5TPAA

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with compound 9 (gne3500)
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
278
structure length
275
Chain Sequence
NHLSIVTLEEAPFVIVEDIDETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title GluN2A-Selective Pyridopyrimidinone Series of NMDAR Positive Allosteric Modulators with an Improved in Vivo Profile.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
total genus 81
structure length 275
sequence length 278
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-10-20
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5tpaA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5tpaA02
1IXIA 3K1MA 4OZ9A 1SD3A 4OEUA 4KHZE 4KR5A 3D4GA 1PB7A 2HFBA 1MY2A 1IZ1A 3H03A 3UK4A 4K3FA 2I3WA 4F3PA 4YB6A 1MG1A 3FD3A 3DP6A 4ZECA 2OLBA 2V3UA 3HO7A 3V5AA 3PUXE 1H76A 3MW0A 5ELVA 1LSTA 5AA3A 1A8EA 3RGYA 1SDXA 3TYHA 3K6UA 1URSA 5HM4B 3Q26A 3UP9A 4MF3A 4KCCA 2F8DA 1LAXA 1SQYA 4NE4A 4ELQA 3FXQA 1JVXA 4F2QA 4UACA 3FV2A 3UORA 4BDQA 2OJTA 3W9WA 1B7HA 4ELOA 3TZAA 1ELJA 4EDPA 4MLVA 1B7ZA 4RXLA 4MLQA 4U4SA 1NKXA 2H5YA 2PT1A 5AA1A 2XXXA 2I0BA 3KSXA 2CMOA 4RK2A 2R6GE 2G93A 4LZ8A 1Q1KA 4LQ2A 2YLNA 2O7UA 4NF5B 4R6HA 4OVJA 2XXPA 2DWAA 3IJXB 2V3QA 2PX1A 3RQTA 4YKIA 1FQBA 4IO7A 1P1NA 4OYVA 3H4ZA 1B5IA 3E4RA 4I62A 3T9UA 3CFXA 1L5TA 4BDRA 3QIMA 1LLSA 1EZ9A 3KGCA 1O7TA 3O6GA 3TKDA 3G3JA 3R26A 2R9JA 4G8NA 1S50A 3R6UA 4YB5A 1FQFA 1B4HA 4DLDA 1MY1A 3QXMA 1P1UA 3G3IA 3HPIA 3KFMA 5F1QA 3T96B 1MXZA 1NH8A 3KEIA 3MBPA 5L9OA 1WODA 2HAUA 1OVBA 2QSXA 4GXAA 3RTFB 1FQCA 1IXGA 2ONSA 1Y1ZA 2F78A 4L17A 5L9SA 4R9GA 4EUOA 3MPKA 3TMGA 1TWYA 2UVGA 5I57B 3QSLA 1B3EA 3PUZE 1OLAA 1B2HA 4E0XA 5J1DA 3KJ7A 4F2OA 2XX7A 4AB5A 4N6PA 1B5JA 4QF9A 3VXBA 3PUYE 1FQEA 3TTRA 2UVIA 2Y7IA 5ITOA 5K2XA 3FIRA 4QHQA 4TQUQ 1ZIUA 1MQIA 2GH9A 1LFIA 4U23A 3H06B 5AA4A 5FHOA 3LSXA 1PBPA 3MZ1A 3OEMA 2HAVA 2ESNA 4H5GA 2XXHA 4O3AA 5A5XA 4I1DA 1XVXA 2A5TB 3IAZA 4RK9A 4OFOA 3MVYA 3TTKA 3LUYA 3V89B 2UVJA 4NF8B 1QULA 2UVHA 4GD5A 4WXJA 1H44A 2YPNA 3DP8A 2AIXA 3H3GA 3I5OA 1LBCA 5H8HA 2DWIA 4Q0CA 1PC3A 1I6BA 3PD8A 4G4PA 1B51A 3JV9A 2F97A 3M3KA 4PETA 4GWOA 3IB1A 5BWJA 3PUWE 3FUZA 5H8NA 4G68B 4IB2A 3DELB 3RNNA 3QUFA 4NF6A 4IGRA 4AB6A 1SW2A 4WEPA 2NWJA 3PPQA 2I0CA 4OTEA 3ILUB 2DP8A 5DEXA 3BFUA 2DXRA 3O28A 2HEUA 2QS3A 2F6GA 3PD9A 1EZPA 1A8FA 3G7WA 4YZZA 1MPDA 1XVYA 1VR5A 4H65A 3O97A 5ITPA 1XOCA 1HSLA 5I56B 3PMVA 4ELRA 1B46A 2GHAA 3RT6B 4OETA 3FVKA 4LUBA 5EHMA 4DIGA 3G3KA 4O3BA 2W7YA 3Q27A 3N94A 4M4GA 3KOSA 3PU5A 3USDA 1LCTA 1LAFE 3K0VA 1QKBA 3W9VA 1USYH 1A7LA 2ANJA 2M8CA 3KG2A 5AA2B 1B3GA 5KCJB 2OZZA 3C35A 5EYFA 2AL5A 2X7QA 1AOVA 3ZKKA 1MQHA 1OLCA 3LC8A 2Z22A 1POTA 1JW1A 3IJOB 4G2ZA 3IO6A 2DQVA 4F19A 1FW0A 3KJTA 1DTGA 4G68C 4QFNA 3U8QA 2Q2AA 5BUUA 4KYEA 3IO4A 4NF4A 1AIVA 3IOVA 3K6XA 4FJPA 1PEBA 1I69A 4MH5A 4QFKA 4RJZA 4FE8A 2NOOA 3CVGA 3IORA 5H8QA 1LAHE 3GBAA 4P0IA 3T9HB 4OFJA 4F1VA 4EQBA 2REJA 2VOZA 3MVXA 3SEUA 3FXRA 4GQOA 3CIJA 4HS7A 4KI0E 5JEIA 1MQJA 1UTHA 1LCFA 3FASA 3KN8A 4TLLB 2O69A 1NMUA 1B9JA 1OQGA 4H8JA 4F3SA 2I4CA 3SEXA 4ZEKA 1IEJA 1NFTA 3MVZA 2XX9A 2OCUA 1TT1A 4LZ5A 1B52A 4NMYA 3S4UA 1NNKA 1PB8A 2DWHA 2H99A 2X7PA 1D3KA 2H4IA 1YAEA 2ZYNA 1YPNA 1I6AA 4OESA 3T9XB 3O29A 1WDNA 5ICTA 1R6ZA 2KLFA 4WKMA 3FXUA 4ZEDA 4IY5A 4DZ1A 4KQPA 5JK4A 3EQ1A 5TU0A 3VE1B 2Y7RA 5DVIA 1H43A 3Q28A 5I2KA 1OMPA 2QL3A 1MY4A 1TFDA 3C33A 4GL8A 1N7WA 4FEBA 2I3VA 3B6TA 4ZS9A 1FTMA 3RN8A 3SEYA 4XKNA 3VXCA 3MUQA 3OOAA 3OD7A 1QUJA 3K00A 4GVOA 2F36A 4QFPA 3EF7A 4G8HA 2B65A 3CG1A 3MWBA 4FAJA 1GR2A 3M3FA 4DDDA 3H7MA 4NF5A 2DS9A 2V93A 3JZJA 5AA2D 1MM6A 3RPWA 4YKJA 4IY6A 2E1SA 3VVDA 3GZGA 1N76A 5KDTB 1MDQA 3TCHA 4BDMA 3EN3A 4IGTA 2IA4A 2P0SA 3LR1A 3G3FA 3N26A 3E3KA 2OK2A 5CMCA 4EQ7A 4JSDA 4RA1A 3VV5A 1B5HA 2QS1A 1SW5A 1ZBMA 4QRZA 4ZEBA 2XXWA 3K6VA 4P0GA 3HCQA 1IUDA 3T93B 3SEVA 2QRYA 3SETA 2LAOA 1ZMGA 1KWHA 1LB9A 4YU0A 1AH5A 4R6YA 4H67A 1QUIA 1R9LA 2XXYA 2Z8DA 3H6TA 1B0HA 3SKPA 2V84A 3OXNA 2Q8JA 2H25A 1RKMA 2RCAA 1VSOA 1DSNA 1Y9UA 3LSFB 4ESWA 1R1NA 4ZZAA 2V25A 4OENA 1MQDA 2PVUA 3PPRA 1N0TA 1FTLA 3VVEA 3H6VA 1ZU0A 1XC1A 2D21A 1UQWA 1UTBB 3QYTA 4GXSB 1SW1A 5I57A 3VFJA 3IR1A 5B7DA 2VGQA 1SI0A 5HPQA 4YAHX 2XXUA 4X1DA 4IO3A 5DVFA 3MQ9A 1MDP1 3ZSFA 1BLFA 3FVGA 1N04A 3MVWA 5DVJA 2GFEA 4I9DA 1O64A 5EHSA 1B7UA 1MPBA 4G8MA 4KPTA 1Y4CA 2XXTA 3OENA 2A5TA 2FYIA 4XIGQ 2GHBA 3PV0E 3C34A 4YMAA 4OFLA 1B0LA 4NF8A 4DXBA 1GV8A 3TCFA 3LSLA 5JTYB 4EF1A 1P1OA 4KYDA 2QMWA 4EF2A 3CRBA 3O2AA 1RYXA 2XXVA 2QS2A 5AE4A 4ONYA 4ZE9A 2DOJA 1D9YA 3KN7A 2DSFA 4PFWA 5CM6A 3T22A 5I2NA 2ZNUA 1LBBA 4OWDA 2BJJX 4BDLA 2HXWA 3CSGA 3A3UA 1Z7NE 3G3HA 2UYFA 2VD2A 5H8FA 4ZDMA 3M3LA 1Y4TA 3BBRA 4XTCQ 1B3LA 2A5SA 2Y84A 1MXVA 3C4MA 4OERA 3TUSA 2RC9A 2DE3A 2F7BA 4H5FA 4KYSA 4ZEFA 3R7XA 3TDJA 1NNPA 2RC7A 2F6PA 5I56A 4EXKA 1QJMA 4U1ZA 5ICQA 1UIVA 3N6TA 1P99A 4ESXA 5I58B 4PE5B 5FHMA 1B3FA 5B70A 4N13A 2O1MA 5AA2A 5KCJA 1B40A 4Q30B 4U1OA 1FTOA 5L9MA 3DP4A 3S2VA 3KBRA 4NWDA 2DVZA 1A99A 1P1QA 4JWYA 2X26A 1FTJA 3CR9A 2XD2A 2NUVA 2I58A 1MXXA 4KCDA 1ZLQA 1A40A 4FECA 1IIWA 5A5XB 3OSRA 4F31B 3CFLA 4R75A 1M5EA 1POY1 4KD5A 2D5WA 2XXIA 3MP8A 4ZEIA 2Q88A 3CG3A 4F39A 2RKMA 1MY3A 4IO6A 2B3FA 5CMKA 4LONB 2I48A 5TP9B 4DCXA 3OO6A 1S9TA 2P1SA 1AL3A 1M5CA 5H8NB 4P11A 2AYSA 3QUJA 1QVSA 2PMSA 1D4NA 4H0WA 3Q25A 4IO4A 5DEXB 1ZKBA 3BKIB 3C32A 4THIA 1Y3QA 1MM7A 4DXCA 4RYAA 4JBZA 1B32A 1TFAA 3TCGA 4DE8A 2ZXTA 2FA7A 3K02A 1US4A 2WKYA 1HSEA 3P7IA 3IOTA 3FGSA 3U1OA 3O66A 3VLUA 4FIMA 4KFQA 2F34A 2I6EA 4RY1A 5CRYA 3KSJA 5ISUA 2V3TA 1LAGE 1OQHA 4O3CA 3TTLA 4E0WA 3ILTB 4Z0IA 3K01A 3A3CA 4N07A 2RC8A 3TQLA 3OO8A 3L6GA 3OELA 1OVTA 2AL4A 1B1HA 3TQWA 4GIZA 2ALUA 2QPQA 1GVCA 1IQ7A 2HCAA 4X1BA 4XXUA 2F7AA 1B58A 4GRKA 3U94A 1FCKA 3K2DA 4F3BA 4BDNA 4U2RA 4GF8A 3TFLA 3GXAA 4WEDA 4PP0A 2O51A 2PYYA 4Q8RA 1II5A 2PT2A 4FORA 3S9MC 4MBPA 1VE4A 2Z23A 1XS5A 2DE4A 1Q35A 1DMBA 5DTBA 4XKRA 2ONRA 3IOUA 4ISUA 5H8QB 1Y20A 1VFEA 1B3HA 4POXA 5KDTA 4NEDA 1MXUA 2ZYOA 3FATA 3IOWA 1Z7ME 1JETA 1H3DA 3C9HA 3S9NC 3N5LA 4UA8A 1BKAA 1Y3NA 1T0KA 4XKQA 5I59B 4F3GA 3HHFA 1JVYA 3D4CA 1MS7A 1DOTA 1XT8A 4C0RA 3TAJA 3TEPA 1IITA 4JWOA 3RLFE 1EZOA 4Q5TA 4QSEA 4PFTA 2R71A 3FJGA 5TPAB 3IB2A 1XHYA 3I6VA 4C1UA 2F5XA 3PGFA 3PPOA 4GOTA 1UIUA 3TODA 4LP2B 2XD3A 2Y7WA 4R72A 4YMBA 3MC2A 1A55A 4NTLA 1SW4A 3U72A 1YTVA 3CFZA 3U92A 3V83A 2UYEA 1USYE 3I3VA 3E13X 3C31A 1UTBA 4ZZEA 4EQ9A 2Q9TA 3H6WA 1Y3PA 1B05A 5I2KB 1MY0A 1P1WA 3G3GA 3MZ9A 4TOZA 3TPAA 1NNTA 4YKKA 5L8DA 3T66A 2ZYMA 5K2YA 3VLWA 2O84X 4U21A 3HHGA 4M1VA 1MXWA 2E0SA 1M5FA 2I49A 3PPNA 4R9FA 3A09A 3HV1A 3THIA 5LOMA 1HSJA 1BTJA 1JW5A 1FTKA 1QW0A 2QJEA 1EH3A 1B6HA 4G77A 3MZBA 3K1PA 3FV1A 1H45A 4F18A 3MJNA 2Y7PA 2O7IA 3WAEA 3UGWA 3IK6B 5JTYA 3KZGA 2H9BA 3O6HA 2ZMBA 3RTWB 3PMXA 3ECRA 3OSQA 1B1XA 2UXAA 3DM0A 4FATA 4IO5A 3F11A 2HZLA 2Q2CA 4OEVA 3JYRA 5DYHA 4OMBA 2THIA 1SYIA 3IB0A 4F1UA 3QAXA 5FTHA 3OMBA 1DTZA 1ZJLA 3RUMA 1DPPA 2F35A 3B7DA 4OHNA 2RINA 1FQDA 1M5DA 4POWA 4F1YA 1N3WA 3ODBA 4RPNA 5IKBA 1BP5A 1PBQA 3S9EA 2XXRA 3L6HA 4F22A 1J1NA 5DT6A 1MH3A 4QFOA 4YICA 2VD3A 2OWTA 3T9VA 3EHTA 4LQ5A 4LATA 3GBBA 2PBWA 1ATGA 5I58A 1RYOA 3LBSA 4OQOA 2XXQA 5HBCA 3FJMA 2O68A 2NXOA 3W15C 4OXVA 4GLIA 4U22A 2HZKA 4G68A 4H1XA 1JQFA 3HN0A 2I4BA 1ANFA 5F7VA 3QK6A 1LB8A 5M2VA 3RY3A 4I8CA 3IX1A 3EPEA 2ONKE 2DYXA 4LA9A 3VDFA 3VVFA 3U93A 1MH4A 1F9BA 4H6DA 4NWCA 1WVJA 2ZNSA 3TTNA 1YCJA 1US5A 4EXLA 3O6IA 3RT8A 2NVUB 4YB7A 3FVNA 2DXYA 4BLAA 4IO2A 2VHAA 5KZTA 1PB9A 1QKAA 2GRVA 3MAMA 3E9XA 5CMBA 2OBGA 2P2AA 1DPEA 3PMWA 1MRPA 3SDFA 1N84A 1NNFA 3Q29A 4X9TA 3SESA 4U4XA 3BFTA 5TP9A 3KOTA 1VFDA 1JEUA 4PQJA 1SVXB 4JSOA 4YKPA 2D3IA 1I6QA 2G29A 3LSWA 5FTIA 4ELPA 5I2NB 1R9QA 4JXIA 3CSBA 1AMFA 3UN6A 3H6UA 4F29A 5AA4B 1IXHA 5H8FB 3K1NA 5I84A 1MQGA 1N7XA 5H8SA 4QSDA 2YJPA 3EHSA 1BIYA 2ZNTA 4DCYA 1CE2A 1NL5A 4RPOA 2O1LA 3GLBA 5IAIA 4LZ7A 1JW4A 1PDAA 4QSCA 2B3BA 2XX8A 5H8HB 4R6KA 1LFGA 3TELA 3IL1B 3ZKLA 1SI1A 1B4ZA 4R74A 4XKPA 2Z8EA 4HW8A 3M8UA 4PFUA 1NH7A 1OIBA 1M5BA 3PPPA 1URGA 3EHUA 3S9LC 4RNSA 4NF6B 1JEVA 1SBPA 3N6UA 1CB6A 2OWSA 2FNCA 4H8IA 3UIFA 4LVQA 4C1TA 2DE2A 4QFLA 3FVOA 2DWJA 4ZE8A 3B6WA 4HCWA 2DVCA 4ECFA 3UA8A 5CBSA 3B6QA 3AXFA 2VP1A 2ZYKA 3KN3A 4Z7EA 1D9VA 1Y1MA 4BDOA 3HSTA 3FZVA 2RCBA 4TLMB 4JB7A 2H98A 3SERA 4R2FA 1N3XA 3MP1A 4PFYA 4ND9A 2HQ0A 1URDA 3WAFA 1ZTYA 3OO9A 3FJ7A 2REGA 4GL0A 3VLVA 1TXFA 4HCYA 4GFRA 2Q89A 5I59A 2QMXA 3OEKA 1LGBC 4R73A 2Z8FA 1QUKA 3ONMA 2Y7KA 3C36A 2CZLA 4HTGA 4NF4B 2IEEA 3MPLA 5TPAA 1SYHA 5FHNA 4X48A 1LFHA 3TTMA 1FQAA 5CI5A 2O6AA 2RF1A 1GTKA 1O63A 2XHDA 1EU8A 4JWXA 1A54A 3K6WA 4JDFA 3V8XB 5CBRA 2F7CA 3CI8A 1S7YA 4MFIA 1GGGA 1JNFA 2QS4A 3PUVE 3DLNA 4FEDA 4AQ4A 3K4UA 3O9PA 3ZS6A 5CC2A 3MP6A 5CMMA 3OO7A 1MXYA 1IXCA 1UTHB 4DXUA 2ABHA 3SEWA 4R2BA 1MPCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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