3RQTA

1.5 angstrom crystal structure of the complex of ligand binding component of abc-type import system from staphylococcus aureus with nickel and two histidines
Total Genus 166
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
166
sequence length
465
structure length
465
Chain Sequence
GKDLNISLPLKTKSIAPYETDVPVKIGAAESLFKTNDQGKIEKALVKSYHQPNDTTLDIELKDNIKFQNGQKLTAEKVKSSLENSMKKSDLVKYSLPISSITAKGQKLTIKTNSAYPELVSELANPFMAIYDTDAKSDVNQTPVGTGPYQIKDYKQSRKISLSNFKDYWQGKPKLDHITVTYQEDGNNRVRNLESQKDDLITDVPVNKVQDIENNQNLKVSKESGFRTSLLMYNHTNKKMTKSVREALDHIIDRQGIADHIYQGYAKPATSPFNDKIPYIKEPKLTKQNIEQAKMLLAKDGYTKEHPLKIKLITYDGRPELSKIAQVLQSDAKKANIEIDIKSVDDIEGYLKDRSAWDATMYSFGTIPRGDTGYFFNQAYKKDGAINKGDYNNSNVDDLINQLNHTVDVKERHNISNDIIKLSSRDVPNSYIAYNDQIVAANSKVKNYKVTPEGIYLIDYRTTIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title 1.5 Angstrom Crystal Structure of the Complex of Ligand Binding Component of ABC-type Import System from Staphylococcus aureus with Nickel and two Histidines.
rcsb
molecule tags Unknown function
source organism Staphylococcus aureus
molecule keywords Putative uncharacterized protein
total genus 166
structure length 465
sequence length 465
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-04-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00496 SBP_bac_5 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 5 Middle
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.105.10 Alpha Beta Roll Dipeptide-binding Protein; domain 3 Dipeptide-binding Protein; Domain 3 3rqtA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rqtA01
2FNCA 2OK2A 4IO7A 4DLDA 3CFZA 4R73A 2ONKE 3H6WA 1FQAA 3MAMA 4F19A 2F34A 1FQCA 5A5XA 3O6IA 2RC8A 1IZ1A 3R26A 4NWDA 4PQJA 2BJJX 1QW0A 3FV2A 3E4RA 4NWCA 1LAFE 5TPAB 3MP8A 1N7XA 3MJNA 3VV5A 2G93A 1WDNA 1P1UA 2QRYA 1P1OA 1D4NA 1URSA 2OWSA 4Z7EA 4DCXA 1H76A 1MQHA 2D5WA 4YKIA 2E0SA 1PDAA 1B2HA 2QMWA 4LUBA 4U22A 3PD9A 1NH7A 4L17A 1R1NA 2O69A 5CBRA 4KR5A 3Q25A 2NWJA 4DE8A 4O3BA 1PBQA 3WAEA 4OWDA 3HO7A 4RK9A 3KOSA 2F5XA 3O2AA 1OLCA 3E9XA 2ZYMA 3IK6B 2Q8JA 5HBCA 1P1NA 1YPNA 4QFKA 4OENA 4WKMA 1B3HA 1FQDA 1R9LA 4XKQA 3KZGA 1LFHA 4AB6A 3S9EA 4OVJA 5L8DA 4LZ7A 2VD2A 3H7MA 1MQGA 1M5EA 5HM4B 4I62A 3THIA 3K6UA 4JWXA 3EHUA 3N5LA 1MDQA 3RQTA 3ZSFA 4NMYA 1I6QA 3O6PA 4G68B 4QSDA 3ODBA 3IB2A 1JEUA 3QUJA 1I6BA 2O1MA 5I56B 5AE4A 3O9PA 1ANFA 4G8NA 4ELOA 3C33A 1OQHA 4N13A 1JVYA 4PETA 2QS2A 2XXTA 4R9FA 1UTHB 4C1TA 3RGYA 4YICA 1FTJA 3CI8A 1SDXA 2Z8FA 3C31A 3C32A 4ESXA 3TTLA 3T9XB 5DVIA 1EZPA 5DTBA 2P2AA 3P7IA 3RT8A 5IAIA 2H98A 3LBSA 3OELA 1YAEA 2XXIA 4K3FA 5ICQA 3HSTA 3DRJA 3BFTA 1B1HA 1MQIA 2PT1A 1XT8A 1DTGA 1H43A 3C9HA 1RKMA 1Y4TA 1FCKA 3FJ7A 2O7IA 1NFTA 3LSFB 2XD2A 4ZE8A 3IR1A 2ABHA 3D4GA 3OO9A 2XXPA 2PBWA 3MUQA 3WAFA 1LAGE 4LZ8A 3IB1A 1MM7A 3Q29A 3E13X 3HCQA 4YB5A 3AXFA 3FV1A 3TMGA 3UP9A 1TFAA 5H8FB 2H25A 1N84A 1OVTA 2P1SA 3SDFA 3U92A 5AA4B 4ELQA 4RJZA 2FYIA 1LSTA 5I2NA 3N26A 1KWHA 1QJMA 4KYEA 4KHZE 1CB6A 4QFNA 1PB7A 4IY5A 2F7BA 3LUYA 4U23A 2Y7KA 2DE2A 3K01A 3IX1A 2B3BA 3K1MA 4O3CA 3U8QA 2ZXTA 1VR5A 4OQOA 4QFPA 2IEEA 3A3CA 1A8FA 2V25A 2RCAA 4F1UA 4EF2A 1N04A 3TFLA 3PU5A 3T22A 4OFLA 1B9JA 5H8HB 3QSLA 3V8XB 3VFJA 1LBBA 4H65A 2Z8DA 2A5SA 5EYFA 4POWA 4OMBA 3MQ9A 4F2OA 3QIMA 3O97A 1IITA 4BLAA 3VVDA 1VSOA 5K2XA 4I8CA 3TELA 1SW5A 2F8DA 2VP1A 1JW1A 2AL5A 5JTYB 5AA1A 3VLWA 4YMBA 1A7LA 1XC1A 3T96B 4P0GA 3HHFA 4OEUA 4ZDMA 1F9BA 1DTZA 5L9MA 2NVUB 4HW8A 2DE3A 4IGTA 4OETA 3PPRA 3QYTA 1SW1A 3EN3A 1AOVA 1P99A 3MVWA 2O84X 1BIYA 2ZYOA 4EDPA 1TFDA 1IIWA 4WXJA 4H8IA 2B65A 4DXBA 2H4IA 2QPQA 4NF5A 1MXXA 4AQ4A 1ZMGA 4KI0E 2UXAA 3TTKA 2PMSA 1LFIA 3FATA 1PB9A 1MXYA 2XX9A 2PX1A 3K1PA 4FAJA 1MY0A 3SEWA 1Z7ME 2YPNA 1LAXA 3E3KA 5FTIA 1O63A 3FD3A 1ZU0A 4XXUA 2F35A 5AA2A 3O6GA 4E0XA 3TZAA 2ZYNA 5L9SA 2ESNA 3K2DA 3QK6A 3IL1B 4X1DA 1ZJLA 1QUIA 4KYSA 1MQJA 3FJMA 1USYE 1GR2A 2UVIA 4H8JA 1OVBA 1MY1A 3CRBA 3L6GA 2ANJA 3FVNA 4ZEDA 2LAOA 2HXWA 3C34A 4QFLA 4Q5TA 1QUKA 2H99A 2UYFA 3PPOA 4QSEA 3LC8A 1MS7A 3RY3A 4R9GA 2DYXA 3U94A 3CFXA 5TP9B 2F7CA 4F18A 2PVUA 1LB8A 3T93B 3M3LA 5H8QA 3HPIA 4ISUA 2DXYA 1FQBA 2P0SA 3VLUA 3T66A 1EU8A 3K0VA 2ZMBA 3KBRA 3KN3A 4LONB 1MY4A 1S7YA 3K6WA 4EQ9A 4RA1A 3B6WA 1Q35A 5KDTB 3PPNA 2F78A 1SVXB 2WKYA 5KCJB 3PMVA 4GWOA 2RF1A 2WOKA 2UVJA 5DEXA 2GHAA 3KOTA 3DP4A 4JWYA 3KJ7A 1PEBA 5CC2A 4ZECA 4N07A 1MG1A 4OERA 5A5XB 4Q0CA 5TPAA 4E0WA 4X9TA 5KZTA 1Y3PA 1POY1 1PB8A 2F6GA 3RLFE 4XTCQ 3K00A 4ZZAA 3M8UA 2QS3A 4PE5B 2I0BA 4U21A 2GRVA 1CE2A 1OLAA 4DIGA 2I0CA 3OD7A 1UIVA 4RK2A 1A54A 5DVJA 3KEIA 2DSFA 1R6ZA 3KSJA 4I9DA 5BUUA 1FW0A 3TKDA 3W9VA 1N3WA 2HAVA 3OO6A 3KSXA 1XOCA 1OQGA 5FHNA 4H5FA 2I48A 1LBCA 2KLFA 2DS9A 3GXAA 1LGBC 3H4ZA 3OO8A 1AMFA 2DOJA 2F7AA 1USYH 1H45A 1QVSA 2DWJA 4THIA 2XXUA 4U2RA 2GH9A 2ONRA 4C0RA 1AL3A 1B4ZA 4Z0IA 3ZKKA 2CZLA 3KFMA 1N7WA 5B7DA 4OFOA 3K1NA 3CVGA 4BDLA 3KN8A 4LP2B 3RUMA 1SYIA 1ZBMA 2Y7PA 4BDQA 3TCFA 3N94A 1S50A 3U93A 4OHNA 1DPEA 4RNSA 1TWYA 4EQBA 4GXSB 3VE1B 3LVUA 4LVQA 4ELRA 3BBRA 5CI5A 4F31B 3EHTA 4F3BA 3B6TA 4G8HA 4JBZA 1I69A 1MY3A 3FIRA 4OESA 5H8SA 2R71A 1NNPA 1AH5A 1NKXA 2QL3A 3MVYA 3KN7A 4IY6A 5I2KA 1FTMA 4G68A 3VVEA 3HV1A 1MXUA 3IJXB 2OZZA 4R72A 3TEPA 4LQ2A 1LLSA 3IOWA 2QS4A 3B7DA 3CR9A 3O6HA 3EF7A 5I57A 3FVOA 2V3QA 1B3EA 1ZKBA 4G77A 4YKPA 4U4XA 4MF3A 3QUFA 2REGA 2I4BA 4LATA 1MY2A 2Q2CA 4F3SA 3TQWA 2Z22A 1URDA 3RYAA 3DLNA 1UQWA 3RTWB 3SKPA 3FXUA 2Q9TA 2XXRA 3L6HA 4RYAA 3OO7A 1DSNA 4H1XA 1QULA 1IXHA 1JW5A 4H67A 3FGSA 4GIZA 4ZZEA 2O6AA 4FJPA 2Y7IA 1XS5A 5CMKA 3K4UA 3DP6A 3F11A 4AB5A 2THIA 3QXMA 4GF8A 2Z8EA 3MZ1A 1RYOA 2O7UA 4KCDA 2HFBA 3H6VA 3MVXA 3HHGA 4ONYA 5I58A 5AA4A 3VXBA 1JQFA 1B5HA 2Q2AA 4ESWA 4NEDA 3FASA 2O51A 4OTEA 2VGQA 4NF8A 1RYXA 1FTLA 1T0KA 3GZGA 2H9BA 1JEVA 4Q8RA 5I2NB 1VE4A 1B40A 2AIXA 3CG1A 3ILTB 2ZYKA 2Y7WA 3FZVA 2X7PA 4JB7A 4MH5A 3TPAA 3OXNA 4JXIA 4H6DA 1IXCA 4QSCA 5H8NA 4XKPA 2XXXA 4GFRA 2DWIA 3FUZA 1DPPA 5EHMA 3PPQA 3JYRA 3PPPA 2QJEA 3U72A 1Z7NE 2QSXA 1QKBA 4F3GA 2F97A 3PMXA 1LAHE 3IB0A 1B3LA 3VDFA 1P1QA 3S9NC 4RY1A 1JETA 4LQ5A 4R6KA 2WOLA 2B3FA 1UTBA 2A5TA 3U1OA 1M5CA 2F6PA 3RNNA 1SW2A 1SD3A 1ATGA 3QAXA 4U1OA 4ZEIA 3O66A 5FHOA 4YB7A 3K6VA 1A8EA 4NF6A 2I6EA 3LSXA 2DQVA 4MLQA 4I1DA 1MXZA 3LSWA 1LCTA 3K02A 1Y1ZA 3N6TA 3TQLA 1SQYA 2XD3A 4EXKA 1OMPA 3TDJA 2I4CA 4RPNA 3S9LC 2DVZA 3DRIA 1IUDA 1LFGA 1US4A 1D3KA 1MPCA 3VXCA 1L5TA 5I59A 4XIGQ 4H5GA 1B32A 3FTOA 2QS1A 1Q1KA 5ITOA 3UK4A 2PYYA 1MPDA 4P0IA 4BDNA 4NF5B 5LOMA 1NL5A 3V89B 2DE4A 1WODA 3R7XA 4KYDA 1D9VA 3Q28A 4FATA 3G3FA 1PC3A 3OOAA 2DVCA 3RPWA 2F36A 1ZLQA 3O28A 3MW0A 1UIUA 3TTRA 4KFQA 3UIFA 5AA2B 2XXVA 3T9UA 4F1YA 5DVFA 3DRFA 3GBBA 1MH4A 1QUJA 3OEMA 4Q30B 1P1WA 5FHMA 3MBPA 3S4UA 4GL0A 1A55A 1YCJA 2OCUA 1GVCA 2Z23A 1BLFA 4NF4B 3FVGA 5CM6A 2PT2A 4YU0A 2XX8A 1LCFA 3OMBA 3N6UA 4RXLA 3IO4A 4PFUA 3DRHA 4QFOA 4LA9A 4ZEKA 5CRYA 5ISUA 1ELJA 1DMBA 3BFUA 3Q26A 4OYVA 1Y3QA 1B0LA 1EH3A 3C4MA 3SESA 4C1UA 1MRPA 5AA3A 3FXQA 4LZ5A 3PUVE 5EHSA 5I84A 3SERA 2DWAA 4EXLA 3MVZA 2REJA 5H8QB 2UVHA 2O68A 3JV9A 3TUSA 3UORA 5HPQA 4JSOA 2R6GE 4P11A 3Q27A 1PBPA 4GOTA 3PUWE 2NUVA 3D4CA 3C36A 4UA8A 3SEYA 3SEXA 3PUYE 3W9WA 4JDFA 4TLLB 4HTGA 3GBAA 2FA7A 3LSLA 4MLVA 2D3IA 4OZ9A 3KG2A 1POTA 3MZ9A 3GLBA 1EZOA 1O7TA 3MP6A 1MM6A 1SYHA 3H03A 2AYSA 2QMXA 5DEXB 4NTLA 4IO2A 4R75A 2HAUA 2GHBA 4HS7A 3TCHA 1B0HA 4F1VA 3SETA 3IOUA 1B5JA 5CBSA 2DWHA 3TTMA 2AL4A 4IO6A 1SI0A 2I3VA 3TYHA 2OJTA 2OBGA 4YKJA 3CSGA 3IORA 3LR1A 1BP5A 3KJTA 1Y3NA 1B05A 3S2VA 1M5FA 4M4GA 4G8MA 2OLBA 3EQ1A 3HN0A 1MPBA 1Y1MA 1S9TA 1FTOA 1Y4CA 1NNFA 4PP0A 1SW4A 1OIBA 2UYEA 5ELVA 2XHDA 4MFIA 4G2ZA 3UA8A 4PFWA 3G3KA 5AA2D 3DRGA 2I49A 2XXWA 5B70A 2YJPA 2Q89A 1B1XA 3A09A 3CHGA 4R6HA 4ZE9A 1VFEA 1XHYA 1B51A 2NXOA 3PD8A 4ND9A 3OSQA 4OXVA 1B7ZA 1HSLA 3G3JA 3IJOB 4QRZA 4G4PA 1JVXA 4IO4A 5DYHA 2X26A 3PV0E 3TCGA 4ELPA 1B3FA 2VOZA 4G68C 5I56A 4ZEFA 3EPEA 4UACA 5I2KB 4ECFA 2DXRA 2HZKA 1Y20A 2ONSA 4RPOA 1AIVA 2W7YA 2ZNUA 1UTHA 3MPLA 3T9VA 1I6AA 4XKNA 2UVGA 4GQOA 4FORA 5ITPA 1IXGA 5I57B 5IKBA 4MBPA 4QF9A 5ICTA 3IO6A 3RYBA 2RCBA 1XVXA 1YTVA 3PGFA 1II5A 1MXWA 2NOOA 1IXIA 4IO5A 3H6UA 4IO3A 5JK4A 4TOZA 4ZEBA 1GV8A 1B46A 1NH8A 2RKMA 1M5DA 3OENA 1VFDA 3V5AA 3G3GA 4POXA 1Y9UA 1H44A 4U4SA 3IOVA 2B4LA 4GLIA 3V83A 1QKAA 2VD3A 4O3AA 4QHQA 5H8FA 4DDDA 5F1QA 4ZS9A 4WEDA 1N76A 4KD5A 5CMBA 2Y84A 4HCWA 3G3HA 3IOTA 4F39A 3FJGA 2VHAA 1B52A 5I58B 4JWOA 4YAHX 2XX7A 1MXVA 3DRKA 2XXYA 3T9HB 4NF8B 2OWTA 4FIMA 3SEUA 3VVFA 1NMUA 1NNTA 5JEIA 4U1ZA 3B6QA 3I3VA 2ZNSA 2G29A 1B4HA 4EF1A 3KGCA 4H0WA 1N3XA 2HEUA 3RT6B 1B58A 1ZIUA 4FE8A 2DP8A 3TODA 4BDMA 3H06B 3RTFB 3CIJA 1HSEA 3W15C 5H8NB 4R6YA 1WVJA 1B7UA 2I3WA 4DXCA 5F7VA 5J1DA 5H8HA 3TAJA 2HQ0A 2D21A 3PAMA 5DT6A 4JSDA 1URGA 3BKIB 1B7HA 3USDA 2Q88A 2YLNA 1JW4A 4TLMB 3CG3A 1B5IA 2V3UA 1NNKA 4IGRA 3SEVA 1UTBB 2A5TB 3IAZA 2R9JA 3H6TA 3ECRA 1TXFA 3MPKA 3FXRA 1GGGA 5JTYA 3MWBA 1FQFA 4R2FA 2O1LA 3VLVA 4FEBA 5BWJA 1MDP1 2Y7RA 3MP1A 4NF6B 4YZZA 1SI1A 2XXQA 5CMCA 4DXUA 4R74A 1R9QA 4X48A 1TT1A 2V93A 4FEDA 4EQ7A 1LB9A 4YB6A 1FTKA 2RC9A 2WOPA 4GRKA 2E1SA 3ILUB 2RINA 3UN6A 3G3IA 3EHSA 3PUXE 1US5A 4DCYA 4F29A 1DOTA 2M8CA 4X1BA 3R6UA 4NE4A 3OEKA 5FTHA 5I59B 4GL8A 4F2QA 3MZBA 1A99A 3DM0A 2V84A 1A40A 4DZ1A 4BDOA 4R2BA 4TQUQ 1IQ7A 1MQDA 3RN8A 1B6HA 4PFTA 3A3UA 3TTNA 1ZTYA 4GVOA 3DELB 4F22A 5K2YA 5CMMA 3S9MC 2GFEA 1FQEA 4GXAA 3M3KA 3ZKLA 2H5YA 1J1NA 1HSJA 3M3FA 3PUZE 3PMWA 4OFJA 4KCCA 2ZNTA 2ALUA 1XVYA 2HZLA 2X7QA 1IEJA 1SBPA 4F3PA 4FECA 4EUOA 2B4MA 1BTJA 4KPTA 4WEPA 5TU0A 4NF4A 3FVKA 1O64A 3ONMA 2IA4A 1BKAA 1D9YA 2XXHA 4N6PA 3OSRA 1N0TA 1H3DA 3I5OA 5TP9A 3ZS6A 2HCAA 3UGWA 4GD5A 2V3TA 2I58A 3CSBA 3MC2A 4YMAA 2CMOA 1EZ9A 1GTKA 4M1VA 1JNFA 3O29A 1M5BA 4YKKA 3DP8A 3JZJA 3H3GA 1MH3A 4BDRA 3C35A 4OEVA 3CFLA 3G7WA 5L9OA 3I6VA 5KDTA 4HCYA 5M2VA 4XKRA 3K6XA 4PFYA 4IB2A 2RC7A 5KCJA 4KQPA 1B3GA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2FNCA 2OK2A 4IO7A 4DLDA 3CFZA 1SPIA 2ONKE 4R73A 3H6WA 1FQAA 3MAMA 4F19A 2OX3A 2F34A 1FQCA 5A5XA 3O6IA 2RC8A 1IZ1A 3R26A 4NWDA 4PQJA 2BJJX 1QW0A 3FV2A 4I3YA 3E4RA 4NWCA 1LAFE 5TPAB 1IMDA 3MP8A 1N7XA 3MJNA 3VV5A 2G93A 1WDNA 1P1UA 2QRYA 5LDZA 1P1OA 1LBZA 1D4NA 1URSA 1FPBA 2OWSA 4Z7EA 4DCXA 1FBGA 1H76A 4HE0A 1MQHA 2D5WA 4YKIA 2E0SA 1PDAA 1B2HA 2QMWA 4LUBA 4U22A 3PD9A 1K9ZA 1NH7A 4L17A 4PF8A 1R1NA 3KC1A 2O69A 5CBRA 4KR5A 3Q25A 1FPJA 2P3NA 1NUWA 2NWJA 4DE8A 4O3BA 2MKZA 1PBQA 3WAEA 4OWDA 3HO7A 4RK9A 4G61A 3KOSA 2F5XA 3O2AA 1OLCA 3E9XA 2ZYMA 3IK6B 2Q8JA 5HBCA 1P1NA 1YPNA 3ROJA 4HE1A 4QFKA 4OENA 4WKMA 1B3HA 1FQDA 4DI3D 1R9LA 2KR0A 4XKQA 3KZGA 1LFHA 4AB6A 1Q9DA 3S9EA 4OVJA 5L8DA 5IGAA 4LZ7A 2VD2A 3H7MA 4PAIA 1MQGA 1M5EA 5HM4B 4I62A 3THIA 3K6UA 4JWXA 3EHUA 3N5LA 1MDQA 2VPNA 3RQTA 3ZSFA 4NMYA 1I6QA 2BJIA 5J16A 3O6PA 4O8MA 4G68B 4QSDA 1FPEA 3ODBA 3IB2A 1JEUA 3QUJA 1I6BA 2O1MA 5I56B 5AE4A 3O9PA 1ANFA 4G8NA 4PF6A 4ELOA 3C33A 1OQHA 4N13A 4JVCA 1JVYA 4PETA 2QS2A 2XXTA 4R9FA 2WEFA 1UTHB 4C1TA 3RGYA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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