5H8QA

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with gne8324
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
278
structure length
276
Chain Sequence
NHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Positive Allosteric Modulators of GluN2A-Containing NMDARs with Distinct Modes of Action and Impacts on Circuit Function.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A,Glutamate receptor io
total genus 81
structure length 276
sequence length 278
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8qA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8qA02
1MPBA 5J1DA 3IB1A 2WKYA 1HSLA 1PB7A 2OWTA 1N7WA 1H44A 1A55A 1VFDA 1NKXA 3RPWA 4YU0A 2NXOA 2HAVA 2DP8A 4R2FA 2A5TA 4FJPA 4F2OA 1QJMA 4IGTA 5JTYA 1NFTA 3VVFA 3KN7A 3FJ7A 4G77A 2I4CA 1XVXA 1GR2A 4YMBA 3U92A 2OLBA 3O6IA 3Q26A 3DELB 3OELA 1B32A 2D5WA 3BKIB 5CBSA 2O68A 2DSFA 5JEIA 1QKAA 1MY3A 3TFLA 3H03A 4I9DA 2QL3A 3O9PA 2V3QA 3HCQA 5DYHA 1Y4TA 1YCJA 3PPPA 3B6WA 3G3FA 4YAHX 3EN3A 2X7QA 4EF2A 3OMBA 4OWDA 2Y7KA 1US5A 4C0RA 5H8QB 1MRPA 4QFLA 4OZ9A 4RK9A 1UIVA 3TQLA 1LLSA 3SERA 1SW1A 1BTJA 4KQPA 4DLDA 3PUYE 1MY1A 2DWIA 3MZBA 2DWHA 3G3HA 1OQHA 1MDP1 1EH3A 3IX1A 1H3DA 2ZMBA 3O6GA 4NWCA 5H8HB 3O29A 3Q29A 2QRYA 3MQ9A 3FXUA 4ND9A 5CC2A 1WDNA 1JEVA 2RKMA 3TQWA 3O97A 3WAFA 1TFDA 1MH3A 3O66A 3U94A 1PC3A 3IAZA 4GWOA 2BJJX 5CRYA 1VFEA 4RJZA 3TUSA 2UYFA 3ECRA 3QUJA 4DXBA 4GL8A 4NEDA 3EF7A 3IR1A 3EHSA 4JB7A 4BDOA 4EQBA 5I58A 4X48A 3E9XA 3TEPA 3KBRA 1B7HA 4KD5A 5H8SA 3PMVA 1AMFA 2I4BA 4NF4A 3MVWA 3H6VA 2UVJA 4YKJA 4LQ2A 3GBBA 4MF3A 1EU8A 2F6PA 3IORA 4C1UA 1UTHB 1I69A 2O7UA 3KOTA 3RLFE 4POWA 3V89B 4F3SA 1SI0A 1MXVA 4FORA 4QF9A 3DP4A 3N6UA 3CI8A 1EZ9A 4OESA 1O64A 3ODBA 3KSJA 5H8FB 4WXJA 5FHNA 3TPAA 5DEXB 3MUQA 1ZLQA 2D3IA 3W9VA 4WEDA 1POTA 1MQIA 3FVOA 4KI0E 3CG3A 2Q8JA 5DT6A 4HCYA 2VHAA 4YICA 1I6BA 2XXYA 3QSLA 1SYIA 3TTNA 3KOSA 1M5FA 4KCCA 2F34A 1IXCA 4YB5A 4LA9A 3W15C 2UXAA 1I6AA 1PEBA 1B3FA 1MQJA 1MQGA 4XKPA 3HV1A 3GLBA 2DVCA 1IZ1A 1H76A 4EQ9A 3K1NA 3FXRA 1GGGA 5ITOA 2OBGA 4DXUA 3O28A 4RPNA 4GLIA 2QPQA 1PB9A 4XIGQ 2XD3A 2HQ0A 3VVDA 3SEYA 1ATGA 1D3KA 1OQGA 3C34A 3W9WA 1FTOA 2FNCA 2IEEA 4GIZA 1MXZA 1VSOA 1BKAA 3MP8A 4G4PA 3MPLA 2D21A 4AB5A 3FATA 3MP6A 4M1VA 1B7UA 1LGBC 3OEKA 3TTLA 1LCTA 3MC2A 1IUDA 3MPKA 4F19A 1LFGA 3PMWA 1NH7A 2Q9TA 2RF1A 4QSCA 1JEUA 3HN0A 1CB6A 4X1DA 4RPOA 2YLNA 1PBQA 1N7XA 4MLQA 4QHQA 2RCAA 4G8MA 2O7IA 5ISUA 4RK2A 1Z7NE 2V25A 4P0IA 1DTGA 3VXBA 2I0BA 1SBPA 2V84A 1XHYA 3PPRA 3RY3A 3H3GA 2KLFA 2UVGA 5KDTB 4LONB 5I59B 1A8FA 5IAIA 4OVJA 2HFBA 2I58A 3FVNA 3ZSFA 1FTLA 4BDNA 2ZYKA 4U23A 3EHUA 1B3EA 5CBRA 2ZYNA 5DVFA 4XXUA 2HAUA 3H4ZA 2W7YA 3Q27A 1DPPA 4Q0CA 3DP6A 5AA2D 3SKPA 1B1XA 3E13X 3S2VA 4BDLA 3FJMA 2Q88A 4GL0A 5H8NB 5H8QA 2PBWA 3RT6B 3RQTA 4YB7A 3VLUA 4H6DA 3PPOA 4R72A 3OSQA 3PUWE 2PT2A 3UK4A 1BIYA 5FHMA 3CSGA 4F3PA 3PGFA 4G68A 4H8JA 1GV8A 1Y3QA 4ECFA 1H43A 3E3KA 4ZE9A 3LSXA 1MXWA 1P1UA 1XC1A 2Y84A 2R71A 4POXA 3TELA 1N76A 4JDFA 5H8HA 4F1VA 1RYXA 5CMBA 2F78A 4TOZA 3R7XA 4MFIA 4NF6A 4Q5TA 5BUUA 4NF5B 4QFNA 2LAOA 2QMWA 4GD5A 1S50A 1BLFA 2FA7A 1NNFA 1SW2A 1B58A 1J1NA 4WKMA 5TP9A 3G3GA 5ICQA 4XKNA 1SD3A 4PETA 1M5EA 1QUJA 3FIRA 4YMAA 3FVGA 2ONSA 3C9HA 1QUIA 1A8EA 4DCXA 3S9LC 1DPEA 5LOMA 1HSEA 4G2ZA 4G68C 2I49A 4GVOA 4HW8A 4UA8A 5HBCA 4F18A 4QRZA 2Z8FA 4AB6A 3VV5A 3HO7A 1URSA 1QKBA 3PU5A 3HHFA 3LUYA 3R6UA 1B0LA 2X7PA 1Y1ZA 4X1BA 3WAEA 3T22A 4U4XA 2I3WA 3TDJA 4H65A 4U1OA 1QW0A 4ISUA 4R9FA 4F2QA 2RINA 1XS5A 2OK2A 4OFOA 4ESXA 1MQHA 4F3GA 3OO7A 2O51A 1RKMA 4R6HA 4F39A 3T9VA 1UTBB 2XX8A 4OEVA 3T66A 2DXRA 1B4ZA 2XXHA 3FGSA 1TWYA 4IO4A 4GRKA 4Q8RA 2UVHA 5B70A 1GVCA 4EXLA 3C4MA 5TPAB 1S7YA 3DP8A 3RN8A 2XXPA 2ZNUA 3OENA 2H99A 4IO7A 3BBRA 5AA2B 3KEIA 2F6GA 3TTMA 5ICTA 2V93A 1B52A 2DOJA 1IIWA 3QUFA 4R2BA 4AQ4A 2THIA 3H6WA 4E0WA 5I2NB 4JWXA 2AIXA 3CIJA 4ELQA 2VD3A 3I3VA 2F97A 4JBZA 1EZPA 2PMSA 3I6VA 3LSFB 4JSDA 1CE2A 3PUZE 1OLCA 4OETA 1DOTA 4H0WA 4I62A 5I84A 1JQFA 1OVTA 2PYYA 2P1SA 3VFJA 1BP5A 3VDFA 4UACA 4R75A 4BDRA 1MM7A 1Y4CA 4G8NA 3CG1A 4C1TA 1URGA 4IY6A 3ZKKA 4G8HA 1MXXA 3VLVA 5FHOA 3GZGA 2REJA 3QK6A 4I1DA 4OFJA 4IGRA 2ANJA 4RA1A 1O7TA 1B1HA 3PD9A 1SI1A 3K00A 4H5GA 3FXQA 5HPQA 1AOVA 4ELOA 3DLNA 1LFIA 4THIA 1POY1 1Y20A 1UQWA 1D4NA 4ZEIA 4N6PA 5AA4A 2AYSA 1MS7A 3ONMA 4R6KA 5I59A 2Y7IA 4ZECA 3AXFA 1FQBA 5K2XA 4R74A 5CI5A 2ZXTA 4OERA 1QULA 3C35A 4OHNA 3FD3A 3ZKLA 4ELPA 1XT8A 1SVXB 5A5XB 1B46A 3ZS6A 3GBAA 4YKPA 1LAFE 2A5TB 1XOCA 2GRVA 4Q30B 3ILUB 3L6GA 1N04A 5I2KA 4QSDA 5JTYB 3TCHA 5KCJB 1ZMGA 4U21A 1ZKBA 2NWJA 4GF8A 4R9GA 4YZZA 3SETA 5L9OA 4RYAA 5H8NA 3CRBA 3B6QA 2G93A 2E1SA 4TLMB 2ZNTA 5CMMA 2QS2A 3BFTA 4P11A 4PQJA 4XKRA 3CVGA 3K01A 1I6QA 1FTJA 2QS3A 2YJPA 4FEBA 1MG1A 4DDDA 2XXQA 3H6UA 4MLVA 1OVBA 3VVEA 3PD8A 3SDFA 4QSEA 4LATA 3U93A 3FV1A 4R6YA 2F7CA 4X9TA 3V5AA 2ZNSA 2I6EA 1FQCA 3TAJA 3R26A 1VR5A 2F35A 1SW4A 4ESWA 4ZZAA 4NF5A 3UORA 2F5XA 3E4RA 3TTRA 2O84X 3RTFB 2QSXA 1SYHA 5KZTA 3RT8A 1LAGE 1HSJA 3MWBA 3LSLA 4NTLA 4FE8A 1FQFA 2CMOA 3RGYA 4F22A 2OJTA 1LFHA 2REGA 1MY2A 1JVXA 4OENA 5TU0A 4MH5A 5DVIA 3HSTA 3S9NC 3B7DA 5FTIA 4XKQA 3M3KA 3LBSA 1MY4A 2Q89A 4NMYA 1JVYA 1IXGA 2HEUA 5B7DA 2ABHA 3K6VA 3K2DA 4YB6A 3U8QA 1IXHA 2ALUA 4IO6A 1FW0A 1II5A 1US4A 1LBCA 1URDA 4HS7A 4EF1A 3IB0A 3FASA 1R1NA 2XXXA 2XX7A 4F1UA 5I58B 2R6GE 4YKIA 5CMCA 4NE4A 1USYH 3HPIA 3EQ1A 5BWJA 3I5OA 4LZ5A 1ZTYA 4YKKA 3LC8A 2PT1A 3K6UA 4JSOA 3UP9A 1AL3A 2B3FA 1B5JA 3C33A 1B3HA 3MZ1A 5L9MA 5I57B 3KFMA 2Z22A 4DCYA 4U1ZA 1OIBA 3SEVA 3IOVA 3A3UA 4IO3A 2VOZA 1ANFA 4DZ1A 1XVYA 3TKDA 4KR5A 3IOTA 4ELRA 1JETA 2ESNA 4H5FA 1YTVA 2F36A 2VGQA 1P1WA 5I2NA 4F31B 4N13A 2GFEA 4KYDA 3UA8A 1L5TA 2P2AA 3MW0A 1IEJA 1JW4A 3IO4A 4HTGA 1B0HA 2FYIA 1NNTA 3C36A 3TODA 3O6HA 2I0CA 1PB8A 2HXWA 1N84A 3GXAA 4PFUA 4EXKA 3M3FA 1MPCA 2DVZA 1OMPA 4KHZE 3TTKA 3S9EA 3CFLA 4ZEFA 1JNFA 3TCFA 4OTEA 1B9JA 5L9SA 3SEUA 5I56B 3OO8A 1M5CA 1PBPA 2O1MA 4BLAA 3B6TA 3IL1B 4F3BA 4QFPA 4F29A 3KGCA 3ILTB 4R73A 3T9HB 3PV0E 3VXCA 3K0VA 2H4IA 4DE8A 1WVJA 3FUZA 3KSXA 1OLAA 1FTMA 2O1LA 2HCAA 4ZEKA 3UGWA 3QXMA 3N26A 2HZLA 4PFWA 1P99A 1UTHA 5CM6A 2DXYA 2Y7PA 3T96B 3MVYA 2H98A 3FJGA 3K1PA 4PE5B 4RNSA 5A5XA 2DE4A 2XXUA 3K4UA 3SESA 5AA1A 4PFTA 2XD2A 5H8FA 3M8UA 5DEXA 2ONKE 5KCJA 4RXLA 2DS9A 3A3CA 4EQ7A 4KYSA 3IJXB 3THIA 2P0SA 4TLLB 3K1MA 1B2HA 5K2YA 2VP1A 1UIUA 5HM4B 1FCKA 3OD7A 2IA4A 4JXIA 2R9JA 1A7LA 4KCDA 3H06B 2RC7A 3OEMA 1LCFA 3Q28A 2XXIA 1B5IA 3KJTA 4BDQA 1LAXA 1Q35A 1SW5A 4U22A 1ZIUA 4G68B 1MXYA 3LSWA 4LQ5A 3C31A 1NMUA 3OSRA 2NOOA 1IXIA 2DE3A 1NNKA 5DTBA 2Q2AA 1B05A 1B51A 2Z23A 1A99A 3S4UA 1LB8A 3KG2A 1DTZA 2HZKA 1R9LA 2NUVA 4ZEBA 4NF6B 2G29A 3TZAA 1Y1MA 3H7MA 4EDPA 4DXCA 3CR9A 1IQ7A 3KZGA 4P0GA 3IO6A 1FQEA 4O3CA 4PFYA 5TP9B 5IKBA 3K6WA 3FV2A 3OOAA 1ZU0A 1KWHA 4NF8B 4OXVA 2PX1A 2DE2A 1ZJLA 2O6AA 2Z8EA 1RYOA 3IOUA 3EHTA 1WODA 4WEPA 1MDQA 4OYVA 4IO2A 4ONYA 2X26A 1B6HA 1O63A 4FECA 3MP1A 4F1YA 3F11A 1MXUA 3QYTA 5KDTA 3T9UA 4IB2A 1D9VA 2QS1A 3HHGA 5DVJA 2F7BA 1P1QA 3V8XB 2RCBA 1S9TA 3KN8A 4IO5A 1T0KA 3S9MC 5I57A 1TT1A 2XHDA 1EZOA 2V3TA 5M2VA 3MAMA 2XXVA 3RNNA 1LAHE 3SEXA 5ELVA 1N3WA 3DM0A 3TMGA 4BDMA 3TYHA 2E0SA 3FZVA 2F8DA 2DYXA 3N6TA 4XTCQ 2B65A 4LZ7A 4QFOA 2DWAA 3JV9A 2I3VA 3MVXA 1MH4A 4ZZEA 1YPNA 1B5HA 3D4GA 1MY0A 4H8IA 3JZJA 2V3UA 3PUXE 3VLWA 3OO9A 5EYFA 1P1OA 4Z7EA 3PUVE 1AIVA 3SEWA 1SDXA 2GHBA 3PMXA 3IB2A 4LP2B 4FAJA 1TXFA 2UVIA 3CFXA 1B4HA 1F9BA 1NL5A 5ITPA 1MM6A 1P1NA 4GFRA 3VE1B 1GTKA 2AL5A 2H25A 3P7IA 4NWDA 4H67A 4ZE8A 3O2AA 4EUOA 4ZS9A 2NVUB 3IK6B 3PPNA 1USYE 3N5LA 2QS4A 5AA3A 2PVUA 1NNPA 1ELJA 3PPQA 3T93B 2DWJA 5I56A 2RC9A 2UYEA 1R6ZA 3MZ9A 3L6HA 3D4CA 2A5SA 3IOWA 1Y3NA 2QJEA 1M5DA 3BFUA 2QMXA 5EHMA 3EPEA 1JW5A 1IITA 3UN6A 4MBPA 4OEUA 4TQUQ 1FQAA 4O3AA 3IJOB 1Q1KA 1VE4A 4OFLA 2B3BA 1MQDA 4GXSB 1AH5A 4KFQA 2H9BA 4KPTA 4U4SA 1B40A 3C32A 3V83A 4JWYA 3OXNA 4K3FA 3CSBA 4ZEDA 3Q25A 1LB9A 3MJNA 1DMBA 1B3GA 2Y7WA 4NF4B 5AA4B 2Z8DA 4FATA 2AL4A 4LUBA 5L8DA 2ZYMA 5F7VA 4FEDA 1LSTA 1UTBA 3TCGA 4OMBA 1N0TA 1N3XA 5FTHA 4JWOA 3JYRA 1Y9UA 1PDAA 1LBBA 1D9YA 4GOTA 2DQVA 4LVQA 5TPAA 4O3BA 2GH9A 5F1QA 4GXAA 2I48A 2ONRA 3CFZA 1MPDA 3G3JA 4OQOA 5EHSA 4Z0IA 5I2KB 1B7ZA 2XXWA 4IY5A 5AE4A 5AA2A 3A09A 1B3LA 2H5YA 4N07A 1R9QA 4L17A 3K02A 3U1OA 2OCUA 3M3LA 3USDA 5CMKA 1TFAA 1YAEA 2XX9A 5JK4A 4QFKA 2GHAA 3G3KA 4U2RA 2Y7RA 2ZYOA 3KJ7A 2O69A 3G7WA 1A40A 1FQDA 4M4GA 1QUKA 1H45A 3OO6A 1M5BA 3QIMA 3H6TA 4I8CA 4E0XA 2F7AA 1NH8A 2M8CA 2YPNA 3MVZA 3T9XB 2Q2CA 1QVSA 1Y3PA 4DIGA 4RY1A 3UIFA 2VD2A 3QAXA 3U72A 1JW1A 3FVKA 4H1XA 2OZZA 4GQOA 4ZDMA 1ZBMA 1A54A 2RC8A 1Z7ME 3KN3A 4FIMA 2XXRA 4NF8A 1FTKA 3RTWB 2OWSA 4LZ8A 3G3IA 3MBPA 3N94A 3LR1A 2XXTA 4HCWA 1DSNA 3RUMA 4PP0A 2CZLA 1SQYA 3K6XA 4KYEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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