3EHTA

Crystal structure of the extracellular domain of human corticotropin releasing factor receptor type 1 (crfr1) in complex with crf
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
452
structure length
452
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPETWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTNAAAEFSLQDQHCESLSLASNISGLQCNASVDLIGTCWPRSPAGQLVVRPCPAFFYGVRYNTTNNGYRECLANGSWAARVNYSECQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Molecular Recognition of Corticotropin-releasing Factor by Its G-protein-coupled Receptor CRFR1.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Escherichia coli
molecule keywords FUSION PROTEIN OF CRFR1 EXTRACELLULAR DOMAIN AND MBP
total genus 123
structure length 452
sequence length 452
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-09-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
A PF02793 HRM Hormone receptor domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ehtA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ehtA01
4.10.1240.10 Few Secondary Structures Irregular Hormone receptor fold GPCR, family 2, extracellular hormone receptor domain 3ehtA03
2G93A 1A55A 5ICTA 3HPIA 4N07A 3EF7A 4KYSA 3TDJA 5I59B 3H6UA 4NF4A 1URDA 1SW1A 2DE2A 4QFOA 3OD7A 4F2QA 2XXXA 3ZSFA 3IJXB 3VDFA 1FCKA 2F6GA 4KD5A 4KFQA 1QJMA 4X1DA 1GVCA 3GLBA 1MH3A 2XXVA 4ONYA 1LBBA 1IZ1A 5BUUA 5I84A 4TQUQ 4IGRA 1QVSA 4U4SA 1SDXA 4YAHX 3LSWA 4LA9A 5I57B 3H6WA 3HCQA 4EF1A 3DP8A 4OTEA 2VD3A 2LAOA 4DIGA 2NWJA 1FQCA 3Q25A 4LZ7A 1B3GA 3L6HA 2VGQA 1LB9A 4PFUA 3Q26A 4GL0A 4DXBA 3ODBA 5AA1A 3CRBA 4RK9A 4HJ0A 2F97A 4ZECA 3DP4A 3PD9A 2RINA 1IIWA 3MPLA 3ILTB 1B0HA 3TTRA 1B5IA 4DDDA 1M5CA 4KQPA 1SQYA 4RK2A 5JK4A 3F11A 5HPQA 2F8DA 1VFEA 1B3LA 4QHQA 3RTFB 3N7RA 3FV2A 1DPPA 4ND9A 1MQIA 3FVNA 3H6VA 4G68B 1USYH 2DQVA 2P0SA 4LUBA 1RYXA 3K2DA 3PMVA 3U93A 1Y1MA 4PFYA 4MH5A 2A5TB 5AA4A 3U94A 1URSA 1P99A 4IO5A 3G3IA 5H8HA 2F6PA 3CVGA 4EDPA 3SEVA 1NKXA 2Z8EA 3S9EA 3KJTA 1B4ZA 2GHAA 3MP6A 5I2NB 1B52A 1Y20A 3N7PA 4LP2B 1P1NA 4YMAA 4YU0A 3EHSA 1MM6A 3VXCA 5ELVA 3PPRA 4QFKA 2DWHA 1VFDA 3N94A 4ESWA 3VVEA 3PV0E 1MY3A 3HHGA 4R9FA 5HM4B 3ILUB 3OEMA 4R72A 1R6ZA 3TEPA 5CMCA 4H65A 1LFIA 3C36A 2HAVA 3HHFA 1F9BA 1Y3NA 2I48A 3TPAA 2F7BA 3CG3A 3H4ZA 3Q29A 1IUDA 1BKAA 4EQBA 4DLQA 5H8FB 1MG1A 2L27A 1NH7A 3O28A 2XXTA 4BDMA 1TFDA 3RT6B 2XXUA 2REJA 3GXAA 5KCJB 3VVFA 4ELRA 1FQEA 4ELQA 4MLVA 2D3IA 3FIRA 3MVZA 3E4RA 4OFJA 1LLSA 1CE2A 2XXPA 3PU5A 3OEKA 4JDFA 4OHNA 3DP6A 2PT1A 4GWOA 1MXXA 3MZBA 5AA2D 2QSXA 4PFWA 5H8NB 2UXAA 1UTBB 3CSGA 3JV9A 3B6QA 1LAFE 4F1VA 2Y84A 2UYFA 4C1TA 4EQ9A 3FXRA 3EPEA 4F18A 4MF3A 3QSLA 4GQOA 4JWYA 3WAEA 3IK6B 3PD8A 3MP8A 4Q8RA 4YB6A 5L8DA 3MC2A 3T93B 2FYIA 4ZZEA 3MAMA 1EZ9A 1ZLQA 2F7CA 2ZYKA 2RCBA 4DXCA 2X7QA 4KPTA 4KCDA 3CR9A 3PPNA 2I58A 4LATA 5ITPA 1RKMA 3T22A 1MY4A 4G8HA 5I2KB 3T9UA 3FUZA 3RNNA 2DWIA 3FJMA 2V93A 4QRZA 1P1QA 3FZVA 2QS3A 4I9DA 2NUVA 3FXUA 4GD5A 5ITOA 1FTOA 3K01A 2Z22A 3K6UA 3QK6A 3IOLA 4ELOA 1DTGA 3TCHA 4HW8A 4OENA 2XX9A 4I62A 3TCGA 1MPDA 1D9YA 1DOTA 3I3VA 2I49A 2PVUA 1GTKA 4Z7EA 3D4GA 4UACA 2XXRA 5AA3A 3IX1A 1N3XA 1M5EA 2VD2A 3KEIA 4EQ7A 2O1MA 4X1BA 1EZOA 2OLBA 4U1OA 3FVOA 4G77A 1FTLA 4YMBA 3O6GA 3FGSA 2O69A 1EU8A 4RXLA 1MH4A 1XC1A 4Q5TA 1B6HA 1HSJA 3CFXA 3E3KA 4F3BA 4GF8A 3UGWA 2B3BA 1A8EA 4K3FA 1MQGA 4XTCQ 2UVIA 3MP1A 3CG1A 3RTWB 1PB9A 3IR1A 1B05A 1M5FA 4NF6A 1EZPA 3IOUA 1B0LA 2ESNA 1N84A 2B65A 5JEIA 1IXCA 2DWAA 4GLIA 4R74A 1UIVA 2Q2AA 4Q0CA 1LSTA 3H03A 4NF5B 4RPNA 2Q8JA 2QJEA 1H44A 1B4HA 3UIFA 3O2AA 5FHMA 3RUMA 4JSOA 4KCCA 5A5XA 1SYHA 2CMOA 1DPEA 1OQGA 3KN3A 4X9TA 4HCYA 3MJNA 3TKDA 3A09A 5B7DA 3PPOA 1RYOA 1YAEA 5DEXA 3OO9A 2UVJA 5CMBA 4X48A 4WKMA 4IB2A 2E1SA 4MBPA 4ZEFA 3VVDA 4HTGA 1TXFA 4NF8B 4WXJA 4F39A 5ISUA 5FHOA 2OBGA 4LF3C 4GVOA 4ZEDA 1M5BA 2HXWA 1ZMGA 2PBWA 2Y7RA 2O7UA 4YKKA 3IB0A 5CMMA 5IKBA 4POXA 2RC9A 1MXYA 3RPWA 1B1HA 1P1WA 3L6GA 1H76A 2W7YA 3FASA 4OMBA 2R71A 2QKHA 1FQFA 3IB2A 3SETA 1L5TA 1MXVA 1ZU0A 1P1UA 4HS7A 4I1DA 5I56B 3RQTA 4GL8A 4TOZA 2QMXA 2OCUA 4HCWA 1SW4A 1B7ZA 2O51A 2AYSA 2PYYA 3U1OA 3EHUA 4R2BA 3TQWA 3S4UA 1JVXA 1H45A 2AIXA 3KOSA 3ECRA 4P0GA 2Z8DA 3TFLA 3PUVE 3MUQA 4JWXA 4PP0A 1AIVA 2V84A 4BDQA 5I58A 3V83A 5II0A 4YKJA 2AL4A 2A5SA 1XS5A 3K6VA 3KN8A 4O3AA 3OMBA 2HZLA 1B58A 1TT1A 4GRKA 4P0IA 3O97A 2H25A 3K6XA 1B9JA 4F3GA 2P1SA 2YPNA 1SI1A 4ZGMA 3ZKLA 1GV8A 2O6AA 4XKPA 3CSBA 4QSEA 2H99A 3IB1A 1IEJA 2ZNTA 4UA8A 3H6TA 2D5WA 2VOZA 3R7XA 3W15C 3GBBA 2DXRA 1TFAA 4IO3A 2Y7PA 1S7YA 3H7MA 4R6YA 1A7LA 1UTHA 5TP9B 5L9OA 4IO7A 5AA2B 2VP1A 1AL3A 3M8UA 5L9MA 1QKBA 1MXWA 2O84X 5JTYA 1II5A 1JEVA 1OMPA 3IORA 1ZTYA 4G8NA 4H1XA 1PB7A 1Q1KA 2PT2A 4NEDA 3ZKKA 2DXYA 3G3KA 4ZEBA 2ZMBA 1VE4A 4NF6B 3A3CA 1LCTA 2PMSA 1BLFA 5L9SA 4H8JA 3USDA 3MQ9A 1B3FA 2QPQA 1SYIA 1MPBA 1I6AA 4R6KA 2Y7WA 4IY6A 3VLUA 2HFBA 3K02A 1OLCA 4IGTA 1VR5A 3IOVA 3W9WA 5CBRA 3IL1B 1A54A 2I4CA 1B3HA 3LSLA 3KOTA 1NFTA 3VLVA 3PUZE 3LSFB 2I6EA 3OSRA 1O63A 4XXUA 3TTKA 5M2VA 1N0TA 5TPAA 3LUYA 5DVIA 3SESA 2UVGA 3HO7A 1ZIUA 3KBRA 1MY1A 1QW0A 1JW1A 2HAUA 4AB5A 2Z8FA 1XT8A 4G8MA 2F36A 4LZ5A 3C34A 3TELA 3SEWA 1FTJA 2JODA 3EN3A 3UP9A 1OQHA 4QFNA 3LBSA 1US5A 3T9HB 4L17A 4F3SA 4OESA 1O7TA 1SBPA 1ZJLA 2UVHA 1MRPA 1GGGA 3CIJA 4TLMB 3M3KA 3T9VA 3PPPA 4NF4B 3SEUA 2M8CA 4DCXA 2DP8A 2R9JA 1FTKA 3FV1A 4U4XA 1D3KA 5DT6A 4PQJA 2AL5A 3TTLA 2XXQA 2XD2A 3O9PA 5CBSA 3I5OA 1R9QA 5I59A 2HQ0A 2ANJA 3TODA 4H0WA 3OO7A 4U21A 1BP5A 4H67A 1MDP1 3UORA 1AMFA 1HSEA 3OXNA 1ANFA 1SW5A 1URGA 2RF1A 4NE4A 3FJGA 4FAJA 2XXIA 3UK4A 3KSXA 4F3PA 3W9VA 3QUFA 2ALUA 1DTZA 3FXQA 3N7SA 3PPQA 3V8XB 4DE8A 4PFTA 4BDOA 1M5DA 4KI0E 4WEPA 5DVJA 2XXHA 2ONRA 4FIMA 1T0KA 2ZNUA 1LCFA 2Y7KA 1LFHA 3TTNA 1B32A 3C9HA 3A3UA 3IJOB 4JSDA 2ONKE 1NNKA 2QL3A 4BDNA 5CMKA 2JNDA 2F7AA 3D4CA 4QSDA 4OWDA 3UA8A 1S50A 1YCJA 4POWA 2HZKA 3H06B 3VFJA 5K2YA 4R2FA 2KLFA 2ZNSA 5IAIA 1B5JA 3N6TA 1PBPA 1FQBA 2PX1A 3KJ7A 1QUKA 2O7IA 3L2JA 5AA4B 4OFOA 1Y3QA 4O3CA 3Q27A 3SDFA 5H8HB 3BFUA 3M3LA 2REGA 3HSTA 2IA4A 2V25A 3CFZA 1ELJA 4YKIA 4OEVA 2YLNA 1QULA 3N6UA 2GHBA 1U34A 3VE1B 3LR1A 1UIUA 1CB6A 3C31A 5DTBA 4H5GA 1Y1ZA 1PEBA 3OOAA 4YB5A 2BJJX 3AQFB 3Q28A 2CZLA 4YZZA 3TAJA 3O6HA 2Q2CA 4RJZA 5I2NA 1LFGA 1OVBA 4F1YA 4KYDA 4PE5B 4YB7A 2F5XA 3FATA 4ERSA 1FTMA 1JETA 4OEUA 4WEDA 1B1XA 1N7XA 4KHZE 3N26A 1IXGA 1MQHA 1US4A 3U8QA 3C4MA 3VLWA 3G3JA 2RC8A 3UN6A 1VSOA 4ZEKA 1WVJA 1MM7A 4H6DA 3TCFA 1NH8A 4Z0IA 5H8QA 1SI0A 5F1QA 2QS4A 4EXLA 4R75A 1SD3A 2ABHA 2Q9TA 4GFRA 4F1UA 3P7IA 4ZE9A 1KWHA 5H8FA 3BBRA 4MFIA 5FTIA 4U22A 3FJ7A 1OVTA 3I6VA 3N5LA 4KYEA 3K0VA 5KCJA 4M1VA 3RY3A 5FTHA 1B2HA 4DLDA 1I6BA 4GOTA 1POY1 4GIZA 4R6HA 3TTMA 1UQWA 3IO6A 1FQAA 1I6QA 1A8FA 4FATA 4RY1A 1QUJA 1AOVA 3EQ1A 4ZDMA 4JWOA 4KR5A 5DYHA 3U92A 3T66A 5H8NA 4H5FA 4IO6A 5TU0A 1JQFA 1UTBA 3TMGA 3K1MA 1A40A 5HBCA 1DMBA 4U1ZA 4H8IA 2IEEA 1IQ7A 3K6WA 3OELA 1MQJA 2GH9A 3KZGA 2RKMA 4F31B 2ZYOA 1P1OA 4P11A 4QFPA 1LBCA 3RLFE 2XX7A 3FVGA 1QUIA 4JB7A 4C0RA 4GXAA 4LZ8A 3FD3A 4MLQA 1XVYA 2ZYMA 3IOWA 1NL5A 1JVYA 2XDGA 3AXFA 1PC3A 3K4UA 3KG2A 5AE4A 2QMWA 5EHMA 2D21A 5I2KA 3C59A 2WKYA 3RN8A 2THIA 3SKPA 1B7UA 3KN7A 4XKQA 1NNFA 2QS2A 3PGFA 4N6PA 5KDTA 3KSJA 3DM0A 1LAGE 3CFLA 1JEUA 4BLAA 1J1NA 3PUYE 2P2AA 1BIYA 1I69A 2H98A 3CI8A 3S2VA 1PDAA 2DE4A 2QS1A 1USYE 3JYRA 1BTJA 4E0WA 3OENA 3VXBA 1DSNA 4FECA 3K1PA 3O29A 1PB8A 4PETA 5CM6A 2ZYNA 1LGBC 3R26A 3THIA 2O1LA 2DYXA 5EYFA 5FHNA 4JBZA 2UYEA 3K1NA 1B40A 2B3FA 4Q30B 3R6UA 4ZEIA 1ZKBA 1Y9UA 1B7HA 3S9LC 2FA7A 4OFLA 3DELB 1NNPA 3PMWA 3C33A 3O66A 4ZS9A 2XD3A 3SEYA 5LOMA 4ISUA 5BWJA 1LB8A 2G29A 5K2XA 1ATGA 3G3HA 4EUOA 2DS9A 4RNSA 3KFMA 4ELPA 3MVYA 2XXWA 4IY5A 3K00A 2QRYA 4F19A 2F34A 1FW0A 4DZ1A 4G4PA 5A5XB 4OYVA 4M4GA 3QXMA 2I4BA 5H8QB 4NF5A 3IOTA 4DCYA 2Z23A 1MY0A 4OZ9A 2NOOA 2X7PA 4FE8A 4DXUA 5DEXB 2OJTA 4N13A 2RCAA 3T9XB 3GZGA 3MZ1A 4THIA 3SEXA 3PMXA 3ZS6A 2I0CA 4ESXA 3MWBA 3O6IA 1IITA 1IXHA 3JZJA 1MQDA 4FEDA 1Y4TA 1WDNA 3MVWA 4ECFA 2XHDA 1MXUA 1IXIA 2VHAA 4AB6A 3S9NC 1POTA 1WODA 4NF8A 1S9TA 3QIMA 2DVZA 1XOCA 3M3FA 1GR2A 2DVCA 2OWSA 3RGYA 2I3VA 4FJPA 4F22A 3HN0A 2Q88A 1FQDA 3PUXE 1N7WA 2V3TA 5EHSA 1B3EA 4OVJA 4LQ5A 3TZAA 3IO4A 1SVXB 5H8SA 1PBQA 4LONB 3SERA 2DSFA 1NNTA 3E13X 2OZZA 5DVFA 4I8CA 3ONMA 3E9XA 4E0XA 3G3GA 1Z7NE 3QUJA 4R73A 4C1UA 4EF2A 3OSQA 5I56A 4OQOA 4YKPA 5CRYA 2XX8A 3LSXA 4O3BA 4OETA 1YTVA 1Q35A 4QFLA 5I58B 5I57A 1YPNA 4XKNA 3BFTA 4QSCA 2FNCA 4XIGQ 1B51A 1MDQA 4TLLB 1LAHE 1N76A 4NTLA 2R6GE 3WAFA 4F2OA 1SW2A 2Q89A 4NMYA 3MBPA 1MS7A 1TWYA 2HCAA 4LVQA 5KDTB 2O68A 1Z7ME 3HV1A 1XVXA 3H3GA 2DOJA 2H5YA 3MW0A 5B70A 5J1DA 1MY2A 3S9MC 3TQLA 1N3WA 4RPOA 3EHTA 2JNCA 3KGCA 2I3WA 3LC8A 4OERA 4EXKA 3V89B 3OO8A 3C32A 4NWCA 1B46A 2H9BA 1UTHB 2DE3A 2XXYA 2ONSA 3QAXA 4R9GA 4G68A 2YJPA 2OK2A 5JTYB 4GXSB 2GFEA 1EH3A 1H3DA 2H4IA 1MPCA 4FORA 4ZZAA 1JNFA 3B7DA 4BDLA 1Y4CA 3C5TA 3MVXA 4RYAA 4IO2A 3B6WA 3MPKA 2A5TA 5CI5A 2HEUA 2X26A 1O64A 2DWJA 1JW5A 2E0SA 5TP9A 5AA2A 3IAZA 4IO4A 4G2ZA 3OO6A 4XKRA 2V3UA 2NXOA 1JW4A 2OWTA 2RC7A 3TYHA 1Y3PA 4F29A 3MZ9A 3TUSA 2NVUB 1D4NA 4QF9A 2Y7IA 2ZXTA 5KZTA 1ZBMA 4U2RA 1LAXA 1R1NA 4NWDA 4ZE8A 4JXIA 3GBAA 3PUWE 1NMUA 4FEBA 5F7VA 3RT8A 5ICQA 4RA1A 3G7WA 3FVKA 3B6TA 1AH5A 1HSLA 5TPAB 3BKIB 1OIBA 1D9VA 5CC2A 2V3QA 2F78A 1A99A 3T96B 2I0BA 1N04A 1QKAA 1R9LA 1MXZA 4OXVA 4DLOA 4U23A 3VV5A 4AQ4A 1XHYA 1H43A 1B5HA 4YICA 1OLAA 3QYTA 4G68C 2F35A 4LQ2A 4BDRA 3C35A 3U72A 2GRVA 3DLNA 3G3FA 3V5AA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2G93A 1A55A 4XFEA 5ICTA 3HPIA 4N07A 3EF7A 4KYSA 1AWBA 3TDJA 5I59B 3H6UA 4NF4A 5IZZA 1URDA 1SW1A 2DE2A 4QFOA 1NI9A 3OD7A 4F2QA 3RPLB 2QVUA 2XXXA 3ZSFA 3IJXB 3VDFA 1FCKA 2F6GA 4KD5A 4KFQA 1QJMA 2HHMA 5ET7A 4X1DA 1GVCA 2FBPA 3GLBA 1MH3A 2XXVA 4ONYA 1LBBA 1IZ1A 5BUUA 5I84A 4TQUQ 4IGRA 1QVSA 4U4SA 4IR8A 4GWZA 1SDXA 4YAHX 3LSWA 4LA9A 1BK4A 5I57B 3H6WA 3HCQA 2CZKA 4EF1A 2XWVA 3DP8A 4OTEA 2VD3A 2LAOA 4DIGA 2NWJA 1FQCA 3D1RA 3Q25A 4LZ7A 1B3GA 3L6HA 2VGQA 1LB9A 4PFUA 3ISPA 3Q26A 4GL0A 4DXBA 3ODBA 5AA1A 3CRBA 1CNQA 4RK9A 4HJ0A 2F97A 4ZECA 3DP4A 2Y5LA 3PD9A 2RINA 1IIWA 1FBHA 3MPLA 4OA4A 3ILTB 1B0HA 3TTRA 1B5IA 4DDDA 1M5CA 4KQPA 1SQYA 4RK2A 5JK4A 2BJIA 3F11A 3KC0A 5HPQA 2F8DA 4P9KA 1VFEA 1B3LA 4QHQA 3RTFB 3N7RA 3FV2A 1DPPA 4ND9A 1MQIA 3FVNA 3H6VA 1FBPA 4G68B 1USYH 2DQVA 2P0SA 4LUBA 1RYXA 4DI3D 3K2DA 3PMVA 3U93A 1Y1MA 3CHGA 4PFYA 4MH5A 2A5TB 5AA4A 3U94A 1URSA 1P99A 1EYKA 4IO5A 3G3IA 5H8HA 2F6PA 4PFIA 3CVGA 1VDWA 4EDPA 3SEVA 1NKXA 2Z8EA 3S9EA 3KJTA 1B4ZA 2GHAA 3MP6A 5I2NB 1B52A 1Y20A 3N7PA 4LP2B 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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