3M8UA

Crystal structure of glutathione-binding protein a (gbpa) from haemophilus parasuis sh0165 in complex with glutathione disulfide (gssg)
Total Genus 158
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
158
sequence length
508
structure length
508
Chain Sequence
DKTFINCVSRSPTGFSPALVMDGISYNASSQQVYNRLVEFKRGSTDIEPALAESWTVSDDGLTYTFNLRKGVKFHSNKEFTPSRDFNADDVVFSFQRQLDPNHPYHNVSKATYPYFKAMKFSTLLKSVEKVDMHTVKITLNRQDATFLASLGMDFISIYSAEYADKMLAAGKPETIDTTPIGTGPFLFAGYQVDQKSRYLAHKEYWKGKADIDRLIFEIVPDATARYAKLQAGACDLIDFPNAADLEKMKTDPKVNLHSQSGLNIAYIAFNTEKAPFDNVKVRQALNYAVDKNAIIDAVYRGAGVAAKNPLPPTIWGYNNEITGYEYSPEKAKQLLKEAGFENGFETDIWVQPVVRASNPNPRRMAELVQSDWEKVGVKSKLVSYEWGDYIKRTKAGELTAGTYGWSGDNGDPDNFLSPLFGSENVGNSNYARFKNPELDALLHKAVGLSDKAERAKIYEQAQVLLKEQAPWINVAHSINFAPTSKRVQDYKQSPFGYTYLYGTKLAD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Glutathione import in Haemophilus influenzae Rd is primed by the periplasmic heme-binding protein HbpA
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heme-binding protein A
molecule tags Transport protein
source organism Haemophilus parasuis
total genus 158
structure length 508
sequence length 508
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-03-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00496 SBP_bac_5 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 5 Middle
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.105.10 Alpha Beta Roll Dipeptide-binding Protein; domain 3 Dipeptide-binding Protein; Domain 3 3m8uA03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3m8uA01
3.90.76.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Dipeptide-binding Protein; domain 1 Dipeptide-binding Protein; Domain 1 3m8uA02
1P1OA 5AA1A 1EZOA 1SW1A 4P0IA 3U8QA 1EZ9A 5HPQA 2HQ0A 1B4ZA 4I8CA 2B4MA 2QS3A 5DVFA 4XKNA 3TTLA 4LVQA 1URDA 4G8HA 4X1BA 2B3BA 2THIA 5I84A 3DRJA 1B1XA 4F2OA 4MLVA 2QS4A 1ZJLA 3IAZA 3O29A 4KCCA 3CSGA 5HM4B 3FASA 1SBPA 4Q30B 1UTHA 4R75A 4UA8A 1JQFA 3OOAA 3RUMA 3M8UA 4OHNA 1LBCA 4MH5A 3FD3A 1NNKA 4IB2A 1ELJA 4U1ZA 1FTMA 4F39A 3EN3A 4YMBA 1SW2A 5I2KA 2Q89A 5L8DA 4KI0E 4OFJA 3O6GA 3MPLA 3RQTA 4IO2A 1LB9A 4DIGA 3SERA 1ZIUA 4PFUA 4Z7EA 3L6GA 2V84A 3K2DA 3RTWB 2D5WA 2I49A 4GWOA 1EZPA 4U21A 4PFYA 3K4UA 2O7IA 1XVYA 4G68A 3USDA 3TCGA 3T96B 3OD7A 4IO5A 3M3LA 3VXCA 2O1LA 4X48A 2ABHA 1Y9UA 3DRGA 5IAIA 3JZJA 4LATA 3K6WA 4OQOA 1B3GA 3SESA 1FTLA 1QVSA 3FV1A 3FTOA 2XXQA 3S9MC 3TCHA 3B7DA 4GLIA 4MFIA 3SETA 1LGBC 3EQ1A 3DRKA 3IB1A 4WKMA 2GFEA 2VGQA 4R6KA 2H99A 4OWDA 4LP2B 1NL5A 5L9OA 5I58B 1NNPA 1N3WA 4NF4B 3IOWA 3MC2A 1URSA 3G3KA 4EXLA 3S9LC 5I57A 2XXVA 3WAFA 2ZMBA 3KFMA 3MUQA 3C34A 3LSXA 3QK6A 1KWHA 2O6AA 1D9YA 1M5EA 1P99A 1N3XA 1FTJA 3K02A 2WKYA 4GD5A 2HEUA 1OVTA 1LBBA 4BLAA 5JEIA 4G77A 4ZZEA 4M4GA 2ZYMA 3LR1A 2M8CA 5F1QA 1B7HA 1M5DA 1JETA 4Q8RA 4MLQA 2XXPA 3G3JA 4HCWA 3TODA 3U92A 4ZE8A 4FAJA 1LAXA 1IXCA 1UIVA 2H9BA 2R71A 3O66A 5HBCA 3IO6A 3UK4A 4EXKA 1Y4CA 4QFOA 1SDXA 3IO4A 4WXJA 3HHFA 1MM7A 2ZYNA 5B7DA 3KSJA 4GF8A 4FE8A 3S4UA 4ZE9A 2F8DA 4R6HA 4IO6A 4ONYA 4KYEA 2DE4A 1BP5A 3RY3A 3C4MA 2OWTA 4O3AA 1DPPA 4H8IA 4ZECA 2PT2A 5IKBA 5DTBA 4NF8A 2NOOA 3O9PA 5ICTA 3CIJA 4QSDA 3PUYE 3DM0A 3KN7A 4EUOA 1A8FA 3N5LA 4QRZA 4WEPA 3A3UA 5H8HA 2O1MA 5K2XA 2I0CA 3B6WA 1P1WA 3V89B 3H03A 4G2ZA 4JSOA 2YJPA 3ZSFA 3TZAA 5M2VA 2IA4A 3GBBA 2NXOA 2PT1A 2AL5A 3D4CA 2HXWA 3QXMA 1OLAA 2AL4A 1N0TA 4BDMA 2CZLA 3TEPA 3TQWA 5CC2A 4XKPA 1ZBMA 2H98A 4JB7A 4DCXA 1MY2A 2ONKE 3MZ1A 3L6HA 4F2QA 2AYSA 4H6DA 2DWIA 1B46A 3C33A 1N84A 4N07A 4F22A 3IOVA 3LBSA 4KR5A 3RT8A 4O3BA 2DYXA 4U4SA 4EQBA 1GTKA 2WOLA 3VXBA 3M3FA 1XVXA 4HS7A 5EYFA 3W9WA 4OVJA 3HO7A 3B6TA 4OZ9A 1VR5A 5KDTB 1B7UA 3SEVA 4Q5TA 4F29A 1H76A 1SW4A 1B6HA 4ELQA 3K1NA 2Z22A 1VSOA 3K01A 1JVYA 3CG3A 2GHAA 1B1HA 1JW4A 4LQ2A 1VE4A 1JEVA 4N6PA 4GQOA 2Z8FA 1AH5A 1JVXA 5CMCA 1NNFA 4YB5A 1BKAA 1MQHA 1XHYA 3O97A 3UORA 2V3TA 1IXIA 2ONRA 2QJEA 4RA1A 3U1OA 3C35A 1FW0A 2HFBA 3VFJA 1B7ZA 2ZNUA 2DWAA 2UYEA 2HCAA 5H8FA 1B5JA 1N7WA 3TELA 4YB6A 3FVNA 4E0XA 1MQGA 3RNNA 4XXUA 5DT6A 3VLVA 1B4HA 2V93A 4IO4A 1GGGA 1H43A 4TQUQ 1OQHA 1GR2A 1GV8A 1FTKA 3A3CA 3HSTA 2Y7WA 3CG1A 3CRBA 3K00A 2XHDA 3CSBA 3PPNA 3G3GA 1QJMA 4QFNA 2R6GE 1AIVA 3KN8A 5FTIA 2O84X 2DOJA 4E0WA 3IL1B 1PB9A 3ZKLA 4F31B 4XTCQ 4R72A 4OYVA 4O3CA 3RYBA 2RCBA 2RINA 1LCFA 4BDLA 4DXBA 4WEDA 1TT1A 1B9JA 1HSLA 2ZNTA 4RY1A 5DEXA 1DSNA 3UGWA 3KG2A 3PPRA 5I2KB 3MAMA 2XX7A 1T0KA 3Q26A 1MS7A 2Y84A 2OK2A 4TOZA 4RXLA 4LZ8A 1ZMGA 1ZKBA 2D21A 1OLCA 1SQYA 4KD5A 1DTZA 2VHAA 4NE4A 2DQVA 1XS5A 3LSLA 5FHOA 1OVBA 4OENA 5EHSA 3T93B 3KBRA 4KHZE 2FNCA 5AA2B 4P0GA 2P0SA 4G68B 4ZS9A 3W9VA 2OJTA 5JTYA 1B05A 3G3HA 1MPCA 1B5HA 2VP1A 4FJPA 1D4NA 1S9TA 5CMBA 1MDP1 5TU0A 1II5A 3CFXA 1MXUA 3OELA 4EQ7A 3JV9A 4R74A 2Z23A 2H4IA 2OZZA 1H3DA 3H6WA 1P1QA 4QSCA 2QRYA 3U94A 1UTBB 4NF5A 1O63A 4Z0IA 4XKQA 4OESA 3VLWA 5I57B 2WOKA 1YTVA 2UVHA 4Q0CA 1URGA 5BUUA 2QS1A 3DLNA 3PMXA 4IO7A 2PBWA 2XXRA 4JWYA 5AA2A 4GL8A 1H45A 2DE3A 4GRKA 4C0RA 3DRHA 2DVZA 5ISUA 3O6HA 2RKMA 3ONMA 3IB0A 1USYH 1O64A 4X9TA 2REGA 3MZBA 1B5IA 3E13X 5TP9A 2X7QA 5LOMA 2F36A 3M3KA 1A55A 1B52A 4F18A 3O6IA 4AQ4A 1PEBA 1B2HA 5K2YA 3KZGA 4LZ5A 3T9UA 2YPNA 3CR9A 1H44A 4PETA 4NF6B 3B6QA 3MP8A 1TWYA 5CM6A 2ONSA 2A5TA 2X26A 1UQWA 1IUDA 4TLMB 2B3FA 5I56B 1UTBA 2Z8DA 2OLBA 3SKPA 3PUVE 4PFTA 1QULA 1WDNA 1B32A 4JDFA 1QW0A 1PDAA 5H8SA 4RPOA 3H6TA 3PV0E 2OBGA 3W15C 1Q1KA 3DP4A 3MQ9A 4JBZA 4KYDA 3OEKA 3RGYA 3OSQA 3CVGA 4R9FA 4C1TA 3FUZA 5FTHA 4F1UA 2I58A 2XD3A 1HSEA 3TDJA 4BDQA 3H7MA 3N6UA 1OIBA 2O68A 4GFRA 4NF8B 4M1VA 1EU8A 4R6YA 3EHUA 2XXIA 1AMFA 4PQJA 2HAVA 4EDPA 1MQDA 3KN3A 1PB7A 4JSDA 1IQ7A 1JW5A 4YICA 5H8HB 3BFTA 4QHQA 3C36A 3QUFA 3FVOA 3ECRA 4NF6A 1B0HA 3IJOB 3ILTB 2QSXA 4AB5A 1FQAA 3OMBA 1MH4A 4LA9A 4GOTA 3PAMA 3H3GA 3RT6B 2PMSA 5J1DA 3TUSA 5I56A 2UVIA 2DE2A 2QMWA 3FGSA 2KLFA 1M5BA 3U93A 2E0SA 1AOVA 1VFDA 1Y3PA 4H65A 1MG1A 1Y3NA 3DP8A 2Y7KA 2F7AA 3TPAA 4IO3A 3AXFA 5AA2D 4RNSA 2XX9A 5AA4A 3CFLA 1B3HA 2R9JA 3U72A 1LB8A 3VLUA 4EQ9A 3EPEA 4N13A 1R6ZA 1TFDA 4G8NA 3LSFB 2RF1A 1N76A 1Z7ME 5FHMA 3FVGA 4OFLA 2DWHA 3IB2A 3RLFE 1BLFA 3IOUA 1IIWA 1RKMA 4GVOA 5TPAB 2XXUA 4GXAA 3QYTA 4YKKA 5AA3A 3HV1A 1SI1A 1FCKA 4KPTA 3OEMA 4IGTA 4LZ7A 2XX8A 3FXUA 1OMPA 4RYAA 3CHGA 4UACA 2E1SA 2XXTA 2DXRA 2Q2AA 3FJGA 3S2VA 2UXAA 1ATGA 3UP9A 1TFAA 3QAXA 1MY0A 2DVCA 2ZXTA 1SYHA 4ZZAA 5ITPA 3FZVA 4NTLA 1MQJA 5H8FB 3C31A 2UYFA 4FORA 3PUXE 1XOCA 3PMWA 2V25A 2DSFA 2XXWA 1Y4TA 2VOZA 2I6EA 3MP1A 4ELOA 2DWJA 1A7LA 2O69A 4AB6A 4NMYA 2F78A 1VFEA 1ZU0A 1Q35A 3IOTA 1MPDA 5TPAA 2O7UA 3VDFA 3LUYA 4I9DA 1P1NA 1I69A 3P7IA 3PMVA 3IX1A 1DOTA 3H06B 3ZKKA 4KQPA 3JYRA 2PYYA 5CMKA 3LVUA 1D9VA 3TTRA 3T9XB 1MDQA 2DS9A 4NWDA 5BWJA 1LCTA 3SEUA 2I3WA 3GZGA 1Z7NE 3O6PA 3DRIA 2F34A 1MY1A 2P2AA 4JWXA 5FHNA 3EHTA 2ZYKA 3E4RA 4P11A 5H8QB 4XIGQ 4ND9A 5DEXB 2H5YA 2A5SA 4POXA 1FQDA 2B4LA 2UVGA 1QUKA 3Q29A 5H8NB 3CI8A 1GVCA 3KOTA 1RYOA 1F9BA 2I3VA 1PB8A 4ELPA 3MW0A 2QS2A 1LAHE 3Q25A 3RN8A 1MXYA 3KSXA 4QF9A 2Y7PA 4QFKA 5L9SA 4K3FA 5I2NA 5KCJB 2OCUA 1B3LA 3S9NC 1NFTA 4EF1A 3K0VA 4PFWA 4U23A 2ZNSA 4KCDA 1I6QA 5DYHA 2BJJX 3ODBA 1LAGE 5JTYB 4XKRA 3QSLA 1JNFA 1J1NA 3HPIA 4NWCA 3I5OA 2F7BA 1Y1ZA 3KEIA 4R9GA 4GL0A 2D3IA 2ESNA 4LQ5A 5H8QA 4R73A 3N6TA 3G3FA 2HZLA 3T9VA 2DP8A 1Y1MA 5H8NA 4YMAA 4F3PA 2Y7RA 2UVJA 4PE5B 2Z8EA 3SDFA 4NF5B 3KJ7A 1WODA 4H5FA 3ZS6A 3OO9A 1R1NA 3MJNA 3TYHA 1I6AA 4DZ1A 3H6UA 3GXAA 2F6GA 1XC1A 4OEUA 1ANFA 5KCJA 3OENA 3TTKA 3FIRA 4ELRA 4H1XA 2B65A 3QIMA 4YKPA 5A5XA 2V3UA 3PD9A 2PVUA 2F97A 5JK4A 1US5A 1BIYA 2G93A 4QSEA 5TP9B 1CE2A 1MRPA 2P1SA 3KGCA 1SW5A 3RTFB 3VVEA 1MPBA 3R6UA 4JXIA 2NWJA 4ZEBA 4IY5A 4NEDA 2A5TB 1LFIA 4FIMA 1EH3A 3IJXB 3TCFA 3FXRA 1D3KA 2RC9A 2LAOA 2NUVA 4H0WA 2QPQA 2V3QA 3K6VA 1MQIA 3HHGA 4ECFA 3UIFA 4MF3A 1MY3A 3I3VA 3VE1B 3THIA 4BDOA 1MXZA 4F1VA 2I48A 3BFUA 3N94A 4RJZA 4OMBA 4RK9A 2XXHA 3KOSA 2Q8JA 3GBAA 3S9EA 2REJA 5L9MA 4PP0A 3TAJA 1MM6A 1POTA 2VD2A 3EF7A 3V5AA 3PPQA 1MXVA 2I4BA 3TMGA 3N26A 2GRVA 3K1PA 3PPOA 5B70A 1S7YA 4KFQA 1YAEA 3TKDA 4FATA 4F1YA 1UIUA 1M5FA 1ZLQA 3DP6A 3PGFA 4DXUA 2FYIA 3CFZA 4DDDA 1A99A 1FQBA 3PPPA 2I4CA 2DXYA 1NNTA 4OERA 4YZZA 2Q9TA 3IK6B 4OETA 1AL3A 3KJTA 2Y7IA 4F3BA 5AA4B 3SEYA 3FJMA 1LAFE 4HTGA 4DLDA 5CMMA 1LSTA 3PUWE 3D4GA 3OO7A 1IEJA 3MVXA 3FVKA 1NH7A 1ZTYA 4GIZA 3EHSA 1QKBA 3IORA 1B40A 1FQEA 1JW1A 4DXCA 5CBRA 2CMOA 3T22A 1WVJA 5F7VA 3IR1A 3OO8A 3OO6A 3BKIB 1SYIA 4ISUA 3K1MA 1I6BA 3TFLA 4BDNA 5I59B 1PBQA 1CB6A 2OWSA 2F7CA 2VD3A 1Y20A 3G3IA 4ESXA 5I58A 3TTNA 3MWBA 1QKAA 4H67A 3O28A 4OXVA 4H8JA 4NF4A 4DE8A 1A40A 1US4A 4FEDA 3MPKA 4THIA 1IXGA 3OSRA 1MXWA 4HCYA 4R2BA 3C9HA 3VV5A 4ESWA 4DCYA 1QUIA 2RC7A 2I0BA 3PU5A 1B58A 4YKIA 3MVWA 4ZEKA 2YLNA 1NH8A 3R7XA 2GH9A 3SEXA 3A09A 1TXFA 4LUBA 4ZEFA 1A54A 3DRFA 4U4XA 4U1OA 5I59A 1SVXB 2Q2CA 4IY6A 2AIXA 4G68C 3PD8A 2QMXA 3RPWA 2HZKA 5EHMA 2QL3A 1PBPA 3WAEA 4IGRA 1YPNA 5ELVA 3V83A 1N7XA 4X1DA 3QUJA 3TQLA 1SI0A 1RYXA 3ILUB 1QUJA 1A8EA 2X7PA 3LC8A 1MY4A 3FV2A 1DMBA 5DVIA 3O2AA 4G4PA 3LSWA 5DVJA 4GXSB 4F3SA 4RPNA 3BBRA 4C1UA 3RYAA 1B3EA 4OEVA 4YB7A 5ICQA 2RCAA 3UN6A 3MZ9A 3I6VA 2RC8A 1DTGA 3T66A 1PC3A 3FXQA 1OQGA 1MH3A 3G7WA 1LLSA 3VVFA 3MP6A 1XT8A 4I1DA 5I2NB 1NKXA 4F19A 1IXHA 4H5GA 2G29A 3UA8A 3SEWA 5KZTA 4MBPA 4KYSA 4POWA 3TTMA 2XXXA 4OFOA 1B3FA 1LFGA 2IEEA 4YKJA 1IITA 3Q27A 2PX1A 4ZEDA 5CBSA 2ANJA 4R2FA 3DELB 3FJ7A 3E9XA 3K6XA 1IZ1A 2ZYOA 5AE4A 2XD2A 1L5TA 1B51A 3R26A 1FQFA 4F3GA 4ZDMA 2GHBA 1HSJA 1FQCA 1P1UA 1LFHA 3V8XB 1MXXA 3VVDA 4I62A 1B0LA 3OXNA 5ITOA 2H25A 3HCQA 5KDTA 4OTEA 1DPEA 3MBPA 1JEUA 4LONB 4YU0A 1NMUA 3H6VA 2WOPA 4ZEIA 3Q28A 4TLLB 1BTJA 3H4ZA 4L17A 4U22A 3GLBA 5A5XB 4U2RA 4QFPA 1POY1 2O51A 4YAHX 1FTOA 3F11A 3K6UA 2Q88A 1R9LA 2HAUA 3E3KA 4FECA 4HW8A 4G8MA 2FA7A 1Y3QA 2F35A 2F6PA 3HN0A 1N04A 2ALUA 5CI5A 1USYE 4BDRA 1M5CA 1SD3A 2XXYA 1R9QA 1O7TA 3C32A 5CRYA 1UTHB 4FEBA 4JWOA 4QFLA 1YCJA 3FATA 3T9HB 1S50A 4EF2A 4RK2A 2W7YA 3MVYA 2NVUB 3MVZA 3PUZE 2F5XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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