The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
LFVALYDFVASGDNTLSITKGEKLRVLGYNHNGEWCEAQTKNGQGWVPSNYITPVN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
High-resolution crystal structures of tyrosine kinase SH3 domains complexed with proline-rich peptides.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
ABL TYROSINE KINASE SRC-HOMOLOGY 3 (SH3) DOMAIN
|
| molecule tags |
Kinase
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| source organism |
Mus musculus
|
| total genus |
10
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| structure length |
56
|
| sequence length |
56
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 1995-05-19 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2GNC A; 2J6F A; 2EKH A; 3NHN A; 1KJW A; 2KT8 A; 1UGV A; 2EGC A; 2EGA A; 3REA B; 5L23 A; 4ORZ A; 2D0N A; 2SEM A; 4WCI A; 3R6N A; 1UJY A; 2JS2 A; 1UDL A; 2YUN A; 3U23 A; 1EFN A; 3THK A; 4EIK A; 3RNJ A; 1TUD A; 3NMZ C; 2EVR A; 1ZLM A; 4RTT A; 4F14 A; 4JJC A; 2YT6 A; 2D8J A; 1GL5 A; 2CSI A; 2GGR A; 1HSQ A; 1U06 A; 4A63 B; 1ZUK A; 1XOV A; 2FPE A; 2L3P A; 3H0I A; 4OMQ A; 1KFZ A; 2HBW A; 2O2O A; 3REB B; 1T0J A; 2BTT A; 3KFV A; 2CUD A; 4X1V A; 2QDL A; 1AWJ A; 4RUG A; 4ESR A; 2I0N A; 2AK5 A; 3PVL A; 2J06 A; 1X6B A; 2DL5 A; 4HVV A; 4QT7 A; 2EYY A; 2LP5 A; 2AKK A; 2J7I A; 4OMO A; 2V1Q A; 1I0C A; 2KE9 A; 2LZ6 B; 1KSW A; 1PKS A; 2DVJ A; 2W10 A; 2DX1 A; 1YCS B; 2GBQ A; 4D8D A; 4CC3 A; 2LNH B; 2RN8 A; 2DF6 A; 2KGT A; 4CC2 A; 4LN2 A; 4K11 A; 2RQR A; 1HJD A; 1GFC A; 2VKN A; 1IO6 A; 2K9G A; 1RUW A; 2KXD A; 1K0S A; 2J6K A; 1UEC A; 2FO0 A; 1OPK A; 3C0C A; 4Z88 A; 4JJB A; 2NWM A; 1SHG A; 1T3S A; 2K79 A; 2LX7 A; 1AWX A; 2D1X A; 1UTI A; 1MV3 A; 1WA7 A; 3EG2 A; 1NLO C; 1GCP A; 4Z8A A; 1AOJ A; 4FSS A; 2FG0 A; 1WX6 A; 2DM1 A; 1WYX A; 3M0Q A; 1M3B A; 1H8K A; 1PNJ A; 1ABQ A; 4OMM A; 1Y57 A; 1T0H A; 1CKA A; 2MCN A; 1VYT A; 2RQT A; 2KEA A; 2ENM A; 3CQT A; 1JXM A; 2XMF A; 2HEQ A; 1VYV A; 3GBQ A; 2DLP A; 4J9E A; 4F16 A; 4JZ3 A; 2DJQ A; 1S1N A; 4J9H A; 3H41 A; 1E6G A; 2KT1 A; 2FEI A; 1AZG B; 1PWT A; 4CC7 A; 5ECA A; 2EPD A; 2DBK A; 1J3T A; 1Z9Q A; 2EYW A; 2CDT A; 1AWO A; 1CSK A; 2JXB A; 4HXJ A; 4J9I A; 2ECZ A; 2KXC A; 2KRO A; 4HCK A; 2VVK A; 4M4Z A; 1ZSG A; 1OOT A; 2BZ8 A; 2J05 A; 3I5S A; 2PNI A; 2P4R A; 5IHI A; 2DNU A; 4DEX A; 1JQQ A; 1PHT A; 3PE0 A; 2GTO A; 3VS0 A; 2F2X A; 5IH2 A; 2PTK A; 1BB9 A; 2KRN A; 1ZBJ A; 4F17 A; 1WI7 A; 4R0K A; 1ZX6 A; 4IIM A; 1YN8 A; 1MV0 B; 1QLY A; 1YWO A; 2C0I A; 4J9D A; 2PZ1 A; 5I22 A; 3M0T A; 2CH4 A; 4DEY A; 3VS7 A; 2CRE A; 4RTW A; 2M0Y A; 2RQU A; 2ESW A; 2SRC A; 2GQI A; 2DA9 A; 1WIE A; 1AWW A; 1X43 A; 1K9A A; 1T3L A; 1Z9Z A; 5GJV B; 1WDX A; 4Z89 A; 1K4U S; 4RTU A; 2L3S A; 1QKX A; 2EGE A; 1KIK A; 2VWF A; 2BZX A; 2K3B A; 4JZ4 A; 1A0N B; 3I5R A; 1UFF A; 3PVQ A; 1RLQ C; 2DYB A; 1WXU A; 1N5Z A; 2EW3 A; 1QKW A; 2O9V A; 2CT4 A; 1H92 A; 2FRW A; 4J9B A; 2KYM A; 4LE9 A; 2GTJ A; 2K7A A; 2EBP A; 3LH5 A; 1ARK A; 3M0R A; 2DL3 A; 1H3H A; 1X69 A; 2DL8 A; 2G6F X; 1X6G A; 3QWX X; 3FJ5 A; 2EQI A; 4RTX A; 3RBB B; 1SSH A; 5EC7 A; 1AEY A; 2DL4 A; 2MOX A; 1GRI A; 1ZUU A; 1CKB A; 2AKL A; 4HVU A; 2RF0 A; 5FWC A; 3VS2 A; 1FMK A; 3M0S A; 2C0T A; 1NYG A; 2YUQ A; 5IHN A; 1M8M A; 2DMO A; 2OI3 A; 1JEG A; 3NGP A; 2A36 A; 3TSZ A; 1NYF A; 1NM7 A; 3UA7 A; 1GBQ A; 1QWF A; 4JJD A; 3VS6 A; 1B07 A; 2H8H A; 4OMP A; 3VS1 A; 1RLP C; 1LCK A; 3EG0 A; 5I11 A; 2DIL A; 1JO8 A; 2ROT A; 2DBM A; 2JM8 A; 2AZV A; 1OV3 A; 2YUP A; 4HVW A; 3I35 A; 2O31 A; 5IXB A; 2A37 A; 1TG0 A; 2ED1 A; 1JXO A; 2ABL A; 1NLP C; 1WFW A; 4AFS C; 2KRS A; 3TSW A; 2L2P A; 1SRL A; 2LQN A; 3SEM A; 3VS5 A; 2OAW A; 2A08 A; 2NUZ A; 4AG2 C; 2DRK A; 4E6R A; 1HD3 A; 2HCK A; 2RNA A; 1WLP B; 1UG1 A; 4J9G A; 1UHF A; 1Y0M A; 2RPN A; 1SRM A; 2KBT A; 1AZE A; 1AD5 A; 1BBZ A; 4AG1 C; 1WXT A; 2J6O A; 1W1F A; 4ZNX A; 3M0U A; 2C0O A; 2CH4 W; 2JTE A; 1K76 A; 3EG3 A; 1M27 C; 1MUZ A; 4RTV A; 1M3C A; 5FWB A; 2EYX A; 2JMA A; 1NG2 A; 2K6D A; 3M0P A; 3VRY A; 2O9S A; 4GLM A; 1TUC A; 2JS0 A; 2A28 A; 3ZL7 C; 3O5Z A; 2OJ2 A; 3A98 A; 1BU1 A; 3IQL A; 2W0Z A; 3H0F A; 2BZY A; 5FW9 A; 2V1R A; 1JU5 C; 1G2B A; 2LJ0 A; 1RI9 A; 2YUO A; 3ULR B; 4AFQ C; 1OPL A; 2JT4 A; 1YWP A; 1U5S A; 2FPF A; 1G83 A; 2CT3 A; 2KR3 A; 1X27 A; 2HSP A; 3EHR A; 4KRT A; 1OEB A; 2DL7 A; 2M51 A; 3UAT A; 4D8K A; 4RTY A; 2F2W A; 4J9F A; 3H0H A; 1NEG A; 2JW4 A; 4CC4 B; 1SEM A; 2D8H A; 2RQW A; 2HDA A; 2DRM A; 1FYN A; 3VS4 A; 1W70 A; 2YDL A; 4RTZ A; 3QWY A; 2ROL A; 1UE9 A; 2F2V A; 2E5K A; 2B86 A; 4IIO A; 2ED0 A; 4LNP A; 4J9C A; 1V1C A; 3JV3 A; 1BK2 A; 2DE0 X; 2MIO A; 2JMC A; 5HCK A; 2AZS A; 1PKT A; 1UUE A; 1I1J A; 1QCF A; 2X3W D; 3EGU A; 3UF4 A; 2L0A A; 4OMN A; 4AFU C; 1GFD A; 1UHC A; 1X2Q A; 1K0X A; 4Y92 A; 1AVZ C; 1QWE A; 1GCQ A; 1E7O A; 1YP5 A; 1M30 A; 4GBQ A; 1VYU A; 3I9Q A; 2YSQ A; 3VS3 A; 5IXF A; 3EHQ A; 2O88 A; 1GCQ C; 2EYZ A; 3NPF A; 1B3Q A; 2KRM A; 1GBR A; 1ABO A; 1E6H A; 2FPD A; 4OML A; 2KYB A; 5GJW B; 3UA6 A; 2LJ1 A; 2LMJ A; 2CUB A; 2JM9 A; 2KNB B; 4LUD A; 3TVT A; 2L3Q A; 1M3A A; 1ZUY A; 1NEB A; 1SPK A; 1YNZ A; 2LJ3 A; 4JPB W; 2K2M A; 1PRM C; 2LQW A; 2FRY A; 2IIM A; 1X2K A; 1PRL C; 1I07 A; 1SHF A; 1W6X A; 2CSQ A; 1WXB A; 3VRZ A; 1UJ0 A; 2RQV A; 1U3O A; 4LUE A; 1VA7 A; 2RMO A; 3SHW A; 2LCS A; 2X3X D; 3EG1 A; 4AFZ C; 5IHK A; 1K1Z A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3V7S A; 1WQW A; 3NHN A; 1QVG A; 1UGV A; 3G71 T; 4L5G A; 3RKX A; 4FSX A; 2K5I A; 4IUT A; 3SD4 A; 2D0N A; 1VQL Q; 1VQM T; 2C06 A; 2K2V A; 4FL6 A; 1S72 A; 3TQ7 P; 1ZLM A; 1IRX A; 4JJC A; 2YT6 A; 1D09 B; 1Q7Y R; 4M7D F; 3HRS A; 5GAM j; 4NOY A; 1KFZ A; 3EAE A; 2OTL Q; 2HBW A; 4BE1 A; 2O2O A; 3J81 E; 1BIA A; 2BTT A; 2RD1 A; 3KFV A; 2CS7 A; 4X1V A; 1G3S A; 3TEE A; 2P84 A; 2NUT A; 1AWJ A; 4RUG A; 3GNG A; 2DXB A; 3A5Z B; 3I55 A; 1YI2 Q; 3J80 E; 3VU3 C; 1BCM A; 2X51 A; 2W10 A; 2DX1 A; 1TXQ A; 2DF6 A; 2KGT A; 1Q81 C; 3JCM h; 4BI3 A; 4C92 E; 2VKN A; 1IO6 A; 2LVM A; 3X25 B; 2KXD A; 2P0P A; 4DOW A; 4LDU A; 3G6E A; 3L2R A; 1OPK A; 4HCB A; 2RHI A; 1T3S A; 2K79 A; 3CPW S; 1OZ3 A; 1WA7 A; 3EG2 A; 3CBP A; 2I2L A; 2QQB A; 2D9T A; 1ACM B; 1H8K A; 3R6O A; 3RUX A; 3OW2 A; 1PNJ A; 3JB9 F; 1VUB A; 1M9S A; 1Y57 A; 1T0H A; 5KYU A; 2YRV A; 1ZSZ C; 4RG2 A; 2MCN A; 2KY9 A; 5CKE A; 2KEA A; 5CKD A; 1M2V A; 2HEQ A; 3CMA T; 3GBQ A; 5KYN A; 1D0X A; 1X75 C; 1V29 B; 2JN0 A; 4J9E A; 4F16 A; 2DJQ A; 2KT1 A; 4CC7 A; 3CCV Q; 2VV5 A; 4IUR A; 1J3T A; 5CO7 A; 3OW2 P; 1VQK A; 1Z9Q A; 5GAN j; 2CDT A; 1YIT T; 3X26 B; 2XDP A; 4HXJ A; 2A7Y A; 1IRE B; 1KK7 A; 2KRO A; 3LW5 E; 4C92 F; 2VVK A; 4Q5W A; 3CC7 A; 2J05 A; 2CZ7 B; 4IUQ A; 2JTF A; 5KYY B; 2F69 A; 4DEX A; 2MWP A; 2EKO A; 1PHT A; 2VYT A; 2IPO B; 2GTO A; 2ZZD A; 1MMA A; 2FZC B; 1BB9 A; 3LWH A; 2ZPG B; 1WJS A; 2KRN A; 1TH7 A; 1ZBJ A; 1RAD B; 1YN8 A; 3UPU A; 5CKH A; 8AT1 B; 5LJ5 e; 2C0I A; 3A1P A; 3L42 A; 3CCU T; 5FU7 C; 3VS7 A; 2CRE A; 2RQU A; 2ESW A; 1G3Y A; 2GQI A; 2DA9 A; 5FRN A; 1AWW A; 3WVD B; 2DKG A; 1YJW Q; 1KIK A; 2X4W A; 2KVQ G; 3CCE Q; 2ZPH B; 4BD3 A; 2NUP B; 3PVQ A; 2R5A A; 4M77 E; 2DYB A; 1N5Z A; 2JNG A; 1NJI R; 3OB9 A; 1RAE B; 2EW3 A; 2ZAE A; 3G71 Q; 1DJ7 B; 2EQM A; 1PSE A; 4LE9 A; 2K7A A; 4XU0 A; 2EBP A; 4N4H A; 2DL3 A; 4B6M A; 1VQM Q; 1H3H A; 1X69 A; 4ATO A; 3QWX X; 4HA8 A; 2EQI A; 3ASK A; 3V7C A; 2CZ6 B; 1SSH A; 1YHQ T; 3A8O B; 4IUU A; 2DJZ A; 2CZ0 B; 2DL4 A; 2DFU A; 3CCM T; 2EAY A; 1CKB A; 2CZ1 B; 3JCM X; 4HVU A; 2RJF A; 1EIF A; 3NTH A; 1XQH A; 1VQN A; 2C0T A; 4J7F A; 1D1A A; 1Q86 R; 4M78 F; 3MCA B; 4E7H A; 3G4S T; 3JCM c; 2PUK B; 2F5T X; 1VQ7 A; 2FL7 A; 2A36 A; 4XTV A; 4MDX A; 1NYF A; 2M1H A; 1NM7 A; 3LLR A; 1N8R U; 2OAU A; 2RB6 A; 3SDZ A; 1VQ5 A; 1GBQ A; 4N4I A; 5GMK i; 1K9M R; 4BY6 B; 4XAX B; 1JJ2 A; 1LNX A; 1B07 A; 2CGH A; 2XK0 A; 4OMP A; 1RLP C; 1M1F A; 2DIL A; 4JLI A; 4M77 F; 1OV3 A; 2DXU A; 2O31 A; 1BCO A; 3LYI A; 5IXB A; 3EFS A; 2RO0 A; 2ABL A; 1PSF A; 1NLP C; 1BIB A; 5CIU A; 2KRS A; 2PUO B; 5L8R E; 3MEV A; 3DB4 A; 3SEM A; 4HT8 A; 4M75 B; 2NUZ A; 2Y90 A; 2DRK A; 2COW A; 5IAY A; 2O4X A; 2DET A; 2FB7 A; 4OVA A; 1AZE A; 2CKK A; 1ZHI A; 1VQ8 A; 4HCZ A; 2QGG A; 2C0O A; 2JTE A; 1M27 C; 2E12 A; 4A53 A; 3OYE A; 3CMA Q; 3EGD A; 3X20 B; 3CCJ A; 2EYQ A; 2K6D A; 3OA6 A; 3VRY A; 2O9S A; 3CCL A; 1QVG S; 1M4Z A; 2A28 A; 5GAN 7; 3OYF A; 2XIC A; 2RHX A; 4QQ6 A; 2GCX A; 4PLL A; 1YIT Q; 2BZY A; 5FW9 A; 3MET A; 2CP0 A; 3ULR B; 1OPL A; 4QKU A; 1YWP A; 1VQO T; 1I81 A; 1FXX A; 1G83 A; 1EX4 A; 2HSP A; 3OYL A; 2H3J A; 2E3I A; 3UT1 A; 2DL7 A; 4D8K A; 5LL6 S; 4RKU E; 2JUF A; 2QTX A; 4PJO B; 3GPL A; 1BYM A; 1NEG A; 2NLU A; 3QBY A; 2AIR B; 2D8H A; 2QI2 A; 4C5I A; 1Y71 A; 2VAS A; 1ZA1 B; 3CCU Q; 2AT1 B; 1YIJ T; 1UE9 A; 2A3L A; 2F2V A; 1SSF A; 3PNW C; 1N27 A; 2CP2 A; 1ZA2 B; 3BDL A; 3H9N A; 2VXE A; 3JV3 A; 1NE8 A; 3PMI A; 1TUG B; 2DE0 X; 3TRE A; 2MIO A; 4QQG A; 2HSE B; 1RAH B; 2RHU A; 4Y28 E; 1QW1 A; 2LTO A; 1P92 A; 5KYY A; 1PG5 B; 1PC0 A; 3M54 A; 3BE3 A; 4OMN A; 2X4Y A; 1RAI B; 1SKU B; 2P0K A; 3WXM B; 5HK3 A; 1G8X A; 1QWE A; 4E7I A; 3MO8 A; 5D6Y A; 2RI5 A; 1YHQ Q; 3CCS A; 2E6N A; 3CCM Q; 4M75 G; 3TU4 K; 1VYU A; 3QUI A; 1TSF A; 3BY7 A; 4E7Z A; 3RDV A; 3PGG A; 3OW2 S; 2HBP A; 1TWB A; 1ABO A; 1E6H A; 2JVV A; 2K5F A; 2IVW A; 2WSF E; 2KYB A; 2M0O A; 1WQ7 A; 3G4S Q; 1C0M A; 2CUB A; 3OS2 A; 2JM9 A; 1YJ9 A; 3OQ5 A; 3TVT A; 2ATC B; 4J5Y A; 3LGF A; 1SPK A; 2K2M A; 4XTX A; 1M1K U; 1KD1 R; 3OBW A; 3CME T; 1PRL C; 1I07 A; 1SHF A; 2OTJ T; 2BE7 D; 3P8H A; 1RAG B; 2RQV A; 2VC8 A; 1Y96 A; 1U3O A; 4L59 A; 1VA7 A; 2RMO A; 4F7U F; 2LCS A; 1QP3 A; 2EKH A; 1I4K 1; 5CKF A; 3S3N A; 4DQ2 A; 4CI0 C; 1YI2 T; 1YJN A; 4M7A B; 4QVD A; 2EGA A; 1TOV A; 5GAO q; 2RJE A; 4FW2 A; 4WTO B; 4C0F A; 4WCI A; 2DVE A; 4XU1 A; 2FZK B; 2B8A A; 2JS2 A; 2YUN A; 3HP9 A; 3JB9 J; 3RNJ A; 5CQX A; 1LPL A; 1S72 T; 2D8J A; 2HKQ B; 2CSI A; 2JJ9 A; 2GGR A; 4A63 B; 3H0I A; 2DO3 A; 5IN1 A; 2DER A; 3O8V A; 5AT1 B; 4C8Q B; 3CCQ A; 3QG1 A; 3HPW A; 3JCM g; 3RKY A; 2I0N A; 4LDW A; 4BY6 C; 2J06 A; 2EFI A; 3FRN A; 2VUB A; 4BI8 B; 1X6B A; 3SWN B; 1MNE A; 5GAN 3; 4QT7 A; 3PMT A; 5DLQ E; 2V1Q A; 1WJQ A; 1K8A U; 1I0C A; 5I2S A; 2KI7 A; 2QAS A; 3I55 T; 1PKS A; 4ZGJ B; 3RKW A; 3HKS A; 1AHJ B; 3JCM V; 2XKO C; 2LDM A; 2GBQ A; 5GMK e; 4XQ3 A; 3EG9 A; 5J3B A; 2LNH B; 4CC2 A; 2LNV A; 1Q95 G; 4M75 A; 2BKD N; 1VQO Q; 2K9G A; 2RA2 A; 1RUW A; 1OYX A; 2LQ8 A; 4M75 C; 2J6K A; 2LC4 A; 4KGV B; 1UEC A; 5CCA A; 1TTH B; 4JJB A; 3AT1 B; 5GAO p; 2LX7 A; 2Y4X A; 2KSS A; 1RAC B; 1K73 U; 2KQW A; 2K57 A; 3OYK A; 4KGX B; 2E6Z A; 2VB6 A; 1YBY A; 1AOJ A; 2MF2 A; 4FSS A; 4Z02 A; 5DY9 A; 2FG0 A; 1WYX A; 1M3B A; 4JRP A; 1YIJ Q; 2ZPE B; 3CEY A; 1G3W A; 5FRM A; 4R56 A; 4V2S A; 5FU6 B; 1M1G A; 2RH2 A; 4EDU A; 1CKA A; 3NFC A; 4PLI A; 1JJ2 S; 4XK8 E; 2V26 A; 2LT1 A; 2E64 A; 2DLP A; 2EWN A; 1R0B G; 4JZ3 A; 3H41 A; 2FEI A; 2WSE E; 1WHH A; 5GAN 6; 3OYC A; 5ECA A; 2EPD A; 2DXC A; 2EYW A; 4M7A G; 2JXB A; 4MMK A; 3J7A F; 2DXT A; 1VQK T; 4LDV A; 2KXC A; 4FYX B; 4ZTF A; 1ZSG A; 1OOT A; 2BZ8 A; 4PJO C; 2DNU A; 4J7I A; 2E4H A; 1VQ6 A; 1VQP T; 1KHC A; 3VJP A; 2M9U A; 1B34 A; 2PTK A; 2KMT A; 1M90 U; 1VQ9 T; 5CAI A; 4F17 A; 1I5O B; 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