4NE4A

Crystal structure of abc transporter substrate binding protein prox from agrobacterium tumefaciens cocrystalized with btb
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
281
structure length
281
Chain Sequence
AQVVVSSKIDTEGGVLGNIILAVLNQNKIETTDRIQLGATPVVRKAITAGEIDIYPEYTGNAAFFFSKADDPLWKDAAKGYEEAKTLDYDANKIVWLAPSPANNTWAIALRKDVADKNNLKTLSDFGKYVAGGGTVVLAASSEFVNSAAALPAFQTTYGFTMKPDQLITLSGGDTAATIAAAANQTNNANAAMVYGTDGGIAPSGLVVLEDDKHVQPVYQPAPIIREEVLKKHPNIEELLKPVFEKLDLATLQDLNARVQVGGEQAKTVAMDFLTKNGFAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of ABC transporter substrate binding protein ProX from Agrobacterium tumefaciens cocrystalized with BTB
rcsb
molecule keywords ABC transporter, substrate binding protein (Proline/glycine/
molecule tags Transport protein
source organism Agrobacterium fabrum
total genus 102
structure length 281
sequence length 281
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04069 OpuAC Substrate binding domain of ABC-type glycine betaine transport system
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ne4A01
3.40.190.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Osmoprotection protein (prox); domain 2 4ne4A02
1OMPA 1FQAA 2CZLA 3H6TA 1OLCA 2OWTA 2ZYKA 4Q30B 1OQGA 3N26A 1MQGA 1O64A 3A3UA 1N04A 1B5JA 3Q27A 3BKIB 3WAEA 1LFGA 1CB6A 3TTKA 3TPAA 4H8IA 5ICTA 5CC2A 1QUKA 3DLNA 2O6AA 3A09A 3ECRA 2M8CA 4OFLA 3RT6B 1USYH 3SEUA 3PPRA 4JBZA 3H6UA 1B7HA 4R9GA 2AL4A 2W7YA 3CIJA 4IGTA 3PMXA 4E0XA 3OXNA 1B32A 4EQ9A 1B40A 3TEPA 3TTRA 3U8QA 1EU8A 3VVEA 4QFLA 2ZXTA 2KLFA 5I58B 5I59A 3IX1A 1MPDA 3WAFA 4F1UA 4YMBA 3MZ9A 4XTCQ 2I0CA 1N3WA 3PUXE 1I69A 4ZE8A 1B3HA 3P7IA 4ELOA 2Q2AA 4NF4A 4LZ5A 4ZDMA 4EXKA 2DWAA 3R7XA 2DWHA 2ANJA 4OXVA 4IO4A 1FQCA 1B4ZA 1FTJA 1VR5A 2I4BA 4MBPA 1H43A 1PBPA 2F97A 1MQDA 3PD8A 3KN8A 4YU0A 3K6WA 4F3SA 4U21A 5JEIA 3TUSA 1GGGA 2R6GE 1QKAA 2OBGA 2PT1A 3H7MA 5CM6A 3M3KA 4ZE9A 5ELVA 2Q88A 1SD3A 5AA1A 4QSEA 1QULA 4RPOA 1T0KA 1POY1 4YZZA 1MXVA 3G3KA 1WVJA 1MDQA 1OLAA 1IXCA 3B7DA 4F22A 4YICA 1R1NA 4OEUA 1FQEA 4F3BA 4FAJA 4EXLA 3JZJA 3KGCA 3OMBA 3MP6A 3SESA 2Q8JA 3PPPA 3TQWA 5JK4A 3K0VA 4QFKA 2ESNA 3OO7A 5DT6A 4DXUA 3MJNA 2FNCA 5L9MA 2QJEA 2PVUA 1HSLA 2O69A 4XKNA 4FEBA 2Z8EA 1RYOA 3BBRA 3ZKKA 4PFWA 4LQ5A 3F11A 2Y7RA 3FVOA 5FHMA 4DCYA 1A7LA 3KG2A 4F31B 2DXRA 4KR5A 1SW5A 2UVIA 3ILTB 4GIZA 1O7TA 1A54A 2O7IA 3PUWE 3DP8A 4EDPA 3DP4A 1Y3NA 2V3QA 1B7ZA 1WDNA 3O9PA 1EZPA 2GHBA 4YKKA 1FQDA 1KWHA 1ZKBA 4ZECA 5CMBA 2YPNA 1XS5A 5ICQA 4U2RA 1LB9A 4ZZAA 4EF2A 2ONKE 4POXA 1D4NA 4XKRA 5IKBA 2VD3A 4M4GA 1QUJA 2Q2CA 4N13A 1SQYA 5ITOA 5AA2D 1O63A 2Y84A 2ZNSA 1UTHA 3KEIA 3OO8A 4G4PA 4GVOA 3U72A 2OLBA 1MDP1 3LSLA 3OSQA 2HFBA 2VP1A 4H1XA 1GTKA 2XXVA 5H8SA 2YJPA 1SBPA 2XXIA 3MBPA 4FJPA 2F7CA 2F8DA 2XXQA 4RXLA 3SETA 4YB5A 1LLSA 1B52A 4TLMB 3N94A 1TFAA 4GOTA 1US5A 1TXFA 4IB2A 4PE5B 1Q1KA 1D3KA 3M8UA 5DVIA 2OWSA 3M3FA 2IA4A 1ZJLA 5JTYB 4IO5A 3HV1A 5DEXA 2Z23A 3E13X 3FUZA 4QFNA 1A8FA 1S50A 3RT8A 1A8EA 5AE4A 2E1SA 3EHTA 3SEVA 5KZTA 1P99A 4ZEIA 4Q5TA 4MFIA 2RCAA 4ZEBA 1DTGA 5L9OA 3K6XA 1II5A 1URGA 1SW1A 4IO6A 5I59B 4EUOA 3OELA 4BDMA 4Q8RA 5B70A 1XT8A 1VFDA 2NOOA 5H8NA 1M5FA 1FTKA 3RTWB 1B5IA 4OERA 4WEDA 4NEDA 1RYXA 5I57B 1OQHA 4NF4B 1PB7A 3LBSA 3UA8A 3Q26A 4QSCA 4N07A 4QSDA 1MH3A 2RC8A 2F5XA 4H6DA 3IOVA 2HZLA 2NWJA 1LSTA 4FATA 2QMXA 3MPLA 2H5YA 4KCDA 1B4HA 2GHAA 2GFEA 3N6UA 3SDFA 3TAJA 2AIXA 5A5XA 2RF1A 4F3GA 3TCHA 3KFMA 4Q0CA 3FVNA 2QS3A 1LAHE 2F6PA 2ONRA 3PD9A 2UVHA 2D3IA 2PX1A 2PT2A 1BTJA 5I56A 2X7QA 3TODA 1XC1A 4HS7A 4RY1A 2BJJX 1YCJA 3O6IA 4HW8A 3MQ9A 1SW2A 1ANFA 4YKIA 3TFLA 4I62A 3FV1A 3GBAA 4LUBA 3O2AA 2XX9A 1B51A 1XOCA 5M2VA 1M5CA 1AL3A 5HPQA 1Y3QA 3PPQA 1B3GA 3MVXA 3RUMA 1H76A 1N0TA 1RKMA 4ZEDA 3Q29A 2O51A 5EYFA 5DTBA 3FD3A 1PC3A 3MWBA 3PV0E 4ZEKA 3MZBA 1SI1A 3D4CA 1FCKA 3H3GA 4BDLA 2QL3A 3K02A 3VVFA 1MPCA 3H6WA 3PPNA 3IJXB 2OCUA 2HQ0A 4JSDA 1B6HA 4POWA 3TYHA 3O66A 3OOAA 1AIVA 3MVWA 1WODA 1VSOA 2A5SA 3RGYA 3SEYA 4UA8A 4O3CA 2Z8DA 1ZIUA 3IK6B 3VXCA 3KOSA 4F2OA 3RQTA 4NF6A 3S2VA 4R6HA 4OFOA 2DSFA 1PEBA 3H4ZA 2DP8A 1NNKA 1Y4CA 3G3HA 3IO4A 2H98A 3VXBA 1B2HA 3PGFA 4GQOA 4OESA 2AL5A 3G3FA 1MY2A 5I2NB 3TZAA 4MH5A 4ESWA 3RPWA 2F7AA 2REGA 1UTBA 3O97A 1JETA 3QUJA 1F9BA 2B65A 1B0HA 4E0WA 1MRPA 4I9DA 1DMBA 4GF8A 3W15C 3KJ7A 4RA1A 1JNFA 1IEJA 4IO7A 4H5GA 3OEKA 4QHQA 2RKMA 4ISUA 2XHDA 3IAZA 4FE8A 3B6QA 1MM7A 3KSJA 3GZGA 1M5EA 4KD5A 4UACA 3K00A 4U4SA 3KJTA 2I48A 1OVBA 2PMSA 5DEXB 4P0IA 3GLBA 4JWXA 4R6KA 4NE4A 3TKDA 3TTLA 2H4IA 1S9TA 4DXCA 4HCYA 5DYHA 4G68C 4P11A 3QUFA 4JWYA 4OMBA 2OK2A 4LQ2A 5AA2A 2REJA 1JQFA 3D4GA 1ZBMA 4U22A 4XKPA 1B46A 3PUVE 1SVXB 2H99A 4QFOA 3R6UA 2D5WA 4H67A 1DOTA 3BFTA 4QFPA 3VLUA 2DWJA 3DP6A 3ZS6A 4OQOA 2DVZA 1SW4A 2ZNUA 3H6VA 3MUQA 3G3JA 3T66A 4JB7A 4F18A 1P1OA 5H8NB 2R9JA 1IXIA 3W9VA 1LAGE 1TT1A 1P1QA 1D9YA 1US4A 1N84A 4PP0A 4U23A 4KHZE 1HSJA 2XXRA 4F3PA 3BFUA 4ZS9A 2I0BA 3TCFA 1QW0A 2XX8A 2I3VA 5CMCA 2QPQA 5DVJA 4G8HA 2O68A 3LR1A 3QAXA 2RINA 2UYFA 3SEWA 3UIFA 4LATA 2V84A 4THIA 5A5XB 1BIYA 1ELJA 5L9SA 3Q25A 4H0WA 4RK9A 1FQBA 2HCAA 1QKBA 3EN3A 1B3FA 3DM0A 1LCTA 1JEUA 2NXOA 5I56B 3FGSA 3K01A 2O7UA 4LONB 3S4UA 2O84X 3KZGA 3U94A 3LSXA 3VLVA 4GD5A 4IY5A 2Q89A 2Y7PA 1JW1A 1N76A 4R6YA 4BDOA 3KBRA 2HZKA 2O1MA 4TQUQ 1R9QA 4MLVA 3AXFA 1LCFA 2ONSA 1MQHA 1MY3A 2LAOA 1PDAA 1P1NA 1JW4A 2XX7A 3MP8A 2OZZA 4FECA 3PUYE 2H25A 5KDTA 2DQVA 4U1OA 1MXYA 4X48A 1XHYA 1ATGA 1B9JA 3CFLA 2Y7IA 3VLWA 3K6VA 4BLAA 5CI5A 2V3TA 1URDA 1BP5A 2FA7A 4NF5A 5CBRA 3GBBA 4LVQA 1LFIA 4TLLB 3O29A 1IQ7A 5HM4B 4H65A 3N5LA 4NF6B 2ZNTA 5H8HA 5LOMA 1Q35A 4EQ7A 2D21A 1H45A 3I5OA 3PPOA 3MP1A 4H8JA 2XXUA 4G68A 2A5TA 1Y4TA 4C1UA 3IORA 1S7YA 3M3LA 1FQFA 3UGWA 1MG1A 4R2FA 3C34A 4KI0E 4BDQA 1UTBB 4OFJA 4Z0IA 3SEXA 3T93B 4RJZA 1N3XA 4ELQA 5AA3A 5H8FA 1VFEA 1B3LA 2NVUB 2I49A 3S9LC 3FATA 4KQPA 4DXBA 4G8NA 1MM6A 4F29A 5ISUA 1YAEA 4HTGA 4NF8A 4I8CA 3KN3A 1N7XA 3MVYA 1SYHA 3H03A 3C36A 4I1DA 3TELA 3TQLA 2G93A 1JEVA 1NH7A 2ZYMA 2B3FA 4DLDA 1IZ1A 1MY0A 4R2BA 3JYRA 1MY1A 2DXYA 5DVFA 3S9EA 4JSOA 4DIGA 4FEDA 5AA2B 5FTIA 1IIWA 4K3FA 3K4UA 3OENA 3B6WA 1J1NA 1I6BA 3MC2A 2DE4A 1TFDA 1QJMA 1DPEA 4PFUA 4G2ZA 4G77A 5F1QA 4DCXA 3FJGA 3HO7A 4XXUA 3UP9A 3B6TA 3LSFB 2UXAA 3T9XB 1DTZA 1IXGA 3UORA 2AYSA 1MXZA 4NMYA 1P1WA 3JV9A 5FTHA 5TP9A 4OTEA 2PBWA 1Z7ME 4LZ8A 3FJ7A 2F35A 2QS4A 3RTFB 4R9FA 4U1ZA 5AA4A 1A99A 4RK2A 3CSBA 4R74A 1BLFA 1LB8A 3IB2A 1R9LA 3K1PA 1Z7NE 1IUDA 3IR1A 3VV5A 2Y7WA 1H3DA 1H44A 1POTA 3L6HA 3OSRA 3E9XA 5F7VA 3MW0A 1MXUA 3V8XB 1LAFE 3HHGA 4RYAA 2V93A 1AH5A 4GLIA 3RNNA 1OIBA 1FTOA 3U1OA 1UQWA 3OO6A 3EF7A 4OYVA 1NFTA 2QS2A 4R72A 5I84A 3CFZA 2VHAA 4F2QA 3FXRA 1LAXA 2DOJA 3IOTA 5JTYA 1UTHB 2XXXA 3C32A 1URSA 5I2KA 4OEVA 4KPTA 4Z7EA 1USYE 3H06B 3QK6A 5K2YA 1LBBA 1GR2A 3Q28A 5BWJA 3FXQA 4R75A 1Y1ZA 5KDTB 4L17A 1VE4A 4LP2B 4GXAA 1NKXA 3QIMA 3THIA 2IEEA 3T22A 3OEMA 4KYDA 3TCGA 3T9HB 3T9VA 1YPNA 1MY4A 4O3AA 4OENA 4EQBA 4YKJA 2VOZA 4JXIA 5KCJA 4PQJA 3HHFA 1LBCA 3ILUB 3RY3A 4OVJA 3T9UA 1AOVA 4F1YA 3CR9A 4YB7A 1M5DA 3G7WA 3DELB 1LFHA 4NF5B 2THIA 5IAIA 4EF1A 2F6GA 4FIMA 3MPKA 3FIRA 3GXAA 5H8QA 1Y9UA 4IO3A 4OHNA 5I57A 1NL5A 3L6GA 1P1UA 1PBQA 2XD2A 2I4CA 3CI8A 5H8HB 3TTNA 3A3CA 4GRKA 2ALUA 2DS9A 1BKAA 4WKMA 4F19A 3KN7A 3K6UA 4G68B 3VDFA 2A5TB 4AB6A 3K2DA 4HCWA 3PMWA 2ZYOA 3TMGA 1NNTA 1CE2A 2Z22A 3I6VA 4OETA 3EHSA 5EHSA 2ABHA 4IO2A 3CRBA 3I3VA 4JDFA 3V89B 2DE3A 3MZ1A 4FORA 1MXXA 5H8FB 2RC7A 3HCQA 4ELPA 2HEUA 4X9TA 2P0SA 3C35A 4G8MA 5TPAA 2X26A 3USDA 4N6PA 4NF8B 2QRYA 1YTVA 3K1NA 3HSTA 3O6HA 4ESXA 3CFXA 2G29A 4GWOA 5EHMA 1B1HA 2HAVA 4C1TA 2FYIA 5BUUA 1QVSA 3QSLA 2XXTA 4ZZEA 2Z8FA 3OD7A 4KYSA 1FTLA 2I3WA 2E0SA 4DDDA 4ND9A 5TU0A 2O1LA 1B7UA 3V83A 1B1XA 4YKPA 1FW0A 5CBSA 4BDNA 3E3KA 3E4RA 4DE8A 1NH8A 3S9NC 1JVYA 2XXYA 3U93A 5CRYA 3C33A 3T96B 3LC8A 4NWCA 4F39A 1JVXA 2DYXA 3FV2A 1GVCA 4YAHX 2DE2A 4R73A 4NWDA 2I58A 5CMMA 4MLQA 1NNFA 1Y3PA 1ZU0A 5TP9B 3C9HA 2F34A 3IOWA 3LUYA 4QF9A 5AA4B 2ZMBA 2WKYA 3ZKLA 2F36A 3MAMA 4KYEA 5L8DA 1MS7A 1XVYA 4O3BA 3UN6A 1ZMGA 2CMOA 2UYEA 5I2NA 3IL1B 3KOTA 3VE1B 4OWDA 1HSEA 1SDXA 2ZYNA 3HPIA 3W9WA 3CSGA 1UIUA 5I58A 1QUIA 4GL8A 2QSXA 1B58A 2H9BA 3R26A 2VD2A 4LA9A 4JWOA 4AB5A 2HAUA 3U92A 3OO9A 4OZ9A 5ITPA 3IB0A 3CVGA 4IGRA 3ZSFA 4X1BA 3KSXA 1EZOA 1MH4A 2UVJA 2OJTA 4AQ4A 3ONMA 4M1VA 1B3EA 2F7BA 5J1DA 2V3UA 4YB6A 3PU5A 1ZTYA 4WEPA 3QYTA 4KCCA 2GRVA 1L5TA 3O6GA 3CG1A 2P2AA 1SI0A 4GFRA 2X7PA 3G3IA 1GV8A 1Y1MA 3UK4A 4ZEFA 1ZLQA 5I2KB 5HBCA 2XD3A 1EZ9A 2P1SA 1TWYA 2HXWA 1IITA 3S9MC 4BDRA 5FHNA 4P0GA 3EHUA 1I6AA 1SYIA 3QXMA 4PETA 1A40A 1UIVA 3HN0A 4RPNA 2XXWA 4TOZA 3PUZE 5KCJB 2PYYA 1OVTA 3C31A 3IO6A 4XKQA 4ECFA 1B5HA 2F78A 3RLFE 3LSWA 2DWIA 2GH9A 4H5FA 4U4XA 1Y20A 4PFTA 5H8QB 4ONYA 2QS1A 3MVZA 4WXJA 3FZVA 1D9VA 3FVGA 5FHOA 4MF3A 1AMFA 2I6EA 5B7DA 2VGQA 3SKPA 4RNSA 4F1VA 3FXUA 3EPEA 1FTMA 3IJOB 3PMVA 2QMWA 3ODBA 3N6TA 1B05A 1MQIA 3FVKA 5K2XA 3TDJA 2XXPA 1EH3A 3C4MA 2Y7KA 3FASA 2XXHA 4PFYA 1N7WA 2R71A 3FJMA 1I6QA 4KFQA 3VVDA 3IB1A 2YLNA 5CMKA 2RC9A 4GL0A 3G3GA 4GXSB 4C0RA 3IOUA 1DSNA 4NTLA 3RN8A 4X1DA 1DPPA 1XVXA 3SERA 4ELRA 5TPAB 2Q9TA 2B3BA 1B0LA 1NNPA 4QRZA 3TTMA 4IY6A 3VFJA 1A55A 3EQ1A 1R6ZA 1PB8A 2NUVA 1LGBC 3V5AA 2UVGA 3O28A 3K1MA 4DZ1A 4LZ7A 2DVCA 1JW5A 1MPBA 4XIGQ 4YMAA 1PB9A 1MXWA 1NMUA 1IXHA 2RCBA 1M5BA 3CG3A 2V25A 1MQJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1OMPA 1FQAA 2CZLA 4OVTA 3H6TA 1OLCA 2OWTA 2ZYKA 4Q30B 2Y5LA 1OQGA 4HE0A 3N26A 1MQGA 1O64A 3A3UA 4N6KA 1N04A 1B5JA 2PCRA 2L5VA 3Q27A 3BKIB 3MYUA 3WAEA 1LFGA 1CB6A 1FBEA 1NUYA 3TPAA 1RDYA 4H8IA 3TTKA 5ICTA 5CC2A 4N8GA 1QUKA 3DLNA 2O6AA 3A09A 2VPNA 3ECRA 2M8CA 2Y5KA 1KZ8A 4OFLA 3RT6B 4QBAA 1USYH 3SEUA 3PPRA 4JBZA 3H6UA 3PTYA 1B7HA 4R9GA 2AL4A 2W7YA 3CIJA 4IGTA 4NX1A 3PMXA 4E0XA 3OXNA 1B32A 4EQ9A 1B40A 3TEPA 3TTRA 3U8QA 1EU8A 3VVEA 4QFLA 4XEQA 2ZXTA 2KLFA 5I58B 5I59A 3IX1A 1MPDA 3WAFA 4F1UA 4YMBA 3MZ9A 4XTCQ 2I0CA 1N3WA 3PUXE 1I69A 1FPLA 4JVIA 4ZE8A 1B3HA 3P7IA 2XWOA 4ELOA 2Q2AA 4NF4A 4LZ5A 4ZDMA 4O7MA 4EXKA 2DWAA 3R7XA 2F3BA 2DWHA 2ANJA 4NF0A 4OXVA 4GWSA 4IO4A 1FQCA 1B4ZA 2QVUA 1FTJA 1VR5A 2I4BA 4MBPA 1H43A 1PBPA 2F97A 1MQDA 3PD8A 3KN8A 4YU0A 3K6WA 4PAKA 4F3SA 4U21A 5JEIA 3TUSA 1GGGA 2R6GE 1NV1A 1QKAA 2OBGA 2PT1A 3H7MA 5CM6A 3M3KA 4ZE9A 5ELVA 2Q88A 1SD3A 5AA1A 4QSEA 5LDZA 1QULA 4RPOA 1DK4A 4PF6A 2FIEA 1T0KA 4N81A 1POY1 3B8BA 4YZZA 1MXVA 3G3KA 1WVJA 1MDQA 1OLAA 1IXCA 3B7DA 4YICA 4F22A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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