5H8QA

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with gne8324
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
278
structure length
276
Chain Sequence
NHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Positive Allosteric Modulators of GluN2A-Containing NMDARs with Distinct Modes of Action and Impacts on Circuit Function.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A,Glutamate receptor io
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
total genus 81
structure length 276
sequence length 278
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8qA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8qA02
4M1VA 4NMYA 3VVEA 4EQ7A 3H3GA 3PMVA 2CZLA 4GXSB 1SYIA 2RC7A 1HSJA 1RYXA 3G3GA 1I6AA 1Y4CA 1N7WA 4U21A 3U72A 4LVQA 5M2VA 4ISUA 4FE8A 1NL5A 2O51A 4BLAA 4H6DA 4FIMA 1SD3A 1OMPA 1M5DA 1GR2A 4I9DA 1B5JA 4OFLA 2HAVA 4F1UA 5I2NB 4Q30B 2OZZA 5H8QA 5L9MA 4QSEA 3FD3A 4U1OA 2QS2A 2UXAA 3ZKLA 1II5A 2XXQA 1B46A 3G3FA 1AH5A 4NF5B 1MH3A 1MPBA 4DXCA 2QS4A 4FORA 1FCKA 4IO3A 4YB6A 4PP0A 3SEVA 3U92A 2BJJX 2ZNUA 4KYSA 4JBZA 4F18A 5ISUA 4U1ZA 4ELRA 4DXUA 2VHAA 4HS7A 4HCWA 2YPNA 2F7CA 2ANJA 1TFAA 3BKIB 3C9HA 2RINA 3PUVE 2O69A 4QFOA 3T66A 4OEUA 3EHTA 3D4CA 3CFZA 1IXHA 3W9WA 2R9JA 1OVTA 3OENA 2XHDA 2XXHA 3DP4A 3MP8A 1FQBA 3QIMA 4Q5TA 2PT2A 2GRVA 4H67A 5H8QB 4GXAA 2DXYA 2VGQA 1FTOA 1UQWA 1Z7NE 4OTEA 3FZVA 3K0VA 1JW5A 1I69A 3TDJA 3TAJA 1IXCA 4HTGA 4OWDA 4RYAA 1PB8A 3BBRA 3MPLA 4OMBA 3TODA 3B7DA 4ZS9A 3WAFA 5JEIA 3RLFE 1NH7A 4K3FA 4LP2B 1FQDA 3O9PA 1SDXA 4G4PA 3GBAA 2DVCA 2GH9A 4IY6A 3RTFB 4DE8A 4KD5A 3RQTA 3F11A 3LBSA 1YTVA 1BTJA 1LAHE 4WKMA 3MZBA 1IZ1A 3C4MA 3TZAA 4KCDA 3OO7A 1M5CA 5F7VA 1MPCA 4EF2A 1D9VA 3TTNA 2H99A 3E13X 2HXWA 3VDFA 1N7XA 4FECA 4OYVA 1B58A 4OESA 4P11A 2G93A 3VLVA 4EDPA 1B40A 4RNSA 4R74A 1B3EA 4JXIA 4LUBA 2H9BA 4TLMB 3KSXA 1B7UA 3V89B 2RKMA 3IAZA 4ECFA 5CI5A 1UTBA 1LAXA 3EN3A 2ZNSA 4R72A 3CIJA 4FAJA 1USYE 2Z8DA 4IO2A 3LSWA 1LCTA 1B52A 1ZTYA 3ILUB 1A99A 3E3KA 4QRZA 5CMKA 1VFDA 3PUYE 2O84X 4YAHX 3FV1A 3ODBA 2M8CA 3QAXA 3RNNA 3H6TA 3O97A 1MQHA 4KYEA 4X9TA 4THIA 5HPQA 4H5GA 4LONB 2V84A 1SBPA 1QVSA 4H65A 5KCJB 3IOVA 1UIVA 4FEBA 4QSCA 3IK6B 3CG3A 2D5WA 1ZLQA 3VXBA 5DYHA 3OO8A 4H5FA 1AMFA 1MXWA 3OSRA 4Z7EA 4JDFA 2AL4A 2REJA 5J1DA 3KZGA 3KOSA 4AB5A 4PFTA 4OZ9A 4G8HA 3K4UA 3R6UA 4U4XA 1BLFA 2Y7RA 5CRYA 1JEUA 1XC1A 1WDNA 3SEWA 1UTBB 3FXRA 4E0XA 1R9LA 2YLNA 3OMBA 3M3KA 4I62A 5AA2D 1NMUA 3MW0A 4U2RA 2I6EA 5FHMA 2XXPA 4F22A 2ZMBA 1Q1KA 4F3BA 1JNFA 3K02A 3K1NA 2Y7KA 1FTMA 3TUSA 1H3DA 4PQJA 1B4ZA 4HW8A 1NFTA 1QUIA 2XXWA 3KFMA 2ZYMA 4XTCQ 3PD9A 3A09A 3TFLA 4F2QA 3TKDA 2QMXA 3FJ7A 1H45A 3U94A 3K2DA 3RPWA 4BDOA 2FYIA 4G8MA 1B5HA 4EQ9A 2IA4A 2ZYNA 3VLUA 3CSBA 2H25A 3H06B 1EZOA 4R73A 2ALUA 1PDAA 2QS3A 3IOTA 1QKAA 4R6HA 4DXBA 5KDTB 1N84A 1B5IA 4ZECA 4XIGQ 1OLCA 3MP6A 1T0KA 2RF1A 1IXGA 3W9VA 3S9EA 1GGGA 4I8CA 3QUFA 3H6UA 1MXZA 1XVYA 3KSJA 4FATA 3PPRA 1QW0A 5ELVA 1FTJA 3MPKA 3M8UA 3MVXA 2F97A 4ZDMA 1OQHA 4U4SA 1YPNA 3PPPA 2ESNA 2YJPA 3DELB 4FJPA 3UP9A 1UTHB 1S9TA 1WVJA 3GBBA 5CMMA 1XS5A 3THIA 2OWSA 4NEDA 4G68A 3C34A 3IORA 3K6UA 4IB2A 3RY3A 5B7DA 1WODA 4OENA 3N6TA 4ZEFA 1M5EA 4GIZA 2B3BA 3BFUA 3QYTA 3I5OA 2UYEA 5DEXA 4N07A 1I6BA 5K2YA 5AA1A 1IIWA 3LC8A 4R2FA 1OVBA 3G3JA 2O7UA 2DWIA 3VVFA 3SKPA 3N5LA 1OLAA 4OHNA 1MDP1 3JV9A 2HQ0A 3OELA 4RK2A 3OOAA 1MM6A 3L6HA 1R6ZA 3G3IA 4YZZA 2A5TA 3HHGA 1SW1A 4JSOA 1GTKA 1LSTA 4XKRA 1LFGA 5JTYB 4QF9A 2V3QA 1QUKA 2A5SA 1POY1 4F31B 3UA8A 4G68B 4QHQA 3USDA 3Q28A 4NTLA 2XX9A 3S9LC 4C0RA 2DOJA 3DLNA 2Z8FA 2QPQA 2DS9A 5DEXB 3TQWA 2I58A 2NXOA 3SESA 3S9NC 4N13A 2QMWA 3MVWA 3HHFA 3IR1A 4HCYA 2I49A 5DVJA 3S9MC 4POWA 1AL3A 3HO7A 4LZ8A 3JZJA 2A5TB 4RJZA 2RCAA 3TTMA 5CBRA 2W7YA 1A40A 4F39A 4GL0A 1VE4A 1Y1ZA 4BDRA 1P1WA 4DDDA 2HEUA 1P99A 4NE4A 2O1MA 1FTKA 5JK4A 1F9BA 1B6HA 5IKBA 3H6WA 1MRPA 1IUDA 1XT8A 4YKJA 3T9VA 1LFIA 4I1DA 1JW4A 3OO9A 4NF8A 2O6AA 4YKKA 3KG2A 3S4UA 1QULA 1N3WA 2Q9TA 2AIXA 3RT8A 1JW1A 1MY3A 1QKBA 4LQ5A 2F6PA 2D3IA 1NH8A 3C32A 2DWJA 1DTGA 5CC2A 1B3HA 2F7BA 5CBSA 2F34A 4WXJA 4O3CA 4EF1A 1ATGA 1MQJA 1OIBA 4G8NA 3U1OA 1B0HA 2V25A 4UACA 3FATA 5FHNA 3QUJA 5HM4B 4ND9A 4ESWA 2F6GA 4RPNA 4GVOA 2G29A 3C36A 2D21A 4GWOA 3RN8A 1EZ9A 1LGBC 2UVGA 2XX7A 4X1BA 2I3WA 4ZZEA 4JB7A 4OVJA 1A8EA 2V93A 3PPNA 1MY1A 1MH4A 5TP9A 3GZGA 1N04A 4ELQA 1B3LA 4XKNA 2VD3A 2H98A 1AOVA 4U23A 3KN7A 4JWOA 1NNPA 4IO7A 4MBPA 5AA2A 1Y20A 3A3CA 4XKPA 4L17A 1SW4A 1MY4A 2ONSA 3IB0A 4R9FA 1H44A 3CG1A 3CSGA 3MZ1A 3B6QA 1NNFA 1LFHA 1US4A 5I59A 3MQ9A 1XHYA 3VVDA 4ZE9A 3IB1A 1JVXA 1B9JA 5EHMA 1DPEA 3TPAA 5FTIA 3ZS6A 1SVXB 3SEUA 4GL8A 3CRBA 4N6PA 3VFJA 1HSLA 2Z23A 4TOZA 3OSQA 3KN3A 5HBCA 4ZEDA 4F3SA 3C35A 2B65A 1LBBA 1KWHA 4H0WA 3PU5A 2V3UA 1S50A 5TP9B 1PBPA 3FVNA 4LZ7A 3M3LA 4G77A 5KZTA 4MFIA 1N76A 2OLBA 3PGFA 1BP5A 3FJMA 5AA2B 5DVIA 2ZNTA 1MM7A 2ONKE 1SQYA 2NWJA 5LOMA 2Z22A 1B32A 1USYH 2HCAA 1FQCA 5AA4A 5TPAA 3PV0E 2I4CA 2DWAA 5I59B 1ZJLA 3O28A 4ZE8A 1ZBMA 2UVIA 1FQAA 1JEVA 2OBGA 2NUVA 3GLBA 3PUZE 5EHSA 3H4ZA 1I6QA 3M3FA 3PMXA 1Q35A 3G7WA 2ABHA 1EH3A 5CMCA 1SI1A 3OEKA 4YKIA 2F5XA 5CMBA 4R2BA 3H03A 2V3TA 5CM6A 4NWCA 3FIRA 1URGA 3TELA 2NOOA 1URDA 5AE4A 1Y3NA 4NF4A 4IO5A 2ZXTA 3OO6A 4RK9A 1LAFE 3K6XA 4YICA 2OWTA 4QFPA 2Q2CA 5FTHA 2CMOA 3HCQA 1IITA 4C1UA 4KPTA 1Y9UA 4F29A 3IO4A 5BWJA 4Q0CA 1LAGE 4IY5A 3FASA 3HN0A 1TWYA 5AA4B 1YAEA 3KJTA 1D4NA 2GFEA 2PYYA 4ZZAA 2OJTA 3SEYA 5DVFA 3FV2A 4QFNA 1OQGA 4OEVA 1MQIA 5ICTA 2DYXA 5H8FA 4XXUA 2XXUA 1B05A 3DM0A 4DZ1A 4OETA 3LSLA 5H8SA 1L5TA 1EU8A 3PPQA 4AQ4A 4H8JA 4PE5B 3I6VA 1ZIUA 2QJEA 1PB9A 3CFLA 1NNTA 4NF4B 1FQEA 3IL1B 4DCXA 1A7LA 4UA8A 2GHAA 2XXXA 4YMAA 2I0CA 4GRKA 1B51A 1SW2A 4GFRA 3N94A 3B6WA 1LB9A 3FXUA 2QL3A 4GLIA 4JWXA 3KEIA 3TCGA 3WAEA 4YB7A 2QSXA 4KI0E 1Z7ME 4G68C 1B2HA 4F3GA 3BFTA 1FW0A 3TMGA 3CI8A 2RC8A 5TU0A 3L6GA 4NWDA 3N26A 4IO6A 2LAOA 5I56A 3C31A 4OFJA 5BUUA 5AA3A 5H8FB 1Y4TA 1JQFA 1MY2A 1TT1A 4LQ2A 4M4GA 1ZU0A 2RC9A 3HPIA 4LZ5A 4MLQA 1B7HA 3Q26A 4EQBA 5L8DA 1B1XA 3SEXA 3T9XB 3V5AA 3MUQA 3KN8A 4LATA 4IGRA 2X26A 2IEEA 1S7YA 1US5A 3Q25A 4OXVA 1FQFA 4F19A 1LLSA 4ZEIA 4DIGA 4ONYA 4F2OA 3IJXB 4PFYA 1B0LA 4PETA 3A3UA 4EXLA 3K01A 3I3VA 1Y3PA 5H8HA 4ESXA 2Y7WA 2THIA 3LSXA 3S2VA 5I56B 4KCCA 1IQ7A 2H5YA 1B3GA 1Y3QA 3V83A 2DE4A 1SYHA 3KOTA 5I58A 5EYFA 3IOUA 3LR1A 2VP1A 2Y84A 1H43A 1SW5A 3O6HA 4MF3A 3FVKA 3UN6A 2AYSA 5K2XA 3SERA 4TLLB 3VE1B 4BDLA 2X7PA 5B70A 3K6VA 3OD7A 3MBPA 3HSTA 1MXVA 3ILTB 2P0SA 3CFXA 3PPOA 3K6WA 1M5BA 3KJ7A 3TTKA 4MH5A 1O63A 2Q2AA 3H7MA 1H76A 2PT1A 3R26A 2P2AA 4JWYA 2FNCA 1O7TA 4LA9A 4R75A 1DTZA 3K1MA 2UVHA 1R9QA 5H8HB 3FJGA 2Q88A 4DCYA 1B7ZA 4GOTA 2F36A 5A5XA 1POTA 4RA1A 3ZKKA 2B3FA 2XXIA 5I58B 2Y7IA 3E9XA 3SDFA 2F35A 2ZYOA 4X1DA 2AL5A 2ONRA 2WKYA 3FVOA 2F7AA 4GD5A 1CE2A 4O3BA 2RCBA 4JSDA 5L9SA 2PVUA 3RTWB 5ITPA 1XVXA 3RT6B 4Q8RA 3RUMA 2DE2A 2PX1A 4E0WA 4MLVA 3O2AA 3VLWA 3K1PA 4R6YA 5H8NA 4DLDA 2NVUB 4H8IA 5I2KA 1DMBA 3PMWA 3AXFA 3G3KA 5ICQA 4EXKA 2I0BA 3MVYA 4R9GA 3TYHA 4NF8B 1JETA 3Q27A 3LSFB 4KR5A 5A5XB 5DT6A 3R7XA 4OQOA 2DXRA 3V8XB 1LB8A 2QRYA 1PEBA 4ELOA 2QS1A 1P1UA 1B4HA 1MY0A 5KCJA 1LCFA 3EQ1A 1ANFA 3ONMA 1LBCA 3PUXE 2XD2A 3EHUA 3O6IA 4Z0IA 3KGCA 3T9HB 4H1XA 4WEDA 3C33A 4F3PA 4TQUQ 1B3FA 1PB7A 1GV8A 3E4RA 2O7IA 4PFWA 4QFLA 2DVZA 1TXFA 4YU0A 2GHBA 3TQLA 4R6KA 1N0TA 4KYDA 1GVCA 1MS7A 1MXUA 3H6VA 3IB2A 5H8NB 3GXAA 5I2KB 4IGTA 2XXVA 3N6UA 1P1OA 4P0IA 4KFQA 3EF7A 1MG1A 1BIYA 3OXNA 3CVGA 4OFOA 3ECRA 2UYFA 3P7IA 3MC2A 2I48A 2H4IA 1HSEA 3MVZA 2KLFA 5I84A 1XOCA 4P0GA 1D3KA 1IXIA 4QFKA 4BDQA 1SI0A 3UIFA 4G2ZA 2O1LA 4GQOA 3Q29A 2DSFA 5DTBA 2I3VA 3T96B 3MAMA 3TTLA 1DSNA 2F78A 1URSA 1VFEA 4QSDA 1MDQA 1ZKBA 1VR5A 1AIVA 5KDTA 2DE3A 1P1QA 4KHZE 3VV5A 2R6GE 4IO4A 2O68A 2I4BA 1CB6A 1N3XA 1RYOA 4O3AA 3T9UA 1VSOA 1M5FA 3IJOB 1MXXA 2OK2A 4FEDA 3QXMA 3IO6A 1IEJA 2PBWA 2PMSA 3UK4A 2FA7A 1B1HA 2E1SA 2DP8A 2XXRA 4YB5A 2E0SA 4WEPA 3G3HA 4X48A 1A54A 3KBRA 1DPPA 1ZMGA 1EZPA 5IAIA 5TPAB 1PC3A 3T22A 4BDMA 4ZEBA 3TEPA 1UTHA 4GF8A 3TCHA 3MP1A 4NF6A 1RKMA 4POXA 3FUZA 3JYRA 3QSLA 3PUWE 4RXLA 1O64A 3DP8A 4YMBA 1FTLA 2HZLA 2OCUA 4U22A 4F1YA 5FHOA 5F1QA 1QJMA 3LUYA 2HAUA 4ZEKA 2REGA 2XX8A 3QK6A 4RPOA 2P1SA 2UVJA 3EHSA 3U8QA 3K00A 1MPDA 3B6TA 5L9OA 2XXYA 3SETA 3MZ9A 2X7QA 3UGWA 3RGYA 4RY1A 5I57A 1PBQA 3HV1A 3OEMA 2ZYKA 4PFUA 4EUOA 2XD3A 1DOTA 1A8FA 1J1NA 1NNKA 2VD2A 3DP6A 3IOWA 1P1NA 3TTRA 3D4GA 5ITOA 3O6GA 4XKQA 3W15C 3MWBA 3MJNA 3IX1A 4NF6B 4BDNA 4YKPA 2Q89A 2Q8JA 1MXYA 1BKAA 1JVYA 5JTYA 2R71A 3TCFA 3O29A 2VOZA 4OERA 3VXCA 1YCJA 2HZKA 1A55A 2Y7PA 1D9YA 2XXTA 3FGSA 2Z8EA 2DWHA 2F8DA 3CR9A 3O66A 3U93A 3ZSFA 4ELPA 4KQPA 1MQDA 3FVGA 1UIUA 1ELJA 5I2NA 3T93B 1NKXA 2DQVA 5I57B 1Y1MA 4C1TA 3PD8A 4AB6A 1QUJA 1R1NA 2HFBA 4NF5A 1MQGA 3FXQA 3UORA 3EPEA 4F1VA 1TFDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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4OMBA 3TODA 3B7DA 4ZS9A 3WAFA 5JEIA 3RLFE 1NH7A 4K3FA 4LP2B 1FQDA 3O9PA 1SDXA 4G4PA 2PCRA 3GBAA 2DVCA 2GH9A 2CEYA 4IY6A 3RTFB 2FVZA 4DE8A 4KD5A 1FJ9A 3F11A 3RQTA 3LBSA 1BTJA 1YTVA 5IZ1A 1LAHE 2HHMA 4WKMA 3MZBA 1IZ1A 3C4MA 2XXKA 3TZAA 4KCDA 5EYGA 3OO7A 1M5CA 5F7VA 1MPCA 4EF2A 1D9VA 3TTNA 2H99A 3E13X 2HXWA 3VDFA 1N7XA 4FECA 4OYVA 1FSAA 1B58A 4OESA 4P11A 2G93A 3VLVA 4EDPA 1B40A 4RNSA 4R74A 4N81A 1B3EA 4JXIA 4LUBA 2H9BA 4TLMB 3KSXA 1B7UA 2L5VA 3V89B 2RKMA 3E78A 3IAZA 2WEFA 2XA5A 4ECFA 5CI5A 1UTBA 1LAXA 3EN3A 4PBHA 2ZNSA 4R72A 3CIJA 4PFBA 2FIEA 4FAJA 3D1RA 1USYE 2Z8DA 4IO2A 3LSWA 1LCTA 1B52A 1ZTYA 3ILUB 4MMPA 1A99A 4QRZA 1FPJA 3E3KA 5CMKA 1VFDA 5IZ3A 3PUYE 2O84X 4YAHX 3FV1A 3ODBA 2M8CA 3QAXA 3RNNA 3H6TA 3O97A 1MQHA 4KYEA 4X9TA 4PGNA 4THIA 5HPQA 4PCDA 4H5GA 2JJKA 4LONB 2V84A 4NAPA 1SBPA 1QVSA 4P1EA 5IM2A 4H65A 5KCJB 3IOVA 1UIVA 4FEBA 4QSCA 3IK6B 4MAGA 3CG3A 2D5WA 1ZLQA 3VXBA 5DYHA 3OO8A 4H5FA 1NV1A 1AMFA 1MXWA 3OSRA 3KBZA 4Z7EA 4JDFA 2AL4A 2REJA 5J1DA 3KZGA 3KOSA 4AB5A 4PFTA 4OZ9A 4G8HA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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