5KDTB

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with gne0723
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
287
structure length
284
Chain Sequence
MSTRLKIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVRYQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Discovery of GluN2A-Selective NMDA Receptor Positive Allosteric Modulators (PAMs): Tuning Deactivation Kinetics via Structure-Based Design.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
total genus 76
structure length 284
sequence length 287
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-06-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5kdtB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5kdtB02
2XHDA 3TKDA 4P0GA 3C9HA 1B1HA 3FVNA 3K1NA 2QJEA 3TCGA 2O51A 4C1TA 1B7HA 3KBRA 1XHYA 4F18A 3T22A 4G8MA 4YU0A 3HHGA 4GVOA 4XKPA 5AA2B 3L6GA 3OMBA 4G68B 1Y9UA 4H67A 1IITA 1POTA 1YPNA 4FATA 4K3FA 3A3CA 2RKMA 3H6WA 2I3WA 1B5IA 1KWHA 2A5TA 3K1MA 4HCWA 5DT6A 4H8IA 3TTNA 3H7MA 4LONB 1LGBC 1B3HA 1FQFA 1NNKA 4R2BA 4N6PA 4NF6B 1F9BA 1LLSA 1DSNA 4BDQA 4QSCA 4GWOA 1YTVA 2ZNSA 3UGWA 5I2NB 2ESNA 1MQHA 5KZTA 3EF7A 4KI0E 1FQDA 1B9JA 3IJOB 1UIUA 4QFPA 4OYVA 3U93A 4MLVA 3KN3A 4X1DA 3E3KA 4ELOA 3EHSA 1P1QA 2F7AA 2I6EA 4F29A 1SQYA 3VXCA 2VGQA 3FXRA 1R9QA 4WKMA 3FXQA 4GFRA 4U21A 4DCYA 3K01A 4DLDA 3DP8A 1IUDA 3LC8A 1LCFA 5I2KB 4ZEFA 3N6TA 3PMXA 3QSLA 3G3FA 3LSFB 5I84A 3VLVA 4RK2A 1ATGA 1B3FA 4FE8A 3RPWA 4F22A 1VFEA 4GRKA 3QK6A 2F78A 3E9XA 2DWIA 4KD5A 4UA8A 5L9SA 3CSGA 3OSQA 1UTHB 3R6UA 4P11A 4DZ1A 2M8CA 5HM4B 1XOCA 1N0TA 4DCXA 4YMAA 1R1NA 3T66A 5TP9B 3JZJA 4OFLA 1L5TA 3VVEA 2ONRA 3TELA 2VD3A 1B3EA 4HTGA 3BBRA 4FEDA 3RLFE 3W9WA 5AA2A 3IOTA 4G68A 2ZYOA 2BJJX 3KOSA 2D5WA 2H98A 3O9PA 2ZYNA 3DP4A 1N3WA 4MH5A 1UIVA 4OVJA 1H44A 4X48A 1IEJA 2NUVA 1LAXA 3MPLA 4KYDA 3IAZA 1ANFA 1PBPA 3ZSFA 3WAFA 1ZJLA 5A5XB 4NF6A 3ZKLA 3HN0A 2QRYA 3GBBA 1BTJA 2QMWA 1B5JA 1QULA 3OO8A 4YKPA 4IY6A 5I2NA 3I5OA 5B7DA 3PUVE 5EHMA 3SERA 4PFTA 2F7BA 4U1OA 2F35A 4QFLA 2QPQA 1S7YA 3UORA 5JEIA 3VDFA 1FTJA 1DPEA 4OZ9A 3K0VA 3U8QA 1P1OA 4BDMA 3PUWE 3SKPA 4X1BA 4MBPA 3SDFA 1XVYA 3G3HA 2RC7A 1IXIA 1MPDA 1JQFA 2XXUA 3M8UA 4XXUA 4ESWA 3PPNA 2X7PA 4Q8RA 4GXAA 4JXIA 2XD2A 3IOUA 3TQLA 1S50A 1MPBA 4YKJA 3C34A 1B0HA 2PMSA 5ELVA 1B4ZA 5I2KA 1NNTA 1DTZA 2GH9A 2UYEA 1MDP1 2DQVA 4TLLB 4GLIA 3UK4A 1OVTA 2DXRA 1UTHA 4WEPA 1UTBB 3OD7A 3CSBA 1D9YA 3C36A 2Y7WA 1MQGA 3ONMA 5AA4B 4PE5B 3M3KA 2H4IA 3QYTA 1OQHA 4ELPA 3OO9A 3CFLA 1P1WA 1URDA 1ELJA 2GHAA 4KQPA 4H65A 2DYXA 3UP9A 1SD3A 3U72A 4ZS9A 4IO2A 1CB6A 2R6GE 2Y7IA 1MQIA 3WAEA 3H06B 1NNPA 5ITPA 2P2AA 1RKMA 5I59B 1NL5A 4TQUQ 3MZ1A 4XKQA 3MP8A 2PX1A 2PBWA 3CG1A 2RC9A 4JWXA 4O3CA 1Y4CA 1MY4A 1SW4A 1BP5A 1M5EA 2NWJA 2V3TA 2R71A 2P0SA 3LUYA 5ICTA 1M5DA 4U2RA 2I48A 4OMBA 1DPPA 3QUJA 1O64A 3FGSA 4O3AA 1B1XA 5L9MA 1IXHA 2PVUA 2DWJA 3Q25A 1B3GA 2OWTA 1IXCA 4TOZA 2QSXA 4PP0A 2XX9A 2XXYA 1MG1A 3W9VA 2DWHA 2PT2A 5ISUA 1MM7A 4Q30B 1OIBA 3ILUB 1H3DA 2B3FA 4H1XA 3D4GA 2R9JA 1PB9A 3QIMA 2V3UA 4KFQA 3V89B 4JWOA 3JYRA 1IIWA 4NE4A 2RCAA 4H8JA 4JWYA 4ZZEA 3LR1A 4QSDA 4XKRA 3N6UA 2O1MA 3RTFB 1M5BA 2QS3A 4BDRA 1DOTA 4YAHX 2F8DA 3MQ9A 4OEUA 3HV1A 2HAUA 4EXLA 4ZEDA 2DXYA 4E0WA 2OWSA 5CMMA 5TPAB 3S4UA 3KGCA 1N7XA 1P99A 5AA3A 3TODA 1TFAA 3TMGA 4IGRA 3O6HA 4PETA 2OCUA 1B52A 3K6WA 2RC8A 4YB5A 1FTLA 3N5LA 5CBRA 2D3IA 4F3SA 1N3XA 4YB6A 3UN6A 1EH3A 3PPQA 2D21A 1SI1A 3H6VA 4XKNA 1Y4TA 3SEXA 4U4XA 1FTKA 3F11A 5KDTB 4R2FA 1H45A 5DVIA 1QKBA 1NNFA 4QFKA 4F3GA 2OK2A 3PV0E 1FQAA 1QJMA 2XX7A 5CMBA 1TT1A 1QUIA 1M5FA 4KHZE 4R72A 2DS9A 2I4BA 2W7YA 5FHNA 3FUZA 4M1VA 4ZEKA 1N04A 1MQDA 5DYHA 4G77A 3C35A 2H5YA 3MW0A 3EN3A 3TEPA 1AMFA 3T9XB 5H8QB 5I58B 3CI8A 3G3JA 5LOMA 2ZYKA 4QFNA 4RXLA 1B7UA 3U1OA 3I3VA 2Z22A 5DEXA 4LATA 2UXAA 1LAHE 3KZGA 1SW1A 1BKAA 4EF2A 4R74A 3VXBA 3ODBA 1A40A 2PT1A 3KG2A 1JEUA 4NF4B 1MXZA 5TU0A 3IO4A 1A8EA 4YMBA 1A54A 4ZE9A 4FAJA 3TTLA 4DXBA 5JTYB 3V8XB 4OEVA 1WDNA 5DVFA 1B4HA 3IJXB 2Q8JA 1NKXA 2HXWA 2QL3A 1HSJA 4FJPA 2HFBA 3TTMA 1SW5A 2HCAA 4OERA 4N13A 2VOZA 1A99A 2THIA 4R6KA 4Z0IA 3FIRA 2RINA 4BLAA 1TFDA 3RUMA 4LUBA 4HCYA 4ONYA 4ZEBA 3HPIA 2UVGA 1XC1A 1MXVA 3LSWA 1LB9A 2GHBA 4F39A 4IO5A 3TDJA 1MDQA 4AB5A 1QW0A 3QXMA 1NFTA 2DVZA 3OEKA 1JEVA 5H8FB 2G29A 2VP1A 3CVGA 2OJTA 1JETA 4MF3A 4NWCA 3HCQA 1UQWA 3PU5A 1CE2A 2ANJA 4XTCQ 3GXAA 2E0SA 4PFUA 2NXOA 1B46A 3ECRA 2Q9TA 1ZLQA 3G3IA 5FHOA 4JDFA 1JNFA 2ALUA 4R6HA 4E0XA 3MVYA 3BKIB 4JBZA 3IOWA 1B32A 2Z8DA 1R6ZA 1O63A 1JW5A 4OXVA 4EQBA 3Q29A 2I58A 1Y20A 3K4UA 3G3KA 2F7CA 3K2DA 3USDA 1LBBA 1O7TA 1B51A 3IB0A 4FORA 2Z23A 5KCJB 2Y84A 2AL4A 1R9LA 3PPRA 4KYSA 3MBPA 2F5XA 4THIA 4QSEA 3VVFA 1PC3A 1OLCA 3OO6A 1Y1ZA 3TAJA 2FA7A 4RA1A 4IY5A 4R6YA 5H8QA 1NH8A 3M3FA 5H8SA 5ITOA 4FIMA 4G2ZA 2X7QA 2RCBA 1GVCA 3T9UA 1SYHA 2REGA 3CRBA 3BFTA 4Z7EA 3O2AA 2CMOA 3N26A 3E4RA 3LSXA 2UVJA 4G8NA 3MAMA 2XXPA 3K1PA 3TQWA 2Q2AA 1J1NA 3A09A 3EPEA 4YICA 3VLUA 2V84A 1FCKA 4EUOA 4PFYA 1B2HA 5ICQA 5H8NB 5AE4A 5DVJA 3LSLA 4EQ7A 3TTRA 4JSDA 2IEEA 4YB7A 4FECA 5EYFA 3O29A 1LAFE 3KSXA 4IGTA 3IR1A 4LP2B 3FV1A 3VLWA 5F1QA 1N76A 1OLAA 3E13X 1OMPA 1MM6A 1PBQA 5I56B 3EHTA 4ZEIA 1MY3A 3TCFA 3TFLA 1MQJA 4IO6A 4LQ2A 1ZTYA 2I49A 3G7WA 4U1ZA 4OTEA 1USYE 4NF5B 1SW2A 3RGYA 1ZU0A 2XXQA 4X9TA 2O7IA 1DTGA 2XX8A 2XXIA 1XT8A 3D4CA 2AYSA 5TP9A 1QVSA 3K02A 5CMCA 4ZZAA 4NTLA 3U94A 2HZLA 5K2YA 1GGGA 1PEBA 1PB7A 4N07A 4TLMB 1A7LA 1BLFA 2O69A 5H8HB 2GRVA 4P0IA 1PDAA 2Y7RA 2ZNTA 1VSOA 1MXXA 4KYEA 1Y3NA 3O28A 4H0WA 1VE4A 4DXUA 1N84A 3MC2A 1LFGA 3PPPA 2ZXTA 2OLBA 4F3PA 3RY3A 1D4NA 3IORA 4OFOA 1B05A 1FTOA 3KEIA 3V83A 5B70A 2REJA 5KCJA 3CFXA 3ILTB 3EQ1A 1AOVA 4YZZA 4HS7A 2V3QA 3P7IA 3IOVA 2UYFA 5A5XA 2GFEA 4POWA 2ONKE 5CI5A 4F1UA 1POY1 4NWDA 4KCDA 1P1UA 1D3KA 4IO3A 3FXUA 4LZ5A 4LZ7A 1IQ7A 4I62A 4ZECA 3OELA 3HHFA 1EZPA 4I8CA 4G68C 3ZKKA 4GF8A 1TXFA 5AA2D 1Z7NE 5M2VA 3IL1B 3C31A 1VR5A 5JK4A 2ZMBA 3VFJA 4NF8B 3CR9A 4ECFA 3QUFA 3K6VA 2I0CA 3GBAA 4FEBA 3CFZA 3SETA 1T0KA 1SBPA 3PD9A 1IXGA 3B7DA 1SDXA 2FNCA 3RQTA 1II5A 5I56A 2XXWA 3CG3A 5EHSA 2HEUA 1NMUA 1AIVA 1MRPA 3KJ7A 3KSJA 3G3GA 2DP8A 2QMXA 4NF5A 3TZAA 2XXTA 1UTBA 3PGFA 3KN8A 4Q0CA 4NMYA 2E1SA 4F1YA 1GR2A 4U22A 5FTIA 4RJZA 1URGA 2YJPA 3RTWB 5AA4A 2Q2CA 2HQ0A 2X26A 4RYAA 1LFIA 3DELB 4I9DA 1B6HA 1B7ZA 2YPNA 3THIA 2IA4A 4WXJA 2XXRA 4ESXA 5IAIA 1I6QA 1MXYA 4GD5A 5H8HA 1QKAA 3PUZE 2QS1A 1MY2A 1B58A 1RYOA 1S9TA 4EF1A 5L9OA 1A55A 3O6GA 4GQOA 1DMBA 3H6TA 5I59A 3MWBA 3OENA 4R9FA 2PYYA 3T96B 2I3VA 4RY1A 2ABHA 4GIZA 2F36A 5J1DA 4QF9A 2KLFA 3B6WA 3MUQA 4WEDA 2DSFA 4GL8A 4DXCA 2QS4A 4YKIA 2NVUB 2RF1A 3MP6A 4OFJA 1I69A 2B3BA 3H6UA 4ISUA 1LCTA 5HBCA 2ZYMA 2ONSA 4F1VA 3MVWA 1QUKA 2O68A 3PD8A 4GOTA 2WKYA 1FW0A 1Y1MA 4RPOA 3T93B 1EZ9A 2I4CA 4U23A 1QUJA 2DE2A 4L17A 3HO7A 1H43A 2H9BA 4KCCA 3IX1A 4HW8A 3S9LC 4KPTA 4ELQA 5I57B 4DIGA 3TCHA 3B6TA 3PMVA 3MVXA 1SVXB 3O66A 5FHMA 2F6PA 5AA1A 2H25A 4NF8A 3OSRA 4POXA 3GLBA 4G8HA 3RT8A 3S9MC 1MH3A 3OO7A 3GZGA 4BDNA 1OVBA 1OQGA 4C1UA 4OETA 2O7UA 2Q88A 1FQEA 1VFDA 3MVZA 3RT6B 2UVHA 1MH4A 3FJMA 2O1LA 1RYXA 4IO7A 5TPAA 1Q35A 4IO4A 2DE4A 3VVDA 4JB7A 1ZBMA 5F7VA 1MXWA 3DP6A 2ZNUA 5CRYA 3R7XA 2O6AA 4GL0A 1MY0A 3PMWA 2G93A 4NEDA 2I0BA 4DDDA 3C33A 4LQ5A 4OQOA 3Q27A 2V25A 3OEMA 4YKKA 3OXNA 4LA9A 3VE1B 2VHAA 3FATA 1LB8A 1MPCA 3FASA 1US4A 1EU8A 5KDTA 1LAGE 1FQCA 4EXKA 3KOTA 3MZ9A 3H03A 1AL3A 4R75A 3Q28A 5BWJA 3IK6B 3RN8A 3SEUA 1JVYA 3S2VA 3B6QA 2B65A 3L6HA 3UIFA 3V5AA 4EDPA 2HAVA 4F19A 3DM0A 2QS2A 1JW4A 2DOJA 4C0RA 2OBGA 3MPKA 2DWAA 4M4GA 5I58A 3PPOA 3C4MA 2UVIA 4RNSA 1N7WA 3H4ZA 1URSA 2V93A 3VV5A 4ELRA 4R9GA 4LVQA 3KJTA 3LBSA 1WVJA 3JV9A 2Y7PA 4Q5TA 3UA8A 1Y3QA 4NF4A 4ND9A 2AIXA 3S9EA 3KFMA 1SI0A 3BFUA 2XD3A 4OHNA 1MY1A 2AL5A 3IB2A 4QFOA 2NOOA 4AQ4A 5FTHA 3FV2A 3KN7A 4O3BA 5JTYA 4LZ8A 1M5CA 2FYIA 3AXFA 3IO6A 2LAOA 4F2QA 3SEYA 2DVCA 2H99A 1JVXA 1ZKBA 4F31B 5DTBA 2XXXA 4JSOA 1GTKA 2Z8EA 4H5FA 1HSEA 3K00A 5CC2A 4QRZA 5I57A 4ZE8A 1TWYA 4R73A 4BDLA 2CZLA 4BDOA 1FTMA 3W15C 1FQBA 3TPAA 4QHQA 3TTKA 2XXHA 4U4SA 5L8DA 1I6BA 3FJGA 3IB1A 5H8FA 4UACA 4F3BA 4IB2A 1JW1A 3DLNA 3H3GA 1AH5A 1A8FA 3FVKA 4EQ9A 3T9HB 1B3LA 2F6GA 1MXUA 4DE8A 4GXSB 5BUUA 1ZIUA 2P1SA 3U92A 3TUSA 4F2OA 1H76A 1USYH 2O84X 3MZBA 3SEWA 3QAXA 2A5TB 1B0LA 4H6DA 1US5A 4KR5A 2F34A 1YCJA 2OZZA 1XVXA 1Q1KA 1EZOA 3S9NC 4MLQA 5K2XA 1NH7A 1XS5A 3I6VA 2YLNA 2DE3A 1ZMGA 3K6XA 4PFWA 1B40A 4RPNA 4OENA 4I1DA 3C32A 4XIGQ 1BIYA 4ZDMA 5DEXB 1WODA 4H5GA 5CBSA 2HZKA 1I6AA 3MJNA 2VD2A 3EHUA 3O97A 4MFIA 2Z8FA 3T9VA 2F97A 1B5HA 3HSTA 2Y7KA 3M3LA 3SEVA 2XXVA 3RNNA 1SYIA 3TYHA 5H8NA 3FD3A 4AB6A 3SESA 3FVGA 1PB8A 1LBCA 4OESA 1LSTA 3MP1A 3A3UA 1YAEA 1Y3PA 3FJ7A 4RK9A 1MS7A 1IZ1A 1GV8A 1P1NA 4OWDA 3K6UA 3CIJA 1HSLA 1D9VA 5CMKA 3Q26A 1Z7ME 3O6IA 3OOAA 1LFHA 3R26A 4PQJA 3FVOA 3FZVA 5IKBA 3ZS6A 3PUXE 4G4PA 3N94A 2A5SA 5CM6A 2Q89A 3PUYE 5HPQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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