5TPAA

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with compound 9 (gne3500)
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
278
structure length
275
Chain Sequence
NHLSIVTLEEAPFVIVEDIDETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title GluN2A-Selective Pyridopyrimidinone Series of NMDAR Positive Allosteric Modulators with an Improved in Vivo Profile.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
total genus 81
structure length 275
sequence length 278
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-10-20
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5tpaA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5tpaA02
1B4HA 5I2NB 3U94A 3HN0A 4PFTA 3S9LC 1FQAA 1LGBC 5H8HA 5HBCA 5CBRA 1IQ7A 3RGYA 4TOZA 1PBQA 1AH5A 3KN8A 2XXPA 1N7XA 3T22A 2DOJA 4R6HA 1HSJA 4OXVA 3G3FA 3TKDA 5DYHA 2LAOA 5TU0A 2Q9TA 2NVUB 1EH3A 2XD2A 3FUZA 3OMBA 1OVBA 2NXOA 2PMSA 2GHBA 2V3TA 1XT8A 1MXYA 5EYFA 1P1UA 4KD5A 3TQLA 3CG3A 4H6DA 2Q2AA 3SEXA 3PMXA 3TPAA 5I58A 2BJJX 3FXQA 3PUXE 3BFTA 1FCKA 3MZBA 1ELJA 5I2NA 1P1WA 3U1OA 2GRVA 2XXXA 5EHMA 3ONMA 1FTMA 3QYTA 3C33A 5JTYB 3SKPA 1B0HA 2QMWA 2G29A 1USYH 3IB2A 1YTVA 2OCUA 1B1XA 3IJOB 1NNPA 3FXRA 5L8DA 3VV5A 1AIVA 3RTFB 2RCAA 3TTRA 4RPNA 1OIBA 3HV1A 4KCDA 2HAUA 1SVXB 3VVEA 1PB8A 2F36A 3TCFA 4AB6A 4MFIA 3PPQA 2DS9A 3EN3A 4M4GA 2P0SA 5CMBA 3KSXA 3JYRA 1B7HA 3K6VA 1AMFA 1Q1KA 2HFBA 4I8CA 4KYSA 4X9TA 5JTYA 2RKMA 3GLBA 1FQBA 3O66A 2B3FA 3MZ1A 2YPNA 4OEUA 2HQ0A 1D9YA 3CIJA 2ONSA 3FD3A 4MLVA 2O7UA 1P1OA 2XXQA 4G8MA 1MDP1 2Q8JA 3C34A 1KWHA 1NH7A 3U72A 3A09A 2XXUA 4H5FA 1B3LA 5CRYA 2V3UA 3RPWA 3OSRA 1B9JA 3VVDA 4FEBA 3AXFA 1II5A 1B2HA 3EHSA 1LAFE 3IO6A 1MXZA 1XOCA 2OWTA 1LFHA 2RC7A 3W9VA 3KJ7A 3GZGA 3K2DA 2R9JA 4DE8A 1JVYA 4O3BA 3IK6B 4YU0A 3Q29A 3QUFA 1JW1A 3RT6B 3MVZA 4LVQA 3K00A 3LSXA 1I6QA 2D3IA 1NL5A 3OD7A 1R9LA 1SW4A 3E9XA 3TEPA 4U2RA 2OZZA 2O69A 5J1DA 4H67A 4ZEBA 3N26A 1YCJA 4H5GA 3VDFA 5DVIA 4IY6A 4EQBA 4MLQA 3I3VA 1RYOA 5AA2D 4P0GA 2Y7RA 2QPQA 4Q30B 3D4GA 3TUSA 2THIA 3TCGA 3W9WA 2M8CA 4RPOA 4JSDA 1EZPA 3G3HA 1LAGE 4GRKA 2QL3A 4BDOA 2Q88A 4F1UA 1SI1A 1ZU0A 1FQEA 2ESNA 5CM6A 4KPTA 2REGA 4I62A 2H4IA 2DE3A 3ZKLA 4QFPA 1OLAA 1B3HA 2ZYMA 4R9GA 2DSFA 2ZYKA 3H06B 1MS7A 2AL5A 4DXBA 1EU8A 4MF3A 4ELPA 3O2AA 4E0WA 1LAXA 2VOZA 3MP1A 3OO6A 2DP8A 1SBPA 5I59B 4NF6B 1IITA 1BLFA 2XXWA 1MY0A 3Q27A 1ZKBA 2Y7IA 2I3WA 3H7MA 2RINA 4DIGA 1IUDA 1TFDA 4QRZA 2AIXA 1DMBA 4KHZE 1O63A 4R72A 4ONYA 4TLMB 4DDDA 1L5TA 1O7TA 4X48A 1H76A 4FECA 5AA4B 3U92A 1N76A 5K2YA 1LBCA 4ZS9A 3GBBA 3KBRA 3OENA 4GIZA 1PBPA 1WDNA 4IO2A 5B70A 2XXYA 3FIRA 5JK4A 2F7BA 1Y3PA 4H8JA 4YKJA 1BKAA 3C9HA 1DTGA 2UYFA 5I59A 4NF6A 3A3CA 1LCTA 5FHOA 2F97A 3S9EA 1UIUA 4YAHX 3IO4A 3F11A 3VVFA 3UK4A 1AL3A 1MQJA 4NMYA 3KZGA 3VE1B 2I49A 3PPOA 4Z7EA 4BDLA 3C4MA 5ITOA 3C31A 1N3XA 5KZTA 3QAXA 3KGCA 1M5EA 5AE4A 1M5CA 2O7IA 1MY1A 3KEIA 5CMKA 1OLCA 1B7ZA 3B6QA 1OQGA 3JV9A 1IZ1A 3E13X 4DCXA 3IOUA 3VLWA 2UVHA 1D3KA 3HHGA 1B52A 1QKAA 3RNNA 4IO4A 1NNFA 4H8IA 1JQFA 5M2VA 2UXAA 4H1XA 3N6UA 1FQFA 4POXA 1Y3QA 4NE4A 2XXIA 3OXNA 1A40A 3K1MA 4OTEA 1IIWA 3M3LA 4OVJA 3PUYE 3CG1A 2B3BA 1PEBA 3MUQA 4EXKA 3USDA 4LQ2A 2O84X 4RXLA 4MH5A 3EHUA 1QUIA 4ZECA 3RLFE 3CVGA 3C35A 5ICQA 2QS1A 4F2OA 5KDTB 1B32A 4XKPA 4G8NA 1A8EA 4QFOA 4WKMA 3QXMA 1QUKA 3TDJA 5I58B 3QK6A 3TFLA 1N7WA 3FATA 4EQ7A 3O29A 3B6TA 4ELQA 1D4NA 4H0WA 3CFLA 4NEDA 4FE8A 4GXSB 3PPNA 2PYYA 3MAMA 3H03A 2ONRA 1B3FA 3IB1A 2QRYA 1RYXA 2XXVA 5KDTA 1LSTA 3DELB 5ICTA 2XX7A 1URGA 3PD9A 2F8DA 1RKMA 5TPAB 1TWYA 3N94A 5KCJB 3TCHA 2YJPA 2E0SA 3N6TA 3EQ1A 4QSCA 3PUWE 4ZZAA 1H44A 1N04A 4XXUA 1FTOA 2Z8DA 1BIYA 4ZZEA 2HAVA 5L9SA 4EUOA 2PVUA 4DXCA 3PU5A 4QSDA 4LZ7A 4QF9A 1MH4A 1SW1A 1MM6A 5IKBA 3IL1B 1UTHA 2Z23A 3DLNA 4F22A 2XX8A 3WAFA 1N84A 1MPDA 2V93A 3Q26A 2R6GE 3PMVA 5TPAA 4R2FA 1XS5A 3OEMA 5KCJA 3T96B 2Z8EA 2I48A 1US5A 2RCBA 3R26A 4HCYA 1SYIA 2F34A 3CR9A 1MPBA 4U21A 1XC1A 1Z7ME 1EZOA 1EZ9A 4O3CA 1ANFA 1S9TA 3EF7A 3MC2A 3K6UA 1LB8A 2Y7KA 4N6PA 1B4ZA 1URSA 1JW5A 3G3KA 4U1OA 4THIA 5HM4B 4GL8A 3E4RA 1SYHA 3SETA 4ZEFA 2ANJA 1URDA 2FA7A 1JVXA 4ZEIA 4YB6A 1IXIA 4LONB 1B5IA 2I0BA 4ZE8A 1MQGA 1GV8A 1B3EA 4F1VA 1VFEA 3PUZE 1WODA 4PE5B 5FHMA 4YKIA 1TXFA 4RA1A 2IEEA 1P1NA 1BP5A 2F6PA 1SDXA 3H4ZA 3KSJA 3OOAA 3BBRA 2V25A 4F3PA 4Q8RA 3H6VA 1OVTA 3E3KA 3WAEA 3TTNA 4JWXA 2REJA 5L9OA 2ALUA 2HCAA 1YPNA 5I57B 2I0CA 5I84A 1MXUA 3ODBA 4R74A 2ZMBA 1MG1A 3VLUA 1MY4A 1ZJLA 1TFAA 3MPLA 1TT1A 1DTZA 3H6TA 5H8NB 1MQHA 3FVNA 3FVKA 2ZXTA 4PFWA 1J1NA 4ELRA 2ONKE 1JNFA 1B40A 4OQOA 3S4UA 4KYEA 4JWOA 4GLIA 4OFLA 4QFNA 3RY3A 3MP8A 1H3DA 3UA8A 5TP9A 2O1LA 2HZLA 2HZKA 4RK9A 3VXCA 4GD5A 4P11A 3RUMA 1A54A 3LBSA 3H6WA 2DWIA 4U4XA 3RN8A 1LLSA 1Y4TA 1OQHA 3EHTA 5I57A 3H3GA 3SDFA 1N3WA 2GHAA 2F7AA 5CBSA 2ZNUA 4C1TA 1WVJA 4AQ4A 3T9UA 3O6HA 4DLDA 3QSLA 3FV2A 2ZNSA 5H8NA 3MQ9A 4H65A 4R6KA 1H45A 2NWJA 3FV1A 4F19A 3KN7A 3CSGA 4DZ1A 4GWOA 3PUVE 1DOTA 3C36A 2ZYOA 4C0RA 1MM7A 3MP6A 2V84A 4K3FA 3HSTA 1Z7NE 3IB0A 4OYVA 3KG2A 1GGGA 5A5XB 1OMPA 1NFTA 3OO9A 1PB7A 2I3VA 4RY1A 3SEVA 3LUYA 4EF1A 1QKBA 4NWDA 1IEJA 2FNCA 3M3KA 5AA2B 4EQ9A 2O1MA 3PV0E 5L9MA 4BDNA 4FATA 4OESA 1Y1ZA 5AA3A 4JXIA 4TLLB 1ZTYA 1USYE 1NMUA 2Z22A 2WKYA 5HPQA 4QFKA 2NOOA 3LR1A 2QS2A 3S2VA 3C32A 4IO7A 3MPKA 4KCCA 3IOVA 3CSBA 2B65A 2X7PA 4GFRA 2CZLA 4OERA 3TTLA 2PBWA 5A5XA 5I2KB 3T93B 3UORA 1HSEA 1H43A 1Q35A 5ISUA 4WEDA 3O6IA 5ELVA 4ESWA 2OWSA 3PPRA 3RT8A 4R9FA 5AA2A 1IXGA 1LAHE 3MW0A 1LCFA 4IY5A 1YAEA 4LZ5A 3KN3A 4YICA 4RK2A 1QUJA 4PFUA 2XD3A 4KFQA 3MVWA 1I69A 1SI0A 3PPPA 1B1HA 4OMBA 3OSQA 3OELA 1HSLA 1POTA 1MXVA 3EPEA 2H25A 2W7YA 5CMMA 1VFDA 4I1DA 4U4SA 1GR2A 2UVJA 2OLBA 2I6EA 2F78A 1A7LA 5I2KA 4WEPA 4DXUA 3PD8A 2X7QA 3TYHA 1PB9A 1FTLA 5B7DA 4P0IA 1A8FA 2AYSA 4BDMA 4C1UA 4G68B 3GXAA 3K1PA 3HPIA 5JEIA 4AB5A 2GH9A 1MY2A 4OEVA 1B5JA 3FZVA 4JB7A 4Q0CA 1B3GA 3IR1A 4BLAA 4LATA 1S50A 4YMBA 1QVSA 1Y20A 4EF2A 2QJEA 3U8QA 1MPCA 3M8UA 1T0KA 4LA9A 5DEXB 5FHNA 3HCQA 3R7XA 4LZ8A 4FJPA 2Y7WA 4O3AA 3OEKA 4OFOA 4GQOA 4N07A 5I56B 3VXBA 4R2BA 1F9BA 2H99A 3P7IA 1XHYA 1B6HA 1QULA 4G68A 1XVYA 3FGSA 3OO7A 4UACA 1FTJA 3K02A 1Y9UA 2QS3A 4QFLA 4XTCQ 2A5TB 2Y84A 4PP0A 3K01A 3FJMA 4JBZA 3SERA 4R75A 3S9NC 4ZEDA 2D21A 2VHAA 3TMGA 5DTBA 3PGFA 1NH8A 5DVJA 5DEXA 4DCYA 1MH3A 3JZJA 1UTHB 4NF4B 2Z8FA 5CI5A 4XKRA 4F31B 4F18A 4KYDA 1B5HA 1JW4A 1MXWA 5I56A 1UIVA 3TELA 3K1NA 3KFMA 4I9DA 4LQ5A 4KQPA 4NTLA 3QUJA 1MQDA 3T9VA 1BTJA 2A5TA 2ZNTA 3SEUA 3KOTA 3SEWA 4Q5TA 1NKXA 2A5SA 1FW0A 5AA1A 4POWA 2HEUA 1P1QA 3V89B 3TODA 3QIMA 4NF4A 3UIFA 3ILTB 3R6UA 2GFEA 5EHSA 1R9QA 4YMAA 1SW2A 3V83A 2KLFA 1ZIUA 2RC8A 1ZLQA 2DVCA 3GBAA 1A55A 3FJGA 1FQCA 3O9PA 1JEVA 3K6WA 4FIMA 3O6GA 4HTGA 2HXWA 1PDAA 4F3BA 3FVGA 4QHQA 1ZBMA 5CMCA 3RTWB 1VR5A 4M1VA 5DT6A 1QJMA 2CMOA 4PFYA 3I5OA 2UYEA 1A99A 2Q2CA 3MVXA 4NWCA 1LFIA 3IJXB 1M5DA 4IB2A 3FXUA 3A3UA 4PETA 4OETA 3TTKA 4OWDA 2VD3A 4QSEA 4RJZA 4N13A 3L6HA 4ELOA 5TP9B 1DPPA 2DQVA 3VLVA 3TTMA 1I6AA 1MQIA 2V3QA 1ZMGA 4NF8B 4NF5B 3B6WA 5ITPA 4YZZA 2UVIA 2F35A 4F1YA 3IAZA 5BUUA 4WXJA 2I4BA 3LC8A 5H8QB 2RF1A 3DP8A 2P1SA 2OBGA 4OHNA 3BKIB 1DPEA 2H5YA 4Z0IA 1ATGA 2XHDA 2ZYNA 5FTHA 1B46A 1JETA 4YKKA 2Q89A 5F7VA 4X1BA 4IO5A 3VFJA 4UA8A 4U23A 4JDFA 3FVOA 1PC3A 4PQJA 1AOVA 2VD2A 2UVGA 1SW5A 4NF8A 4NF5A 1P99A 4YB7A 2DWJA 4U1ZA 3TZAA 1Y4CA 4FORA 2FYIA 4ZEKA 1B05A 1CE2A 3DM0A 5H8QA 3T9HB 4EDPA 1UTBB 3G3IA 4F2QA 4TQUQ 3LSLA 1NNTA 1IXCA 4OFJA 2DE4A 4G8HA 4BDRA 4ZE9A 1NNKA 2DYXA 4G4PA 4XKQA 3HHFA 2PX1A 4IGRA 1SQYA 3IOTA 2I4CA 1SD3A 1R6ZA 5BWJA 3V5AA 4EXLA 1MY3A 1B58A 3UGWA 4E0XA 1GVCA 3TAJA 3MWBA 2F6GA 2P2AA 3FJ7A 2D5WA 4RYAA 4OZ9A 4JSOA 3DP6A 2OJTA 4XKNA 1M5BA 5K2XA 4ZDMA 4ISUA 2NUVA 3Q28A 4F39A 4X1DA 2AL4A 2DWHA 5H8SA 4F3GA 3MBPA 3H6UA 3U93A 1UTBA 3G3GA 1Y3NA 3SEYA 3THIA 3FASA 2G93A 3L6GA 4BDQA 3LSWA 2F5XA 3T9XB 3ZKKA 3T66A 3CFZA 4FAJA 5FTIA 1MRPA 1QW0A 3ZS6A 3MJNA 1M5FA 1D9VA 4R73A 3SESA 1MXXA 4GVOA 4G68C 2XX9A 5LOMA 4MBPA 1IXHA 3N5LA 4F3SA 3O28A 2OK2A 4ECFA 4GF8A 4G77A 1CB6A 1LB9A 3CRBA 4KI0E 4F29A 3CI8A 3ECRA 3TQWA 1GTKA 3RQTA 3KOSA 1FQDA 4HW8A 2DWAA 3UN6A 3IOWA 5AA4A 5H8FB 1POY1 2R71A 1XVXA 2Y7PA 2DVZA 1LFGA 4IGTA 1B7UA 3IX1A 2H9BA 2YLNA 1DSNA 4LP2B 1R1NA 3G7WA 1O64A 2RC9A 2O68A 4LUBA 2PT2A 3PMWA 3HO7A 3M3FA 2XXHA 3W15C 3OO8A 3BFUA 2O6AA 4GXAA 2DXRA 3DP4A 1Y1MA 5CC2A 2DXYA 2ABHA 4R6YA 3KJTA 2E1SA 4RNSA 2IA4A 3K4UA 5IAIA 3G3JA 4HS7A 2VGQA 1FTKA 3O97A 4L17A 5H8FA 1S7YA 4G2ZA 4GL0A 5DVFA 2QS4A 5H8HB 3MZ9A 4HCWA 3MVYA 4ND9A 4XIGQ 1I6BA 3V8XB 2I58A 3K0VA 1MDQA 3IORA 2XXTA 4OENA 2O51A 2X26A 4YB5A 4YKPA 1JEUA 3I6VA 3CFXA 3ZSFA 4JWYA 2PT1A 4U22A 2DE2A 2VP1A 3ILUB 5F1QA 4IO6A 1US4A 1UQWA 4GOTA 2F7CA 3D4CA 3B7DA 1B0LA 2H98A 2QSXA 2QMXA 3Q25A 1VSOA 4KR5A 1VE4A 3K6XA 3UP9A 1N0TA 3S9MC 1LBBA 2XXRA 4ESXA 4FEDA 4IO3A 1B51A 3LSFB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1B4HA 5I2NB 3U94A 3HN0A 4PFTA 3S9LC 1FQAA 1LGBC 2FBPA 5H8HA 5HBCA 5EYGA 5CBRA 1IQ7A 3RGYA 4TOZA 1PBQA 1AH5A 1YYZA 3KN8A 2XXPA 1N7XA 3T22A 2DOJA 4R6HA 1HSJA 4OXVA 3G3FA 3TKDA 1FJ6A 5DYHA 2LAOA 5TU0A 2Q9TA 2NVUB 1EH3A 2XD2A 3FUZA 3OMBA 1OVBA 2NXOA 2PMSA 2FHYA 2GHBA 2V3TA 1XT8A 5F24A 1MXYA 5EYFA 1P1UA 4KD5A 1FSAA 3TQLA 3CG3A 4PGPA 4H6DA 2Q2AA 3SEXA 3PMXA 3TPAA 5I58A 2BJJX 3FXQA 3PUXE 5FBPA 1CNQA 4GWYA 3BFTA 1FCKA 4O94A 3MZBA 1ELJA 4PF6A 5I2NA 1P1WA 3U1OA 2GRVA 2XXXA 5EHMA 3ONMA 1FTMA 3ROJA 3QYTA 3C33A 5JTYB 3SKPA 1B0HA 2QMWA 2G29A 1USYH 3IB2A 1YTVA 3D1RA 2OCUA 1B1XA 3IJOB 1NNPA 3FXRA 2PFZA 5L8DA 3VV5A 1AIVA 4O7IA 3RTFB 2RCAA 3TTRA 4XFEA 4RPNA 1OIBA 3HV1A 4KCDA 5IZ3B 2HAUA 5A5LA 1SVXB 3VVEA 1PB8A 2F36A 3TCFA 2XWKA 4AB6A 4MFIA 3PPQA 2DS9A 3EN3A 4M4GA 2P0SA 5CMBA 3KSXA 3JYRA 1B7HA 3K6VA 1AMFA 1Q1KA 2HFBA 4I8CA 4KYSA 4X9TA 5JTYA 2RKMA 3GLBA 1FQBA 4HE2A 3O66A 4PDDA 2B3FA 3MZ1A 2YPNA 4OEUA 2HQ0A 1D9YA 3CIJA 2ONSA 3FD3A 4MLVA 4MNCA 2O7UA 1P1OA 2XXQA 4G8MA 1MDP1 2Q8JA 3C34A 1KWHA 1NH7A 3U72A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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