The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
|
sequence length |
63
|
structure length |
63
|
Chain Sequence |
GGTGVTLFVALYDYEAITEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVD
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
SH3 domain specificity
rcsb |
| molecule keywords |
Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Fyn
|
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
10
|
| structure length |
63
|
| sequence length |
63
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2009-04-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2FPE A; 1BBZ A; 1UJY A; 2W10 A; 5GJW B; 3UA6 A; 1H92 A; 2A37 A; 1GBR A; 5I22 A; 1UE9 A; 4DEY A; 2EYW A; 4LUD A; 1GL5 A; 3EHQ A; 2EKH A; 4HVU A; 4Y92 A; 1MV0 B; 2F2W A; 4JJB A; 4F14 A; 1X27 A; 4JPB W; 4JZ4 A; 1H3H A; 1WIE A; 4GBQ A; 1PKS A; 3VS1 A; 1PHT A; 3TVT A; 4ESR A; 1OV3 A; 3A98 A; 3UA7 A; 4AG1 C; 2ENM A; 1YCS B; 3EGU A; 2AZS A; 1VA7 A; 1U06 A; 2LQW A; 1X6B A; 1CSK A; 2DM1 A; 2FG0 A; 1JQQ A; 2L3P A; 2DA9 A; 1B3Q A; 1T3L A; 2FRW A; 1AEY A; 2A08 A; 2SEM A; 1ZLM A; 2OAW A; 1A0N B; 5FW9 A; 1AWO A; 4OMP A; 1JU5 C; 2FEI A; 1V1C A; 2V1R A; 2JW4 A; 4HVV A; 2DRK A; 2RN8 A; 1B07 A; 2K2M A; 1K0S A; 1OPL A; 1T0H A; 2JM9 A; 2ECZ A; 2EVR A; 1ZUK A; 1Y0M A; 1M8M A; 2JS2 A; 1SHF A; 1AWJ A; 2KRN A; 1OOT A; 1I1J A; 2BZY A; 1AWX A; 1FYN A; 2D8H A; 2KRS A; 1RLP C; 1UTI A; 2I0N A; 2PZ1 A; 2DE0 X; 2BTT A; 3VRY A; 3SHW A; 1Z9Q A; 2HSP A; 1CKA A; 1WI7 A; 1QWF A; 1WXU A; 4AG2 C; 4R0K A; 4IIM A; 2J6O A; 3EG0 A; 1K0X A; 2CSQ A; 2RQW A; 3REB B; 2GQI A; 1WLP B; 2CH4 W; 1M27 C; 1QLY A; 2YUQ A; 2RNA A; 2ROT A; 4J9B A; 2E5K A; 2CSI A; 2K3B A; 2SRC A; 4HCK A; 1UUE A; 2KR3 A; 1NM7 A; 1WYX A; 1NLO C; 4Z8A A; 3M0Q A; 1GCP A; 4J9H A; 4OMN A; 4RUG A; 1YNZ A; 2C0I A; 2H8H A; 1E6G A; 2F2V A; 2W0Z A; 1TUD A; 2DBK A; 4F16 A; 1HD3 A; 2KEA A; 3ZL7 C; 3EHR A; 3I5S A; 1FMK A; 4RTW A; 2K6D A; 1BU1 A; 5IHN A; 1AOJ A; 2AZV A; 1AVZ C; 1RUW A; 2LZ6 B; 2DX1 A; 4OML A; 1MUZ A; 4LUE A; 5IHK A; 2DMO A; 4D8D A; 2MCN A; 3I9Q A; 3VS7 A; 2J6F A; 2RF0 A; 4WCI A; 4A63 B; 4CC4 B; 1X6G A; 1ZUY A; 1PKT A; 1AD5 A; 2ABL A; 3EG1 A; 4HVW A; 5GJV B; 2BZ8 A; 3FJ5 A; 4AFS C; 2P4R A; 1M3A A; 1YP5 A; 5FWC A; 1W6X A; 2MOX A; 4CC3 A; 3NHN A; 2YUO A; 3KFV A; 1E6H A; 4K11 A; 2DBM A; 2K79 A; 2EQI A; 2IIM A; 2L2P A; 2VWF A; 4ZNX A; 1SSH A; 1X43 A; 2J7I A; 1OPK A; 2PTK A; 1UGV A; 1E7O A; 1WA7 A; 2O9S A; 4AFQ C; 2DVJ A; 3TSW A; 2XMF A; 3EG2 A; 1WXB A; 1SRL A; 2RQU A; 3GBQ A; 3QWX X; 1EFN A; 2K9G A; 2GNC A; 1NLP C; 1QKX A; 2DF6 A; 3UAT A; 1KIK A; 2YSQ A; 4HXJ A; 1I07 A; 4E6R A; 4DEX A; 4X1V A; 1TG0 A; 1KSW A; 1Y57 A; 1SEM A; 2GTJ A; 4Z88 A; 3ULR B; 4D8K A; 3NGP A; 2JS0 A; 4CC2 A; 1QKW A; 2AK5 A; 1UFF A; 5IHI A; 4J9C A; 1ARK A; 1PRL C; 1GFC A; 3JV3 A; 5IH2 A; 3H0F A; 3VS2 A; 2EYX A; 2OI3 A; 1SRM A; 2MIO A; 1TUC A; 4JJC A; 2EW3 A; 1JXM A; 1U3O A; 2JXB A; 2KNB B; 2HDA A; 1VYT A; 2LJ0 A; 2EGE A; 1WFW A; 1RI9 A; 2O9V A; 1NYG A; 3TSZ A; 2KE9 A; 1BK2 A; 3VRZ A; 4F17 A; 2OJ2 A; 1IO6 A; 1K1Z A; 1T3S A; 2RQV A; 1MV3 A; 4RTX A; 1AWW A; 2HBW A; 1K9A A; 4JJD A; 5ECA A; 2KXC A; 2EPD A; 2PNI A; 3VS4 A; 4GLM A; 2KT1 A; 2NWM A; 1UDL A; 1X2Q A; 2FO0 A; 3VS0 A; 4CC7 A; 5IXB A; 3CQT A; 1M3B A; 4J9I A; 1ZUU A; 1H8K A; 1K4U S; 2YUN A; 2J6K A; 3U23 A; 2AKK A; 2L3S A; 1UEC A; 1T0J A; 4QT7 A; 2VKN A; 1JEG A; 2RQR A; 2D1X A; 3NPF A; 2FRY A; 2GTO A; 1KJW A; 2KGT A; 1M30 A; 2LJ1 A; 2EYY A; 5IXF A; 1AZG B; 3THK A; 4RTU A; 3PVQ A; 3I35 A; 1GRI A; 2AKL A; 2J05 A; 4FSS A; 3C0C A; 2DL5 A; 2L0A A; 1GCQ C; 2X3X D; 1ZBJ A; 2YT6 A; 2JM8 A; 1KFZ A; 2KXD A; 1S1N A; 2NUZ A; 2FPD A; 2JMC A; 2RMO A; 1YWO A; 1M3C A; 2CRE A; 1N5Z A; 1G83 A; 1JO8 A; 2VVK A; 2DLP A; 2K7A A; 2KRM A; 2CH4 A; 2GBQ A; 2C0O A; 2ED1 A; 1ZX6 A; 3H41 A; 2C0T A; 5I11 A; 3M0S A; 1UJ0 A; 2KRO A; 4AFZ C; 3VS6 A; 2X3W D; 1W70 A; 4IIO A; 4J9E A; 4RTZ A; 4OMM A; 2LP5 A; 1UHC A; 2CUB A; 2KYM A; 1K76 A; 2KBT A; 2M0Y A; 3M0R A; 1HSQ A; 2FPF A; 2KT8 A; 1WX6 A; 2EGC A; 3VS3 A; 1AZE A; 1QWE A; 3UF4 A; 1YWP A; 4ORZ A; 2DL3 A; 3R6N A; 3QWY A; 2O2O A; 2D0N A; 3PVL A; 3LH5 A; 2CT4 A; 2O88 A; 4M4Z A; 1WDX A; 5L23 A; 1GCQ A; 1PWT A; 5EC7 A; 2ROL A; 2A28 A; 2ED0 A; 4Z89 A; 5FWB A; 1CKB A; 1UHF A; 4RTV A; 2BZX A; 1GBQ A; 2DL8 A; 1SHG A; 1Z9Z A; 3NMZ C; 4LNP A; 4LE9 A; 2F2X A; 3O5Z A; 3REA B; 1X2K A; 2DIL A; 2LMJ A; 2QDL A; 2EBP A; 3RBB B; 2A36 A; 3PE0 A; 1SPK A; 3VS5 A; 2LNH B; 3RNJ A; 1W1F A; 2CT3 A; 1XOV A; 2JMA A; 2HCK A; 2B86 A; 1J3T A; 1G2B A; 1QCF A; 3M0P A; 2KYB A; 1NYF A; 2G6F X; 4J9G A; 1PNJ A; 2LX7 A; 2M51 A; 4KRT A; 1HJD A; 2CUD A; 2LQN A; 2V1Q A; 2ESW A; 2JT4 A; 2LJ3 A; 4RTY A; 2RQT A; 4J9D A; 2LCS A; 2DJQ A; 1JXO A; 3IQL A; 2JTE A; 1ZSG A; 2CDT A; 3M0T A; 3I5R A; 1YN8 A; 1VYV A; 2YDL A; 2O31 A; 3H0H A; 4OMO A; 2EGA A; 2J06 A; 1I0C A; 2EYZ A; 3SEM A; 2DNU A; 4AFU C; 3H0I A; 4J9F A; 1BB9 A; 1U5S A; 2HEQ A; 5HCK A; 4JZ3 A; 1GFD A; 3EG3 A; 1X69 A; 3M0U A; 4OMQ A; 1ABO A; 4RTT A; 1OEB A; 2DYB A; 2DL7 A; 2DRM A; 1NEG A; 2YUP A; 1NG2 A; 1RLQ C; 2DL4 A; 1PRM C; 4LN2 A; 2L3Q A; 1ABQ A; 2D8J A; 1UG1 A; 4EIK A; 2RPN A; 1WXT A; 1NEB A; 2GGR A; 1VYU A; 1LCK A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3OYM A; 3RMS A; 3QPH A; 1BBZ A; 3EFO A; 5GJW B; 4LD6 A; 2HZY A; 1YJW T; 3JCM J; 4DEY A; 4M7A F; 3OA6 A; 1GL5 A; 3EHQ A; 2JVV A; 2LTO A; 1MV0 B; 2A3L A; 3MEU A; 4JJB A; 4GBQ A; 4J83 A; 1PHT A; 1HYO A; 3HRS A; 1OV3 A; 3UA7 A; 3RKW A; 3D7S B; 3EGU A; 1RAH B; 1U06 A; 4Y28 E; 4ZGJ B; 2FG0 A; 1JQQ A; 3CME T; 2SEM A; 5GMK l; 2JN0 A; 1A0N B; 3CCE Q; 4FYV B; 4OMP A; 5IAY A; 2XK0 A; 4HCB A; 2GCX A; 2QGG A; 1Q81 C; 1T0H A; 2VXE A; 1ZUK A; 4XU1 A; 3OSS C; 1M8M A; 1SHF A; 1FYN A; 2P0K A; 4XTU A; 3L2R A; 2I0N A; 2PVD B; 2DE0 X; 2BTT A; 3OW2 S; 4FM4 B; 2HSE B; 3E19 A; 3SHW A; 3EH2 A; 3RES A; 2HSP A; 1WHK A; 1ZHI A; 3OMC A; 2QAS A; 2YLC A; 4R0K A; 5GAM j; 2GQI A; 4N0A A; 2KDS A; 1QVG S; 5GAO q; 1YIJ Q; 5GAN g; 3A8H B; 2YUQ A; 2ROT A; 4J9B A; 1Y7X A; 3GIB A; 4KBM B; 2OTL Q; 2EIF A; 3UDC A; 5HY6 A; 1TSF A; 2KR3 A; 1WYX A; 1M9S A; 4OMN A; 3MEA A; 3EG9 B; 2M0O A; 1E6G A; 5GAM d; 2F2V A; 1TUG B; 4O5V A; 5DLQ E; 3OYA A; 3MJX A; 1HD3 A; 2KEA A; 2HL3 A; 3BY7 A; 4F7U A; 1Q7Y R; 1FMK A; 4RTW A; 1VQP Q; 1ACM B; 4E7I A; 1P92 A; 1AOJ A; 4JUV A; 4E7J A; 2LZ6 B; 2CZ6 B; 4OML A; 1U8R A; 1MUZ A; 4E2F B; 1UGS B; 4LUE A; 4IUQ A; 3VS7 A; 3SWN A; 2DZ9 A; 1ZA2 B; 3CPW P; 2DIQ A; 2JJ9 A; 4J6W A; 3MEV A; 4WCI A; 4CC4 B; 2PUO B; 2PVG B; 1VQO T; 4ZN3 A; 4FW1 A; 5GAN 5; 4A4F A; 5LJ3 j; 4YTL A; 4F7U E; 1ZUY A; 4PFO A; 1H64 1; 1AD5 A; 3JRZ A; 4FT2 A; 2BZ8 A; 2V8J A; 3FJ5 A; 1OUL A; 3JSC A; 2P4R A; 5FWC A; 2MOX A; 4CC3 A; 3KFV A; 2YLB A; 2QQ9 A; 4K11 A; 2K79 A; 2LQ8 A; 2IIM A; 3EGX B; 4X9D A; 2ZPI B; 2ZPE B; 5LJ5 h; 1NJI C; 4BY6 C; 3JCM W; 1OPK A; 3CCJ A; 4E7K A; 5D7U A; 4AFQ C; 2DVJ A; 3URG A; 5L8R E; 5LJ3 d; 1YHQ T; 3G71 T; 3QWX X; 1EFN A; 2F69 A; 3A8O B; 5FU6 B; 5GAN 6; 1QKX A; 1SG5 A; 1BIA A; 3PGG A; 4X1V A; 1M1K C; 1KSW A; 1Y57 A; 3LGF A; 2Y4X A; 4L6V 5; 4Z88 A; 3LGL A; 4CC2 A; 3JCM h; 4C5G A; 5IHI A; 4J9C A; 3BW1 A; 3JB9 J; 1N8R C; 3HKS A; 2ZGW A; 2GFA A; 5CK9 A; 1FXX A; 1QVG P; 1VYT A; 1RAA B; 3MKD A; 1NYG A; 3TSZ A; 1BK2 A; 2CP6 A; 1WJR A; 4FYW B; 4XU2 A; 3CBP A; 1K1Z A; 1MV3 A; 3QUI A; 2OAU A; 1N9R A; 1YBY A; 2KXC A; 2EPD A; 2PNI A; 3JCM c; 3EAE A; 2EAY A; 3CCS A; 4M77 G; 3QDF A; 2NWM A; 3AHU A; 2ZPB B; 1UDL A; 6AT1 B; 3JB9 I; 3CCJ T; 1LNX A; 2FO0 A; 4CC7 A; 3CCV A; 1ZUU A; 1H8K A; 4PJL A; 1KQ2 A; 2QEX T; 3JAM E; 3DLL A; 3U23 A; 3L2V A; 1O9S A; 3OBW A; 5C6S A; 2DK3 A; 3CC4 Q; 3QDR B; 2NUP A; 1LVK A; 1SSF A; 1TS9 A; 4KH0 B; 5GAN j; 1M90 C; 2M9U A; 1KC8 R; 3CCL T; 2EYY A; 1VQ4 A; 2VUB A; 4C8Q D; 4FIB A; 2Z0W A; 4F7U G; 1B34 A; 3PVQ A; 3I35 A; 4FSS A; 1PG5 B; 2AKL A; 1RAD B; 4C8Q A; 1KC8 U; 3M5A A; 3QJ6 A; 3G6E T; 2EQM A; 2YT6 A; 2I2L A; 1TWB A; 2QA4 Q; 2JMC A; 4DA4 A; 2K4Y A; 3VUB A; 5GAN d; 1RAC B; 1G83 A; 3CCS T; 5FRN A; 1ZSZ C; 5GAN 8; 2CZ0 B; 4LD9 K; 3PT9 A; 4QVD A; 2GBQ A; 3CPF A; 2C0O A; 1PC0 A; 4XTV A; 5I11 A; 5GMK h; 1UJ0 A; 4C8Q E; 4BD3 A; 2KVQ G; 2M02 A; 3C4S A; 4M7D C; 2DFU A; 3M56 A; 3RMQ A; 3KXT A; 2E12 A; 1PM3 A; 2LNV A; 2KYM A; 1PCX A; 2QTX A; 4ANJ A; 4QKU A; 2XDD A; 2KT8 A; 2FPF A; 1OQK A; 1WX6 A; 3P8H A; 4HKE A; 4KGV B; 1KQ1 A; 3OQ5 A; 1VQ8 A; 1YWP A; 4EMK B; 2GFU A; 1VQ4 T; 4JS4 A; 4HA8 A; 4GY5 A; 1GCQ A; 1W2B A; 2COZ A; 1PWT A; 2RJD A; 4II1 A; 1K9M C; 2ED0 A; 2X4J A; 2Y4Y A; 4OMF B; 5FWB A; 1CKB A; 1UHF A; 1S72 A; 2EFI A; 1NJI R; 1H3Z A; 1IRX A; 3NMZ C; 2JTF A; 2F2X A; 3EGD B; 1QMC A; 3CCU A; 4C0G A; 4DOW A; 2QGF B; 3RBB B; 3QBY A; 3E9F A; 1NJI U; 3RUX A; 2DER A; 2WSC E; 3VS5 A; 2LNH B; 3WVE B; 4DBH A; 3M9Q A; 2MF2 A; 2PQW A; 3LX7 A; 3A5Z B; 3HFN A; 1D0Y A; 2CZ1 B; 3QHS A; 2R57 A; 4C0D B; 2HCK A; 1VQ9 A; 1J3T A; 3CCE T; 1N8R R; 1YCY A; 1XQH A; 2M51 A; 1M1K U; 1VQ8 T; 4NL2 A; 3QYG B; 4C5E A; 5FU7 C; 3CMA A; 3OYD A; 2LQN A; 3M58 A; 2RI2 A; 2JT4 A; 4RTY A; 1N8R U; 2RQT A; 1YJ9 A; 2DJQ A; 3G1J A; 5GAO p; 3CXC S; 1C1A A; 2CP7 A; 3OYB A; 2YDL A; 4OMO A; 4O6J A; 4BDY A; 1S72 T; 3H0I A; 3VU3 C; 1RAE B; 2EJ9 A; 3MP8 A; 2EJG A; 1VQ7 Q; 2DTH A; 4C8Q F; 2BE7 D; 3GPL A; 4EMH A; 2VXF A; 3CCU T; 3HRU A; 1QP2 A; 2DL7 A; 2DRM A; 4C8Q G; 1NEG A; 1NG2 A; 1YIJ T; 4PJJ A; 2E41 A; 2O01 E; 1UG1 A; 1UGQ B; 1WXT A; 1NEB A; 3EFR A; 2OTL T; 2HAX A; 2FPE A; 1TTH B; 2W10 A; 1PD0 A; 3C94 A; 4LUD A; 2L5Q A; 4OB0 B; 1BCO A; 4HVU A; 4Y92 A; 3PTA A; 1D09 B; 1R8O B; 3MEW A; 1WIE A; 3VS1 A; 3TVT A; 1VIE A; 1M2V A; 1YIT A; 1VQP T; 3CCJ Q; 1YJ9 T; 2AZS A; 1VA7 A; 2DZC A; 5FLX E; 2LQW A; 3G7Z A; 1CSK A; 3ZBD A; 2L3P A; 2DA9 A; 4EDU A; 1ZLM A; 2V8K A; 2OAW A; 4ATO A; 2HBP A; 2RHZ A; 4HVV A; 2RN8 A; 2K2M A; 7AT1 B; 4WTO B; 4F04 B; 1OPL A; 3MO8 A; 2YRD A; 3EGD A; 2VGM A; 1G3Y A; 2OTJ A; 3OYJ A; 1AWJ A; 2KRN A; 1OOT A; 4HT9 A; 2EWN A; 2XIC A; 2PZ1 A; 5CAI A; 2QK0 A; 1VIF A; 3A8M B; 4Q5W A; 1XJW B; 1RAB B; 1KHC A; 1WI7 A; 4M78 C; 1QVF S; 1Y71 A; 2Y90 A; 5DLO A; 2RI5 A; 4M77 B; 2CH4 W; 3FC3 A; 3CXC P; 4FT4 A; 2KI7 A; 2IPO B; 3CC4 A; 2F5K A; 2SRC A; 2D9T A; 4HCK A; 1IRE B; 2HQE A; 3CCV Q; 2M1H A; 5GMK m; 3DB4 A; 1JJ2 A; 4J9H A; 4RUG A; 2C0I A; 2H8H A; 1UB4 A; 1B7T A; 5LJ5 f; 4JDS A; 4DBF A; 1K9M U; 4RG2 A; 4F16 A; 1KQS P; 3ZL7 C; 3I5S A; 1Y96 A; 3I55 A; 1MGQ A; 4A4H A; 1PSE A; 5IHN A; 1ZQ1 A; 3WVD B; 4F7U B; 1VQ4 Q; 2PVO B; 1OU8 A; 5IHK A; 4OP0 A; 4D8D A; 2MWP A; 5LJ5 g; 5KH6 A; 1FMW A; 2YHT A; 2RF0 A; 4PJO C; 1X01 A; 4AT1 B; 4KGX B; 4LDW A; 4OB2 B; 3V8K A; 4A63 B; 3CCM A; 2HL5 C; 2RHY A; 4C92 C; 2ABL A; 2DIG A; 1RAG B; 3ME9 A; 2FZG B; 1LOJ A; 3CD6 A; 2LDM A; 5GAO l; 4NS5 A; 2FZK B; 4KUI A; 2DBM A; 2FHD A; 3SD4 A; 1FX7 A; 2EQI A; 3CC4 T; 4PFZ A; 2VWF A; 1SSH A; 3SWN B; 1X43 A; 2X4Y A; 4B9X A; 1E7O A; 2FZC B; 1WA7 A; 1W2B S; 3L2Z A; 2O9S A; 4M75 C; 4PLI A; 2VV5 A; 3EG2 A; 3BDU A; 1ZA1 B; 3GBQ A; 2K9G A; 3O8V A; 2DF6 A; 1KIK A; 4DBR A; 1VQ8 Q; 2DJZ A; 4DEX A; 4BE1 A; 2DO3 A; 1YI2 A; 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