The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
8
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sequence length |
58
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structure length |
58
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Chain Sequence |
VTLFVALYDYEARTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPV
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
FYN
|
| publication title |
Solution structure and peptide binding of the SH3 domain from human Fyn.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Phosphotransferase
|
| total genus |
8
|
| structure length |
58
|
| sequence length |
58
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 1996-04-22 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2A28 A; 4HVW A; 2EYW A; 1GFD A; 1JO8 A; 1WYX A; 2GBQ A; 3R6N A; 2CRE A; 1K0S A; 2DL5 A; 2ENM A; 2JW4 A; 1UGV A; 2JMC A; 2J7I A; 2ROT A; 1SPK A; 2BZX A; 2ED0 A; 1ABO A; 4HVU A; 2XMF A; 2I0N A; 2DLP A; 1UHC A; 2EVR A; 5FWB A; 4RUG A; 4D8D A; 2LP5 A; 1UDL A; 1ABQ A; 2KXD A; 2BTT A; 2J05 A; 1U3O A; 2PZ1 A; 1QWF A; 2B86 A; 1VYT A; 3EG1 A; 1SRM A; 1UFF A; 1X2Q A; 2EQI A; 3VS0 A; 1I1J A; 4E6R A; 2EYZ A; 2OJ2 A; 2CT3 A; 1SHF A; 2DBM A; 2RQT A; 1ZLM A; 1AEY A; 2FG0 A; 1GBR A; 5IH2 A; 2DL3 A; 2NUZ A; 3EGU A; 1KSW A; 2O88 A; 1I07 A; 1OPK A; 1JU5 C; 2V1R A; 5I22 A; 2LNH B; 4OMO A; 1ZUY A; 1OPL A; 4J9C A; 2L0A A; 3PVL A; 1JXM A; 2CH4 W; 1RUW A; 2J6K A; 1KFZ A; 4LE9 A; 3PVQ A; 3VS2 A; 1WA7 A; 2DL8 A; 2YDL A; 3FJ5 A; 2K6D A; 1AZE A; 2D8J A; 2ECZ A; 5L23 A; 1RI9 A; 1UJ0 A; 2A08 A; 2JM9 A; 1X27 A; 1SHG A; 2FPF A; 3TSZ A; 2CDT A; 2DA9 A; 2H8H A; 2LJ0 A; 1QLY A; 1ZX6 A; 2AZV A; 4ZNX A; 1UEC A; 4J9D A; 3M0Q A; 4AG2 C; 1BB9 A; 1JXO A; 1SSH A; 2X3X D; 3UAT A; 4IIO A; 1WXU A; 3THK A; 4OMM A; 4RTZ A; 3VS5 A; 4J9I A; 1X69 A; 4RTU A; 4RTX A; 4CC2 A; 5IHI A; 3REB B; 1AWW A; 1BBZ A; 2FPE A; 4HXJ A; 2W0Z A; 2JT4 A; 1NG2 A; 1W6X A; 1E6G A; 2EYY A; 2O9V A; 2HEQ A; 5IXF A; 1LCK A; 1CSK A; 2OAW A; 2DX1 A; 3JV3 A; 1AVZ C; 4HVV A; 3RNJ A; 1WFW A; 2EPD A; 2O2O A; 1YCS B; 2YT6 A; 1HD3 A; 3NMZ C; 1UUE A; 2LJ1 A; 4ORZ A; 4IIM A; 4F14 A; 2KRM A; 4J9F A; 4AFU C; 1PWT A; 1TUC A; 2HCK A; 2EKH A; 2IIM A; 2KRN A; 2LZ6 B; 2JTE A; 2RQU A; 5HCK A; 2ABL A; 4HCK A; 1K0X A; 4CC4 B; 2KE9 A; 1E7O A; 3ZL7 C; 2K79 A; 4ESR A; 1A0N B; 1Y0M A; 2YUN A; 4OMN A; 1EFN A; 2DIL A; 3NPF A; 1ZBJ A; 1NEB A; 2FPD A; 1XOV A; 1K76 A; 3M0P A; 2D0N A; 1GCP A; 2JMA A; 1GL5 A; 2RQV A; 2VWF A; 2O31 A; 2PNI A; 2EW3 A; 2EGA A; 2X3W D; 2KRO A; 3I35 A; 4RTV A; 1CKB A; 1RLP C; 1NYG A; 2BZ8 A; 3M0T A; 2L3Q A; 4LUD A; 1TG0 A; 4AG1 C; 1J3T A; 2ED1 A; 4F16 A; 2M51 A; 3NHN A; 1JQQ A; 1UJY A; 2RMO A; 2K9G A; 3EHR A; 2LJ3 A; 2KEA A; 1S1N A; 2KT1 A; 1V1C A; 2CT4 A; 4LN2 A; 2EYX A; 1WI7 A; 1B07 A; 1PNJ A; 3KFV A; 1X2K A; 4JJD A; 2GTO A; 1U06 A; 2CH4 A; 2FRY A; 3NGP A; 4JJB A; 1H3H A; 2RN8 A; 3H0H A; 1IO6 A; 2LQN A; 3QWY A; 1I0C A; 1VYV A; 2DL4 A; 2MOX A; 4DEY A; 2L3S A; 1PRL C; 1G2B A; 4J9B A; 1T3S A; 1X43 A; 1K4U S; 1W70 A; 3I9Q A; 1KJW A; 3VS3 A; 2DL7 A; 1NYF A; 1T0J A; 2FEI A; 2L3P A; 1VYU A; 3H0F A; 2YUQ A; 2C0O A; 2K3B A; 1PKT A; 1T3L A; 2QDL A; 4AFQ C; 1GCQ A; 5IHN A; 3VRZ A; 3SEM A; 1QWE A; 4JPB W; 2GQI A; 4LNP A; 2EGE A; 1Y57 A; 1ARK A; 1NEG A; 4CC3 A; 3RBB B; 1YN8 A; 3EG3 A; 2P4R A; 2SEM A; 2PTK A; 1AOJ A; 1NM7 A; 2FO0 A; 2KR3 A; 2O9S A; 2RF0 A; 2K2M A; 4K11 A; 2F2W A; 3H0I A; 2LCS A; 3EG0 A; 2K7A A; 2AK5 A; 2F2X A; 3GBQ A; 4GLM A; 2JS2 A; 5IXB A; 1E6H A; 2VVK A; 1QCF A; 5GJV B; 1WX6 A; 3I5S A; 1WLP B; 3TSW A; 2AKL A; 1B3Q A; 4OML A; 2HDA A; 1OV3 A; 2ROL A; 1H92 A; 4CC7 A; 1YNZ A; 2GTJ A; 3UA6 A; 2KNB B; 1WXB A; 1RLQ C; 2L2P A; 1WDX A; 2KYB A; 1NLP C; 3UF4 A; 1VA7 A; 2E5K A; 4RTT A; 3VS7 A; 4AFZ C; 2CUD A; 1UE9 A; 3VS6 A; 2DYB A; 3O5Z A; 1UTI A; 1AWJ A; 5IHK A; 4WCI A; 1MUZ A; 2RNA A; 1UG1 A; 2J06 A; 4QT7 A; 1QKW A; 2CUB A; 2D1X A; 2GNC A; 1WXT A; 2JXB A; 1PRM C; 1ZSG A; 3TVT A; 2F2V A; 4R0K A; 2W10 A; 3REA B; 1OOT A; 2DRM A; 1ZUK A; 1Z9Q A; 3IQL A; 2CSI A; 1AWO A; 5ECA A; 2KXC A; 2KRS A; 1M27 C; 3C0C A; 3ULR B; 1GRI A; 5GJW B; 1GCQ C; 1K9A A; 4RTW A; 1PHT A; 2KYM A; 3M0R A; 1ZUU A; 1OEB A; 1TUD A; 2KT8 A; 2LMJ A; 2J6F A; 1HSQ A; 2BZY A; 1UHF A; 2EBP A; 4EIK A; 4FSS A; 2NWM A; 4J9G A; 2OI3 A; 5EC7 A; 1T0H A; 3VRY A; 1G83 A; 1SEM A; 1CKA A; 2DVJ A; 4KRT A; 2DRK A; 2YUO A; 4GBQ A; 1M30 A; 1Z9Z A; 2DE0 X; 5FW9 A; 4Z89 A; 1NLO C; 3H41 A; 3M0U A; 1M3A A; 2LX7 A; 4AFS C; 2RQW A; 1M3C A; 3EHQ A; 1M3B A; 2KBT A; 4X1V A; 3SHW A; 4JZ4 A; 1AZG B; 1X6G A; 5I11 A; 3A98 A; 4Z8A A; 2ESW A; 3UA7 A; 2M0Y A; 2V1Q A; 2A37 A; 1SRL A; 1JEG A; 1HJD A; 1GBQ A; 3PE0 A; 2SRC A; 4JJC A; 2DNU A; 2D8H A; 1QKX A; 1FMK A; 2GGR A; 1AWX A; 1BK2 A; 1H8K A; 2EGC A; 4A63 B; 2DF6 A; 2DM1 A; 1WIE A; 2J6O A; 3VS4 A; 2G6F X; 2FRW A; 5FWC A; 2DJQ A; 3CQT A; 4OMP A; 1YWO A; 2DBK A; 1K1Z A; 4Z88 A; 1BU1 A; 4D8K A; 2RPN A; 1KIK A; 2MCN A; 2CSQ A; 3M0S A; 2RQR A; 1N5Z A; 1YWP A; 3EG2 A; 1FYN A; 4Y92 A; 4LUE A; 2JM8 A; 3QWX X; 2VKN A; 3I5R A; 2AZS A; 2MIO A; 2HSP A; 1W1F A; 2AKK A; 2C0I A; 2DMO A; 3U23 A; 4JZ3 A; 4RTY A; 3LH5 A; 1MV0 B; 1AD5 A; 4F17 A; 2A36 A; 2HBW A; 2JS0 A; 2KGT A; 1M8M A; 2YSQ A; 4J9E A; 2C0T A; 4M4Z A; 4J9H A; 1MV3 A; 1GFC A; 2LQW A; 4DEX A; 2YUP A; 1X6B A; 4OMQ A; 3VS1 A; 1U5S A; 1PKS A; 1YP5 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4B6M A; 4DA4 A; 4XTV A; 3CBP A; 1K8A R; 1D3B A; 3QKJ A; 1YIT A; 2E5Q A; 4IUV A; 3V8K A; 3CC4 T; 3CXC A; 1G3T A; 3P8D A; 4MZP A; 4PJM A; 1Q81 U; 2JTF A; 4RKU E; 5CO7 A; 2K5L A; 1SPK A; 2CP5 A; 4C8Q D; 3MP8 A; 2IVW A; 2XMF A; 4Y91 A; 2DLP A; 5GAM d; 3CC4 Q; 4PJO G; 5GAN f; 1YJN A; 2QXF A; 4NL3 A; 1G8X A; 2NUP A; 3KUF A; 1SRM A; 2M1H A; 2KMT A; 4C5G A; 4E6R A; 1I1J A; 4R56 A; 5CKE A; 5J3B A; 2EYZ A; 2LCL A; 2HZY A; 3CCM T; 3ZFJ A; 1AEY A; 1GBR A; 4QW2 A; 4FYV B; 2VYT A; 2DL3 A; 4ZTF A; 5GAO p; 1KSW A; 1I07 A; 3OYH A; 1LNX A; 2V1R A; 3JB9 J; 3GPL A; 1M2V A; 1ZUY A; 4MMK A; 4E47 A; 2DET A; 5GMK i; 2CH4 W; 1FWZ A; 3QUI A; 1KFZ A; 3OYF A; 3VS2 A; 2DL8 A; 2DTH A; 3PTA A; 2HSE B; 2K6D A; 5GAM h; 4ZGJ B; 1KHI A; 1NJI U; 1TXQ A; 1RL2 A; 1MMD A; 2VAS A; 1IRX A; 2M9U A; 1Q81 R; 5HK3 A; 3JRZ A; 4M7A A; 1YBY A; 4M7D A; 1X27 A; 1SHG A; 4O5V A; 3VUZ A; 4F7U F; 1M1G A; 2FVU A; 1PM3 A; 1F1B B; 1WHJ A; 2AZV A; 4ZNX A; 4GY5 A; 1BB9 A; 1O75 A; 4C92 B; 1G3Y A; 4DBQ A; 4RTZ A; 3OS0 A; 4M78 E; 4J9I A; 3DB4 A; 2GQV A; 4J6W A; 2K5I A; 3F70 A; 3RKY A; 5IHI A; 4N4H A; 1YI2 T; 4EMK B; 3QHS A; 2O9V A; 5A0D A; 2M16 A; 4J83 A; 4FSX A; 1AVZ C; 4OF1 A; 4N4G A; 1HD3 A; 3CC2 T; 1UUE A; 4C8Q A; 3CCU T; 2KRM A; 4J9F A; 2NUT B; 1PWT A; 3RR6 A; 2QGF B; 1G3S A; 4M7D E; 1ZQ1 A; 2IIM A; 3CME A; 2RQU A; 5HCK A; 4LDW A; 2ABL A; 8AT1 B; 5A0L A; 1R0B G; 1E7O A; 1NJI R; 1G5V A; 3CCU Q; 2MAM A; 3CCS Q; 1A0N B; 4PJN A; 1Y0M A; 1UGR B; 4JRP A; 4OMN A; 2DIL A; 1NEB A; 3FC3 A; 3GLX A; 1GCP A; 2JMA A; 5KYN A; 4LDU A; 3L2Q A; 1QVG A; 2H3J A; 3OYC A; 2A0F B; 3CPW P; 3QZ5 B; 3I35 A; 2HAX A; 1DJ7 B; 2R58 A; 3UPU A; 1VQN Q; 4LUD A; 1N9S A; 2DXT A; 1TG0 A; 3EG9 A; 4X34 A; 4XTY A; 5GAN 4; 1JQQ A; 2RMO A; 3EHR A; 1VQK T; 2ZPE B; 2CZ0 B; 1V1C A; 5FU7 B; 2P84 A; 2VXE A; 1VUB A; 5KCH A; 5GAN 6; 1KC8 U; 4XU2 A; 1PNJ A; 2YLC A; 1X2K A; 3OYI A; 2GTO A; 1U06 A; 3NGP A; 3I55 T; 1VQK Q; 2RN8 A; 3GP8 A; 3OYL A; 2LQN A; 5GAN e; 1I0C A; 1M4Z A; 1VYV A; 2DL4 A; 2O4X B; 2X4W A; 4M75 B; 2LRQ A; 4J9B A; 1X43 A; 2RHX A; 4KUI A; 3JB9 G; 3I9Q A; 1VQ6 T; 3I55 Q; 2DL7 A; 1NYF A; 1EIF A; 4PJO A; 1VQ8 Q; 5GAO n; 2K3B A; 1IB8 A; 3C12 A; 1BIB A; 4XTZ A; 4PJJ A; 1T3L A; 2CZ1 B; 3CCR T; 2DXC A; 5DLO A; 5IHN A; 1JB0 E; 2FZG B; 3SEM A; 5IAY A; 1QVF P; 1D09 B; 1HK9 A; 1VQ6 Q; 2EGE A; 5FLX E; 3S3O A; 1NEG A; 1FMW A; 3E1S A; 5I2S A; 4II1 A; 3CCR Q; 2PTK A; 3OW2 P; 3L2R A; 3BW1 A; 3I56 T; 2GFU A; 2VB6 A; 1MMG A; 2X9H A; 3OMG A; 4A4E A; 3M59 A; 4MZM A; 3L1A A; 5IXB A; 5KYY B; 3P8B B; 3I56 Q; 4QVD A; 1B3Q A; 1KC8 R; 3NTH A; 2V26 A; 4PJO E; 2RI3 A; 1H92 A; 3JAM E; 1YNZ A; 5L8R E; 3RUX A; 2YXY A; 4XU1 A; 3CXC P; 1MND A; 2XKO C; 1WDX A; 5GAO m; 2L5Q A; 2E5K A; 4RTT A; 3VS7 A; 5I21 A; 2OTL T; 1SF9 A; 3WXM B; 3X28 B; 1PSE A; 2OTJ Q; 1PCX A; 5IHK A; 2PVG B; 1MUZ A; 1VQ9 A; 2OTL Q; 1BCO A; 4OMF B; 5HK0 A; 4QT7 A; 4C0F A; 2D1X A; 2RI5 A; 3SDZ A; 4M78 C; 3CCE Q; 1G3W A; 1PRM C; 2RJE A; 5FRO A; 1QQJ A; 3GOX A; 1K73 U; 2F2V A; 2EQK A; 4X9C A; 1M1K C; 3G6E Q; 1U8R A; 2DRM A; 1VQM A; 3SWN C; 4M75 G; 1ZUK A; 1PG5 B; 1Z9Q A; 3IQL A; 5GAN 3; 2EJF A; 4KUL A; 1YIJ A; 1M27 C; 1R8O B; 4OVA A; 4BI3 A; 2DTO A; 3C0C A; 2PU9 B; 1VQ5 A; 1RAF B; 4J7I A; 1MMA A; 1PHT A; 3HFO A; 2CS7 A; 1I5O B; 2RJF A; 2BZY A; 5GAM g; 5A2Q E; 1UHF A; 1X6O A; 4J7F A; 1UB4 A; 5CQY A; 2RHZ A; 3JB9 F; 1T0H A; 2LTO A; 1VIF A; 2E65 A; 4DBF A; 3UT1 A; 1CKA A; 3QJ6 A; 2YUO A; 1M30 A; 4Z89 A; 1M3A A; 3SB2 A; 4AFS C; 2RQW A; 4X9D A; 2QA4 Q; 1XJW B; 3OMC A; 1X6G A; 4HA8 A; 2QEX A; 5GAN 5; 3A98 A; 2IPO B; 1K73 R; 2WSF E; 2QAZ A; 3VKI A; 2XID A; 2GGR A; 2XIC A; 2QG9 B; 3JCM V; 1H8K A; 2QQ9 A; 2ATC B; 1Y71 A; 1YIT Q; 2AHJ B; 2G6F X; 2P4T A; 4J6Y A; 1SKU B; 2LVM A; 5FU6 B; 2KSS A; 4OGE A; 3E9F A; 2CYZ B; 4D8K A; 2RPN A; 1TU0 B; 2EJG A; 1KIK A; 4AT1 B; 2E6N A; 1O9S A; 3CCQ T; 2XDD A; 1NE8 A; 3QWX X; 4C92 A; 2A3L A; 1YJN Q; 3CMA T; 1D0Y A; 2E6Z A; 2DMO A; 3LH5 A; 1AD5 A; 3PIO A; 4BI4 A; 2VXF A; 1ZSZ C; 3OS5 A; 3P8H A; 1QVG P; 3CBM A; 2MMP A; 1P92 A; 4GLK A; 1MV3 A; 2KI7 A; 4L6V 5; 1GFC A; 4DEX A; 2YUP A; 3VS1 A; 4FT4 A; 1YP5 A; 2A28 A; 1Q82 C; 1ZBX A; 2EYW A; 2WAC A; 1WYX A; 3OBW A; 2QI2 A; 3R6N A; 2AT1 B; 2Y4Y A; 2XU8 A; 1K0S A; 4XTX A; 2DL5 A; 4ZN3 A; 5D6Y A; 3MO8 A; 2JMC A; 2YLB A; 4C0D C; 4KH0 B; 3NTK A; 1BCM A; 2XDB A; 5IT9 E; 4C92 E; 3C95 A; 1VOM A; 1YCY A; 4PJO C; 4RUG A; 3LW5 E; 1LPL A; 1C6V X; 2KXD A; 2BTT A; 2J05 A; 1U3O A; 2COW A; 5IN1 A; 4AMC A; 1QWF A; 3PMT A; 1ZA2 B; 1UFF A; 1X2Q A; 3VS0 A; 3MEU A; 1VQ7 A; 3JCM b; 1V76 A; 3Q1J A; 1PD1 A; 2RQT A; 3VV0 A; 2FG0 A; 3HKS A; 1YJW A; 1YHQ A; 4HCC A; 4IUP A; 3MJX A; 3M4Y A; 2XK0 A; 3RKW A; 1OPK A; 2GFA A; 4N4I A; 3JCM d; 3R6O A; 1N9R A; 1PD0 A; 1RAE B; 4A53 A; 1OPL A; 1WZO A; 3PVL A; 2J6K A; 1RUW A; 3PVQ A; 1S72 A; 5D7U A; 3CD6 T; 1IHW A; 2R57 A; 3FJ5 A; 2P0P A; 9ATC B; 4JRQ A; 5KYW B; 1TS9 A; 4LXC A; 5LJ3 e; 2ECZ A; 3LYI A; 1UJ0 A; 2A08 A; 2D9T A; 3X25 B; 3CME Q; 3H8Z A; 2PUO B; 4M78 D; 2AIR B; 3M55 A; 5EG2 A; 3TSZ A; 1VQP A; 3CC7 T; 1RAC B; 2H8H A; 2LJ0 A; 1RAB B; 1QLY A; 3ME9 A; 8ATC B; 1OU8 A; 1UEC A; 2DO3 A; 3JCM h; 1JXO A; 4IIO A; 4C5I A; 3V7S A; 1WXU A; 1W2B S; 2JOY A; 5KE3 A; 1JJ2 S; 4RTU A; 2R5A A; 5KE2 A; 4MML A; 3REB B; 2QYZ A; 1AWW A; 2COY A; 4M7D D; 1NG2 A; 1W6X A; 2EYY A; 4M75 E; 1LCK A; 5GMK e; 3VJP A; 1KQ1 A; 3HRT A; 2DX1 A; 3BDU A; 2OX7 A; 1QCN A; 4DOW A; 2YRV A; 4ZTJ A; 2EPD A; 3URG A; 4IIM A; 1JBM A; 4AFU C; 1WHG A; 3RIR A; 1TUC A; 3OBY A; 2HCK A; 2V8K A; 2CP2 A; 2EKH A; 4JDS A; 2LZ6 B; 3V7C A; 4HCK A; 1K0X A; 4CC4 B; 2E3I A; 3NTI A; 4XU3 A; 2YUN A; 2H3E B; 3GNG A; 5GAO l; 3NPF A; 1XOV A; 3GIB A; 5GAN d; 1U1S A; 2QTX A; 1GL5 A; 4MZT A; 2M0O A; 2PNI A; 2EW3 A; 6AT1 B; 1TWB A; 2RO0 A; 3MEA A; 4RTV A; 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