3C4MA

Structure of human parathyroid hormone in complex with the extracellular domain of its g-protein-coupled receptor (pth1r)
Total Genus 154
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
154
sequence length
519
structure length
469
Chain Sequence
AKIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTNAAAEFDDVMTKEEQIFLLHRAQAQCEKRLKEVRPCLPEWDHILCWPLGAPGEVVAVPCPDYIYDFNHKGHAYRRCDRNGSWELVPGHNRTWANYSECVKFL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Molecular recognition of parathyroid hormone by its G protein-coupled receptor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Fusion protein of Maltose-binding periplasmic protein and Pa
molecule tags Membrane protein
source organism Escherichia coli
total genus 154
structure length 469
sequence length 519
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
A PF02793 HRM Hormone receptor domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c4mA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c4mA01
4.10.1240.10 Few Secondary Structures Irregular Hormone receptor fold GPCR, family 2, extracellular hormone receptor domain 3c4mA03
1MXYA 1HSJA 3KN3A 3Q25A 1UIUA 3R6UA 2R71A 1B5JA 4G68C 2HAUA 3HSTA 1M5EA 3EPEA 4OEVA 3JZJA 4KI0E 4JB7A 2ONSA 5ITOA 4KFQA 4Z0IA 3PUZE 2D21A 4EXLA 3RNNA 4IO7A 2A5TB 1B0LA 4ISUA 4PETA 3TKDA 1YPNA 3KZGA 3N6UA 4GVOA 2HZKA 4GL8A 1AMFA 2I3VA 4R6KA 3MJNA 3KEIA 3ZKKA 3P7IA 2AL5A 1QKAA 5BUUA 3O2AA 1MPCA 5AA2B 5CBRA 5DTBA 4I9DA 4ZEBA 1USYE 4RPOA 3RLFE 1MS7A 2DXYA 2QPQA 2ZYNA 1Y20A 1B40A 5ISUA 1P1NA 4DXBA 4UACA 1RYOA 3O28A 3MQ9A 1SW1A 4ZEFA 2F5XA 3OOAA 3MP6A 4XKPA 4NEDA 1N84A 4F3BA 3E13X 2YJPA 2OJTA 4K3FA 1YTVA 5HM4B 5I57A 2DWAA 1MXXA 4FE8A 4U23A 4I62A 2GHAA 3LSWA 4IY5A 4F2QA 3PV0E 5L9OA 1B58A 3ODBA 4RK2A 2DSFA 3MVYA 3G7WA 3F11A 4AQ4A 2HQ0A 3MVXA 1RKMA 3RTFB 1ZBMA 3FVNA 1MXZA 2O68A 3FXQA 1LFGA 4PFTA 4QHQA 2Z8DA 3R7XA 4POWA 3LBSA 1A8FA 3I3VA 4H5FA 2I4CA 4OENA 4MFIA 2H9BA 3M3FA 3ZSFA 3JV9A 5EHSA 1FCKA 3IOUA 2PT1A 4H8JA 1NNPA 4RNSA 1JW4A 5ICTA 2V84A 1B7HA 1AOVA 4R6HA 3S9EA 3T9HB 5DYHA 3OSQA 2O84X 1Q35A 2V93A 4IO2A 4P0GA 2I6EA 3PMXA 2HZLA 1MPDA 1ZIUA 4N07A 1PBQA 2QL3A 3EHTA 1OLAA 4QSCA 3B7DA 4ESWA 3UK4A 3VVEA 1SW5A 1LCTA 4YU0A 1BIYA 4F3PA 2ONKE 5I2KA 5CMKA 2Q9TA 1LB8A 2IEEA 5CMBA 1VFEA 2XXPA 5F7VA 3MP1A 4X1BA 3SEYA 3C36A 3O29A 2XXIA 1JNFA 3IO4A 3A09A 3SKPA 4G2ZA 4YMAA 2XD2A 4RY1A 1QW0A 3B6TA 4XKQA 4ZZEA 1GTKA 3M3KA 5KZTA 1PB9A 1B9JA 3O6IA 3MAMA 3ILUB 1FTLA 2F7BA 2XXTA 1JVXA 3AXFA 4LQ5A 5JEIA 2ZXTA 3FZVA 3QUFA 3W15C 2G29A 1IXIA 3K4UA 3TZAA 4ZGMA 2HCAA 3M8UA 4IGRA 3DLNA 3IOVA 1JEUA 1BLFA 1B4ZA 3PU5A 4QFKA 3OEKA 2QMXA 2XXYA 4QF9A 3RPWA 1UTHA 3EHSA 5FHMA 4YZZA 3K1MA 1AIVA 4OZ9A 4GRKA 2JODA 1N7WA 1R9QA 3IX1A 4ZDMA 5H8FA 2ZNTA 5TU0A 2F6GA 5H8HB 4EQBA 4U2RA 4H8IA 1Y1MA 2ESNA 4R9FA 5A5XA 1B5HA 3M3LA 1CE2A 2Y84A 5B70A 2X7QA 1MXWA 4G8MA 4N6PA 5DEXA 2ZMBA 3MP8A 3QYTA 4KCCA 4DCYA 1A7LA 1FQFA 3TTKA 2YPNA 4RJZA 3TDJA 4E0WA 3OD7A 1Y3NA 3FV2A 1FTMA 3OMBA 3OO8A 4EDPA 3U92A 3E9XA 3G3KA 3WAFA 4OWDA 3ILTB 3MZ1A 3LSXA 2F7AA 4H6DA 3H7MA 1XC1A 3N7RA 4NF6A 2PX1A 1OMPA 1LBBA 2GRVA 1Z7NE 2UVJA 1US5A 3I5OA 1NH7A 1SBPA 1UIVA 3Q27A 4QFLA 3O6GA 3PMVA 3GLBA 3K1NA 4G68B 1MQDA 3KN8A 4XXUA 5TP9B 1DMBA 4NWCA 1IEJA 3DELB 3FGSA 1B3FA 1LBCA 1P1OA 3UN6A 5LOMA 1SI0A 2O1LA 3VLUA 5L8DA 1MY3A 4G8HA 1JVYA 3H4ZA 2B3FA 4FEDA 3U8QA 3RTWB 1P1UA 4GWOA 1TWYA 5I2NA 1QUJA 2Z23A 1DPPA 3H6WA 1LAFE 5ICQA 4HW8A 3SEWA 3H06B 3SEVA 1B3GA 3K6UA 3HV1A 4DLDA 1N3XA 4H0WA 1MQIA 1MDQA 4KYDA 3KN7A 3UORA 2D3IA 2QS2A 3FXUA 3Q26A 2RC9A 1QKBA 3USDA 5II0A 5I56B 4JSDA 2UVGA 4MLQA 3G3IA 4KYEA 2I58A 3MWBA 3CFLA 3O66A 2G93A 4KR5A 4BDNA 1S7YA 2XX7A 4TLMB 3Q28A 1RYXA 4ESXA 1LAGE 1UTBB 2XXVA 2DWIA 4ZE8A 1MQHA 4C0RA 2AYSA 3BFTA 1MQJA 4EF1A 2HAVA 4DXCA 3H3GA 2RC7A 4IB2A 3K6XA 3RUMA 1DPEA 4C1TA 3KOTA 1XVXA 1DTZA 2LAOA 4DXUA 2HXWA 1D9YA 3TEPA 1S50A 4GL0A 2OZZA 5FTIA 1BP5A 1FTJA 1EZOA 1IZ1A 3GBAA 5AA1A 4G4PA 1JQFA 3TCHA 1MH4A 2RINA 1WDNA 1Y4TA 4LQ2A 4OESA 4PFWA 1OLCA 3UIFA 5CI5A 3OO7A 3V89B 1NFTA 1ZU0A 5ELVA 3IB1A 4GXAA 1IQ7A 1N7XA 2GFEA 4N13A 3PUYE 5K2XA 3SERA 4NF5A 3CI8A 2I48A 4QFOA 2QRYA 2H4IA 4PFYA 1M5DA 1A54A 4ELOA 3S9MC 1LFIA 1MG1A 1WVJA 4ND9A 4RK9A 2Y7WA 3SETA 1ZMGA 4RXLA 3T66A 3N7SA 3KBRA 1FW0A 3C32A 4WXJA 3V83A 1YCJA 2XXHA 2F7CA 4OXVA 3VLVA 4GLIA 1LGBC 5L9SA 4KYSA 4PE5B 2XXXA 1FTOA 4NF4A 1QULA 4BDQA 1XHYA 1FQAA 4GFRA 1SD3A 2O6AA 4XIGQ 4LZ7A 5I57B 1Y4CA 1PEBA 3C31A 1SDXA 3HHGA 4F19A 1A99A 4F3GA 3MVZA 4F29A 1NL5A 2OLBA 2O1MA 2NWJA 3S2VA 4U4XA 3T9XB 2L27A 1B1HA 5DT6A 3OENA 3C5TA 1MM6A 2UVHA 3KOSA 4OMBA 4POXA 4YICA 1NNKA 1BKAA 3S9NC 2FYIA 2Y7RA 1R1NA 3E3KA 3CFZA 4OETA 4F1VA 1Z7ME 4YB7A 4R6YA 2O51A 3OO9A 4F31B 2OCUA 4G8NA 3VE1B 1A55A 3R26A 2H99A 4WEDA 4JXIA 4HJ0A 2ZNSA 3VDFA 4BDOA 2FA7A 4TOZA 3QAXA 1LAHE 2V3QA 5K2YA 3B6WA 1MH3A 1SQYA 3IOWA 3G3JA 4Q5TA 1L5TA 5I2KB 4F39A 1IUDA 1Y3PA 2Y7IA 2W7YA 3THIA 4LUBA 3TPAA 2PVUA 1II5A 2NOOA 2I49A 3VLWA 1N04A 2PMSA 2XXUA 1POTA 1MY1A 2Z8FA 2V3TA 1ZTYA 2KLFA 2Q8JA 2XD3A 1T0KA 3KG2A 3CR9A 4EXKA 2GHBA 4XTCQ 5IAIA 4F1YA 2XX9A 2ZYMA 4LP2B 3K01A 1AH5A 5DVFA 3PUVE 2QS1A 2DWJA 5CC2A 2JNCA 2OWTA 1CB6A 2DVCA 5ITPA 3OO6A 5TPAA 1O64A 4KPTA 4U21A 3W9VA 5I58A 5H8SA 4OEUA 2F8DA 2F78A 1Y1ZA 2UXAA 4NF8A 1JETA 1EU8A 5H8NA 1UTHB 4U4SA 1TT1A 4E0XA 4Z7EA 1TXFA 2DS9A 2O69A 3CRBA 5H8FB 4LVQA 3IAZA 1EH3A 3N5LA 4LONB 2I4BA 4IO5A 2UYFA 2IA4A 4R73A 5A5XB 2QSXA 3HO7A 1VE4A 3VV5A 4TLLB 5DEXB 4Q8RA 3FUZA 5HBCA 2DOJA 4BDLA 4GXSB 4FATA 3IO6A 4JDFA 3KJ7A 1IXGA 3BFUA 4GQOA 2Z8EA 4HS7A 1USYH 2XXRA 3HN0A 4FECA 2A5SA 1PDAA 4NF6B 3RY3A 1URDA 5FTHA 2F97A 4KD5A 2QS3A 1WODA 3EN3A 4O3CA 1QUIA 4IGTA 3FV1A 1B46A 3LC8A 3EQ1A 4DE8A 1NMUA 3CSGA 1PB8A 1ZJLA 2Q2AA 3RN8A 3SEUA 3VFJA 2YLNA 1HSEA 2V3UA 3T9VA 2F35A 3T22A 1US4A 1VR5A 1EZPA 3K0VA 1URSA 2F36A 2Z22A 3SESA 5KDTA 2PT2A 4BLAA 4BDRA 3IL1B 3KGCA 1Y3QA 4YKJA 2H98A 1IITA 1POY1 4GOTA 1U34A 5I2NB 4FEBA 4AB5A 1I6AA 2VOZA 1MM7A 3ECRA 3GZGA 2R6GE 4XKRA 3K6WA 5EYFA 1KWHA 1B6HA 4ZECA 3DP4A 3KJTA 4R2BA 2RKMA 2GH9A 2DP8A 3T9UA 2XDGA 2BJJX 2ALUA 2PYYA 3C4MA 3H03A 3TCFA 4EQ7A 3TTRA 2DYXA 1H44A 3VVFA 1J1NA 4TQUQ 4ZS9A 1M5BA 4U22A 5H8QA 3MUQA 3FVKA 3FIRA 3TTMA 5IKBA 4UA8A 4YKIA 2ZNUA 4DCXA 2DE2A 3LSFB 2X26A 4Q0CA 3FJMA 3OXNA 2DE4A 3QIMA 1IXHA 5AE4A 3PPOA 3QK6A 4GF8A 3SDFA 4THIA 4KCDA 1B3EA 3K6VA 4ECFA 4KQPA 4DIGA 3PPRA 4QRZA 1SYHA 1FTKA 1AL3A 4RPNA 1ZKBA 5KCJA 2QJEA 1XOCA 4JSOA 2THIA 3CIJA 1FQBA 4I1DA 3U93A 1MDP1 3CFXA 1Q1KA 3VXBA 4ONYA 3EF7A 3O97A 1SVXB 3BKIB 3TFLA 4C1UA 1A8EA 2X7PA 4FJPA 4IY6A 2I3WA 4XKNA 1HSLA 1N3WA 1R6ZA 3LR1A 1FQEA 3MW0A 3MPLA 3PPQA 4NF5B 1MXUA 4EQ9A 3GBBA 3U94A 3C59A 2B65A 2FNCA 1LCFA 3C33A 3BBRA 2VHAA 4NTLA 3PPNA 1B7UA 2OK2A 1H76A 2F6PA 1NNFA 3IK6B 4OHNA 1H45A 4QSEA 1D9VA 3C35A 4H65A 1B52A 2CZLA 4JWXA 4GD5A 5CBSA 3FXRA 3CG1A 1ATGA 3L6HA 4BDMA 3G3GA 4YAHX 3VVDA 1XVYA 3HHFA 4ERSA 2A5TA 4NF4B 1B7ZA 3O6HA 3ONMA 4WEPA 1A40A 3JYRA 4JWOA 4OERA 2P2AA 3UGWA 2QMWA 5AA2A 4DDDA 3PMWA 3DM0A 1B4HA 4OFOA 1Y9UA 1XT8A 2PBWA 2O7UA 2RF1A 4ZEKA 4MLVA 1F9BA 4Q30B 4YB6A 1TFAA 3GXAA 1B51A 1ZLQA 1ANFA 2NUVA 2AIXA 3TCGA 3HPIA 1GR2A 5B7DA 1P99A 1YAEA 2NVUB 3ZKLA 4ELPA 1QUKA 2OWSA 4R75A 3WAEA 1URGA 2UVIA 1IXCA 2REGA 3U1OA 5JTYB 1ELJA 4PP0A 3RQTA 5BWJA 3IB0A 5JTYA 1UQWA 2Q2CA 3K02A 1IIWA 1OVBA 5M2VA 4ZZAA 2ONRA 3S9LC 1I6QA 2Q89A 3MBPA 1MRPA 2JNDA 4YKKA 5JK4A 3TELA 2M8CA 4PFUA 1LAXA 1I69A 4P0IA 2XXWA 2ZYKA 1M5FA 3MPKA 3VXCA 1MQGA 2VGQA 4NMYA 2RC8A 4R2FA 4U1OA 3OELA 3C9HA 1PB7A 3V5AA 2ABHA 3TUSA 3K2DA 4YKPA 1B05A 3RT6B 2E0SA 3PUXE 1GV8A 4OYVA 3T93B 3U72A 3IOLA 4P11A 5HPQA 2QS4A 5J1DA 3KSJA 5FHNA 3H6TA 2XXQA 3DP6A 3CVGA 2REJA 3T96B 2P1SA 5TPAB 4QFPA 5EHMA 2NXOA 3LUYA 5I58B 5AA2D 2B3BA 5L9MA 3TMGA 2P0SA 3OEMA 1B3HA 3IOTA 4NF8B 3TAJA 4ELRA 5H8NB 3FVOA 4EF2A 3IORA 1N76A 1XS5A 4HTGA 4H5GA 4F22A 1GGGA 1N0TA 1TFDA 3IJXB 3RT8A 4GIZA 3C34A 1R9LA 4JWYA 2H5YA 3S4UA 1DOTA 2OBGA 3Q29A 3SEXA 3KFMA 3HCQA 2F34A 3QUJA 5AA4B 4RA1A 1VSOA 1FQCA 4F2OA 4OVJA 4F1UA 4ELQA 1B3LA 5AA4A 3G3HA 1EZ9A 1LLSA 2RCAA 1NH8A 1QJMA 1PBPA 3V8XB 4F3SA 3H6UA 3PUWE 5CM6A 4H1XA 1MY4A 4QSDA 5F1QA 5H8HA 1O7TA 4HCWA 3TYHA 3ZS6A 4X9TA 3OSRA 5CRYA 4G77A 4ZEDA 4MF3A 4RYAA 4AB6A 2DXRA 2XX8A 5AA3A 1I6BA 1VFDA 4OTEA 4F18A 3D4GA 1FQDA 3TTLA 2V25A 3UP9A 3A3UA 4R9GA 4WKMA 1O63A 3QXMA 3IJOB 2H25A 3PGFA 5FHOA 4R72A 2D5WA 1SYIA 1LSTA 1MY2A 5I84A 4X1DA 5KDTB 2ANJA 4IO4A 2ZYOA 4LF3C 3KSXA 3N94A 3PD8A 3FD3A 1LFHA 1JW1A 3MZ9A 4LA9A 2AL4A 4OFJA 4LATA 2DWHA 3FJGA 3G3FA 3TTNA 1MY0A 4O3AA 1OQGA 4U1ZA 1MXVA 4M1VA 3FATA 3N7PA 3MC2A 4G68A 2I0BA 5TP9A 1D3KA 5I59B 5CMMA 1SI1A 3QSLA 4X48A 1B1XA 1LB9A 2Q88A 5DVJA 1S9TA 5I59A 3TQWA 3UA8A 1B0HA 3LSLA 3O9PA 2VD3A 3EHUA 2Y7PA 4HCYA 4ZE9A 4M4GA 1NNTA 3K1PA 4QFNA 3IB2A 3K00A 4DLOA 1DTGA 4ZEIA 3W9WA 1H43A 4I8CA 4YMBA 4MBPA 1QVSA 3CSBA 5H8QB 4KHZE 4IO6A 3CG3A 1MPBA 2UYEA 3D4CA 2WKYA 1P1QA 4O3BA 3E4RA 1JW5A 1OIBA 3PPPA 3FVGA 2Y7KA 1PC3A 4FORA 2CMOA 3TQLA 3H6VA 5I56A 4PQJA 2XHDA 2RCBA 3L2JA 2E1SA 3MZBA 4DZ1A 1SW4A 1BTJA 2VP1A 5DVIA 2R9JA 3AQFB 4H67A 1B32A 1DSNA 4FIMA 3N26A 1JEVA 3PD9A 5KCJB 2HFBA 4L17A 4NWDA 4DLQA 1UTBA 3DP8A 4JBZA 4YB5A 3I6VA 2O7IA 3IR1A 4R74A 4OFLA 3RGYA 3A3CA 4LZ8A 4MH5A 3FJ7A 3TODA 2QKHA 4IO3A 1SW2A 2VD2A 1B5IA 2DE3A 1NKXA 2HEUA 3L6GA 4FAJA 2DQVA 2DVZA 1H3DA 4NE4A 4OQOA 1GVCA 4EUOA 3FASA 1P1WA 1OVTA 2I0CA 1OQHA 3B6QA 1B2HA 4LZ5A 5CMCA 3MVWA 1D4NA 3N6TA 1M5CA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5ET7A 1MXYA 1HSJA 3KN3A 3Q25A 1FJ6A 1UIUA 3R6UA 2R71A 1B5JA 4G68C 2HAUA 3HSTA 1M5EA 3EPEA 4OEVA 3JZJA 4KI0E 4JB7A 2ONSA 5ITOA 4KFQA 4Z0IA 3PUZE 3KC0A 2D21A 4EXLA 3RNNA 4IO7A 2A5TB 1B0LA 4ISUA 4PETA 2WBDA 3TKDA 1YPNA 3KZGA 3N6UA 4GVOA 2XWOA 2HZKA 4GL8A 1AMFA 2I3VA 4R6KA 3MJNA 3KEIA 3ZKKA 3P7IA 2AL5A 1QKAA 5BUUA 3O2AA 1MPCA 5AA2B 5CBRA 5DTBA 4I9DA 4ZEBA 1USYE 4RPOA 5EQAA 1MS7A 2DXYA 2QPQA 2ZYNA 1Y20A 3RLFE 1B40A 5ISUA 1P1NA 4DXBA 4UACA 1RYOA 5EQ9A 3O28A 3MQ9A 1SW1A 4ZEFA 2F5XA 1KA1A 1INPA 3OOAA 3MP6A 4XKPA 4NEDA 4AS5A 1N84A 4F3BA 3E13X 2YJPA 2OJTA 4OVQA 4K3FA 1YTVA 5HM4B 2L5VA 4GX4A 5I57A 2DWAA 1MXXA 4FE8A 4U23A 4QBAA 4I62A 4O7IA 2GHAA 3LSWA 4IY5A 4F2QA 3PV0E 5L9OA 1B58A 3ODBA 4RK2A 2DSFA 3MVYA 1FBHA 3G7WA 3F11A 4AQ4A 2HQ0A 3MVXA 1RKMA 1NV2A 3RTFB 1ZBMA 3FVNA 1MXZA 2O68A 3FXQA 1LFGA 4PFTA 4QHQA 2CEYA 2Z8DA 3R7XA 4POWA 3LBSA 1A8FA 3I3VA 4H5FA 2I4CA 4OENA 4PBQA 3B8BA 4MFIA 5FBPA 2H9BA 3M3FA 3ZSFA 3JV9A 5EHSA 1FCKA 3IOUA 2PT1A 4H8JA 1NNPA 4RNSA 1JW4A 5ICTA 2V84A 3IFCA 1B7HA 1AOVA 4R6HA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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