3EHTA

Crystal structure of the extracellular domain of human corticotropin releasing factor receptor type 1 (crfr1) in complex with crf
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
452
structure length
452
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPETWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTNAAAEFSLQDQHCESLSLASNISGLQCNASVDLIGTCWPRSPAGQLVVRPCPAFFYGVRYNTTNNGYRECLANGSWAARVNYSECQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Membrane protein
source organism Escherichia coli
publication title Molecular Recognition of Corticotropin-releasing Factor by Its G-protein-coupled Receptor CRFR1.
pubmed doi rcsb
molecule keywords FUSION PROTEIN OF CRFR1 EXTRACELLULAR DOMAIN AND MBP
total genus 123
structure length 452
sequence length 452
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-09-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
A PF02793 HRM Hormone receptor domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ehtA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ehtA01
4.10.1240.10 Few Secondary Structures Irregular Hormone receptor fold GPCR, family 2, extracellular hormone receptor domain 3ehtA03
4PETA 1VE4A 3A3UA 1FQDA 3LUYA 4KCCA 3THIA 3K6VA 1ZU0A 2OJTA 3KEIA 1LFHA 3T96B 3O6HA 1MRPA 2Q9TA 3SDFA 1B7ZA 1O64A 4EQ7A 3LSWA 4IO7A 3GZGA 3UA8A 4FEDA 1JETA 3K6XA 4KCDA 4QSEA 1XOCA 1MXXA 4C1UA 3PPNA 3OEMA 3H6VA 3T9UA 4LATA 2DWJA 5DTBA 1FQCA 2D5WA 4LVQA 3N26A 4QFNA 1CE2A 2DE4A 3FVKA 2Z8FA 3MC2A 2R6GE 1TFAA 4RYAA 3C35A 4FAJA 3RLFE 3OSQA 5J1DA 1OVTA 2THIA 2PVUA 2XXUA 4U4XA 1IXGA 4FJPA 2IA4A 4UACA 3QSLA 3CRBA 2QMXA 3RQTA 2F7BA 2XD2A 1B7HA 1FTMA 2PYYA 3LR1A 1B52A 3EHUA 2O1LA 2F8DA 3O29A 2VHAA 1IITA 1US4A 3DLNA 3T93B 2ONKE 2JODA 2H5YA 3D4GA 3EPEA 5H8FA 3K1NA 3PU5A 4GXAA 5I56B 3E13X 2H99A 3CG1A 4EUOA 1AL3A 2OLBA 1AIVA 2ZNUA 3FGSA 1I6QA 3EQ1A 1MS7A 4U1ZA 5H8FB 4F22A 1PB9A 4GFRA 4KD5A 1B4HA 1N7WA 1B40A 3K01A 2I3VA 4LQ2A 4TQUQ 2VD3A 2V3UA 4NF8A 3TCGA 4GIZA 3FATA 3SETA 3ZKLA 3OEKA 4QHQA 4NF4A 1QVSA 2REGA 2QS3A 4DLDA 1MY2A 3S4UA 2OZZA 5JTYA 4NF8B 5TP9B 1MQDA 1LFIA 3PUYE 4ZGMA 2IEEA 1N3WA 4EF2A 1SYIA 4EQ9A 3C32A 1JW5A 4JXIA 2NVUB 4G2ZA 1Q35A 2QL3A 5H8HB 5EYFA 2DE2A 5CI5A 3IB1A 1II5A 4BDMA 4X1DA 4F1VA 1M5FA 2XD3A 5B7DA 1VFDA 3O28A 1H3DA 3N7RA 1OMPA 1IXCA 3IOTA 4YKIA 4NEDA 1UTHB 4QSDA 1ZMGA 3T66A 4H0WA 3BKIB 2F97A 5HPQA 4BDLA 1LAHE 1B2HA 1POTA 3PUVE 4EQBA 4IO4A 3IOVA 2RC7A 3MW0A 4ONYA 4N13A 4IO2A 1YCJA 2DSFA 4YZZA 3GLBA 3V5AA 1JEUA 4ESXA 4Z7EA 4ESWA 3OSRA 3KJTA 4R9GA 2P1SA 5I58A 1U34A 4OESA 4I62A 3RT6B 1MM6A 2NWJA 5K2YA 1XC1A 2OBGA 4F31B 2HFBA 3VXCA 2PBWA 2Y7RA 3N6UA 3TDJA 4GQOA 3O9PA 4FORA 3MUQA 1O63A 1YTVA 3TTLA 2F6GA 2AIXA 2ESNA 4WKMA 2GH9A 1MDQA 4KYDA 1WVJA 1LBBA 4OMBA 4ERSA 4O3CA 5FTIA 3K1MA 4XKQA 3DP4A 2F34A 2NUVA 2HXWA 3KGCA 4PFWA 1NNPA 4AB5A 5I2KA 2XXTA 1S9TA 3PUZE 4BDQA 4DE8A 5HM4B 3FZVA 1AOVA 3H6WA 3T9HB 5L9OA 4FATA 2HZLA 5I57B 4OFJA 2OK2A 4H1XA 5JEIA 2A5TA 4O3BA 3OO8A 1ZBMA 2VP1A 2ZYKA 2Z8EA 3K02A 3RN8A 5CBRA 4C0RA 5CRYA 5II0A 4EF1A 4X1BA 3PUWE 4OETA 3N5LA 1FQEA 1EU8A 3H7MA 1B9JA 4ELQA 4XXUA 5EHSA 2A5TB 4GF8A 4EDPA 3TMGA 4F39A 4U22A 3GBAA 4YMAA 4F3GA 4OHNA 2OCUA 5KCJA 3ZKKA 5CMKA 2YLNA 1PC3A 2VD2A 3HSTA 2I3WA 3H6TA 1B4ZA 1SW1A 1DPEA 1SQYA 1IZ1A 1FTJA 1NL5A 1DTGA 4H67A 1BLFA 2F7CA 1MY0A 3UGWA 2QS4A 1LSTA 2DWAA 3IORA 2I48A 3TTNA 4Q30B 3JV9A 2G29A 1QJMA 3V8XB 1RYOA 1SBPA 3Q28A 3IOUA 2GFEA 2H98A 1B51A 4OENA 4KR5A 3S9LC 2X26A 2QMWA 3EHTA 4F1UA 3VVEA 2HCAA 4FE8A 2PX1A 1LCFA 4U4SA 3USDA 2RKMA 4JBZA 3IB0A 1LAXA 4GL8A 1ZIUA 4X48A 3SESA 2UXAA 4IB2A 3U94A 1MQHA 1ZJLA 1N04A 4UA8A 4HCYA 3LC8A 1SVXB 3FUZA 1MXZA 4QFLA 3HV1A 4IO5A 1NH7A 3QYTA 2YPNA 3PMWA 1VFEA 2L27A 3G7WA 1FTKA 5AA2D 3O6GA 3FJ7A 4R6YA 4H65A 3LBSA 4IGTA 3B6TA 3CSBA 2RINA 4F3PA 1USYH 3HN0A 2UVHA 3EHSA 1Y3PA 1T0KA 1D4NA 1DPPA 3M3KA 3I6VA 4POWA 5AA4B 4IY6A 3I3VA 3E9XA 1P1NA 2XXYA 3C36A 1WODA 3DP8A 1UQWA 5A5XB 1D3KA 4GVOA 4OFOA 2AL4A 3M3FA 3K0VA 3OMBA 3N7PA 2RC8A 1M5DA 2I49A 2FYIA 3T9VA 3MVZA 3TQLA 3FXRA 3U72A 2ONRA 4YKKA 2XXPA 4BDOA 3CFXA 3FJGA 2D21A 3TFLA 1POY1 3RT8A 3Q25A 1JQFA 4R6KA 4BLAA 3TODA 2Q8JA 3HPIA 1MXVA 1B3LA 1SW5A 1P99A 3QUJA 4Q0CA 5TPAA 3B7DA 4R73A 4G68C 2DYXA 1QULA 1N3XA 4ELPA 2ZMBA 1JW4A 3IX1A 1PB8A 2V93A 1Y20A 5TPAB 3M3LA 1B5HA 3K4UA 1UIUA 3Q27A 1BKAA 3B6WA 5DVJA 1SD3A 4LA9A 1N84A 3A09A 1I6AA 4ZZAA 4AQ4A 5AA2B 4OTEA 4RPNA 1ZTYA 1A55A 4ELRA 1Y3NA 4LZ8A 3SEYA 2DXYA 5JK4A 1J1NA 4R72A 2UYEA 1GGGA 2HAVA 5I56A 3N7SA 1ATGA 4DDDA 3RGYA 3TCFA 2QS2A 3N6TA 1BIYA 1Y4CA 4POXA 1NKXA 1EZPA 4GL0A 3S9MC 3H3GA 1P1QA 1H45A 2W7YA 4LQ5A 4YB7A 4R2FA 2HQ0A 2DWIA 4KFQA 5DYHA 4F18A 3MZ9A 4U23A 3L6GA 3VVDA 3IK6B 3RPWA 4LZ5A 2GHAA 1B3GA 4PFTA 3TELA 3A3CA 3CFZA 3TQWA 4YAHX 1OQHA 3K2DA 3TCHA 3CFLA 5TP9A 2R9JA 3KSJA 4MFIA 3IJXB 3BBRA 4HTGA 4QFPA 4ND9A 1SI1A 1UTBB 1Y1MA 3R26A 5FHOA 5H8HA 2F5XA 4RNSA 3U93A 1MPBA 4OYVA 2X7QA 1HSEA 4HCWA 1LLSA 4OERA 1AH5A 3WAEA 1NFTA 1DOTA 3C31A 2D3IA 4G4PA 4KQPA 4NF5B 4RPOA 3ONMA 1UTHA 4NTLA 1Z7ME 1NH8A 2QRYA 2F78A 4QRZA 5KDTB 4BDNA 1IUDA 1LBCA 4ZE9A 1RKMA 4R9FA 3D4CA 2E0SA 4OEVA 1LAFE 1OQGA 4I1DA 2E1SA 3AQFB 3L6HA 4ZECA 2CMOA 3W9WA 3SERA 3TTRA 1IIWA 2V84A 4EXKA 4Q8RA 3JYRA 1EZ9A 1JNFA 1FQFA 4I9DA 3CI8A 4C1TA 4H5GA 3OENA 4F3BA 4ZEDA 4GXSB 3IOWA 1ZKBA 4ZZEA 3OD7A 1B1XA 4Q5TA 4YU0A 1Z7NE 2YJPA 3PGFA 4FECA 2F6PA 1MDP1 2Z22A 3QAXA 4U21A 2UVJA 3GXAA 2Q2AA 2VGQA 4H6DA 3OO6A 1R1NA 4R6HA 3RY3A 4KYSA 4PQJA 4GWOA 5LOMA 3LSFB 2Z23A 2XX9A 1MM7A 2V25A 3HO7A 4KI0E 3OELA 5I57A 1FCKA 4JWXA 3S9EA 3AXFA 4E0WA 4RXLA 1JEVA 3CG3A 2QSXA 2QPQA 2UYFA 3PUXE 2REJA 2HEUA 2ZNSA 1B0HA 1MG1A 5H8QB 3T9XB 3F11A 5ISUA 4KHZE 3U92A 1B7UA 3KN7A 4R75A 2QS1A 2A5SA 4XKRA 4P0GA 2NOOA 2Y7PA 4AB6A 4DXCA 4JSDA 5I84A 4TLLB 4QFOA 4DXUA 4XIGQ 4JWOA 2HAUA 3MVXA 1A40A 2RCAA 5I59B 5CM6A 3KOSA 1QW0A 3RNNA 3QIMA 3SKPA 1A7LA 4TOZA 1EH3A 1XS5A 1TFDA 3L2JA 3SEXA 3MBPA 1I69A 2Y84A 3H06B 1HSJA 4XKNA 1Y4TA 4OVJA 4N07A 5DEXB 4KPTA 4DCXA 4N6PA 1FTLA 4RJZA 3IJOB 4U1OA 1P1WA 1NMUA 1B5IA 1D9YA 5FHMA 3WAFA 1IEJA 2DVZA 1OVBA 3H4ZA 3O66A 1QUJA 2Y7IA 4G77A 3PD9A 2V3TA 4HW8A 5AA3A 3TEPA 4NWCA 4EXLA 2H9BA 1PEBA 1S7YA 1QUKA 4ZEKA 2XX7A 1B05A 2ZNTA 5TU0A 4DZ1A 1MPCA 3PV0E 4F2QA 3N94A 4WXJA 3FIRA 3UIFA 3ILUB 2Z8DA 2O68A 1SW2A 4NF6B 1L5TA 1YPNA 3CIJA 1PDAA 2O84X 3OO7A 3PPRA 3TTMA 2DE3A 4GOTA 4JB7A 3U1OA 5BUUA 4YMBA 3RUMA 1FTOA 3TKDA 3HCQA 4JDFA 3PD8A 5K2XA 3BFTA 4YKPA 3VV5A 3CR9A 2B65A 4LUBA 3PPPA 2XXQA 3UORA 3C4MA 3SEWA 2P2AA 2QJEA 3MVWA 3HHGA 5AA4A 2R71A 3MVYA 3UN6A 2WKYA 5CMCA 3DP6A 1N7XA 5A5XA 1M5BA 3OOAA 1O7TA 3MZ1A 1WDNA 3JZJA 1M5CA 3O6IA 4YB6A 2H25A 3OO9A 1ELJA 4K3FA 1MXYA 1R9QA 1LB8A 1LCTA 5F1QA 4FEBA 3FD3A 1MQGA 3B6QA 5L9MA 2Q2CA 4P0IA 4ELOA 2XXWA 4PE5B 3HHFA 4MLVA 3RTFB 4OZ9A 3H03A 3DELB 1MY4A 3H6UA 5HBCA 3FASA 2ALUA 4PP0A 3K1PA 5ICTA 2DOJA 4ZE8A 3E4RA 4I8CA 4F1YA 3QUFA 1QKAA 1XVXA 2I58A 5L8DA 3ZS6A 1SI0A 3UK4A 1MQIA 1OIBA 4ZS9A 4GLIA 1NNFA 4LONB 1BTJA 4WEDA 4JSOA 4THIA 4P11A 3KN8A 3DM0A 3LSLA 2O7IA 3C5TA 1XVYA 3ILTB 1MXUA 5AA2A 1IXIA 2I4BA 4KYEA 1B0LA 3G3GA 1IQ7A 2DXRA 2ZYOA 3KZGA 4X9TA 5B70A 3IL1B 5DVIA 3FJMA 3PPOA 5AA1A 4F29A 3C34A 1PB7A 2ONSA 3VLUA 1B3EA 3K6UA 3VE1B 1Y9UA 1JW1A 3MPLA 3TPAA 4XTCQ 5IAIA 1OLAA 3TYHA 1NNKA 5F7VA 1VSOA 2AL5A 4Z0IA 3W15C 1PBPA 3VDFA 3V89B 1TXFA 4NE4A 4G68A 1SDXA 1URGA 1H76A 4M1VA 4YB5A 1MY1A 4QF9A 3K6WA 1DSNA 2XXVA 2RC9A 4WEPA 4G68B 2FA7A 1B1HA 3TTKA 1AMFA 4OFLA 4ZEBA 2CZLA 4G8NA 3E3KA 4MH5A 1FQBA 4RY1A 2VOZA 1UTBA 2F36A 5ITOA 3MP6A 5DVFA 2I4CA 4E0XA 3FXQA 1Y1ZA 5H8NA 1OLCA 3FV2A 3IB2A 1P1OA 3P7IA 1XT8A 1ANFA 2BJJX 2O69A 1GV8A 3KFMA 1SW4A 4L17A 1LFGA 4NF5A 3MAMA 5H8NB 5DT6A 3PPQA 4LF3C 1USYE 4H8IA 4O3AA 3UP9A 3EN3A 1D9VA 5KDTA 3MP1A 2O7UA 2H4IA 2O1MA 4IY5A 1KWHA 3FV1A 3VXBA 1TWYA 4HS7A 4NF4B 3G3JA 1N76A 3MJNA 2M8CA 4H8JA 3MWBA 5JTYB 3IO6A 4YICA 2XHDA 3KOTA 5ITPA 1FQAA 3CVGA 3M8UA 3SEUA 4RK9A 5AE4A 3EF7A 1A8EA 2DVCA 1MPDA 3C9HA 5CMMA 3TUSA 3KN3A 1ZLQA 4MF3A 4LP2B 3VVFA 1EZOA 2GRVA 1M5EA 1B46A 4FIMA 4U2RA 1B32A 3G3FA 1R9LA 1P1UA 3C33A 2XDGA 1UIVA 4JWYA 2UVIA 4M4GA 4YKJA 1GR2A 4QFKA 3FVGA 4MBPA 2JNCA 3MZBA 2AYSA 2XXRA 4F3SA 3G3KA 3KJ7A 3G3IA 5I58B 2QKHA 3MP8A 2XXHA 2DP8A 4RK2A 1BP5A 1VR5A 2ZYMA 1FW0A 1NNTA 1MH4A 4IGRA 5FTHA 1YAEA 4MLQA 5CMBA 1B58A 2PT1A 2F7AA 5H8QA 4HJ0A 3S2VA 3VLWA 1B3FA 1F9BA 4RA1A 5H8SA 2I6EA 1JVYA 1JVXA 2Y7WA 1I6BA 3T22A 1A54A 5BWJA 1LB9A 5I59A 3PMXA 5I2KB 1LAGE 3LSXA 1QUIA 1URSA 1CB6A 4DCYA 2I0CA 5M2VA 1IXHA 3C59A 3R7XA 5DEXA 2FNCA 5ICQA 1B5JA 4ECFA 2B3FA 3VLVA 2ABHA 4QSCA 3CSGA 2O6AA 5CC2A 2ZYNA 3VFJA 4R2BA 2KLFA 3RTWB 3I5OA 5I2NA 2OWSA 1SYHA 1MH3A 4IO3A 1MY3A 1GVCA 5I2NB 3IR1A 3KBRA 1S50A 1DMBA 4G8HA 4TLMB 3G3HA 1Y3QA 3Q29A 2Q88A 5KCJB 2G93A 3O2AA 2XX8A 1LGBC 4OEUA 2V3QA 2Q89A 4NF6A 1GTKA 2OWTA 4XKPA 5ELVA 3SEVA 2PMSA 1PBQA 5L9SA 4H5FA 4ZDMA 3U8QA 2RF1A 3ODBA 3QK6A 2ANJA 4PFUA 3S9NC 3TAJA 3IAZA 1URDA 3MQ9A 2HZKA 1Q1KA 1N0TA 2O51A 3ECRA 3Q26A 2XXIA 1H43A 3R6UA 3K00A 3PMVA 3ZSFA 1A8FA 1MXWA 3IO4A 2X7PA 2DWHA 3FVNA 3IOLA 1TT1A 1QKBA 1HSLA 1H44A 2DQVA 1US5A 4OXVA 4F19A 3MPKA 2DS9A 3O97A 1B3HA 3V83A 1RYXA 5EHMA 4GD5A 1B6HA 4ZEIA 4PFYA 2GHBA 4OWDA 1XHYA 2F35A 5IKBA 3TZAA 1A99A 1MQJA 3KSXA 4DLOA 2Y7KA 4DXBA 4LZ7A 5KZTA 1DTZA 2ZXTA 3GBBA 3QXMA 2UVGA 4ISUA 2NXOA 3KG2A 2RCBA 3FXUA 4F2OA 1R6ZA 4NWDA 5CBSA 2PT2A 4BDRA 5FHNA 4ZEFA 2B3BA 4GRKA 3OXNA 2LAOA 4DIGA 2I0BA 4NMYA 2JNDA 4R74A 3W9VA 4DLQA 4IO6A 4OQOA 3BFUA 3FVOA 2P0SA 4G8MA 2XXXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NV1A 4PETA 2Q8MA 1VE4A 2PFYA 3A3UA 1FQDA 3LUYA 4KCCA 3THIA 3K6VA 1ZU0A 1FPEA 2OJTA 3KEIA 1LFHA 2WYKA 3T96B 3O6HA 1MRPA 2Q9TA 3SDFA 4OVQA 1B7ZA 1O64A 4EQ7A 1FRPA 3LSWA 4IO7A 3GZGA 3UA8A 4FEDA 1JETA 1FBEA 3K6XA 4KCDA 4QSEA 1XOCA 1Q9DA 1MXXA 4C1UA 3PPNA 5ET7A 2WYPA 1LBWA 1FBPA 3OEMA 3H6VA 3T9UA 1NV3A 4LATA 2DWJA 5DTBA 5IZ1A 1FQCA 2D5WA 4LVQA 3N26A 4QFNA 1CE2A 2DE4A 3FVKA 1YYZA 2Z8FA 3MC2A 2R6GE 1TFAA 4RYAA 3C35A 4FAJA 3RLFE 3OSQA 5J1DA 1OVTA 2THIA 2PVUA 2XXUA 4U4XA 4MX6A 1IXGA 4FJPA 2IA4A 4UACA 3QSLA 3CRBA 2QMXA 5ET8A 3RQTA 2F7BA 2XD2A 1B7HA 4H45A 4N81A 1FTMA 2PYYA 3LR1A 1B52A 3EHUA 2O1LA 1FPBA 2F8DA 3MYUA 3O29A 2XA5A 4HE0A 2VHAA 1IITA 1US4A 3DLNA 3T93B 2ONKE 2JODA 1NUXA 2H5YA 3D4GA 3EPEA 5H8FA 3K1NA 3PU5A 4GXAA 4PDDA 5I56B 3E13X 2H99A 3CG1A 4EUOA 1AL3A 2OLBA 1AIVA 2ZNUA 3FGSA 5IZ3B 1I6QA 3EQ1A 1MS7A 4U1ZA 5H8FB 4OVPA 4F22A 4P56A 1NI9A 1PB9A 4GFRA 4KD5A 1B4HA 1N7WA 1B40A 3K01A 2I3VA 4LQ2A 4TQUQ 2VD3A 2V3UA 4NF8A 3TCGA 4GIZA 3FATA 3SETA 3ZKLA 3OEKA 4QHQA 4NF4A 1QVSA 2REGA 2QS3A 4DLDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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