The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
63
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structure length |
63
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Chain Sequence |
GGTGVTLFVALYDYEAITEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
SH3 domain specificity
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| molecule tags |
Transferase
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| molecule keywords |
Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Fyn
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| total genus |
10
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| structure length |
63
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| sequence length |
63
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2009-04-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2HSP A; 1NYF A; 4J9B A; 3O5Z A; 2GBQ A; 1WFW A; 1WX6 A; 2GGR A; 2V1Q A; 2KNB B; 4Z8A A; 2CH4 W; 1AD5 A; 4HCK A; 1HD3 A; 2K2M A; 1X2K A; 1ZUY A; 5EC7 A; 5GJW B; 2D0N A; 2SEM A; 4J9E A; 4A63 B; 2DL8 A; 2EBP A; 4LNP A; 2K3B A; 1K76 A; 1ARK A; 1X6G A; 2CUD A; 2J05 A; 2LZ6 B; 2A36 A; 2EKH A; 2F2V A; 4JJD A; 1GRI A; 1WXT A; 2A37 A; 3ULR B; 2DL5 A; 2DRM A; 1UHC A; 1LCK A; 2D1X A; 2FPD A; 3EG3 A; 1M3C A; 1OOT A; 3M0R A; 4JZ3 A; 1GCP A; 2EPD A; 2DIL A; 3VS2 A; 4D8K A; 2JXB A; 2LJ1 A; 3M0P A; 1RI9 A; 2H8H A; 2AZS A; 3UF4 A; 3SHW A; 3PVL A; 2KXC A; 3IQL A; 2FRW A; 4HVW A; 1IO6 A; 2JMC A; 2W10 A; 2JS2 A; 1Z9Z A; 2CRE A; 3PE0 A; 2ENM A; 1W1F A; 2VKN A; 4AG2 C; 2J6O A; 1AWO A; 2E5K A; 2ED0 A; 2YDL A; 3CQT A; 1AWX A; 2KR3 A; 4J9G A; 1G83 A; 3M0S A; 1J3T A; 2LX7 A; 1N5Z A; 2DRK A; 1E6H A; 2KRO A; 2DE0 X; 1QWE A; 1NLO C; 4OMQ A; 5IHN A; 4K11 A; 2BZX A; 4E6R A; 3NMZ C; 4DEY A; 2DBK A; 1OEB A; 1GL5 A; 2CT3 A; 4RUG A; 2K6D A; 1AWJ A; 1NM7 A; 2EGE A; 1M30 A; 4ESR A; 3I5S A; 1CSK A; 1UJY A; 2EVR A; 5I22 A; 2DLP A; 3A98 A; 3TVT A; 1NEB A; 1GCQ C; 1HJD A; 4HVU A; 3M0Q A; 2JM9 A; 2LJ0 A; 2G6F X; 3RBB B; 1JU5 C; 2RQU A; 2DBM A; 2FPE A; 4AFZ C; 3REB B; 4Z89 A; 2IIM A; 4RTU A; 1YWO A; 2KRM A; 2ED1 A; 2VWF A; 1WXB A; 2RQV A; 3NHN A; 3H0I A; 1NEG A; 4GBQ A; 2OJ2 A; 1K9A A; 1MV0 B; 3ZL7 C; 2BZY A; 1PRL C; 2L2P A; 4D8D A; 2KBT A; 1XOV A; 4ZNX A; 2L0A A; 2YUQ A; 5FW9 A; 2PZ1 A; 1UHF A; 1PKS A; 3M0T A; 4J9F A; 2EQI A; 2CH4 A; 1G2B A; 4J9I A; 3I35 A; 2AZV A; 2L3P A; 4HVV A; 2J6F A; 1H3H A; 4RTW A; 1QKW A; 1YNZ A; 3I9Q A; 2YT6 A; 1UEC A; 4JJB A; 3U23 A; 1H92 A; 4RTV A; 2ROT A; 2EYY A; 2KRN A; 2KT8 A; 2KYM A; 2LCS A; 5FWB A; 2GNC A; 1BU1 A; 2K7A A; 5L23 A; 1B07 A; 4AFS C; 1ZX6 A; 2AKK A; 2FPF A; 2LQW A; 4J9C A; 4RTX A; 3VS4 A; 1EFN A; 1VA7 A; 2X3W D; 1T0J A; 2OI3 A; 2FEI A; 1OPL A; 1CKA A; 2YSQ A; 4LE9 A; 2LJ3 A; 2SRC A; 3TSW A; 3I5R A; 4OMM A; 3H0F A; 2QDL A; 2XMF A; 4AFU C; 1A0N B; 1WIE A; 2JTE A; 2L3Q A; 1FYN A; 2YUO A; 3SEM A; 1X69 A; 3UAT A; 1WA7 A; 2MOX A; 3FJ5 A; 2DL3 A; 2YUP A; 2RPN A; 3VS0 A; 2DX1 A; 1I0C A; 1NLP C; 1M8M A; 1U3O A; 1W6X A; 1Y57 A; 4GLM A; 4OMO A; 2DM1 A; 1T3S A; 2MIO A; 1UG1 A; 2ESW A; 1JXM A; 3M0U A; 1SEM A; 3H41 A; 2RQR A; 2C0T A; 2JS0 A; 1FMK A; 4J9D A; 2DL7 A; 1QCF A; 1BBZ A; 4AFQ C; 2J06 A; 2KT1 A; 2O31 A; 5ECA A; 2KEA A; 2D8J A; 4X1V A; 2JT4 A; 2HCK A; 1SRL A; 2NUZ A; 2RQW A; 1Y0M A; 2GTO A; 3EHQ A; 1T0H A; 1SPK A; 1X43 A; 4DEX A; 2OAW A; 5IHK A; 1YP5 A; 2O2O A; 1UGV A; 2I0N A; 2F2X A; 1UE9 A; 2GQI A; 1U06 A; 5GJV B; 2PNI A; 4AG1 C; 1K0S A; 1BK2 A; 3UA7 A; 1ZUK A; 5IHI A; 2DNU A; 3VS5 A; 2K9G A; 1KFZ A; 2ECZ A; 3VS3 A; 1M3B A; 2DVJ A; 4M4Z A; 1AZE A; 2FG0 A; 1QLY A; 2W0Z A; 2CSI A; 2F2W A; 1YCS B; 1I07 A; 3C0C A; 1KJW A; 1K4U S; 2ROL A; 2GTJ A; 1JO8 A; 1HSQ A; 2HDA A; 1YN8 A; 2EYX A; 2JMA A; 2YUN A; 2O9S A; 4JJC A; 1S1N A; 3EG1 A; 3H0H A; 2AK5 A; 4QT7 A; 2J7I A; 4J9H A; 1GCQ A; 3UA6 A; 2BZ8 A; 1U5S A; 4LUE A; 4Z88 A; 2KYB A; 1ZBJ A; 1SHG A; 1RUW A; 2O88 A; 1Z9Q A; 3LH5 A; 4CC2 A; 5IXB A; 5IXF A; 3VS6 A; 5HCK A; 3VRY A; 1UFF A; 3QWY A; 2ABL A; 5IH2 A; 2LNH B; 4CC4 B; 2EGC A; 2LQN A; 1YWP A; 1JQQ A; 1ZUU A; 1I1J A; 3NPF A; 2V1R A; 1GFD A; 2LMJ A; 5FWC A; 2RNA A; 4JPB W; 4F17 A; 2K79 A; 2EYZ A; 2CSQ A; 1SRM A; 2O9V A; 2EW3 A; 4Y92 A; 2CDT A; 2KGT A; 1OV3 A; 2MCN A; 1SSH A; 4KRT A; 2KRS A; 1PWT A; 1GBQ A; 1AOJ A; 3THK A; 4OML A; 1E6G A; 1PKT A; 2DMO A; 2C0O A; 2VVK A; 3PVQ A; 2HEQ A; 2DL4 A; 1MUZ A; 1PRM C; 2CUB A; 1TUC A; 2NWM A; 2RMO A; 1WLP B; 4LN2 A; 1B3Q A; 1SHF A; 2M51 A; 2B86 A; 2JW4 A; 3R6N A; 1UUE A; 1AWW A; 4CC3 A; 2DJQ A; 4R0K A; 5I11 A; 2J6K A; 1RLQ C; 4RTZ A; 3RNJ A; 2LP5 A; 4HXJ A; 1VYV A; 1WDX A; 1VYU A; 2D8H A; 2HBW A; 2FO0 A; 2A28 A; 1H8K A; 3EGU A; 4F14 A; 4CC7 A; 2RF0 A; 3NGP A; 2JM8 A; 3GBQ A; 4ORZ A; 3EG0 A; 1W70 A; 4F16 A; 4OMP A; 1ZSG A; 1UTI A; 1TG0 A; 2M0Y A; 2RQT A; 1X6B A; 2DYB A; 1ABQ A; 1QKX A; 1V1C A; 1NG2 A; 2DA9 A; 1CKB A; 1JXO A; 2RN8 A; 1WYX A; 2EGA A; 2P4R A; 2A08 A; 1T3L A; 1ABO A; 3EHR A; 4RTY A; 2KE9 A; 1E7O A; 1PNJ A; 1VYT A; 1NYG A; 1WXU A; 1JEG A; 1AZG B; 3EG2 A; 2KXD A; 4LUD A; 4IIO A; 1UDL A; 3KFV A; 3QWX X; 3VS7 A; 3VS1 A; 1X27 A; 3VRZ A; 1RLP C; 2X3X D; 4FSS A; 1KIK A; 2PTK A; 1KSW A; 1BB9 A; 4RTT A; 1PHT A; 3JV3 A; 1K1Z A; 1GFC A; 1OPK A; 2FRY A; 1AEY A; 1WI7 A; 2BTT A; 4OMN A; 3REA B; 2DF6 A; 4EIK A; 1K0X A; 1M3A A; 1ZLM A; 1TUD A; 1X2Q A; 1GBR A; 3TSZ A; 1MV3 A; 4IIM A; 1AVZ C; 2CT4 A; 2L3S A; 2EYW A; 1M27 C; 1UJ0 A; 2C0I A; 4JZ4 A; 1QWF A; 2AKL A; 4WCI A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4F7U G; 3JB9 I; 2DJZ A; 3SB2 A; 2GBQ A; 4M78 A; 3UWN A; 1VQO A; 1R77 A; 2V1Q A; 3RMS A; 2KNB B; 3MP8 A; 1QP2 A; 1HD3 A; 3H9N A; 3CC2 A; 5EC7 A; 2GF7 A; 1QVG A; 3RMQ A; 3OYC A; 4M75 F; 2X35 A; 1SF9 A; 3MP1 A; 4LNP A; 3VYH B; 2K3B A; 5D6X A; 2J05 A; 2A36 A; 2EKH A; 2F2V A; 3QZ5 B; 1YI2 T; 4XAX B; 1M4Z A; 5KCO A; 4RKU E; 2DL5 A; 5KE2 A; 1NJI C; 3TRE A; 1W2B P; 1Q81 R; 2D1X A; 4NOY A; 2FPD A; 1YJW Q; 4DOW A; 1GCP A; 4FT4 A; 4D8K A; 1YHQ Q; 4OB0 B; 4J7I A; 2LJ1 A; 3OYL A; 2AZS A; 3SHW A; 3C12 A; 2FRW A; 4HVW A; 2JMC A; 2EJG A; 3PFS A; 5CQX A; 1Z9Z A; 2J6O A; 2E5K A; 3CQT A; 4A54 A; 8AT1 B; 2KR3 A; 4M77 A; 1MNE A; 1PCX A; 2ZPF B; 2DXU A; 1G83 A; 3CC4 Q; 3M0S A; 4O5V A; 1J3T A; 4NS5 A; 4EMK B; 2DRK A; 1VQL T; 1R0B G; 1JBM A; 1NLO C; 4OMQ A; 4K11 A; 2BZX A; 2F5T X; 2L89 A; 1NZ9 A; 4E6R A; 3JAM E; 1OEB A; 3QSU A; 1K73 U; 1U1T A; 3LX7 A; 2PVG B; 2QQA A; 3QDF A; 3OYG A; 1N8R C; 1KD1 R; 1KQS A; 3CCE T; 5CAI A; 2QTX A; 2P0Q A; 5I22 A; 2EIF A; 2IG0 A; 3A98 A; 3TVT A; 4M77 C; 1N9R A; 5KYN A; 1IZ6 A; 4EMG A; 2JM9 A; 2G6F X; 2RQU A; 2DBM A; 1QCN A; 4AFZ C; 2K5I A; 4Z89 A; 3GIB A; 2KRM A; 4JRK A; 1K73 R; 1ZSZ B; 2DIG A; 3OYD A; 2MWP A; 3SWN C; 3H0I A; 1NEG A; 2OJ2 A; 4AMC A; 2L2P A; 4D8D A; 1XOV A; 1M1G A; 3MHX A; 1LOJ A; 4F7U B; 3G6E A; 3M0T A; 2CH4 A; 3UPU A; 1RI0 A; 5GAO p; 2J6F A; 1AHJ B; 3I9Q A; 3MKD A; 4QQD A; 2R58 A; 2EYY A; 2H3E B; 1WJS A; 1Q95 G; 2FPF A; 3VS4 A; 2E41 A; 1EFN A; 1VA7 A; 2X3W D; 3HKS A; 4KH1 B; 1VQN Q; 2GFU A; 3S6W A; 1OPL A; 1TWB A; 3EGD A; 1CKA A; 4LE9 A; 1D0X A; 2JOY A; 3CC2 Q; 1EIF A; 3CCV T; 1WIE A; 1KG1 A; 1Q81 U; 3CD6 A; 4C5G A; 2L3Q A; 4PJO B; 2YUO A; 3SEM A; 3S3M A; 1Q7Y U; 3E2U A; 4PJO A; 2XG8 D; 4M75 G; 1PD1 A; 2MOX A; 3CCE A; 1QP3 A; 2YUP A; 2RPN A; 4PJO C; 2DXT A; 2CZ7 B; 1W6X A; 5KH6 A; 4B6M A; 2DEQ A; 4QQ6 A; 4ELZ C; 2LT4 A; 3CCR Q; 3OYY A; 2ESW A; 2HZY A; 3CXC P; 4C0D C; 1JXM A; 4F7U E; 1PSE A; 2FB7 A; 4C92 A; 2C0T A; 3VKI A; 4J9D A; 4M78 B; 2X4J A; 3CCM Q; 3DLM A; 5CKH A; 3JB9 J; 5FLX E; 2O31 A; 2KEA A; 3E9F A; 1I5O B; 4C0D B; 2HCK A; 1SRL A; 2ATC B; 4C8Q F; 4MZM A; 3LW5 E; 3HRU A; 3CCU Q; 1X43 A; 2OAW A; 3L2Q A; 5A0G A; 2O01 E; 2DEU A; 3CCS Q; 1G3S A; 2QA4 T; 1VQ8 A; 1G3W A; 2JN0 A; 5GAN 8; 5LJ5 g; 2PNI A; 3QZ9 B; 2XDD A; 4DOV A; 1RAB B; 1BI1 A; 5FU7 C; 4BDZ A; 1B34 B; 3PMI A; 1WHM A; 2DVJ A; 2QG9 B; 4M4Z A; 4C8Q A; 2FG0 A; 2W0Z A; 4M77 F; 1VQ9 T; 1YCS B; 3G4S Q; 3C0C A; 4M7D E; 1JO8 A; 1RAC B; 3GPL A; 1ZHI A; 2R5A A; 1QMC A; 3JCM g; 4JJC A; 3NTH A; 3JCM d; 2ZPI B; 4J8O A; 2QEX Q; 2A7Y A; 2J7I A; 5KCH A; 2JJ9 A; 3EGX B; 2DXB A; 1SHG A; 3CEY A; 1RUW A; 1R0C B; 5IXB A; 2E1H A; 4Y28 E; 3OW2 P; 3A1P A; 1IHV A; 2ABL A; 1IXD A; 1KK7 A; 1WGS A; 5CKB A; 1IHW A; 1XTD A; 4BB7 A; 3MEA A; 2LDM A; 1GFD A; 2BKD N; 4JPB W; 2K79 A; 4KUL A; 5I2M A; 1K8A C; 2QGG A; 3CCM A; 3OYF A; 4DBF A; 1KC8 C; 1H64 1; 4M75 A; 4Y92 A; 2KGT A; 2MCN A; 2RHI A; 1Q86 U; 1V29 B; 2Y4X A; 1WHJ A; 5LJ5 h; 3CPW S; 1PWT A; 1GBQ A; 3QG1 A; 2NUP B; 1ACM B; 2E6Z A; 5CKE A; 4XU0 A; 3QO3 A; 1PKT A; 1VQ7 T; 5D6W A; 1H3Z A; 4ZTJ A; 2QA4 A; 1VQ8 T; 3MPU B; 2CUB A; 2M1H A; 2F5K A; 4PK4 A; 1B3Q A; 2E12 A; 1VQK A; 2QQR A; 1WHH A; 4PJO F; 1VQN A; 4R0K A; 1O75 A; 5CIU A; 1RLQ C; 2CP5 A; 3SWN A; 1QCO A; 3RNJ A; 3WVE B; 4HXJ A; 4N0A C; 3FJP A; 1WDX A; 2K3Y A; 1MMN A; 2HBW A; 1UGR B; 2YRC A; 1H8K A; 1IB8 A; 3V7S A; 1BYM A; 4NL2 A; 2DAQ A; 2JM8 A; 4ORZ A; 3EG0 A; 2ZPG B; 4OMP A; 1ZSG A; 4MML A; 1UGP B; 2EAY A; 3URG A; 1QKX A; 3BDL A; 3C4S A; 1ZSZ C; 2LNV A; 1ABO A; 3EHR A; 2KE9 A; 4R55 A; 1WJR A; 4JRQ A; 1VYT A; 3OBY A; 1JEG A; 4BE2 A; 2JZ2 A; 1UDL A; 1OX8 A; 2VV5 A; 4HCC A; 4ATO A; 2PTK A; 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3JRZ A; 1R8O B; 1LPL A; 1AWX A; 2L3R A; 5DY9 A; 3PT9 A; 2D6F A; 4MMK A; 1YI2 A; 1M90 C; 3KBG A; 2DD5 A; 1N5Z A; 4JJN K; 2XI9 A; 5GAN 4; 4LD9 K; 3MEW A; 2DE0 X; 1MHN A; 2E3H A; 1IGU A; 4C8Q E; 5HY6 A; 3NMZ C; 4DEY A; 5GMK m; 3V8L A; 2K6D A; 4J83 A; 3JCM c; 4ESR A; 5KYY B; 2ZZD A; 2EVR A; 4JLI A; 1YIJ A; 2LX9 A; 4F7U F; 1GCQ C; 1HJD A; 1RAD B; 3M0Q A; 1NJI U; 1JU5 C; 4XU2 A; 4XU3 A; 1I4K 1; 4M75 D; 4B9X A; 5FU6 B; 4RTU A; 5C0M A; 2XD0 A; 3D7S B; 5DLO A; 1KQ2 A; 1WXB A; 1YIJ Q; 3M54 A; 1KC8 U; 1K9A A; 4LXC A; 4PJO D; 3ZL7 C; 1KQS S; 2BZY A; 1FXX A; 1YJ9 A; 4LDY A; 3BY7 A; 1VQ9 A; 1SSF A; 3DKM A; 5A2Q E; 2EQI A; 4J6W A; 3G71 A; 2AZV A; 3ASK A; 2NYS A; 3MO8 A; 1H3H A; 4RTW A; 2YT6 A; 3CBP A; 2VB6 A; 1UEC A; 3M55 A; 4JJB A; 4RTV A; 2P4T A; 3L1A A; 2KYM A; 3HFN A; 1Q7Y R; 2C06 A; 1BU1 A; 3CMA T; 2QYZ A; 5L23 A; 1ZSZ A; 4C0F A; 3CD6 T; 5GAO n; 1NE8 A; 2HKQ B; 1IGQ A; 4M7A B; 2FEI A; 5GAN g; 3CCQ A; 4CI0 C; 2R5M A; 2LJ3 A; 4M7A G; 3TSW A; 1BI3 A; 1YJN A; 2QDL A; 2XMF A; 4QKU A; 4MDW A; 2RJD A; 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