The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
|
sequence length |
63
|
structure length |
63
|
Chain Sequence |
GGTGVTLFVALYDYEAITEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVD
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Fyn
|
| publication title |
SH3 domain specificity
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Transferase
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| total genus |
10
|
| structure length |
63
|
| sequence length |
63
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2009-04-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1UUE A; 2EW3 A; 2DNU A; 1K0S A; 3TVT A; 1GBQ A; 2LP5 A; 5IHN A; 2YUP A; 1KJW A; 2DBK A; 1FYN A; 1AEY A; 2XMF A; 3O5Z A; 1ZLM A; 1JU5 C; 2DIL A; 2K6D A; 1UJY A; 1Z9Q A; 2X3X D; 1NYF A; 3IQL A; 1NEG A; 4J9I A; 1QLY A; 4D8D A; 2FPE A; 4OMP A; 2LX7 A; 4AFS C; 2DJQ A; 2CSI A; 4J9D A; 3VS0 A; 2DYB A; 1RI9 A; 2OI3 A; 1CSK A; 2FPD A; 1BB9 A; 4CC2 A; 1WFW A; 1RUW A; 2JTE A; 2CDT A; 2V1Q A; 1GCQ C; 1UHF A; 1QKX A; 1ARK A; 3NMZ C; 2M0Y A; 2BTT A; 1PKS A; 5IHI A; 2KXD A; 1PRM C; 1UEC A; 1X43 A; 3R6N A; 4Y92 A; 1AWO A; 1X2Q A; 4AFZ C; 2RQU A; 4RTW A; 3SHW A; 4AFU C; 2LQN A; 2BZ8 A; 1QKW A; 1SPK A; 1S1N A; 3U23 A; 2FO0 A; 2RPN A; 3VS1 A; 1YNZ A; 2M51 A; 2VWF A; 3H0H A; 1M30 A; 4RUG A; 1N5Z A; 2KNB B; 3I9Q A; 1AVZ C; 1ZBJ A; 5HCK A; 4EIK A; 4Z89 A; 2AK5 A; 4GLM A; 2AZS A; 4WCI A; 2EYX A; 1U06 A; 2RF0 A; 2EGA A; 4R0K A; 3VS2 A; 2F2W A; 2DL3 A; 1SRL A; 2ED0 A; 1PWT A; 2RNA A; 1PKT A; 3EGU A; 1U3O A; 1JQQ A; 4IIO A; 2DL5 A; 2DX1 A; 4HXJ A; 1Y57 A; 2JMA A; 4JZ3 A; 1E7O A; 1M3A A; 1UDL A; 2FPF A; 3THK A; 2L3S A; 2V1R A; 2OAW A; 2LMJ A; 2EYZ A; 1WYX A; 5GJW B; 3EG2 A; 2D0N A; 2K9G A; 1E6H A; 4FSS A; 1QWF A; 2DRM A; 3M0T A; 2K79 A; 2KYB A; 3EG1 A; 3M0R A; 2HDA A; 4IIM A; 2X3W D; 1VYV A; 1OPL A; 1T3S A; 2KRO A; 1I0C A; 1YN8 A; 3I5S A; 2YUN A; 2O2O A; 1VYU A; 2JM9 A; 1GRI A; 2I0N A; 2BZY A; 2GQI A; 2E5K A; 5IHK A; 1WXU A; 2MIO A; 2KRS A; 3GBQ A; 2KRM A; 4J9H A; 2GGR A; 2KT8 A; 2JM8 A; 1Y0M A; 2DM1 A; 1XOV A; 2CSQ A; 2DBM A; 3EHR A; 5GJV B; 2NWM A; 1X69 A; 2HSP A; 4Z8A A; 1YWO A; 1T0J A; 2IIM A; 3UF4 A; 4CC7 A; 2CT3 A; 2KRN A; 2L0A A; 3REB B; 4AG2 C; 4E6R A; 2DRK A; 4M4Z A; 1ABQ A; 1TUD A; 3UAT A; 2HBW A; 1IO6 A; 1WA7 A; 2W10 A; 2D8J A; 4OMN A; 2C0O A; 2KXC A; 2VVK A; 4DEX A; 4J9G A; 1ZUY A; 1UG1 A; 4J9E A; 3LH5 A; 3VRZ A; 1RLQ C; 2KEA A; 2L3P A; 2HCK A; 1ABO A; 2RMO A; 1HJD A; 2G6F X; 3EG0 A; 2C0T A; 2LCS A; 1JO8 A; 1T3L A; 3PVQ A; 2KR3 A; 2CUB A; 2DL8 A; 2RQW A; 4LUE A; 2FEI A; 2A37 A; 2BZX A; 2RQT A; 1KIK A; 4RTY A; 2DF6 A; 2FG0 A; 4J9F A; 4RTU A; 2JMC A; 4ZNX A; 3PVL A; 3I5R A; 1GFC A; 1SEM A; 1K1Z A; 4ESR A; 1W70 A; 2ROL A; 2A08 A; 3VS7 A; 5IXB A; 4JPB W; 1W6X A; 3H0I A; 1JXO A; 3H41 A; 1T0H A; 3FJ5 A; 2A36 A; 1W1F A; 1K4U S; 1HSQ A; 1OEB A; 2DL4 A; 1YCS B; 2KYM A; 4X1V A; 1ZX6 A; 3VRY A; 1QCF A; 2EGC A; 2YUO A; 3TSZ A; 1ZUK A; 5L23 A; 1EFN A; 4JZ4 A; 2EVR A; 2PTK A; 3NGP A; 1QWE A; 3QWX X; 2JT4 A; 2J6O A; 2J7I A; 1AD5 A; 1M27 C; 1HD3 A; 4JJC A; 2NUZ A; 1KSW A; 1YP5 A; 2AKK A; 1FMK A; 3A98 A; 2LQW A; 2OJ2 A; 2GBQ A; 1I07 A; 2PZ1 A; 1ZSG A; 2CUD A; 2DVJ A; 3M0Q A; 2DA9 A; 1WXT A; 1BBZ A; 3I35 A; 1AOJ A; 1UHC A; 5IXF A; 5I11 A; 2CT4 A; 4HVV A; 1OPK A; 4CC4 B; 1KFZ A; 3JV3 A; 2VKN A; 2DMO A; 1K76 A; 1UFF A; 2O9V A; 3CQT A; 3M0U A; 2MCN A; 2O31 A; 3REA B; 4F17 A; 1MV0 B; 2AZV A; 2DE0 X; 1AWX A; 2O88 A; 1OV3 A; 4OMM A; 3M0P A; 2FRY A; 1JXM A; 3EHQ A; 3SEM A; 1NLO C; 3RBB B; 1Z9Z A; 1G2B A; 1I1J A; 2EKH A; 2L3Q A; 1UJ0 A; 4LN2 A; 4JJB A; 1SHF A; 1YWP A; 1PRL C; 1WX6 A; 2YUQ A; 4F16 A; 1AZE A; 1NG2 A; 2KBT A; 5I22 A; 1WDX A; 2B86 A; 2EPD A; 1BK2 A; 1NM7 A; 2W0Z A; 2P4R A; 4AG1 C; 1GBR A; 1TUC A; 2EYY A; 3M0S A; 2GTJ A; 2F2X A; 1TG0 A; 2MOX A; 1SSH A; 3VS3 A; 2LJ1 A; 5FW9 A; 2ECZ A; 4KRT A; 1WLP B; 2JS2 A; 1NLP C; 1JEG A; 1GCP A; 2H8H A; 4RTX A; 2ROT A; 1AZG B; 1X6G A; 1K9A A; 2EBP A; 2F2V A; 3TSW A; 2LNH B; 2D8H A; 2ED1 A; 4OMQ A; 4RTV A; 1PHT A; 2ABL A; 2HEQ A; 3VS5 A; 1CKB A; 2C0I A; 2KT1 A; 1GFD A; 1H3H A; 4D8K A; 2ESW A; 1PNJ A; 2LJ3 A; 2KGT A; 2CH4 W; 4LNP A; 1ZUU A; 1M3C A; 3ZL7 C; 2JXB A; 3RNJ A; 3ULR B; 2EYW A; 1A0N B; 4RTT A; 1LCK A; 1X2K A; 1UTI A; 1NEB A; 2J06 A; 3PE0 A; 4Z88 A; 1AWW A; 1K0X A; 5EC7 A; 5ECA A; 1V1C A; 1SRM A; 1MV3 A; 4F14 A; 3NHN A; 1BU1 A; 2GTO A; 2GNC A; 3VS4 A; 2CRE A; 3UA6 A; 1NYG A; 2DL7 A; 1M8M A; 2YDL A; 2PNI A; 1B3Q A; 1CKA A; 1GL5 A; 2SEM A; 5FWB A; 1SHG A; 1X6B A; 2FRW A; 4ORZ A; 3VS6 A; 1G83 A; 4HVW A; 2D1X A; 1J3T A; 1MUZ A; 2O9S A; 4A63 B; 1RLP C; 1VA7 A; 4CC3 A; 2LJ0 A; 1WIE A; 4LE9 A; 4OMO A; 2RQV A; 3UA7 A; 2SRC A; 2RN8 A; 1U5S A; 2J6F A; 2K7A A; 4DEY A; 2KE9 A; 5IH2 A; 2K2M A; 1UE9 A; 2RQR A; 2LZ6 B; 2EQI A; 3C0C A; 1AWJ A; 2AKL A; 2J6K A; 1WI7 A; 3H0F A; 4OML A; 2L2P A; 4K11 A; 4QT7 A; 2DLP A; 2K3B A; 4HCK A; 4RTZ A; 2YSQ A; 2JS0 A; 4J9B A; 1GCQ A; 3NPF A; 1VYT A; 1UGV A; 4LUD A; 4J9C A; 1M3B A; 3QWY A; 4GBQ A; 1WXB A; 1E6G A; 1H92 A; 2QDL A; 2YT6 A; 1X27 A; 4AFQ C; 2J05 A; 4JJD A; 2A28 A; 2JW4 A; 3KFV A; 5FWC A; 4HVU A; 1OOT A; 2CH4 A; 1H8K A; 2ENM A; 2EGE A; 1B07 A; 3EG3 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2EW3 A; 3QO3 A; 1K0S A; 3L2W A; 1GBQ A; 2IG0 A; 2GFU A; 2YUP A; 1GXI E; 1AEY A; 3GP8 A; 4JS5 A; 2NYS A; 3QZ5 B; 2DIL A; 2DKG A; 2X3X D; 1NYF A; 5FU7 C; 5LJ3 g; 1IRE B; 4PFO A; 3OW2 A; 1QLY A; 4FYV B; 2DJZ A; 2K3Y A; 2DJQ A; 5IT9 E; 3FB9 A; 3CC7 T; 2XU8 A; 3QG1 A; 4M75 G; 1RI9 A; 1CSK A; 3GF5 A; 2V1Q A; 1Y96 A; 2L8D A; 1UHF A; 1KQS P; 1ARK A; 2DTH A; 5IHI A; 3SWN A; 1KQS A; 1PRM C; 3R6N A; 1MMN A; 2KAF A; 1X2Q A; 2RQU A; 4M78 E; 3EFO B; 2HKQ B; 3SHW A; 4M78 F; 4DA4 A; 2KQW A; 2PUK B; 4V2S A; 3M5A A; 3A8L B; 2ZGW A; 1YNZ A; 2COY A; 1M30 A; 2D0Q B; 3CPW P; 1YIT A; 1PM3 A; 4RUG A; 1N5Z A; 2KNB B; 4EIK A; 5HCK A; 1ZBJ A; 3HL8 A; 3SD4 A; 4BI3 A; 3A1P A; 4GLM A; 1B34 A; 2AZS A; 1TOV A; 4B9W A; 2EYX A; 3M57 A; 3VKI A; 1WJQ A; 2F5T X; 4DBR A; 2KMT A; 3A8O B; 4EMG A; 2F2W A; 2G3R A; 4M7A B; 4X34 A; 2HQH A; 4C8Q B; 4FCY A; 2ED0 A; 4KBM B; 4XTU A; 2JZ2 A; 3PNW C; 3HRT A; 2YLC A; 5CAI A; 4OB0 B; 4XU3 A; 1LJO A; 4JZ3 A; 1E7O A; 1M3A A; 2FPF A; 2M0O A; 2EAY A; 4PFZ A; 5GJW B; 3M4G A; 2D0N A; 2K9G A; 2CP5 A; 3M0T A; 1VQM T; 4IUV A; 1KHI A; 1Q82 U; 3OYF A; 5IN1 A; 5CKB A; 3TQ7 P; 4D6W A; 1QVG P; 1W4S A; 3GPL A; 5GAM e; 5CQY A; 1VYU A; 2I0N A; 1QVG A; 4PJO A; 5GAO l; 2CP0 A; 1M2V B; 5IHK A; 2MIO A; 1XJW B; 3GBQ A; 1XNI A; 3OYE A; 1KG1 A; 2KRM A; 3L2U A; 1RAG B; 1N6A A; 1Y0M A; 2DM1 A; 1XOV A; 1ZHI A; 4IUQ A; 4Z8A A; 1YWO A; 2DEU A; 3HFN A; 5GMK l; 2QK0 A; 4E6R A; 2DRK A; 4HCB A; 1Q81 C; 4BY6 B; 5KE3 A; 1VIE A; 4EMK A; 5KYW A; 4BE0 A; 4JS4 A; 1IO6 A; 4KUD K; 2JJ9 A; 2KXC A; 2VVK A; 1N8R R; 4HT9 A; 4J9E A; 4J6X A; 3HP9 A; 3LH5 A; 3VRZ A; 1RLQ C; 2L3P A; 1G8X A; 2C0T A; 8AT1 B; 3PVQ A; 1T3L A; 3QSU A; 2QQB A; 3CXC P; 1QVF A; 2DL8 A; 3MP1 A; 4MMK A; 3LGF A; 3QYG B; 4NL2 A; 1BI0 A; 1QCO A; 3E9F A; 3PVL A; 3LW5 E; 4PJO G; 1SEM A; 1YIJ A; 1MGQ A; 1W70 A; 4M7D C; 1T0H A; 3FJ5 A; 2A36 A; 1W1F A; 2PQW A; 1NPP A; 5D7U A; 5C6S A; 2P4T A; 4C8Q E; 1YCS B; 4M7A F; 4C8Q F; 4O6J A; 5GAN j; 5HK0 A; 5FRO A; 3C12 A; 2CP2 A; 3EGD B; 3GNG A; 1M27 C; 3MP8 A; 4OF1 A; 4C92 B; 2QXF A; 4QQD A; 1KSW A; 1YP5 A; 3VYG A; 4UC4 A; 3V8J A; 3CME Q; 2AIR B; 2GBQ A; 2P0K A; 4WTO B; 2DVJ A; 4J5Y A; 1TS9 A; 3GNF B; 1BBZ A; 3CD6 Q; 1UHC A; 4FIB A; 2MK5 A; 4IKF A; 3X25 B; 3OYL A; 2OAU A; 1K8A R; 4HVV A; 1OPK A; 2DAQ A; 1RI0 A; 4BDY A; 1K76 A; 3A5Z B; 3MEA A; 1YJ9 Q; 2O9V A; 1AT1 B; 3JSC A; 2DE0 X; 2EFI A; 3OYG A; 1AWX A; 2CGH A; 1D0Y A; 4F7U B; 1VQP Q; 3RBB B; 4BI4 A; 1I1J A; 4QKU A; 2L3Q A; 4JJB A; 1S72 T; 2KBT A; 1ZSZ C; 3EGX A; 2V8J A; 2W0Z A; 2WSC E; 3BW1 A; 3WVD B; 4C5I A; 2P4R A; 3RMS A; 1FX7 A; 5GAM d; 3CD6 A; 1NBE B; 4FL6 A; 4HKE A; 1YJ9 A; 1Q82 C; 2LJ1 A; 2ECZ A; 1WLP B; 2JS2 A; 1VQN A; 3SB2 A; 4JDS A; 1RAD B; 1X6G A; 3CMA Q; 2F2V A; 1K73 R; 2QDY B; 2DXU A; 2QA4 A; 2HEQ A; 1CKB A; 2KT1 A; 3MP6 A; 1M90 R; 1WHG A; 8ATC B; 2LJ3 A; 5A0G A; 3A8G B; 2HQX A; 3QKJ A; 4FW1 A; 1M3C A; 3ZL7 C; 3RMQ A; 2JXB A; 3RNJ A; 1IHV A; 2WSF E; 1LCK A; 1N27 A; 1Q7Y R; 4Z88 A; 2J06 A; 3V8K A; 1AWW A; 1WZO A; 2BKD N; 5LJ3 f; 1VQP T; 1FMV A; 1M2O A; 2HSE B; 5CKE A; 5LJ5 g; 3HHT B; 5EC7 A; 4PL6 A; 2MMP A; 2XDD A; 1YBY A; 2DFU A; 1MV3 A; 1BU1 A; 2LRQ A; 3G71 Q; 4J7F A; 3V7R A; 1MHN A; 1C6V X; 1WPY A; 2GTO A; 2VAS A; 3UA6 A; 4JLG A; 5L8R E; 1OI1 A; 3KBG A; 3RIR A; 2YDL A; 2OX7 A; 2PNI A; 1SHG A; 1X6B A; 2FRW A; 4ORZ A; 1G83 A; 3JB9 F; 3TCJ A; 5GAN 3; 1RL2 A; 4C92 F; 1RLP C; 1U1T A; 4R56 A; 4BAC A; 3VU3 C; 4LE9 A; 4M7A C; 3QDF A; 5HKC A; 5CK9 A; 1OZ3 A; 1U5S A; 5KH6 A; 1BIB A; 3I56 T; 3NFC A; 5FLX E; 5GAN e; 2XG8 D; 5IH2 A; 2K2M A; 3CCM Q; 1I8F A; 2PVG B; 2R5M A; 3OSS C; 3C0C A; 2DO3 A; 2L2P A; 4E7I A; 2DLP A; 1VQ4 Q; 2DPP B; 2E6N A; 1OX9 A; 4F7U F; 4E7H A; 2E3I A; 1QP2 A; 5KYU B; 1K9M C; 4HCC A; 3NPF A; 4OB2 B; 3J7A F; 1WXB A; 3JB9 H; 4NOY A; 3CCS T; 1H92 A; 2LC4 A; 2QDL A; 1U1S A; 1O75 A; 1QP3 A; 2J05 A; 4OGC A; 1JJ2 P; 2LT4 A; 5FWC A; 5LJ5 e; 2HBP A; 2E65 A; 4HVU A; 5GAM h; 4BE2 A; 2EWN A; 2DD4 A; 4C5G A; 1H8K A; 3MEU A; 1UUE A; 3N5B B; 1VQO Q; 3TVT A; 2LP5 A; 5IHN A; 2DBK A; 2XMF A; 1G3W A; 1VQ4 A; 3CCL T; 3AT1 B; 2M16 A; 2ZAE A; 2VB6 A; 1Z9Q A; 2AHJ B; 2DXB A; 1ZA1 B; 2QYZ A; 4OMP A; 3QJY A; 2EQK A; 1VQ8 Q; 4BY6 C; 3HFO A; 3L42 A; 2DZ9 A; 3E9G A; 5DY9 A; 3VS0 A; 2RO0 A; 3JB9 I; 4XTZ A; 2FPD A; 1Q95 G; 2EJ9 A; 2JTE A; 2V26 A; 4LDY A; 2PVD B; 4FU6 A; 1V76 A; 1RAI B; 1HYO A; 1VQ9 T; 1PKS A; 1IB8 A; 2KXD A; 3G6E T; 1UEC A; 4LDX A; 1NE8 A; 1X43 A; 1JB0 E; 4Y92 A; 5J39 A; 3OY9 A; 3UPU A; 1HK9 A; 4AFZ C; 4BUG A; 2COW A; 4OMF B; 4M7D B; 5DLO A; 2BZ8 A; 1S1N A; 3VS1 A; 2RPN A; 2M51 A; 2VWF A; 3VJP A; 4PFP A; 2OTL Q; 1VQO T; 1Q81 R; 4AT1 B; 5FRM A; 1AVZ C; 4BDZ A; 2HL3 A; 2AK5 A; 4KGX B; 2R5A A; 1YJN T; 4WCI A; 2RF0 A; 3EH1 A; 2EGA A; 4N4I A; 4R0K A; 3VS2 A; 2CZ0 B; 3X20 B; 3H9N A; 1YJW Q; 1LVK A; 2O4X B; 1SRL A; 2Y90 A; 2QAZ A; 4RCB A; 3CCJ T; 1U3O A; 3CCR Q; 4C92 C; 1JQQ A; 4KUI A; 2DL5 A; 3OYY A; 3CCQ Q; 2JMA A; 4MZT A; 3PFS A; 3C95 A; 5I21 A; 2K3X A; 1G5V A; 4KGZ B; 3L1A A; 2RK1 A; 3LYI A; 5CO7 A; 3CC4 A; 1W2B S; 2JTF A; 4FSS A; 1QWF A; 3DB4 A; 2K79 A; 3MET A; 2OTL A; 1Q86 C; 3PT9 A; 4CRI A; 1VYV A; 1D0Z A; 2XID A; 2KDS A; 4Y91 A; 1OPL A; 5C0M A; 1I0C A; 1D0X A; 1YI2 Q; 2O01 E; 5A0L A; 3L2R A; 1IRX A; 3CCU A; 3AHU A; 1ZSZ B; 1IHW A; 4Q5W A; 3X26 B; 1NJI U; 2E5K A; 1B34 B; 3OS5 A; 4II1 A; 1EX4 A; 3CCQ A; 3MEW A; 4IUP A; 2ZPB B; 1RAC B; 2YHT A; 1N9R A; 2DIG A; 1MMD A; 1YJW T; 1PCX A; 1KQ2 A; 3CC2 T; 2KT8 A; 4DQ2 A; 2DVE A; 2VXF A; 1OU8 A; 3M55 A; 4M78 A; 1G3Y A; 5GJV B; 3CCR T; 5DLQ E; 3JCM g; 1YIT Q; 2I2L A; 3JCM V; 2XK0 A; 3UF4 A; 4CC7 A; 3CCV A; 3OS1 A; 2RI2 A; 5LJ5 d; 2HD0 A; 3PMI A; 4JLI A; 5GAM g; 2XI9 A; 1Y71 A; 1YI2 A; 4M78 D; 2W10 A; 3PIO A; 2D8J A; 2K57 A; 5DM7 R; 4ZN3 A; 1UG1 A; 4KUL A; 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