The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
57
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structure length |
57
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Chain Sequence |
TLFVALYDYEAWTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Tyrosine-protein kinase Fyn
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| publication title |
SH3 domain specificity
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| molecule tags |
Transferase/protein binding
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| total genus |
12
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| structure length |
57
|
| sequence length |
57
|
| chains with identical sequence |
C
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2012-01-10 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1OEB A; 3NGP A; 2RNA A; 1HD3 A; 4AFU C; 1CKA A; 1T3S A; 3SEM A; 5IXB A; 3NHN A; 3RNJ A; 2LCS A; 2EGE A; 1AWX A; 1UDL A; 2JXB A; 1WXB A; 2RQW A; 2K7A A; 2DRM A; 1QWE A; 3ULR B; 5HCK A; 2FPE A; 1OOT A; 2RMO A; 1G2B A; 2A08 A; 2BTT A; 1WX6 A; 1NYG A; 2EGA A; 4HVU A; 1K76 A; 2O88 A; 1WA7 A; 2B86 A; 2C0I A; 1NG2 A; 5IHN A; 2EGC A; 4QT7 A; 1UTI A; 1Z9Z A; 2DRK A; 2ED1 A; 1YWP A; 4RUG A; 1SHG A; 4X1V A; 2DBK A; 3NPF A; 4LN2 A; 1SPK A; 3I9Q A; 2L2P A; 2O9S A; 3PVQ A; 2X3W D; 1UG1 A; 4AFS C; 2VKN A; 1UEC A; 2J05 A; 4GLM A; 2A36 A; 1PHT A; 2V1R A; 1H92 A; 2C0O A; 2D1X A; 2EVR A; 2GTJ A; 2FEI A; 4RTT A; 2DLP A; 1ZLM A; 1JEG A; 3M0P A; 1WLP B; 1AEY A; 1NYF A; 1GBQ A; 3VS3 A; 2YUO A; 3EGU A; 3SHW A; 4M4Z A; 1ARK A; 3VRY A; 2JS2 A; 3LH5 A; 4F14 A; 4FSS A; 1JXO A; 3VS7 A; 1I07 A; 5FWB A; 2GNC A; 1KSW A; 2BZX A; 3EHR A; 3H0I A; 4JPB W; 2KRM A; 2JMA A; 2KXC A; 2JMC A; 1I1J A; 2LJ1 A; 4JJC A; 1H8K A; 2EYW A; 4LUD A; 1AOJ A; 4OML A; 2DIL A; 2DX1 A; 1A0N B; 1GCQ A; 1PRM C; 1NEB A; 1HJD A; 2GGR A; 2FPD A; 2VWF A; 1CSK A; 2YUQ A; 4JJD A; 1SRM A; 2CH4 A; 2EW3 A; 3GBQ A; 4JJB A; 2J06 A; 2O2O A; 3VS5 A; 2NUZ A; 1M27 C; 2MOX A; 2FO0 A; 2EYZ A; 2P4R A; 3NMZ C; 1BK2 A; 3PE0 A; 2DMO A; 2CT4 A; 1W70 A; 2KR3 A; 1K1Z A; 3M0Q A; 1K4U S; 4ORZ A; 1H3H A; 1XOV A; 3THK A; 3EG1 A; 3UF4 A; 2HEQ A; 1GFC A; 4GBQ A; 2LZ6 B; 2F2X A; 3VS6 A; 4LE9 A; 2SEM A; 4JZ3 A; 2PZ1 A; 1YCS B; 1AWO A; 3ZL7 C; 4K11 A; 4AFZ C; 1QLY A; 3C0C A; 4J9F A; 2FG0 A; 2EPD A; 3M0R A; 1AWJ A; 1RUW A; 2E5K A; 4RTW A; 1UE9 A; 1WFW A; 2EYY A; 4OMQ A; 5I11 A; 2JTE A; 1YP5 A; 1WI7 A; 1PNJ A; 2YSQ A; 1ZX6 A; 5IH2 A; 1MV0 B; 3UA7 A; 5GJV B; 1M3B A; 4CC4 B; 2ENM A; 2F2W A; 3EG2 A; 4KRT A; 4HVV A; 1TUC A; 4WCI A; 2YUN A; 1JO8 A; 1ZUK A; 3UA6 A; 1TG0 A; 2KT8 A; 1J3T A; 2I0N A; 2LQW A; 2GTO A; 2J7I A; 2D0N A; 4F16 A; 4Y92 A; 4AFQ C; 1KIK A; 2VVK A; 4ESR A; 5IXF A; 1K0S A; 4CC2 A; 2RQR A; 4LNP A; 3M0S A; 2RQT A; 3U23 A; 1MUZ A; 2KNB B; 2OJ2 A; 2NWM A; 1ZSG A; 1NLP C; 2W0Z A; 1GL5 A; 1VYT A; 3H41 A; 2BZ8 A; 4HVW A; 4CC3 A; 4D8K A; 1X27 A; 1WXU A; 2KYM A; 2V1Q A; 1K0X A; 2KRS A; 1WYX A; 1QCF A; 2DF6 A; 2EYX A; 3VS4 A; 1T0H A; 3A98 A; 1SEM A; 1AZG B; 1U5S A; 3EG0 A; 4Z8A A; 4AG1 C; 3TSZ A; 1IO6 A; 1EFN A; 4OMM A; 1NM7 A; 1WIE A; 3I5S A; 1SRL A; 3IQL A; 2RQU A; 1GCQ C; 3VS0 A; 1X6B A; 2EKH A; 2AZS A; 4D8D A; 3VS2 A; 1KFZ A; 3EHQ A; 2CH4 W; 5I22 A; 2M0Y A; 1E7O A; 2D8H A; 2HCK A; 1AZE A; 1Y0M A; 2K79 A; 4LUE A; 4DEX A; 2KGT A; 1X2Q A; 1RI9 A; 1ZUY A; 3H0F A; 2A28 A; 1VYU A; 5IHK A; 1W1F A; 1UHC A; 2GBQ A; 4F17 A; 1ABO A; 4Z88 A; 3TSW A; 3PVL A; 1X2K A; 2DL3 A; 1ZBJ A; 1VYV A; 2ECZ A; 1BU1 A; 2FPF A; 1VA7 A; 1NEG A; 4J9D A; 2LP5 A; 1RLQ C; 1UUE A; 2EQI A; 2PTK A; 2K6D A; 1UGV A; 4J9B A; 1HSQ A; 4RTX A; 3REB B; 2AKL A; 1M30 A; 2CSI A; 1MV3 A; 4IIO A; 5EC7 A; 1M3C A; 1ABQ A; 1X69 A; 2ABL A; 5GJW B; 1AVZ C; 1NLO C; 3CQT A; 1UJY A; 2J6F A; 4Z89 A; 2HDA A; 1GFD A; 1T3L A; 2F2V A; 4RTV A; 2DL5 A; 2FRW A; 3H0H A; 2JM9 A; 1GBR A; 2OAW A; 1ZUU A; 2DA9 A; 3QWX X; 2DL8 A; 1V1C A; 2AKK A; 2YT6 A; 2XMF A; 3O5Z A; 2K2M A; 1I0C A; 2LMJ A; 1GCP A; 2KEA A; 2H8H A; 2O9V A; 2PNI A; 1M8M A; 2FRY A; 4AG2 C; 2O31 A; 1QWF A; 2L3Q A; 4J9E A; 1N5Z A; 2L3P A; 2BZY A; 1BBZ A; 1BB9 A; 2AK5 A; 2X3X D; 1QKX A; 3M0U A; 1Y57 A; 2JM8 A; 2DBM A; 1U06 A; 1X6G A; 1KJW A; 2GQI A; 2DJQ A; 2MCN A; 2CDT A; 1E6H A; 2CT3 A; 3QWY A; 4J9G A; 3I5R A; 1K9A A; 3VS1 A; 1FMK A; 2W10 A; 1Z9Q A; 2QDL A; 1X43 A; 1S1N A; 1JXM A; 4RTZ A; 2ED0 A; 3UAT A; 2DVJ A; 1B07 A; 5ECA A; 1GRI A; 2CSQ A; 2LX7 A; 2JW4 A; 3EG3 A; 4J9H A; 3VRZ A; 4J9C A; 2A37 A; 1OV3 A; 1G83 A; 1PKS A; 5FW9 A; 2IIM A; 3JV3 A; 2YUP A; 2RF0 A; 1B3Q A; 2ESW A; 1JQQ A; 1OPL A; 2DNU A; 2YDL A; 2CRE A; 4HXJ A; 4A63 B; 1T0J A; 2SRC A; 2RQV A; 1W6X A; 2K9G A; 4RTU A; 2DE0 X; 4IIM A; 2ROT A; 2KT1 A; 2ROL A; 1QKW A; 1WDX A; 2DL7 A; 2J6K A; 2KYB A; 3FJ5 A; 2OI3 A; 4ZNX A; 4OMN A; 2CUB A; 2EBP A; 1RLP C; 2D8J A; 2RPN A; 4RTY A; 2K3B A; 2LJ0 A; 1AD5 A; 1PWT A; 2LJ3 A; 3TVT A; 2DYB A; 1PRL C; 1E6G A; 5L23 A; 1LCK A; 2CUD A; 2LNH B; 5IHI A; 2HBW A; 2G6F X; 3KFV A; 2J6O A; 1FYN A; 1JU5 C; 5FWC A; 1U3O A; 1UFF A; 2JS0 A; 2KRO A; 4J9I A; 1UJ0 A; 2L0A A; 4R0K A; 1PKT A; 2C0T A; 1WXT A; 1M3A A; 1TUD A; 4HCK A; 2KXD A; 2JT4 A; 4JZ4 A; 4DEY A; 4OMP A; 2DL4 A; 2M51 A; 4OMO A; 2KE9 A; 3R6N A; 3M0T A; 1SHF A; 2MIO A; 2HSP A; 2LQN A; 3REA B; 2KBT A; 2KRN A; 1YWO A; 4EIK A; 1SSH A; 2DM1 A; 1YN8 A; 2RN8 A; 1AWW A; 4CC7 A; 1UHF A; 1CKB A; 1OPK A; 2L3S A; 4E6R A; 3RBB B; 1YNZ A; 3I35 A; 2AZV A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4C8Q G; 3NGP A; 2RNA A; 3CC2 A; 3A8H B; 1HD3 A; 1T3S A; 3SEM A; 2K5L A; 2LCS A; 1M90 C; 3L2Z A; 2PQW A; 5KCH A; 2RQW A; 2K7A A; 2MWP A; 1YJW Q; 2DK3 A; 2XDB A; 1OYX A; 2RMO A; 5GAN j; 6AT1 B; 2EGA A; 3RKW A; 4HVU A; 2LRQ A; 4M7D G; 1BIB A; 2V8I A; 5D6Y A; 1YJ9 T; 4JRQ A; 1HXD A; 1QVF A; 2LC4 A; 1KK7 A; 1OU9 A; 2H3J A; 4X1V A; 4RUG A; 1N9R A; 1SPK A; 3I55 A; 2L2P A; 2GFA A; 3EGD A; 1QCN A; 3PVQ A; 5GAO l; 1UG1 A; 4LD9 K; 4QQG A; 3GIB A; 3OW2 P; 1H92 A; 3S6W A; 2C06 A; 1D3B A; 1I4K 1; 2CGH A; 1TUG B; 4QQD A; 1VQ8 Q; 1YJ9 A; 2R58 A; 2RJC A; 2LNV A; 2X51 A; 3M0P A; 2QXF A; 2VXF A; 4L6V 5; 5KYW A; 4R56 A; 4E7L A; 3SHW A; 1M1K U; 5LJ5 g; 3CCR T; 1K9M R; 3UWN A; 3VS7 A; 1JXO A; 4DBR A; 4QQ6 A; 5CO7 A; 4DA4 A; 2BZX A; 3RMS A; 1K73 U; 1EX4 A; 2YLC A; 1EIF A; 5LJ3 g; 2KRM A; 3E1S A; 4VUB A; 4LDU A; 3M55 A; 1C1A A; 1WJR A; 1IZ6 A; 4JS5 A; 3D7S B; 1TS9 A; 4C0G A; 5GMK e; 3QG1 A; 2NUT B; 4M7A G; 2M16 A; 3DLL A; 2VWF A; 4RCB A; 2EJ9 A; 3CBO A; 1WHM A; 3QJ6 A; 3GLX A; 2OTL Q; 2KMT A; 2EYZ A; 4MZT A; 3OYM A; 1OQK A; 5I21 A; 2DMO A; 4EDU A; 3VJP A; 3CCS T; 1W70 A; 1W2B A; 2A3L A; 1K4U S; 4ORZ A; 1ZBX A; 3UPU A; 3EG1 A; 5GAM h; 3HRT A; 1MND A; 4M78 E; 1QVF P; 3OYB A; 5FU6 C; 3VS6 A; 4LE9 A; 2SEM A; 2DJZ A; 2RK1 A; 3G6E Q; 3CD6 Q; 1YCS B; 3G4S Q; 3ZL7 C; 3C0C A; 4OB1 B; 3CCS A; 4M7D D; 2E5K A; 3M53 A; 2E64 A; 5I11 A; 2R57 A; 2JTE A; 1M5Q 1; 2BIV A; 2XKO C; 3JB9 F; 1PNJ A; 2YSQ A; 1ZX6 A; 5A2Q E; 1ZSZ C; 3JB9 J; 2ENM A; 1WJQ A; 4HVV A; 3L2R A; 3QO3 A; 3J80 E; 2KT8 A; 3A1P A; 3I56 Q; 1VQM A; 2J7I A; 2NUT A; 1YI2 T; 3G1J A; 4F16 A; 4Y92 A; 4AFQ C; 2EIF A; 3JB9 G; 1K0S A; 1WJS A; 5L8R E; 1K9M U; 2JOY A; 3OQ5 A; 4LNP A; 2E65 A; 1PD0 A; 4XTY A; 2HBP A; 3H9N A; 2KNB B; 2OJ2 A; 2XID A; 2W0Z A; 1YI2 A; 2EAY A; 5HK0 A; 1GL5 A; 3CPW A; 3OYG A; 2D9T A; 1IB8 A; 3CCR Q; 1YJN T; 1M2V A; 4CC3 A; 1K8A R; 1WXU A; 4NS5 A; 5GAM j; 2EYX A; 3VS4 A; 3V8J A; 4XU3 A; 3RR6 A; 1UGR B; 3A98 A; 2KK4 A; 1W2B P; 4HCB A; 4PJO G; 1EFN A; 4PFP A; 4OMM A; 1NM7 A; 1YJN A; 3IQL A; 1BYM A; 2RQU A; 1TU0 B; 5GAN 2; 4LDY A; 4QVD A; 2AZS A; 3QUI A; 4UC4 A; 1VQO T; 4ZGD B; 3X24 B; 1I5O B; 5I22 A; 3HP9 A; 4PLI A; 1BKB A; 2D8H A; 3RMQ A; 5FRO A; 1RAE B; 1G3T A; 1ZUY A; 3C95 A; 3MKD A; 3QDR B; 1D09 B; 1W1F A; 4MML A; 1ZBJ A; 2HZY A; 5J3B A; 2XI9 A; 2FPF A; 2X4W A; 1VQO A; 3T9N A; 4BI8 B; 1KD1 R; 4J9D A; 3G71 T; 5GAN 6; 1RLQ C; 3WXM B; 9ATC B; 1HSQ A; 1N8R R; 1VQ4 Q; 4IIO A; 2EYQ A; 3M5A A; 4M75 E; 2ABL A; 1AVZ C; 2JTF A; 3C94 A; 1B34 B; 2QK0 A; 2Y4X A; 1SF9 A; 2DO3 A; 4RG2 A; 4X34 A; 2F2V A; 5LJ5 j; 3OBY A; 4RTV A; 2IG0 A; 3G71 A; 3H0H A; 2JM9 A; 2OAW A; 1FWZ A; 2M9U A; 1ZUU A; 2E10 A; 2DL8 A; 3ZFJ A; 3OYD A; 3OYE A; 1V1C A; 1NBE B; 5DM7 R; 3O5Z A; 4M78 B; 1GCP A; 5LJ3 j; 5GAN d; 3M59 A; 1M8M A; 4AG2 C; 2YRV A; 3L42 A; 4KH1 B; 4RG8 A; 3L2W A; 2H3E B; 4J8O A; 2BZY A; 2E5Q A; 5GAN f; 1Q7Y R; 2YWW A; 1QQJ A; 3P8B B; 2PU9 B; 4PK4 A; 4M75 D; 4FM4 B; 3X28 B; 2EQK A; 2CDT A; 2V8K A; 4J9G A; 3I5R A; 4PNO A; 3VS1 A; 2QDL A; 5A0D A; 1JXM A; 4PJO D; 3UAT A; 2DVJ A; 4M7D A; 2P0K A; 2JW4 A; 4BDY A; 3VUZ A; 3CCE T; 1OV3 A; 1JQQ A; 1OPL A; 1IXD A; 3P8H A; 2DNU A; 5EG2 A; 1JBM A; 2SRC A; 3G7Z A; 2MK5 A; 5J26 A; 2HL5 C; 4RTU A; 2DE0 X; 2LQK A; 3MHX A; 4OMN A; 3OYF A; 2EBP A; 3CCE A; 2QQS A; 2PVO B; 5LL6 S; 3EGX B; 5FLX E; 3S3N A; 2LJ3 A; 3TVT A; 2DYB A; 1KD1 U; 4C0F A; 1E6G A; 1LCK A; 2LNH B; 2QDY B; 5GAN 4; 2J6O A; 3AT1 B; 1JU5 C; 1N8R U; 5GMK i; 3LLR A; 1UFF A; 2RI2 A; 4J9I A; 8AT1 B; 2L0A A; 5GAN 5; 1YHQ T; 2K5I A; 1VQP Q; 1PCX A; 4DEY A; 2DL4 A; 2O01 E; 2KE9 A; 3R6N A; 3MEU A; 4M7A A; 1SHF A; 2HSP A; 1D1B A; 2QTX A; 3MEV A; 4N0A A; 2KRN A; 4XK8 E; 2Y90 A; 4F7U A; 2DM1 A; 3OYK A; 2ZGW A; 2RN8 A; 2CZ7 B; 3EFO A; 3QKJ A; 1IGU A; 2JUF A; 4MDW A; 2O4X B; 4J7I A; 1YHQ A; 2RJF A; 1G3S A; 3RBB B; 4NL3 A; 3SB2 A; 3I35 A; 2CKK A; 4XTW A; 2EQJ A; 2OX7 A; 1CKA A; 1YIT Q; 3INZ A; 3NHN A; 3RNJ A; 1Q7Y U; 3GP8 A; 2QEX T; 3R6O A; 1C0M A; 2RHY A; 4FU6 A; 3TEE A; 3ULR B; 1QWE A; 3CBP A; 2E6N A; 5HCK A; 1UGP B; 3CCM T; 1VQ6 Q; 4IKF A; 3TU4 K; 1NYG A; 2RJD A; 4FYW B; 3FLG A; 2C0I A; 4J6Y A; 5IHN A; 2NUP B; 1M1K C; 2EGC A; 1Q86 R; 3MP1 A; 3BW1 A; 1UTI A; 1Z9Z A; 1YBY A; 1K73 C; 2GCX A; 3NPF A; 4LN2 A; 3I9Q A; 4FYY B; 3CCM A; 4BI4 A; 4N4G A; 3JCM b; 1MHN A; 1UEC A; 2J05 A; 4GLM A; 2A36 A; 2V1R A; 3PFS A; 2FEI A; 3LYI A; 1MGQ A; 4RKU E; 4RTT A; 1BIA A; 4BDZ A; 5GAM d; 3CPW S; 2EWN A; 3DB3 A; 3JSC A; 1AEY A; 3OS2 A; 4IUP A; 1GBQ A; 1LNX A; 3VS3 A; 2L8D A; 4OGE A; 2YUO A; 1QP3 A; 3EGU A; 4LD6 A; 2O4X A; 4F14 A; 3OMC A; 4FSS A; 2QYZ A; 5GAN h; 3QYG B; 4DBQ A; 2YXY A; 1I07 A; 5GAM f; 2QA4 T; 1XNI A; 3EHR A; 3H0I A; 2LDM A; 4IUV A; 1U8R A; 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