4NE4A

Crystal structure of abc transporter substrate binding protein prox from agrobacterium tumefaciens cocrystalized with btb
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
281
structure length
281
Chain Sequence
AQVVVSSKIDTEGGVLGNIILAVLNQNKIETTDRIQLGATPVVRKAITAGEIDIYPEYTGNAAFFFSKADDPLWKDAAKGYEEAKTLDYDANKIVWLAPSPANNTWAIALRKDVADKNNLKTLSDFGKYVAGGGTVVLAASSEFVNSAAALPAFQTTYGFTMKPDQLITLSGGDTAATIAAAANQTNNANAAMVYGTDGGIAPSGLVVLEDDKHVQPVYQPAPIIREEVLKKHPNIEELLKPVFEKLDLATLQDLNARVQVGGEQAKTVAMDFLTKNGFAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
source organism Agrobacterium fabrum
publication title Crystal structure of ABC transporter substrate binding protein ProX from Agrobacterium tumefaciens cocrystalized with BTB
rcsb
molecule keywords ABC transporter, substrate binding protein (Proline/glycine/
total genus 102
structure length 281
sequence length 281
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04069 OpuAC Substrate binding domain of ABC-type glycine betaine transport system
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ne4A01
3.40.190.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Osmoprotection protein (prox); domain 2 4ne4A02
5ITOA 3ZS6A 3EHUA 4MH5A 2DS9A 2CMOA 2PX1A 4HS7A 4R75A 5H8QB 3M3FA 1T0KA 5HBCA 4ELQA 3T9HB 4NF6B 3PUYE 4NMYA 2G93A 2XXRA 2RC9A 1BKAA 1LCFA 2RCBA 3L6HA 5DTBA 5K2XA 2UVGA 5I2KB 1IEJA 4THIA 4OYVA 1MDP1 4EQ7A 1NNFA 3TAJA 3MQ9A 1WDNA 2I3WA 3IR1A 2B3BA 5EHMA 1FTKA 1LB9A 2XHDA 1F9BA 4I1DA 4WEDA 1N7XA 2O1LA 2O6AA 3PUZE 1UTHA 1HSLA 2O51A 2O68A 4GWOA 1Z7ME 5AA3A 2DWHA 2A5SA 1VFDA 3TTNA 2PT1A 3I5OA 4G8MA 1UQWA 3FJ7A 2DWAA 1JETA 2A5TA 4TOZA 1H44A 4HCWA 3PPNA 1IXHA 1B52A 1YTVA 2GH9A 1HSEA 1DPEA 1SI0A 1XC1A 1QULA 1XVXA 1ELJA 1NKXA 4F22A 1B3GA 4BDOA 3N94A 4LVQA 3G3FA 3MP1A 2H9BA 2HCAA 3K6XA 4NWCA 3E4RA 4M4GA 3H3GA 3FXQA 1LAHE 1B7UA 4GD5A 4NTLA 1MXWA 5JTYA 3KN7A 3C36A 5H8FA 3TKDA 4HW8A 5I2NB 1O7TA 3KN8A 3TTMA 3BKIB 2XD3A 4C0RA 3PPOA 3LSLA 1N76A 4FIMA 1SBPA 1MRPA 3TCGA 3PUXE 3A3UA 2QL3A 1ZTYA 4IO2A 4FJPA 4RYAA 3H4ZA 3MBPA 3N6TA 4P0IA 2FNCA 3B6QA 1IIWA 1SYIA 3O97A 1B3HA 3CI8A 5ICTA 5M2VA 3PMWA 4Z7EA 2DE2A 2OCUA 3VXBA 1SYHA 4F3PA 5H8HA 4YICA 3K0VA 3FXRA 2D3IA 5HM4B 4GL0A 2B3FA 1MQDA 5CI5A 3MAMA 1IITA 1PB7A 3RPWA 5AA2B 4GIZA 2V25A 2KLFA 2OZZA 3RY3A 3H03A 2V84A 1B46A 3ZKLA 4IGTA 4ZE8A 3MWBA 1LGBC 3VV5A 1OQGA 3TELA 4DE8A 3VE1B 5JEIA 2F78A 2QMWA 2X7QA 1YAEA 1N7WA 4F19A 2I0BA 3C35A 1QVSA 4JSOA 3D4GA 1ZKBA 1B3FA 3P7IA 1A7LA 1MQJA 4GL8A 4OEUA 1TFDA 4DCYA 4R72A 4EF1A 1D4NA 3CFLA 3T9XB 4G68B 1LFIA 4YB5A 3E9XA 3IK6B 4O3BA 3K6VA 3OSQA 4ELPA 5AA2D 2E1SA 1NL5A 2Y84A 4YMAA 2XXWA 4ZZAA 1AL3A 1MPDA 3G3KA 3OOAA 3QXMA 2IA4A 3U93A 2VOZA 3VXCA 4TLMB 2OWSA 1OMPA 1II5A 3PGFA 4ZECA 3LSWA 1Y4TA 2AIXA 4FAJA 3CFZA 2HXWA 3QK6A 4X48A 3K1NA 3UK4A 2ALUA 3OELA 4Q8RA 1XS5A 1B9JA 2REJA 2UYFA 3TZAA 5TP9A 1USYH 4OWDA 4N13A 3MP8A 4NF4B 2V3TA 1R6ZA 3T66A 2QS4A 1OIBA 3ECRA 3IB1A 2PYYA 5FTHA 3TYHA 3TFLA 2OBGA 1QUJA 5I59A 4ISUA 1DTGA 2VHAA 4DXUA 4RY1A 2A5TB 4BDMA 2NUVA 2XD2A 3VDFA 2XX8A 4G4PA 3MVYA 1A54A 3IOTA 4R6HA 4XKQA 3T93B 4F1YA 4ESXA 2DWIA 3U1OA 5CC2A 1MY3A 1P1WA 3THIA 1N04A 1Y4CA 1H45A 5B7DA 2O7IA 2ZYMA 4AQ4A 3G3HA 4QFNA 4U1ZA 1A40A 5CBRA 4OQOA 2DE3A 3SESA 1TT1A 4L17A 3I3VA 1MXYA 3KJTA 2ZMBA 2GHAA 1B7ZA 1SDXA 2DVZA 4E0XA 3HV1A 3IO4A 4NF5A 3EHTA 1FQFA 4EDPA 2I3VA 4ZEFA 1D9YA 5AA4A 3K00A 5FHNA 4OMBA 2ESNA 3FUZA 2NWJA 3T96B 5I57A 3A3CA 3CIJA 1B7HA 1S9TA 1B3EA 3IOVA 4E0WA 2QJEA 2ONRA 1PBPA 4LZ5A 4NE4A 1DOTA 1QW0A 3T9VA 5K2YA 1NH7A 2UVHA 1O63A 2H5YA 5KDTB 3DLNA 1B40A 4FE8A 3FVOA 4F1UA 4R2BA 2NXOA 5H8HB 4KHZE 3QUJA 1EZPA 3O9PA 4OFJA 1GGGA 1A99A 2ZYOA 3Q27A 2ZNSA 3VLWA 1JQFA 2E0SA 1N84A 4U4SA 3HSTA 3CFXA 1B0LA 1UTBA 2Z8DA 3W9WA 4IY5A 3HHFA 3T22A 3U8QA 1ZMGA 3QIMA 3HHGA 1NH8A 5FTIA 4AB6A 1RYOA 3EPEA 3TODA 4U2RA 5CM6A 1P1UA 2Z22A 3FJMA 4DIGA 4GRKA 3USDA 3C33A 4IO6A 2Z23A 5HPQA 1POY1 3Q28A 1ZLQA 3RQTA 1NNTA 4EQ9A 1SW4A 5AE4A 2O7UA 3MJNA 4RJZA 5DEXB 2THIA 4XIGQ 3FV1A 1I6AA 4BDNA 4XTCQ 4XKPA 3GXAA 1FTOA 1D3KA 3MPLA 1GVCA 4LONB 3O6HA 4H6DA 2I6EA 4BDRA 3CSBA 4ND9A 1WVJA 3OO7A 3OMBA 4YB6A 1QKBA 3FVGA 3K02A 2Y7KA 3HCQA 3H6TA 1DMBA 3EHSA 5KZTA 4FEDA 1RKMA 1B2HA 2OLBA 4GFRA 2DE4A 3O29A 4GF8A 1M5FA 4G8HA 1H76A 5L9OA 3HPIA 1MQHA 5AA1A 5F1QA 1MH4A 3SDFA 2VGQA 5CMMA 3MC2A 3T9UA 4HTGA 3FV2A 4DXBA 1B6HA 4LATA 3JZJA 5EYFA 1MPCA 3W15C 2QS3A 3FGSA 4H67A 4JSDA 4OESA 5A5XB 4LZ7A 4TLLB 5I59B 3EF7A 4ELRA 1B0HA 2GHBA 2LAOA 4QRZA 4IO4A 1VR5A 3OO9A 1URDA 2DVCA 1B5HA 2I58A 1FCKA 2I4CA 1FQDA 4NEDA 4IY6A 4ZZEA 4RK9A 1H43A 4JWYA 4G2ZA 1M5DA 5I56B 3U94A 4K3FA 4GOTA 4WEPA 4F3GA 2P2AA 2YJPA 1XT8A 4WXJA 1B58A 3IB2A 3IOUA 4H65A 5F7VA 3OXNA 3SEUA 3KZGA 1VE4A 3C31A 4GQOA 1P99A 2QSXA 3IX1A 4XKNA 3VVDA 4R2FA 4RK2A 1FTJA 4YKIA 1A8FA 4KYEA 1MXZA 3MZ9A 1EH3A 1MM7A 4ESWA 4NF5B 4XXUA 1FQEA 1LAGE 1L5TA 1MQIA 4GXAA 1PB8A 5AA4B 3PMXA 3C32A 1QUKA 2XXHA 2F35A 4I62A 4JWXA 4DDDA 4KPTA 1JEVA 1AMFA 5ICQA 4F2QA 2F7BA 1N0TA 1A8EA 3LC8A 4RNSA 4O3CA 4PFUA 1HSJA 3DELB 3PPQA 5I58A 1WODA 3PPPA 1LBBA 4X9TA 1JW4A 1NMUA 2XXTA 5KCJB 4KD5A 3I6VA 5CRYA 1J1NA 3PV0E 4OVJA 1EU8A 3PD8A 3SEXA 3MUQA 3KOSA 4F18A 4QHQA 2GRVA 3Q26A 3V8XB 4KYSA 4PFTA 5J1DA 1P1OA 2O69A 4NF8A 3B7DA 4BLAA 1MG1A 4KQPA 3TQWA 5H8QA 3TCHA 2ZNUA 4NF6A 4DCXA 4KR5A 4I8CA 1PBQA 4QF9A 4R6KA 3VLUA 2I4BA 1NFTA 3S9MC 3OENA 4UA8A 2UXAA 5I2KA 1MY2A 1MXUA 1MXXA 1ZJLA 3CVGA 4I9DA 4O3AA 3MVZA 3TTLA 1Y20A 2DXYA 4LUBA 1PC3A 3N26A 1SW1A 1LFHA 1OQHA 3K4UA 2V93A 3KJ7A 3HO7A 5CBSA 4H1XA 3QUFA 4KI0E 4FECA 3CSGA 1XVYA 2YPNA 2F97A 2H98A 1LLSA 1UTHB 1B05A 4U22A 4F1VA 3O2AA 3GBBA 3WAFA 1POTA 3H06B 4XKRA 3OO8A 1QJMA 3MZ1A 1B4ZA 1Y1ZA 1TFAA 3O28A 1SD3A 4POWA 2ONKE 3W9VA 5IAIA 2Y7IA 4KCDA 1B1XA 2AL5A 1DSNA 3K01A 2D21A 2QS1A 2HZLA 3S2VA 4F31B 2XXYA 4ZEDA 1GTKA 1BLFA 3RN8A 3B6TA 2HFBA 3O66A 2QS2A 5H8SA 1UIUA 1XHYA 1S50A 4G77A 2P1SA 2ZYKA 1YCJA 5FHOA 1JNFA 3KSXA 1MY1A 4C1UA 1S7YA 3VVFA 5DVFA 1FTMA 4NWDA 1ATGA 4OZ9A 1AOVA 1GV8A 5JTYB 3UGWA 1JW5A 1CB6A 2Z8EA 3H6WA 2X7PA 5H8FB 3TQLA 2FYIA 4Q0CA 4OHNA 2BJJX 3LR1A 2HEUA 2R71A 1MY0A 2RF1A 2RC8A 2DOJA 2OWTA 2XXXA 4FATA 2H25A 3WAEA 3TTKA 1MDQA 1IXIA 4LA9A 3RT6B 1FQCA 3M3LA 1B5JA 4JB7A 3PUWE 4BDQA 2M8CA 2RC7A 4P11A 3S4UA 4QSDA 2F7CA 1DTZA 5TPAA 1KWHA 4F3SA 1BP5A 1B1HA 3TDJA 2GFEA 5AA2A 3KSJA 1I69A 4MLQA 1EZOA 3PUVE 3R6UA 4MBPA 4PE5B 3C4MA 4KFQA 3SEWA 2CZLA 1QKAA 3BBRA 5ELVA 1I6BA 2UVJA 4H8IA 2ANJA 4IGRA 3V83A 3Q29A 5L9MA 1AIVA 1M5EA 1FTLA 2REGA 4H5GA 2HAVA 3MZBA 1OVTA 1IXCA 1MQGA 3SEYA 3TTRA 4DLDA 3ZKKA 2NOOA 3KOTA 1MS7A 3IL1B 4ELOA 3PPRA 3V89B 5LOMA 1LAXA 3GBAA 3RT8A 3TUSA 4G68A 4JXIA 4HCYA 4NF8B 3E13X 1SW5A 4ZEKA 3ONMA 3H6UA 2HAUA 2I48A 4GVOA 3SKPA 2OK2A 5BUUA 2Q8JA 4OERA 2HZKA 2UVIA 4U23A 4OFOA 4YKJA 4QFOA 1JW1A 4MFIA 5H8NA 1TWYA 4JBZA 3RGYA 4IO7A 2XXQA 3IOWA 4WKMA 2Y7PA 1D9VA 3LSXA 2DWJA 2OJTA 1IQ7A 4FEBA 1I6QA 2VD2A 4N6PA 2QRYA 2PT2A 4RA1A 2AL4A 4U21A 4DXCA 2PMSA 3O6IA 2WKYA 2F34A 2ZNTA 4NF4A 5BWJA 3V5AA 2Q2AA 3RTWB 2F7AA 2F6GA 5TP9B 4EXKA 1AH5A 4OETA 4LZ8A 2F8DA 3KFMA 4Q30B 1DPPA 4JDFA 1EZ9A 1RYXA 4KCCA 4LQ2A 1JEUA 2DYXA 3G3JA 3TEPA 4ZEIA 5DVIA 1ZIUA 3K6UA 2V3QA 1SW2A 3MW0A 4Q5TA 2Y7WA 4YB7A 4YKKA 1IXGA 1A55A 1B5IA 3S9EA 2Q9TA 4EUOA 3CR9A 3LSFB 3OD7A 4PFYA 4JWOA 1ZU0A 5L9SA 3N5LA 3D4CA 2PVUA 3VFJA 1CE2A 4F3BA 2DP8A 4PP0A 3OSRA 2RINA 2ZYNA 3KG2A 1BIYA 3C34A 2VP1A 3KBRA 1LB8A 4LP2B 3G3GA 3ODBA 1NNPA 4PQJA 3GZGA 4DZ1A 5TU0A 1ANFA 3KGCA 1Z7NE 3DP4A 1M5BA 3PD9A 5ISUA 1URSA 3ZSFA 3UN6A 2ZXTA 2FA7A 5DVJA 1B51A 3EQ1A 2RKMA 3E3KA 4OFLA 5DYHA 4RXLA 2VD3A 3U92A 1XOCA 1ZBMA 2H4IA 1MM6A 5I57B 2ONSA 1MXVA 5KDTA 4UACA 4ZS9A 3FD3A 1FQBA 3H7MA 4H0WA 3JYRA 4MF3A 2XX9A 1Y1MA 3LUYA 3BFTA 3OEMA 4AB5A 3G3IA 4QFPA 1P1QA 5TPAB 3FJGA 1SQYA 1OLAA 1IUDA 3DM0A 1PEBA 1H3DA 5FHMA 1UIVA 3AXFA 1B32A 3FIRA 3S9NC 1O64A 1Y9UA 2ABHA 5I84A 4BDLA 4YZZA 1Y3NA 3O6GA 4R74A 3KEIA 5B70A 3OO6A 2B65A 4GXSB 5JK4A 1UTBB 5CMBA 4KYDA 1MY4A 3MPKA 1PDAA 4POXA 2XXVA 3MVXA 1MH3A 1M5CA 2Q2CA 2R9JA 3IJXB 4IB2A 2F5XA 3RLFE 3IO6A 1R9LA 3FVNA 3SERA 3UORA 1N3XA 3OEKA 3MVWA 4PFWA 3B6WA 1JVYA 4F39A 5DT6A 5DEXA 3CG3A 3TPAA 2PBWA 3UA8A 1P1NA 3GLBA 3SEVA 1N3WA 3VLVA 4EF2A 2QPQA 3CG1A 4ECFA 2XX7A 1YPNA 4G8NA 4EQBA 1SI1A 5H8NB 3QSLA 2O84X 4QFLA 2W7YA 3FVKA 1VFEA 1US4A 2DSFA 1Q35A 2DQVA 4LQ5A 4GLIA 1Q1KA 3PMVA 4G68C 2XXPA 3IORA 3SETA 2Q88A 4F29A 4H8JA 4YAHX 3UIFA 2G29A 3F11A 1TXFA 3DP6A 3CRBA 1R1NA 4PETA 5EHSA 2V3UA 3QYTA 4R6YA 4MLVA 2D5WA 3FZVA 1LSTA 4M1VA 3IAZA 3K6WA 5A5XA 1JVXA 4YU0A 1IZ1A 2F6PA 3BFUA 2X26A 1B3LA 3IJOB 2P0SA 5L8DA 3FASA 3LBSA 4F2OA 3UP9A 4ZE9A 2I49A 2H99A 1BTJA 5I2NA 1Y3QA 1LAFE 5CMCA 5I56A 4QSCA 3U72A 3EN3A 3VVEA 1US5A 3PU5A 5ITPA 4ZDMA 2QMXA 1USYE 1URGA 1QUIA 2HQ0A 4RPNA 3A09A 3RNNA 1R9QA 4R9FA 4H5FA 4N07A 2XXIA 4OEVA 3HN0A 3DP8A 3TCFA 3S9LC 1FQAA 4FORA 3TMGA 1B4HA 4R73A 3ILTB 3KN3A 3K1MA 4OXVA 1OVBA 4ONYA 3ILUB 1MPBA 1OLCA 1VSOA 1LBCA 1LCTA 3FATA 4YMBA 3L6GA 2UYEA 4U4XA 4X1DA 2NVUB 4ZEBA 1NNKA 2YLNA 3MP6A 3IB0A 3JV9A 4R9GA 3RUMA 4U1OA 5CMKA 2XXUA 1FW0A 4IO3A 3H6VA 3C9HA 4Z0IA 4TQUQ 3G7WA 2IEEA 3RTFB 3N6UA 2I0CA 4YKPA 2Q89A 4EXLA 1LFGA 3M3KA 2O1MA 1PB9A 3K2DA 5KCJA 3FXUA 2R6GE 2DXRA 2F36A 1GR2A 4OENA 5I58B 4QFKA 3R26A 5IKBA 2AYSA 4RPOA 3R7XA 4IO5A 2RCAA 4C1TA 3QAXA 3K1PA 1SVXB 4X1BA 1Y3PA 2Y7RA 3M8UA 2Z8FA 4QSEA 4P0GA 3Q25A 4OTEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5ITOA 3ZS6A 3EHUA 4MH5A 1Q9DA 2DS9A 2CMOA 2PX1A 4HS7A 4R75A 5H8QB 3M3FA 1T0KA 1FJ6A 5HBCA 4PDDA 3MYUA 4ELQA 3T9HB 4MCOA 4NF6B 3PUYE 4NMYA 2G93A 2XXRA 2RC9A 1BKAA 1LCFA 2QVUA 2RCBA 3L6HA 5DTBA 5K2XA 2B4MA 2UVGA 4JVDA 1LBZA 5I2KB 1IEJA 4THIA 4OYVA 1MDP1 1NV7A 4EQ7A 1NNFA 3TAJA 3MQ9A 1NV3A 1WDNA 2I3WA 4MHFA 3IR1A 1YXIA 2B3BA 4NN3A 5EHMA 1FTKA 1LB9A 2XHDA 1F9BA 4I1DA 4WEDA 1N7XA 2O1LA 2O6AA 3PUZE 1UTHA 1HSLA 4X04A 2O51A 1K9ZA 2O68A 4GWOA 1Z7ME 5AA3A 2DWHA 2A5SA 1VFDA 3TTNA 2PT1A 3I5OA 4G8MA 1UQWA 3FJ7A 2DWAA 5A5LA 1JETA 2A5TA 4TOZA 1H44A 4HCWA 3PPNA 4MJOA 1IXHA 1B52A 1YTVA 2Y5KA 2GH9A 1HSEA 5T3JA 1DPEA 1SI0A 1XC1A 1QULA 1XVXA 1ELJA 1NKXA 4F22A 1B3GA 4P8BA 4BDOA 3N94A 4LVQA 3G3FA 3MP1A 2H9BA 2HCAA 3K6XA 4NWCA 3E4RA 4M4GA 3H3GA 2MKZA 3FXQA 1LAHE 5IGAA 1B7UA 4GD5A 5IM2A 4NTLA 2VT5A 1MXWA 5JTYA 3KN7A 3C36A 5H8FA 3TKDA 4HW8A 5I2NB 1O7TA 3KN8A 3TTMA 2B4LA 3BKIB 2XD3A 4C0RA 3PPOA 4GWWA 3LSLA 1N76A 4MEVA 4FIMA 1SBPA 4N8GA 1MRPA 3TCGA 3PUXE 3A3UA 2QL3A 1ZTYA 4IO2A 1DCUA 4FJPA 3H4ZA 4RYAA 3MBPA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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