The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
63
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structure length |
63
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Chain Sequence |
b'GGTGVTLFVALYDYEAITEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVD'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Fyn
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| publication title |
SH3 domain specificity
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| molecule tags |
Transferase
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| total genus |
10
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| structure length |
63
|
| sequence length |
63
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2009-04-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2I0N A; 4D8D A; 4OMM A; 4IIM A; 3IQL A; 4M4Z A; 2EGA A; 2BZX A; 2GBQ A; 3VS5 A; 4HXJ A; 4Y92 A; 2DL4 A; 3M0P A; 1UFF A; 2EYW A; 1KIK A; 2DIL A; 2HDA A; 1YNZ A; 2CUB A; 3QWY A; 1PRL C; 4KRT A; 1YCS B; 2PZ1 A; 2YSQ A; 1PNJ A; 2K7A A; 4JJC A; 2CH4 W; 1YWP A; 1AWO A; 4AFQ C; 2LP5 A; 2EW3 A; 1QKW A; 2B86 A; 2KR3 A; 2K6D A; 5I11 A; 1W6X A; 2RNA A; 1JQQ A; 2MCN A; 4JZ4 A; 1M3B A; 2V1Q A; 1KJW A; 1UJ0 A; 4J9I A; 4RTV A; 1AWJ A; 3REA B; 3UAT A; 2DBK A; 2H8H A; 1K0S A; 4RTZ A; 1NG2 A; 1Y0M A; 1SRM A; 1T0H A; 1NLO C; 2DJQ A; 2KEA A; 2ROL A; 1W70 A; 2AKL A; 2VWF A; 1T3S A; 1YWO A; 2KRS A; 2DVJ A; 1SRL A; 2BZ8 A; 1UGV A; 2AKK A; 1K0X A; 1SSH A; 4HVV A; 2D1X A; 3M0U A; 1ZSG A; 1AVZ C; 4J9F A; 2FPD A; 2RQR A; 2OJ2 A; 1TG0 A; 1BBZ A; 3U23 A; 1E6G A; 2DF6 A; 2RF0 A; 5I22 A; 2VVK A; 2GTJ A; 2JT4 A; 1JXM A; 2DA9 A; 4K11 A; 2J06 A; 3JV3 A; 4ZNX A; 4OMO A; 2RMO A; 2DL7 A; 2RQT A; 1BK2 A; 1WA7 A; 1VYU A; 1X69 A; 5FWC A; 1UHF A; 4OMQ A; 2O88 A; 3TSZ A; 2DYB A; 1AD5 A; 2L2P A; 2DBM A; 2JS2 A; 1GCQ C; 3PVQ A; 2HSP A; 2L0A A; 1ARK A; 1HD3 A; 1WIE A; 2RPN A; 4Z89 A; 1WYX A; 5FWB A; 2KXC A; 3SHW A; 1GCP A; 2EYY A; 2ENM A; 1UDL A; 1PRM C; 2F2V A; 3O5Z A; 1M30 A; 2C0T A; 2F2X A; 2P4R A; 1QKX A; 1AOJ A; 1M3C A; 2D0N A; 2DM1 A; 1H8K A; 3CQT A; 1QCF A; 1UTI A; 4AG1 C; 2A36 A; 1GFC A; 1BU1 A; 1ABQ A; 2JXB A; 1WLP B; 2LQW A; 2K9G A; 2KNB B; 1OOT A; 2RN8 A; 1EFN A; 4D8K A; 3REB B; 2CT4 A; 5IXF A; 3M0S A; 4OMN A; 1ZX6 A; 2ECZ A; 1NLP C; 2ED0 A; 1Y57 A; 2GQI A; 3TSW A; 1JEG A; 4IIO A; 2VKN A; 2A28 A; 4JJD A; 1WFW A; 4HVU A; 4AFZ C; 1MV3 A; 2MIO A; 1KSW A; 4J9G A; 2OI3 A; 1X43 A; 4R0K A; 2QDL A; 4LN2 A; 1UG1 A; 1GFD A; 1WXB A; 1FYN A; 2J6O A; 1ZUY A; 1J3T A; 1G2B A; 4HCK A; 1PKS A; 1JXO A; 4QT7 A; 3SEM A; 1HSQ A; 4AG2 C; 1RI9 A; 2AZS A; 5HCK A; 4F16 A; 1QLY A; 2ED1 A; 2JW4 A; 4AFS C; 1WXU A; 2CUD A; 3KFV A; 3ZL7 C; 1K76 A; 4RUG A; 1SEM A; 5GJV B; 4RTY A; 3ULR B; 2FO0 A; 2O31 A; 2LJ1 A; 4Z8A A; 2FPE A; 3UA6 A; 1X6G A; 3VRY A; 4HVW A; 2LNH B; 1UHC A; 3M0T A; 3NGP A; 2SEM A; 2CRE A; 2O2O A; 1NM7 A; 3EG0 A; 4F17 A; 3VS2 A; 1AWX A; 4OML A; 2EKH A; 1PHT A; 3H41 A; 2L3Q A; 1RUW A; 2YUP A; 1XOV A; 5IH2 A; 2EPD A; 1CKB A; 2DE0 X; 2GGR A; 4WCI A; 1TUC A; 2EYZ A; 4J9B A; 1GL5 A; 2LZ6 B; 2HBW A; 1RLP C; 1SPK A; 1OEB A; 1ZLM A; 3FJ5 A; 1AZE A; 1U06 A; 2KRO A; 1PKT A; 2LJ0 A; 1YP5 A; 2ROT A; 4GLM A; 1MV0 B; 1UJY A; 3I5S A; 1AWW A; 1SHG A; 1UUE A; 1M3A A; 1U5S A; 3M0R A; 1UE9 A; 2KRN A; 2KYB A; 3EGU A; 3H0H A; 4J9D A; 1GBR A; 5IHK A; 3VS7 A; 4DEY A; 2NUZ A; 1ZUK A; 3QWX X; 4RTU A; 2GNC A; 2JTE A; 2X3X D; 5EC7 A; 4CC7 A; 3RBB B; 3NMZ C; 4LUD A; 1NYF A; 3NPF A; 3VRZ A; 1X27 A; 2KGT A; 3A98 A; 4JJB A; 2DRM A; 2FPF A; 1T0J A; 2KE9 A; 1B3Q A; 2LMJ A; 3H0F A; 4DEX A; 1Z9Z A; 1OPL A; 2M0Y A; 5IHI A; 2KRM A; 2E5K A; 1QWF A; 3H0I A; 4LUE A; 4RTT A; 2IIM A; 1N5Z A; 2O9V A; 2YDL A; 1E7O A; 2PNI A; 2LQN A; 2C0I A; 2DRK A; 4CC4 B; 1IO6 A; 2LJ3 A; 3TVT A; 2GTO A; 2OAW A; 3EHQ A; 2KT1 A; 2CSI A; 2M51 A; 2YUN A; 2J6F A; 1JO8 A; 3GBQ A; 3M0Q A; 4J9C A; 1OPK A; 2FRW A; 1FMK A; 1HJD A; 1B07 A; 2YUQ A; 3VS1 A; 2EGC A; 2K3B A; 1GBQ A; 2JMA A; 1GCQ A; 2NWM A; 1KFZ A; 1E6H A; 4J9H A; 1I0C A; 1JU5 C; 1I1J A; 1A0N B; 5GJW B; 2FEI A; 3EHR A; 2DL5 A; 2EVR A; 2JM8 A; 5ECA A; 2CT3 A; 2EYX A; 5L23 A; 3VS3 A; 2JM9 A; 2X3W D; 1MUZ A; 2XMF A; 4LE9 A; 1QWE A; 2KBT A; 3THK A; 2K79 A; 2AK5 A; 3EG1 A; 4ESR A; 4J9E A; 2AZV A; 1NYG A; 2D8H A; 5IHN A; 2C0O A; 2KYM A; 3LH5 A; 3UF4 A; 2HEQ A; 2MOX A; 4FSS A; 2FG0 A; 2EGE A; 3EG2 A; 2A08 A; 1RLQ C; 3I35 A; 3C0C A; 1Z9Q A; 3VS6 A; 2K2M A; 1ZUU A; 2DX1 A; 4CC2 A; 1LCK A; 4F14 A; 1M27 C; 2DMO A; 1PWT A; 1H92 A; 1GRI A; 2L3S A; 1T3L A; 2L3P A; 2RQV A; 3RNJ A; 1UEC A; 1H3H A; 3EG3 A; 3UA7 A; 2G6F X; 2W0Z A; 2EBP A; 1VYT A; 1YN8 A; 4X1V A; 4E6R A; 2YT6 A; 2J6K A; 1X2K A; 2A37 A; 4ORZ A; 2KXD A; 1X2Q A; 1BB9 A; 2RQW A; 1SHF A; 4JZ3 A; 3I9Q A; 2KT8 A; 1CSK A; 2DL8 A; 1NEB A; 1OV3 A; 5IXB A; 3VS4 A; 1VYV A; 3PE0 A; 2JS0 A; 1K4U S; 1WDX A; 1CKA A; 4GBQ A; 3I5R A; 4Z88 A; 1TUD A; 1M8M A; 1K1Z A; 1ZBJ A; 2SRC A; 1WXT A; 4EIK A; 3NHN A; 2O9S A; 1X6B A; 2CH4 A; 1AEY A; 1VA7 A; 4A63 B; 1W1F A; 2FRY A; 1AZG B; 4RTW A; 1WI7 A; 2YUO A; 2V1R A; 2W10 A; 2LCS A; 1G83 A; 2EQI A; 1S1N A; 2LX7 A; 4LNP A; 3R6N A; 3VS0 A; 2DLP A; 2J7I A; 1V1C A; 2D8J A; 2CSQ A; 1U3O A; 4AFU C; 2F2W A; 1WX6 A; 2BZY A; 2ABL A; 4OMP A; 2RQU A; 3PVL A; 1K9A A; 2JMC A; 2HCK A; 2BTT A; 2DNU A; 2ESW A; 1I07 A; 5FW9 A; 2J05 A; 1NEG A; 4JPB W; 2CDT A; 2PTK A; 1ABO A; 2DL3 A; 4RTX A; 4CC3 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5KH6 A; 2QDY B; 1D1B A; 2QI2 A; 4M4Z A; 3OS0 A; 2EGA A; 2I2L A; 1AHJ B; 1WHG A; 3M57 A; 2E1H A; 1QVG S; 3J80 E; 1VQ4 T; 2DEU A; 2DL4 A; 2JOY A; 1S72 T; 1KIK A; 1M2V B; 2DIL A; 1K8A R; 2CP7 A; 3CCE Q; 3CMA Q; 2O01 E; 3BY7 A; 1MMD A; 2PZ1 A; 1DJ7 B; 3S6W A; 2K7A A; 4C92 G; 4BD3 A; 1VQ6 T; 2OTL A; 3EH1 A; 2B86 A; 3GP8 A; 2XU8 A; 2X35 A; 4C8Q C; 3CC4 Q; 4ZTJ A; 2V1Q A; 4C8Q B; 3JCM V; 1UJ0 A; 4J9I A; 1K0S A; 1NG2 A; 2QA4 Q; 4MML A; 3OY9 A; 1SRM A; 2DIG A; 2HD0 A; 2E5Q A; 1T0H A; 2DJQ A; 3CCJ A; 2KEA A; 4IUP A; 1T3S A; 1XJW B; 1U1T A; 2CP2 A; 1UGV A; 4RMO A; 2RI3 A; 4O5V A; 4HVV A; 3I55 A; 4PLI A; 2OJ2 A; 4II1 A; 1BBZ A; 2ATC B; 1Q82 R; 4FW2 A; 3L2Q A; 2QAS A; 3FEO A; 2Y4X A; 2RF0 A; 3TCJ A; 5KYX A; 3HPW A; 1VQP Q; 2VVK A; 3JCM h; 2OTJ T; 3SB2 A; 1JJ2 S; 2J06 A; 2VXE A; 2D9T A; 2P0Q A; 1OU8 A; 3OYN A; 3GLX A; 1YBY A; 2FB7 A; 1UHF A; 3G71 T; 3MP8 A; 3RKY A; 2QQ9 A; 5GAO n; 3V8L A; 3JB9 H; 2L2P A; 3G1J A; 1BI0 A; 2EQK A; 2MWO A; 2ZPE B; 2X4W A; 3X28 B; 1HD3 A; 4Z89 A; 2LCL A; 1VQ7 A; 4IUU A; 2DTO A; 2RA2 A; 4R56 A; 4C8Q D; 3EG9 B; 2EYY A; 3O5Z A; 1SG5 A; 3JCM e; 1RI0 A; 4M77 G; 3MCA B; 4QKU A; 2E41 A; 1RAF B; 1WJS A; 1AOJ A; 2DM1 A; 4M78 A; 1QCF A; 2A36 A; 2CP5 A; 1YHQ A; 1XQH A; 1BU1 A; 2AT1 B; 2YXY A; 4LD9 K; 1IRE B; 1WLP B; 2LQW A; 4M7D F; 2K9G A; 1YI2 T; 2KNB B; 3RDV A; 2XK0 A; 4M77 E; 1RAB B; 1OOT A; 3QYH B; 2HL3 A; 1EFN A; 4IUQ A; 4D8K A; 1M8V A; 5DM7 R; 1N9S A; 3REB B; 3M0S A; 4M7A F; 3QJY A; 4OMN A; 1ZX6 A; 3A8H B; 3QYG B; 8ATC B; 1Y57 A; 2A28 A; 1W2B A; 2P0P A; 3BFM A; 2GF7 A; 2HKQ B; 1RAH B; 1IRX A; 4A4E A; 2EYQ A; 4LN2 A; 2P0K A; 3GIB A; 2A0F B; 5FRM A; 1G2B A; 1JXO A; 3SEM A; 4C0D C; 4E7I A; 5GAN 4; 1HSQ A; 5GAO m; 4C0D B; 1RI9 A; 1D1C A; 5GAM h; 5I21 A; 2HQH A; 2VYT A; 1K76 A; 2DTI A; 4RUG A; 3CCR A; 4PJN A; 4M77 B; 1BIB A; 4Z8A A; 4PJO G; 5KYX B; 2KK4 A; 3EFO A; 3M0T A; 3QBY A; 2OTL Q; 2F69 A; 4QQD A; 2RJD A; 2DYI A; 2EKH A; 2OX7 A; 4PJO E; 2RI5 A; 2YUP A; 4B9X A; 5GAM e; 3CCL T; 1YIJ T; 2EPD A; 4QVZ A; 4WCI A; 1TUC A; 5GAM j; 5GAO q; 1GL5 A; 2HZY A; 1VQN T; 3G4S T; 1RLP C; 1SPK A; 1OEB A; 1AZE A; 5KYN A; 1V29 B; 5LJ5 d; 3VKI A; 4MZT A; 5HY6 A; 1PKT A; 3CCJ Q; 1YP5 A; 4GLM A; 5GAM g; 3CCU T; 3I5S A; 4J5Y A; 2ZPB B; 4OMF B; 1U5S A; 1VQ5 T; 1RAC B; 3OYE A; 3PNW C; 4ME7 A; 1GBR A; 3WVE B; 3RER A; 3HTR A; 3E2U A; 2E6N A; 4EMG A; 2BIV A; 3OYC A; 3A8M B; 1YJ9 A; 4CC7 A; 3L2W A; 4PJO C; 1X27 A; 3GNG A; 4PJO B; 3PIP A; 4XTW A; 1PM3 A; 4ATO A; 1B3Q A; 2QK0 A; 3S3M A; 1PSE A; 5IHI A; 2E5K A; 1QWF A; 1N8R U; 3RKW A; 1QCO A; 2LQN A; 1VQ9 T; 3CMA T; 4DA4 A; 1N8R C; 2DRK A; 1IO6 A; 4MDX A; 3TVT A; 2DKG A; 2OAW A; 2KT1 A; 1MGQ A; 2M51 A; 1IGU A; 1VQ7 Q; 4J9C A; 2XIC A; 2G3R A; 4ZGE B; 3OS5 A; 2KQW A; 4N4H A; 3CC7 Q; 1B07 A; 3M54 A; 1VQ8 T; 1OYX A; 2K3B A; 4N0A A; 1GBQ A; 2NUP B; 4EDU A; 1TSF A; 1WQW A; 2NWM A; 1E6H A; 2CKK A; 1YHQ Q; 1ZQ1 A; 1K73 U; 3QO3 A; 1XTD A; 1R77 A; 2QA4 T; 2K4Y A; 3ZFJ A; 2ZPI B; 3CCV A; 1C0M A; 2CT3 A; 2E3H A; 5L23 A; 4XK8 E; 3VS3 A; 1Q86 U; 3THK A; 4LDX A; 1R0B G; 4ZGJ B; 3DLM A; 5FRO A; 5A2Q E; 1Q86 C; 4HT9 A; 4PFO A; 2KDS A; 1KQS P; 4M75 F; 2P84 A; 2M16 A; 2KYM A; 3LH5 A; 3OW2 P; 2MOX A; 3EG2 A; 1Q81 U; 1B34 A; 3ASK A; 1Q7Y R; 3QUI A; 1Z9Q A; 3NFC A; 3VS6 A; 1M90 R; 1ZUU A; 4CC2 A; 1Q81 C; 4QVD A; 3OQ5 A; 1OX9 A; 2R5A A; 4KBM B; 3FLG A; 1YJW A; 2E64 A; 2RHU A; 2JJ9 A; 5FLX E; 3CCR Q; 2L3P A; 1UEC A; 1H3H A; 5GAM f; 1RL2 A; 2RH2 A; 3EG3 A; 3UA7 A; 4FYX B; 2G6F X; 2W0Z A; 2EBP A; 1YN8 A; 2LC4 A; 3RUX A; 4A53 A; 5GAO p; 2J6K A; 3VYH B; 4ORZ A; 2QG9 B; 3OSS C; 5CKD A; 2KT8 A; 1TUG B; 1B7T A; 2DET A; 1IZ6 A; 1VYV A; 5LJ5 e; 1WDX A; 3I5R A; 5LJ5 j; 4A4G A; 2DXC A; 1K1Z A; 4HKE A; 3OYD A; 1WXT A; 3NHN A; 2FRY A; 2W10 A; 3S3O A; 4HCC A; 1OZ2 A; 1KHI A; 1S1N A; 4LNP A; 1AT1 B; 1JBM A; 2EJG A; 3BE3 A; 4D6W A; 1K9M C; 2K3Y A; 2D8J A; 2K5L A; 3KXT A; 4E7K A; 3GF5 A; 5LJ3 d; 3JB9 I; 3OYG A; 2BE7 D; 3CCE A; 2QTV A; 2RHY A; 3M55 A; 3PVL A; 2JMC A; 3HFO A; 2ESW A; 2YWW A; 2RK2 A; 4JPB W; 2CDT A; 4BE0 A; 4BB7 A; 1D0X A; 4F7U G; 3OW2 A; 2XHC A; 2BZX A; 3CC4 A; 1QVF S; 2EYW A; 5HK0 A; 1B34 B; 4PJL A; 2DTH A; 1I8F A; 1ZHI A; 2OTL T; 3LLR A; 4KRT A; 4BAC A; 1BCM A; 2DER A; 4F7U E; 5GAN 6; 2CH4 W; 4FSX A; 1AWO A; 2LP5 A; 2A3L A; 2K6D A; 2HQX A; 5CVI A; 2RHX A; 2NUT A; 2EFI A; 2PVO B; 2RNA A; 2XDD A; 4KGX B; 1KJW A; 4IUV A; 3JCM Q; 4RTV A; 4JRI A; 3CCJ T; 2H8H A; 1VQP A; 4C0Z A; 1FX7 A; 2O4X A; 2X4Y A; 1NLO C; 2CZ1 B; 3I55 T; 3JSC A; 1W70 A; 2AKL A; 2VWF A; 2DD4 A; 3VYG A; 2DVJ A; 1EZZ B; 1VQL A; 3CD6 A; 1SRL A; 1K0X A; 3M0U A; 1KQS S; 4F7U B; 2K5I A; 3U23 A; 2HSE B; 2ZAE A; 3HFN A; 4FT4 A; 5KYW A; 2ZPF B; 5GMK i; 3QHS A; 5I22 A; 5KYU A; 4C8Q F; 4EPC A; 1D0Y A; 2RJC A; 3FJP A; 4KH1 B; 3JV3 A; 4ZNX A; 4OMO A; 2RMO A; 2DL7 A; 3M9Q A; 3PGG A; 3PFS A; 1X69 A; 4FIB A; 2QTX A; 1M1K C; 4E7Z A; 1AD5 A; 1EX4 A; 2DZ9 A; 1VQ7 T; 2JS2 A; 4XTV A; 1TTH B; 3JB9 J; 3T9N A; 1GCQ C; 3UWN A; 4PK4 A; 5GAN 5; 3OS1 A; 1Y7X A; 1ARK A; 2Z0W A; 3X26 B; 4C8Q G; 4FYW B; 4QQG A; 4J7I A; 5CKB A; 1PRM C; 2PVG B; 1YHQ T; 4ELZ C; 3CCS A; 2C0T A; 1PD0 A; 1KC8 U; 2F2X A; 2P4R A; 3RR6 A; 1M3C A; 3WXM B; 2BUD A; 2VXF A; 3RMS A; 1KC8 C; 1GFC A; 3LYI A; 4HA8 A; 1TH7 A; 1ABQ A; 1BYM A; 1O9S A; 4UC4 A; 1PCX A; 2Y4Y A; 4JRQ A; 5CAI A; 5LJ3 e; 3JCM X; 1XNI A; 1LOJ A; 4NOY A; 2RHZ A; 4X9D A; 5LJ3 j; 2V26 A; 2CT4 A; 2NUT B; 4F04 B; 2ECZ A; 4AT1 B; 5DY9 A; 2XI9 A; 2R5M A; 4JS5 A; 4JJD A; 4RTX A; 4KH0 B; 3D7S B; 3TQ7 P; 1LJO A; 4B9W A; 1UG1 A; 1WXB A; 5GAN d; 2J6O A; 5CR2 A; 1BI2 A; 4HCK A; 1PG5 B; 4J6X A; 4QT7 A; 4PFZ A; 4XTZ A; 3CCR T; 4AG2 C; 2R57 A; 1UGR B; 3QZ5 B; 4IUT A; 2DVE A; 2ED1 A; 2JW4 A; 5GJV B; 3ULR B; 2O31 A; 1W2B P; 3UA6 A; 5KYW B; 1X6G A; 4RCB A; 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