3CFXA

Crystal structure of m. acetivorans periplasmic binding protein moda/wtpa with bound tungstate
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
293
structure length
293
Chain Sequence
GEVLTVFHAGSLSVPFEELEAEFEAQHPGVDVQREAAGSAQSVRKITELGKKADVLASADYALIPSLMVPEYADWYAAFARNQMILAYTNESKYGDEINTDNWYEILRRPDVRYGFSNPNDDPAGYRSQMVTQLAESYYNDDMIYDDLMLANTGMTLTTEENGTALIHVPASEEISPNTSKIMLRSMEVELSSALETGEIDYLYIYRSVAEQHGFEYVALPPAIDLSSLEYADNYSKVQVEMVNGEVVTGSPIVYGVTIPNNAENSELATEFVALLLGETGQQIFIENGQPPI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Distorted octahedral coordination of tungstate in a subfamily of specific binding proteins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords UPF0100 protein MA_0280
molecule tags Transport protein
source organism Methanosarcina acetivorans
total genus 100
structure length 293
sequence length 293
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-03-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13531 SBP_bac_11 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3cfxA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3cfxA02
1D4NA 1NH8A 3SKPA 4N13A 1B3FA 2XXQA 3C36A 4RK2A 5KZTA 3U92A 3OO6A 4IY5A 1IITA 2WKYA 2PBWA 3KOSA 1FQFA 4O3AA 3VE1B 1FQCA 1US5A 4R73A 3KOTA 3CFXA 5CC2A 2RCAA 4ZECA 4H65A 3E9XA 1PB8A 1B58A 1XT8A 4YKIA 2E1SA 1R9QA 3IOWA 3VLWA 1XHYA 1DTGA 4NF6A 3K0VA 2XXVA 3PU5A 5I59A 3GBBA 4P11A 4PP0A 1B1HA 4OEUA 1B7HA 1LB8A 3KN7A 4ECFA 2O1LA 2XHDA 4JBZA 2CZLA 4F29A 4U4XA 2Z23A 4F1VA 2O68A 3M8UA 2XXRA 4F3PA 4NF8B 4R9FA 1CB6A 5I58A 3JYRA 4FAJA 5F7VA 4QF9A 1D9VA 4RYAA 1SW4A 5KDTA 5K2YA 3VVDA 2O51A 3MUQA 2OBGA 2Z8EA 2QPQA 4R72A 3W15C 2G93A 1II5A 2XXPA 1FQAA 2I6EA 1ZTYA 1S50A 1Y3NA 5I2NB 1Y1MA 4DXCA 1QKBA 1N04A 3M3KA 3CSBA 4C0RA 1EU8A 2Z8DA 1MQDA 3O6HA 3G3FA 1PBQA 1ELJA 1MPDA 3IB0A 1RYOA 2HZKA 2ALUA 4PE5B 3ECRA 4OZ9A 3LSXA 4PFWA 5ISUA 4ELPA 1I6QA 4F2QA 3TFLA 1FTLA 4YKPA 5EYFA 5ICTA 1WODA 4QFNA 3TCHA 4POWA 1SW5A 4PFTA 3N94A 2F7CA 3M3FA 4THIA 3P7IA 1FTKA 1LGBC 1SW1A 5H8QB 4UACA 3S9LC 1URGA 1PB7A 1MQIA 4NF4A 2H99A 3FV2A 2O1MA 4BDNA 3FJ7A 1MM7A 4EF1A 2H25A 3RNNA 2RCBA 2AL4A 3Q27A 1XOCA 4NTLA 1A54A 4ZEBA 1MXUA 3MPLA 4F3SA 3G3GA 3SDFA 3RT8A 1OIBA 1F9BA 2AIXA 1GV8A 3N26A 3Q29A 3SEYA 2Z22A 2KLFA 3VFJA 3O9PA 1QJMA 2DWIA 3OENA 4YB5A 3BFUA 2DQVA 3OXNA 4XKQA 3K1PA 3KBRA 5DYHA 4QFPA 4LATA 2B3FA 1I6BA 3MP1A 4PETA 3T96B 2A5SA 1M5DA 4G2ZA 4IO3A 3VLVA 4QHQA 3U72A 4IGRA 2AL5A 2RC7A 4TQUQ 5AA4A 4XKNA 3CI8A 2H4IA 1R1NA 4DCXA 3HPIA 5DEXB 4PFYA 2OWTA 3PGFA 4I9DA 5AA2A 3O66A 5CMCA 1B46A 1UIVA 3VVFA 1GGGA 3EF7A 1LBBA 3H6TA 4GVOA 3PPRA 3VVEA 2UVGA 5I58B 5FHMA 4YMAA 1IEJA 3A09A 1B4HA 4EXKA 3S9MC 2Q8JA 2F97A 4LUBA 3OEMA 2GH9A 2B3BA 4LQ5A 4ZEKA 2OWSA 5KDTB 4JXIA 4ISUA 4DZ1A 4OWDA 2QMXA 3RTFB 3TPAA 3GBAA 1AH5A 1YAEA 4EQ7A 3JV9A 1NMUA 2UXAA 4JSDA 3R26A 4JWXA 3PMWA 1XVYA 1Y20A 1IIWA 4G68B 4DLDA 4ZEFA 1Y3PA 1H43A 3N5LA 4X48A 4EF2A 2GHAA 1NH7A 4GXAA 1B5IA 1EZ9A 4NEDA 2VP1A 4U21A 3PUWE 1OLCA 1MPCA 4LVQA 3C34A 3Q28A 1SYIA 5FHNA 4RY1A 1US4A 4ELRA 1LLSA 3FVNA 3KG2A 3MBPA 2I4BA 3IO4A 3PUZE 3OEKA 2VD2A 1QW0A 2YPNA 4YICA 1PBPA 2ANJA 5HBCA 3RGYA 3PD9A 1BIYA 3CG3A 3KSJA 2Y7WA 3MZ1A 3LR1A 1VR5A 3EQ1A 1MH4A 1VFEA 3IB2A 3C4MA 3PV0E 4NF8A 2VHAA 4OEVA 4Q0CA 3W9WA 4F22A 4FORA 1MY3A 3TQWA 3GXAA 2Y7PA 3H03A 3K6WA 3BKIB 1H44A 3OELA 4OTEA 2RF1A 1TFAA 2GHBA 4KI0E 4F39A 5JK4A 3TTKA 3MVYA 2R6GE 4YAHX 2GFEA 2P2AA 2DE4A 4ELQA 4H6DA 2THIA 1ZJLA 1A8FA 1MXXA 4JWOA 3QK6A 4HCWA 3UN6A 4EDPA 4GOTA 5I2NA 4GFRA 3B6QA 1R6ZA 2UVHA 4BDOA 3HN0A 2I4CA 4UA8A 1SD3A 3ZKKA 4YKJA 3DP6A 1A99A 1RYXA 5L9MA 1O63A 2VGQA 4U23A 1WDNA 2REGA 3IL1B 1NNTA 4U2RA 3PUVE 3FD3A 4Z0IA 3U93A 3TDJA 4H67A 4BLAA 1B5JA 1NFTA 1B3LA 2Q88A 5AA2B 2DE2A 4WXJA 4TOZA 3FASA 1YCJA 4OESA 1B4ZA 4KYSA 3MVXA 3PMXA 4YB7A 2HQ0A 3OO9A 3QYTA 1DPPA 4H5GA 4NWCA 1LAXA 2QRYA 3Q25A 1XS5A 5CI5A 3DELB 3FXRA 1H45A 4G68C 3HCQA 4R74A 1S9TA 2V93A 1USYH 1TXFA 1TT1A 4H8IA 3EHTA 3ONMA 5JTYB 5L9SA 3S9EA 2HZLA 3FVKA 1SQYA 4KYEA 3B6WA 1Y4CA 1LBCA 4RA1A 2IEEA 1N0TA 4IY6A 1BP5A 1URDA 3MAMA 4GL8A 1B32A 3T9XB 1IQ7A 3RQTA 2DP8A 4XKPA 3I5OA 4KHZE 4OETA 3Q26A 1M5FA 5FTIA 2M8CA 5B70A 1GTKA 1B52A 2OLBA 3UP9A 5ELVA 5DVJA 4H8JA 4DXBA 1QUKA 4R2BA 3T66A 5AA2D 4R9GA 2O7UA 3EPEA 4R75A 3RTWB 3F11A 3IR1A 1EZOA 5DEXA 1EZPA 3CFZA 4EXLA 4OENA 3MJNA 4I1DA 2F35A 2XX9A 4KR5A 3TYHA 3K02A 1ZU0A 2D3IA 3RN8A 4FIMA 4GF8A 3H6UA 1UQWA 3SETA 1B51A 3MW0A 4OERA 1MXYA 3TZAA 2QL3A 2CMOA 2HAUA 4IO6A 1MXVA 5M2VA 2I0CA 2XX7A 4G68A 4F3GA 3U1OA 3QSLA 1NL5A 2DYXA 3PMVA 3B7DA 4ZZEA 3FIRA 4DXUA 3R7XA 2DOJA 2P1SA 4F18A 1SI1A 3S4UA 2XXYA 5CMKA 1DPEA 4U4SA 1DTZA 2PMSA 5EHSA 2F7BA 4QSCA 1AMFA 1M5EA 4POXA 4ND9A 4WEPA 3MVZA 2X7QA 1B5HA 3HHGA 3O28A 2GRVA 3N6TA 2DVZA 3RUMA 4YZZA 3KEIA 4KYDA 3K6UA 4IGTA 2I48A 2ZNSA 1N3XA 3LBSA 5H8FA 4IO2A 1GR2A 1JW4A 2ONRA 3K2DA 4MF3A 2O7IA 2PT2A 2PT1A 1PB9A 1ATGA 3O2AA 3TQLA 1JVXA 3QXMA 4YB6A 3FZVA 3ILUB 2XXIA 4NE4A 1NNFA 3CIJA 3FXQA 1Q35A 1BKAA 3SEUA 1O64A 3FXUA 1J1NA 2B65A 1O7TA 3O29A 4GIZA 3VLUA 1IXCA 3K6XA 4LZ7A 4MFIA 1H76A 3ZS6A 4AQ4A 1NNKA 5A5XB 1MPBA 2I58A 2D21A 3EHSA 4MLVA 4FJPA 2HCAA 2ZYKA 1KWHA 4G4PA 3T22A 2QJEA 4R6YA 1Z7NE 1GVCA 5DVIA 1MY2A 4GWOA 5CM6A 3E13X 5BUUA 4FEBA 3TTLA 1D3KA 5H8NB 1HSEA 2ZYOA 3KJ7A 1DOTA 2F8DA 3E4RA 3BFTA 3T9HB 5KCJA 4LP2B 4ELOA 1FTMA 4KPTA 2I49A 4TLLB 2RC9A 1A55A 1TWYA 2V3QA 3BBRA 4KCCA 1B3HA 3O97A 1QVSA 1Y3QA 3OSRA 2DSFA 4ZEIA 1A8EA 1QUIA 4K3FA 4KQPA 2AYSA 2I3VA 3OD7A 1I6AA 5L9OA 1LCTA 4GQOA 4ZS9A 2I0BA 4AB5A 4KFQA 1PEBA 3TODA 1B7UA 2F34A 2OCUA 2FNCA 2QS4A 3T93B 1ZIUA 4OQOA 5JTYA 3KN3A 1FTOA 4OFJA 2NWJA 3MQ9A 3LC8A 1SBPA 1DMBA 1ZLQA 3KSXA 1AIVA 1QKAA 1LFHA 1HSJA 3C35A 3QAXA 3IAZA 2BJJX 5AA1A 4QFOA 3UIFA 5JEIA 4HTGA 4OXVA 2O6AA 4G8MA 2YLNA 1N7XA 1VE4A 1OVTA 1MDQA 1LCFA 3VV5A 2QS1A 1MS7A 3MWBA 1Y4TA 1ZKBA 2F6GA 2VD3A 3CFLA 3G3JA 2Y84A 1S7YA 2Q9TA 4NWDA 1JEVA 3VDFA 4BDQA 1BTJA 2D5WA 4TLMB 5L8DA 3ODBA 1ZBMA 5ITPA 2ZYNA 1MY0A 5AA3A 2O69A 4RK9A 2QS3A 3PUXE 2H5YA 3K6VA 5H8FB 4JWYA 4HS7A 5IAIA 1HSLA 3I6VA 3FJGA 2ZXTA 2ONSA 1D9YA 1MY1A 1MH3A 4X1DA 1JVYA 3CG1A 1OMPA 1SI0A 4GL0A 5DVFA 3FUZA 1SVXB 1QUJA 3IORA 2HFBA 1MQJA 3C32A 3H3GA 2W7YA 3DP8A 4M4GA 3KN8A 1IUDA 4N6PA 3MP8A 2RINA 1POTA 3H6VA 1A40A 3V89B 3D4CA 3RPWA 3IJXB 5H8HB 5KCJB 4GRKA 1N3WA 1P1QA 5FTHA 4EQBA 3USDA 3ILTB 3GZGA 3OO7A 3TELA 5ITOA 3K00A 3QUJA 2F6PA 3UA8A 3C31A 2Y7IA 4HCYA 3MPKA 4LA9A 1MM6A 4QSDA 3IOVA 4H5FA 3H4ZA 1SW2A 5I57B 4MH5A 4MLQA 3H7MA 3UK4A 4YU0A 3CVGA 3KJTA 4DE8A 4MBPA 4F19A 5TP9B 3I3VA 1P1WA 2FYIA 3TAJA 1B2HA 5CBRA 2Y7RA 1VSOA 1B05A 3MP6A 2HAVA 3G7WA 4JDFA 1B6HA 3C9HA 4FATA 3HV1A 5A5XA 2F36A 1MRPA 2OJTA 2A5TB 4ESXA 1JW1A 4RPNA 4WKMA 2F7AA 5J1DA 1SYHA 4C1UA 3CR9A 4G8NA 3K4UA 2FA7A 4XTCQ 5H8NA 2NUVA 4XIGQ 4OHNA 4Q5TA 4FE8A 3G3KA 1OVBA 2NOOA 1UIUA 1OQGA 4R6HA 3KZGA 1IXHA 3TMGA 1MY4A 1XC1A 3RT6B 1LAHE 2I3WA 3MZBA 3S2VA 1MQGA 2P0SA 3DP4A 3LSLA 4IO5A 3TTMA 3PPPA 3WAEA 1I69A 4XKRA 4X9TA 1ZMGA 1MDP1 3ZKLA 4ZZAA 1P1NA 2ZMBA 4X1BA 5B7DA 1QULA 5CMBA 4OVJA 3K01A 3O6GA 1VFDA 5HM4B 3T9VA 2DWJA 3THIA 1Z7ME 1H3DA 3V83A 1LB9A 4BDLA 2V84A 4N07A 5EHMA 3IB1A 3WAFA 1JEUA 5BWJA 4E0WA 3D4GA 4GD5A 5TPAA 3KFMA 4QRZA 4M1VA 3VXCA 3GLBA 4NF5B 1OLAA 4WEDA 4EQ9A 1N7WA 5FHOA 2QSXA 2VOZA 3UORA 2DE3A 1UTHA 4ZE8A 1NKXA 4U1ZA 4FECA 4FEDA 5CMMA 5F1QA 3TTRA 1IZ1A 3VXBA 3HO7A 1JNFA 1WVJA 1UTBB 5I56B 4F3BA 1SDXA 2PVUA 3SERA 4XXUA 1XVXA 4GXSB 4I62A 1L5TA 1FQDA 1EH3A 1A7LA 3DLNA 2UVJA 1B0HA 3TEPA 2DXRA 2ABHA 4ESWA 4OFLA 4NMYA 3RLFE 3FVGA 4KCDA 4RXLA 2Z8FA 4R2FA 3B6TA 3PPOA 3R6UA 4I8CA 3IO6A 3HSTA 3SEVA 5I2KA 3IOTA 4HW8A 3SEXA 4H0WA 1FQEA 3EHUA 2OZZA 2XXHA 4PFUA 4P0IA 1LSTA 4H1XA 3PPQA 4Q30B 4DIGA 4O3BA 1BLFA 3FATA 3C33A 2YJPA 3JZJA 1B0LA 1LAFE 2XD2A 1LFGA 2ESNA 2G29A 4QFLA 1YPNA 1RKMA 3FGSA 4YKKA 3QIMA 3LUYA 3PUYE 3U94A 3EN3A 3QUFA 4DCYA 1PC3A 4F31B 1LFIA 1CE2A 1Y9UA 5H8HA 1N76A 4P0GA 5LOMA 1MXWA 2DS9A 2V3TA 2LAOA 1FTJA 4OYVA 3A3CA 4OFOA 1YTVA 1M5CA 3MVWA 1TFDA 3OMBA 2ZYMA 4NF6B 3V8XB 4JB7A 5I59B 5DT6A 3MC2A 5I57A 3V5AA 3TKDA 3TCGA 1ANFA 2R71A 3HHFA 5TP9A 3M3LA 2ZNTA 3SESA 1IXGA 2DVCA 3LSFB 2V3UA 2ONKE 2QS2A 3G3HA 3K1NA 3T9UA 1P1UA 3K1MA 3PPNA 4IO4A 4Q8RA 1T0KA 1PDAA 2HEUA 5TPAB 2XXTA 5ICQA 2DWAA 4RPOA 3AXFA 3U8QA 1R9LA 1Q1KA 1B9JA 2A5TA 3OOAA 2XD3A 2Y7KA 4GLIA 1UTHB 2NVUB 1POY1 1JETA 2PX1A 4AB6A 1URSA 4ZDMA 3PD8A 3H06B 5I84A 2Q2AA 1JQFA 4F1UA 5HPQA 4QFKA 5H8SA 4YMBA 3G3IA 1LAGE 2O84X 4G8HA 3OSQA 4LZ5A 2E0SA 4E0XA 4O3CA 3ZSFA 1Y1ZA 1OQHA 2DXYA 1AOVA 4ZE9A 3A3UA 4BDMA 3OO8A 4C1TA 2V25A 5CRYA 3UGWA 3DM0A 3MZ9A 1MXZA 1IXIA 2OK2A 1DSNA 4F1YA 5I2KB 4JSOA 1NNPA 2REJA 4ONYA 5K2XA 4U22A 4Z7EA 1MG1A 3O6IA 4NF4B 5TU0A 3H6WA 2DWHA 1M5BA 1B3GA 4IO7A 3RY3A 4NF5A 5AE4A 2X7PA 3SEWA 1B7ZA 2XX8A 2H9BA 3IX1A 3TCFA 3IJOB 4DDDA 3TUSA 2Q2CA 1B40A 1USYE 1N84A 2XXUA 4OMBA 2QMWA 2UVIA 4U1OA 4F2OA 2XXWA 1FW0A 1P1OA 3FJMA 5IKBA 3L6HA 3FV1A 4QSEA 4RNSA 1UTBA 5I56A 2PYYA 1P99A 1JW5A 3W9VA 3FVOA 3E3KA 1FQBA 3N6UA 4BDRA 3IOUA 3KGCA 1AL3A 5DTBA 5AA4B 4ZEDA 2HXWA 3L6GA 2XXXA 2F78A 2NXOA 2X26A 4G77A 2UYEA 3CSGA 2H98A 1B3EA 2F5XA 2IA4A 5CBSA 3TTNA 2RC8A 1MQHA 3IK6B 4LZ8A 4PQJA 3S9NC 2UYFA 5H8QA 2R9JA 4R6KA 1FCKA 4KD5A 4RJZA 4LQ2A 1B1XA 3LSWA 4LONB 2RKMA 3CRBA 4L17A 4IB2A 2ZNUA 2Q89A 4EUOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1D4NA 1NH8A 3SKPA 4N13A 1B3FA 2JJKA 2XXQA 3C36A 4RK2A 5KZTA 3U92A 3OO6A 4IY5A 1IITA 2WKYA 2PBWA 3KOSA 1FQFA 4O3AA 3VE1B 1FQCA 1US5A 4R73A 3KOTA 3CFXA 5CC2A 2RCAA 5DW8A 4ZECA 4H65A 3E9XA 1PB8A 1B58A 1XT8A 4YKIA 1K9ZA 2E1SA 1R9QA 3IOWA 4PE3A 1XI6A 3VLWA 1NV1A 1XHYA 1DTGA 4MMPA 4NF6A 3K0VA 2XXVA 1IMFA 3PU5A 5I59A 3GBBA 2QVVA 4P11A 4PP0A 1B1HA 4JVCA 4OEUA 1B7HA 1LB8A 3KN7A 4ECFA 2O1LA 2XHDA 4JBZA 4PDHA 2CZLA 4F29A 4U4XA 4N15A 2Z23A 4PFBA 4F1VA 2O68A 5EQ9A 1IMBA 3M8UA 2XXRA 4F3PA 4NF8B 4R9FA 1KA1A 3T0JA 1CB6A 5I58A 3JYRA 4FAJA 5F7VA 4QF9A 1D9VA 4P1LA 4RYAA 4I3EA 4NG7A 1SW4A 5KDTA 2WYPA 5K2YA 2OWZA 2XWIA 3VVDA 2O51A 3MUQA 2OBGA 2Z8EA 2QPQA 4R72A 3W15C 2G93A 1II5A 4AS4A 2XXPA 1FQAA 1NV2A 2I6EA 1ZTYA 1S50A 1Y3NA 4OVSA 2VT5A 4HE0A 5I2NB 1Y1MA 4DXCA 1QKBA 1N04A 3M3KA 3CSBA 4C0RA 1EU8A 2P3NA 2Z8DA 1MQDA 1FBFA 3O6HA 3G3FA 1PBQA 1ELJA 1G0HA 1MPDA 4N91A 3IB0A 1RYOA 2HZKA 2ALUA 4PE5B 3HFUA 1LBYA 3ECRA 4OZ9A 3LSXA 4PFWA 5ISUA 4ELPA 1I6QA 4F2QA 3TFLA 1FTLA 4YKPA 5EYFA 5ICTA 1WODA 4QFNA 3TCHA 4POWA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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