4YKKA

Mnemiopsis leidyi ml032222a iglur lbd d-serine complex
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
247
structure length
247
Chain Sequence
NLIGRHLRLGSVEEQPFMFFATEGCEGNDCWSGMVNDMVVKLSEDLGFTYEYIQPDDRKFGALNKTTNEWNGMIRDLLDDKTDMIAIDLSTNSARKSAIDYSFPFMDAGIKAVVKGEGTTLNQVLELLDQDKYKWGVIGSRHPETLLKTHRDSRYSRLVDEGVELKDLNHAIETLRGGLFVFIDEGPVLAHNLISDCDVFSVGEEFQSFEYAFGLPKDSPYKSLIDSHLLKFREEGFIDILWEKWSS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Glycine activated ion channel subunits encoded by ctenophore glutamate receptor genes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ML032222a iGluR
molecule tags Membrane protein
source organism Mnemiopsis leidyi
total genus 78
structure length 247
sequence length 247
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-03-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10613 Lig_chan-Glu_bd Ligated ion channel L-glutamate- and glycine-binding site
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ykkA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ykkA02
4FORA 2ZMBA 5A5XB 3FJ7A 1M5EA 4KI0E 2I3VA 3Q25A 3MZ1A 3PU5A 2GRVA 4G8MA 2ONKE 2A5TA 4ZEFA 1R9LA 4YB5A 3W15C 1GTKA 2PYYA 3E3KA 4NE4A 3O97A 3EN3A 3RUMA 1MG1A 2V93A 2Y7WA 2OK2A 1LFIA 1LBBA 3BFTA 3G3GA 3W9WA 5J1DA 3L6GA 4OYVA 4YKIA 1SI0A 5TPAA 5HPQA 5CC2A 3VVDA 1NNPA 4HCWA 1AIVA 4UACA 1CB6A 1PBQA 3OEKA 1B3FA 3KOTA 3PPQA 5F7VA 3OSRA 3ZKKA 4IO2A 2D3IA 5CBRA 3IK6B 2B65A 1EH3A 4THIA 3KN8A 3WAFA 5I57A 5H8NA 3C31A 1BTJA 5DVFA 1ZIUA 4PP0A 3K1MA 2W7YA 4TLMB 1LAGE 4C1UA 3K02A 3C33A 2I58A 2XXRA 2DVCA 3KN7A 5HBCA 3N26A 1WVJA 4JWXA 1A99A 5FHOA 4PQJA 3U92A 3V89B 1A40A 2ZNTA 3RGYA 1B5JA 4DLDA 1O64A 2E0SA 3K6UA 3EHSA 1PB8A 3PUYE 5FTIA 4F3GA 4FATA 1MH4A 3FXQA 4EQ9A 5L8DA 4OWDA 1MDQA 1PEBA 1IQ7A 3MBPA 4PE5B 1N84A 4GXAA 3H6WA 1OLAA 2Z8EA 3K6XA 1O63A 2Y7KA 1FTMA 5CMBA 4KD5A 4R73A 2B3BA 4ND9A 1N76A 2UXAA 4RA1A 3RN8A 3PPOA 1R1NA 4EF2A 1O7TA 1PDAA 3S4UA 3LSXA 1IEJA 3MVWA 2OZZA 3HPIA 1USYH 4OTEA 1MXZA 4RK2A 2X7QA 4HS7A 1IXGA 2XHDA 4QHQA 1MM6A 3H6TA 1VE4A 1IXHA 1B3HA 1YPNA 3RY3A 4U4XA 4F18A 2ZNSA 3KSJA 5I2KA 1QKAA 1Y20A 1H43A 3W9VA 2F7AA 2ESNA 5KCJA 3E13X 3FVNA 3SEVA 1B2HA 5TP9B 4AB6A 4UA8A 5H8QB 3B6TA 1P1QA 2P1SA 2Q89A 1SQYA 4QF9A 4Z0IA 3PPNA 1H45A 1OLCA 1RYXA 3FGSA 4EXLA 3RT6B 1VFDA 2THIA 1MQHA 2H25A 4YU0A 3IO4A 4HW8A 2WKYA 2QS1A 1R9QA 4OFJA 1YCJA 3K6VA 3IOUA 1ZTYA 4NF6A 2I49A 1FQAA 3BFUA 4LQ5A 4G77A 1UTHB 1IXCA 3P7IA 4GF8A 4H6DA 1LGBC 2R6GE 4ZE8A 4ESXA 4NTLA 3ILTB 3UK4A 1FQBA 2VD2A 4EQ7A 3PD8A 4IO3A 3JYRA 3RPWA 1MY0A 3G3IA 3R26A 4ZEIA 2OBGA 1FCKA 3EF7A 2HAUA 1SW1A 4GFRA 3OEMA 5I2NB 3CFZA 1SYIA 3MW0A 2REGA 3SESA 5CM6A 2Y7IA 3MPLA 1A7LA 2F7BA 2HFBA 5I56A 1MS7A 3HV1A 3MVYA 3KFMA 4ONYA 2O69A 4P11A 1EU8A 2REJA 4NMYA 3CR9A 3HN0A 3VVFA 5CMCA 4POWA 1ZU0A 2ONRA 1Y3NA 3MZ9A 2DP8A 2XXPA 1MY4A 1DTZA 2X26A 1Y4TA 3QK6A 4KPTA 3A09A 2OJTA 3QAXA 4HTGA 3IB2A 2RF1A 1OMPA 2O68A 1B51A 4OENA 1N7WA 4QFKA 3A3CA 1Y3PA 3CIJA 4DXUA 2DWHA 1B3LA 3OO9A 2UVIA 1POTA 2NXOA 5H8FB 3IOTA 3D4CA 5KZTA 3HHGA 4H67A 4LZ8A 2DS9A 1MM7A 1VFEA 4ELQA 1MXVA 4F1UA 5H8HA 1HSLA 4KYDA 3UA8A 1MPDA 1PBPA 3MUQA 2PVUA 4RK9A 1F9BA 3H06B 1FW0A 1MXUA 4G68A 3GXAA 2UVJA 1DTGA 3MQ9A 5KDTA 4RPOA 2UYEA 1JW4A 4BDMA 2F34A 2RKMA 1B3GA 4YKKA 4ZEBA 2OCUA 1I6AA 2DE4A 3USDA 3IOVA 5L9OA 4XIGQ 1Y3QA 1I69A 2R71A 1MRPA 4XKPA 3H4ZA 1MQGA 5DTBA 1M5CA 1H3DA 2ZXTA 1B52A 3T9VA 2O7UA 1T0KA 5I59A 4JBZA 1MQIA 1TFAA 3TKDA 1B46A 1HSJA 5DEXA 2QMXA 2G29A 2P0SA 1MH3A 4R2BA 5AA4B 4H1XA 3LC8A 1VSOA 3O2AA 4FJPA 4KQPA 2HQ0A 3I6VA 3K1NA 3KZGA 1TT1A 4I62A 2ZYOA 2VGQA 5CMMA 4O3CA 3TQWA 2I6EA 4H0WA 2IEEA 2XXHA 3H03A 1IITA 4F2OA 3T9HB 2A5SA 4I8CA 4DZ1A 5LOMA 1MDP1 4F39A 2R9JA 3CFLA 3CSGA 1R6ZA 3MC2A 2F97A 2OWSA 4F22A 2RC7A 4P0GA 3RQTA 3U72A 1QJMA 3H6VA 3TDJA 1DPEA 2CMOA 2OLBA 4BLAA 3IJXB 3IB0A 1B32A 5I84A 4TOZA 3FXRA 5DVIA 3EHUA 3GZGA 2V25A 4MLVA 2HCAA 3CFXA 3UGWA 4ESWA 5A5XA 4PFWA 3FV1A 1CE2A 4I1DA 4MBPA 3TQLA 1OQGA 2A5TB 1DMBA 1ZBMA 4QRZA 2HAVA 5B70A 3FD3A 1PC3A 4JDFA 3C36A 3FVKA 5EHSA 1SVXB 4Q0CA 1GV8A 1UQWA 5TPAB 4M1VA 1MY1A 1JEUA 4GL8A 3TTMA 3V83A 3MVXA 3TELA 4NF4A 3CI8A 4BDOA 4KFQA 4OFLA 2V84A 1TFDA 3K01A 4POXA 4KYEA 3TCGA 4JXIA 4XKRA 2UVGA 4BDNA 1NKXA 3TCHA 2QPQA 4EQBA 2O1LA 1IUDA 2F5XA 1PB7A 4N13A 1GGGA 3A3UA 4U4SA 3SKPA 3VLVA 4U1ZA 4YKJA 1VR5A 3K2DA 4E0WA 1QVSA 5TU0A 2H98A 2DWIA 4MF3A 4XKQA 3HO7A 4DIGA 1HSEA 3HHFA 3TTNA 4U23A 3VE1B 3MWBA 1LB9A 2F8DA 3TCFA 4FEDA 2G93A 1M5DA 1LB8A 3H6UA 1NMUA 1SI1A 2YLNA 4R74A 1KWHA 4ELOA 5I58A 4RXLA 1D9YA 3MZBA 2X7PA 3OSQA 1YAEA 5BWJA 2XXUA 5AA3A 2QS2A 4H8IA 1II5A 1P1OA 2ONSA 4F19A 3CG3A 2ZYKA 3F11A 2QSXA 3OELA 4NWCA 3K0VA 4IGTA 1SYHA 4ZZEA 4GIZA 3QUFA 1USYE 2XXIA 2I3WA 3FIRA 4PFUA 4X48A 4Z7EA 1BKAA 1ELJA 4LONB 1QUKA 1GVCA 2Q2CA 4LA9A 4WEDA 1ANFA 3TTRA 1PB9A 5I2KB 3FVOA 3ECRA 3JV9A 3O6IA 1SW5A 3N94A 3PMWA 4RY1A 4LUBA 4YKPA 4G8HA 2H5YA 5EHMA 1BIYA 1OIBA 3WAEA 3Q27A 3KEIA 1ZKBA 1DPPA 3DP4A 4LZ7A 3OD7A 1ZJLA 3O29A 4DCXA 2RINA 5TP9A 2DVZA 4U1OA 2GFEA 3T22A 2NUVA 3E4RA 5H8QA 2PT2A 5B7DA 2F78A 2ABHA 3AXFA 1JETA 2DSFA 1Q1KA 1URSA 4QFOA 1Y4CA 4F3SA 3SEUA 1IZ1A 4GXSB 4OQOA 4DDDA 4FIMA 4IO4A 4OEUA 5AE4A 2DXYA 1FQFA 5IAIA 3I3VA 3DP8A 4U2RA 4L17A 5FTHA 3FV2A 3IO6A 2AL5A 2FNCA 4GD5A 1UTHA 4Q5TA 4P0IA 2DE3A 1POY1 5ICTA 4MLQA 1UIUA 2RCAA 1SW2A 3KG2A 3M3FA 3T96B 4F29A 2DXRA 2NVUB 5AA2A 3PPRA 2DWJA 3SETA 1FTKA 2VOZA 3K1PA 1B7UA 4FECA 4PETA 2H9BA 5M2VA 1FQDA 5I2NA 3QIMA 3TAJA 3ZS6A 4MH5A 4U21A 1S7YA 2XXQA 2QS3A 1LBCA 4ZEKA 4JWYA 5DYHA 1MPBA 1BP5A 2I0BA 2HXWA 3IORA 3SEYA 3EHTA 4JB7A 1BLFA 2XXWA 1MXWA 3LBSA 5JTYA 4PFTA 2VD3A 3PUZE 4QSDA 3QXMA 3DELB 1A8FA 3G3JA 3T93B 1MY2A 2AYSA 3TUSA 1UTBA 3TZAA 4AB5A 3MP6A 4EXKA 1MY3A 1US4A 1JNFA 4N07A 2RC8A 4YB6A 2HZKA 4PFYA 1WDNA 1LAHE 1URGA 4R9GA 2AL4A 1EZPA 1WODA 4IO6A 3B7DA 2XD3A 2PBWA 5HM4B 4JWOA 2DWAA 3CRBA 3OXNA 2LAOA 4RYAA 4X1BA 4ZEDA 2QMWA 3O9PA 1SDXA 4TLLB 3UIFA 3T9XB 4WXJA 2O7IA 5L9SA 1B4HA 2HZLA 5CMKA 4NWDA 1FTOA 2H99A 3U94A 3VFJA 4YAHX 1QKBA 2QL3A 2ANJA 1XS5A 3S9EA 3ZKLA 4JSOA 2M8CA 2XXVA 3PUWE 5I59B 4DXBA 3KBRA 4R9FA 4NF5B 2HEUA 1NNTA 4G2ZA 3E9XA 3SERA 4IO7A 4GRKA 1D3KA 2I4BA 3ODBA 2XXYA 2Y84A 1I6BA 4LQ2A 4OERA 4X9TA 4YMBA 3HSTA 1JQFA 2IA4A 2P2AA 4EF1A 1FTJA 2Z8DA 4OXVA 1B4ZA 5AA4A 4K3FA 5ISUA 2E1SA 3FUZA 4I9DA 1B0LA 1B1XA 4WKMA 4GWOA 1SBPA 2QRYA 3FJGA 3K4UA 3MVZA 1B6HA 1S9TA 4MFIA 4FEBA 2O84X 2XD2A 3EPEA 4G4PA 1MXYA 1TXFA 3VVEA 4GLIA 3C9HA 1NNFA 4OFOA 1B58A 5BUUA 1FTLA 4KYSA 4NF8A 4QFPA 1P1NA 4LVQA 3KSXA 2PMSA 2DYXA 3ILUB 3N6TA 4IO5A 1N04A 3QYTA 2Z23A 5L9MA 2DQVA 1MQDA 1FQEA 4E0XA 4EDPA 2ZNUA 1S50A 2Y7RA 4H65A 3C32A 1EZ9A 2V3TA 4RPNA 4O3AA 2B3FA 3PUXE 3VXBA 3Q28A 4IGRA 1B0HA 4FE8A 3FJMA 1ATGA 1IXIA 2D21A 2O6AA 3MP8A 4G68C 1H44A 3D4GA 3S9MC 4NF4B 3PMXA 5K2XA 1L5TA 2UYFA 2GHAA 1QUJA 1Z7ME 3O6HA 1LLSA 3TEPA 1LCTA 5I57B 5H8NB 3LUYA 3RTWB 1Z7NE 4NEDA 3G7WA 1XVXA 1D9VA 4R6YA 1LSTA 3B6WA 1A55A 1N3WA 1AL3A 1YTVA 2O1MA 3N5LA 4R72A 3FXUA 2NOOA 1J1NA 4YMAA 3U93A 3VLWA 2Q8JA 5AA2D 3I5OA 4ELPA 4YB7A 2F6PA 3C35A 4Q8RA 1US5A 5EYFA 3LR1A 3IX1A 3T9UA 3K6WA 2XXXA 5DVJA 3BKIB 2O51A 3R6UA 3QSLA 3DLNA 3V8XB 4RNSA 2QS4A 5I58B 3C34A 1LAXA 2PT1A 3FVGA 3TMGA 3LSLA 2F35A 1I6QA 2RC9A 3G3KA 3CG1A 1D4NA 4ECFA 1ZMGA 1OVBA 1B1HA 4JSDA 1M5FA 3V5AA 3IAZA 3TTLA 1B3EA 1ZLQA 3MAMA 2F6GA 1B40A 2UVHA 2VHAA 4DE8A 3G3FA 2QJEA 1NFTA 4OZ9A 3RNNA 4KHZE 3S9NC 3O28A 3DM0A 1URDA 3T66A 3TYHA 5ICQA 4ZS9A 3PUVE 4R2FA 1A54A 3PPPA 4U22A 4GL0A 4O3BA 4ELRA 2CZLA 1NH8A 3B6QA 4C0RA 5ITPA 4OHNA 4C1TA 1P99A 4EUOA 5KCJB 4KCDA 4DXCA 1EZOA 2I0CA 1XVYA 3H3GA 4KCCA 3FASA 1LCFA 3IJOB 3GBAA 3Q29A 4BDLA 2AIXA 4XXUA 2GH9A 3CVGA 1GR2A 4R75A 1Y9UA 5FHMA 1DSNA 2V3QA 2XX7A 4XKNA 4ISUA 1XOCA 3PMVA 1B7ZA 4OEVA 3G3HA 1LFGA 3O66A 3IOWA 1M5BA 4BDRA 1P1WA 2DOJA 3DP6A 4OVJA 4NF6B 2Z22A 3UP9A 4GOTA 3N6UA 2VP1A 2BJJX 2ZYNA 4ZECA 3C4MA 3TODA 3HCQA 1SD3A 1LAFE 2KLFA 1N3XA 5CBSA 1RYOA 5K2YA 3IB1A 1NNKA 3CSBA 2DE2A 4LZ5A 3OO7A 4F1YA 3KOSA 2Q88A 5JK4A 2XX8A 2I4CA 4ZE9A 4HCYA 1XC1A 3RTFB 4GQOA 4OMBA 1TWYA 5AA2B 2I48A 1NL5A 4LP2B 5IKBA 1IIWA 3OO8A 5I56B 3LSWA 3SEXA 2D5WA 1DOTA 1B7HA 3VLUA 2OWTA 3SEWA 3VV5A 2Y7PA 4F31B 1AMFA 3MP1A 4F1VA 1OVTA 5CI5A 1JVYA 3VDFA 4R6KA 4OESA 4KR5A 1JW5A 3GBBA 2F7CA 1JW1A 3OO6A 1A8EA 3R7XA 3M3LA 4YICA 5JTYB 3M8UA 3IR1A 4DCYA 1UIVA 2FYIA 1AH5A 3OMBA 3OOAA 1UTBB 4H5FA 3KJ7A 4IY5A 4G8NA 2PX1A 1QUIA 4H5GA 4N6PA 3VXCA 1MQJA 3BBRA 2NWJA 5DT6A 5ITOA 4R6HA 4TQUQ 2Q9TA 2Q2AA 5CRYA 5H8HB 3ZSFA 2GHBA 2F36A 1XT8A 5H8FA 1QULA 3EQ1A 1JVXA 2YPNA 4G68B 5FHNA 3U8QA 3FATA 3RT8A 5KDTB 2FA7A 2H4IA 3FZVA 4BDQA 5JEIA 4ZDMA 3UORA 3JZJA 4ZZAA 1N7XA 3KN3A 4QSEA 3M3KA 3PGFA 4IB2A 3ONMA 2YJPA 1Q35A 1N0TA 4OETA 3KJTA 3RLFE 5F1QA 1MPCA 3PD9A 2Z8FA 5DEXB 3S9LC 3H7MA 4RJZA 4X1DA 2RCBA 3K00A 3SDFA 1B5HA 1MXXA 1H76A 3TFLA 5H8SA 4M4GA 4WEPA 1P1UA 4F3BA 4NF5A 2ZYMA 3LSFB 1JEVA 3Q26A 3O6GA 3THIA 3KGCA 1AOVA 3QUJA 3IL1B 4F2QA 5AA1A 3OENA 1XHYA 1RKMA 3MPKA 1LFHA 1B9JA 3S2VA 2XXTA 1Y1MA 3U1OA 4QFNA 1Y1ZA 4Q30B 1QW0A 4F3PA 4GVOA 3TTKA 3MJNA 1B05A 4QFLA 1NH7A 4FAJA 3TPAA 4AQ4A 4H8JA 1SW4A 3PV0E 4QSCA 4LATA 1B5IA 3GLBA 2ALUA 1FQCA 3UN6A 4IY6A 2V3UA 5ELVA 1OQHA 4YZZA 4NF8B 4XTCQ 2XX9A 3L6HA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FORA 2ZMBA 5A5XB 3FJ7A 1SPIA 1M5EA 4KI0E 2I3VA 3Q25A 3MZ1A 3PU5A 3GYYA 3A29A 4XFEA 2GRVA 4G8MA 2ONKE 2A5TA 4PCDA 4ZEFA 1R9LA 4YB5A 3W15C 1GTKA 2PYYA 3E3KA 4NE4A 3O97A 3EN3A 1EYIA 3RUMA 1MG1A 2V93A 2Y7WA 2OK2A 1LFIA 1LBBA 3BFTA 3G3GA 3W9WA 5J1DA 3L6GA 4OYVA 4YKIA 1SI0A 5TPAA 5HPQA 5CC2A 3VVDA 1NNPA 1Q9DA 4HCWA 1AIVA 4UACA 1CB6A 1PBQA 3OEKA 1NV0A 1B3FA 3KOTA 3PPQA 5F7VA 3OSRA 4AS5A 3ZKKA 4IO2A 2D3IA 5CBRA 3IK6B 2B65A 1EH3A 3T1BA 4GX3A 4THIA 4PBQA 3KN8A 3WAFA 5I57A 5H8NA 3C31A 1BTJA 5DVFA 1EYKA 4PF8A 1ZIUA 4PP0A 3K1MA 2W7YA 4TLMB 1LAGE 4N81A 4C1UA 3K02A 3C33A 4PBHA 2I58A 4H45A 2XXRA 2DVCA 3KN7A 5HBCA 3QMFA 3N26A 1WVJA 4JWXA 1A99A 4XF5A 4GX4A 5FHOA 4PQJA 3U92A 3V89B 1A40A 2CEYA 2ZNTA 3RGYA 1B5JA 4DLDA 1O64A 2E0SA 3K6UA 3EHSA 1PB8A 3PUYE 4GWZA 5FTIA 4O94A 4F3GA 4FATA 1MH4A 3FXQA 4EQ9A 5L8DA 4OWDA 1MDQA 1PEBA 1NUYA 1IQ7A 3MBPA 4PE5B 1N84A 1FPKA 4GXAA 3HFUA 3H6WA 1OLAA 2Z8EA 3K6XA 4GWWA 1O63A 2Y7KA 1D9QA 4PDDA 1FTMA 4HXVA 1FPEA 5CMBA 2FIXA 4KD5A 4R73A 2B3BA 4ND9A 1N76A 2UXAA 4RA1A 3RN8A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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