4OEUA

Crystal structure of nikz from campylobacter jejuni in complex with ni(l-his)
Total Genus 160
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
160
sequence length
493
structure length
493
Chain Sequence
IPKDTLIIAVENEIARINPAYSEDHDAVINLVFSGLTRFDENMSLKPDLAKSWDISKDGLVYDIFLRDDVLWHDGVKFSADDVKFSIEAFKNPKNNSSIYVNFEDIKSVEILNPSHVKITLFKPYPAFLDALSIGMLPKHLLENENLNTSSFNQNPIGTGPYKFVKWKKGEYVEFKANEHFYLDKVKTPRLIIKHIFDPSIASAELKNGKIDAALIDVSLLNIFKNDENFGILREKSADYRALMFNLDNEFLKDLKVRQALNYAVDKESIVKNLLHDYAFVANHPLERSWANSKNFKIYKYDPKKAEDLLVSAGFKKNKDGNFEKDGKILEFEIWAMSNDPLRVSLAGILQSEFRKIGVVSKVVAKPAGSFDYSKVDSFLIGWGSPLDPDFHTFRVFESSQDSALNDEGWNFGHYHDKKVDIALQKARNTSNLEERKKYYKDFIDALYENPPFIFLAYLDFALVYNKDLKGIKTRTLGHHGVGFTWNVYEWSK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Promiscuous nickel import in human pathogens: structure, thermodynamics, and evolution of extracytoplasmic nickel-binding proteins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative peptide ABC-transport system periplasmic peptide-bi
molecule tags Transport protein
source organism Campylobacter jejuni
total genus 160
structure length 493
sequence length 493
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-01-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00496 SBP_bac_5 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 5 Middle
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.105.10 Alpha Beta Roll Dipeptide-binding Protein; domain 3 Dipeptide-binding Protein; Domain 3 4oeuA03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4oeuA01
3.90.76.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Dipeptide-binding Protein; domain 1 Dipeptide-binding Protein; Domain 1 4oeuA02
1P1OA 3LC8A 2R6GE 2B65A 5FHMA 3K1PA 4ELRA 2ZNSA 3W9WA 2XXXA 5TP9B 1MQGA 3H03A 3M8UA 2Q2AA 1LAXA 2OLBA 4NMYA 4RXLA 3DRIA 1S9TA 3MVWA 1MDQA 3PD8A 4KCDA 1P99A 1R1NA 4EUOA 4ONYA 4U2RA 4YMBA 3IK6B 1Y3NA 2XXWA 5AA4B 1F9BA 5H8FB 3PPRA 2XXHA 4G8HA 4GOTA 1FQDA 3TTLA 3KN8A 4H8JA 4NF6B 3S4UA 3C4MA 3KBRA 3HN0A 3VDFA 5KDTB 4F29A 4POWA 2F6GA 3IX1A 4NF4B 1XVXA 3RT6B 4H65A 4NE4A 3QK6A 1CE2A 1BIYA 2B3BA 4N6PA 4ELOA 1PBQA 3W15C 4LP2B 1OLCA 3HO7A 2O1LA 1LBBA 1MPCA 2DP8A 3FJGA 1MY1A 1N7XA 4HW8A 2WOKA 2WOPA 3O97A 1IXIA 4PFUA 5I2KB 1JETA 5F7VA 2DWHA 3O2AA 3IAZA 3S9MC 1MPDA 4E0WA 3QUJA 4Q30B 2Z8EA 4F3GA 3ZSFA 5BUUA 1AIVA 3G3HA 1B05A 1MM7A 1URGA 3TAJA 4IO3A 3I6VA 1JW4A 3OO9A 1FTOA 4OZ9A 4ESWA 1MQIA 2VHAA 2P2AA 3C31A 3BBRA 3FXUA 1MXUA 3VVFA 2H5YA 1MQJA 1ZJLA 2D3IA 5A5XB 2ZNTA 3MPLA 5B7DA 1SW4A 4DCXA 4ZE8A 1LLSA 1USYE 3H6WA 3TELA 1AOVA 2E0SA 4G8NA 2QS2A 2Y7WA 1OIBA 3IOUA 3QSLA 5L9OA 3PMWA 3WAFA 5I58B 2ZYMA 3L6GA 1B7HA 3FJMA 3VVEA 5CRYA 5BWJA 5KZTA 3U94A 2DVCA 3G3JA 2F8DA 4YB6A 1B3LA 3K0VA 4ESXA 1D9VA 2V3QA 2ALUA 4ZZAA 1B51A 1O7TA 3DRKA 4DDDA 1Y4TA 1MS7A 1B5IA 2NUVA 2XXPA 4QSDA 1XC1A 3OO8A 3ECRA 4RJZA 4F2OA 1SBPA 2UVGA 3GBAA 1ELJA 4U23A 4ISUA 4U21A 4QFNA 4WKMA 1UTHA 4PFYA 4DIGA 3IO6A 3Q27A 1NL5A 3DP8A 3KGCA 4EF1A 3CIJA 4NF8B 3QXMA 1QJMA 5H8QB 3T9VA 3LVUA 2UVJA 4NF5B 3PUVE 2Q2CA 2QMWA 3K2DA 3FVGA 4FIMA 1MH4A 3HV1A 4I8CA 4M4GA 1RYOA 1I6AA 3N5LA 4BDQA 2Z23A 2O1MA 1IITA 1POTA 2QSXA 3EQ1A 3EPEA 3O6HA 1FCKA 1XT8A 5AA1A 4YB5A 2DQVA 3B6WA 3KG2A 4EF2A 2XX8A 1B9JA 4P0IA 2QS1A 3KN3A 2XXUA 4I9DA 3OSRA 2VD2A 4GFRA 3BKIB 3RY3A 1N84A 3R26A 1NFTA 3K1NA 4LQ2A 1B3GA 2ANJA 1JW5A 3IJOB 5JTYB 3RN8A 1DTZA 1D4NA 5I56B 4LONB 3TTKA 1TFDA 4QFPA 3HHFA 4OFOA 1WODA 1Y3PA 1ZKBA 2A5SA 3IOTA 2YLNA 3CI8A 2GHBA 2ZNUA 4FJPA 1MM6A 4KD5A 3RTWB 1MQDA 3MBPA 2DSFA 3P7IA 2F78A 4PE5B 5DVFA 4QHQA 1I69A 2XD2A 4Z7EA 2XX9A 5DEXB 3KOSA 3K01A 4F31B 2P1SA 4U22A 3C33A 2RC8A 4FEBA 1I6BA 4YKPA 4BDNA 3I5OA 2OWTA 3ONMA 3PPOA 4OERA 5DYHA 4DXBA 5FHOA 1ANFA 3LR1A 1JW1A 4YU0A 3TPAA 4F3PA 1MDP1 3SEVA 3RT8A 1MRPA 3ILUB 3ILTB 4O3BA 1GV8A 4U4XA 3F11A 1OVBA 5H8HB 4XIGQ 5CI5A 2ZXTA 2XXQA 4ZEIA 1BKAA 2V3TA 1MXYA 2DVZA 1R6ZA 2I49A 3TYHA 4PFTA 1JEUA 2PMSA 1M5EA 4JWYA 4OYVA 3T22A 1ZIUA 3MJNA 4BDOA 2VGQA 2ZYNA 1PBPA 1B40A 3BFUA 3G3KA 2HAUA 3PAMA 2CMOA 4NWCA 3IB0A 3SKPA 1DTGA 2E1SA 3PUYE 1EZ9A 4AB6A 4R9GA 2DWIA 4IGTA 2UYFA 3FVOA 3SEUA 3TMGA 1Y1MA 2XD3A 4HTGA 2THIA 4FECA 2YPNA 2ZYOA 3C35A 1A54A 4JBZA 1MG1A 2B3FA 3U93A 4ND9A 4Q5TA 4G68C 5I84A 2DE3A 4FATA 5IKBA 3GXAA 1EH3A 2H25A 3PGFA 4TOZA 1UTBA 4R2BA 4PFWA 4DXCA 3RPWA 4ZEBA 2I6EA 3MZBA 3H7MA 3RGYA 2QJEA 1A40A 4OMBA 1B1XA 3Q25A 1S7YA 1VFEA 1II5A 4OEUA 1MXWA 4DE8A 1LGBC 5H8NA 4KFQA 4JB7A 3LUYA 5H8SA 2I4BA 2FA7A 4PETA 5EYFA 4QRZA 4YKIA 3K4UA 1H44A 3N6TA 3S2VA 2O7UA 3PMVA 4LZ7A 3VE1B 4GQOA 3UP9A 5K2XA 1FTKA 4F22A 4X1DA 3UIFA 4OESA 3BFTA 2V25A 5L8DA 1B3HA 3OEMA 2QPQA 3HPIA 1ATGA 2O51A 2RC9A 1QKAA 5I57A 1SVXB 1QUJA 4G2ZA 3CSBA 3N26A 4U4SA 1YTVA 5L9SA 2DWJA 2XHDA 4G4PA 3EHUA 3TQWA 2I3VA 4R6KA 1O64A 3UK4A 4OWDA 2XXTA 1FW0A 5J1DA 4K3FA 5CBSA 3B7DA 3DP4A 1H76A 2DE4A 1QKBA 1GVCA 3O66A 3K6XA 2AL5A 2I48A 3E13X 1WVJA 4F1YA 3PPQA 5H8FA 4RPOA 2OBGA 5DT6A 3H06B 1MY2A 4ZECA 4NF6A 2PT1A 4H6DA 2H99A 3GLBA 1UIUA 3H4ZA 4ZEKA 3CSGA 5ICQA 2AIXA 2H4IA 3SEYA 4MBPA 4C1TA 4R73A 1SW1A 3SERA 2GHAA 3TEPA 4OTEA 4TLMB 4XXUA 1YPNA 4I62A 3MP1A 4R72A 2M8CA 4BDLA 4OHNA 5I2KA 1LBCA 2NOOA 4H0WA 1M5FA 4IO2A 3FATA 5ITPA 3MPKA 2OZZA 2REJA 1MY4A 2UXAA 1FTLA 1A8EA 1M5BA 2DXRA 3H3GA 4IO4A 4ZS9A 5TU0A 3PPPA 5I59A 2PT2A 2A5TA 4GF8A 3OOAA 1Q1KA 2O7IA 5LOMA 1QW0A 5EHMA 5CMMA 3R6UA 3B6TA 1QVSA 5A5XA 2RKMA 2HEUA 2I3WA 4I1DA 3OELA 3SETA 4GIZA 1D9YA 3U72A 5B70A 4YKJA 5DTBA 4NTLA 1UTHB 1Q35A 1ZU0A 1LAHE 4R9FA 2ONRA 4EXKA 1I6QA 5I58A 2R71A 3FASA 3QYTA 2HXWA 1TWYA 1URDA 4F1UA 1EZOA 3H6TA 1VFDA 5AA2A 2F35A 3QIMA 3MUQA 1VSOA 3KEIA 4JSOA 2BJJX 3MQ9A 1MQHA 3KN7A 4P11A 3K6VA 3E3KA 3MP6A 3DLNA 1T0KA 3KJTA 3UN6A 1B0HA 3KSXA 3LBSA 4QFOA 1A8FA 2HZKA 2UYEA 2OCUA 1B3FA 3DRGA 5I2NA 1MXXA 4FAJA 4HCWA 1SYHA 2ONKE 3G3GA 4OFJA 4QFLA 2I0BA 4DZ1A 1IIWA 2NXOA 4IGRA 3FZVA 1QULA 4ZE9A 2HQ0A 4RYAA 3TTRA 4F18A 2AL4A 2OWSA 3TCFA 3IB2A 4NF8A 2O69A 3O28A 3UGWA 4E0XA 2I58A 1US4A 2X7PA 1OMPA 2XXIA 3DRFA 3AXFA 1GGGA 4N07A 3PD9A 2DS9A 3EHTA 3IR1A 1JQFA 4QF9A 4L17A 2PVUA 5TPAA 1QUKA 3R7XA 4IB2A 4OVJA 3S9EA 4IO5A 1RYXA 2DOJA 4JDFA 1DMBA 1R9QA 4KCCA 1LFIA 3T9HB 3JV9A 3K1MA 2RCAA 1SW5A 3RUMA 3SESA 1N76A 2ONSA 1BP5A 3VV5A 4ELQA 4RPNA 3MVYA 3SEWA 1MY0A 4F19A 1IEJA 5ICTA 3T9UA 1B32A 3Q28A 1NNPA 1JVXA 3ZS6A 3PUWE 3TUSA 4XKRA 4R6YA 2DXYA 3IORA 2WOLA 1OVTA 4F1VA 4X1BA 5K2YA 4H67A 1A55A 3CFXA 2PBWA 2Z8DA 5CMBA 2Q89A 3ZKKA 1FTJA 5KCJA 1Z7NE 4O3AA 4R6HA 4EXLA 3T66A 3IL1B 2ZMBA 2VP1A 1H43A 2RC7A 4GXSB 3RNNA 4MH5A 4GL0A 3E4RA 5EHSA 4G68B 4C0RA 4LQ5A 1MY3A 1P1UA 1SD3A 3S9NC 1DPEA 4QSCA 5JK4A 1IQ7A 4IO6A 3G3IA 5HBCA 4O3CA 3O29A 1ZLQA 1AMFA 4H5FA 1POY1 1MH3A 3A3UA 4JWOA 4DLDA 4DXUA 4IY5A 4GXAA 4YMAA 3N94A 3MVXA 4KI0E 1B4HA 1B7ZA 2VOZA 2F97A 2O68A 4EQ7A 4XKNA 3E9XA 4X48A 4NEDA 4KYSA 4TLLB 2QRYA 3VLWA 1P1NA 1UTBB 4N13A 5AA3A 3FJ7A 4F2QA 3DRHA 3TCHA 2I4CA 3KFMA 3N6UA 4U1OA 1B7UA 1IXGA 1LCTA 4XKQA 3TODA 5AA2D 3GZGA 5H8NB 4OENA 5FTIA 2D21A 1FQBA 3IJXB 1HSLA 4WEPA 2REGA 4BLAA 1B0LA 1P1WA 1R9LA 3C34A 4Z0IA 3TQLA 3K00A 3D4CA 3JZJA 4MLVA 4P0GA 1Y1ZA 5HM4B 5CMCA 3TFLA 4EQBA 2Z22A 5I57B 1TFAA 3I3VA 3MP8A 1NNTA 4AQ4A 4GVOA 5FTHA 4GD5A 5IAIA 2RF1A 1EU8A 3FUZA 1M5DA 4X9TA 1N3XA 4GRKA 2QS4A 4FE8A 2GH9A 3G7WA 3QUFA 1Y9UA 1L5TA 1Y4CA 3VLUA 4OXVA 2ABHA 4LZ8A 1TT1A 1M5CA 3Q26A 4M1VA 3A09A 5TP9A 1ZMGA 3CRBA 4OETA 3CG3A 3U1OA 1IXHA 4FORA 3PUXE 2UVHA 1PEBA 1H3DA 1LAGE 4BDMA 1LB9A 3LSXA 4PP0A 2F7AA 4HS7A 3TTMA 1SW2A 3RLFE 5AA4A 4G8MA 1USYH 3LSLA 1B3EA 2XXVA 4QSEA 4GLIA 1OQHA 2QL3A 2WKYA 3G3FA 3T9XB 1N04A 4LVQA 3RYBA 5KDTA 3HCQA 1XVYA 4NF4A 2AYSA 1LFGA 2W7YA 3ODBA 2R9JA 1NNKA 1S50A 1IZ1A 1B6HA 4HCYA 1URSA 1N0TA 4YKKA 3DM0A 2HAVA 3U8QA 2KLFA 4EQ9A 3B6QA 2IEEA 3TKDA 1ZTYA 2O84X 4OQOA 3FVKA 1UIVA 4XKPA 3FD3A 4G77A 3FVNA 1LCFA 1KWHA 1LB8A 3JYRA 5I59B 4JWXA 3FGSA 2A5TB 3VXBA 3FXRA 1N7WA 4R75A 2D5WA 3KJ7A 3ZKLA 1B2HA 3M3FA 4THIA 4YICA 3FV1A 1NH7A 4YAHX 3SDFA 3C9HA 4DCYA 4BDRA 1B52A 3FXQA 1DSNA 4ZEDA 1JEVA 5ISUA 3THIA 1HSEA 3CFLA 4OEVA 3FV2A 1JNFA 1B5HA 2Q9TA 1Y20A 3M3LA 5CMKA 1TXFA 2HCAA 1NH8A 5AA2B 4QFKA 5CM6A 2Z8FA 4YZZA 1P1QA 3MZ9A 3OD7A 3PUZE 1DOTA 3EHSA 4ZEFA 2RCBA 4ELPA 1PB9A 5JEIA 4TQUQ 1B46A 3MWBA 3IOWA 4LA9A 2XXRA 1DPPA 4JXIA 3TZAA 4WEDA 4UACA 1IXCA 3MW0A 4H8IA 4JSDA 5I2NB 4KHZE 2NVUB 2X26A 1CB6A 1SI1A 2Y7IA 2ZYKA 3QAXA 1FQEA 2X7QA 3H6UA 3M3KA 4RK2A 4KPTA 1O63A 3O6PA 3W9VA 2DWAA 2Y7KA 4ZDMA 3TDJA 3V5AA 4AB5A 2NWJA 1XOCA 3IB1A 3D4GA 2QS3A 1A99A 4UA8A 2YJPA 2FYIA 3IOVA 2Y7PA 3O6IA 4GWOA 3A3CA 3MZ1A 2VD3A 3O6GA 2PYYA 3VLVA 3VFJA 1QUIA 1PC3A 3CHGA 4FEDA 4GL8A 4RNSA 4R2FA 3GBBA 1A7LA 5H8QA 2PX1A 4H1XA 2DE2A 2DYXA 4NF5A 3OENA 5TPAB 4EDPA 2XX7A 1B1HA 1FQAA 2HZLA 2UVIA 4XTCQ 2F6PA 3K6WA 2Q88A 4MF3A 5ELVA 1LSTA 1XS5A 2FNCA 1LFHA 2XXYA 1BLFA 5DVIA 1H45A 4Q0CA 3USDA 3VXCA 2RINA 4RA1A 2GFEA 4IY6A 3PPNA 2B4LA 2B4MA 5ITOA 3PMXA 3LSFB 3RQTA 1EZPA 3OO6A 4MFIA 3DELB 3IO4A 1SDXA 4C1UA 3KOTA 3RTFB 4ECFA 3DRJA 4OFLA 1JVYA 5KCJB 5JTYA 4KQPA 3S9LC 5I56A 1SI0A 1AL3A 3C32A 5CBRA 1FQCA 1FTMA 3V8XB 2CZLA 3LSWA 2P0SA 3K6UA 3SEXA 1HSJA 3MVZA 3TTNA 1ZBMA 2F5XA 3KSJA 3OMBA 1RKMA 3UA8A 5DEXA 3T93B 4H5GA 4POXA 3HSTA 2G29A 1VE4A 1MPBA 1IUDA 3O9PA 3OXNA 1YCJA 4ZZEA 2O6AA 2OJTA 5M2VA 1PB7A 3KZGA 1GTKA 2V93A 1B5JA 2H98A 4F3BA 4LATA 3EN3A 1MXVA 1LAFE 1Z7ME 4LUBA 4NWDA 3OSQA 1OLAA 1VR5A 3CG1A 2I0CA 4F3SA 5FHNA 5H8HA 1MXZA 1UQWA 4G68A 2F36A 1NKXA 1AH5A 4YB7A 4PQJA 4RY1A 3OO7A 5L9MA 3V83A 5HPQA 3C36A 3CFZA 2G93A 3Q29A 2ESNA 2F34A 1BTJA 3H6VA 4KR5A 1NMUA 3WAEA 3MC2A 1WDNA 4KYDA 4KYEA 1SQYA 1B58A 4RK9A 3DP6A 5AE4A 1PDAA 2V3UA 3L6HA 3FIRA 4WXJA 5F1QA 1B4ZA 2OK2A 1J1NA 2H9BA 1XHYA 1US5A 5CC2A 3U92A 2F7BA 2IA4A 3MAMA 1YAEA 1N3WA 3FTOA 2Y84A 3TCGA 1PB8A 1GR2A 3V89B 3HHGA 3T96B 3OEKA 4Q8RA 1Y3QA 3PV0E 1OQGA 2Y7RA 5DVJA 2Q8JA 2F7CA 4LZ5A 1SYIA 4IO7A 4R74A 1D3KA 2GRVA 4MLQA 3CVGA 3VVDA 4F39A 2QMXA 3PU5A 4U1ZA 2V84A 1NNFA 3EF7A 2LAOA 1FQFA 2HFBA 3K02A 3UORA 3CR9A 3RYAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1P1OA 3LC8A 2R6GE 2B65A 5FHMA 3K1PA 4GX4A 4NG7A 4ELRA 2ZNSA 3W9WA 1G0HA 2XXXA 5TP9B 1MQGA 3H03A 3M8UA 4N17A 2Q2AA 1LAXA 1Q9DA 2OLBA 4NMYA 4RXLA 3DRIA 1S9TA 3MVWA 2XWIA 1MDQA 3PD8A 4KCDA 1P99A 1R1NA 4EUOA 1NV1A 4ONYA 4U2RA 4YMBA 3IK6B 3FBPA 1Y3NA 2XXWA 5AA4B 1F9BA 5H8FB 2OX3A 3PPRA 2XXHA 4PDDA 4G8HA 4GOTA 1FPDA 1FQDA 3TTLA 3KN8A 4H8JA 4NF6B 3S4UA 3C4MA 3KBRA 3HN0A 3VDFA 5KDTB 4F29A 4POWA 2F6GA 3IX1A 4NF4B 1XVXA 3RT6B 4H65A 4NE4A 3QK6A 1CE2A 1DCUA 1BIYA 1NV6A 2B3BA 4N6PA 4ELOA 1PBQA 3W15C 4GBVA 4LP2B 1OLCA 4P1EA 3HO7A 2O1LA 1LBBA 1MPCA 2DP8A 4NN3A 3FJGA 1MY1A 1N7XA 4HW8A 2WOKA 2WOPA 3O97A 1IXIA 1BK4A 4PFUA 5I2KB 1JETA 5F7VA 2DWHA 3O2AA 4XF5A 3IAZA 3S9MC 1MPDA 4E0WA 3QUJA 4Q30B 2Z8EA 4PBQA 2JJKA 2QVVA 4F3GA 3ZSFA 5BUUA 1AIVA 3G3HA 1B05A 2KR0A 1MM7A 4GWZA 1URGA 3TAJA 4IO3A 3I6VA 1JW4A 3OO9A 1FTOA 2MKZA 4OZ9A 4ESWA 4PTKA 1LEVA 4GX3A 4NX1A 1MQIA 2VHAA 2P2AA 3C31A 3BBRA 3FXUA 1MXUA 3VVFA 2H5YA 1MQJA 1ZJLA 2D3IA 5A5XB 2ZNTA 3MPLA 5B7DA 1SW4A 4DCXA 4ZE8A 1LLSA 1USYE 3H6WA 3TELA 1AOVA 2E0SA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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