMA 1BIYA 2QMXA 1MPBA 2V3QA 2I48A 4F1VA 1B7HA 3RY3A 4U22A 1D9VA 2W7YA 3QUJA 3IL1B 3O66A 3T9UA 5ICQA 3N5LA 1B58A 1YPNA 2O7UA 1MDP1 4LONB 3MVXA 1II5A 1QVSA 3KG2A 5L9MA 1M5FA 2D3IA 1B5JA 2UVGA 1LLSA 1IITA 3SKPA 4N13A 4EXKA 4G8MA 3TPAA 2QS1A 3VXBA 3GBBA 4JSDA 3BFTA 3V89B 1ZTYA 1KWHA 5A5XB 2F7AA 1Y4TA 3O29A 1B9JA 4OFJA 3TODA 4HCWA 2VD2A 1P1WA 5FHOA 1US4A 1FTLA 3R6UA 3IO6A 1YCJA 4KYDA 5HBCA 3KFMA 4OXVA 4TOZA 3OEMA 5ITPA 3DP4A 4GQOA 3H06B 1NMUA 5EHSA 1B3FA 3MVZA 1JNFA 3PPNA 1HSJA 4F22A 4KPTA 3IB1A 5DEXA 2PYYA 2XXIA 3IJOB 1IIWA 1IZ1A 3FIRA 2I58A 3FXUA 3PPQA 5A5XA 3I5OA 3RT8A 5I59B 3HSTA 4IY5A 4XIGQ 2I4BA 1MY4A 3W9WA 1TFDA 1LAGE 4YB7A 3BKIB 3ZS6A 3VVEA 1H3DA 4XKPA 4M4GA 3TYHA 3PUXE 3KOTA 2G29A 3UORA 3F11A 1Y3NA 3G3KA 4MF3A 3TTKA 4NE4A 1RKMA 3ILUB 4KHZE 3DP6A 5I59A 3KEIA 1O7TA 4YMBA 5BWJA 2PVUA 2ZMBA 3RN8A 4GXAA 1Y1MA 4HS7A 4Z0IA 3OSRA 4P0IA 3GXAA 1DTZA 3S9MC 2H4IA 2DSFA 1SI0A 3R26A 3ONMA 1OVTA 4ZEIA 5AA2B 4ESWA 4LQ2A 5TPAB 4OEVA 1NNKA 2DWIA 4OMBA 1LFHA 1FQCA 3KZGA 1JEUA 1LAFE 4R72A 3O28A 4ZEDA 4P11A 5L8DA 3QUFA 4OWDA 4ZEKA 4DCYA 2KLFA 1US5A 3OO6A 3EHTA 4P0GA 1QULA 1H76A 1IXHA 3JV9A 3TQWA 1MY2A 4G8HA 4QRZA 5TPAA 4QFLA 1OQHA 1FTJA 5TP9B 2IEEA 2HAVA 3PGFA 4BDRA 3FV2A 3EHUA 4DDDA 1QKBA 1OIBA 2ZNTA 4AB5A 3HO7A 1D4NA 3U93A 2OK2A 2PX1A 4MH5A 4UACA 5CMBA 4YKIA 4IO7A 4PE5B 4IB2A 1BP5A 5I58B 1B52A 3V83A 4JSOA 4DIGA 4ZE8A 2Y7WA 1VE4A 3IK6B 5TP9A 5AA4B 5H8QB 2NVUB 2XX8A 3RLFE 1ZLQA 2XXHA 1I6BA 2H9BA 4ZDMA 1A55A 2I4CA 3VVFA 3VV5A 3RUMA 3FXRA 1O64A 5I56A 3FD3A 1BKAA 2ZNSA 1MM6A 4FIMA 2ONSA 4F2QA 4QFNA 1AL3A 5CMKA 5I58A 4TLLB 4G8NA 1TT1A 3PD9A 2F35A 2XXRA 1JQFA 1N7WA 1FQBA 2I6EA 4ZE9A 2LAOA 4GRKA 1IXGA 5H8SA 5AA4A 1GGGA 3OENA 1EZPA 3PUVE 2RC7A 3IORA 3H4ZA 3W15C 3SEXA 1USYE 4Q8RA 3C9HA 4GOTA 5H8HB 1PC3A 3G3FA 3KBRA 2XXTA 1MDQA 4OVJA 3KJTA 4YICA 2Q8JA 3FUZA 1A7LA 3K6UA 3MBPA 3VXCA 3E3KA 1EZOA 1UTBB 3VLUA 1P99A 3Q25A 3CI8A 1MY0A 3KJ7A 1F9BA 1QUKA 1PB7A 2HZKA 3HHFA 4OETA 3MVWA 1LB9A 4R9FA 3V8XB 3HHGA 2DVZA 4WKMA 4KFQA 5CI5A 2DXYA 1VFEA 3T93B 3CFZA 1M5BA 3HCQA 3TTNA 5JK4A 1UTBA 5TU0A 4G4PA 4ECFA 3VLWA 3K6VA 2OCUA 5K2XA 4X9TA 2THIA 2XXPA 2V93A 2O7IA 2QS2A 1LB8A 4KCCA 3K1PA 4LP2B 5KCJB 3H6VA 3O6HA 4XXUA 4WEPA 2RKMA 1SW5A 3ODBA 2DE3A 1LBCA 3ZKLA 1XC1A 4F3PA 2YPNA 1P1OA 3OO9A 2FYIA 2UVHA 4O3AA 3T9HB 4YB6A 2OBGA 3UP9A 4QSCA 4IGTA 1A8FA 4PETA 2F36A 4YKKA 2ONRA 3TTMA 1B1HA 3TCHA 4FAJA 4AQ4A 3EF7A 1A54A 2A5SA 1FQFA 2FA7A 4NF4B 1NKXA 1VFDA 5KDTB 4JB7A 5FHMA 4OERA 4F18A 1I69A 1N3XA 2O51A 3KN8A 1DMBA 2HQ0A 3C31A 3CFXA 5B7DA 2Z8EA 1OVBA 2Y7IA 3E13X 1VR5A 4GVOA 4H1XA 2ZYMA 3N94A 3CG1A 4G68A 4PFYA 1R9LA 1QW0A 1Q35A 1POY1 4U1ZA 2F6PA 1B6HA 1ZBMA 4PFUA 3C32A 4R9GA 4NF4A 3H6UA 4YU0A 1TFAA 3MVYA 3SEYA 5I57B 3SEUA 3IOTA 3M3LA 4OYVA 1FTOA 4EXLA 1IEJA 4Z7EA 4X1BA 3GZGA 5DVJA 2QS3A 4R6YA 2GRVA 2R9JA 4RA1A 5I2NB 3TQLA 2F8DA 2DE2A 1B4ZA 4NWDA 3USDA 3K6XA 2Q2AA 5L9OA 2VD3A 4PQJA 2ZYNA 3E4RA 2PMSA 1UTHB 3G7WA 1WVJA 2UYFA 5CC2A 1LGBC 2RC8A 2QS4A 1BTJA 4ZEBA 4KR5A 2OWTA 3FVOA 1WDNA 3LBSA 2X7PA 3H6WA 1YAEA 4DZ1A 1DPPA 1MH4A 5FTIA 2E0SA 4DCXA 1A8EA 3D4CA 1CB6A 4ONYA 5J1DA 3QAXA 3PU5A 2Q89A 2XHDA 4UA8A 2GFEA 4NF8B 2O84X 2I0CA 1LFGA 2XD3A 4EF1A 1R6ZA 4GL0A 1UTHA 1XVYA 3Q29A 1B7UA 1MXWA 1MXXA 3N26A 1Y4CA 3PUWE 4KYSA 4YB5A 4PFWA 3PV0E 1H43A 3VVDA 1ZJLA 4O3BA 4ZZAA 2OLBA 4R6KA 3UIFA 1ZU0A 3RT6B 1FQDA 4H0WA 2Q2CA 4RNSA 2D5WA 2XXVA 4GF8A 1D3KA 1FQEA 3TMGA 4R2BA 3MWBA 2UVIA 5H8NB 1P1NA 4BDOA 4MLQA 5AA2D 1ATGA 4QFOA 4YAHX 1UQWA 2XD2A 3SESA 2ZYOA 3LUYA 3I6VA 4M1VA 1R1NA 4IO3A 3EN3A 3G3GA 1SQYA 3PUYE 4NTLA 1ELJA 3MZBA 5FHNA 1MQHA 3U1OA 3PMXA 1A99A 1OQGA 2H98A 3VLVA 2I0BA 1JEVA 1I6QA 5H8NA 2R6GE 3IJXB 2B3BA 3IOWA 1B51A 2ZXTA 3MC2A 2PT1A 1URDA 3CG3A 1MXZA 3RGYA 3MZ9A 1CE2A 2F97A 5DVFA 4AB6A 3MZ1A 2DE4A 4C1TA 1PB8A 2Q9TA 3QSLA 2I3WA 1SDXA 2YJPA 1IXCA 1M5CA 3LSLA 1T0KA 3OOAA 4GL8A 2ZNUA 4KQPA 5AA3A 2Z8FA 2H5YA 2VGQA 3TCFA 5AA2A 2ESNA 1A40A 1JETA 3A09A 3M3FA 1O63A 5LOMA 2I3VA 4NEDA 4EF2A 3H3GA 3PD8A 3SEVA 4JWYA 3FVKA 4RK9A 4ELOA 3HV1A 4OZ9A 3KGCA 3DELB 1LAHE 3O9PA 1B4HA 2O1MA 1JW5A 2XX9A 4YZZA 4U1OA 2R71A 5EYFA 2Z23A 4QHQA 3OO8A 5EHMA 1EU8A 2AL5A 2QSXA 1MQIA 4GXSB 2B3FA 2OZZA 4F29A 4F39A 1MQDA 4ZECA 3C36A 4PP0A 2AIXA 3Q28A 3IB0A 5DT6A 1XOCA 3TZAA 3S4UA 3W9VA 1NFTA 1L5TA 2O1LA 1ZKBA 2M8CA 1MXVA 4DXUA 1QJMA 2XXWA 2RINA 5H8QA 2Z22A 2VP1A 1GR2A 5CMCA 2DQVA 5IKBA 4TLMB 1B5IA 2Y84A 4DXBA 1QKAA 1H44A 2QRYA 3KSJA 1S9TA 1DTGA 3DLNA 3VFJA 4RJZA 5BUUA 1B40A 4MBPA 1POTA 2QPQA 4I1DA 4LA9A 3LSWA 4F3GA 1LFIA 2A5TB 2V84A 2YLNA 4GFRA 4F3BA 4U23A 5JEIA 3CIJA 2GHBA 4H5FA 2Y7KA 4IGRA 3DP8A 4H67A 3TCGA 3OSQA 1XT8A 3UK4A 4FORA 1HSEA 5H8HA 4Q30B 4OQOA 1SYHA 1MY3A 2REJA 1B32A 1JW4A 1AIVA 2RCBA 4F19A 3G3IA 4LVQA 5CRYA 4QFPA 3EQ1A 1B46A 3EPEA 1HSLA 1BLFA 2ONKE 1B2HA 3IX1A 4OFOA 1B5HA 4ZZEA 3AXFA 3UA8A 3ECRA 3S9NC 3WAFA 1FTMA 3CRBA 2F5XA 3QIMA 1B0HA 1Y3PA 4QF9A 3V5AA 3G3JA 1N7XA 2RF1A 1MH3A 3I3VA 3G3HA 1UIUA 4POWA 3IO4A 3LSXA 5CM6A 1B1XA 3VDFA 4N07A 2P2AA 4YMAA 4IO2A 2F34A 1FW0A 5ICTA 5JTYB 4E0XA 3O97A 4F1UA 3BFUA 2DOJA 1SBPA 4JWXA 2PBWA 4LQ5A 2F78A 3MP1A 3U8QA 3L6GA 2RCAA 3CVGA 2AL4A 4R6HA 5KCJA 4ELPA 3OXNA 2XX7A 4LZ8A 1QUIA 3P7IA 3U72A 1MXYA 1WODA 2QMWA 4BDLA 2NWJA 3O2AA 1URSA 3H7MA 3C33A 1NH8A 5M2VA 3T9VA 1AOVA 3PMWA 2HEUA 1LAXA 5JTYA 1FCKA 5AA1A 5DTBA 4OESA 3MQ9A 1GV8A 3TELA 3MW0A 4Q0CA 4N6PA 4OEUA 4FJPA 3PPOA 1SW1A 4EQBA 4BDQA 1RYOA 4OTEA 3RNNA 4EQ7A 5L9SA 3VE1B 1MQGA 1M5DA 5KDTA 3TAJA 3UGWA 3TKDA 5ELVA 1MPCA 4H8JA 1YTVA 4QFKA 3CSBA 4THIA 4HTGA 3TTRA 1IUDA 4BDNA 4JXIA 1FQAA 4I62A 2NXOA 1GVCA 3MPLA 1ZMGA 3DM0A 5DYHA 4G68C 3M3KA 2Y7RA 2V3TA 2O6AA 3A3UA 4ESXA 4XKNA 1PBQA 3BBRA 1ZIUA 2GH9A 3LR1A 2DP8A 5I57A 1B3LA 2DYXA 1PB9A 4LZ7A 2VHAA 3OELA 1N04A 2B65A 1AMFA 3T22A 1J1NA 4BLAA 3U94A 3CFLA 1RYXA 3PPPA 5I84A 2Z8DA 3S9EA 5I2NA 5DEXB 4EUOA 4GIZA 2CZLA 1LBBA 3QK6A 4F31B 2DS9A 1NNFA 3KN7A 3FASA 4RYAA 3HPIA 3K6WA 4H6DA 4R75A 2ZYKA 3FATA 2BJJX 4LATA 4RPNA 3K2DA 1EH3A 3SETA 3TUSA 1Z7ME 3C34A 4U21A 4NF8A 1SVXB 3IOUA 3OO7A 3RTWB 4ELRA 3SEWA 4FECA 4POXA 3IAZA 1B3EA 1UIVA 4G2ZA 5I2KB 1URGA 2QJEA 5ITOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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