1RYOA

Human serum transferrin, n-lobe bound with oxalate
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
324
structure length
324
Chain Sequence
KTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Metal transport
source organism Homo sapiens
publication title The oxalate effect on release of iron from human serum transferrin explained.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serotransferrin
total genus 103
structure length 324
sequence length 324
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-12-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ryoA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ryoA02
1B6HA 4QRZA 1IXIA 4MLVA 3ILUB 5H8HA 4R73A 3BKIB 1B40A 3IOVA 2PT1A 2QSXA 1NNTA 2O51A 3PPRA 4JXIA 4UA8A 5L8DA 3TYHA 2DYXA 1QUKA 1AL3A 4IO2A 3K6VA 1B46A 1MM6A 3V89B 1SDXA 2I58A 3D4GA 2HAUA 4QFNA 4YZZA 3TTRA 1Y3QA 2HAVA 2UYFA 1II5A 3K02A 1MPCA 1Y3PA 4PFUA 4R75A 2NUVA 5EHSA 1SW2A 4LATA 3EN3A 3KN8A 5I57B 1PB7A 1GV8A 3LC8A 4QSEA 4EQBA 3VE1B 3H6TA 1JNFA 3QK6A 2H25A 4Q0CA 5AA2D 3QAXA 3IB2A 2DVZA 1FQBA 1XVXA 2DE3A 2B65A 3FJGA 5IAIA 1Q35A 3U1OA 5AA2A 1XT8A 4IO4A 1NH8A 3RLFE 1F9BA 3CSGA 4JSOA 5DTBA 3CFZA 4KR5A 1MPDA 2VD2A 2Y7WA 1O63A 3MC2A 3HV1A 4TLLB 5BUUA 2ZMBA 4C1UA 4N07A 4NF6B 1N76A 4R72A 4IGTA 4F1UA 3LBSA 1WODA 3IB0A 4XTCQ 3CR9A 3RQTA 2DE2A 3N6UA 4GL0A 5A5XB 4OZ9A 4ZS9A 1N84A 4XKQA 1UTBA 5TPAB 4NF8A 3VXCA 2ESNA 4LQ5A 2Q8JA 5ICQA 1YCJA 4LZ5A 3QUFA 4GF8A 1LCTA 1B0LA 3IOUA 1B1XA 2HEUA 3B6TA 3RGYA 1N3XA 3K1PA 1MQIA 3DP8A 3TODA 1BLFA 4IO3A 4P0IA 4F3BA 1RYOA 3FV1A 1MDP1 4YAHX 5JTYB 2Y84A 1YAEA 1Z7NE 5F7VA 2NVUB 3VLWA 4H8IA 3ILTB 4DCYA 1B7ZA 2DQVA 1QULA 2PYYA 4R9FA 1PBPA 3HSTA 1O7TA 3FZVA 1QKAA 3T9UA 2QS2A 2A5TB 5M2VA 3OSRA 1D9YA 3BFTA 1IEJA 4JWXA 2YLNA 4ZEDA 3R6UA 3C35A 4RPOA 2OZZA 1OLCA 4IO6A 3DELB 5EYFA 1SI0A 1LFIA 3K00A 4QFPA 3H7MA 1FQDA 1JW1A 1JQFA 3F11A 2XX9A 4ELRA 2F78A 2DVCA 3TTNA 1MY0A 3H6UA 1SW1A 1LSTA 2A5SA 4OVJA 2ZNUA 4YKPA 3GBAA 3OOAA 3M3KA 4LP2B 1A40A 1FW0A 4RPNA 2F35A 4HW8A 4MBPA 3SEYA 4ZZAA 3I6VA 3KEIA 2O7IA 1MXUA 2UVGA 3LUYA 3MZ1A 3PPNA 3TTKA 1VR5A 3B7DA 4ZEKA 5L9OA 5ISUA 2XXHA 5KCJA 4AQ4A 2Z8DA 1FCKA 2R71A 3M8UA 1DTGA 1NH7A 3W9WA 5DEXA 1WVJA 3N6TA 4GWOA 3EHSA 4YICA 1A8EA 1DPPA 1PB8A 4YB6A 2F34A 3TMGA 1SBPA 4LVQA 4DZ1A 3IO4A 5I2NB 3PPQA 1MQJA 4Q5TA 5AA1A 4LZ7A 4L17A 3V83A 5LOMA 2ONKE 3U72A 1Y9UA 2PBWA 1B05A 3OO7A 2QS1A 1IUDA 1H45A 4IO5A 2QMWA 1PDAA 1ELJA 3KSJA 3Q29A 2QJEA 2I0CA 2RCBA 3KFMA 3MJNA 4DE8A 2XXXA 4GD5A 3H6WA 4DCXA 5H8NA 2Q2AA 2QRYA 3HO7A 3JV9A 1ZLQA 2OWTA 1SYIA 3SEWA 2HFBA 1ZIUA 4U1ZA 3OSQA 3C31A 3UA8A 1TWYA 3T22A 3UORA 2PMSA 2Z8EA 3TAJA 2GHBA 1EH3A 1VSOA 4OEUA 1FTOA 5I56B 1MH4A 1OVTA 5EHMA 1LAHE 2G29A 4FEDA 3KSXA 3MP8A 3FVGA 2D3IA 4OXVA 3TQWA 2I48A 4IB2A 3IJOB 2F36A 2V25A 2HZKA 2AIXA 3KJTA 1UTHA 1D4NA 3A09A 4NF4B 3FASA 3PPOA 4H8JA 2I3VA 4O3BA 1MXWA 1JW5A 2E0SA 3RT6B 5H8QB 4O3AA 2DWHA 4H67A 3PUZE 3B6QA 3CRBA 4PQJA 2UYEA 3DLNA 1DPEA 4C1TA 5DVFA 4ZEIA 4FATA 5JK4A 5CI5A 3UP9A 3S9MC 2I4CA 3V8XB 4F2QA 5ICTA 1JETA 3PMXA 1DOTA 4KCDA 4ECFA 4ZE8A 3KOSA 2ANJA 4JSDA 2DXRA 4X1DA 4U23A 5I58B 2OJTA 4HS7A 2H5YA 2VHAA 1MXZA 3QIMA 5AE4A 5CMMA 2DS9A 4C0RA 4I9DA 2RC7A 3GLBA 4FECA 1M5FA 1IIWA 5BWJA 3OO9A 2I49A 2ZYOA 4U21A 5CRYA 3G7WA 4YB5A 2AYSA 4ZEBA 5H8HB 1B5JA 1USYE 4RYAA 3GXAA 4GXAA 1B0HA 2YPNA 3MPKA 3IOWA 3PUWE 4X1BA 1VFEA 3O66A 2PX1A 1GGGA 1IXHA 3K4UA 3PGFA 1Q1KA 2XXVA 5K2YA 1OVBA 1URGA 4E0XA 1R9LA 3M3FA 2FA7A 4NF5A 1QKBA 4H65A 1I69A 4KQPA 3FVNA 4KYEA 1LGBC 4R9GA 1VE4A 2QMXA 5I59A 4HCYA 2FYIA 4OEVA 5ITOA 3K1NA 1JEVA 2DWJA 2PT2A 3TFLA 1SI1A 4FORA 4F3SA 4U1OA 2WKYA 3RTWB 3G3IA 4RK9A 5AA2B 3MZ9A 4G2ZA 1OMPA 1B3FA 2I0BA 3RNNA 1UQWA 3KBRA 3VV5A 3WAFA 3I3VA 1LAXA 2O7UA 5DYHA 5F1QA 5L9MA 4BDOA 1A7LA 1CB6A 4GL8A 4R6YA 1B4HA 1SD3A 2DE4A 3U92A 3VLVA 1LFGA 3CFLA 1MXVA 4BLAA 4H5FA 2F7AA 3TELA 3FVKA 2F7BA 3TDJA 3Q28A 3K6UA 1POY1 2XD2A 5HPQA 4LONB 3FXQA 3C33A 1UTBB 3CG1A 4U2RA 3IOTA 1SW5A 3BBRA 2XXTA 3PV0E 4IY5A 2XHDA 4PETA 1QUJA 3W9VA 1I6QA 5AA4A 2Y7RA 5FHOA 4GFRA 2BJJX 4FAJA 2GFEA 1US4A 2OCUA 4ELPA 1MY4A 3MUQA 4RXLA 3LSXA 3VFJA 3THIA 2B3FA 4OWDA 4RA1A 5TU0A 4HTGA 1TXFA 1CE2A 4ND9A 4EUOA 1MM7A 2IEEA 1L5TA 4YKIA 1AOVA 3MVYA 4OFLA 4GVOA 1POTA 2H4IA 2FNCA 3EQ1A 2ZYMA 2IA4A 4F31B 3TKDA 3ONMA 2E1SA 1B5IA 3B6WA 4Z7EA 2D5WA 3Q25A 1B7HA 3KJ7A 4G68A 4RNSA 2UXAA 1B51A 4JWYA 3O2AA 3HPIA 3TEPA 1Y1MA 3H4ZA 4JWOA 2ONRA 4THIA 3OXNA 1XVYA 1YTVA 3EHTA 2P1SA 4P11A 3PPPA 3CSBA 2UVHA 3G3GA 4XXUA 1R1NA 4DXBA 5CM6A 5TPAA 3LR1A 3PMVA 1B3EA 1NNPA 3IB1A 1EU8A 4BDRA 3KN7A 2V3QA 2GRVA 4X48A 2H98A 2UVIA 2Q2CA 5KDTA 4JDFA 5H8FB 2HCAA 1A8FA 4H5GA 1UIVA 3QYTA 3OO6A 4G4PA 4OENA 5JTYA 3H6VA 1OQGA 3TTLA 3TTMA 3C36A 1J1NA 4Q8RA 5CBRA 5KCJB 1NNFA 3S9LC 4DIGA 2R6GE 4RY1A 5FTIA 4QHQA 4O3CA 3FGSA 1ZBMA 3OO8A 4QFLA 3HHGA 1LAFE 1B58A 3OELA 1LAGE 2DWIA 1IZ1A 4NMYA 4F2OA 4IY6A 4QFOA 3N26A 1IXGA 2XXWA 1IITA 4YMAA 1XS5A 4JBZA 1B4ZA 2DP8A 5FTHA 3JZJA 1GTKA 5FHNA 3FATA 2F7CA 1FQFA 1FTJA 2XX8A 3FIRA 3T66A 5H8SA 4MLQA 4ESXA 4F39A 2DSFA 1Y4CA 2O68A 3CI8A 4WEDA 3L6HA 1EZ9A 3DM0A 1QW0A 4Z0IA 4ZZEA 4MF3A 4M1VA 3H03A 1BP5A 4G8NA 3UIFA 4LUBA 1P1UA 1NNKA 5H8NB 3RN8A 1TFDA 2CZLA 1B3HA 1TFAA 1M5CA 4YMBA 1BKAA 3PU5A 3U8QA 2DOJA 1LB9A 5I2KA 2Y7KA 2V3UA 3IO6A 4BDLA 2GHAA 4ZEFA 3C9HA 1ZJLA 2DWAA 2R9JA 3TCGA 1FQEA 4F18A 3MPLA 1P99A 1ZMGA 1A55A 1MDQA 4ZDMA 3P7IA 5IKBA 2RKMA 3FV2A 4PP0A 3VVEA 1UTHB 3MBPA 1S50A 4ISUA 4ZE9A 1B3LA 4KD5A 3ZSFA 2QS3A 2THIA 1I6BA 1RKMA 1DMBA 1JVXA 5J1DA 2OLBA 3RY3A 1MQGA 1TT1A 4MH5A 3UN6A 4TQUQ 1MQDA 1MPBA 2ONSA 1URDA 1AIVA 5CBSA 4GLIA 3VVDA 4F3PA 5K2XA 2YJPA 2O69A 4PFYA 3KOTA 1B2HA 1LB8A 4HCWA 3DP6A 4ELQA 3EF7A 1B52A 4R2BA 2XD3A 1N04A 2HQ0A 1H44A 3USDA 1DSNA 3CVGA 5CMBA 5I56A 4I1DA 3T9VA 4OERA 3TQLA 4U22A 3G3KA 3FD3A 1SW4A 4R2FA 4DXUA 5TP9A 2UVJA 1PB9A 2AL5A 2B3BA 1MH3A 5AA3A 3U93A 3VDFA 3EHUA 2V93A 1MY1A 3A3UA 2LAOA 1FTKA 1M5BA 1H43A 3T9XB 3FXRA 3TUSA 4LA9A 4XKNA 4NF5B 4JB7A 4FE8A 1Z7ME 3MQ9A 4POXA 1M5DA 4FEBA 3GZGA 2QPQA 1N3WA 2KLFA 4ELOA 5I59B 3HCQA 3PUVE 3FJMA 4GRKA 4XKRA 1SYHA 4OTEA 3FVOA 1FQCA 5HBCA 2XXRA 3RTFB 3C34A 2ZYKA 2Y7PA 4I8CA 5KZTA 1MXXA 1MS7A 5FHMA 1N0TA 1BIYA 3G3FA 2D21A 2HXWA 2QS4A 3KZGA 3K6WA 1GR2A 4IGRA 3N5LA 4F1VA 1LBBA 1QVSA 4KFQA 3M3LA 4OFOA 4R6HA 4NTLA 5I84A 1AH5A 4XIGQ 5DVIA 1JW4A 4U4SA 4BDNA 3JYRA 4OQOA 2I6EA 3SEVA 3MW0A 2ZYNA 5JEIA 3O6HA 2X7PA 4F22A 3SERA 5AA4B 2OBGA 3ODBA 4EDPA 1PC3A 1R9QA 3RT8A 3PUYE 3TZAA 1S7YA 3PMWA 4FIMA 3TPAA 4NF8B 4KCCA 1Y20A 3S9EA 2NWJA 2ZNTA 1B7UA 1A99A 1KWHA 1MY3A 1LFHA 3LSLA 2ABHA 4DXCA 5I57A 2Z22A 1ATGA 4GOTA 2DXYA 3W15C 2REGA 2VD3A 3OD7A 4G68B 4WXJA 2Z23A 1UIUA 3HN0A 3O28A 2AL4A 5ITPA 2Z8FA 1Y4TA 1USYH 2RC9A 3N94A 2W7YA 4F19A 1P1QA 4G68C 3CIJA 4NWDA 1FQAA 3MVXA 4IO7A 4R74A 3IORA 1QJMA 3FJ7A 1PBQA 4TOZA 3MAMA 4TLMB 2O6AA 1M5EA 4OMBA 4G8HA 5KDTB 4KPTA 4NF6A 4DLDA 3SEXA 1XHYA 3SETA 2OK2A 2ZNSA 4OFJA 4NE4A 3ZKLA 1FTLA 4YKJA 5A5XA 4EXKA 1H3DA 3PD9A 3Q27A 2O84X 3ZS6A 4WEPA 2XXYA 4KHZE 4EXLA 2XXUA 2G93A 1XOCA 1DTZA 3MVZA 3I5OA 3O97A 3OMBA 1OIBA 1N7WA 1FTMA 3K1MA 3SEUA 4MFIA 1S9TA 1OLAA 3KGCA 4AB6A 3D4CA 4POWA 4ESWA 4ONYA 4YB7A 2RCAA 1NL5A 1Y3NA 3H06B 1H76A 2QL3A 4YU0A 3MP6A 4UACA 2Q88A 5DEXB 1ZU0A 2NXOA 3K6XA 1MY2A 5CC2A 2X7QA 3C32A 4NWCA 2A5TA 4QSDA 1WDNA 3GBBA 4EF2A 3V5AA 1MQHA 5H8FA 1URSA 3L6GA 2F97A 3IX1A 3A3CA 5I2KB 1MG1A 3LSWA 1N7XA 3SKPA 5B7DA 3E13X 1MXYA 3FUZA 1JVYA 3WAEA 4GQOA 1HSEA 3K2DA 2F8DA 1AMFA 4KYSA 4I62A 1B1HA 2RC8A 3G3HA 1XC1A 4EQ9A 4QSCA 1B9JA 3CG3A 4DDDA 2CMOA 4RJZA 2OWSA 3OEKA 2XXQA 4KYDA 2P2AA 3VVFA 3LSFB 2XXPA 4OHNA 1NFTA 1IXCA 2ALUA 3R7XA 3KN3A 5CMKA 4H1XA 2V84A 1ZKBA 4F3GA 1A54A 3E4RA 1OQHA 2VOZA 1LLSA 1D9VA 4G77A 4RK2A 1BTJA 3IAZA 1ANFA 4GIZA 4H6DA 3K0VA 5I2NA 4AB5A 3S9NC 4F29A 2M8CA 3SESA 3ZKKA 3PUXE 1IQ7A 4E0WA 3AXFA 3H3GA 4N6PA 1LCFA 4WKMA 3U94A 3CFXA 1LBCA 3HHFA 1P1OA 4NEDA 2Q9TA 4KI0E 3UGWA 2GH9A 4F1YA 3ECRA 1P1NA 1R6ZA 5L9SA 2F6GA 1QUIA 3O9PA 3S4UA 2V3TA 3E3KA 1O64A 4QF9A 3BFUA 3OENA 3MP1A 3IR1A 3TCFA 2RF1A 4U4XA 4PFTA 4OETA 2VP1A 3QUJA 1D3KA 2Q89A 4LZ8A 1B3GA 1HSLA 2F6PA 3G3JA 5TP9B 4PE5B 4X9TA 1T0KA 2NOOA 1Y1ZA 4R6KA 3RUMA 5B70A 1P1WA 5HM4B 3FXUA 3SDFA 1I6AA 2H99A 2X26A 2VGQA 4QFKA 1VFDA 3Q26A 3MVWA 3IK6B 2H9BA 3K01A 3QSLA 1EZPA 2O1MA 3IJXB 4P0GA 4PFWA 3MZBA 1MRPA 5DT6A 4YKKA 2HZLA 4NF4A 3T93B 1EZOA 4Q30B 3OEMA 1JEUA 4OESA 2I3WA 4FJPA 4G8MA 1NKXA 3KG2A 3TCHA 3VLUA 4BDQA 5H8QA 4EF1A 1GVCA 3PD8A 4EQ7A 1B32A 3C4MA 1SQYA 2Y7IA 3O6GA 3EPEA 3RPWA 1RYXA 3QXMA 1PEBA 3UK4A 5CMCA 3IL1B 2O1LA 2ZXTA 3T96B 4GXSB 2P0SA 2I4BA 2XXIA 2RINA 4OYVA 4N13A 3MWBA 4M4GA 3VXBA 5ELVA 1B5HA 1US5A 5I58A 3R26A 1HSJA 3S2VA 3O29A 1YPNA 2REJA 4BDMA 4ZECA 4XKPA 3E9XA 2PVUA 3O6IA 1SVXB 2F5XA 4LQ2A 4K3FA 4H0WA 3T9HB 1ZTYA 5DVJA 3DP4A 1NMUA 2XX7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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