5H8QA

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with gne8324
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
278
structure length
276
Chain Sequence
NHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
Updating...
connected with : NaN
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
publication title Positive Allosteric Modulators of GluN2A-Containing NMDARs with Distinct Modes of Action and Impacts on Circuit Function.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A,Glutamate receptor io
total genus 81
structure length 276
sequence length 278
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8qA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8qA02
3KN3A 3H6VA 1M5EA 1XVXA 1URDA 3TZAA 1YAEA 4GXSB 4GD5A 3U72A 3TTNA 3BFTA 3H6WA 2DE4A 4U21A 3KZGA 4H65A 5CRYA 3S4UA 3N6TA 3O6GA 1OLCA 1MY3A 2PT2A 5I84A 4O3AA 4IO2A 4R74A 4RPNA 2BJJX 3CIJA 4ZZEA 3HPIA 4QFNA 3QXMA 1Y20A 3MPLA 3RPWA 4H0WA 3CVGA 4UA8A 1PC3A 4FAJA 4R2BA 3GLBA 1PB9A 2HCAA 1LSTA 2Y7KA 2F5XA 3BKIB 1DPPA 2XX8A 4DCYA 1Y3PA 2GHAA 3I3VA 2QSXA 3PUZE 1EZOA 1B5JA 5DVJA 2D5WA 2ZYOA 4XKPA 3IAZA 1PB7A 2NOOA 1B7UA 3B6WA 1B3EA 4R6YA 2FA7A 3PV0E 3TCHA 3AXFA 2XHDA 5EYFA 4ZE9A 3G3GA 2RC9A 1P1WA 2AIXA 2YJPA 1A8FA 3MP8A 1FTLA 3FXRA 1FQDA 3VLWA 2V93A 4GQOA 2I3WA 1MRPA 3U94A 3O66A 4XKRA 4YKKA 3RQTA 1Y4TA 1JNFA 2RF1A 1N3WA 1VR5A 3G3KA 5A5XB 3GBBA 5A5XA 3FXQA 3ILTB 3MWBA 3MVXA 3RTFB 4HW8A 3V8XB 3VE1B 3TTRA 4MF3A 4OXVA 1B3HA 3PUYE 4ZEDA 1FQBA 5DEXB 3CG1A 3H6TA 4NEDA 5DEXA 4DLDA 4ELQA 4YKPA 2QRYA 4YKIA 4POXA 4IGTA 3IOVA 3K0VA 1M5CA 3G7WA 2UVGA 3SEWA 3FVNA 2GFEA 2UVHA 4GF8A 4MBPA 2XXHA 5ITOA 3OO7A 2O6AA 1DSNA 3MP1A 4BDRA 2O69A 1H43A 4ELOA 3KEIA 5JTYB 1SBPA 4G8HA 2ONKE 1EH3A 1S9TA 5JTYA 4IY6A 3O97A 1MQDA 2PMSA 4FE8A 3KBRA 1SI1A 3DP6A 1GVCA 1ELJA 3CFZA 2PYYA 1NMUA 2UYFA 3K4UA 3MVWA 4ISUA 1D4NA 3TYHA 1R1NA 4PQJA 3K1PA 5EHMA 3OO9A 5FHNA 4KPTA 1IEJA 3FVGA 1ZTYA 3FGSA 5ICQA 4R72A 4OESA 4ELPA 2NVUB 3QIMA 2Z8EA 2IEEA 1AIVA 3PPNA 2DXYA 1B1HA 4TLMB 3B6TA 1IXIA 2HZLA 2H9BA 4NF8B 4NF8A 1N0TA 4GL8A 3OELA 1IITA 1B7ZA 1PBQA 2GHBA 3MW0A 1B9JA 2RC7A 5CMCA 1FTKA 1MXXA 5HPQA 4HCYA 2VHAA 3K1MA 1NNFA 3KGCA 4XKQA 2XXIA 3G3JA 2Q2AA 4EQBA 4G8NA 3H03A 2V84A 3DELB 3HSTA 4OHNA 4QFKA 1I6BA 1SW1A 1EZ9A 2DVZA 4QRZA 2HXWA 5BUUA 1MY1A 1B1XA 1N3XA 4E0WA 5HM4B 4IO5A 3SKPA 3TQWA 4JBZA 4ZEIA 4Z7EA 5K2YA 5CBRA 5FHOA 3K6UA 2FNCA 4Q0CA 2B65A 5K2XA 1SW2A 1MDP1 5DYHA 4QSCA 3RUMA 4RXLA 4ZEFA 3L6GA 4GWOA 4WEPA 1LGBC 3CSBA 4DXBA 2QS1A 2V3TA 3QUFA 3Q26A 2QS4A 3FV1A 3P7IA 2F6GA 2DQVA 2D21A 1QJMA 4EDPA 3VXCA 4X1DA 1ZIUA 4IB2A 1A7LA 2PT1A 3U92A 5H8NB 3N5LA 1OLAA 5CBSA 5H8NA 1DTGA 1D9VA 1JW5A 1NNKA 1FCKA 3C4MA 2NXOA 1MH4A 5H8HB 4LA9A 5H8HA 4JSDA 1RYOA 2ONSA 3R6UA 3E3KA 4JWXA 2B3FA 3C36A 1WDNA 4GLIA 2Q9TA 1NL5A 3ODBA 3IOWA 1HSEA 3FASA 1M5DA 2HAUA 4KYDA 1YCJA 4RA1A 1NFTA 1ZLQA 1IIWA 3Q27A 2F35A 3PUXE 4MLQA 5LOMA 4QHQA 1GV8A 1T0KA 3TODA 1NNTA 3DP8A 3FXUA 1CB6A 1JVXA 4YZZA 3VXBA 4QF9A 4F29A 5DTBA 2OCUA 4EXKA 2QMWA 4PP0A 4QFLA 5CI5A 5CMKA 1Q35A 5ITPA 3OEMA 1MS7A 1R9QA 1MY2A 4G68B 3M8UA 2DOJA 4G68A 3K6VA 3R26A 1MPBA 3A09A 1SI0A 1JEVA 1MXZA 3E9XA 3OXNA 1MXYA 3T9VA 5IAIA 3PMVA 1FTJA 2QPQA 1DOTA 5DVIA 2I3VA 1H44A 4H8JA 1BTJA 1MY0A 1PEBA 2E0SA 2DE2A 3SEXA 4F3GA 1DTZA 1WODA 1QKBA 5F1QA 3T66A 5I2NB 3MZ9A 5I2NA 3I5OA 3ZKLA 3H4ZA 3V83A 3FV2A 3CR9A 1LCTA 1IQ7A 3N6UA 3IOTA 1MDQA 4XTCQ 1MM7A 4F39A 3U8QA 4P11A 2O7IA 1US5A 4H1XA 1MM6A 3JYRA 3K01A 4HCWA 1UIUA 1GTKA 3M3FA 4ESXA 2XX9A 5DT6A 3S9EA 3IB1A 2XD2A 1A99A 4IO7A 4OFLA 4ECFA 3OSQA 1WVJA 4R6KA 4R9FA 2XX7A 4ESWA 1LBCA 5H8SA 3O6IA 1S50A 4FJPA 3ECRA 4F18A 1EU8A 3TMGA 4RJZA 5H8FB 3B7DA 1XHYA 4KR5A 5H8FA 3LSWA 3HO7A 2NUVA 3UORA 1SW5A 1M5FA 4G4PA 3KJ7A 4GL0A 3W15C 3LSLA 4QSDA 5H8QB 3PPQA 2Q88A 1KWHA 2I4CA 5H8QA 3LR1A 4JB7A 2V3QA 4XIGQ 3IR1A 1B58A 2XXUA 3SEUA 3TFLA 1I6QA 3LC8A 3JV9A 4GFRA 5KZTA 2AYSA 4YB7A 4OQOA 4LZ7A 1F9BA 1ZBMA 1MQIA 3UK4A 1H45A 4O3CA 2ZNTA 3RN8A 4UACA 4POWA 2OZZA 1RKMA 1LFHA 1B4ZA 2ONRA 1B40A 1H76A 1EZPA 3EHUA 5FHMA 2E1SA 1GGGA 3OO6A 3RLFE 4OENA 1O63A 1FQCA 1N84A 2DYXA 1SDXA 2P1SA 4KQPA 3A3UA 4G68C 5ELVA 1IZ1A 2Z8FA 1SVXB 1Z7ME 4LQ5A 2OBGA 4F22A 1S7YA 3G3HA 4PFTA 5EHSA 1Y3NA 1QW0A 1P1UA 3PUWE 2NWJA 2LAOA 4F1VA 4ND9A 3CI8A 2VGQA 3JZJA 1AOVA 2OWTA 4OEVA 1LAGE 1Y3QA 2ZNUA 3PU5A 1SYIA 2I48A 4PETA 4PFWA 4FEBA 3ZS6A 1M5BA 4YU0A 4G77A 4ELRA 4BDNA 1QUKA 3VDFA 3H3GA 3IJOB 2DSFA 3UGWA 4DIGA 2Y84A 4M1VA 1POTA 4U22A 2O68A 1B52A 2F78A 1PDAA 4FORA 4YMAA 3KN7A 4FECA 3S9LC 3OO8A 1HSJA 4EUOA 1ZU0A 2X26A 4U23A 5ICTA 3FUZA 3TKDA 3KJTA 4KCDA 2O1MA 3IO4A 1NNPA 5HBCA 2H25A 2M8CA 3QAXA 4I8CA 3EPEA 1MQGA 5J1DA 2YPNA 3MUQA 4NE4A 2ALUA 3FIRA 2R6GE 3IL1B 3KN8A 2HZKA 1B05A 1LB9A 3GXAA 3SDFA 2OWSA 3KSXA 3KG2A 4DZ1A 1Y4CA 5AA2D 1IXHA 3C33A 4GVOA 1OMPA 1USYH 4MLVA 4YKJA 3U1OA 3FJ7A 2PX1A 5I57B 4P0GA 3HN0A 1MQHA 5I57A 1D3KA 4PFUA 2UYEA 2IA4A 3PGFA 2P0SA 4LQ2A 5M2VA 3RT6B 2ABHA 5BWJA 1NH8A 2A5TB 2R71A 2A5TA 3BBRA 4R75A 5DVFA 5AA3A 3QYTA 3B6QA 2I49A 3RT8A 1YPNA 1B3LA 1AL3A 1FQFA 1XT8A 4PE5B 3IORA 4OMBA 1P1OA 4RY1A 2KLFA 4JSOA 4QSEA 3SETA 1Y9UA 1MXWA 2A5SA 3OMBA 3TDJA 3VLVA 1SYHA 3H6UA 3T22A 3C35A 3O28A 3FD3A 3W9WA 1Z7NE 2V25A 4R6HA 4OFJA 2DVCA 1US4A 1UTBB 3PPRA 4YB6A 1I69A 1UTBA 4H5FA 2AL4A 4GRKA 1NH7A 2I6EA 3T9UA 4TOZA 1LAHE 2XXQA 1VSOA 1LAXA 5CM6A 3HHFA 3MBPA 3C9HA 4RNSA 4E0XA 2PVUA 3G3IA 1NKXA 3DP4A 4NF4B 4NF4A 4F2QA 3U93A 4LVQA 1II5A 1FTOA 3K1NA 3Q29A 5AA4B 3CFXA 3C34A 4HTGA 2Q89A 2XXPA 5AA4A 2O51A 2I58A 3T96B 1ZMGA 3CRBA 4KI0E 4BDQA 4GOTA 4IO4A 3USDA 4F1YA 1FW0A 2RINA 2W7YA 4OWDA 2R9JA 4R9GA 4C0RA 3MVYA 1VE4A 1LFGA 4U4SA 2REJA 1IXCA 4LZ5A 4ZECA 1ATGA 1ZKBA 4XKNA 1JW1A 5TPAB 2XXRA 2DXRA 5TPAA 4OVJA 1R6ZA 3MVZA 4NWDA 1XOCA 2XXVA 1O7TA 3DLNA 2H98A 1PB8A 2O7UA 2HEUA 4H6DA 3W9VA 3BFUA 3ILUB 2YLNA 4R73A 3IK6B 1B46A 2ZXTA 3MJNA 3QUJA 2DWAA 2X7QA 4ONYA 4U2RA 1A55A 2OJTA 4F3PA 5KCJB 2ZYKA 2QL3A 2DWIA 5KCJA 4NMYA 4AQ4A 3FVOA 1DMBA 3H06B 1OQGA 2VD2A 4G8MA 4PFYA 4DXUA 4EQ7A 2D3IA 3FJMA 2PBWA 2FYIA 1IXGA 3S9MC 1MPCA 3TELA 1IUDA 4BDOA 5AA2B 3HHGA 5AA2A 5B7DA 4EQ9A 3IJXB 2CMOA 3T9XB 3FVKA 3V5AA 4THIA 3IB0A 3SESA 2G29A 3ZSFA 3RGYA 3GBAA 4YMBA 1Q1KA 3IX1A 4KCCA 1GR2A 1URSA 2XD3A 1XC1A 1LLSA 1MQJA 3MAMA 2VOZA 3K2DA 2X7PA 4F3BA 3QSLA 3O9PA 4FIMA 2F6PA 4JXIA 4YB5A 4Z0IA 1O64A 3PPPA 5B70A 4RPOA 4IGRA 3D4CA 1JQFA 2Y7WA 4HS7A 1USYE 3SEYA 2ANJA 1MY4A 2F7CA 3EF7A 4YAHX 4LP2B 2F7BA 4K3FA 3F11A 5CMMA 3UN6A 5L9MA 3C31A 1ZJLA 3KOSA 3FATA 3LSXA 4ZS9A 2WKYA 4IO3A 1I6AA 1UQWA 3LSFB 1MG1A 2THIA 5L8DA 3EQ1A 1R9LA 5JEIA 4EXLA 1SW4A 2REGA 1B5IA 1BLFA 1Y1ZA 2DP8A 4AB5A 2ESNA 2UVJA 3ONMA 4C1UA 1B3GA 5TU0A 5AA1A 2O84X 2P2AA 1FTMA 2V3UA 2XXWA 3Q28A 4FEDA 1MPDA 2H99A 3OEKA 4F31B 1HSLA 1DPEA 4N13A 1BIYA 3OD7A 3VLUA 4LATA 1H3DA 3EHTA 3SEVA 4WXJA 1PBPA 4H67A 3MZBA 3N26A 3ZKKA 4BDMA 4OFOA 5I56B 2ZMBA 4F1UA 5I56A 3KFMA 2Q8JA 1LB8A 2I4BA 3UA8A 5FTIA 5CMBA 5L9SA 2QMXA 4X9TA 5I2KB 5I2KA 2H5YA 4ZEKA 2Q2CA 1SQYA 1LCFA 2RKMA 3THIA 5ISUA 2I0BA 3O6HA 1RYXA 1AH5A 4X1BA 1J1NA 3G3FA 4H8IA 3TUSA 1LBBA 3FJGA 1JVYA 1UTHB 4X48A 3C32A 3RNNA 1UTHA 1QVSA 1LAFE 3I6VA 1QKAA 2OLBA 3MZ1A 3UP9A 1OVBA 3OSRA 2DWJA 4LONB 2Y7RA 2F8DA 2O1LA 4F2OA 3KOTA 5IKBA 4QFPA 2XXTA 4DXCA 1UIVA 3TCGA 4DE8A 2ZYNA 3PD8A 1D9YA 3T9HB 1TFAA 3PD9A 3M3LA 1MH3A 1OQHA 1B5HA 4ZEBA 3VVEA 4NTLA 1N7XA 4G2ZA 1B7HA 3IOUA 1QUIA 1VFEA 4Q30B 1TWYA 3D4GA 2F7AA 1BKAA 4M4GA 3RTWB 4IO6A 3OENA 3TTKA 1QUJA 4N6PA 1B0LA 3V89B 2HAVA 3MP6A 4L17A 2HFBA 1TFDA 1OIBA 3CG3A 1P1QA 1OVTA 4ZE8A 1ANFA 2DE3A 4KYEA 1N7WA 1POY1 2XXXA 1B4HA 3HCQA 1FQAA 4Q8RA 2QJEA 2ZYMA 3K00A 4QFOA 4JDFA 3A3CA 3K02A 4OTEA 4EF1A 4I62A 4F3SA 1P1NA 1VFDA 1B6HA 4OYVA 5L9OA 3O29A 2GRVA 1CE2A 4ZZAA 2GH9A 3VVDA 3EHSA 3MC2A 1B2HA 1P99A 4H5GA 3S2VA 4C1TA 3WAEA 4NWCA 3TPAA 4MH5A 4DDDA 3M3KA 2Z22A 1B0HA 2UVIA 4EF2A 3CSGA 2RC8A 2F36A 1URGA 3RY3A 5KDTB 1B51A 4KYSA 1A54A 5KDTA 4R2FA 2B3BA 4I9DA 1YTVA 3FZVA 1FQEA 4KD5A 1LFIA 2AL5A 3E13X 4LZ8A 4RYAA 2XXYA 1TXFA 4KHZE 3TTLA 2DWHA 4I1DA 4AB6A 3Q25A 4DCXA 5AE4A 3PMWA 3IO6A 2VD3A 3PPOA 3DM0A 5I58B 3IB2A 4JWOA 5I58A 5JK4A 4OETA 1BP5A 4O3BA 4MFIA 3CFLA 3S9NC 3TTMA 4ZDMA 4RK9A 2G93A 3PMXA 5FTHA 2RCAA 3N94A 2OK2A 4TLLB 4Q5TA 4GXAA 1A8EA 2VP1A 2HQ0A 3HV1A 2CZLA 4U4XA 4P0IA 4NF6B 4FATA 1XVYA 4NF6A 3OOAA 4WEDA 1L5TA 1AMFA 2Z8DA 3O2AA 3TAJA 2UXAA 2I0CA 3UIFA 2Y7IA 2H4IA 4KFQA 1MXUA 2QS2A 4U1ZA 1B3FA 1TT1A 4YICA 3VVFA 4XXUA 1B32A 1JW4A 4WKMA 3GZGA 4OZ9A 1JETA 4IY5A 4TQUQ 3K6XA 2RCBA 3L6HA 1QULA 3H7MA 2DS9A 3T93B 5TP9B 5TP9A 5I59B 5F7VA 5I59A 1A40A 1MXVA 5CC2A 4N07A 3EN3A 4LUBA 3TQLA 3MQ9A 2F97A 2ZNSA 2Z23A 3PUVE 3WAFA 3SERA 4OEUA 3LUYA 1XS5A 4U1OA 1N76A 4JWYA 3QK6A 1JEUA 4BLAA 4F19A 1N04A 1Y1MA 3VV5A 3KSJA 2QS3A 3MPKA 4RK2A 3R7XA 3E4RA 3TEPA 3K6WA 4GIZA 3VFJA 4NF5B 4BDLA 4NF5A 4OERA 2F34A 3LBSA 2Y7PA 3TCFA 1SD3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3KN3A 3H6VA 2DDKA 1M5EA 1XVXA 1URDA 3TZAA 1YAEA 4GXSB 4GD5A 3U72A 3TTNA 3BFTA 3H6WA 5T3JA 4PFBA 2DE4A 4U21A 4P47A 1NI9A 3KZGA 4H65A 5CRYA 3S4UA 3N6TA 3O6GA 1OLCA 1MY3A 2PT2A 3QMFA 5I84A 4O3AA 4IO2A 4QBAA 4R74A 4RPNA 5LDZA 2BJJX 3CIJA 1EYJA 4ZZEA 3CHGA 4N6KA 3HPIA 4QFNA 3QXMA 1Y20A 3MPLA 3RPWA 4H0WA 3CVGA 4UA8A 1PC3A 4FAJA 4R2BA 3GLBA 1PB9A 2XWVA 2HCAA 1LSTA 2Y7KA 5ET6A 2F5XA 3BKIB 1DPPA 2XX8A 4DCYA 1Y3PA 2GHAA 3I3VA 2QSXA 3PUZE 1EZOA 1B5JA 5DVJA 2D5WA 2ZYOA 4XKPA 3IAZA 1PB7A 2NOOA 1IMEA 1B7UA 3B6WA 1NV3A 1B3EA 4R6YA 2FA7A 3PV0E 3TCHA 4PGPA 3AXFA 3ROJA 2XHDA 5EYFA 4ZE9A 3G3GA 2RC9A 4H46A 1P1WA 4KXPA 2AIXA 2YJPA 5IZ1A 1A8FA 3MP8A 1FTLA 3FXRA 1FQDA 3PTYA 3VLWA 2V93A 4GQOA 2I3WA 1MRPA 3U94A 3O66A 4XKRA 4YKKA 3RQTA 4N4UA 1Y4TA 1JNFA 2RF1A 1N3WA 1VR5A 3G3KA 5A5XB 3GBBA 5A5XA 3FXQA 3ILTB 3MWBA 3FXBA 3MVXA 4O7MA 3RTFB 4HW8A 3V8XB 3VE1B 3TTRA 4MF3A 4OXVA 1B3HA 3PUYE 4ZEDA 1FQBA 5DEXB 3CG1A 3H6TA 4NEDA 5DEXA 1LEVA 1YZ0A 4DLDA 4ELQA 4YKPA 2QRYA 4YKIA 1IMDA 4POXA 4IGTA 3IOVA 3K0VA 1M5CA 3G7WA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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