The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
57
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structure length |
57
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Chain Sequence |
TLFVALYDYEAWTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
SH3 domain specificity
rcsb |
| molecule keywords |
Tyrosine-protein kinase Fyn
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| molecule tags |
Transferase/protein binding
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| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
12
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| structure length |
57
|
| sequence length |
57
|
| chains with identical sequence |
C
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2012-01-10 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5EC7 A; 2DJQ A; 2K6D A; 2AK5 A; 1KSW A; 1X2Q A; 2KT1 A; 2KXD A; 3NMZ C; 1X6G A; 1K76 A; 2AZV A; 2ROT A; 1BU1 A; 2K3B A; 2L3S A; 2DX1 A; 1E7O A; 3PVL A; 4M4Z A; 4OMM A; 1SEM A; 2SRC A; 4HXJ A; 3VS5 A; 4LUE A; 1G2B A; 5I22 A; 1PRM C; 1YWO A; 1H3H A; 1ZX6 A; 1AWW A; 1KFZ A; 1M3B A; 4AFU C; 1NYG A; 3JV3 A; 3TSZ A; 2QDL A; 3SHW A; 5L23 A; 2DL8 A; 2KYB A; 1ZUK A; 2LP5 A; 2JM9 A; 4LE9 A; 4DEX A; 1TUC A; 5FWB A; 2RQT A; 2JM8 A; 1NYF A; 2AZS A; 1CSK A; 3QWX X; 1OOT A; 2DF6 A; 1VYU A; 3C0C A; 1RUW A; 4LUD A; 1HJD A; 1S1N A; 2L3P A; 3NGP A; 1UE9 A; 3VS4 A; 2DL5 A; 1WDX A; 3VS3 A; 2EYW A; 3I5R A; 2RNA A; 1T3S A; 2NUZ A; 4F14 A; 1M8M A; 2BZ8 A; 2W0Z A; 5FW9 A; 1AOJ A; 3A98 A; 1J3T A; 1SHG A; 1WXU A; 2KRN A; 1QKW A; 1MUZ A; 2O88 A; 4CC4 B; 1W70 A; 1AWO A; 2CUD A; 1TG0 A; 2B86 A; 3I9Q A; 2K7A A; 3PE0 A; 2RQU A; 2GTO A; 1WX6 A; 4AG2 C; 1AEY A; 2CSI A; 4IIO A; 4GLM A; 2FPD A; 2CDT A; 1ZBJ A; 5IHK A; 2KXC A; 2RN8 A; 1VA7 A; 1CKB A; 1UGV A; 4CC2 A; 3I35 A; 1X43 A; 2HCK A; 2LMJ A; 4K11 A; 2HEQ A; 1U3O A; 3M0R A; 1QLY A; 3GBQ A; 1ZSG A; 3H0F A; 1V1C A; 3KFV A; 2HDA A; 1GCQ C; 5IXB A; 1H92 A; 1QCF A; 2EW3 A; 2FRW A; 2RQW A; 5HCK A; 1SRL A; 4JJC A; 2EQI A; 1I0C A; 1PKS A; 2FRY A; 2DL3 A; 5GJW B; 4RTV A; 2J7I A; 2H8H A; 2KT8 A; 1WYX A; 4Z88 A; 1Y57 A; 1WFW A; 2FG0 A; 2BTT A; 3CQT A; 1BBZ A; 1NG2 A; 4RTU A; 1ZLM A; 1OV3 A; 2J6O A; 3ZL7 C; 1M27 C; 2CSQ A; 1SHF A; 2L3Q A; 3M0P A; 1WXT A; 1GCP A; 4Z89 A; 1OEB A; 2F2V A; 4EIK A; 2J05 A; 4JPB W; 1RLQ C; 1RLP C; 2IIM A; 1YWP A; 1LCK A; 1UJY A; 1OPL A; 2W10 A; 3VRY A; 4J9B A; 2JXB A; 3FJ5 A; 1WA7 A; 2L2P A; 2JMC A; 3LH5 A; 3PVQ A; 1UUE A; 1AWJ A; 2A36 A; 2JW4 A; 3VS6 A; 2FPF A; 2G6F X; 4OMO A; 4RTT A; 4E6R A; 1JXM A; 1Z9Q A; 1PNJ A; 3H41 A; 2KGT A; 2J06 A; 4AFS C; 3H0H A; 3M0U A; 1K9A A; 2YDL A; 4JJB A; 1W1F A; 3RBB B; 1M3C A; 1NEB A; 4F16 A; 4WCI A; 1UHF A; 4OMP A; 1TUD A; 1SSH A; 3VS0 A; 2O31 A; 3M0T A; 2YUO A; 1BB9 A; 1QWE A; 2PZ1 A; 4J9C A; 3TVT A; 5IH2 A; 2XMF A; 2YSQ A; 4LN2 A; 2KBT A; 3EG1 A; 1XOV A; 2D1X A; 1AD5 A; 2O9V A; 2LQN A; 1X27 A; 1A0N B; 4J9E A; 3VS7 A; 4AG1 C; 2FEI A; 2A28 A; 2OAW A; 2KRO A; 1E6H A; 2E5K A; 2KRS A; 1NM7 A; 2RPN A; 1FMK A; 1GCQ A; 2P4R A; 4D8D A; 2C0T A; 4JZ3 A; 1B07 A; 2LJ3 A; 1HD3 A; 4JZ4 A; 5GJV B; 1T0H A; 2CT4 A; 2KNB B; 2DA9 A; 3UA6 A; 2YT6 A; 2D8J A; 4Z8A A; 2K79 A; 4F17 A; 1EFN A; 4HVV A; 2ED0 A; 4AFQ C; 1HSQ A; 2O2O A; 2VVK A; 2VWF A; 1U06 A; 3RNJ A; 2JTE A; 3EG2 A; 2FO0 A; 1GBQ A; 2OJ2 A; 1GL5 A; 5I11 A; 1RI9 A; 3NPF A; 1PHT A; 2RMO A; 1WLP B; 4OMN A; 2L0A A; 2J6K A; 1VYV A; 2SEM A; 3EGU A; 1I1J A; 2LNH B; 5IHI A; 2JS2 A; 2AKL A; 1PRL C; 2EYZ A; 2YUQ A; 1VYT A; 2DM1 A; 4J9H A; 1QWF A; 3EHR A; 3H0I A; 2DRK A; 2ECZ A; 1I07 A; 2ABL A; 1GRI A; 4RUG A; 1ABO A; 1AZG B; 2O9S A; 1WI7 A; 2CUB A; 2F2X A; 1M30 A; 3VS2 A; 2DMO A; 2DBK A; 1UHC A; 1JEG A; 2KR3 A; 1T3L A; 2K9G A; 2ENM A; 2DYB A; 1MV0 B; 2J6F A; 3M0Q A; 4RTZ A; 4ORZ A; 2K2M A; 2NWM A; 4RTX A; 1T0J A; 2A37 A; 1KJW A; 2LCS A; 1UEC A; 1K4U S; 1FYN A; 1GFC A; 1PKT A; 3EHQ A; 2LZ6 B; 3O5Z A; 4DEY A; 1NLO C; 2DBM A; 2M0Y A; 3REB B; 2V1Q A; 2DIL A; 2F2W A; 4KRT A; 1JQQ A; 4ZNX A; 1AVZ C; 4RTY A; 4CC3 A; 1K0S A; 1IO6 A; 1B3Q A; 5FWC A; 3REA B; 1AZE A; 4J9F A; 2PNI A; 4Y92 A; 3ULR B; 2EGC A; 1GFD A; 2RQR A; 1WXB A; 4OML A; 1UDL A; 2X3W D; 4CC7 A; 4HCK A; 1K0X A; 5IXF A; 3TSW A; 4HVU A; 2DLP A; 2YUP A; 2KE9 A; 1ZUU A; 4J9G A; 2CH4 W; 2OI3 A; 2VKN A; 4QT7 A; 2M51 A; 2LJ1 A; 2BZX A; 3UAT A; 4R0K A; 1QKX A; 1SRM A; 2LJ0 A; 4IIM A; 2KYM A; 3VRZ A; 2MIO A; 2JMA A; 2EPD A; 2KRM A; 2YUN A; 2EGA A; 3R6N A; 2GQI A; 1U5S A; 3THK A; 2DL7 A; 2KEA A; 3M0S A; 1WIE A; 2FPE A; 3EG0 A; 2X3X D; 3UA7 A; 1UJ0 A; 3U23 A; 2EBP A; 1NLP C; 1Z9Z A; 2BZY A; 2EKH A; 4OMQ A; 2DNU A; 2DRM A; 1N5Z A; 2D8H A; 2EYX A; 1KIK A; 3EG3 A; 1Y0M A; 2HSP A; 1ZUY A; 4J9D A; 4AFZ C; 4FSS A; 2GNC A; 4RTW A; 1UTI A; 3I5S A; 1PWT A; 2ESW A; 2C0O A; 2PTK A; 1JO8 A; 1G83 A; 1YP5 A; 1YN8 A; 2I0N A; 4A63 B; 1AWX A; 3QWY A; 2MOX A; 2A08 A; 2DVJ A; 1K1Z A; 3NHN A; 1X69 A; 2V1R A; 1X6B A; 2GTJ A; 2MCN A; 1H8K A; 2DL4 A; 1X2K A; 2LQW A; 1JU5 C; 2GBQ A; 2EGE A; 1GBR A; 4JJD A; 3UF4 A; 4X1V A; 5ECA A; 2CRE A; 2GGR A; 2EVR A; 1NEG A; 5IHN A; 2D0N A; 4LNP A; 2RF0 A; 1UG1 A; 1YNZ A; 3VS1 A; 2ED1 A; 1BK2 A; 2AKK A; 2EYY A; 1M3A A; 4D8K A; 4ESR A; 1ARK A; 4GBQ A; 2JT4 A; 2JS0 A; 1MV3 A; 3SEM A; 2CH4 A; 1YCS B; 2LX7 A; 3IQL A; 1CKA A; 2DE0 X; 1E6G A; 2CT3 A; 2RQV A; 1UFF A; 2C0I A; 2ROL A; 1JXO A; 4HVW A; 1ABQ A; 4J9I A; 1OPK A; 1W6X A; 1SPK A; 2HBW A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2ZPG B; 1TUG B; 2KT1 A; 2KXD A; 1VQ8 A; 1X6G A; 1BU1 A; 2E3H A; 1VQL T; 3CC4 A; 1VQN T; 3H8Z A; 1YIJ Q; 2L3S A; 4OMM A; 1SEM A; 4HXJ A; 3VS5 A; 3OW2 S; 2JUF A; 5I22 A; 1H3H A; 5D6Y A; 3TSZ A; 3OYC A; 2RD1 A; 2QDL A; 1U8R A; 1OYX A; 1I8F A; 1Q95 G; 1ZUK A; 2HL3 A; 2PUK B; 2LT1 A; 2FHD A; 2K5F A; 2YWW A; 2JM8 A; 2QK0 A; 4LDY A; 1Q7Y U; 5GAN g; 1K9M U; 1MMD A; 1HJD A; 1QVF S; 3LX7 A; 4GLK A; 3JB9 J; 3EH1 A; 4PLL A; 2EYW A; 4HCC A; 3I5R A; 4OGC A; 2VXF A; 1K8A U; 1U1T A; 3CMA Q; 2COZ A; 2VUB A; 1VQ9 Q; 3MJX A; 1WXU A; 2KRN A; 5FU6 B; 1QKW A; 3CCR T; 1YHQ T; 1BI2 A; 5GAN d; 1AWO A; 2CUD A; 4HT8 A; 1VQO Q; 3I9Q A; 2GTO A; 1WX6 A; 3E2U A; 4IIO A; 4J83 A; 4GLM A; 4LDU A; 1R0B G; 4BDY A; 3A8H B; 3HRT A; 3OSV A; 2JNG A; 1JRI A; 3HRU A; 4XU1 A; 4DOW A; 2EJG A; 2LC4 A; 5HY6 A; 3P8H A; 1CKB A; 1X43 A; 1GXI E; 3QYH B; 4II1 A; 4OVA A; 3CCU A; 4V2S A; 2HCK A; 1I81 A; 1F1B B; 4EMG A; 4VUB A; 3M0R A; 3CME Q; 2RB6 A; 2JZ2 A; 3PIP A; 3KFV A; 2IG0 A; 3G71 A; 1QCF A; 2EW3 A; 4PNO A; 1EZZ B; 4KGZ B; 1QVF P; 4F7U A; 1WQ7 A; 2DL3 A; 3NTK A; 4RTV A; 1KQ1 A; 1WYX A; 1Y57 A; 6AT1 B; 1WFW A; 1YJW Q; 5GMK j; 3JB9 G; 1YJN T; 4RTU A; 3UT1 A; 5A0L A; 2J6O A; 5FRN A; 3PT9 A; 1SHF A; 3P8D A; 4ZN1 A; 2A0F B; 4KUI A; 4Z89 A; 4M75 B; 3GIB A; 4FM4 B; 1M1K C; 4PFZ A; 4E7L A; 1YWP A; 1UJY A; 2W10 A; 4QW2 A; 4XTV A; 2KK4 A; 1VQ8 Q; 1TXQ A; 4KGV B; 4KGX B; 2RJF A; 1N9S A; 2CYZ B; 2LQ8 A; 4M75 E; 4IUP A; 5J26 A; 1AWJ A; 2JW4 A; 3VS6 A; 3WXM B; 3CC4 Q; 2OTL T; 4M77 E; 4IUQ A; 2RO0 A; 1PNJ A; 2J06 A; 5GAN 2; 3RBB B; 1M3C A; 2O31 A; 3M0T A; 1BB9 A; 4QQ6 A; 4J9C A; 3TVT A; 5GAO q; 2XMF A; 4M78 B; 3SDZ A; 3M4G A; 3M4Y A; 1LVK A; 1KQ2 A; 3EG1 A; 4N4G A; 2L89 A; 3RDV A; 5CR2 A; 1AD5 A; 2O9V A; 1X27 A; 2CP6 A; 4BE2 A; 3M5A A; 4IUU A; 2FEI A; 4DOV A; 2OAW A; 2KRO A; 1RAI B; 1D1A A; 2KRS A; 3RMQ A; 3V8K A; 4M78 E; 4D8D A; 2P4R A; 4F7U B; 1G3W A; 3M57 A; 2E1H A; 3OYK A; 4EDU A; 1KC8 C; 4FYW B; 1M2V B; 5GJV B; 2KNB B; 1AT1 B; 2YT6 A; 2D8J A; 1VQM A; 3VV0 A; 1EFN A; 1IRX A; 1MND A; 3HP9 A; 4HVV A; 1G3Y A; 2EWN A; 4N4H A; 1R0C B; 5GAN 6; 1VQK A; 1IXD A; 3JCM X; 1KD1 C; 1HSQ A; 3E19 A; 5KE2 A; 2VWF A; 1QCN A; 2JTE A; 2D6F A; 2DTO A; 1JJ2 A; 4WF2 A; 2R5M A; 4DQ2 A; 1RI9 A; 3NPF A; 2OTJ A; 1XQH A; 1QVG S; 3NFC A; 3R6O A; 2X9H A; 2IPO B; 2J6K A; 1RL2 A; 5GAM g; 3X26 B; 2LNH B; 3D7S B; 2JS2 A; 4IUR A; 4C5G A; 3L2Q A; 1OUL A; 2K3X A; 2RJE A; 1PRL C; 2DK3 A; 2QGG A; 3QPH A; 2M1H A; 3EHR A; 1K73 C; 2QTV A; 4IKF A; 1OI1 A; 2JTM A; 1I07 A; 1GRI A; 1JB0 E; 5GAN 7; 3G71 Q; 4RCB A; 5LL6 S; 4B6M A; 3G4S Q; 2O9S A; 4FL6 A; 1M90 C; 3J80 E; 3PMT A; 3GP8 A; 4BY6 B; 1YCY A; 1VQ6 Q; 3BW1 A; 5GAM d; 2MWP A; 2KR3 A; 2ZGW A; 4FW2 A; 4KH1 B; 1AHJ B; 1MV0 B; 5GAN 8; 3M0Q A; 3JB9 F; 2K4Y A; 4ORZ A; 1M2O A; 1YI2 A; 2PVD B; 2NWM A; 2QAZ A; 2NLU A; 2F69 A; 1FYN A; 3HL8 A; 1VUB A; 3G6E A; 4DBR A; 5KYN A; 2M0Y A; 3REB B; 4C5E A; 2COW A; 3CCE A; 4OB3 B; 4M7D G; 4FSX A; 1QP3 A; 1JQQ A; 4ZNX A; 3DB4 A; 2ZPB B; 5IN1 A; 4OP0 A; 4M7A E; 1IO6 A; 2OAU A; 1D0Y A; 2DXT A; 3REA B; 1TTH B; 1W2B A; 4Y92 A; 4C92 D; 1EIF A; 3EFO B; 3JCM V; 1PC0 A; 4JLI A; 1QMC A; 2H3J A; 1BKB A; 4HCK A; 2OX7 A; 2DLP A; 2YUP A; 2KE9 A; 4J9G A; 2VKN A; 2C06 A; 2M51 A; 2BZX A; 5KCO A; 1SRM A; 4C92 F; 4MZP A; 4A4E A; 2RHI A; 3VRZ A; 2MIO A; 2JMA A; 2RH2 A; 1RAH B; 5CKD A; 2K5L A; 2XK0 A; 5C6S A; 2EGA A; 3R6N A; 4PFO A; 4J7F A; 1WGS A; 4AMC A; 2KEA A; 2KVQ G; 1WHM A; 2M0O A; 2X3X D; 4FCY A; 4PJO E; 2GFU A; 3OYN A; 3QII A; 2BZY A; 2EKH A; 3FEO A; 1SF9 A; 2DRM A; 3HTR A; 4HT9 A; 2BKD N; 1KIK A; 4J7I A; 1VQP T; 1VQK Q; 3A8O B; 4AFZ C; 3CXC A; 1YIJ T; 1UTI A; 2ZPH B; 2ESW A; 1Y71 A; 2C0O A; 3QYG B; 1G83 A; 2YXY A; 1KHC A; 1Q7Y C; 4C92 C; 1LNX A; 1K9M C; 2A08 A; 3MP8 A; 1X69 A; 2RJC A; 2V1R A; 1FMW A; 2LQW A; 4JRP A; 2NYS A; 2EGE A; 3NTH A; 3QKJ A; 4MDW A; 2EJF A; 3QZ5 B; 1V76 A; 1C0M A; 4PJJ A; 1UG1 A; 2NUP A; 1IB8 A; 1QP2 A; 4XU2 A; 1WHL A; 1BK2 A; 1S72 A; 3VUZ A; 2E10 A; 4D8K A; 2GQV A; 3OYA A; 1TU0 B; 5KYU B; 2JS0 A; 3HSB A; 3CMA T; 2LX7 A; 1VQ4 A; 1E6G A; 2RQV A; 5GAN 4; 4A4G A; 3HRS A; 1NE8 A; 3OYI A; 1KC8 R; 4HVW A; 1VQO T; 4J9I A; 4NL2 A; 5CCA A; 3M0U A; 5EC7 A; 2R5A A; 4RCC A; 1ZSZ C; 2WAC A; 1KD1 R; 1X2Q A; 4IUV A; 1PD1 A; 3CCE Q; 2IVW A; 2P0P A; 4M7D F; 5IAY A; 5HKC A; 2QQ9 A; 1E7O A; 4XU3 A; 4QVD A; 3PNW C; 1KHI A; 3CME T; 1G2B A; 1PRM C; 3JSC A; 1AWW A; 1D0X A; 4AFU C; 4C92 A; 2LRQ A; 2JM9 A; 5GMK h; 2LCC A; 2E4H A; 2F1L A; 3MP6 A; 3N5B B; 2DYI A; 2EIF A; 1K73 R; 5FWB A; 5EG2 A; 3F70 A; 1WZO A; 1Q86 U; 1OZ3 A; 2NUP B; 2VYT A; 3QWX X; 4JUV A; 1D0Z A; 1OOT A; 2DF6 A; 1YJW T; 4HA8 A; 2JTF A; 3FDR A; 2BUD A; 1M90 R; 5LJ3 f; 2XDB A; 2LNV A; 2WSE E; 3SWN C; 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