The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
63
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structure length |
63
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Chain Sequence |
b'GGTGVTLFVALYDYEAITEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVD'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Fyn
|
| molecule tags |
Transferase
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| source organism |
Homo sapiens
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| publication title |
SH3 domain specificity
rcsb |
| total genus |
10
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| structure length |
63
|
| sequence length |
63
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2009-04-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4R0K A; 4AFS C; 1EFN A; 1GCQ A; 2RQW A; 1PHT A; 4J9E A; 2K3B A; 2LJ3 A; 2KXD A; 5I11 A; 2VVK A; 1ZLM A; 2GGR A; 1K1Z A; 2RQU A; 3NMZ C; 1KSW A; 1JXM A; 1WXU A; 3VS0 A; 1YWP A; 3EG0 A; 2EYY A; 3EHQ A; 4FSS A; 1JO8 A; 1V1C A; 1HSQ A; 3O5Z A; 4RTV A; 1AZG B; 1G83 A; 2B86 A; 3TSZ A; 3NPF A; 3ULR B; 2FPD A; 4IIO A; 1VA7 A; 1AZE A; 2HCK A; 1ZUU A; 2KEA A; 1JU5 C; 4Z88 A; 2CH4 W; 2DBK A; 2JS2 A; 5ECA A; 1K0S A; 1MUZ A; 2YDL A; 4HCK A; 2X3W D; 3RNJ A; 4D8D A; 1NLO C; 2O88 A; 1NYF A; 1B3Q A; 1PRM C; 2MIO A; 2RQT A; 1YN8 A; 3I5R A; 3ZL7 C; 5HCK A; 1RUW A; 1QKW A; 4LN2 A; 3UA6 A; 1W1F A; 4K11 A; 2AZV A; 1A0N B; 1WX6 A; 4J9B A; 2SEM A; 2O9S A; 1FYN A; 1JEG A; 2DYB A; 2YUQ A; 2J6O A; 1MV3 A; 5I22 A; 4RTT A; 3REB B; 2BZY A; 1GL5 A; 2PZ1 A; 1GBQ A; 2KNB B; 1J3T A; 2KR3 A; 1W70 A; 1ZUY A; 5GJV B; 1U3O A; 2YUN A; 3EGU A; 3VS2 A; 4J9D A; 2LMJ A; 2EKH A; 1CKB A; 1NEG A; 2DBM A; 1AVZ C; 2BZX A; 1NEB A; 2J6F A; 3A98 A; 2CSQ A; 2KRN A; 4CC7 A; 5FW9 A; 1PKS A; 2P4R A; 1RLP C; 2YT6 A; 2K79 A; 2LX7 A; 2V1R A; 4J9H A; 1AEY A; 1M8M A; 4E6R A; 3H0H A; 1OPK A; 2JW4 A; 4OMP A; 4F17 A; 4Z89 A; 1B07 A; 1UG1 A; 2JT4 A; 3R6N A; 2YUO A; 4CC3 A; 1X27 A; 2L2P A; 3H0I A; 2FPF A; 2D8H A; 2NWM A; 1K0X A; 4ESR A; 1I0C A; 4OMM A; 4LUE A; 1KFZ A; 1UEC A; 2LQN A; 2KT1 A; 3VS1 A; 2I0N A; 2O2O A; 2JXB A; 3FJ5 A; 2JM8 A; 2EVR A; 2ED0 A; 2KBT A; 1KJW A; 1CSK A; 3QWX X; 4X1V A; 2DL8 A; 1RI9 A; 2LNH B; 1AWX A; 2F2X A; 1BK2 A; 1X6B A; 3TVT A; 1UUE A; 2JTE A; 2CT4 A; 1XOV A; 2O9V A; 2AKK A; 2W0Z A; 1T0H A; 2RQR A; 4RTY A; 2CT3 A; 2G6F X; 2EGA A; 2JMA A; 3C0C A; 1E7O A; 4M4Z A; 3THK A; 2PNI A; 3LH5 A; 4JJC A; 2K7A A; 2HEQ A; 3EG3 A; 1NYG A; 1E6G A; 2A28 A; 3TSW A; 1AWO A; 2KYM A; 2X3X D; 2KRO A; 5IH2 A; 5L23 A; 1AWW A; 3IQL A; 1K9A A; 2C0O A; 4OMN A; 1T3L A; 2XMF A; 5IHI A; 1GCP A; 3GBQ A; 2DM1 A; 1H92 A; 2J06 A; 2AK5 A; 1QWF A; 2FG0 A; 2VKN A; 2YSQ A; 4RTW A; 1I07 A; 1JXO A; 2D8J A; 1GRI A; 3VS3 A; 4KRT A; 1LCK A; 1E6H A; 1SRM A; 1Z9Z A; 3UF4 A; 3JV3 A; 2EGC A; 1OEB A; 3SEM A; 1RLQ C; 2FO0 A; 1WYX A; 3M0Q A; 5EC7 A; 1H8K A; 2ED1 A; 5GJW B; 4HVW A; 2BZ8 A; 1M3C A; 1QCF A; 1WXB A; 2RN8 A; 1OV3 A; 2EGE A; 2KXC A; 1GFC A; 1WDX A; 3M0U A; 1JQQ A; 2RMO A; 2E5K A; 1W6X A; 1M30 A; 2CRE A; 2CSI A; 2EW3 A; 1U06 A; 2JM9 A; 2LP5 A; 1ABQ A; 1WIE A; 2KRM A; 1M27 C; 1OPL A; 2M0Y A; 2L3Q A; 1UGV A; 1WA7 A; 2CUB A; 4J9F A; 1GCQ C; 2SRC A; 3I35 A; 4QT7 A; 3PVQ A; 3CQT A; 4CC2 A; 2OAW A; 2K2M A; 4J9G A; 2DIL A; 5IXB A; 1YP5 A; 2LZ6 B; 1GBR A; 2DMO A; 2GTJ A; 2CUD A; 4IIM A; 2L0A A; 3M0T A; 1TUD A; 4LUD A; 1NLP C; 2MCN A; 2KGT A; 2H8H A; 1BU1 A; 3VS5 A; 1S1N A; 1UJY A; 1SSH A; 2GNC A; 4OML A; 3H41 A; 2AZS A; 1TUC A; 5FWC A; 3NHN A; 2FRW A; 2O31 A; 4CC4 B; 3REA B; 1WXT A; 1QLY A; 1X2Q A; 2QDL A; 4GLM A; 5IXF A; 2EYZ A; 2YUP A; 1SEM A; 1UHC A; 1U5S A; 2DL3 A; 2ENM A; 2LJ0 A; 2KE9 A; 3UAT A; 1YWO A; 1Z9Q A; 4AFQ C; 4JZ3 A; 1QKX A; 1AD5 A; 2LJ1 A; 2CDT A; 2GBQ A; 2DNU A; 4AFZ C; 2A37 A; 4HVV A; 1M3A A; 1YNZ A; 2ECZ A; 1ZUK A; 3PE0 A; 2W10 A; 3I9Q A; 1PRL C; 1WFW A; 1T0J A; 3U23 A; 2CH4 A; 1BB9 A; 1GFD A; 2EYW A; 1UTI A; 2JMC A; 2D0N A; 1N5Z A; 4HVU A; 4Z8A A; 4GBQ A; 4HXJ A; 2DJQ A; 1HJD A; 3UA7 A; 2IIM A; 2ROL A; 2J05 A; 5IHN A; 4JZ4 A; 2AKL A; 1X2K A; 4RUG A; 2DF6 A; 4RTU A; 1UJ0 A; 1ARK A; 4DEX A; 2OJ2 A; 3I5S A; 2VWF A; 3M0P A; 2K9G A; 3VRZ A; 4LE9 A; 1PNJ A; 3EHR A; 3VS7 A; 2GTO A; 1AOJ A; 1M3B A; 4J9C A; 2DVJ A; 5IHK A; 1WI7 A; 2DL4 A; 1T3S A; 1VYT A; 2JS0 A; 4JJD A; 1KIK A; 4F16 A; 2J7I A; 2ESW A; 2FRY A; 2J6K A; 4ZNX A; 4J9I A; 3SHW A; 2RNA A; 2HSP A; 2KT8 A; 1BBZ A; 5FWB A; 2M51 A; 2C0I A; 1YCS B; 1QWE A; 1VYU A; 2C0T A; 2V1Q A; 4DEY A; 1G2B A; 4WCI A; 1K4U S; 2RQV A; 4Y92 A; 2KYB A; 2RPN A; 1FMK A; 2BTT A; 1NM7 A; 1Y57 A; 4A63 B; 2DL5 A; 2A36 A; 4OMO A; 1UFF A; 1IO6 A; 2KRS A; 1X6G A; 2EPD A; 2L3S A; 3M0R A; 2DX1 A; 2DRK A; 3VS4 A; 1MV0 B; 3QWY A; 2DE0 X; 2NUZ A; 2FPE A; 2DA9 A; 2DRM A; 4D8K A; 2HBW A; 3PVL A; 4AFU C; 4LNP A; 4RTX A; 3EG1 A; 2F2V A; 2PTK A; 2ABL A; 1X43 A; 2L3P A; 2DL7 A; 3NGP A; 1AWJ A; 1UHF A; 2DLP A; 1UDL A; 2EQI A; 4EIK A; 2FEI A; 3H0F A; 1OOT A; 2D1X A; 2A08 A; 1PKT A; 1ZSG A; 4OMQ A; 1K76 A; 1Y0M A; 3M0S A; 1ABO A; 1TG0 A; 1UE9 A; 1CKA A; 2K6D A; 2ROT A; 1H3H A; 1HD3 A; 2EYX A; 4JJB A; 3KFV A; 1ZX6 A; 3VRY A; 1VYV A; 4AG2 C; 2LQW A; 2F2W A; 1SPK A; 3EG2 A; 1SRL A; 4AG1 C; 1WLP B; 1PWT A; 2OI3 A; 1ZBJ A; 1I1J A; 2HDA A; 4F14 A; 1SHG A; 4JPB W; 1X69 A; 2EBP A; 4ORZ A; 1SHF A; 2LCS A; 4RTZ A; 3VS6 A; 1NG2 A; 3RBB B; 2MOX A; 2GQI A; 2RF0 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4Q5W A; 3RMQ A; 4AFS C; 3QHS A; 4J9E A; 5CKD A; 4BDY A; 3OYD A; 3MCA B; 4PJO F; 4NL3 A; 2VVK A; 1Q81 C; 2XIC A; 2EYY A; 4M78 A; 1GXI E; 2D6F A; 4KT0 E; 4RTV A; 5GAM d; 1WJR A; 1VQO Q; 3JCM c; 3OBY A; 3ULR B; 4M7A D; 3SD4 A; 2CP0 A; 4IIO A; 4C8Q B; 1WQW A; 1VQ6 T; 4RCC A; 2KEA A; 3HFN A; 1JU5 C; 2DBK A; 2QAZ A; 4CI0 C; 4LDW A; 1MUZ A; 3BE3 A; 4HCK A; 1M1K U; 3CD6 Q; 3CMA Q; 3L2Z A; 4PJO C; 1I8F A; 5HKC A; 3JCM g; 1PRM C; 2MIO A; 2EJ9 A; 2LT4 A; 2EWN A; 1YN8 A; 6AT1 B; 3ZL7 C; 5HCK A; 1RUW A; 4LN2 A; 5LJ3 g; 1Y7X A; 1G3S A; 1W1F A; 4C5I A; 3CCM A; 1A0N B; 1AT1 B; 1WX6 A; 2HZY A; 2O4X B; 4C92 C; 4HT8 A; 1JB0 E; 3CBP A; 1Q95 G; 2P4T A; 4QVC A; 1JEG A; 2DYB A; 2YUQ A; 1V29 B; 1FXX A; 1MV3 A; 2LQK A; 5I22 A; 2F5T X; 3REB B; 2PZ1 A; 1GBQ A; 2YLB A; 4LDY A; 3KBG A; 2KR3 A; 1W70 A; 1KG1 A; 3VS2 A; 3M59 A; 1CKB A; 2X35 A; 1DJ7 B; 3JB9 F; 1PD1 A; 4BI3 A; 4LDU A; 1PKS A; 1UGS B; 2K79 A; 4E6R A; 1ZA1 B; 3QBY A; 2JW4 A; 2HAX A; 4Z89 A; 1LNX A; 3VUB A; 2L2P A; 3H0I A; 1N8R R; 2NWM A; 3HTR A; 3JCM V; 3UT1 A; 5GAN 2; 4M78 B; 4ESR A; 4OMM A; 4LUE A; 5GAO r; 2LQN A; 3CBO A; 4J6W A; 2JXB A; 3FJ5 A; 4DBQ A; 2JM8 A; 2EVR A; 3OS2 A; 4C0F A; 4O6J A; 1IGU A; 3QWX X; 4X1V A; 4RMO A; 1VQL T; 1BK2 A; 1X6B A; 3MO8 A; 1XOV A; 2O9V A; 4PLI A; 3CC4 T; 2E3I A; 2RQR A; 5GAO m; 1YJW Q; 4JJC A; 2K7A A; 1Y96 B; 2QTV A; 2RHY A; 1E6G A; 3I56 Q; 3G6E A; 1QVF P; 4KGZ B; 1K9A A; 4OMN A; 1VQN T; 2Z0W A; 1GCP A; 3CD6 A; 2DM1 A; 3E1S A; 2OTL A; 2QG9 B; 3QYG B; 3SWN C; 3FEO A; 3NFC A; 2VKN A; 4RTW A; 1JXO A; 1LCK A; 4A4E A; 1E6H A; 1SRM A; 1Z9Z A; 2FYK A; 4EDU A; 2FO0 A; 1VQ7 T; 3CCM Q; 2ED1 A; 2RD1 A; 2RJF A; 5GJW B; 5GAO q; 4HVW A; 5A0D A; 1OZ3 A; 3I56 A; 4EMG A; 2JOY A; 2KSS A; 3HL8 A; 4BAC A; 2EGE A; 4QW2 A; 3BY7 A; 2E41 A; 3JCM P; 2QI2 A; 2CZ7 B; 2WSC E; 4C92 F; 4OB0 B; 4PFO A; 1BIB A; 1JQQ A; 1K73 C; 1UGP B; 1BKB A; 3EFR A; 4XU1 A; 1ABQ A; 3WXM B; 5FRN A; 1M27 C; 1I4K 1; 1OPL A; 3M5A A; 4C0D C; 3AHU A; 3CEY A; 2GFA A; 3OA6 A; 3L2U A; 4J9F A; 3P8D A; 2SRC A; 1RAE B; 3PVQ A; 4J5Y A; 2HQX A; 4J9G A; 2K2M A; 3QDR B; 2DIL A; 2E65 A; 4PJO A; 3OYA A; 1GBR A; 4M77 D; 2CUD A; 3M0T A; 2KDS A; 3RDV A; 2YLC A; 1PG5 B; 3VS5 A; 2GQV A; 3WVE B; 2DPP B; 2MWO A; 3LLR A; 3H41 A; 3EGX A; 1D3B A; 4KGX B; 2FRW A; 4J6X A; 4CC4 B; 1M9S A; 2RA2 A; 4BUG A; 2KVQ G; 3KXT A; 2QDL A; 5IXF A; 1BCM A; 4NS5 A; 1UHC A; 3X25 B; 1KD1 U; 2OAU A; 4LD9 K; 1WZO A; 1Z9Q A; 2XG8 D; 1QKX A; 3UDC A; 2GBQ A; 2A37 A; 3S6W A; 1M3A A; 3OYJ A; 3ER0 A; 1M90 C; 2CZ1 B; 4DBH A; 1WFW A; 2RM4 A; 2R58 A; 2ZCF B; 1NJI U; 1VQ6 Q; 1VQL Q; 2D0N A; 1QVF S; 1K8A U; 5GAM e; 2IIM A; 3CC7 A; 5LJ5 e; 4A54 A; 5IHN A; 2DZ9 A; 4JZ4 A; 2AKL A; 3OBW A; 1RAG B; 1UJ0 A; 2OJ2 A; 1VQP Q; 1PD0 A; 3P8H A; 5KYX B; 1KHI A; 4II1 A; 3OYK A; 1D0Y A; 3CCE Q; 2JVV A; 1C0M A; 1YJN A; 2HL3 A; 4C5H A; 2KMT A; 4C5G A; 1T3S A; 1IXD A; 4C92 D; 1LVK A; 1WPY A; 1XTD A; 1VQ5 A; 4F7U B; 2CZ0 B; 2OX7 A; 2J6K A; 3A5Z B; 2QXF A; 2G3R A; 4FT2 A; 2BKD N; 3HFO A; 3CME T; 5GAN 3; 1Y71 A; 2HSP A; 5M9O A; 5I21 A; 5KYX A; 5FWB A; 3CC2 T; 5KYW A; 4MDX A; 4C0Z A; 4QKU A; 2NUP B; 4OGE A; 5CKB A; 1VYU A; 2V1Q A; 4XTU A; 1M4Z A; 2YRD A; 5FRM A; 1K4U S; 2RQV A; 4Y92 A; 3G1J A; 2JTM A; 3CCU Q; 2RPN A; 2LCC A; 4JS5 A; 4M75 F; 1M1K R; 2OTJ A; 1G3W A; 3M0R A; 2DX1 A; 2PQW A; 4M7A E; 1RAB B; 2RO0 A; 2VXE A; 4WTO B; 1KK7 A; 3CCQ T; 2DRM A; 4D8K A; 3QYH B; 3QXE B; 4ANJ A; 3PVL A; 1VQ7 A; 3RKX A; 2F2V A; 4OP0 A; 1WGS A; 8ATC B; 2DVE A; 4D6W A; 2FEI A; 3H0F A; 2QDY B; 4YTL A; 4RG8 A; 3PGG A; 2D1X A; 4E7K A; 1ZSG A; 1Y0M A; 1QW1 A; 4M78 D; 1UE9 A; 2K6D A; 4IUQ A; 2RI5 A; 4M75 C; 1U8R A; 4J7F A; 2EYX A; 1K9M C; 2JZ2 A; 3VRY A; 1VYV A; 3CCR A; 2CP2 A; 4M7A A; 2M02 A; 2YHT A; 2MYS A; 2OI3 A; 4FL6 A; 3CPW A; 2HDA A; 1QP3 A; 1SHG A; 1VQL A; 1VQ4 Q; 4ORZ A; 3C12 A; 5DLO A; 3VS6 A; 2K5F A; 3QUI A; 1NG2 A; 3CC7 Q; 2HMA A; 3JCM W; 1W2B P; 2ED0 A; 2RF0 A; 1U1S A; 4R0K A; 3ZEH A; 1EFN A; 3BW1 A; 2RQW A; 2RJD A; 1MMD A; 4N0A C; 2XDB A; 4JDS A; 5GAN d; 1R8O B; 5LJ3 d; 4E2F B; 4L6V 5; 1K8A C; 1K1Z A; 1NE8 A; 3NMZ C; 2V8I A; 1KSW A; 3CC2 Q; 3VS0 A; 3CCJ T; 1YWP A; 3EHQ A; 2K3X A; 1JO8 A; 3I55 T; 2NUT B; 2VB6 A; 2DK3 A; 1HSQ A; 3G6E Q; 1VQ5 Q; 2FPD A; 1I5O B; 2ATC B; 1VQ9 Q; 1WHK A; 2O88 A; 2P84 A; 4AT1 B; 1O75 A; 1G5V A; 3GNF B; 3RUX A; 2YRC A; 1VQM A; 2DTH A; 2PUK B; 4BE2 A; 2AZV A; 2RH2 A; 5C0M A; 4C0G A; 1BYM A; 2KI7 A; 3EFS A; 2O9S A; 3NTK A; 4BB7 A; 5GMK h; 2COW A; 3M4G A; 4HCB A; 4M77 G; 1UGQ B; 2BZY A; 3JSC A; 2KNB B; 1HYO A; 1J3T A; 1D3B B; 1YI2 T; 4A4H A; 5GJV B; 1VQ7 Q; 3EGU A; 4J9D A; 2LMJ A; 2EKH A; 1NEG A; 2DBM A; 2E6N A; 2BZX A; 1JJ2 A; 2KRN A; 4NOY A; 4N4H A; 3VKI A; 2R5M A; 5FW9 A; 3PIO A; 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