The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
57
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structure length |
57
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Chain Sequence |
KELVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKTEVNGRQGFVPAAYVKKLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solvation in Protein Folding Analysis: Combination of Theoretical and Experimental Approaches
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Sh3-domain
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| source organism |
Gallus gallus
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| molecule keywords |
SPECTRIN ALPHA CHAIN
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| total genus |
11
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| structure length |
57
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| sequence length |
57
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-12-18 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4JJC A; 4EIK A; 2L3S A; 2RQV A; 2DL3 A; 1WXU A; 2AZV A; 1K4U S; 1JQQ A; 2AKK A; 2HSP A; 5IXF A; 3NPF A; 2BTT A; 2CSI A; 2LJ0 A; 3VS1 A; 1GCQ A; 2ENM A; 1E6G A; 1VYV A; 2D0N A; 2YDL A; 1KFZ A; 3VS4 A; 2EKH A; 1YWP A; 1M8M A; 2PNI A; 1V1C A; 2BZY A; 2GQI A; 1BK2 A; 1OPL A; 3VRZ A; 1SSH A; 1VYT A; 2BZX A; 2RQT A; 3U23 A; 3VS3 A; 1UJY A; 2PTK A; 4J9E A; 1T0J A; 3H0H A; 2KGT A; 2DX1 A; 1CKA A; 1B07 A; 1NYG A; 1ARK A; 2DLP A; 1IO6 A; 2XMF A; 3REA B; 2PZ1 A; 3PVL A; 1XOV A; 2LNH B; 1I07 A; 2FG0 A; 3I5S A; 2J06 A; 2MIO A; 3EG0 A; 4LNP A; 1PKT A; 4RTX A; 2D8J A; 2W10 A; 4OML A; 4RTT A; 2YSQ A; 2VKN A; 1ZSG A; 2E5K A; 3TSZ A; 3I35 A; 2JW4 A; 2NUZ A; 2YUP A; 3R6N A; 2P4R A; 4Z88 A; 1WXB A; 3I9Q A; 1TUD A; 1T0H A; 2EQI A; 1WX6 A; 2VVK A; 1UJ0 A; 2LMJ A; 1GL5 A; 2JMC A; 2GTJ A; 4Y92 A; 2FEI A; 2K9G A; 4X1V A; 2DYB A; 3EHR A; 1NLP C; 4F14 A; 1WYX A; 1X2K A; 1MV3 A; 1KSW A; 1GRI A; 4HVW A; 4IIO A; 4J9I A; 1G83 A; 1Z9Z A; 1W70 A; 2MOX A; 2ED1 A; 3A98 A; 5GJW B; 5IH2 A; 1ABO A; 2L3Q A; 5ECA A; 1E7O A; 3EG3 A; 1WLP B; 1QKW A; 3EG1 A; 1YNZ A; 2SRC A; 3M0S A; 2A37 A; 1KJW A; 2V1Q A; 1RI9 A; 4D8D A; 2J7I A; 4JJD A; 4CC3 A; 3ULR B; 1H3H A; 2GBQ A; 2JXB A; 2H8H A; 2RMO A; 2KRS A; 2DE0 X; 2DMO A; 4D8K A; 5EC7 A; 1UHC A; 3M0U A; 2RQU A; 2KXD A; 4OMN A; 4J9D A; 2DL5 A; 2ESW A; 1UEC A; 1H8K A; 2DL7 A; 2RN8 A; 2J6K A; 2X3W D; 1ABQ A; 1U3O A; 4HXJ A; 4OMP A; 4R0K A; 1K1Z A; 1CKB A; 1M3A A; 1QCF A; 1X6G A; 4AFQ C; 1YN8 A; 2M51 A; 5IHN A; 3GBQ A; 2KT1 A; 1AWJ A; 1ZX6 A; 3THK A; 1OV3 A; 4HVU A; 1UHF A; 1M3B A; 2L0A A; 1S1N A; 1PWT A; 2CT4 A; 1QLY A; 2I0N A; 1K9A A; 3ZL7 C; 2KRM A; 2KXC A; 1Y0M A; 1W1F A; 1BBZ A; 2KRN A; 3H41 A; 3UAT A; 4JZ4 A; 3NMZ C; 2G6F X; 3PVQ A; 2CH4 A; 4CC7 A; 1X2Q A; 1J3T A; 1MV0 B; 1PNJ A; 3VRY A; 5L23 A; 2JMA A; 1UGV A; 1RLQ C; 1M30 A; 1UDL A; 1W6X A; 4Z8A A; 2JM8 A; 3M0R A; 2K7A A; 1AEY A; 1K76 A; 2HBW A; 2K2M A; 3FJ5 A; 4A63 B; 2SEM A; 1GBR A; 2KT8 A; 1ZUY A; 2OI3 A; 2DF6 A; 4F16 A; 2CDT A; 1TUC A; 2DRM A; 4F17 A; 2A36 A; 2GNC A; 1E6H A; 1X43 A; 2CSQ A; 4WCI A; 2O9S A; 1ZUK A; 2QDL A; 1AWW A; 1AZE A; 1B3Q A; 5FW9 A; 1BB9 A; 1SPK A; 3UA6 A; 5IHK A; 4ZNX A; 3QWY A; 1AWX A; 3C0C A; 2EYW A; 4LN2 A; 2LQN A; 2RQR A; 1WXT A; 2JS2 A; 3VS7 A; 3EGU A; 5I22 A; 3PE0 A; 2DJQ A; 1ZLM A; 2YUN A; 3M0T A; 2RNA A; 4DEX A; 4RTW A; 2DL8 A; 1VYU A; 2FPF A; 3VS6 A; 2FRW A; 1WFW A; 3VS5 A; 1K0S A; 2DBM A; 2YT6 A; 1OPK A; 1UE9 A; 2JT4 A; 1PRM C; 1UFF A; 3O5Z A; 3I5R A; 2ECZ A; 3EHQ A; 1WA7 A; 2OJ2 A; 1UG1 A; 1AVZ C; 2L2P A; 2K6D A; 4E6R A; 4KRT A; 1JEG A; 1QKX A; 3REB B; 2FRY A; 1PKS A; 1H92 A; 2IIM A; 2W0Z A; 3TSW A; 1PHT A; 2ROT A; 2EVR A; 3SEM A; 1I0C A; 2KE9 A; 2LJ1 A; 1TG0 A; 2YUO A; 2J05 A; 2DBK A; 1NM7 A; 1I1J A; 4J9H A; 4IIM A; 1VA7 A; 4HVV A; 1QWF A; 2ABL A; 2HCK A; 5HCK A; 2ROL A; 1JO8 A; 1U5S A; 2KBT A; 1GBQ A; 3SHW A; 2LJ3 A; 1NG2 A; 4J9B A; 3RNJ A; 3VS2 A; 1NLO C; 2O2O A; 1GCP A; 1EFN A; 1YP5 A; 4DEY A; 1X6B A; 5IXB A; 2B86 A; 1JXM A; 1NEG A; 2C0O A; 2LCS A; 1U06 A; 2LX7 A; 2C0T A; 1FYN A; 4K11 A; 4LE9 A; 3H0I A; 4GLM A; 2ED0 A; 2NWM A; 1JU5 C; 2CUD A; 2JTE A; 1LCK A; 2BZ8 A; 3KFV A; 1KIK A; 2O31 A; 2D8H A; 2A28 A; 1G2B A; 2F2V A; 1N5Z A; 4RTY A; 2J6O A; 4ESR A; 2K3B A; 1HJD A; 1GFD A; 3VS0 A; 2EYY A; 1A0N B; 4AFU C; 2FPD A; 2EGC A; 2YUQ A; 1QWE A; 1GFC A; 4JZ3 A; 2KYM A; 1ZUU A; 2O9V A; 3NGP A; 5IHI A; 1MUZ A; 3H0F A; 2FO0 A; 1K0X A; 2O88 A; 5GJV B; 2L3P A; 4RTU A; 1M3C A; 4OMM A; 4Z89 A; 2KRO A; 1AOJ A; 1AD5 A; 5I11 A; 2X3X D; 3NHN A; 2GTO A; 4OMO A; 4AFS C; 1SHG A; 2KNB B; 3CQT A; 4JPB W; 1M27 C; 3UA7 A; 2A08 A; 2DIL A; 2EYZ A; 1ZBJ A; 2CUB A; 1UTI A; 4AG2 C; 2DL4 A; 1WIE A; 4CC2 A; 2EW3 A; 1WI7 A; 2D1X A; 2M0Y A; 2LQW A; 1SEM A; 2CT3 A; 4CC4 B; 2F2W A; 2AKL A; 1HD3 A; 3IQL A; 2KYB A; 1HSQ A; 2RF0 A; 3QWX X; 4GBQ A; 1AWO A; 1X69 A; 1Y57 A; 1UUE A; 1SHF A; 3M0P A; 2GGR A; 1FMK A; 4RTZ A; 1BU1 A; 4RUG A; 2V1R A; 1RLP C; 2DM1 A; 4QT7 A; 2EGE A; 2EYX A; 4JJB A; 2MCN A; 1RUW A; 1X27 A; 2VWF A; 3EG2 A; 4J9G A; 4HCK A; 1Z9Q A; 1YCS B; 2OAW A; 2DVJ A; 4OMQ A; 1T3S A; 3TVT A; 2JM9 A; 2DRK A; 4RTV A; 2F2X A; 2DNU A; 3UF4 A; 1AZG B; 1NYF A; 3RBB B; 4AG1 C; 1PRL C; 2CH4 W; 3M0Q A; 1OOT A; 2RPN A; 2HDA A; 4AFZ C; 2K79 A; 4M4Z A; 1WDX A; 2J6F A; 2KEA A; 1CSK A; 2AZS A; 1JXO A; 1OEB A; 1NEB A; 4FSS A; 2EPD A; 4LUD A; 2EBP A; 2C0I A; 2CRE A; 2RQW A; 2DA9 A; 2FPE A; 3LH5 A; 4LUE A; 4J9C A; 2KR3 A; 1T3L A; 2AK5 A; 5FWB A; 1GCQ C; 2HEQ A; 1SRL A; 2LZ6 B; 5FWC A; 4J9F A; 3JV3 A; 1SRM A; 2LP5 A; 2JS0 A; 4ORZ A; 1YWO A; 2EGA A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4OVA A; 3WVE B; 4EIK A; 4E7I A; 3VYG A; 5GMK m; 2DL3 A; 3OS1 A; 1HK9 A; 2HBP A; 3G71 T; 4J7F A; 2P0K A; 4BE2 A; 5I21 A; 3VS1 A; 3OA6 A; 4C8Q C; 2D9T A; 4OGC A; 2QEX T; 1VYV A; 4MDX A; 3SFM A; 3FDR A; 1YWP A; 1M8M A; 4C5G A; 5GMK l; 3V8L A; 1BK2 A; 4LXC A; 1Y96 B; 4DOW A; 2GFU A; 5IAY A; 2GF7 A; 1K8A R; 3JB9 D; 4IKF A; 5GAN f; 4C8Q A; 2ZPE B; 3J80 E; 1T0J A; 1QP3 A; 4FW2 A; 4D6W A; 5GAN 8; 1QVG P; 2KGT A; 2V8I A; 3HHT B; 1RAH B; 1NYG A; 1N8R C; 1ARK A; 4XU1 A; 1FWZ A; 4EPC A; 4M78 C; 5GAN d; 3PVL A; 1PKT A; 4RTT A; 4OML A; 3OYY A; 2F1L A; 1M8V A; 2HZY A; 3I35 A; 3OYF A; 2B8A A; 4PFP A; 2NUZ A; 5LJ3 e; 3R6N A; 4CRI A; 3CXC A; 1YJN A; 2K57 A; 1WX6 A; 1X75 C; 2VVK A; 4M75 E; 4OP0 A; 4Y92 A; 1YJN Q; 2IG0 A; 1UGR B; 3OYA A; 1WQW A; 1KSW A; 2QYZ A; 1GXI E; 3UWN A; 4HVW A; 1BCM A; 4IIO A; 2CGH A; 1W70 A; 2ED1 A; 3QYH B; 2A3L A; 3VUB A; 3OYC A; 1ABO A; 2EKO A; 1UGP B; 3E2U A; 4M78 B; 1XJW B; 3EG1 A; 4E7Z A; 4R56 A; 2A37 A; 2F69 A; 3OS0 A; 1M2O A; 4JUV A; 2RMO A; 8AT1 B; 2KRS A; 3OSS C; 1VQL A; 1JRI A; 2L8D A; 1VQL Q; 3JCM V; 3WVD B; 1QW1 A; 4OMP A; 1K1Z A; 1M3A A; 4NS5 A; 5GAN 2; 1YN8 A; 2M51 A; 1WHH A; 3LWI A; 1MMG A; 3CMA A; 2QDY B; 5FU7 C; 3GPL A; 3CMA Q; 1QLY A; 4J6X A; 3JCM Q; 2I0N A; 2QAS A; 2QTV A; 3OSV A; 1HYO A; 3MCA B; 1MMD A; 3QJ6 A; 2E64 A; 3UAT A; 4PKC C; 5GAN 5; 2NUT B; 1RI0 A; 4PJL A; 4QVZ A; 3PVQ A; 4M7D F; 3HRS A; 4QVC A; 4HCZ A; 2COW A; 3SB2 A; 4XTY A; 3V8J A; 1UGV A; 1UDL A; 1W6X A; 2VXE A; 5AYF A; 4M7A B; 4J83 A; 3M0R A; 1AEY A; 3PMT A; 3QYG B; 4RG2 A; 3L2V A; 3FJ5 A; 2KVQ G; 1GBR A; 2D0Q B; 4M78 E; 1KD1 C; 2A36 A; 2XD0 A; 1Q81 C; 3CPF A; 1BIB A; 2CZ1 B; 2LQK A; 1E6H A; 1M90 C; 2QEX A; 4C0D C; 4X34 A; 1IHV A; 2YLC A; 1ACM B; 1JJ2 A; 2QEX Q; 1PCX A; 2BE9 B; 3BW1 A; 5A0G A; 2QQB A; 4Z02 A; 2JZ2 A; 2JUF A; 3EH2 A; 3VS7 A; 1AT1 B; 2F5T X; 4M77 D; 4DEX A; 3A1P A; 1HXD A; 3VS6 A; 4AT1 B; 2DBM A; 5GAO m; 1PRM C; 4GLK A; 3AHU A; 3EHQ A; 3CCU T; 2OTL T; 5LJ3 d; 1AVZ C; 4KRT A; 1JEG A; 1QKX A; 4QQG A; 2DTH A; 1R77 A; 2EIF A; 3ZBD A; 2IIM A; 2W0Z A; 4KH1 B; 4C0D B; 1PHT A; 4C92 G; 3SEM A; 5GAO l; 1M1K U; 1SG5 A; 2LJ1 A; 2DAQ A; 1EX4 A; 1TG0 A; 4OB3 B; 4A4K A; 2XHC A; 4RKU E; 3HP9 A; 4B6M A; 1Q82 U; 2DBK A; 5EG2 A; 3JCM e; 1NM7 A; 1VA7 A; 1QWF A; 2ABL A; 4JLG A; 1VQK T; 2E70 A; 2ROL A; 5KYY B; 3OB9 A; 4J9B A; 3VS2 A; 2EWN A; 3OYN A; 1K73 C; 3JCM c; 2O2O A; 4ME7 A; 1O75 A; 4M7A E; 3NTI A; 1WHK A; 5IXB A; 1JXM A; 2P4T A; 2LCS A; 5KYW A; 2C0T A; 4K11 A; 4GY5 A; 4LE9 A; 4PL6 A; 1SF9 A; 3C12 A; 3QJY A; 2CZ0 B; 2BZ8 A; 1FMW A; 2KK4 A; 3V8K A; 4C8Q F; 3LGL A; 2F2V A; 3LW5 E; 1N5Z A; 4RTY A; 3CC4 A; 3UT1 A; 1HJD A; 1IGU A; 1GFD A; 4AFU C; 4BE0 A; 4DA4 A; 3CC4 Q; 1TXQ A; 2P0P A; 1IHW A; 4QW2 A; 1GFC A; 1PG5 B; 1ZUU A; 2O88 A; 2OX7 A; 1TTH B; 1YJW T; 3MEW A; 3DKM A; 1H3Z A; 3OW2 A; 4Z89 A; 1QVF A; 2CP3 A; 4JRK A; 1D3B A; 4X9D A; 2X3X D; 1SHG A; 1IGQ A; 4JRI A; 1M27 C; 3GNF B; 2A08 A; 2EYZ A; 1ZBJ A; 2VV5 A; 4PJM A; 3RR6 A; 3QG1 A; 1Q7Y U; 5J39 A; 3CCL T; 2D1X A; 4BAC A; 2ZZD A; 2YLB A; 2F2W A; 2AKL A; 4XK8 E; 2E12 A; 4FU6 A; 3CCJ T; 5GAM e; 2KYB A; 2RF0 A; 3ER0 A; 1AWO A; 2YXY A; 1X69 A; 1WJR A; 4C0G A; 1Y57 A; 4M77 C; 4N0A A; 5GMK e; 1UUE A; 1BIA A; 3CXC P; 2L3R A; 2EQK A; 4J6Y A; 2QQS A; 4RTZ A; 1BU1 A; 3EGD A; 1VQP T; 2DM1 A; 2EGE A; 5GAN g; 4IUR A; 2WAC A; 2MCN A; 1OU9 A; 1G3W A; 2VWF A; 2LRQ A; 5KCH A; 2JTM A; 2MWP A; 1WJQ A; 5HK3 A; 4M77 A; 2DRK A; 2PUO B; 3EGD B; 4F7U A; 3HL8 A; 4RTV A; 1TU0 B; 4PJO G; 1NYF A; 3OYH A; 2CH4 W; 3QO3 A; 1OOT A; 2HDA A; 2MI6 A; 2DEU A; 2K79 A; 1K9M C; 2NUP B; 3X28 B; 2FZC B; 3EFO B; 1QMC A; 2VGM A; 1NEB A; 1NE8 A; 3OYB A; 3A8L B; 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1G83 A; 1Q7Y R; 2E3H A; 1Z9Z A; 3RDV A; 2DTI A; 2MOX A; 2YRV A; 3A98 A; 5GJW B; 5KCO A; 1D1A A; 1M4Z A; 5ECA A; 2JOY A; 5GAO q; 1YJW Q; 1UB4 A; 3EG3 A; 1YNZ A; 2SRC A; 3L42 A; 3TCJ A; 4D8D A; 3QDF A; 2J7I A; 3ULR B; 1H3H A; 3BDL A; 2GBQ A; 3CCL A; 3CCS T; 3CCL Q; 4ZGE B; 3CXC S; 4D8K A; 3VJP A; 4EMK C; 3X26 B; 2RQU A; 1UEC A; 1H8K A; 2JVV A; 1VQ9 T; 4PJN A; 4BI3 A; 1U3O A; 2LT1 A; 3FB9 A; 4XAX B; 1VQP A; 3RKX A; 1VQ4 T; 1QCF A; 4KH0 B; 1X6G A; 4YTL A; 3C94 A; 2A7Y A; 1VQP Q; 5IHN A; 3L2Z A; 5LJ3 h; 1Y96 A; 2KT1 A; 4EMK A; 2EJF A; 2DXB A; 5DLQ E; 3CCV T; 4HVU A; 2OTJ T; 3CCQ T; 1S1N A; 1PWT A; 4FYV B; 2KRM A; 1BBZ A; 3H8Z A; 5HY6 A; 1W2B S; 4EMK B; 5CIU A; 1QVP A; 4JZ4 A; 5LJ5 d; 1FX7 A; 1PD1 A; 1YIT T; 1IXD A; 1Q86 C; 1D1B A; 3P8H A; 3G7Z A; 4QQ6 A; 2LTO A; 3EG9 B; 2RH2 A; 1RLQ C; 4Z8A A; 3M53 A; 2K7A A; 3UDC A; 2C06 A; 2HBW A; 4EMG A; 2LX9 A; 4JRP A; 4LDX A; 4J8O A; 1U1T A; 3QZ5 B; 3MP6 A; 4A4H A; 2K3Y A; 1ZUY A; 4F16 A; 2CDT A; 3BDU A; 1TUC A; 5CKD A; 4ZN1 A; 3GF5 A; 1H64 1; 2JNG A; 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