4YKIA

Mnemiopsis leidyi ml032222a iglur lbd glycine complex
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
247
structure length
247
Chain Sequence
LIGRHLRLGSVEEQPFMFFATEGCEGNDCWSGMVNDMVVKLSEDLGFTYEYIQPDDRKFGALNKTTNEWNGMIRDLLDDKTDMIAIDLSTNSARKSAIDYSFPFMDAGIKAVVKGEGTTLNQVLELLDQDKYKWGVIGSRHPETLLKTHRDSRYSRLVDEGVELKDLNHAIETLRGGLFVFIDEGPVLAHNLISDCDVFSVGEEFQSFEYAFGLPKDSPYKSLIDSHLLKFREEGFIDILWEKWSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Glycine activated ion channel subunits encoded by ctenophore glutamate receptor genes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ML032222a iGluR
molecule tags Membrane protein
source organism Mnemiopsis leidyi
total genus 79
structure length 247
sequence length 247
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-03-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10613 Lig_chan-Glu_bd Ligated ion channel L-glutamate- and glycine-binding site
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ykiA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ykiA02
1US4A 3H6VA 5H8SA 1MXUA 1JW1A 1Z7NE 2I49A 4LZ8A 4Q0CA 3W9VA 4IO3A 3M3FA 1B3LA 4LVQA 2RKMA 3SEUA 2UVHA 1SDXA 4ECFA 1MY2A 4R2FA 3PUYE 4IY5A 1URDA 4IGTA 5DYHA 2RINA 3N94A 1XOCA 4DIGA 1AIVA 4XXUA 3S9NC 4MBPA 3SERA 4IO5A 1XHYA 3O9PA 2UVGA 1URSA 4ISUA 2VHAA 1ZJLA 1P1WA 3I3VA 2I0CA 3K4UA 4XKRA 2THIA 3Q29A 5I2KB 1B1XA 1OVBA 4YKPA 2QJEA 1A40A 1M5DA 3THIA 2CMOA 2UVIA 4JSOA 3RTFB 4LUBA 1MPDA 4NF5B 5B70A 1MQDA 2DOJA 3RGYA 2UVJA 1LFHA 4NF4A 3TTKA 3G3JA 3LC8A 5ICTA 3QUFA 2REJA 3T96B 4BDNA 4F1UA 3DP8A 1N7WA 3FASA 2F36A 1M5CA 1LSTA 1LLSA 4FE8A 4RPOA 4OXVA 3TTMA 1B40A 3CSGA 3JZJA 2ZYOA 3SESA 2H4IA 4ESXA 2AIXA 2RF1A 5JTYA 1FTMA 4I9DA 4QFLA 1MXVA 3TEPA 4YICA 4ZEKA 1NL5A 5L8DA 2VD3A 4POXA 2HFBA 3MZ9A 1H45A 2O68A 1B2HA 3ONMA 3K1NA 3CSBA 1R9QA 2BJJX 4EDPA 2Y7RA 3G3FA 3W15C 2UYEA 4GD5A 3M8UA 4OETA 3LSXA 4DCYA 4DDDA 4BLAA 5I59A 1B7HA 4OTEA 5A5XB 4N6PA 4NTLA 2NOOA 1MPBA 1JEUA 3O97A 1XVXA 3Q28A 1TFAA 1D4NA 1QUIA 1B5IA 3TQLA 4KHZE 4JDFA 4NF6B 5I2NA 1DSNA 5H8NA 4N13A 1ATGA 4H0WA 2ZYKA 4LONB 4WEPA 2Q89A 4OVJA 1XS5A 1NNFA 2PMSA 1R9LA 1JNFA 4K3FA 3OENA 3PUWE 3OSRA 1JW4A 1VFEA 1H43A 1EH3A 2FA7A 2GHAA 3B7DA 1I69A 3QIMA 3K2DA 3CG1A 3U92A 2I3VA 2Q88A 3U94A 5ELVA 1OMPA 1JVYA 2V3QA 2Z8FA 3T66A 1B58A 3S9MC 1CE2A 3T9XB 1FQBA 1LBBA 1DPEA 4R2BA 3G3HA 1LB9A 2P2AA 5CMBA 3TDJA 4OHNA 4LZ5A 5KDTB 3DP6A 1IQ7A 1HSJA 4YAHX 3VDFA 1LAGE 1D9YA 3LBSA 5I58A 1M5EA 2YLNA 4F3BA 1QVSA 2X7PA 1VR5A 1UIUA 1IUDA 2VD2A 5CBSA 1QW0A 4LQ5A 2XXXA 3EF7A 3PD9A 4ND9A 1JQFA 4H6DA 4F31B 1MQIA 1FQEA 3K6XA 3O6HA 1B51A 4KYEA 3E3KA 3KSJA 5LOMA 4YB7A 3N5LA 3R26A 4QSDA 4XIGQ 5H8HA 3H3GA 5TP9B 4F39A 4GOTA 3FUZA 4DCXA 4HTGA 4OYVA 5KCJA 4F1VA 4BDMA 4ONYA 3JV9A 1GV8A 3SKPA 4KYDA 5I56B 1S9TA 3RN8A 4YKIA 1B5JA 3EHUA 4KI0E 2E0SA 3ZKKA 3GLBA 4G68C 2XXIA 3VLVA 4EUOA 1MY4A 4X1BA 3UGWA 4F19A 1Y3NA 1Y1ZA 1USYE 4KCDA 4H5GA 2VP1A 3F11A 3IR1A 3TELA 4KQPA 3EHTA 2ZNUA 1A8EA 1IXGA 2UYFA 4YMAA 1EZ9A 3V5AA 3S4UA 3AXFA 2V3UA 2HCAA 3C9HA 4YB5A 3E9XA 4PETA 3HN0A 3B6WA 3IX1A 1IIWA 1H3DA 2XHDA 5L9MA 4G8HA 1O7TA 3MP6A 4N07A 3I5OA 4H8IA 1B46A 4IO7A 3R6UA 1B3GA 1RYOA 2O69A 2O6AA 2B3BA 1LCTA 4QFPA 1MY3A 3HO7A 5TPAB 5K2YA 1JW5A 2F7AA 3T93B 5L9SA 1SI1A 3PMVA 2OZZA 4NE4A 3OEMA 3FVGA 5CMCA 1H44A 5AA2A 2E1SA 4MLVA 3KEIA 3UIFA 3CI8A 4PFWA 2HXWA 4QHQA 4BDLA 4ELOA 1FTLA 3M3KA 2DE4A 2UXAA 2KLFA 3HV1A 3SETA 4E0WA 2QS4A 4LZ7A 4F3PA 4I62A 3N6UA 3KGCA 5I57B 2OJTA 2ZXTA 1Y4CA 1FW0A 1S50A 4DE8A 3KN8A 2DQVA 1MRPA 2PT1A 2AL4A 1B05A 3Q25A 3IB1A 3MW0A 2V93A 1PBQA 3PPOA 1LBCA 1B0HA 4GLIA 3C4MA 2XD3A 2Z8DA 5FTIA 2QRYA 1Y3QA 1FTJA 1MH4A 1FTKA 4Z0IA 3TKDA 1MM7A 1DPPA 5H8FB 1UQWA 5CI5A 1R6ZA 3DM0A 1GR2A 4ZEIA 1D3KA 2REGA 1B9JA 4NMYA 3PUZE 1JEVA 1US5A 1A7LA 3UK4A 2OWSA 4NEDA 1PEBA 4PP0A 2XD2A 1TFDA 1I6BA 1MY1A 3KZGA 1PC3A 2I58A 2ONSA 4KD5A 5CMKA 4RNSA 1FQAA 4IGRA 3MPKA 2V3TA 3G7WA 4PFYA 1Y9UA 4U21A 3V8XB 5H8NB 3FJMA 3QYTA 4EQ7A 5TU0A 3CIJA 1S7YA 3PPRA 1XT8A 1AL3A 3GBAA 3OO8A 3VE1B 4MH5A 4RK2A 1UTHB 2OWTA 3PPPA 2XX9A 4QSCA 3IJOB 1B0LA 2DWJA 1SYHA 4MLQA 1F9BA 1B7UA 5HM4B 4YZZA 3TCGA 2Z22A 3TCFA 2G29A 4F2OA 2XXQA 4FORA 5CM6A 2PX1A 4RJZA 4FJPA 5ITOA 2R6GE 3IO6A 4JWXA 5AE4A 3G3KA 4H8JA 2QL3A 2O84X 1WODA 5H8QA 4RK9A 4GVOA 3K00A 3H03A 5FHNA 2DVZA 1N0TA 3E4RA 3FGSA 4GRKA 1SI0A 1SD3A 5AA4A 4F1YA 3IJXB 4BDOA 2F6GA 3FJGA 3DLNA 3KSXA 1AMFA 2G93A 4R73A 3B6TA 5J1DA 1P1UA 2HAVA 3LSFB 3VXCA 3IOUA 3T9VA 3QAXA 1QUJA 4Q8RA 5CMMA 1YTVA 3QSLA 4KFQA 3IOVA 2H9BA 4WKMA 4G8NA 4ZECA 1P99A 3PU5A 2F35A 4G68A 2H5YA 2RC7A 3R7XA 2QS3A 2RCAA 3N6TA 1JVXA 3I6VA 2ABHA 3UA8A 4DLDA 4LP2B 1B52A 3L6GA 1MXYA 5KCJB 2Y7WA 2NWJA 3FV1A 4R72A 4QRZA 2PYYA 2XXTA 3C36A 3IO4A 4Q30B 2XX8A 5CRYA 4QFNA 3IAZA 1OLAA 5JEIA 3K02A 1B3FA 3VVFA 3CG3A 4R6HA 2QS2A 4F3SA 3HHFA 2GH9A 1B5HA 1IEJA 3SDFA 4QFKA 3VV5A 3PD8A 1OQGA 3CVGA 4ELRA 3TZAA 3K6WA 4F3GA 4ZEDA 4L17A 4YU0A 1MY0A 4RY1A 4TLMB 1N76A 3VLWA 3MBPA 2P1SA 1YAEA 4ESWA 1FQDA 1MQGA 3ODBA 3IK6B 1TT1A 4U4SA 4C1TA 1AOVA 1LFIA 4KCCA 3C31A 3H4ZA 4KYSA 4ZEBA 3FXUA 2XXRA 3K6UA 3EN3A 4HCWA 5B7DA 2ZYMA 2DVCA 1OIBA 3VXBA 3DELB 3OO7A 4FEBA 2IA4A 4FIMA 1NH8A 3K1MA 4OFLA 3G3GA 3ILTB 1PB7A 2QS1A 3GBBA 2HQ0A 4DXCA 2H25A 4O3AA 1N84A 4F22A 3E13X 4RA1A 4RYAA 3OD7A 3FJ7A 4ELQA 1FTOA 4H67A 3RPWA 5JK4A 4BDRA 3KJ7A 3TPAA 3KN7A 2F97A 4JB7A 3P7IA 2VOZA 4OFOA 3O2AA 2O51A 4P0GA 2QPQA 1FQCA 1N7XA 1RYXA 4PFUA 1B7ZA 3IOWA 1NNTA 1SYIA 4QF9A 2HZKA 2FNCA 2RCBA 1MQHA 1LCFA 2M8CA 3SEWA 2Y84A 3MJNA 1EU8A 2F7CA 4IY6A 1MG1A 1URGA 4U4XA 4U2RA 4EQ9A 1ELJA 4LATA 1TWYA 1R1NA 2X7QA 4UACA 2Q2CA 3D4GA 4OFJA 2ESNA 4XTCQ 2IEEA 3MUQA 1MPCA 3EPEA 4EQBA 3ZSFA 2I3WA 4MFIA 3FVKA 1H76A 2RC8A 1B3EA 4M4GA 1ZU0A 3KN3A 4IO2A 2F8DA 3MZBA 4AB6A 2HEUA 4YKJA 3PPQA 2DYXA 1QJMA 1BIYA 2XXVA 3IORA 4U23A 3FXRA 4OEUA 3PGFA 4ELPA 1NKXA 2Q2AA 3O29A 3EQ1A 2DXYA 5A5XA 2D21A 4AQ4A 3EHSA 1BP5A 2VGQA 1DOTA 1ZBMA 3MAMA 2I48A 1IZ1A 2HZLA 2F6PA 4HW8A 1LAHE 1NH7A 4NF6A 5BUUA 5DTBA 1D9VA 3TFLA 2I4CA 3SEVA 1GTKA 1SW5A 4OERA 1MH3A 4IO4A 3S2VA 5H8QB 1SVXB 3O28A 5M2VA 5KZTA 3B6QA 2Y7PA 5DEXA 2YJPA 4UA8A 1II5A 1O63A 4F18A 5IAIA 3TUSA 3H6TA 1MXWA 3TODA 2YPNA 3JYRA 5DVJA 5BWJA 2A5TA 1PBPA 4NF4B 2D5WA 5EHMA 4AB5A 2QSXA 2XXPA 2DE2A 4FECA 3CFXA 3HSTA 1UTBA 4GF8A 4XKQA 1GGGA 4DZ1A 3RLFE 3T22A 4GFRA 2ANJA 3LUYA 3MZ1A 4KPTA 3VFJA 1WDNA 1B6HA 4NF8A 2GFEA 1USYH 1WVJA 3KJTA 3RUMA 5KDTA 3TTRA 2QMWA 3O66A 5JTYB 4G68B 2NXOA 1ANFA 4R6KA 3OELA 3RT8A 3MVYA 4C0RA 3CFZA 4JSDA 1LGBC 2I4BA 2V84A 3FV2A 4WXJA 4ZE9A 2WKYA 5EYFA 4MF3A 3TTLA 4PQJA 2Z23A 4P0IA 4XKPA 1A55A 4FATA 1DTGA 4FEDA 3Q26A 4ZEFA 1B4ZA 4OESA 3K6VA 3D4CA 3U93A 3G3IA 3FIRA 5I59B 1LFGA 3RNNA 3VLUA 4OEVA 1SW1A 1Z7ME 2V25A 1MS7A 2PBWA 1LAFE 4ZZAA 3VVEA 1L5TA 3MVZA 3KOSA 3USDA 2I6EA 3TAJA 5I2NB 4HS7A 3OOAA 3KBRA 2DS9A 2DE3A 4X1DA 1POTA 3H06B 3PPNA 4F2QA 3VVDA 1LB8A 1IXIA 4OZ9A 2O1MA 2Z8EA 2RC9A 1B3HA 2H99A 4WEDA 4JWOA 2DWHA 3CRBA 4O3BA 1IXCA 2Q9TA 3O6GA 1RKMA 1BLFA 1NNPA 3FATA 3TCHA 1P1QA 5EHSA 5FTHA 2D3IA 2DXRA 2Q8JA 3OXNA 1B32A 3S9LC 1Y1MA 1POY1 1MM6A 3FD3A 3HHGA 5TPAA 3S9EA 1MQJA 3M3LA 1I6AA 1TXFA 1UIVA 4R9GA 1ZTYA 2O7IA 4RPNA 4EXKA 2DWAA 3LR1A 5I58B 3W9WA 4C1UA 1PB9A 1HSLA 5ITPA 4G4PA 3PV0E 4GXAA 4U1ZA 4XKNA 3FXQA 3PMXA 3FZVA 1N3WA 4DXUA 1YCJA 3FVNA 3ZKLA 5H8HB 1EZPA 3MVXA 5IKBA 2ZMBA 5I57A 2B65A 3TMGA 4R6YA 2DP8A 1ZIUA 3ZS6A 3N26A 3IL1B 1IXHA 4OWDA 1J1NA 4ZE8A 4G8MA 1P1OA 2A5SA 3U72A 5H8FA 2AYSA 4ZDMA 4M1VA 3U8QA 1Q35A 2GHBA 1MXZA 3K0VA 4OENA 5F1QA 1QUKA 3H7MA 4LA9A 3KFMA 4I1DA 4IO6A 4X48A 1QKBA 4QSEA 3T9UA 3K1PA 3RT6B 1OQHA 4ZZEA 4E0XA 1VSOA 4U22A 3LSLA 3H6WA 4TOZA 2ONRA 5DVIA 1A99A 4BDQA 4POWA 3UN6A 4LQ2A 1UTHA 4GQOA 2XXYA 3C33A 3V83A 2Y7KA 4OMBA 3TTNA 1IITA 3HCQA 3MP8A 3T9HB 1OVTA 5FHOA 5I84A 1KWHA 5DEXB 4H65A 3QXMA 3A3UA 5AA1A 1ZMGA 3MPLA 5AA2B 2A5TB 4KR5A 1QULA 3TQWA 5ICQA 5I2KA 1ZLQA 3IOTA 4EF2A 1UTBB 2HAUA 2DWIA 1MDP1 1NMUA 1YPNA 3HPIA 4GL0A 4G77A 1Y20A 2O7UA 4NF8B 1CB6A 2W7YA 1GVCA 4YB6A 2FYIA 3V89B 4NF5A 1B1HA 4GIZA 1QKAA 4P11A 3ILUB 3MC2A 2I0BA 2F78A 4PE5B 2DSFA 3BFTA 3MQ9A 4Q5TA 2NUVA 1AH5A 1NNKA 2ONKE 4PFTA 3C32A 1M5FA 4JWYA 4DXBA 4YMBA 5FHMA 1P1NA 1DTZA 5K2XA 2R71A 3QK6A 3PMWA 1O64A 3SEXA 2PVUA 1N04A 3ECRA 3UP9A 1XC1A 2PT2A 3L6HA 2H98A 2R9JA 4NWDA 1NFTA 3OO9A 1Y4TA 1BTJA 2ZYNA 2ZNSA 3RTWB 4R74A 4IB2A 2XXWA 1FQFA 4I8CA 3K01A 1VE4A 1B4HA 2F5XA 4U1OA 2OK2A 5ISUA 5HBCA 3PUXE 4G2ZA 1OLCA 5CBRA 1PB8A 4TQUQ 1M5BA 3MWBA 1LAXA 5L9OA 3BFUA 1MDQA 2P0SA 3WAFA 1SW2A 3PUVE 2OBGA 1PDAA 4FAJA 3BKIB 1SQYA 1JETA 3CR9A 3MVWA 3GXAA 4R9FA 3O6IA 4O3CA 4R75A 1EZOA 3OEKA 1VFDA 3U1OA 3GZGA 2XX7A 1FCKA 1DMBA 3BBRA 4ZS9A 1A8FA 1ZKBA 2XXHA 2O1LA 3OMBA 5DVFA 3C34A 5AA2D 1T0KA 3A09A 1I6QA 3RQTA 3TYHA 5AA4B 1MXXA 3MP1A 1SW4A 4EXLA 3LSWA 2X26A 2QMXA 1HSEA 2OCUA 5HPQA 2ZNTA 3A3CA 3H6UA 3RY3A 4X9TA 3OO6A 4GXSB 4QFOA 1XVYA 4JBZA 3WAEA 3IB0A 2AL5A 3SEYA 5AA3A 4TLLB 4RXLA 2NVUB 2GRVA 3DP4A 3UORA 1Y3PA 4EF1A 1A54A 4THIA 3IB2A 1BKAA 2Y7IA 3KOTA 2XXUA 4NWCA 3Q27A 4H1XA 4GWOA 4H5FA 2OLBA 4YKKA 4HCYA 3C35A 1SBPA 4F29A 5TP9A 2F34A 4Z7EA 1Q1KA 3QUJA 2CZLA 4GL8A 3KG2A 2LAOA 2ALUA 2B3FA 4JXIA 1N3XA 5I56A 3FVOA 3OSQA 2F7BA 5CC2A 4OQOA 3CFLA 5F7VA 5DT6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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