1MPBA

Maltodextrin-binding protein (maltose-binding protein) mutant, with arginine replacing tryptophan at position 230 (trp-230-arg)
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPRAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structures and Solution Conformations of a Dominant-Negative Mutant of Escherichia Coli Maltose-Binding Protein
pubmed doi rcsb
molecule tags Periplasmic binding protein
source organism Escherichia coli
molecule keywords MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN
total genus 126
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 1995-07-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mpbA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mpbA01
3PPRA 3C32A 2OK2A 3MVZA 1NFTA 3ODBA 5HM4B 2O1MA 1GV8A 2THIA 2M8CA 2HZKA 1ZBMA 3A3CA 2R71A 5I2NB 1LCFA 2H4IA 2V3QA 2Z8DA 2I3WA 4KYDA 2F7BA 1NMUA 4MLVA 1NNFA 4WKMA 1TXFA 3G3FA 2F36A 2XX8A 1MQJA 1FQEA 5ICQA 1JNFA 1P1UA 4H8IA 1QUKA 2G29A 2LAOA 1MDQA 3ZKKA 3T9UA 1B46A 3IJXB 1NNPA 1UTHA 3UORA 4QSCA 3VLVA 1MXVA 2Y7KA 4FEDA 1SQYA 4F29A 2OJTA 3MVXA 4GF8A 3A3UA 1H44A 3VDFA 5ITPA 3ZKLA 4LVQA 1BLFA 4OERA 3H4ZA 5I58A 3PUZE 4RPNA 2GRVA 1USYH 1R1NA 1B3HA 4QHQA 2D3IA 4M4GA 1AOVA 4JBZA 3FVNA 3RY3A 1IXHA 4G68C 1MXUA 1JETA 3N94A 5TP9A 4RXLA 4PETA 1JVXA 4F2OA 1SYHA 3QXMA 3CFZA 2QS3A 3A09A 2I3VA 1UQWA 5L9MA 3VXCA 2X7PA 3TZAA 4FECA 3BBRA 4R74A 2DP8A 4TLLB 5CC2A 1D3KA 3PUXE 1MXYA 4OESA 1JEUA 2DWHA 4ELRA 2QS4A 2F35A 2DSFA 3ECRA 3SDFA 3GLBA 2REJA 1P1WA 1POY1 2PBWA 4QF9A 1XOCA 2DWIA 4DLDA 5BUUA 3VXBA 1FW0A 3QYTA 3IX1A 3MC2A 3U93A 4AB5A 1QKBA 4YMAA 1GR2A 3TPAA 2XXUA 1DSNA 3UA8A 2Q2CA 2OWTA 3V83A 4AB6A 1A99A 5I58B 4EUOA 4IY6A 1HSJA 3LBSA 1B7UA 3EHSA 3KSJA 1LAHE 1QKAA 3K00A 4Q30B 1XT8A 2ABHA 4LZ7A 1CE2A 4LP2B 4OFOA 3CIJA 2DYXA 3U92A 4FORA 3I3VA 3IAZA 5L9OA 4GXSB 3PUYE 1QJMA 2VGQA 3TMGA 3G3HA 1I69A 1LSTA 2H9BA 3MZBA 3TUSA 5ELVA 1GVCA 1Y3QA 1YCJA 4DXUA 4R9GA 3C9HA 4DE8A 1LFGA 2DOJA 1Y1MA 2D5WA 4ZEDA 2R9JA 1N7XA 3U1OA 3B6TA 3BFTA 2I49A 3MZ9A 3GXAA 2UVHA 5FHOA 4F18A 4RNSA 3H6WA 4N6PA 4JSOA 3KSXA 2B65A 3IOWA 2UVIA 1D4NA 3TQLA 3CG3A 3O2AA 4K3FA 2F78A 3OO6A 4R75A 2PVUA 3IK6B 3K2DA 5CMBA 3B6WA 1B7HA 3C36A 1Y9UA 5B7DA 3Q25A 3K4UA 1FCKA 2I48A 4H5FA 3OSQA 2F8DA 3LSLA 3SKPA 3HSTA 1TFDA 2ONKE 5EHSA 1Z7NE 2HAVA 4QRZA 3G3GA 3FD3A 3W15C 1QUJA 3ONMA 4OQOA 3SEUA 4XIGQ 5DTBA 3S2VA 1O63A 1US4A 1DOTA 5EHMA 4OETA 4LQ2A 1QVSA 2F6PA 3OEMA 4JWYA 4F1UA 1JW4A 3K0VA 2DVCA 3TQWA 5H8QA 4YICA 5F1QA 4X1DA 3QK6A 3IO4A 3CSBA 5ISUA 4TOZA 5H8SA 1B1HA 2VD3A 2RC9A 4FAJA 3G3IA 2H99A 5I84A 3HV1A 1MQIA 4N13A 4PFYA 5IKBA 3V89B 1GTKA 1ANFA 5TPAB 1RKMA 4OXVA 3MPLA 4YKJA 3T96B 4P0GA 4PFWA 2O6AA 2YJPA 4X1BA 1Y3PA 2F7CA 1B3LA 3UN6A 4KYEA 4OENA 3O9PA 3KOSA 2H98A 4E0WA 3IO6A 1OLAA 2ESNA 2XXPA 3E13X 4BDLA 5B70A 4YU0A 5KCJA 4ZE8A 2I0BA 3KN7A 4GD5A 4IO2A 5AE4A 3E3KA 3TKDA 2HFBA 4NE4A 1SW2A 4NTLA 3PV0E 4F1VA 3PD8A 2NVUB 1H3DA 5H8QB 3MBPA 3TTMA 4ESWA 4Q0CA 3HO7A 1USYE 4ZS9A 3FXUA 4BDOA 4H5GA 3MWBA 3TODA 4NF4A 2H5YA 3T9VA 1P1OA 1GGGA 2UVGA 4G4PA 3C34A 3FJ7A 1A40A 3MAMA 2F6GA 2F7AA 3G7WA 4F1YA 3H3GA 4OZ9A 1FQBA 4KCCA 2ZYKA 3RTWB 2NOOA 4U23A 1PB7A 1ATGA 4G68A 3N26A 3IOUA 3LSXA 3CI8A 3PMXA 4IGTA 2B3BA 1F9BA 5LOMA 2DE3A 3O6IA 4GVOA 1IQ7A 3V8XB 1MDP1 4EQ7A 3RUMA 3R26A 2UVJA 3K6XA 5KCJB 4RY1A 1SBPA 1LBCA 4ND9A 4L17A 3DP6A 4XKRA 3LSFB 4AQ4A 3DM0A 3FUZA 3TCHA 4DIGA 3EPEA 4F3PA 1Q35A 5A5XA 2PYYA 1PDAA 3EHUA 2I6EA 3PGFA 1EZOA 4P0IA 1FQCA 1AIVA 4NF4B 4YB7A 4R6YA 5CRYA 4G2ZA 1IITA 2I58A 2QPQA 1B6HA 5CMCA 1Y3NA 2FNCA 3LUYA 3DP8A 5FHNA 3VVFA 3C31A 4KI0E 2FA7A 4I1DA 1EZ9A 3EHTA 4HW8A 1DTGA 2W7YA 3O28A 4GL0A 4IO7A 3RT8A 3N6TA 1SI1A 4R6HA 1O7TA 1P1NA 4G68B 4IGRA 3VV5A 1EU8A 2XXVA 3SEVA 1LCTA 3OELA 4NF6A 3DP4A 3UIFA 2XXHA 2PT2A 1I6BA 1MQDA 1ZLQA 2DS9A 4RA1A 1OLCA 4THIA 4F3SA 1B1XA 4N07A 4MLQA 5IAIA 3KBRA 4KYSA 3IORA 5A5XB 1LBBA 1QUIA 3TELA 1RYOA 3MVWA 3H6VA 2G93A 1J1NA 2Q2AA 3D4GA 2DWJA 3E9XA 3TAJA 2ZMBA 3MVYA 3K6UA 4IO3A 1MY1A 4HS7A 2NXOA 4NMYA 1I6QA 3IOVA 2ZYNA 3CR9A 4DZ1A 3IL1B 2PT1A 3OD7A 4EQBA 4JWXA 4ONYA 1D9YA 4PQJA 3PMWA 1H45A 4XKPA 2F34A 1XVXA 1JVYA 3CG1A 4R73A 3TFLA 2Q88A 2A5SA 2GFEA 2BJJX 4H6DA 5CMKA 1VE4A 4KPTA 1IXIA 4TLMB 1Q1KA 1B4ZA 3QUJA 4MF3A 4NF6B 2QJEA 2O7UA 3C4MA 1MH3A 5HBCA 3KGCA 3TCGA 3S9NC 4X9TA 2HZLA 2H25A 5JTYA 2PX1A 4I62A 1A54A 4G8MA 2XXQA 2Y7WA 3PU5A 4ISUA 2IA4A 1MPCA 3I5OA 3LSWA 1MPBA 4EXLA 3KOTA 3ILTB 3EF7A 3U72A 2OWSA 1MG1A 2CMOA 3BFUA 2FYIA 2AYSA 3QAXA 3GBAA 2I4CA 3M3FA 4HCWA 3O6GA 2V84A 2V3TA 1M5FA 3TTNA 5I56A 2XXRA 1Y20A 3GBBA 1JW1A 1S50A 2F5XA 4LONB 2Q89A 4DXCA 3OO7A 2ONRA 1OQHA 5H8NA 3I6VA 3VE1B 2D21A 4IY5A 4U22A 2Y7IA 5TPAA 4NWCA 3CFXA 2UYFA 3Q29A 4U2RA 3RT6B 2RC8A 1MM6A 3R7XA 4DXBA 1BIYA 4M1VA 5FTHA 2CZLA 2F97A 3MP8A 2Q9TA 1EZPA 1B7ZA 4ZZEA 5JTYB 3OOAA 4RYAA 3IB2A 4MFIA 1TT1A 2WKYA 4GIZA 1MM7A 2ALUA 3RGYA 1AMFA 2AL4A 4O3AA 4XKQA 4G8NA 4ZECA 1MXWA 4EF1A 3VFJA 3T9XB 1HSLA 1OVTA 3Q28A 4YB6A 3OENA 4X48A 2Y84A 5CI5A 2OZZA 1H43A 1PBPA 1M5CA 2AIXA 1SW4A 4KCDA 3H03A 5CBRA 1A8EA 1VFDA 1B0HA 1MQHA 3K6VA 4OHNA 3M3KA 1KWHA 4OWDA 2QRYA 5I56B 4ECFA 4LUBA 1MY4A 2DQVA 4OYVA 3N5LA 3T22A 3L6HA 5L8DA 1M5BA 1UTBA 1URGA 2UYEA 4XXUA 4IO5A 3FV1A 4C1UA 3O29A 1LB8A 1AH5A 2OLBA 5H8NB 3G3KA 1T0KA 1H76A 2XX7A 1CB6A 4JB7A 4OFJA 3G3JA 4C0RA 3RN8A 4U4SA 3TYHA 3FXRA 1MY0A 1NNTA 1M5DA 3S9EA 3PUWE 3IR1A 5BWJA 1NH8A 1B52A 3W9VA 1B3EA 5F7VA 1FQDA 3HHGA 3KN3A 3FXQA 5DEXA 1P99A 2XXYA 2VOZA 2OCUA 4C1TA 3HCQA 1NKXA 4F39A 4OTEA 2NUVA 3UK4A 1ZU0A 3K01A 1FTLA 3FGSA 4WEDA 4Q5TA 1DPPA 2Q8JA 3KJTA 3K1MA 4QSEA 1QW0A 5K2YA 4GQOA 1A8FA 4QFPA 1ELJA 3K1PA 2ZNUA 1II5A 2I0CA 2YLNA 1POTA 3QUFA 2REGA 1UTBB 3CSGA 2HEUA 4QFKA 3IB1A 2ONSA 1RYXA 5H8FA 4QFLA 3UGWA 1WVJA 4WXJA 4KQPA 3PUVE 4O3CA 4YMBA 2ZNTA 3SEWA 5H8HA 3SEXA 4XTCQ 2QS1A 1XHYA 5M2VA 2DVZA 4EF2A 1B40A 2DE2A 1YAEA 3O6HA 3ZS6A 2GHBA 3OMBA 4BLAA 4OFLA 1IXCA 2GH9A 4F31B 3TTRA 2HQ0A 3IJOB 1B0LA 4EQ9A 4RPOA 5DEXB 4YKKA 5CM6A 4R2BA 3RLFE 4POWA 1IIWA 2A5TA 4I9DA 4BDMA 3WAFA 1URSA 3THIA 3PPPA 5DT6A 1ZTYA 4RK9A 3OEKA 1SI0A 1B5HA 5I2KB 4LZ8A 3PPOA 1N0TA 1Y4TA 3QSLA 2ANJA 4F22A 4ESXA 3RPWA 2DE4A 5JEIA 3TTKA 1R9QA 4H65A 3C35A 3KN8A 1DPEA 2QL3A 4GLIA 3KZGA 4ELPA 3O97A 1OQGA 2XHDA 1P1QA 1B32A 3U8QA 3MQ9A 1JQFA 3KG2A 5H8FB 3E4RA 4KFQA 2VHAA 1PB8A 1AL3A 4U1OA 4YB5A 1TWYA 4GOTA 4ZEIA 4GL8A 5H8HB 2X26A 4I8CA 4LZ5A 2GHAA 1VSOA 4OMBA 3FVGA 3EN3A 4OVJA 2XXXA 1MS7A 3U94A 2HXWA 3MW0A 5I59B 1Y4CA 5J1DA 2Y7RA 4FE8A 3TDJA 5AA4A 4QFOA 3F11A 3B7DA 4E0XA 3H06B 3T93B 4DCYA 5JK4A 1SYIA 5I57A 3BKIB 3SEYA 4R2FA 5FTIA 4Z7EA 2A5TB 1N76A 3MPKA 1ZMGA 3P7IA 1MQGA 1SDXA 3LR1A 2P1SA 3PD9A 1SW5A 3OO8A 4BDRA 1A55A 1LFHA 3ZSFA 3OXNA 4TQUQ 4ZDMA 3M3LA 1URDA 5KDTA 1BKAA 4MH5A 2AL5A 1IEJA 1FTJA 4WEPA 1O64A 4EXKA 3HHFA 1B58A 1MXXA 1LLSA 1FTMA 3RTFB 5AA1A 2IEEA 1B3FA 1S9TA 4GFRA 1LGBC 3T66A 1FTOA 4DDDA 4U4XA 4HCYA 1SW1A 2VP1A 3O66A 1WODA 2XXWA 1MXZA 2V93A 3AXFA 4LA9A 3H7MA 1JW5A 5ICTA 1SVXB 4G77A 2ZXTA 1LAGE 4IO6A 1OMPA 1DTZA 1XS5A 4ZEFA 3MZ1A 1B51A 2V3UA 4O3BA 5AA4B 4EDPA 4RK2A 3KJ7A 1OIBA 3FJGA 4FJPA 3RNNA 1FTKA 1IXGA 1UTHB 1XVYA 5I57B 3TCFA 3N6UA 2ZYMA 2NWJA 1B9JA 3CVGA 4R9FA 4FATA 2X7QA 3PPNA 1LAXA 4GRKA 3SETA 1NL5A 4JDFA 1MRPA 2RINA 4NF5A 2ZNSA 4UACA 2DXRA 4YKPA 3QIMA 1YTVA 5TP9B 2HAUA 4PP0A 5KDTB 1JEVA 4FEBA 2YPNA 2HCAA 3EQ1A 3IOTA 2V25A 3VVEA 3OO9A 2XX9A 2O69A 1VFEA 4QFNA 3H6TA 3Q27A 4YKIA 3USDA 1FQFA 4R6KA 4ZEKA 3KFMA 3HPIA 4QSDA 4ZZAA 4HTGA 3V5AA 3T9HB 5CBSA 1MY2A 3MP1A 1ZKBA 2XXTA 1N84A 2XXIA 4PFTA 5L9SA 1S7YA 1YPNA 3VLUA 4KR5A 1PB9A 5FHMA 2RF1A 1B5IA 1SD3A 3VLWA 4RJZA 4XKNA 1Y1ZA 4ZE9A 2R6GE 4P11A 3TEPA 1A7LA 1B3GA 4U1ZA 4LATA 4LQ5A 1R9LA 1US5A 3DLNA 4IO4A 4DCXA 1I6AA 1WDNA 1BP5A 2RKMA 3JZJA 4NF5B 3FZVA 2O68A 2UXAA 5AA2D 1MH4A 3KEIA 3FVOA 1NH7A 3W9WA 3FASA 5DVFA 4JXIA 4R72A 3ILUB 3LC8A 4KD5A 3R6UA 2DXYA 4PFUA 1R6ZA 2RC7A 2Y7PA 1DMBA 5ITOA 3C33A 4UA8A 1PEBA 1N04A 5DYHA 3K1NA 3S9LC 3PPQA 3FJMA 2QS2A 4MBPA 1Z7ME 4Z0IA 1EH3A 4H67A 5AA3A 2Z8FA 1IZ1A 2I4BA 4BDNA 2O51A 2OBGA 1B5JA 1OVBA 4H1XA 4YZZA 1B4HA 2ZYOA 2O7IA 4NF8A 1IUDA 3VVDA 4F19A 4F3BA 4JWOA 1PBQA 2VD2A 1XC1A 2DWAA 1BTJA 3K6WA 1PC3A 4OEVA 1B2HA 4H0WA 3S9MC 2O84X 3CFLA 4NEDA 3H6UA 4ELQA 2B3FA 2KLFA 2PMSA 5EYFA 5AA2A 3S4UA 2XD3A 3WAEA 1N7WA 3JV9A 4U21A 1N3XA 1UIUA 3K02A 4ELOA 1UIVA 1M5EA 3FVKA 5I2KA 2Z8EA 2P2AA 1FQAA 1VR5A 2XD2A 4H8JA 3FIRA 1LB9A 1MPDA 1L5TA 5KZTA 4IB2A 4G8HA 4KHZE 3RQTA 3FV2A 5TU0A 3CRBA 4Q8RA 3SERA 3GZGA 3MJNA 5CMMA 5I2NA 3MUQA 4F2QA 1MY3A 2Z23A 4POXA 3HN0A 1B05A 3MP6A 2RCBA 4NF8B 3IB0A 2O1LA 4FIMA 2RCAA 5K2XA 2Z22A 3B6QA 2P0SA 3JYRA 2QMWA 5DVJA 1LAFE 3UP9A 1ZJLA 4GWOA 5HPQA 3OSRA 4F3GA 2E0SA 4NWDA 5I59A 1QULA 1N3WA 3D4CA 4OEUA 4JSDA 4ZEBA 3DELB 3TTLA 1D9VA 1TFAA 2QMXA 1ZIUA 2QSXA 1HSEA 4BDQA 3Q26A 1LFIA 5AA2B 3SESA 3FATA 5DVIA 3PMVA 3L6GA 4PE5B 4GXAA 2E1SA 4YAHX 1NNKA 3M8UA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3PPRA 3C32A 2OK2A 3MVZA 1NFTA 2FHYA 3ODBA 5HM4B 2O1MA 1GV8A 2THIA 2M8CA 2HZKA 1ZBMA 3A3CA 2R71A 5I2NB 1LCFA 1NUYA 2H4IA 2V3QA 2Z8DA 1NUXA 2I3WA 4KYDA 2F7BA 1NMUA 4MLVA 1NNFA 4WKMA 1TXFA 3G3FA 2F36A 2XX8A 1MQJA 2WYPA 1FQEA 5ICQA 1JNFA 1P1UA 3QMFA 3KC1A 4H8IA 1QUKA 2G29A 4GWYA 2LAOA 1NV1A 1MDQA 3ZKKA 3T9UA 1B46A 4PAFA 3IJXB 1NNPA 4OVTA 1UTHA 4MAGA 4O94A 4HE0A 3UORA 4QSCA 3VLVA 1MXVA 2Y7KA 4FEDA 1SQYA 4F29A 4GX3A 2OJTA 3MVXA 4GF8A 3A3UA 1FJ9A 1H44A 3VDFA 5ITPA 3ZKLA 1DBZA 3EKIA 4LVQA 2Q8MA 1BLFA 4OERA 1LBXA 3H4ZA 5I58A 4N8GA 3PUZE 4RPNA 2GRVA 1USYH 1R1NA 1B3HA 4QHQA 1LBVA 4H45A 4I3YA 2D3IA 4M4GA 1AOVA 4P1LA 4JBZA 3FVNA 3RY3A 1IXHA 4G68C 1MXUA 1JETA 3N94A 5TP9A 2P3VA 4RXLA 4PETA 1JVXA 3D1RA 2F3BA 4F2OA 1SYHA 3QXMA 3CFZA 2QS3A 3A09A 2I3VA 1UQWA 3BIHA 5L9MA 3VXCA 2X7PA 3TZAA 4FECA 3BBRA 4R74A 2DP8A 4TLLB 5CC2A 2Y5LA 1D3KA 3PUXE 1FBGA 1MXYA 4OESA 1JEUA 2DWHA 4ELRA 2QS4A 2F35A 2VPOA 2DSFA 3ECRA 1NV6A 3SDFA 1FBPA 3CHGA 3GLBA 2REJA 1P1WA 1POY1 2PBWA 4QF9A 1XOCA 2DWIA 4DLDA 5BUUA 3VXBA 1FW0A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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