3EHTA

Crystal structure of the extracellular domain of human corticotropin releasing factor receptor type 1 (crfr1) in complex with crf
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
452
structure length
452
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPETWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTNAAAEFSLQDQHCESLSLASNISGLQCNASVDLIGTCWPRSPAGQLVVRPCPAFFYGVRYNTTNNGYRECLANGSWAARVNYSECQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Molecular Recognition of Corticotropin-releasing Factor by Its G-protein-coupled Receptor CRFR1.
pubmed doi rcsb
molecule keywords FUSION PROTEIN OF CRFR1 EXTRACELLULAR DOMAIN AND MBP
molecule tags Membrane protein
source organism Escherichia coli
total genus 123
structure length 452
sequence length 452
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-09-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
A PF02793 HRM Hormone receptor domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ehtA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ehtA01
4.10.1240.10 Few Secondary Structures Irregular Hormone receptor fold GPCR, family 2, extracellular hormone receptor domain 3ehtA03
3KEIA 4RK9A 3SEVA 5IAIA 3K00A 4NTLA 5ISUA 1R1NA 3VVEA 4Z7EA 3OD7A 3HO7A 4ERSA 5ICQA 1ZU0A 3VDFA 1M5CA 3N7RA 3KFMA 2GHBA 4K3FA 3H03A 5EHMA 5H8NB 1PB8A 3PUXE 5TPAA 2QS3A 5CMBA 1URGA 2A5TA 1SI1A 2F97A 3TEPA 1SW1A 3EN3A 1FQAA 2XXTA 1B3GA 4AB6A 4OETA 1IUDA 1FTKA 1SYHA 2Z8FA 2OWSA 3MP8A 4AQ4A 4FATA 4YICA 4TOZA 4YMAA 4JB7A 4XIGQ 3H6UA 3FJ7A 4FJPA 5TP9A 2QL3A 2JNDA 3MWBA 1Y4TA 4NE4A 3KOTA 1MM6A 4YAHX 1QJMA 2Y7KA 5I58B 1LCTA 1URDA 2XXHA 1UTBB 3ZKKA 3KSXA 2ZYNA 1BLFA 1IXGA 3FVKA 3C34A 2Z8EA 4O3CA 5DEXB 1J1NA 4QFKA 1JEVA 1B52A 2XX8A 1B3FA 3W9VA 3OMBA 2CZLA 3O97A 3V83A 3IR1A 3C35A 3CSBA 2A5SA 5L9SA 2F36A 4I9DA 4LZ8A 1H43A 1ELJA 5H8SA 3VE1B 1YPNA 3R26A 1Y9UA 4ZEDA 4KYDA 4F1VA 2H5YA 4H6DA 4PETA 3FV1A 4HS7A 2L27A 3U93A 1B2HA 3S9NC 3FD3A 4H8JA 4MLVA 1XT8A 4M1VA 5H8HA 4RJZA 1A54A 3MPKA 1B5IA 4I8CA 1P1WA 3HPIA 3O28A 4RK2A 2IEEA 4G8NA 3HV1A 3EPEA 3UORA 1FQBA 3SEYA 4EXLA 1TT1A 4WKMA 2RCBA 2O6AA 1PEBA 4NMYA 5I84A 3K01A 4JWOA 3UIFA 1JW5A 4RNSA 4IO6A 3N6TA 4YKKA 4P0GA 3VLUA 3LSWA 3IORA 3CVGA 1GVCA 3B6WA 3ZSFA 5I59B 1USYH 1Z7NE 3WAFA 1B5JA 3FXUA 4R9GA 1B4HA 3TZAA 4IO4A 3RT8A 1FQFA 4GVOA 2ZNSA 4U21A 4RPOA 5TU0A 5HBCA 4N13A 4IGRA 4OEVA 4YB5A 2FNCA 3PUWE 4DCXA 2LAOA 1MXYA 4TLMB 1OLAA 4L17A 3EHUA 1LAXA 3MVZA 4DIGA 1VFEA 2Y7WA 2O69A 1NMUA 4OMBA 5H8QB 4KFQA 2DOJA 3OO7A 3T22A 2UVHA 2DXRA 2H9BA 1A55A 4EQ7A 3OO6A 2REGA 4U4XA 3KJ7A 5H8NA 3L6HA 5II0A 3DELB 3N94A 4F1YA 3VLVA 2F78A 1SD3A 5EHSA 5K2XA 4ECFA 2VOZA 4RA1A 3BFUA 2Q2CA 2DS9A 1NKXA 1A8EA 2YJPA 4DXCA 3OOAA 3LC8A 4IY5A 1MQHA 2AL5A 1P99A 3FUZA 1OMPA 4BDRA 2V93A 5BWJA 4G68B 2JNCA 2ANJA 2Q9TA 3N5LA 3SEXA 4Q5TA 3T9VA 4ESXA 2HAUA 1PC3A 2AIXA 4ZECA 4JSDA 2Q88A 1RKMA 2H4IA 5CMMA 3H3GA 3MVWA 1Y1ZA 1JQFA 2Y7IA 3IJXB 3VFJA 5I56A 2A5TB 5DEXA 4RXLA 1NL5A 1GV8A 4KPTA 2B65A 4JWXA 3V8XB 1EZPA 1B32A 2AL4A 2F35A 2FYIA 3MC2A 4GF8A 3G3GA 3IL1B 2E1SA 5TP9B 1NNKA 3W9WA 2ZYMA 1LSTA 3E3KA 3QUJA 3BKIB 1MY4A 4LVQA 2PBWA 2PYYA 1P1NA 4BDQA 3N7PA 2QS1A 1MDQA 5AA4A 2Y84A 2I6EA 1YTVA 3QUFA 4C1TA 2B3BA 2HZLA 4ZZAA 4BLAA 3E4RA 1N0TA 5CBSA 1PB9A 2OCUA 4QSEA 3K1PA 4ZDMA 3KG2A 1AMFA 2ESNA 1QW0A 5BUUA 3QXMA 1Q35A 1I69A 1GR2A 4IO7A 2PMSA 3QIMA 2VD2A 2D5WA 5CM6A 4X1DA 1B7UA 3FXQA 4BDLA 1IXCA 1AOVA 4DXBA 4C1UA 1PDAA 2Z22A 3MW0A 5H8HB 1ZKBA 3Q26A 3E9XA 3G3IA 1KWHA 3IOWA 3ZS6A 3A3CA 2F34A 4NF4B 1Y3NA 1B1HA 4G68C 3TQWA 2OK2A 4N07A 4FORA 1LBBA 4NF5A 3IK6B 2ONRA 4KCCA 3H4ZA 4OERA 1MPBA 3B6TA 4P11A 2F5XA 1M5DA 2R9JA 1SYIA 1ATGA 3TKDA 2XXRA 4NF8A 3VLWA 2XX7A 4R2FA 1N04A 1NNFA 5LOMA 4I62A 4UACA 5DVJA 3HCQA 4RYAA 2O7IA 5FHOA 1O7TA 5F7VA 3V5AA 4MFIA 3I6VA 2RKMA 1US5A 1FTJA 3D4CA 3DLNA 1MDP1 2XXIA 3MP1A 2DWIA 4KHZE 1IZ1A 4F2OA 1MG1A 1JETA 4R9FA 3CRBA 3IX1A 3PV0E 2AYSA 2THIA 3HN0A 4WEPA 4HCWA 1Y3PA 2GRVA 2XXYA 4ZE8A 2NVUB 4DE8A 1LAGE 5AA1A 4R73A 3K1MA 1S9TA 4G8MA 2O7UA 3K02A 4OZ9A 3K4UA 4IO3A 4NWCA 3K0VA 3ZKLA 3IB1A 3MBPA 4ESWA 3LSXA 1Q1KA 1OIBA 5IKBA 5ITOA 3VVFA 1NH7A 1HSLA 4OHNA 1Y1MA 5CMKA 3TTRA 3VXBA 4PE5B 3PPQA 2O84X 2XXXA 1CB6A 3O29A 3H06B 3TODA 1D3KA 3OO9A 1SW2A 1GTKA 4QRZA 2DWJA 1IXHA 1PBPA 2NWJA 5L9OA 5I56B 3TPAA 1MS7A 4KQPA 2X7QA 1DSNA 1FQEA 3A09A 3KJTA 4Q8RA 3PGFA 3PUVE 4G8HA 1LLSA 5DVIA 1B5HA 3EHSA 3CG3A 4KYEA 4YMBA 1S7YA 2XXQA 4N6PA 3T66A 4MH5A 3MZ1A 2Q89A 2E0SA 1BKAA 2XXWA 2UYFA 5AA4B 4H67A 1A7LA 4POXA 3FV2A 3IJOB 3TDJA 2B3FA 3SETA 2FA7A 1A8FA 2OBGA 5KZTA 1WVJA 4ND9A 3TUSA 4LUBA 3TFLA 3OEKA 4ONYA 4ZEBA 1MY1A 3K6XA 1N76A 1POY1 2OWTA 1XVXA 1YAEA 4NF4A 5K2YA 3L6GA 4RPNA 1Y20A 2KLFA 4DLOA 4R2BA 3TMGA 4UA8A 4QFNA 5FHMA 5AA3A 1FTLA 1MQJA 1QUKA 1H76A 3TCFA 3UN6A 2ZNUA 2GFEA 3N26A 2HCAA 4LP2B 2X26A 2P1SA 2GH9A 1N84A 2DQVA 3EHTA 3B6QA 3F11A 4ELPA 1Y4CA 2OJTA 3QYTA 2DVZA 2YLNA 3FJGA 3A3UA 1B46A 3U92A 3MJNA 4NF5B 1XOCA 2XD2A 1AL3A 5EYFA 1OQHA 3N6UA 1IIWA 4H5GA 4EXKA 1N3XA 3U72A 3HHGA 2F7CA 1D9YA 3KBRA 3PPRA 1LB8A 1Y3QA 1N7WA 3ILUB 3P7IA 4NF8B 2RINA 3T96B 4JDFA 3O6HA 3TTNA 5AA2B 2Z23A 3K1NA 2P2AA 2F8DA 3LSFB 3FASA 1OLCA 4EQ9A 1VR5A 3CI8A 3T9XB 5ELVA 4YKIA 3UK4A 2XX9A 1FCKA 1TWYA 1MM7A 4AB5A 1B4ZA 3M3FA 3PD9A 3GZGA 3VV5A 5DYHA 3I5OA 3GXAA 3MAMA 2VD3A 3JZJA 3G3KA 1POTA 3MZ9A 3C5TA 4EF1A 1IXIA 3CFZA 3CG1A 2H99A 4H65A 4OEUA 3AQFB 4DZ1A 4GFRA 1MY0A 4E0WA 1DMBA 4LONB 2QS2A 1UIUA 1SI0A 5H8FA 3IB2A 1MY2A 2I58A 1FQCA 1OQGA 1QUJA 5I2NA 5JK4A 3OXNA 4Z0IA 4U4SA 3Q28A 4NF6A 1N3WA 2QRYA 4OESA 3OENA 4R72A 2QKHA 4X9TA 2RC8A 1B0HA 4XKRA 1SBPA 4IO2A 1R9QA 4KI0E 3I3VA 4Q0CA 4YKJA 2V3TA 4YKPA 2G29A 3O6GA 3RN8A 3MPLA 2HFBA 2I4CA 1LFGA 1JW1A 3D4GA 1MRPA 3IOTA 3RGYA 4OFOA 1WDNA 4F3PA 1NH8A 1H44A 1H3DA 1QUIA 1D4NA 3C9HA 2ONKE 3B7DA 4PFTA 3ECRA 2NOOA 2Y7RA 2HQ0A 3L2JA 3K6UA 3UA8A 2Q8JA 3PMXA 2I49A 1LAHE 1XS5A 1MQGA 4ELQA 3DP6A 3E13X 4QFOA 2ZMBA 3UGWA 3KN3A 4O3BA 1LGBC 2QMXA 1RYOA 2V25A 3SKPA 3N7SA 3O2AA 2R71A 4E0XA 3OO8A 2RC9A 1ZLQA 3FVNA 1B05A 1NFTA 4Q30B 3O9PA 1TXFA 4KR5A 4FEBA 5AE4A 1NNPA 4BDMA 3FGSA 3DM0A 4HW8A 4G77A 4F29A 4OTEA 4PQJA 3G3JA 3C31A 3C33A 5CC2A 4DCYA 1BTJA 1H45A 5CRYA 1T0KA 4FIMA 4H0WA 3ONMA 2O51A 1DTGA 4C0RA 1QVSA 1MXWA 2UVIA 1VSOA 3PUZE 3KSJA 3V89B 2DYXA 2Q2AA 2W7YA 1R6ZA 3KN7A 3PPPA 1MPDA 3FIRA 2I4BA 5CI5A 3KGCA 2ABHA 1I6BA 1A40A 4F3GA 5AA2A 4QSDA 4F22A 1TFDA 3FJMA 4LQ2A 2G93A 3OSRA 3OELA 2ZYKA 4LZ7A 1BIYA 4H8IA 5JTYA 1B7ZA 3H6WA 4U2RA 4IGTA 4QF9A 2R6GE 4OWDA 2I0CA 3C36A 1USYE 3DP4A 4ZZEA 3THIA 4ZGMA 1PBQA 1R9LA 2H98A 3EQ1A 3T9HB 4ELOA 3QAXA 5KCJA 3H7MA 4U23A 4GQOA 4I1DA 2DWHA 2UVGA 2XXVA 3MVYA 1B6HA 2P0SA 1F9BA 4ELRA 5FTIA 5I2KA 3KN8A 4RY1A 3TAJA 5M2VA 2F6PA 4R6KA 3SERA 3WAEA 3TCGA 1I6QA 2IA4A 4H5FA 4XKQA 1CE2A 1B3HA 3Q29A 3RY3A 4R6YA 4F3SA 5JEIA 3KOSA 4HTGA 2V3UA 1UTHA 3S2VA 3TTLA 5A5XA 3Q25A 2BJJX 1B1XA 1HSJA 1TFAA 3RQTA 3HHFA 3M8UA 1OVTA 1QKAA 5HPQA 5ICTA 3GLBA 5DT6A 3UP9A 2QPQA 3BFTA 3BBRA 1D9VA 5HM4B 5H8FB 4R74A 3TELA 4F1UA 2WKYA 5I2NB 3PPOA 3FZVA 1ANFA 2UVJA 4PFWA 4EDPA 5J1DA 4NF6B 4JXIA 4OFJA 4QSCA 4M4GA 3M3KA 4ISUA 4PFUA 1SW5A 3IO4A 4IO5A 4ZS9A 1LCFA 3AXFA 3ODBA 3CFLA 3PMVA 5I57A 4YB6A 3CFXA 3PU5A 2M8CA 4FAJA 4EUOA 1AIVA 1JNFA 3T93B 3T9UA 4EQBA 4F39A 2REJA 4DLQA 4THIA 2ALUA 2Z8DA 1MQIA 4OYVA 4OQOA 2YPNA 5DVFA 2I0BA 1B51A 2RCAA 2DXYA 4X1BA 2F7AA 1BP5A 4LA9A 3RNNA 2RF1A 4YU0A 1VE4A 2DP8A 3U94A 3W15C 5FHNA 2PT1A 4WEDA 3K6VA 3IAZA 4FE8A 4GXSB 4NWDA 3PMWA 4GLIA 2HXWA 1P1OA 2F7BA 3VVDA 2OZZA 3EF7A 1DPEA 3JYRA 1QULA 2NXOA 4ZE9A 5L9MA 3IB0A 1DPPA 3GBBA 3S9MC 3Q27A 2D21A 2VP1A 3IOUA 1EZ9A 1GGGA 2XD3A 4MBPA 3SDFA 2O1LA 3O66A 1EH3A 1Z7ME 4R6HA 4YZZA 3TCHA 1JEUA 3DP8A 1M5FA 5KDTB 1II5A 2ZNTA 2UXAA 4MLQA 1ZMGA 1HSEA 1UIVA 5CMCA 3MZBA 2DE4A 1U34A 1LBCA 2GHAA 3TYHA 2DVCA 4F31B 3MP6A 1XVYA 3FXRA 4FECA 3MQ9A 2DE3A 4ZEKA 4QFPA 4LF3C 1O63A 4U22A 4XTCQ 3FVGA 3H6TA 2D3IA 1SDXA 3S9EA 1B3LA 1LFIA 4BDNA 1XHYA 5JTYB 5AA2D 3MVXA 2XHDA 1US4A 4LATA 4OENA 5B70A 5L8DA 1XC1A 1ZTYA 4YB7A 3LR1A 3K2DA 3QK6A 1EU8A 3LSLA 3CSGA 4GWOA 3CR9A 1B7HA 3PUYE 2H25A 3C32A 4KD5A 1ZJLA 2VGQA 5KCJB 2PVUA 1A99A 3U8QA 3TTKA 2QMWA 3SEUA 3USDA 1SW4A 3R6UA 5I2KB 1JVYA 1IITA 3K6WA 1NNTA 5F1QA 2UYEA 1FTMA 4MF3A 4XKNA 5I58A 5ITPA 4XKPA 2I48A 3RTWB 1N7XA 4H1XA 1MQDA 3IOLA 1UTBA 1LB9A 1S50A 1EZOA 5TPAB 1JW4A 4F2QA 4F18A 1B3EA 2V3QA 2F6GA 1JVXA 1MH4A 3KZGA 1LFHA 4F19A 3LUYA 4TQUQ 3SESA 3FVOA 4JSOA 3IOVA 3H6VA 4KCDA 1UTHB 1FTOA 4P0IA 5A5XB 3MUQA 1MXVA 1IEJA 2DSFA 3RTFB 3S9LC 4PFYA 5B7DA 4F3BA 2RC7A 2VHAA 1IQ7A 4WXJA 5CBRA 4QHQA 3OEMA 4OVJA 4FEDA 2JODA 3G3HA 2OLBA 3QSLA 4OFLA 4X48A 2PX1A 4IY6A 2HEUA 3TTMA 2QS4A 1URSA 2O68A 3GBAA 4O3AA 1I6AA 1M5BA 4GL8A 1ZIUA 3R7XA 1UQWA 3M3LA 1OVBA 1L5TA 3FATA 5DTBA 4GXAA 2ZYOA 5I57B 1P1QA 3PPNA 1B58A 3G3FA 2Y7PA 3VXCA 4POWA 1MH3A 3OSQA 4G4PA 4DDDA 3RUMA 3G7WA 1PB7A 1M5EA 4BDOA 2PT2A 4R75A 1MXZA 2XDGA 1RYXA 3HSTA 3SEWA 1P1UA 3PD8A 5I59A 4JWYA 1B9JA 3TQLA 1AH5A 3O6IA 1SQYA 4LZ5A 1B40A 2V84A 4TLLB 1ZBMA 3JV9A 3RPWA 2X7PA 4LQ5A 2DWAA 1YCJA 2I3VA 3ILTB 1LAFE 4U1OA 2XXPA 3RLFE 3U1OA 5KDTA 3RT6B 2DE2A 4NEDA 1WODA 4OXVA 2QSXA 3C59A 4DLDA 3CIJA 1O64A 2HAVA 4PP0A 2XXUA 2ONSA 4EF2A 4ZEFA 1DOTA 1FQDA 4HJ0A 2CMOA 2O1MA 3C4MA 1MXXA 4GRKA 4JBZA 5H8QA 4KYSA 1B0LA 1MPCA 1FW0A 2NUVA 1SVXB 3S4UA 1QKBA 4DXUA 2HZKA 2ZXTA 5FTHA 4ZEIA 4IB2A 3IO6A 4GIZA 1DTZA 1MY3A 4HCYA 4QFLA 4GL0A 2I3WA 1VFDA 4XXUA 3LBSA 1MXUA 4GOTA 2QJEA 4U1ZA 4GD5A 4G68A 4G2ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3KEIA 4RK9A 3SEVA 5IAIA 3K00A 4NTLA 5ISUA 1G0HA 1R1NA 3VVEA 4Z7EA 3OD7A 4NHBA 3HO7A 4ERSA 5ICQA 1ZU0A 3B50A 3VDFA 1M5CA 3N7RA 3KFMA 2GHBA 4K3FA 3H03A 5EHMA 5H8NB 1PB8A 3PUXE 5TPAA 2QS3A 5CMBA 4HE0A 1URGA 2A5TA 1SI1A 2F97A 3TEPA 4N6DA 4MX6A 1SW1A 3EN3A 1LBVA 1FQAA 2XXTA 1B3GA 4AB6A 2HPGA 4OETA 1IMBA 1IUDA 1FTKA 1LBYA 1SYHA 2Z8FA 2OWSA 4HE1A 3MP8A 4AQ4A 4FATA 4YICA 4TOZA 4YMAA 4JB7A 4XIGQ 3H6UA 3FJ7A 4FJPA 2QFLA 5TP9A 2QL3A 2JNDA 5I5PA 3MWBA 1Y4TA 4NE4A 3KOTA 1MM6A 2XWKA 4YAHX 1QJMA 5IGAA 2VPOA 2Y7KA 5I58B 1LCTA 1URDA 2XXHA 1UTBB 3ZKKA 3KSXA 2XXKA 4I40A 2ZYNA 1BLFA 1IXGA 3FBPA 3FVKA 3C34A 2Z8EA 3MSTA 1FPGA 4O3CA 5DEXB 1J1NA 4QFKA 1JEVA 1B52A 2XX8A 1B3FA 3W9VA 3OMBA 2CZLA 3O97A 3V83A 4N15A 4PDDA 3IR1A 4NG7A 3C35A 3CSBA 2A5SA 5L9SA 2F36A 4I9DA 1FRPA 4LZ8A 1H43A 1ELJA 5H8SA 3VE1B 1YPNA 3R26A 4PCDA 1Y9UA 4ZEDA 4KYDA 4F1VA 1RDZA 1NUZA 2H5YA 4H6DA 4PETA 4N81A 2MKZA 3FV1A 4HS7A 2L27A 4G61A 1B2HA 3U93A 3S9NC 3FD3A 4H8JA 1K9ZA 4MLVA 1XT8A 4GWZA 1FPDA 4M1VA 5H8HA 4RJZA 1A54A 3MPKA 1B5IA 4I8CA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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