4H1XA

Crystal structure of a phosphate abc transporter, phosphate-binding protein (sp_2084) from streptococcus pneumoniae tigr4 at 1.77 a resolution
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
GTIEVISRENGSGTRGAFTEITGILKKDGDKKIDNTAKTAVIQNSTEGVLSAVQGNANAIGYISLGSLTKSVKALEIDGVKASRDTVLDGEYPLQRPFNIVWSSNLSKLGQDFISFIHSKQGQQVVTDNKFIEAKTETTEYTSQHLSGKLSVVGSTSVSSLMEKLAEAYKKENPEVTIDITSNGSSAGITAVKEKTADIGMVSRELTPEEGKSLTHDAIALDGIAVVVNNDNKASQVSMAELADVFSGKLTTWDKIK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of a phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein (SP_2084) from Streptococcus pneumoniae TIGR4 at 1.77 A resolution
rcsb
molecule keywords Phosphate-binding protein pstS 2
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Streptococcus pneumoniae
total genus 76
structure length 257
sequence length 257
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF12849 PBP_like_2 PBP superfamily domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4h1xA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4h1xA02
4QFLA 4GXSB 1MPCA 4GLIA 2DE3A 3ILUB 3TAJA 4U4XA 4G8MA 3MBPA 3EHTA 4I1DA 1LB9A 1VSOA 3VVEA 1NFTA 4FECA 2PT1A 2ZNSA 2Q8JA 4NWDA 4JB7A 2FA7A 3OD7A 3T9HB 2R9JA 2DQVA 2OBGA 1MDP1 1MDQA 4E0XA 3O6GA 1R1NA 1FQFA 2ESNA 1DPPA 3MJNA 2XXQA 2Q9TA 4YMBA 1N04A 3VFJA 3FD3A 5H8SA 4JWXA 2Q2CA 3IB2A 1ZBMA 3UGWA 3ZS6A 2NXOA 2XXVA 3BBRA 1RYXA 4R73A 1TT1A 3MZBA 3CG3A 1UTBA 3O2AA 4F3GA 5TPAA 3PUZE 1II5A 4G77A 4R72A 1I69A 3KN7A 5IKBA 3MP1A 1A54A 4U4SA 1GTKA 2QMXA 3ODBA 4YZZA 1P1QA 1MXXA 4OFOA 5I59B 3TFLA 1Z7NE 4ECFA 1POTA 1XVYA 4BDQA 1CE2A 4KI0E 4ELOA 3C36A 4GL0A 4DXCA 2KLFA 3UA8A 4I8CA 1MG1A 2V84A 2REJA 3KOTA 3ILTB 3C34A 1URDA 2VP1A 1B40A 4XKQA 3OSQA 1IXGA 3EQ1A 3U72A 1JETA 1OVBA 3MAMA 3WAFA 4O3BA 1ATGA 3BFUA 1GR2A 3THIA 3TELA 4Q8RA 4WEDA 1OQHA 5H8FB 1QUIA 1O63A 3H6VA 3K00A 1TFDA 3GXAA 4GWOA 4DCYA 3JZJA 2OLBA 1FTOA 3H03A 3H06B 3R26A 1I6AA 2OJTA 3FVKA 3G3KA 4OXVA 1P1NA 1A8FA 4NE4A 3UP9A 4M4GA 1LAHE 3H6TA 4EQ7A 4MLQA 4NF8A 3IL1B 3MZ9A 3A3UA 3L6GA 2DS9A 2O51A 2ZXTA 1J1NA 4NEDA 1NL5A 4ND9A 3O28A 3TYHA 1ANFA 1MXWA 1QUKA 1BTJA 2HAVA 1SI1A 4NF4A 4UA8A 1H3DA 5CMKA 3QSLA 3U94A 5FTHA 3MVYA 3KG2A 2RCBA 3K6XA 4JSOA 1L5TA 3QUFA 2O69A 1ZKBA 5KCJB 4AB5A 2THIA 1B7HA 3SKPA 1P1WA 4WXJA 3K1PA 1MXYA 3PU5A 4ELRA 3TDJA 3T22A 2DE4A 2ONRA 4POXA 3VLUA 1ZJLA 4OENA 3W15C 1T0KA 4R75A 3M3FA 1JVYA 4TQUQ 1UIVA 4OZ9A 1OIBA 5CBSA 1A8EA 1N76A 2O1LA 4GD5A 4QSEA 1FQAA 5H8QA 4DDDA 4F3BA 2IA4A 4OWDA 2G29A 2ZNUA 4XXUA 3FATA 3IX1A 4U21A 4K3FA 1SW1A 3TTRA 4U1ZA 2UYFA 3K2DA 2NUVA 1B6HA 2DWJA 1US5A 2DP8A 3MWBA 3QK6A 2Z8DA 1FCKA 3VLWA 3R6UA 4JWYA 4MH5A 3TPAA 3H7MA 1A99A 4FE8A 1UTHB 1B05A 2F6PA 1ZTYA 4TLMB 1VFDA 2XXRA 3PPQA 2H4IA 4E0WA 1PBPA 1B4HA 1AIVA 5HPQA 2DYXA 2PMSA 2QS1A 3U1OA 3CFXA 4YAHX 3IOWA 1TWYA 3UIFA 1DTZA 3WAEA 3SEUA 4KPTA 4LP2B 4RPOA 3MW0A 3N26A 4YICA 4ZEFA 4R6YA 4PE5B 3G3JA 5I2KB 2QS4A 4G68C 5H8NB 5KDTA 4XKRA 2HQ0A 4PQJA 1LFIA 4KCCA 2HEUA 2XXUA 1MM7A 1SI0A 3CIJA 4HCYA 3G7WA 4BDRA 4P0IA 3GBBA 5J1DA 1YTVA 3KSJA 2VOZA 5AA2D 5TP9B 5BWJA 3U8QA 3ZKLA 3HSTA 2ZMBA 3W9WA 4IY6A 3MP6A 3VVDA 1URGA 3C35A 4LUBA 3C33A 1XHYA 1MY4A 4LZ5A 1DPEA 4Q30B 3EF7A 1Y3QA 5I59A 5AA3A 4G8HA 3IORA 1QW0A 4N13A 1A7LA 2F35A 3SETA 3K4UA 5CMBA 3W9VA 1USYE 3FVOA 4EF2A 1NNTA 2G93A 4OERA 4GOTA 3VV5A 4X9TA 5I2NB 1SQYA 4G8NA 5K2XA 1VR5A 4HCWA 2I4CA 2OK2A 2O84X 2W7YA 3IOUA 5L9SA 4OETA 2PYYA 1LSTA 4FIMA 3MPLA 2PVUA 4F2OA 2Y7WA 1M5DA 1LAXA 4GQOA 4EF1A 1B3FA 3B7DA 1FW0A 3KEIA 3S4UA 5L8DA 5I57B 5CC2A 5DVFA 4F39A 2XXHA 1SVXB 3DM0A 3O97A 4KCDA 3RLFE 3PMXA 4RK2A 1Y20A 1N3WA 1O64A 5AA2B 4C1TA 2QMWA 3N5LA 2H25A 5AA4B 4G68A 4OTEA 2AL5A 1H76A 3CSGA 2DOJA 4TOZA 4QHQA 1MY3A 3PUWE 1OLAA 3FJMA 4X1BA 2AIXA 3K01A 5ICTA 1B1XA 3KJ7A 1MM6A 4OESA 3SESA 4F22A 2QL3A 3KN8A 4OQOA 4PFUA 4ISUA 4YU0A 3TEPA 2B3FA 2Q89A 3MQ9A 3RTWB 1HSEA 3OEKA 4ZS9A 3OSRA 4R74A 3SEYA 3O66A 5HM4B 2WKYA 2R71A 3R7XA 2NOOA 4I9DA 4U2RA 4P11A 1MH3A 4GRKA 3OO6A 1EZOA 4ZZEA 5I56B 4QFKA 2V93A 2HXWA 3C4MA 1NH7A 2DSFA 4RXLA 1I6QA 1IXCA 3E4RA 2HZKA 3T9UA 2GRVA 4F1UA 1MH4A 4P0GA 2GH9A 1WVJA 1D9VA 4IO4A 1RKMA 1SD3A 2DVCA 3FJ7A 4RJZA 5FHOA 4H1XA 4N6PA 3JYRA 2ONKE 4R9GA 3RQTA 2A5SA 1VE4A 3C32A 3E13X 2F6GA 2M8CA 2A5TA 3E9XA 1OLCA 3LR1A 2NWJA 2REGA 1VFEA 4UACA 4NMYA 1IUDA 2I4BA 4PFTA 4GVOA 4RK9A 3MC2A 4KR5A 3FXRA 2OZZA 3AXFA 4X48A 3K02A 1QKBA 3QYTA 4OFJA 3PPPA 4KD5A 4NF5A 1PBQA 1HSLA 4F1VA 5KZTA 1YCJA 3UORA 4GXAA 5BUUA 3CSBA 2UVHA 4H8JA 1SW5A 1RYOA 5AE4A 2X7QA 1Q35A 2YLNA 4ZEBA 1D9YA 1D4NA 1EH3A 2I0CA 5ITPA 4F1YA 4RPNA 3RT8A 3FUZA 2QS3A 1EZPA 1N0TA 1MQJA 1B5JA 1Y4TA 4GFRA 3S9EA 2PBWA 4OHNA 1B46A 2Q2AA 3RN8A 5B70A 1B2HA 4G2ZA 1AH5A 1KWHA 3K6VA 2UVJA 4YB7A 2RC9A 3PUVE 2P1SA 3TQWA 2D3IA 4F31B 2D5WA 3M3KA 4DCXA 1MS7A 2RC7A 1Z7ME 4RA1A 5H8NA 1TFAA 5ICQA 1B3LA 1Y9UA 2HFBA 2O68A 3MVXA 3EN3A 1DSNA 4NWCA 5A5XA 5LOMA 4WKMA 1JNFA 4H0WA 2XX7A 3V5AA 2Y7KA 1SW4A 2H9BA 2F97A 1ZMGA 3PD8A 1AMFA 4RNSA 1Y1ZA 1MQGA 1B9JA 5FHMA 3H6UA 1IXHA 4G4PA 4DXBA 4H8IA 4DIGA 5ITOA 3A3CA 3M8UA 1WDNA 3Q27A 3L6HA 1XS5A 1XC1A 2H98A 3S9NC 3FV2A 5CMCA 1B51A 3S9LC 2F78A 2OCUA 3PD9A 3HV1A 3VVFA 3TTKA 3VXCA 1A55A 1MPDA 5I2NA 1FQDA 1SBPA 2ZYKA 3RUMA 3MVZA 1UIUA 3VLVA 3CG1A 3LC8A 1NNKA 2Z8FA 3PPRA 1Y3NA 3KN3A 1P99A 2Y7IA 2DE2A 2V3UA 2XXTA 3O29A 1Q1KA 3VE1B 1FTJA 4IO3A 3Q26A 5I57A 4IO7A 1MQDA 5L9MA 4PETA 4PFYA 4QSDA 4ZEIA 3PPOA 4DZ1A 3HN0A 1NMUA 3T9VA 1IEJA 2DWAA 1N7WA 4ZECA 2IEEA 1B32A 3DP6A 1LFHA 3LUYA 2ZNTA 4OYVA 1MQIA 2F5XA 5AA4A 3FVNA 1XT8A 1US4A 5IAIA 1OVTA 3G3IA 5EHMA 3HCQA 4EDPA 3H4ZA 3FXUA 2RINA 1LAGE 1MXUA 3TCHA 4ZEDA 2GHAA 4NF6B 3TKDA 4R6HA 1PB9A 1USYH 3OO8A 4F19A 3BKIB 1A40A 5F1QA 4KYEA 4Z0IA 1S7YA 4WEPA 3KZGA 5HBCA 4IY5A 3DP8A 4FORA 1PC3A 2ZYNA 1B3EA 3OEMA 3MUQA 2Z22A 5CM6A 4QFPA 4LONB 1TXFA 4H6DA 1MY0A 3IJOB 1FQCA 1XOCA 2P2AA 4NF8B 1LCTA 3A09A 3QXMA 2V25A 1QUJA 4THIA 1BKAA 3EHUA 3H3GA 1H44A 1S50A 3PUYE 1GGGA 3HO7A 4I62A 5I58B 3K6UA 3Q29A 2I6EA 2QJEA 4ZEKA 4DXUA 3SDFA 1FQBA 2UYEA 2XXYA 3N94A 2E1SA 4NF4B 2RC8A 4YB6A 3IR1A 1QJMA 1AOVA 4IB2A 3RTFB 3IOTA 2HZLA 2ZYOA 3N6UA 4IO2A 3OXNA 4MFIA 4TLLB 4FJPA 5ISUA 3IAZA 1DMBA 2UVGA 1B0HA 3EPEA 4H5FA 1NKXA 3F11A 3PPNA 3PGFA 4ONYA 1B4ZA 5ELVA 3MPKA 3V8XB 2O1MA 4AB6A 2I48A 2X7PA 4IO6A 3RNNA 3KJTA 1LCFA 4R2BA 1PB8A 2RKMA 1M5BA 4MBPA 3TODA 1JEVA 3ZSFA 3IOVA 5JEIA 2XXXA 5JK4A 1MY2A 4C0RA 1B3HA 5H8FA 3LSFB 1R9QA 5TU0A 5H8QB 4H65A 3SEXA 4GL8A 4X1DA 2Y84A 3OENA 4ELPA 2Z23A 5H8HB 4R9FA 1N3XA 5M2VA 4U23A 2B3BA 4H5GA 3RT6B 5JTYB 4ZZAA 3FGSA 2UXAA 2LAOA 1ZU0A 3UN6A 4BDLA 1H45A 3I6VA 4R6KA 1B5HA 2O7IA 4IO5A 3C9HA 2I58A 1JW4A 4GF8A 1FTLA 3U93A 2FNCA 4POWA 1MXVA 3TZAA 1IIWA 4OEUA 1IITA 1NH8A 4C1UA 4KYSA 5CMMA 4F29A 3PMWA 1R6ZA 2PX1A 3G3GA 3T96B 4FEBA 4QFNA 3I3VA 2F34A 4JBZA 1F9BA 5KCJA 2DWHA 1EZ9A 2Z8EA 1R9LA 3OO7A 2QSXA 3E3KA 5KDTB 2QPQA 3TCFA 3VDFA 4YKJA 3FZVA 1I6BA 3GBAA 2VHAA 1B52A 3TCGA 2V3TA 1NNPA 3KFMA 2P0SA 5CBRA 3D4GA 1WODA 5DVJA 4JSDA 4KQPA 4IGTA 3RGYA 4RY1A 2PT2A 1B3GA 1P1UA 3K0VA 1IXIA 4U22A 4GIZA 3ZKKA 4QSCA 5DT6A 4F2QA 3Q28A 4R2FA 1MY1A 1PDAA 3KSXA 2XD3A 3T9XB 1B5IA 1MQHA 2F7BA 4YB5A 3M3LA 4F3SA 1B1HA 2FYIA 1MXZA 3VXBA 4YMAA 3B6WA 2VD3A 1B7UA 2RCAA 1UTHA 3UK4A 3S9MC 4N07A 2E0SA 3I5OA 4FAJA 4XKPA 2I0BA 4JDFA 4MF3A 1UQWA 4QFOA 4NF6A 3IB1A 3T93B 4EXKA 3O6IA 4YKKA 3CFLA 4F18A 5CRYA 5I84A 4RYAA 3QIMA 4LVQA 2HCAA 3JV9A 3CFZA 1SYHA 5I2KA 1ELJA 1JQFA 2GFEA 3H6WA 2AYSA 3CVGA 5DEXB 1P1OA 3TTLA 1FTMA 5FTIA 1D3KA 2F7AA 1YPNA 2ABHA 4G68B 1DTGA 1ZLQA 4JWOA 1Y1MA 1CB6A 2VGQA 1ZIUA 4FEDA 2Y7PA 1SW2A 1IQ7A 1Y4CA 1MRPA 5I58A 2OWSA 1PB7A 3LSWA 2XX8A 5TP9A 2XD2A 1AL3A 3TUSA 3B6TA 2YJPA 3DELB 1OMPA 4U1OA 3TTNA 3K1NA 2F8DA 3IO6A 4HW8A 3MZ1A 4PP0A 3OMBA 1GVCA 3V83A 3SEWA 1NNFA 3PV0E 3EHSA 3DLNA 4XKNA 2X26A 3MP8A 1QULA 3SERA 4O3AA 4LQ2A 3USDA 1H43A 4ELQA 1N84A 3CRBA 4NTLA 1S9TA 4KFQA 2V3QA 4F3PA 4Z7EA 1LB8A 3IO4A 2Q88A 1UTBB 3FJGA 2XHDA 5TPAB 2ALUA 2A5TB 5K2YA 3IJXB 1BIYA 5B7DA 1O7TA 4YKPA 4Q0CA 2D21A 3HHFA 4FATA 3FV1A 4OVJA 3TTMA 2F36A 3QUJA 1FTKA 1EU8A 2QRYA 2NVUB 2RF1A 4QF9A 2O6AA 3S2VA 3TQLA 4M1VA 4HS7A 5H8HA 4O3CA 3KBRA 3G3FA 4ESWA 4Q5TA 1GV8A 5JTYA 3G3HA 2ANJA 1MPBA 2B65A 4LA9A 4ESXA 4LATA 1LFGA 5AA2A 4NF5B 4QRZA 1SYIA 3LSLA 1URSA 2ZYMA 3OOAA 3LSXA 4LZ7A 2HAUA 1BP5A 3KOSA 3O9PA 4OEVA 5EYFA 4JXIA 1B0LA 4PFWA 5AA1A 3P7IA 3OO9A 4IGRA 5DYHA 3CR9A 5DTBA 2I3WA 4LZ8A 1PEBA 2I3VA 3DP4A 3FVGA 4BDNA 1XVXA 3K6WA 1Y3PA 1JW5A 1QKAA 5I56A 1M5EA 4KYDA 4ZDMA 3OELA 3TMGA 2BJJX 2DXRA 1N7XA 1JVXA 3U92A 4EQBA 4ZE9A 2CZLA 2VD2A 3N6TA 2YPNA 5DVIA 1M5CA 2DVZA 2AL4A 2GHBA 5A5XB 3PUXE 5EHSA 3O6HA 2CMOA 2DWIA 4EXLA 5L9OA 1LBBA 1LLSA 3D4CA 4H67A 3GLBA 3K1MA 3Q25A 2UVIA 1JEUA 2DXYA 3ONMA 3B6QA 3C31A 1LBCA 1FQEA 1SDXA 3IB0A 1POY1 2H5YA 4BDOA 1B58A 3FIRA 3T66A 3HPIA 2R6GE 2XXWA 2H99A 3FASA 5CI5A 1HSJA 4DLDA 4OMBA 2Y7RA 3RY3A 3BFTA 3ECRA 2XXPA 3GZGA 3PMVA 4YKIA 1OQGA 3LBSA 1IZ1A 4HTGA 2XX9A 2ONSA 4XTCQ 4ZE8A 4DE8A 3FXQA 4BDMA 1QVSA 1JW1A 3SEVA 2OWTA 3QAXA 2QS2A 2XXIA 3KGCA 1LAFE 4KHZE 4MLVA 4AQ4A 1LGBC 4XIGQ 1DOTA 3V89B 1BLFA 4EQ9A 3IK6B 3MVWA 4LQ5A 4OFLA 5F7VA 4L17A 2F7CA 1YAEA 2O7UA 1M5FA 2I49A 3RPWA 5DEXA 5FHNA 4BLAA 4EUOA 1B7ZA 3HHGA 3CI8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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