3G3KA

Crystal structure of the glur6 ligand binding domain dimer i442h k494e k665r i749l q753k e757q mutant with glutamate and nacl at 1.24 angstrom resolution
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
256
structure length
253
Chain Sequence
NRSLIVTTILEEPYVLFKKSDKPLYGNDRFEGYCIDLLRELSTHLGFTYEIRLVEDGKYGAQDDVNGQWNGMVRELIDHKADLAVAPLAITYVREEVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKRSKISTYDKMWAFMSSRRQSVLVKSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPMGSPYRDKITLAILKLQEQGLHMMKEKWWRGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Stability of ligand-binding domain dimer assembly controls kainate receptor desensitization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 88
structure length 253
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-02-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3g3kA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3g3kA02
4WKMA 2I0CA 1Y3NA 1ZBMA 2UVGA 4BDNA 2PMSA 3EN3A 3RY3A 3H3GA 2V25A 4R6HA 1VFEA 2GHBA 4ZDMA 4QFLA 5EHMA 2BJJX 3VLVA 5TPAA 1MS7A 4F2QA 2UVJA 3SDFA 5H8QA 1P1QA 4GVOA 1FW0A 4RNSA 2O1MA 3CFLA 1BP5A 3DLNA 1S7YA 1JVXA 2RKMA 4MLQA 1POTA 3HV1A 4IO2A 4ZEDA 5ICTA 5H8HA 1N76A 4GOTA 4KYSA 4F1VA 1QUIA 5FHOA 4NF6A 3S4UA 1VFDA 4IY6A 2HAUA 1B5HA 1MY4A 1Y3PA 1IIWA 4NEDA 2DVCA 1XVXA 3AXFA 3DELB 2XXRA 4X48A 4LUBA 2V3TA 1NNPA 5CMKA 3W9WA 1OIBA 1H45A 4NF5A 3ILTB 4JXIA 1NNFA 4DE8A 4OFJA 2QL3A 2GRVA 1NFTA 4FJPA 4JWXA 2PT2A 1TXFA 3K0VA 2F7AA 5CMMA 2XXUA 4AQ4A 1ZTYA 4F39A 4KCCA 4DLDA 1DMBA 3GBAA 4F1UA 2DOJA 4NWDA 1M5EA 1WVJA 4BDMA 2G93A 5CI5A 3Q27A 3PV0E 3H6TA 2QS1A 1WODA 1B3GA 5I59B 4ZEBA 1PB7A 3MC2A 3FJ7A 5AA4B 1N7XA 2DWJA 3ODBA 3OSQA 1A40A 2F7CA 3T9HB 1H3DA 1UIUA 1LB9A 4P0IA 1MM7A 1ATGA 1HSLA 3ILUB 3WAFA 2PT1A 2ABHA 3FIRA 1VE4A 5K2XA 3FVGA 1FCKA 1Z7ME 2AYSA 1RYXA 3MVYA 3T96B 4ZE8A 1SDXA 3N6TA 1UTHA 1XC1A 4C1UA 4MBPA 1B1XA 4RA1A 3TAJA 4DXCA 3KG2A 1YTVA 3RLFE 4AB5A 4H67A 2HZKA 3W15C 3O2AA 4F1YA 4JBZA 4U21A 1CB6A 2ZYKA 3SKPA 5BWJA 3RT8A 1NNTA 3OO9A 1Y1MA 1B7UA 4ZZAA 1MDP1 2REJA 2HEUA 5I56A 4RJZA 3C4MA 3TTLA 2Q2CA 1BIYA 4F3PA 3K01A 2F97A 5KCJB 4KYDA 3MQ9A 1B4ZA 1TFDA 1ANFA 3UGWA 5DVIA 3G3FA 3K1MA 2Y7KA 1HSEA 1Y4TA 1IXIA 1P1NA 5AA2A 3TCGA 4WXJA 5KZTA 4HCWA 1I69A 1Y20A 3B7DA 4MH5A 2UXAA 4R2BA 1B6HA 4OEUA 4KD5A 5CRYA 3RTFB 4YKIA 3UIFA 1MY0A 1OVBA 4DXBA 4YB6A 3TUSA 2UVIA 4OFOA 4DIGA 1B7HA 2RF1A 4TQUQ 3K4UA 3MP1A 3TQLA 3FZVA 3UK4A 1LB8A 1O63A 4TLLB 1J1NA 4R6KA 1LBBA 4RPNA 3RN8A 3TTMA 3QYTA 1MM6A 4IO7A 3ZS6A 2AIXA 3MJNA 1N3WA 3GLBA 3RUMA 2OK2A 4GLIA 3U94A 4IGRA 1D3KA 4ZE9A 4DCYA 1XOCA 2QMWA 5TU0A 3TMGA 1P1UA 4F29A 3CG3A 4LVQA 1XT8A 4RXLA 4IY5A 3M8UA 2FYIA 2V93A 3I5OA 1PB8A 3QSLA 3G3JA 3TTRA 2R6GE 4IB2A 3U8QA 3EF7A 3FASA 3B6QA 2V84A 4GXAA 1NMUA 3FXUA 3VXCA 5H8SA 3FGSA 2D21A 3KSXA 3HPIA 1R9LA 3IOTA 5I58B 3IOVA 2F5XA 2I48A 3L6GA 3E4RA 4QSDA 2HXWA 1MQGA 1B2HA 2GFEA 2I0BA 4YKPA 3OEMA 4ZEFA 5H8NB 4C1TA 1QKBA 3S9NC 2UYFA 4L17A 2ANJA 2V3UA 3LR1A 1D9YA 4M1VA 1RKMA 1P99A 1POY1 4GF8A 3S9EA 2X7PA 3VLWA 4KHZE 2B3BA 5DYHA 3RT6B 3T9VA 5A5XB 1S9TA 2XX7A 2H9BA 4NF4B 2QJEA 3DP8A 4O3CA 3TCFA 2CMOA 1YAEA 1SI0A 1P1OA 4HS7A 2OBGA 2ZYOA 5M2VA 1IITA 5DEXA 4G68C 2W7YA 4GXSB 2LAOA 4PP0A 1XHYA 1OQHA 2QSXA 1Y1ZA 4N6PA 2GHAA 4XIGQ 1IXGA 2XD2A 4R2FA 1FQFA 2A5TA 2P2AA 2I4CA 1UTBA 2VHAA 2V3QA 3C9HA 2RCAA 4G68A 4OFLA 5DVJA 2Z23A 2XXTA 3EHUA 1R6ZA 2RINA 1N84A 2Z8EA 2QS4A 2QPQA 3U72A 1Q1KA 2OWSA 2DXYA 1OMPA 4UACA 5EYFA 3OELA 2X26A 3PPNA 1SW4A 4EQBA 1NL5A 3FJGA 5I2KB 3KBRA 4LP2B 1OLAA 3MWBA 4YB5A 2DYXA 1MQDA 1MQHA 1NKXA 2AL5A 4GL8A 1LAFE 3PU5A 5K2YA 3LSFB 4TLMB 1SW5A 3KN7A 5CMBA 1B5IA 5HM4B 2XXPA 1XVYA 2UYEA 4QFNA 3MAMA 1IUDA 1Y4CA 4PETA 3PD8A 4FAJA 2H99A 2XXQA 3PPPA 4R9GA 1A7LA 3I6VA 1MQIA 1D4NA 4I62A 2I4BA 5I57A 1ELJA 4P11A 1FQAA 3K1NA 1QVSA 1N3XA 4PE5B 1ZU0A 3EHTA 3D4GA 4BLAA 2I3WA 3HN0A 3GZGA 1US5A 1JETA 5I2NB 3S2VA 4U22A 2NXOA 1GGGA 5FTIA 1GTKA 2DWAA 4E0XA 3CRBA 4XKNA 1L5TA 1UQWA 4OZ9A 4NWCA 3GXAA 1TWYA 1EZOA 2DE2A 1H43A 3U93A 5KDTB 3N6UA 3PPOA 4IO5A 2VD2A 3OENA 3TEPA 2XXYA 4JB7A 4XKRA 2YPNA 3PMXA 1B40A 2I58A 3VVFA 4PFTA 3S9LC 3MZ1A 3CIJA 3VVEA 2FNCA 1FTMA 2IA4A 4QF9A 1B1HA 3A09A 2PYYA 3IR1A 4POXA 4WEPA 2VD3A 4FATA 4POWA 3K6VA 4Q30B 3PMWA 3JZJA 3W9VA 1N0TA 2RC9A 3OO7A 2REGA 3HHGA 2OJTA 3K6WA 3FVNA 4OETA 2ONKE 1JQFA 4H5GA 2E0SA 2Q9TA 3O29A 4OQOA 1Q35A 3H6VA 1MPCA 4FORA 5ELVA 2O68A 2XXIA 3VVDA 3TODA 3C33A 3PUWE 3VLUA 4Q5TA 3TFLA 2B3FA 2I49A 2ZNTA 4ISUA 4LQ5A 5ICQA 1O64A 3IJOB 1EU8A 3N5LA 2DP8A 1LCFA 4QFKA 2ZNUA 3C31A 3TELA 3E9XA 3MP6A 3JYRA 3MPLA 3M3KA 5AA1A 2D5WA 3VXBA 4HW8A 3H06B 4GQOA 4HTGA 2O69A 3B6WA 2OCUA 4N13A 1B9JA 3F11A 3ZKLA 2P1SA 4JWOA 3SEUA 3FD3A 4F31B 3LUYA 1MXVA 2OWTA 1LFIA 2VOZA 4NE4A 1DTZA 3VFJA 4XKQA 3RGYA 4JDFA 4G2ZA 4BDLA 5TP9B 4QFOA 3HHFA 2Y7PA 3OXNA 1ZIUA 1S50A 2YLNA 2UVHA 4LONB 4NTLA 5I59A 4KI0E 5AA4A 3FV1A 3IB0A 1MY3A 3KSJA 4BDOA 5JTYB 3PPRA 4YKJA 4G77A 3C36A 2VP1A 3KN3A 1BTJA 3A3CA 2G29A 4F18A 4ONYA 2HZLA 1QJMA 3RQTA 2O51A 3QUFA 1B0LA 5AA3A 1SBPA 2ZYNA 2O6AA 3DM0A 2DE4A 2IEEA 4ESXA 2ZYMA 3CFXA 3THIA 5ITPA 3IK6B 3SESA 5ITOA 3WAEA 1B3FA 4DCXA 3MPKA 4JSOA 4F3BA 4EDPA 2DSFA 1LAGE 3HCQA 1QKAA 2Q89A 2B65A 1JW4A 3IO4A 2XXHA 1M5BA 4R73A 4NMYA 1JEUA 4QHQA 1SYHA 3ONMA 3T93B 3UN6A 3PD9A 1YPNA 3MUQA 1A99A 3TTKA 4G8MA 1LLSA 4YAHX 3OSRA 3PGFA 1T0KA 4THIA 2XXVA 4OEVA 1SI1A 4Z0IA 3G7WA 5KCJA 2NUVA 5EHSA 4E0WA 1NNKA 1B51A 3V5AA 1LFGA 4F3GA 1JNFA 5L9MA 4PQJA 3G3IA 4ZECA 1MXYA 3EHSA 2Y7WA 3MVXA 3EPEA 3FJMA 3A3UA 1MH4A 4ZZEA 4LATA 4LZ7A 1LGBC 1IXHA 2HQ0A 2M8CA 5H8FB 4HCYA 2X7QA 2WKYA 4NF8B 3H7MA 5ISUA 3CVGA 4I1DA 2ESNA 1JEVA 4H6DA 3ECRA 3O66A 1OLCA 1B5JA 3R7XA 3FUZA 4X9TA 4QSCA 4EQ7A 5IKBA 1USYE 1LBCA 4U4XA 4EUOA 3H03A 3IL1B 5CBSA 1TT1A 4Q8RA 4OHNA 3RTWB 3CSGA 4U4SA 3U1OA 3CI8A 3O6GA 4LA9A 4PFYA 1SVXB 4Z7EA 4P0GA 1FTLA 3TDJA 3FXRA 2HFBA 5JEIA 3KOSA 4YZZA 3JV9A 2Q2AA 1QW0A 3K6UA 1PC3A 5L9OA 5I58A 3G3KA 4FECA 4EF1A 5TPAB 3MZ9A 2CZLA 3N94A 4F19A 4GIZA 4ELQA 3KOTA 3IAZA 4H8JA 2QRYA 2D3IA 5H8QB 3PUVE 3O28A 3BFUA 5H8NA 3K1PA 1DPPA 5AA2D 1ZMGA 5L8DA 4ELPA 3VE1B 2RC7A 4TOZA 1PBQA 3OOAA 1CE2A 3U92A 5H8HB 1LSTA 1LCTA 3PMVA 4YMBA 3V83A 3LSWA 4OENA 4M4GA 4RY1A 4NF6B 1M5DA 3KEIA 1H76A 2P0SA 5A5XA 3K00A 4NF4A 3OMBA 5FHMA 4U2RA 1H44A 4QSEA 4OESA 3K6XA 4F22A 1B3EA 3K2DA 4EQ9A 4GFRA 1FQCA 3KJ7A 1JW5A 1FTJA 3HO7A 1AIVA 1PDAA 2DQVA 2I6EA 4NF5B 2F78A 2XX9A 3Q28A 1MQJA 2THIA 4X1DA 3M3LA 2O1LA 1B46A 1LAHE 2A5SA 1AH5A 1R1NA 5CM6A 2RC8A 1PBPA 1SD3A 3GBBA 3UP9A 3LBSA 3IJXB 5I2KA 2PBWA 4R75A 3BBRA 1RYOA 4PFUA 2Q88A 4X1BA 3TTNA 3DP6A 1GR2A 4I9DA 4RK2A 2H5YA 1SYIA 4MFIA 3C34A 4RK9A 3TZAA 5I84A 4LQ2A 4RPOA 2FA7A 3S9MC 1I6QA 1QULA 2XHDA 2DXRA 2Z8DA 2Y7RA 1N7WA 3CR9A 1Y3QA 2R9JA 3SEWA 1O7TA 4G8HA 3O6HA 4K3FA 2H4IA 1UTHB 4WEDA 4OVJA 2H98A 4O3BA 3RPWA 4FE8A 3BKIB 5DT6A 4ELOA 1VR5A 3KN8A 1BLFA 4F3SA 4JWYA 1US4A 3M3FA 5I2NA 2QMXA 4DDDA 2RCBA 1B58A 3B6TA 4IO4A 1R9QA 1P1WA 1II5A 1PB9A 2XXWA 3OO6A 1MPBA 1AOVA 1BKAA 5IAIA 3MVZA 5KDTA 3QXMA 2ONSA 4BDQA 3QK6A 4KFQA 1B3HA 1A54A 4YMAA 1TFAA 3UA8A 5I56B 1MRPA 2ZMBA 2Z22A 5B7DA 4GRKA 3PUZE 2DS9A 3TPAA 4G8NA 4QFPA 3LC8A 3FATA 1DSNA 3Q29A 3IX1A 2Y84A 2OLBA 4DXUA 5DTBA 1SQYA 5DVFA 1XS5A 1AMFA 5AA2B 3E13X 3I3VA 3L6HA 5J1DA 1A55A 1B4HA 1NH7A 4OWDA 1B52A 1B05A 1OVTA 1IEJA 2Y7IA 4EXLA 2DE3A 4IO6A 3SEVA 2O7UA 2YJPA 4ESWA 1DPEA 1EZ9A 4R6YA 3E3KA 3K02A 4BDRA 1PEBA 2PVUA 1JVYA 4KCDA 1QUJA 4LZ8A 1A8FA 3VDFA 3DP4A 1DTGA 2R71A 4FEBA 1MY1A 4R74A 2DVZA 3OO8A 2Z8FA 1Z7NE 3KJTA 4OYVA 3OD7A 3CSBA 3SETA 1M5CA 3IB2A 1ZJLA 3H6UA 3PPQA 4QRZA 3OEKA 3T22A 3UORA 3T66A 1NH8A 2HAVA 5B70A 4U1OA 1Y9UA 1MXWA 5CMCA 4FEDA 4EXKA 1SW2A 2HCAA 4LZ5A 3PUYE 3HSTA 4YB7A 4PFWA 5JK4A 2GH9A 4OXVA 4ZS9A 5FHNA 2F8DA 4EF2A 3D4CA 2QS2A 3T9XB 2XD3A 1AL3A 1HSJA 5TP9A 2AL4A 1WDNA 3O97A 2DWHA 4DZ1A 1MXZA 1N04A 4GWOA 2VGQA 4XTCQ 1MH3A 1EH3A 4H8IA 4GD5A 1EZPA 1A8EA 3P7IA 5JTYA 3Q26A 1B0HA 3KGCA 3LSLA 4F2OA 2NOOA 3IOUA 3QIMA 2DWIA 3QUJA 4H1XA 3FXQA 2F35A 3IORA 1SW1A 3KFMA 5F1QA 2I3VA 4ND9A 1FQEA 1JW1A 4N07A 4RYAA 2ONRA 5HPQA 3MP8A 3SERA 3G3GA 5CC2A 5AE4A 3H4ZA 1MDQA 2XX8A 4GL0A 1KWHA 4ZEIA 4OMBA 4C0RA 1DOTA 2Q8JA 4R72A 5F7VA 1ZLQA 3V8XB 5DEXB 1FTKA 3MZBA 4OTEA 1USYH 4YKKA 4IO3A 4H5FA 1FQDA 1B32A 1MXUA 2KLFA 5LOMA 1MY2A 1I6AA 1LAXA 1IZ1A 2QS3A 3C35A 3H6WA 3IB1A 1QUKA 2PX1A 3C32A 2A5TB 4KYEA 4ZEKA 3FV2A 3R26A 1URDA 1UTBB 1FTOA 4IGTA 1VSOA 4G68B 4XXUA 1IQ7A 2O7IA 4U23A 4U1ZA 3VV5A 4JSDA 3O9PA 3PUXE 1I6BA 5L9SA 1MPDA 4XKPA 4G4PA 4O3AA 3IOWA 1M5FA 3MW0A 2H25A 3MVWA 4AB6A 2O84X 2F36A 4Q0CA 2ZNSA 3TQWA 3FVKA 1URSA 4R9FA 1GV8A 2F6GA 3MBPA 3FVOA 1B3LA 3TKDA 1GVCA 4MF3A 3T9UA 3CFZA 1UIVA 3IO6A 4FIMA 3O6IA 1FQBA 4ECFA 5H8FA 3ZKKA 4NF8A 4YICA 3LSXA 3SEYA 2E1SA 3G3HA 1ZKBA 4H65A 2NVUB 1OQGA 5HBCA 2NWJA 5CBRA 4UA8A 4H0WA 3RNNA 3BFTA 4I8CA 3KZGA 3ZSFA 3Q25A 5I57B 2F34A 2XXXA 3TCHA 2OZZA 1LFHA 4KQPA 3QAXA 4ELRA 1D9VA 1YCJA 5FTHA 3EQ1A 2F7BA 3TYHA 1MXXA 3R6UA 2F6PA 4MLVA 5BUUA 4KPTA 3SEXA 1MG1A 1F9BA 1B7ZA 1IXCA 3USDA 3V89B 4KR5A 4OERA 1URGA 3N26A 2ALUA 3CG1A 2ZXTA 4YU0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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