1RYOA

Human serum transferrin, n-lobe bound with oxalate
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
324
structure length
324
Chain Sequence
KTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Metal transport
source organism Homo sapiens
publication title The oxalate effect on release of iron from human serum transferrin explained.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serotransferrin
total genus 103
structure length 324
sequence length 324
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-12-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ryoA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ryoA02
1Z7ME 1SI1A 1FTMA 3I5OA 2P2AA 3HO7A 4BDNA 1ZKBA 4NF5A 3T9XB 4GLIA 3SEYA 2H99A 1DPPA 3E3KA 4F3GA 4GFRA 2Z8DA 2RINA 5J1DA 4OTEA 3ZS6A 4XKRA 4KYDA 1MPBA 3O9PA 2QS3A 1FW0A 1JQFA 1PDAA 5A5XA 3TKDA 4R75A 5DYHA 2XXHA 3UGWA 1LCFA 3KSJA 2VOZA 4R74A 1FQFA 3QYTA 3BFTA 4PETA 4GWOA 4H5FA 4OERA 4G68B 4U2RA 3BKIB 3W9VA 3G3GA 1A8FA 1IXIA 2RF1A 1R9LA 3QIMA 4LVQA 4OZ9A 1B4ZA 4F31B 2I4CA 4G4PA 1PB9A 1MH4A 1POTA 2O6AA 4YU0A 2PMSA 3UA8A 4OXVA 5DTBA 5H8QB 1H44A 1H3DA 1I6QA 1NH7A 3IX1A 3RTWB 4NEDA 2F36A 4MBPA 2QJEA 4F1UA 2A5TB 3U93A 2Y7PA 1A99A 1EH3A 4NF8B 2OWSA 3E13X 1VFEA 4NF4B 3RY3A 4Z7EA 1IUDA 3K01A 3K6VA 4KYEA 1DTGA 3C34A 3A09A 2UVHA 2G93A 1OMPA 3OELA 1TXFA 1RYOA 1B40A 3H3GA 2RC7A 1MPCA 4PFYA 3C4MA 5CMMA 3MPKA 5H8SA 2UVIA 2XXWA 1URDA 2R9JA 5CBSA 3I6VA 3PU5A 3QXMA 4PFTA 5I58B 1NFTA 3FGSA 5JEIA 4RPOA 4EUOA 4MFIA 4RYAA 3SEXA 3V5AA 2M8CA 5JTYA 3OMBA 1QVSA 1MXWA 3MVZA 5KDTA 1Y3PA 1YPNA 5H8HA 2I3WA 3IJOB 2KLFA 1I6BA 2NVUB 4ZZAA 1Y20A 4PP0A 1OQHA 4LQ5A 4ESXA 2A5SA 1B5HA 5M2VA 2XXXA 1FTKA 4AQ4A 1B58A 1P1QA 4XTCQ 4OFJA 5AA2B 4XKNA 4G8MA 2REJA 4H67A 3OEMA 3OENA 5LOMA 3VDFA 1J1NA 2X7PA 2OWTA 3OSRA 4IO3A 1B0LA 2FYIA 1QKBA 4U1ZA 1LFGA 3G3HA 1LFHA 2PBWA 4AB6A 1R1NA 3GZGA 2F5XA 4QFPA 1GVCA 3FJMA 4DXUA 1N84A 3C36A 3CFLA 2H25A 2Z22A 1JETA 4KCDA 2HFBA 4QHQA 3RN8A 3TELA 5ICTA 1N3XA 4I9DA 4RK2A 4EQBA 5KCJA 1NH8A 2VD3A 2F6PA 2Z8EA 1Q35A 2FA7A 4FEDA 3UP9A 4HCWA 1S7YA 3U1OA 3FASA 2RC9A 2XD3A 2ZYOA 3IO6A 4OEVA 3FVNA 3IOVA 3UORA 2XD2A 1B4HA 1BP5A 3IAZA 4WXJA 1VE4A 4F29A 3TZAA 4JSOA 3Q28A 4KD5A 2UVGA 3MW0A 4U4XA 1FQBA 2PYYA 3M8UA 4ONYA 5I57A 3S2VA 3H03A 1DMBA 2XX8A 3HV1A 3SERA 2B3FA 1ZJLA 4I8CA 1ZBMA 1XVXA 3FXRA 1OIBA 4DXCA 2H98A 4TLLB 4ELQA 3HHGA 3GLBA 5L9OA 3MBPA 1Y9UA 3DLNA 3O6HA 3C31A 3T66A 4ZEKA 4GOTA 5A5XB 2Z8FA 1IIWA 1MY1A 3KN3A 1PB7A 3C9HA 3BBRA 1TFAA 4EQ7A 1EZOA 4KHZE 3G3FA 1M5FA 4M4GA 4EXKA 2PX1A 4H8JA 4QSCA 3B6QA 2Y7RA 5I59A 5BUUA 3WAEA 2O1LA 1R6ZA 4E0XA 3M3KA 1A7LA 1P1UA 3TCGA 1WODA 2OCUA 4ZE8A 2ONKE 2XX9A 2UVJA 3PUZE 3CSGA 3THIA 2F78A 2UYEA 3MZ1A 4HS7A 4HW8A 1VSOA 4XIGQ 1SYHA 1B3EA 1TWYA 3VLVA 1SW5A 1SI0A 5DEXA 4H1XA 3MZ9A 1BLFA 4WEPA 2QPQA 3D4CA 3K1PA 1PC3A 3CIJA 3MWBA 5IAIA 1IXHA 4OESA 2QRYA 3DELB 4X1BA 3JZJA 1URGA 3PPPA 1UTHA 3QUFA 4POWA 1NNFA 1EU8A 4H8IA 3IB1A 3TQWA 4IGTA 1YAEA 4QFNA 3A3CA 3MVYA 4NE4A 1LCTA 1AOVA 2F6GA 3MP1A 2NWJA 3QUJA 5JTYB 3U72A 3O28A 5KDTB 4MLQA 3N5LA 5DVFA 3H7MA 5H8HB 3TCFA 4K3FA 1B3LA 3MUQA 4LZ7A 4P0GA 2GH9A 1RYXA 4R9GA 1D9YA 1OLCA 2OBGA 4OENA 2I6EA 4XXUA 3LSLA 2F7CA 3CI8A 3V83A 1OLAA 4H65A 3DP6A 3TTKA 4R6YA 3RGYA 4UA8A 3WAFA 1CB6A 1P1OA 2FNCA 2DXYA 4DLDA 4LONB 1L5TA 4RK9A 5I2NA 1FQCA 4QRZA 3JV9A 4ZDMA 4P11A 3OD7A 2RC8A 4KQPA 1VFDA 3IOTA 3SEUA 3FD3A 2Q8JA 3U92A 4EF1A 5JK4A 4N07A 4IGRA 4TLMB 3TEPA 4YICA 3S4UA 1JEVA 2X26A 4ZZEA 4DE8A 5FHOA 2LAOA 3HCQA 4UACA 3Q25A 2AYSA 4YMBA 2HZKA 2F7AA 5KCJB 2PT2A 1MQHA 4H6DA 2DE2A 3TPAA 3FXUA 4P0IA 1TT1A 1IEJA 3LC8A 1MXYA 5AA3A 1URSA 1WVJA 2Q2AA 4ZEFA 1QW0A 1IQ7A 1JW1A 3H6TA 3RQTA 3QAXA 4OFOA 3S9NC 3IR1A 1B3HA 5FHNA 3EHUA 2I49A 1N04A 4DCXA 3USDA 4F22A 4F18A 4KR5A 2I0BA 1SW4A 1LB8A 3KSXA 3DP4A 5I57B 2DSFA 4GXAA 3LSFB 1I69A 4JBZA 3B6TA 1ATGA 3C32A 4WKMA 4FAJA 4OHNA 1S50A 3FVOA 3VFJA 3HHFA 3FJ7A 4NF6A 4G2ZA 2R6GE 3GBBA 1FQAA 2O7UA 4YZZA 2H5YA 1ZLQA 1F9BA 2O7IA 1MXZA 3UK4A 3SEWA 4F19A 5TP9A 1EZPA 3CSBA 3KJ7A 1B32A 1B51A 3PPOA 3D4GA 2RCAA 1MXUA 1ELJA 3E9XA 2XXRA 4Q5TA 2HZLA 2QMXA 3S9MC 3O6GA 1Y3NA 3KOTA 3UN6A 3O2AA 4NWDA 2AL5A 4FATA 1H43A 2VGQA 3HSTA 3DP8A 1UTBA 3K0VA 1TFDA 3VVDA 5L8DA 2B3BA 1M5DA 4JWYA 4YKJA 4JDFA 2NOOA 4F1VA 3IB2A 5DEXB 4F3PA 3PMWA 3CRBA 3H6VA 4ECFA 3IOUA 2UXAA 4U1OA 4R6HA 1B5IA 3H06B 2HCAA 2XXPA 1N0TA 1MXXA 1JNFA 2G29A 1IXGA 5CMKA 3JYRA 1BIYA 1UTHB 5KZTA 1D9VA 3IO4A 3ZSFA 4YKIA 1N3WA 5HPQA 1DPEA 1XOCA 1DOTA 2DWIA 1CE2A 1OVBA 4GXSB 3TTLA 4IB2A 1YCJA 1JW5A 4HTGA 3TMGA 3K6WA 3ZKLA 1B6HA 1GV8A 1Y1MA 4LATA 2GHAA 3SKPA 3PPRA 2HAVA 3TTNA 5EHSA 3OEKA 3U8QA 1DSNA 5CBRA 3KBRA 1M5BA 1ZTYA 2BJJX 1XT8A 1NMUA 3KZGA 3K6UA 3K1NA 3VLWA 3QK6A 5I2KA 4QFOA 4FJPA 2X7QA 1HSJA 4U23A 2GRVA 1OQGA 2I48A 3S9LC 4IY5A 5H8NA 1FTJA 4OFLA 2QS1A 4H5GA 3Q29A 3C35A 1NNKA 4N13A 4L17A 3OO7A 3MVWA 5I2NB 1MXVA 2ZXTA 3OSQA 1UIUA 1QUKA 1MY3A 1M5CA 2DYXA 4NF5B 4R73A 3L6GA 1SDXA 1Y4TA 3ODBA 1MQJA 2AIXA 3E4RA 3KJTA 2ZYMA 3TTRA 1P1WA 4THIA 4YAHX 3FATA 1OVTA 3PUXE 3TUSA 5CMBA 4C1UA 4X9TA 3PUWE 4TOZA 4LZ5A 2CMOA 1B9JA 4GVOA 2Z23A 1MPDA 2I3VA 4EQ9A 3IORA 3PUVE 1LAGE 3T96B 3C33A 3MZBA 3B6WA 2DQVA 5IKBA 2XHDA 4JWXA 4KYSA 2F7BA 1GGGA 3MAMA 5TPAA 1BTJA 1XC1A 1M5EA 3FUZA 2IA4A 4KI0E 4U4SA 2V3QA 3OOAA 3CFZA 1H76A 4KCCA 3O6IA 1O7TA 4EDPA 5CI5A 4PFUA 4YKKA 4ZEIA 1JEUA 4RPNA 1MDP1 4LQ2A 4ZEDA 2XXYA 3OO9A 4RY1A 1UIVA 3VVFA 2VD2A 1POY1 4NF6B 3PD9A 1SW2A 3RT8A 4Z0IA 3IK6B 1SYIA 4QFLA 1MH3A 5I56A 1MQIA 2ALUA 1JVXA 5HBCA 1MY2A 1P99A 1B7HA 1LLSA 3LSXA 2XXUA 5H8FA 1A40A 4BDOA 4FIMA 4R9FA 1NKXA 3VVEA 5TP9B 2WKYA 1AIVA 5AA4A 4TQUQ 2PVUA 3U94A 3FVKA 1ZU0A 3MPLA 3T9VA 3N6UA 4YB7A 3OXNA 4R72A 2DE4A 4F2OA 2OK2A 3VLUA 1UTBB 3CR9A 1D3KA 1SD3A 2ZNSA 4WEDA 3G7WA 3RT6B 3EHSA 2QS4A 5F1QA 4KFQA 1FQDA 3IB0A 2O68A 1SVXB 1NL5A 4DCYA 1Y1ZA 5DT6A 1GR2A 1LAHE 4RJZA 1LSTA 1S9TA 2R71A 3TTMA 1MQGA 5L9MA 5CC2A 4NTLA 4PE5B 4IY6A 2E1SA 4R2BA 2Y84A 1JVYA 4ZECA 1PB8A 3R6UA 1B5JA 3K02A 1US4A 3MVXA 1FTLA 3LBSA 4ZEBA 2UYFA 3LR1A 5DVJA 1N76A 4BLAA 2DWHA 3SESA 1USYH 3N26A 1FCKA 2HEUA 2QS2A 3PGFA 4FEBA 3FIRA 3G3IA 3TODA 4X1DA 2QL3A 5FTIA 3EHTA 3CG1A 2Y7KA 4Q0CA 2D21A 1B7UA 4F2QA 5AE4A 3ILUB 4Q30B 2O51A 3EN3A 1PEBA 5I2KB 4BDQA 3ECRA 2OZZA 5HM4B 3VXCA 5H8NB 3OO8A 4JWOA 3FXQA 3MJNA 4FE8A 5AA1A 1B2HA 3KEIA 3PD8A 3O97A 2V3UA 1T0KA 1B46A 4LA9A 1QUIA 1YTVA 5ITOA 3W15C 3CG3A 3R7XA 3FV2A 2PT1A 3P7IA 4ESWA 4BDMA 3N94A 2ONRA 3PMXA 2DWAA 2H4IA 5F7VA 2ZMBA 3ZKKA 1B05A 1KWHA 3TDJA 1LAFE 1LB9A 2YLNA 2P1SA 1A8EA 5ISUA 2B65A 4F39A 3L6HA 4ELRA 5EHMA 3KGCA 1AMFA 1MQDA 2ZNUA 3MC2A 2XXIA 5AA2D 4G77A 3KG2A 3K00A 2V25A 2V93A 2RCBA 1O64A 4GF8A 3RLFE 4IO7A 1SBPA 1I6AA 2GFEA 5TPAB 4U22A 2P0SA 1B3FA 4I62A 3SDFA 2DE3A 2XXQA 3SEVA 3FV1A 4ND9A 5I59B 4EXLA 5B70A 1IITA 1WDNA 4O3CA 2HAUA 2XXVA 4GRKA 4MLVA 2I58A 1JW4A 4M1VA 3N6TA 4IO4A 3CVGA 3F11A 2DVCA 1FQEA 4JXIA 3EF7A 1QJMA 4OYVA 2DS9A 2YJPA 3G3KA 3MQ9A 3K6XA 4BDRA 4DZ1A 4LP2B 1H45A 3PPQA 2ZYNA 3G3JA 4U21A 1Q1KA 5DVIA 5I56B 1N7WA 4R6KA 2CZLA 5CRYA 3MP6A 4F1YA 4MH5A 2DWJA 4IO5A 1QKAA 4GQOA 3T9UA 5K2XA 1ANFA 4XKQA 5H8FB 1MY4A 1NNPA 3UIFA 1NNTA 4GL8A 4FECA 5L9SA 5AA4B 5ELVA 1P1NA 4ZS9A 4E0WA 4ELOA 3TCHA 2Y7IA 3K2DA 2W7YA 3W9WA 2O69A 1GTKA 5ICQA 3O66A 4O3BA 2Y7WA 4RXLA 1R9QA 3RNNA 1EZ9A 3A3UA 2DOJA 3KOSA 1LAXA 1FTOA 1HSLA 1A54A 3PV0E 1MRPA 2Q9TA 4JSDA 3HPIA 1USYE 2D3IA 4Q8RA 5FTHA 1LBCA 5I84A 4FORA 3LUYA 3OO6A 2ZNTA 3IJXB 2YPNA 4BDLA 4QF9A 2AL4A 2DXRA 1B1HA 3R26A 3M3LA 2D5WA 3H4ZA 3T9HB 1N7XA 4G68A 4GD5A 3Q26A 4PFWA 4YKPA 2V84A 4IO6A 1XS5A 2ZYKA 2REGA 2Q88A 3BFUA 4GL0A 4F3BA 4I1DA 3PPNA 4NMYA 5ITPA 2ABHA 4G8HA 5CMCA 3RUMA 1HSEA 2DP8A 1SQYA 5B7DA 1MG1A 4ELPA 4YB5A 2XXTA 1AH5A 3DM0A 4OEUA 4LUBA 2F97A 5H8QA 3H6WA 4XKPA 2O1MA 3TYHA 1BKAA 3LSWA 1VR5A 4POXA 2HQ0A 3O29A 2ONSA 1RKMA 3KN7A 3PMVA 2A5TA 3IOWA 3S9EA 4H0WA 1B7ZA 4NF8A 1LGBC 4G68C 1MDQA 4NF4A 3TFLA 2RKMA 1LFIA 2QSXA 1Y3QA 4PQJA 2H9BA 3AXFA 2O84X 3ILTB 3RPWA 3PUYE 4X48A 2OLBA 3IL1B 1B3GA 4OETA 4AB5A 3KN8A 4YMAA 4DXBA 4QSEA 4C0RA 1MM6A 4O3AA 3RTFB 3SETA 1MS7A 3I3VA 2DVZA 3TQLA 3CFXA 3KFMA 4RNSA 5I58A 1ZMGA 3T93B 5CM6A 2E0SA 2HXWA 3ONMA 4ZE9A 3FVGA 2I4BA 1II5A 2QMWA 2I0CA 4OVJA 1LBBA 1Z7NE 4EF2A 2Q89A 4OWDA 4QSDA 3VV5A 4F3SA 3GXAA 4JB7A 4YB6A 2Q2CA 4DIGA 4QFKA 2F8DA 4GIZA 1PBQA 3B7DA 2VHAA 1A55A 3K4UA 2V3TA 5AA2A 4G8NA 1D4NA 4IO2A 4DDDA 4HCYA 4LZ8A 4N6PA 1XVYA 1IZ1A 1B1XA 2OJTA 5K2YA 1DTZA 3VE1B 3GBAA 1ZIUA 3Q27A 4KPTA 2ESNA 2XX7A 4NWCA 1QULA 3EQ1A 5EYFA 1O63A 3M3FA 1SW1A 4OQOA 4R2FA 2ANJA 1B0HA 3EPEA 1MM7A 4OMBA 2NUVA 3FJGA 5FHMA 3MP8A 3FZVA 1MY0A 2F34A 4C1TA 3H6UA 3VXBA 2F35A 2THIA 3K1MA 3HN0A 3TAJA 1IXCA 3V89B 2NXOA 3T22A 2IEEA 1UQWA 1PBPA 1XHYA 1B52A 3V8XB 4ISUA 2GHBA 1QUJA 2VP1A 1AL3A 1Y4CA 1US5A 4MF3A 5BWJA 3QSLA 5TU0A 4RA1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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