The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
63
|
structure length |
63
|
Chain Sequence |
GGTGVTLFVALYDYEAITEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVD
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| publication title |
SH3 domain specificity
rcsb |
| molecule keywords |
Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Fyn
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| total genus |
10
|
| structure length |
63
|
| sequence length |
63
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2009-04-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1SEM A; 1H92 A; 2JW4 A; 4F14 A; 3NMZ C; 4ORZ A; 2RMO A; 1ZSG A; 2EGE A; 2DRM A; 3UAT A; 2RN8 A; 1M3B A; 2DBK A; 1V1C A; 3NPF A; 2MIO A; 3H0I A; 4FSS A; 1PNJ A; 2DX1 A; 1WXU A; 4CC7 A; 3PVL A; 2DYB A; 1W70 A; 2LNH B; 4RUG A; 2J7I A; 1JXO A; 2MOX A; 2F2X A; 4ZNX A; 1PKT A; 1T0H A; 1NM7 A; 2EVR A; 1QKW A; 4AFS C; 1G83 A; 2DL5 A; 2V1R A; 2ECZ A; 4RTW A; 2AKK A; 5IXB A; 2VKN A; 1M30 A; 2I0N A; 1ABQ A; 3M0S A; 3TVT A; 4D8K A; 1I1J A; 2DLP A; 1MV0 B; 1UFF A; 1JEG A; 3I5S A; 4RTY A; 2FRY A; 3M0R A; 1AVZ C; 2HEQ A; 2CSI A; 2K79 A; 1MV3 A; 4RTT A; 4HVU A; 2SEM A; 4KRT A; 2JMA A; 1NYF A; 2FEI A; 1UJY A; 2W10 A; 1NLO C; 2LQW A; 5IHK A; 2KE9 A; 2ROL A; 4LNP A; 3LH5 A; 1E6H A; 3VS2 A; 1WDX A; 4JZ4 A; 2LJ1 A; 4CC3 A; 3CQT A; 4F17 A; 1H8K A; 2A37 A; 1ZBJ A; 1YNZ A; 4RTZ A; 3O5Z A; 1M3A A; 4IIM A; 1GL5 A; 2JXB A; 2X3W D; 3RNJ A; 2ROT A; 1W6X A; 3REB B; 2AKL A; 2J06 A; 2RQR A; 3H0F A; 2IIM A; 3H0H A; 4HCK A; 1E7O A; 1X6B A; 2KYM A; 4E6R A; 3THK A; 1M3C A; 3EG3 A; 1UHC A; 2RF0 A; 4OMP A; 1AWX A; 1PRM C; 2K7A A; 4J9I A; 2DE0 X; 1A0N B; 2D0N A; 2OI3 A; 2JM9 A; 2LX7 A; 2K2M A; 2KT8 A; 2C0O A; 3M0T A; 2KXD A; 3VS1 A; 4J9G A; 4J9B A; 2V1Q A; 4X1V A; 3M0Q A; 1ARK A; 1J3T A; 1IO6 A; 2EBP A; 4D8D A; 1LCK A; 1CKB A; 1SHF A; 2CUD A; 2FPD A; 2EYW A; 5FW9 A; 1X6G A; 3TSZ A; 1WLP B; 1WX6 A; 4AFU C; 2W0Z A; 2DL3 A; 5FWC A; 1BK2 A; 4HVV A; 2G6F X; 3I5R A; 2DL7 A; 2VVK A; 4K11 A; 2JTE A; 1UHF A; 2DL4 A; 2KBT A; 1BBZ A; 1K4U S; 1RLP C; 4AFZ C; 4Z88 A; 2AZV A; 1S1N A; 2OAW A; 1Z9Z A; 5FWB A; 3R6N A; 5IXF A; 2M51 A; 2J05 A; 1AEY A; 1RI9 A; 1JO8 A; 1UUE A; 1X69 A; 2O9S A; 3VRY A; 2J6K A; 1E6G A; 1GBQ A; 1X2K A; 3SHW A; 1OPL A; 1X43 A; 2CDT A; 2CH4 A; 1PWT A; 4J9F A; 3ULR B; 1G2B A; 3EG0 A; 2EQI A; 2EYX A; 1U06 A; 1W1F A; 1VYT A; 2AZS A; 4A63 B; 2ED0 A; 2EPD A; 1TUC A; 2EGA A; 3H41 A; 1GCP A; 4F16 A; 3QWY A; 1EFN A; 1Z9Q A; 2J6F A; 2YT6 A; 3C0C A; 4J9E A; 2DA9 A; 2DMO A; 1GFC A; 2RQT A; 3FJ5 A; 5IH2 A; 2DJQ A; 2KRM A; 2LCS A; 4AG2 C; 2A36 A; 2O2O A; 1BB9 A; 2GNC A; 3QWX X; 1BU1 A; 2HCK A; 1K0S A; 1KSW A; 2YUO A; 2HDA A; 2P4R A; 2XMF A; 2K9G A; 2K3B A; 2KEA A; 4J9H A; 1GCQ A; 2DBM A; 4QT7 A; 2GGR A; 4LUE A; 1ZUK A; 1YWO A; 1WI7 A; 5IHI A; 3EHQ A; 1AOJ A; 1JXM A; 1K76 A; 5IHN A; 3PVQ A; 1CKA A; 2RQW A; 1OEB A; 3IQL A; 1SPK A; 3TSW A; 1RLQ C; 2D1X A; 2JMC A; 4AG1 C; 1T3S A; 1HD3 A; 5ECA A; 2LJ0 A; 2X3X D; 2L3P A; 1WFW A; 3M0U A; 3EG2 A; 1NEB A; 2DVJ A; 2RQU A; 1VYV A; 3VRZ A; 4Z89 A; 2BZX A; 3NHN A; 5GJW B; 1QWF A; 4OML A; 2H8H A; 2KXC A; 4RTV A; 1M8M A; 2SRC A; 2KNB B; 2M0Y A; 2BTT A; 1ZLM A; 1PHT A; 1I0C A; 2VWF A; 4JJD A; 1T0J A; 2PZ1 A; 2FPF A; 4OMO A; 3SEM A; 2ABL A; 3NGP A; 2DRK A; 1AWO A; 1RUW A; 4RTU A; 1HJD A; 2D8H A; 2HSP A; 4J9C A; 4RTX A; 1UJ0 A; 4OMM A; 2MCN A; 1GCQ C; 1PRL C; 1T3L A; 1HSQ A; 1UDL A; 1OOT A; 1OPK A; 1AWJ A; 2KGT A; 1SSH A; 1YP5 A; 2BZ8 A; 3EHR A; 4JJB A; 1XOV A; 1SHG A; 2NUZ A; 1AZG B; 2BZY A; 2J6O A; 2RNA A; 1Y0M A; 1QLY A; 1ZUY A; 3VS0 A; 1U5S A; 2KRS A; 2K6D A; 1FMK A; 5EC7 A; 4EIK A; 2CT3 A; 3UF4 A; 2F2V A; 2JT4 A; 2HBW A; 4WCI A; 2DM1 A; 4JZ3 A; 2PTK A; 3UA7 A; 2EGC A; 4CC4 B; 2GBQ A; 4GBQ A; 2JS2 A; 1VYU A; 2DIL A; 3ZL7 C; 3U23 A; 4IIO A; 2ED1 A; 1NYG A; 3GBQ A; 2EYY A; 3VS7 A; 4OMN A; 2DF6 A; 1NEG A; 1YN8 A; 3I35 A; 1UGV A; 3I9Q A; 2FO0 A; 2PNI A; 2B86 A; 2F2W A; 2FRW A; 2E5K A; 2KR3 A; 2YSQ A; 5I11 A; 2CUB A; 2DNU A; 1GBR A; 2GQI A; 2L3S A; 2LZ6 B; 2KYB A; 1M27 C; 2KT1 A; 5I22 A; 1AZE A; 1AD5 A; 2RPN A; 1YCS B; 1K9A A; 1I07 A; 1JQQ A; 2EYZ A; 3REA B; 4LE9 A; 4OMQ A; 2YDL A; 3EG1 A; 3UA6 A; 2L2P A; 1AWW A; 1SRM A; 1UTI A; 2FG0 A; 2A08 A; 2LQN A; 1SRL A; 4JPB W; 4GLM A; 4LUD A; 1KIK A; 4J9D A; 1TUD A; 1WYX A; 2YUQ A; 1QCF A; 2EKH A; 1NG2 A; 4LN2 A; 4DEY A; 1FYN A; 1Y57 A; 1NLP C; 4DEX A; 2AK5 A; 3EGU A; 2A28 A; 1CSK A; 2DL8 A; 2CT4 A; 3VS4 A; 3PE0 A; 2KRN A; 2CH4 W; 5GJV B; 1K0X A; 2LJ3 A; 2GTO A; 2GTJ A; 3VS5 A; 2EW3 A; 1WXT A; 4JJC A; 2L0A A; 1QKX A; 1YWP A; 2JS0 A; 4HVW A; 2RQV A; 1KJW A; 1WA7 A; 1PKS A; 1U3O A; 3VS3 A; 5HCK A; 3RBB B; 1QWE A; 5L23 A; 2L3Q A; 1OV3 A; 2OJ2 A; 1MUZ A; 4HXJ A; 2YUN A; 1KFZ A; 3M0P A; 2KRO A; 2FPE A; 2ENM A; 2YUP A; 1ABO A; 1X2Q A; 1TG0 A; 2C0I A; 2ESW A; 4AFQ C; 2LMJ A; 2D8J A; 1UEC A; 2C0T A; 4CC2 A; 2JM8 A; 3VS6 A; 1VA7 A; 1ZUU A; 3A98 A; 4Y92 A; 1N5Z A; 3JV3 A; 1X27 A; 1GFD A; 1B3Q A; 1JU5 C; 4M4Z A; 4ESR A; 1WXB A; 2NWM A; 2O9V A; 3KFV A; 1H3H A; 1UG1 A; 1ZX6 A; 1B07 A; 2CRE A; 1UE9 A; 2LP5 A; 2O88 A; 4R0K A; 2O31 A; 1K1Z A; 2QDL A; 1WIE A; 4Z8A A; 1GRI A; 2CSQ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3UWN A; 1ZSZ C; 1ZQ1 A; 2V26 A; 3HRT A; 3A8G B; 4JLI A; 1YIT Q; 2JW4 A; 1H92 A; 3M9Q A; 3JCM h; 1M4Z A; 3CC4 Q; 3CCR A; 2ATC B; 3CBP A; 4J5Y A; 1WJS A; 2EGE A; 5CK9 A; 3FEO A; 2QAZ A; 3VKI A; 1Q81 R; 1QVF P; 1OU8 A; 4FSS A; 5FRO A; 2LQ8 A; 2DYB A; 3EFO B; 2KI7 A; 5LJ3 d; 2LNH B; 3OQ5 A; 4RUG A; 2F2X A; 4ZNX A; 4JDS A; 1T0H A; 5CVI A; 1NM7 A; 2EVR A; 4AFS C; 3OYJ A; 2AHJ B; 3QZ9 B; 4HKE A; 2DXB A; 2YLB A; 2VKN A; 1G3Y A; 2MPX C; 2I0N A; 4PJJ A; 1MND A; 4D8K A; 3CCM Q; 2RB6 A; 2DLP A; 3LH0 A; 2QEX T; 1UFF A; 1IGQ A; 1QVP A; 1Q7Y C; 3I5S A; 1PSE A; 1ZSZ B; 3OW2 S; 3PIO A; 1TU0 B; 1WQ7 A; 1VQP T; 2EKO A; 2K79 A; 1BI0 A; 4RTT A; 3CME A; 4X9C A; 2SEM A; 1C6V X; 1RAA B; 3MCA B; 2W10 A; 2RJE A; 3S3N A; 1U1T A; 4P5N A; 4JRI A; 1MMD A; 1QW1 A; 4M77 D; 3QG1 A; 3CCM T; 3JB9 F; 2LJ1 A; 3HRS A; 3RMQ A; 1VQ6 Q; 1ZBJ A; 4BDY A; 4RTZ A; 3O5Z A; 4N0A A; 3TRE A; 3WVE B; 1RAE B; 3CC7 Q; 4KUL A; 2WAC A; 5CKF A; 2DEU A; 2AKL A; 4O6J A; 3H0H A; 1OUL A; 1E7O A; 4E6R A; 3CBM A; 2AIR B; 3CCE Q; 3CCU A; 2R57 A; 2KT8 A; 3BDL A; 2C0O A; 4C8Q D; 1LJO A; 2JTF A; 4X1V A; 1PSF A; 4D8D A; 2DTI A; 1SKU B; 2CUD A; 3VYH B; 2FPD A; 5FW9 A; 1PD1 A; 3OYY A; 1X6G A; 3TSZ A; 1M90 R; 4LDW A; 3OS2 A; 2E65 A; 2DL3 A; 5FWC A; 4HVV A; 5DLO A; 2DL7 A; 4J7F A; 4EMH A; 1B7T A; 2DL4 A; 1BBZ A; 3OYF A; 3J7A F; 1F1B B; 1FX7 A; 2AZV A; 1S1N A; 2OAW A; 3SWN A; 5IXF A; 2J05 A; 1VQ7 T; 4OB3 B; 3VRY A; 4E7S A; 4F7U A; 5GMK e; 1VQL T; 1E6G A; 5GAN f; 3NTK A; 1VQ4 Q; 1X43 A; 4OB1 B; 4PLL A; 1PWT A; 4XTY A; 5A0L A; 4YTL A; 2XHC A; 2XIC A; 3RUX A; 3SB2 A; 2EGA A; 2GFA A; 1JBM A; 1M2O A; 2DA9 A; 2PUO B; 1M1K U; 2RQT A; 1N8R U; 2DJQ A; 2KRM A; 2LCS A; 3VUZ A; 4N4G A; 4E2F B; 1I5L A; 3PFS A; 4IUU A; 4JS5 A; 4V2S A; 5KYW B; 1G3S A; 4J7I A; 1K0S A; 4Y28 E; 1KSW A; 2HDA A; 2P4R A; 2XMF A; 4OF1 A; 3CCL A; 5GAN 8; 5HK0 A; 4J9H A; 5LJ3 e; 1RI0 A; 1VQ4 T; 2MMP A; 2CP3 A; 4LUE A; 1M1G A; 1RAD B; 2K2V A; 4M77 E; 5L8R E; 4A4K A; 1ZUK A; 2VB6 A; 1WI7 A; 3QZ5 B; 4XTU A; 3X24 B; 3OYI A; 3HHT B; 4JJN K; 5LL6 S; 1Q82 C; 4MDX A; 3TSW A; 3EFS A; 3MP1 A; 1RLQ C; 4AG1 C; 2M0O A; 3RKW A; 2BE9 B; 1HD3 A; 4PJO C; 3PMI A; 2XDP A; 5ECA A; 4C5H A; 4DBR A; 2L3P A; 1VQK Q; 3EG2 A; 1NEB A; 4M77 C; 2DVJ A; 2RHU A; 3VRZ A; 4Z89 A; 2LT4 A; 1I4K 1; 1RAI B; 2XK0 A; 1ZLM A; 1D3B A; 2VWF A; 4JJD A; 4JRP A; 1XTD A; 2RD1 A; 2E41 A; 4JLG A; 2HNI A; 3I55 A; 2QI2 A; 2FPF A; 4C8Q E; 3JB9 G; 4RCB A; 2DRK A; 1HJD A; 2E6N A; 4AT1 B; 4BDZ A; 2YRV A; 3JCM X; 5KYN A; 4FIB A; 1UDL A; 1KD1 C; 2DTH A; 3EH1 A; 2QTV A; 3CMA A; 1SSH A; 1UGR B; 1D1A A; 3J80 E; 4F7U F; 4LDY A; 3I56 T; 4C5G A; 1VQ9 T; 5CR2 A; 4PJM A; 5GAN j; 2RNA A; 2E3I A; 3NTH A; 4XU1 A; 1Y0M A; 4DA4 A; 1YIJ A; 4KUD K; 4KUI A; 3LWH A; 2VAS A; 4M77 B; 1TSF A; 1EIF A; 3CCJ Q; 1I81 A; 3A1P A; 3UF4 A; 5J3B A; 2F2V A; 2JT4 A; 3E1S A; 2HBW A; 2L5Q A; 3H9N A; 2JS2 A; 5IN1 A; 5GAN 5; 4ATO A; 1YJN A; 5AT1 B; 3U23 A; 4GLK A; 2HMA A; 1NYG A; 1N6A A; 2EYY A; 3VS7 A; 1VOM A; 4XAX B; 4OMN A; 1NEG A; 1YN8 A; 3I35 A; 4ZGJ B; 2RH2 A; 9ATC B; 1LNX A; 5CAI A; 3I9Q A; 2FO0 A; 2DD5 A; 2KR3 A; 2YSQ A; 3M59 A; 2EQU A; 1KD1 U; 5GAN g; 2ZAE A; 2GQI A; 2LZ6 B; 2NLU A; 3ZEH A; 2KT1 A; 2DIG A; 1OX8 A; 1KQS A; 1AD5 A; 3CCQ A; 5KYU A; 1I07 A; 2RHZ A; 2O4X B; 5KYY B; 2K57 A; 3OSS C; 2YDL A; 4M75 E; 1UGS B; 2L2P A; 3EG9 B; 1AWW A; 2FG0 A; 2A08 A; 2LQN A; 4BY6 C; 4C0D C; 3G4S T; 4GLM A; 4J9D A; 1G3T A; 1QQJ A; 1TUD A; 2IVW A; 2YUQ A; 1QCF A; 4RCC A; 2DZC A; 1YHQ T; 1NLP C; 4FW1 A; 4M75 C; 1G5V A; 2DL8 A; 3OW2 P; 1IB8 A; 2LJ3 A; 2ZPH B; 4CRI A; 5GAO q; 1YJ9 Q; 1NJI U; 3QYH B; 1C0M A; 1UGP B; 3MO8 A; 4JJC A; 2L0A A; 3CXC A; 1YWP A; 2BUD A; 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4BE2 A; 1QVG S; 1PM3 A; 5GAO m; 4MZT A; 1N9S A; 1N8R R; 1NYF A; 2FEI A; 2D6F A; 1UJY A; 1YJW A; 2KE9 A; 2ROL A; 3RDV A; 4TVR A; 1NE8 A; 3OSV A; 3VS2 A; 3QJ6 A; 1WDX A; 3L2V A; 4ELZ C; 1X01 A; 4JZ4 A; 1M2V A; 1H8K A; 2A37 A; 3CCU T; 1IRX A; 2DEQ A; 2DAQ A; 2X4J A; 4KGZ B; 2YLC A; 3JB9 J; 1M3A A; 5FU6 B; 2CYZ B; 2JXB A; 2X3W D; 4OB2 B; 1V29 B; 2M9U A; 1U1S A; 4XK8 E; 4MZM A; 3REB B; 4QQG A; 3H0F A; 2IIM A; 4HCK A; 1X6B A; 2EJG A; 2FL7 A; 4FL6 A; 4FYY B; 1M3C A; 2HL3 A; 5GAM h; 4C0Z A; 2L8D A; 2QK0 A; 1W2B S; 3HSB A; 1UB4 A; 3C4S A; 1R0C B; 1HXD A; 4J9I A; 1A0N B; 2DE0 X; 2D0N A; 2OI3 A; 2LX7 A; 4C92 A; 5KE2 A; 1M1F A; 3M0T A; 2KXD A; 4J9G A; 3GF5 A; 3JSC A; 2EBP A; 2JVV A; 4FW2 A; 4BE1 A; 2E4H A; 1QVF A; 1WX6 A; 4AFU C; 2RO0 A; 2W0Z A; 4M7D F; 1BK2 A; 3T9N A; 2G6F X; 2QEX Q; 1VQO A; 1KC8 U; 3BFM A; 5LJ3 g; 5EG2 A; 5GAO r; 2CKK A; 1BKB A; 1KHC A; 5FWB A; 3R6N A; 1K73 U; 4M7A E; 1AEY A; 1UUE A; 1VQP Q; 3HKS A; 3P8B B; 3MEV A; 1OPL A; 2CDT A; 4ELY C; 3F70 A; 1KK7 A; 2EJ9 A; 4IKF A; 3CCL T; 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