The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
|
sequence length |
63
|
structure length |
63
|
Chain Sequence |
GGTGVTLFVALYDYEAITEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVD
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Fyn
|
| publication title |
SH3 domain specificity
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Transferase
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| total genus |
10
|
| structure length |
63
|
| sequence length |
63
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2009-04-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1B3Q A; 5IH2 A; 1AWO A; 2EVR A; 2KYM A; 2D0N A; 2GNC A; 2LJ1 A; 1HJD A; 1WXB A; 2ENM A; 3QWX X; 1KSW A; 2CH4 W; 2FRY A; 1ZUY A; 1GBR A; 1KJW A; 2K3B A; 1GFD A; 2E5K A; 1LCK A; 1GRI A; 2F2V A; 2D8H A; 2DIL A; 3EG0 A; 1AZG B; 2KRO A; 2LZ6 B; 1RLQ C; 1X2Q A; 1MV0 B; 1UE9 A; 1WXU A; 1JQQ A; 3VS6 A; 2RF0 A; 4LE9 A; 1AEY A; 1AVZ C; 1Z9Q A; 1FYN A; 4J9D A; 1M3A A; 1KIK A; 2EYW A; 1RUW A; 2YUQ A; 1GCP A; 3NMZ C; 2BZY A; 3LH5 A; 2KE9 A; 4QT7 A; 2RNA A; 2ECZ A; 4RTU A; 1K4U S; 4LUE A; 2J05 A; 4JJC A; 1VYV A; 3JV3 A; 2JM9 A; 2O31 A; 1SSH A; 3UA7 A; 2C0T A; 1OEB A; 1GCQ A; 2CDT A; 2O88 A; 2AZS A; 1K1Z A; 3GBQ A; 4J9I A; 5L23 A; 4AFZ C; 1NEB A; 2DL5 A; 2A37 A; 5GJW B; 1K9A A; 4CC7 A; 2G6F X; 1X6B A; 2HSP A; 2YT6 A; 3EGU A; 2NUZ A; 3VS2 A; 4DEY A; 2EGC A; 4M4Z A; 2L3Q A; 1AWW A; 2EYZ A; 1AOJ A; 1K0X A; 2DE0 X; 1S1N A; 2A08 A; 3VS4 A; 2EKH A; 1Y0M A; 2JT4 A; 1IO6 A; 2FPE A; 1M30 A; 1MUZ A; 4J9B A; 3PVQ A; 3SEM A; 1I1J A; 2DL3 A; 1UUE A; 2V1R A; 1I07 A; 2HBW A; 5FWB A; 2ROL A; 1UJY A; 3QWY A; 3VRY A; 2W10 A; 1ABQ A; 3EG2 A; 4AFU C; 1JO8 A; 1QCF A; 4JZ4 A; 1VYU A; 5IHN A; 2CUB A; 4CC2 A; 2B86 A; 2K79 A; 1AWJ A; 3I35 A; 4RUG A; 4JJB A; 1YWO A; 2EYX A; 2CUD A; 2LJ0 A; 2LQW A; 2C0I A; 4Y92 A; 2CRE A; 2DL8 A; 5IHK A; 2DRM A; 5I22 A; 3M0Q A; 1HSQ A; 2P4R A; 4X1V A; 3VS5 A; 2W0Z A; 2J7I A; 1JEG A; 2DA9 A; 1GCQ C; 2RQU A; 1WFW A; 1TUC A; 2YUO A; 5IHI A; 3H41 A; 3R6N A; 3M0U A; 2GGR A; 1QKW A; 1KFZ A; 1UHF A; 1YP5 A; 1M27 C; 1ZX6 A; 4J9F A; 1RI9 A; 1N5Z A; 2L2P A; 2VWF A; 2KEA A; 2YUN A; 4E6R A; 1V1C A; 2EGA A; 4HVW A; 2OI3 A; 1WXT A; 5FW9 A; 1UFF A; 2K9G A; 1QWE A; 2J6O A; 4J9G A; 1UTI A; 3VS1 A; 2ED0 A; 4FSS A; 2EW3 A; 2KNB B; 2KT1 A; 2MCN A; 3VRZ A; 1UGV A; 1UEC A; 3O5Z A; 4D8D A; 2CH4 A; 2HEQ A; 2LMJ A; 2DF6 A; 4OMN A; 5HCK A; 1BB9 A; 1ZSG A; 1K76 A; 2J6K A; 1NYF A; 1JXO A; 2A36 A; 3NPF A; 2DBM A; 1VA7 A; 2VKN A; 1G83 A; 1H3H A; 1M3B A; 1UG1 A; 1SPK A; 2V1Q A; 1XOV A; 2EYY A; 2KT8 A; 2JS2 A; 1T0H A; 3C0C A; 1J3T A; 1MV3 A; 1SEM A; 1JXM A; 2D8J A; 1T3L A; 1U5S A; 2BZX A; 2I0N A; 1SHG A; 3PVL A; 3ZL7 C; 3VS3 A; 1A0N B; 2K2M A; 2L0A A; 2A28 A; 2DRK A; 1WA7 A; 2DL7 A; 4OMQ A; 3EHR A; 4ESR A; 2KYB A; 2LP5 A; 2SRC A; 2ROT A; 2EPD A; 2KXD A; 1E6H A; 1AD5 A; 2RQW A; 3I5S A; 1VYT A; 1SRM A; 2O2O A; 2HDA A; 2H8H A; 2LCS A; 1GBQ A; 1WLP B; 2FPF A; 2FEI A; 3H0F A; 2XMF A; 1E7O A; 1AWX A; 1M8M A; 2M0Y A; 1T3S A; 2FO0 A; 3PE0 A; 1ZUK A; 4J9E A; 1NLO C; 1TG0 A; 3EHQ A; 3TVT A; 2L3P A; 2CT3 A; 2MIO A; 5ECA A; 2D1X A; 4AG1 C; 3SHW A; 1CKB A; 2KRN A; 2DL4 A; 4IIM A; 2DVJ A; 3VS7 A; 3UF4 A; 2CSI A; 1HD3 A; 2DM1 A; 2KXC A; 3EG3 A; 2YDL A; 2EQI A; 2JMA A; 1QKX A; 5I11 A; 3RNJ A; 2J06 A; 2RPN A; 4LN2 A; 1U3O A; 1X27 A; 1W6X A; 4J9H A; 1PWT A; 1RLP C; 1QWF A; 2AKK A; 2DNU A; 2LJ3 A; 1BBZ A; 1X2K A; 4RTY A; 1WDX A; 2PNI A; 4HCK A; 3VS0 A; 1M3C A; 2FPD A; 2GBQ A; 1UHC A; 3KFV A; 1Z9Z A; 1H8K A; 4RTV A; 1BU1 A; 2GTO A; 4CC3 A; 4CC4 B; 1X6G A; 3I5R A; 2CSQ A; 2RQR A; 2DJQ A; 2DX1 A; 2RN8 A; 2NWM A; 3M0R A; 2ED1 A; 1U06 A; 2ABL A; 4JJD A; 2IIM A; 4Z8A A; 2J6F A; 3UAT A; 1H92 A; 3M0P A; 1PHT A; 1ZUU A; 2K7A A; 4HXJ A; 4AFS C; 2X3X D; 4ZNX A; 2AK5 A; 5IXF A; 2DLP A; 2BZ8 A; 2KR3 A; 2O9V A; 1ABO A; 2EGE A; 2F2X A; 4Z89 A; 1W1F A; 4EIK A; 1NYG A; 2KRS A; 2YSQ A; 2KGT A; 1SHF A; 3M0S A; 2X3W D; 2FRW A; 2F2W A; 4LUD A; 2DBK A; 4R0K A; 3I9Q A; 3REA B; 5EC7 A; 1Y57 A; 2OJ2 A; 2PTK A; 1W70 A; 1NEG A; 2OAW A; 2VVK A; 2LX7 A; 3CQT A; 1X69 A; 4HVU A; 2DYB A; 3FJ5 A; 2JXB A; 1AZE A; 3IQL A; 4LNP A; 3M0T A; 4RTT A; 2ESW A; 4DEX A; 1PNJ A; 2O9S A; 3UA6 A; 1OV3 A; 2HCK A; 1PRL C; 2GQI A; 1JU5 C; 4RTX A; 4AFQ C; 4F16 A; 5IXB A; 1UJ0 A; 1T0J A; 3TSW A; 2FG0 A; 1GL5 A; 2JMC A; 2LNH B; 1PKS A; 3RBB B; 3U23 A; 4RTZ A; 1B07 A; 1E6G A; 2RQV A; 3ULR B; 1CSK A; 5GJV B; 2SEM A; 2BTT A; 1K0S A; 1NLP C; 1YNZ A; 4F14 A; 1WI7 A; 4J9C A; 2CT4 A; 1QLY A; 1YWP A; 1EFN A; 2M51 A; 1WIE A; 4OMM A; 3H0I A; 2PZ1 A; 2JTE A; 2GTJ A; 4F17 A; 1NG2 A; 4K11 A; 1I0C A; 3NHN A; 4RTW A; 1ZBJ A; 1OOT A; 1OPL A; 1FMK A; 4KRT A; 1G2B A; 4HVV A; 4JZ3 A; 2DMO A; 1ARK A; 4JPB W; 4IIO A; 1TUD A; 2LQN A; 1ZLM A; 3H0H A; 2RMO A; 1GFC A; 2EBP A; 2AZV A; 1CKA A; 1SRL A; 2QDL A; 4GBQ A; 4ORZ A; 4WCI A; 3EG1 A; 2JW4 A; 2MOX A; 3THK A; 2KRM A; 1PKT A; 1PRM C; 1X43 A; 3TSZ A; 2RQT A; 2YUP A; 5FWC A; 1UDL A; 2AKL A; 3A98 A; 2KBT A; 4A63 B; 4Z88 A; 1NM7 A; 3NGP A; 4GLM A; 2JS0 A; 4OMP A; 1WX6 A; 3REB B; 4D8K A; 4OMO A; 1WYX A; 1BK2 A; 1YCS B; 2C0O A; 4OML A; 2JM8 A; 1OPK A; 2K6D A; 1YN8 A; 4AG2 C; 2L3S A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2H3E B; 5IH2 A; 2D0N A; 2MWO A; 2GQV A; 1M2V A; 3C12 A; 1HJD A; 1YI2 Q; 2ENM A; 5GAN 3; 1KJW A; 1RAI B; 2C06 A; 2F2V A; 2D8H A; 2DIL A; 3P8D A; 1X2Q A; 5CR2 A; 2HAX A; 1JQQ A; 3RR6 A; 1KD1 R; 3BW1 A; 2LX9 A; 4J9D A; 1M3A A; 3EH1 A; 2ZPF B; 4M75 G; 1N9S A; 2JN0 A; 5GAO l; 1VYV A; 3RKX A; 3DB4 A; 2JM9 A; 1QVP A; 3E2U A; 1UGP B; 2RI3 A; 3EH2 A; 2CDT A; 4J9I A; 1QW1 A; 1WPY A; 2FVU A; 1LVK A; 1X6B A; 2VAS A; 3EAE A; 2HSP A; 3EGU A; 3QYH B; 1K9M R; 4QQG A; 4BY6 B; 2QTV A; 3JRZ A; 1G8X A; 2RK1 A; 1S1N A; 1SF9 A; 1Y96 B; 1BI3 A; 3RUX A; 1YJW T; 2DJZ A; 2HQE A; 1M30 A; 1VQL T; 1IRE B; 4O6J A; 1I1J A; 1F1B B; 5KYN A; 3CME A; 2VXE A; 1KQ2 A; 3HRT A; 3CME Q; 5A0L A; 3J80 E; 5LJ5 j; 2W10 A; 1RAC B; 1U1T A; 1BI1 A; 1RAH B; 4J6Y A; 2H3J A; 1RI0 A; 5I2S A; 4RCB A; 2Y4X A; 3I35 A; 4PJO D; 2QQS A; 3OYG A; 2EYX A; 3S3O A; 3DKM A; 1QP2 A; 1OX9 A; 2DRM A; 3OYB A; 3UDC A; 2CP5 A; 4FCY A; 5GAO r; 5KYY B; 5GMK h; 1JEG A; 3WVE B; 1FXX A; 3L2Z A; 1R0C B; 3M0U A; 2E1H A; 1G5V A; 5HKC A; 4BDZ A; 1KFZ A; 2XU8 A; 1YP5 A; 1YIJ T; 1M27 C; 1ZX6 A; 3JCM P; 1RI9 A; 4BE1 A; 4IKF A; 3QJ6 A; 2L2P A; 2YLC A; 4E6R A; 4HVW A; 1OI1 A; 2RHY A; 3A8G B; 2KY9 A; 1VIE A; 1N9R A; 2EIF A; 4ELZ C; 4BE0 A; 3OW2 S; 3OA6 A; 2LTO A; 3CBM A; 2ED0 A; 1GXI E; 1UGV A; 1ZSZ C; 3S6W A; 4F7U A; 2CH4 A; 3LW5 E; 2E64 A; 2JOY A; 5HCK A; 1PD0 A; 5A0G A; 1VQO A; 3G4S A; 2DBM A; 2RJF A; 4E7S A; 1K8A C; 4QQ6 A; 5CKD A; 3MPU B; 2FZK B; 4FL6 A; 2CGH A; 2YRC A; 1H3H A; 1M3B A; 2V1Q A; 5LJ3 j; 3SWN A; 1T0H A; 3C0C A; 1J3T A; 1MV3 A; 5GAN 4; 3GPL A; 2I0N A; 3E9G A; 4MML A; 2X51 A; 5CKE A; 2X4X A; 3VS3 A; 3CCJ A; 5CVI A; 1WA7 A; 3EHR A; 4ESR A; 3EFR A; 2LP5 A; 3CCJ Q; 3CCS A; 1TXQ A; 2KXD A; 1E6H A; 4FW1 A; 3I5S A; 1PD1 A; 1M90 C; 2HDA A; 2H8H A; 2FPF A; 1BYM A; 4IUU A; 4LDX A; 1T3S A; 5CCA A; 4N0A A; 2RI5 A; 1FMV A; 4J9E A; 4M77 G; 3AHU A; 3EHQ A; 4QVZ A; 1M1F A; 2RHZ A; 1NPR A; 3TEE A; 2EFI A; 1CKB A; 2DVJ A; 4C5I A; 3CPW P; 3UF4 A; 1NJI C; 2VUB A; 2CSI A; 2XIC A; 2DM1 A; 4JRQ A; 3V8L A; 1KD1 U; 1HK9 A; 2JMA A; 4X34 A; 4M7D A; 2IVW A; 2YRV A; 4LN2 A; 1U3O A; 3LH0 A; 4J9H A; 2QQR A; 2DYI A; 1S72 T; 1M1K R; 3CC7 A; 4PK4 A; 3SWN C; 5GAN j; 2DKG A; 4C5G A; 1UHC A; 3CCE Q; 8AT1 B; 1Z9Z A; 1H8K A; 2EJ9 A; 2K5F A; 1TTH B; 2GTO A; 1JBM A; 1I5O B; 2K2V A; 5J26 A; 3CCU Q; 2CSQ A; 2RQR A; 1LNX A; 2RO0 A; 3X24 B; 1WJR A; 3M0R A; 2ED1 A; 1U06 A; 3I55 Q; 4N0A C; 3OS5 A; 3LGL A; 3M0P A; 3ER0 A; 1N27 A; 2DTH A; 1ZUU A; 2X3X D; 4ZNX A; 1Q7Y C; 3MP8 A; 4M7A B; 4FT4 A; 4OP0 A; 5CKB A; 2EGE A; 1VQK A; 4EIK A; 2KRS A; 2KGT A; 1I5L A; 1Q81 R; 3JB9 F; 1VQK Q; 4LUD A; 3I9Q A; 5EC7 A; 3PMT A; 1Y57 A; 4HKE A; 2PTK A; 1W70 A; 1RAE B; 3CQT A; 1LJO A; 3JCM Q; 4C8Q A; 3FJ5 A; 4C8Q D; 1RAF B; 1YJN Q; 4DEX A; 5A0D A; 1QVF S; 3UA6 A; 1OV3 A; 4C5E A; 1VQN Q; 2QI2 A; 3CCQ T; 2QA4 Q; 1MMD A; 1SKU B; 1JU5 C; 4F16 A; 1UJ0 A; 1YJ9 Q; 5L8R E; 3TSW A; 2VGN A; 2QDY B; 5I21 A; 4PNO A; 2VGM A; 4RTZ A; 3V7C A; 5LJ3 e; 1B07 A; 1D1C A; 1E6G A; 3M54 A; 2K4Y A; 4L6V 5; 2RQV A; 3MEW A; 3CBP A; 1CSK A; 4F7U F; 4FYV B; 2QGG A; 1NLP C; 1YNZ A; 4F14 A; 2MPX C; 3HFO A; 1WI7 A; 4J9C A; 4BDY A; 4ME7 A; 2M51 A; 4E47 A; 5CQX A; 2GTJ A; 4F17 A; 4K11 A; 4M78 B; 2HQX A; 3NHN A; 2EJG A; 1EIF A; 2HKQ B; 2DVE A; 2MYS A; 1OPL A; 1RL2 A; 3URG A; 3QSU A; 1P92 A; 4BUG A; 1G2B A; 1VQ6 A; 3DLL A; 4PJN A; 3EFO B; 1C0M A; 1IHV A; 2FL7 A; 3A8O B; 2PU9 B; 3VYH B; 3CMA A; 1EX4 A; 4A4E A; 5KE2 A; 4C8Q C; 2QQA A; 3I56 T; 3CMA Q; 2JVV A; 2AZV A; 1Q86 R; 2QDL A; 2GCX A; 2MOX A; 3THK A; 1VQ9 Q; 5C0M A; 2OX7 A; 4ATO A; 1PKT A; 4HCC A; 1X43 A; 2DD5 A; 4XAX B; 4PFP A; 3RER A; 1VQ5 Q; 5GAN e; 1Q82 R; 2PVG B; 1W2B A; 1IZ6 A; 4GLM A; 2DAQ A; 1KC8 C; 3PMI A; 4JUV A; 4OMP A; 4DA4 A; 4D8K A; 9ATC B; 2ZZD A; 2RI2 A; 1MMA A; 2RM4 A; 1IHW A; 1HYO A; 2M16 A; 4N4I A; 2C0O A; 4OML A; 3QXE B; 1Y96 A; 1OPK A; 2X4Y A; 1YN8 A; 2GFA A; 2L3S A; 1X75 C; 1AWO A; 2EVR A; 2COZ A; 4FW2 A; 3INZ A; 2F1L A; 4C92 B; 1VUB A; 3QWX X; 3CCR T; 4PJO G; 3HTR A; 2FZG B; 3NTH A; 4A4G A; 4NL2 A; 4ANJ A; 3M59 A; 3V8K A; 1LCK A; 1GRI A; 3OMG A; 3CCM T; 1NPP A; 1RLQ C; 5GAN h; 1UE9 A; 5IN1 A; 4M7D B; 1TU0 B; 1M1K U; 4LDW A; 4B9X A; 3LWI A; 2EYW A; 1RUW A; 1IRX A; 1GCP A; 2BZY A; 3S3M A; 3LH5 A; 2KE9 A; 4QT7 A; 5KYY A; 3EGX B; 4GY5 A; 2O31 A; 3OYD A; 1M5Q 1; 4FYX B; 2C0T A; 3CC2 T; 1GCQ A; 2AZS A; 4PKC C; 3OS1 A; 1VQ6 T; 1K9A A; 4ZTF A; 3DLM A; 4BY6 C; 5CO7 A; 1WQ7 A; 2DER A; 4AMC A; 1KQS A; 1EZZ B; 4DEY A; 2NUT A; 1VIF A; 2R58 A; 2V8I A; 4M75 B; 4M4Z A; 1AOJ A; 2DTI A; 2QGF B; 4C8Q F; 2DE0 X; 1KK7 A; 1Y0M A; 3OYN A; 2JT4 A; 1YIT T; 1QVG S; 1MUZ A; 1Q81 U; 1M8V A; 2DL3 A; 4J7I A; 2F5T X; 2HBW A; 5FWB A; 2HSE B; 1UJY A; 1TWB A; 1IGQ A; 3PTA A; 5KCH A; 3EG2 A; 4UC4 A; 2LT1 A; 2E10 A; 1VQP T; 4HT8 A; 2CP3 A; 4JZ4 A; 3A8H B; 4OB2 B; 1YJW Q; 2K79 A; 3J7A F; 4QVD A; 5KE3 A; 4KBM B; 3E9F A; 1VQL Q; 1OZ3 A; 2Z0W A; 4Y92 A; 5GAM h; 4IUT A; 1Q95 G; 1BI0 A; 4LDU A; 4JDS A; 5DM7 R; 4XK8 E; 5KYX B; 3VS5 A; 2J7I A; 3CXC P; 3LLR A; 2WSF E; 3MCA B; 1GCQ C; 1R77 A; 5CQY A; 2MF2 A; 1QKW A; 2P84 A; 2MAM A; 1JRI A; 1UB4 A; 1N5Z A; 2YUN A; 2EGA A; 3QBY A; 4FYW B; 5FW9 A; 1XJW B; 2K9G A; 2MK5 A; 1PG5 B; 1QWE A; 4WTO B; 1MNE A; 5GAN 7; 1NBE B; 1BIB A; 3HKS A; 2KNB B; 2MCN A; 3VRZ A; 2CP6 A; 1UEC A; 2XI9 A; 4D8D A; 1YIJ A; 1R0B G; 4F7U E; 4KH1 B; 1WHH A; 1YHQ T; 3KBG A; 1ZSG A; 1YIJ Q; 2M0O A; 4XTV A; 2M9U A; 3FDR A; 1OQK A; 1VA7 A; 1G83 A; 3O8V A; 1M2O A; 3JCM e; 3OY9 A; 1Q86 U; 1VQM T; 2EYY A; 2AHJ B; 4DBF A; 2DXU A; 3RMQ A; 1KD1 C; 2NYS A; 4J8O A; 1T3L A; 1SHG A; 3PVL A; 4XU0 A; 1KG1 A; 1A0N B; 3VYG A; 2L0A A; 2JJ9 A; 2DRK A; 1Q82 U; 2KYB A; 1BCM A; 2SRC A; 1RAG B; 1Y07 A; 2DXT A; 3OYL A; 3CBO A; 2FEI A; 3H0F A; 2PVO B; 4KGV B; 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