3RQTA

1.5 angstrom crystal structure of the complex of ligand binding component of abc-type import system from staphylococcus aureus with nickel and two histidines
Total Genus 166
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
166
sequence length
465
structure length
465
Chain Sequence
GKDLNISLPLKTKSIAPYETDVPVKIGAAESLFKTNDQGKIEKALVKSYHQPNDTTLDIELKDNIKFQNGQKLTAEKVKSSLENSMKKSDLVKYSLPISSITAKGQKLTIKTNSAYPELVSELANPFMAIYDTDAKSDVNQTPVGTGPYQIKDYKQSRKISLSNFKDYWQGKPKLDHITVTYQEDGNNRVRNLESQKDDLITDVPVNKVQDIENNQNLKVSKESGFRTSLLMYNHTNKKMTKSVREALDHIIDRQGIADHIYQGYAKPATSPFNDKIPYIKEPKLTKQNIEQAKMLLAKDGYTKEHPLKIKLITYDGRPELSKIAQVLQSDAKKANIEIDIKSVDDIEGYLKDRSAWDATMYSFGTIPRGDTGYFFNQAYKKDGAINKGDYNNSNVDDLINQLNHTVDVKERHNISNDIIKLSSRDVPNSYIAYNDQIVAANSKVKNYKVTPEGIYLIDYRTTIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title 1.5 Angstrom Crystal Structure of the Complex of Ligand Binding Component of ABC-type Import System from Staphylococcus aureus with Nickel and two Histidines.
rcsb
molecule keywords Putative uncharacterized protein
molecule tags Unknown function
source organism Staphylococcus aureus
total genus 166
structure length 465
sequence length 465
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-04-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00496 SBP_bac_5 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 5 Middle
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.105.10 Alpha Beta Roll Dipeptide-binding Protein; domain 3 Dipeptide-binding Protein; Domain 3 3rqtA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rqtA01
5F7VA 2RC8A 1EZOA 2R9JA 3T93B 3TELA 3PPRA 1N7WA 3KN8A 2I0CA 4H8JA 4DCXA 1US4A 2X7PA 3RN8A 1Y1MA 3RTFB 3LSFB 3DRJA 5B70A 3G3HA 5HPQA 3JYRA 1FTJA 2ZNUA 2O7UA 2DP8A 1NNKA 3VXBA 5DTBA 1MXUA 1NMUA 3T96B 1IXIA 4NTLA 4K3FA 3OEMA 4KI0E 3TTKA 4BDNA 3S9LC 3PPPA 1MXVA 2I3WA 2M8CA 4F1VA 1YPNA 4IO6A 1DTZA 2Y7PA 4YKJA 3H6WA 1OVTA 2RC9A 5ISUA 3KJTA 4ZDMA 5AE4A 1AIVA 3FV2A 3FGSA 2QSXA 2XXUA 3FZVA 3EQ1A 1N0TA 3FD3A 3Q26A 2HAUA 4QFPA 2RKMA 2F34A 2AYSA 1D4NA 5JEIA 1FQFA 5JTYA 2DXRA 4F31B 2QS2A 4XXUA 3KN3A 3UORA 2F8DA 3IB1A 4DDDA 4H65A 2I6EA 3FVKA 3OO9A 1FQDA 1O7TA 3IR1A 4MBPA 4ECFA 3VLVA 2Q2CA 4HCYA 2Z8DA 2ZYMA 2XXTA 3H6TA 4JBZA 4FORA 3ZSFA 3Q29A 1A99A 1URDA 3SKPA 4KYSA 5I2NB 4R2BA 4YKIA 5DVIA 4JSDA 4F18A 3ZKLA 1RKMA 4GF8A 2RCAA 3DP6A 4MLQA 5I59A 4OENA 3PD8A 5I57A 1B7HA 4ZEIA 3CHGA 2B65A 4X9TA 3KEIA 4RXLA 4GOTA 4F3BA 1N76A 3A3UA 3QUJA 1ZLQA 4MH5A 1B0LA 4IO4A 3MZ9A 5FHMA 5I2KB 3JZJA 3IL1B 2HQ0A 2O6AA 4GIZA 3LVUA 4XKQA 4EQBA 2WOKA 3TCGA 1Q35A 4YMBA 4R6YA 1MY4A 1Y20A 3RLFE 4FJPA 3PD9A 1OIBA 1YCJA 3IOVA 3QUFA 3VE1B 4YB5A 1F9BA 1P1UA 2ESNA 1Y9UA 1QKAA 4OFLA 4BDQA 3CRBA 3SEUA 2QPQA 4XKRA 3C4MA 4I8CA 1JEVA 2ONSA 1DOTA 3T9XB 2P0SA 4U2RA 4M1VA 3PUZE 2Q89A 3U72A 3N26A 2ZXTA 1PEBA 1OQGA 4JB7A 2PBWA 4H5GA 3CFXA 3G7WA 1Y4CA 1MQGA 3WAFA 3U8QA 4QFOA 3FVNA 2Q8JA 1FCKA 1LBBA 3EF7A 1VFEA 1BP5A 4WEDA 1BLFA 2VOZA 5AA1A 4BLAA 2X26A 3K1PA 1GTKA 2REJA 1XVYA 3HV1A 3N5LA 3ILUB 1B52A 1LCTA 1QUKA 3K1MA 3MVXA 1SQYA 3PUXE 1EZPA 2FNCA 3TYHA 4U1OA 4RK2A 3G3IA 2PT1A 3DRGA 2HZLA 2XX7A 3S4UA 2CZLA 4ZE9A 2OK2A 4PFWA 3B6TA 3T9HB 3TQLA 4U1ZA 4R72A 1R9QA 3QSLA 2VD3A 2AL5A 1B4ZA 2P2AA 1OVBA 4PQJA 3FATA 5K2YA 4NMYA 4ELOA 3TPAA 2THIA 4ISUA 3EHSA 5I59B 4OERA 2I3VA 4G8MA 3UA8A 1FQCA 1A8EA 5I57B 4LP2B 4OEVA 3UIFA 5H8FA 3KBRA 5FTIA 1UTHB 4RK9A 4F1YA 1SDXA 1FTKA 1WDNA 3MZ1A 2XXQA 4DLDA 1ZIUA 4OVJA 1AMFA 4YKPA 3N6UA 4FEBA 4POWA 3QIMA 2R71A 3M3LA 1YTVA 3DRKA 3LC8A 3M8UA 3EN3A 3PMXA 4JXIA 3IB2A 3IJXB 3RT8A 4OMBA 3C9HA 2Y7KA 1WVJA 3C35A 1D3KA 3F11A 3MJNA 5EYFA 5DVFA 4F2OA 2P1SA 4H67A 1B3HA 2HEUA 3HSTA 1R6ZA 2H25A 4EDPA 2F7CA 4QSDA 4QFKA 2PMSA 5EHMA 1VR5A 2G29A 5ICQA 3GBBA 3ZS6A 1EZ9A 4F2QA 3OXNA 3D4CA 4OFOA 4NF6B 1KWHA 2VP1A 1IEJA 3QAXA 4KD5A 5TPAB 3EHTA 3BKIB 3OSRA 3K6VA 3VDFA 4LQ2A 4Z7EA 3V8XB 4GWOA 4BDRA 1MH3A 3WAEA 1ZBMA 3O6GA 4R6KA 1B5IA 3MC2A 4NF8B 3HO7A 1OQHA 1IZ1A 3CFZA 2AL4A 3MVWA 1M5FA 1SW5A 3VLWA 2B4LA 3RTWB 2NOOA 3KSXA 2OCUA 3K01A 5B7DA 1SYIA 3DLNA 1B58A 1ZJLA 1II5A 1MY1A 3OO6A 5CBRA 4NEDA 1MM6A 4H6DA 5ITOA 4GQOA 5I2NA 4LZ8A 2UVJA 5H8FB 2DWJA 3TTRA 4ZEBA 3V89B 1TWYA 3FJGA 2HAVA 1IXCA 3HCQA 2QS3A 3MAMA 2QMWA 5TU0A 1SI1A 4F3PA 4O3CA 3CI8A 4THIA 1NFTA 4G68B 4YAHX 4NF5A 4QSEA 1B5HA 1A55A 5BUUA 4ELRA 3C36A 4OETA 4YMAA 5I2KA 3MPKA 3RGYA 4XTCQ 4FATA 1B7UA 5ELVA 1ZKBA 1FQAA 4U23A 5DYHA 1LFGA 4JWOA 1URSA 3SEWA 1B4HA 3IOUA 3E13X 4LATA 4NF4A 1M5EA 2DQVA 2DWIA 5KZTA 3TFLA 2B3BA 2Z8EA 1SYHA 1YAEA 3H3GA 4YB6A 4PFYA 2H9BA 3RYBA 3RY3A 4NWDA 3G3GA 1NNFA 4JWXA 4ZECA 2IEEA 4I62A 3C32A 1FQEA 1NKXA 2ANJA 1LAFE 3G3FA 4ZEFA 1B3EA 1LB8A 2KLFA 5L9MA 3H7MA 2NWJA 5I84A 2DVZA 1MS7A 4XIGQ 3FJ7A 3KOTA 1S9TA 1PB7A 3HHGA 2D21A 1N3WA 2NUVA 1LAHE 1D9YA 3MZBA 5AA4A 2UXAA 4EXLA 3I5OA 3KZGA 4KPTA 3Q25A 2E0SA 3EHUA 1QW0A 4C1UA 3HHFA 5L9SA 2DYXA 4POXA 3CSGA 1B7ZA 4QF9A 3I3VA 1CE2A 5I58A 1H43A 4GXAA 1B3LA 3FTOA 5CRYA 1BTJA 5AA2D 4OZ9A 1B40A 5KCJB 3LSWA 1MXWA 2HZKA 1Y4TA 2O51A 4R75A 5L8DA 1A40A 3DP4A 4OFJA 3RUMA 4DXCA 1S50A 3VVDA 2I4CA 1JVYA 1SW4A 1M5CA 4KR5A 5CBSA 1UTHA 3C34A 1LCFA 4OQOA 3DM0A 3PMVA 4NF5B 1LGBC 3S9NC 4JDFA 2XX8A 4MLVA 2Z22A 3R7XA 4GLIA 1Q1KA 2V84A 4JSOA 5H8SA 3MVZA 4KYEA 3K2DA 4ND9A 3T9VA 4KCCA 1EH3A 2QRYA 1SI0A 3O9PA 2YPNA 2DE4A 1N3XA 4NF4B 4I9DA 3TTLA 4X48A 3TTMA 1TFDA 3DP8A 1Y3NA 2DOJA 2XXHA 4P0GA 4YKKA 2Y7WA 3KJ7A 3BFUA 1USYH 2CMOA 1IQ7A 1O63A 1QULA 4DIGA 4R9FA 3OO8A 1QKBA 1MQJA 2QJEA 1EU8A 2H98A 4MFIA 1I6QA 3SEYA 3O6PA 1XHYA 1R9LA 2VHAA 3CSBA 4L17A 4TQUQ 1IXGA 1RYXA 1B1HA 1RYOA 2E1SA 1Y3PA 3IK6B 1XC1A 2F78A 4QRZA 4NF6A 4PE5B 3ODBA 2DWAA 1H3DA 2Z23A 5FHOA 5TPAA 1SD3A 4IGTA 3MW0A 3GXAA 3S2VA 5AA4B 2O68A 1HSLA 4BDLA 2YJPA 2GRVA 4NF8A 3O2AA 4GD5A 3FVGA 4M4GA 1B3FA 3THIA 2V25A 3RT6B 5I58B 4ZEKA 1B3GA 2UVIA 4IO3A 3EPEA 1ATGA 3E3KA 5K2XA 2DXYA 3RYAA 4O3BA 4DCYA 3ILTB 1B6HA 1GGGA 4QFNA 3QXMA 4KQPA 1MG1A 3L6HA 3G3KA 2O7IA 2YLNA 3GBAA 5A5XA 1JW1A 1ELJA 2RF1A 1US5A 4HTGA 3B6WA 1WODA 4QSCA 4F29A 3H06B 4U4SA 1ANFA 4R74A 4UA8A 3B7DA 2DE2A 4OWDA 3UK4A 2RCBA 1SBPA 3T22A 3MPLA 1LBCA 2I58A 3B6QA 3U1OA 3MP6A 2AIXA 1N84A 1GVCA 2Q2AA 4G68A 5CC2A 1LFIA 2ZYOA 1IXHA 2DS9A 4FEDA 2QL3A 4F1UA 2H5YA 4RYAA 4EQ9A 4PETA 3CVGA 2UVGA 1NH7A 2D5WA 3DRHA 4G8HA 4R6HA 4WKMA 4QHQA 4IY6A 2XXWA 2DE3A 3MBPA 1A54A 3LSXA 3S9MC 2DSFA 3OD7A 3CIJA 3OOAA 1PBQA 1MPDA 1NNTA 2VD2A 3W9VA 3BFTA 3GZGA 4Q0CA 3TTNA 1TFAA 3TUSA 4FE8A 3T9UA 1PDAA 3A09A 3FXRA 2GFEA 2XXYA 3W9WA 2UYEA 3FUZA 2FA7A 2I48A 1MQHA 4AQ4A 5CMKA 1UTBA 4OESA 1TT1A 5TP9A 3C33A 2OLBA 1CB6A 1L5TA 2O69A 3JV9A 3K0VA 2VGQA 2XXXA 2QS1A 2WKYA 1USYE 2RC7A 3O97A 1JW5A 1IITA 4EF1A 3KN7A 1AOVA 3UGWA 1MXYA 3R26A 4H1XA 2UYFA 3K02A 2X7QA 1HSEA 3UN6A 4ELPA 1VFDA 1JEUA 1DPEA 4G2ZA 1MM7A 4KYDA 3SEXA 1NNPA 3CG1A 3CR9A 2NXOA 3SEVA 1B1XA 2RINA 4YZZA 5DVJA 1A7LA 2ABHA 1FQBA 4FAJA 3PGFA 1SW2A 2WOLA 3U93A 3BBRA 5KCJA 4EXKA 2ZYKA 5A5XB 4GFRA 4TOZA 1MH4A 4I1DA 2O1MA 3LSLA 3QYTA 4RA1A 2F6PA 2F97A 2OJTA 1GV8A 1MXXA 5AA2A 3OEKA 3A3CA 4LUBA 3VVFA 4DXUA 5DT6A 3FASA 2Y7IA 4GXSB 4F3GA 2ONRA 2IA4A 4NWCA 3UP9A 4ZZAA 2F35A 3E9XA 4LONB 1B0HA 1LSTA 2GHBA 1PB8A 2ZNSA 2ONKE 5FTHA 1PC3A 1R1NA 2XHDA 1H45A 1VE4A 2B4MA 1P1WA 3K00A 3H4ZA 3M3FA 1QUIA 4N13A 5I56A 4NE4A 4TLMB 3KFMA 5EHSA 5F1QA 4Q8RA 1UIVA 5H8NA 1ZU0A 3C31A 4LZ5A 2A5TB 1LFHA 5BWJA 3ZKKA 4AB6A 4JWYA 4HS7A 3K1NA 1JVXA 3DELB 1JNFA 2FYIA 3FJMA 1H44A 4PP0A 1P99A 1URGA 1I6AA 4Q5TA 1A8FA 1HSJA 2Z8FA 3RQTA 1M5DA 2I4BA 3IAZA 4QFLA 2QS4A 1UTBB 3N6TA 3S9EA 5TP9B 2ZMBA 1GR2A 5ICTA 4G8NA 4OEUA 1I6BA 4XKPA 3SESA 2GHAA 2REGA 4BDOA 1NH8A 4LZ7A 1ZTYA 3H03A 3DRIA 4N6PA 5CMMA 1PBPA 3PUVE 2F7AA 4DE8A 3IX1A 2PT2A 2HCAA 2B3FA 4KHZE 1DTGA 2XD3A 3K6XA 3IO6A 4EQ7A 3T66A 5ITPA 1LB9A 1Z7NE 3LBSA 4U4XA 4OYVA 5AA3A 1I69A 3MP8A 3OELA 3O28A 5AA2B 1QUJA 5H8QB 3TDJA 3V83A 4RY1A 4F3SA 2V3UA 1UIUA 5J1DA 3PAMA 3TQWA 2XXPA 1BKAA 4IO5A 2PVUA 3TODA 2V3QA 3KSJA 2D3IA 1PB9A 2XXIA 3U92A 3FVOA 2HFBA 4C1TA 4P11A 4X1BA 3PPNA 3VFJA 3L6GA 1T0KA 5IKBA 3FXUA 3QK6A 4F39A 2XXVA 1B32A 5DEXA 3MWBA 3ECRA 5I56B 3TEPA 4H8IA 3O6IA 3OO7A 3IOTA 3DRFA 4YU0A 3MP1A 5H8NB 4E0XA 4KFQA 2G93A 4Q30B 5KDTA 3CG3A 3PU5A 4RNSA 1SW1A 4RPOA 2XX9A 4MF3A 5JK4A 4H5FA 4ONYA 4RJZA 1AH5A 3GLBA 4DZ1A 1LAGE 4ZE8A 2QMXA 3N94A 4U22A 3VV5A 3P7IA 3HPIA 3PPQA 3Q27A 4U21A 1FW0A 3TMGA 3FXQA 1XS5A 3W15C 1MDQA 1MXZA 4KCDA 2F5XA 2I49A 5L9OA 3MUQA 1OLCA 1MDP1 5M2VA 3AXFA 5CMCA 3TZAA 4WXJA 4WEPA 2V93A 1MPBA 5JTYB 3ONMA 2OWSA 3SDFA 4LVQA 3K6UA 4N07A 1XT8A 3OENA 2O1LA 4TLLB 3KGCA 2OZZA 5HM4B 2DVCA 3VVEA 4LQ5A 1AL3A 5FHNA 2Y84A 4EUOA 3O29A 3TCHA 3OMBA 4PFUA 1SVXB 4Z0IA 1JETA 1LLSA 4AB5A 1J1NA 1MQDA 4UACA 3USDA 4E0WA 3KG2A 4G4PA 4R73A 1LAXA 1N04A 4OTEA 1Z7ME 5HBCA 3G3JA 3IB0A 2W7YA 4GVOA 2Q9TA 3R6UA 3K4UA 1TXFA 3H6UA 4F19A 4IB2A 4OXVA 4ESXA 3HN0A 4R9GA 4GL8A 4IO7A 5CMBA 2Q88A 3V5AA 4ZZEA 4GRKA 5H8HA 1MY2A 1OLAA 5DEXB 1XVXA 2PX1A 2ZNTA 4G68C 1B05A 4OHNA 1DSNA 2HXWA 4R2FA 3SETA 3IO4A 3RPWA 2H99A 3TAJA 5KDTB 2Y7RA 5LOMA 3IJOB 2OBGA 5CM6A 2OWTA 1O64A 2ZYNA 3IORA 4YB7A 2NVUB 4C0RA 4HCWA 3KOSA 1IIWA 2GH9A 2A5TA 1B2HA 3TCFA 3PUWE 3O6HA 1M5BA 1MY0A 2LAOA 1FTMA 4ESWA 1OMPA 4FECA 2I0BA 1Y3QA 1JQFA 2R6GE 2PYYA 1ZMGA 3PV0E 4IY5A 1D9VA 1NL5A 1B5JA 3PUYE 3VXCA 1QJMA 2DWHA 4O3AA 3TKDA 3E4RA 4DXBA 1P1QA 4IO2A 3VLUA 2F36A 3RNNA 1MRPA 4ZS9A 3PMWA 2ALUA 3PPOA 4FIMA 1DMBA 3LR1A 3MVYA 4P0IA 2WOPA 1VSOA 4HW8A 1POTA 4ELQA 1B9JA 2XXRA 2XD2A 1XOCA 1P1OA 2V3TA 4RPNA 2O84X 4GL0A 2A5SA 4IGRA 3IOWA 1QVSA 1MPCA 4LA9A 3FV1A 3MQ9A 1S7YA 1IUDA 5H8QA 2H4IA 3K6WA 4H0WA 1B51A 3I6VA 4EF2A 1JW4A 3D4GA 3Q28A 3U94A 4XKNA 1UQWA 3OSQA 5CI5A 1BIYA 3H6VA 3M3KA 1H76A 5H8HB 3FIRA 5IAIA 1DPPA 2F7BA 3CFLA 1POY1 1P1NA 4F22A 3O66A 1FTOA 1FTLA 4YICA 4BDMA 4PFTA 1B46A 2UVHA 4G77A 1N7XA 1Y1ZA 4X1DA 3SERA 1MY3A 1MQIA 3LUYA 4ZEDA 2F6GA 2BJJX
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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