The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
67
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sequence length |
249
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structure length |
244
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Chain Sequence |
HGVCWIYYPDGGSLVGEVNEDGEMTGEKIAYVYPDERTALYGKFIDGEMIEGKLATLMSTEEGRPHFELMPGNSVYHFDKSTSSCISTNALLPDPYESERVYVAESLISSAGEGLFSKVAVGPNTVMSFANGVRITHQEVDSRDWALNGNTLSLDEETVIDVPEPYNHVSKYCASLGHKANHSFTPNCIYDMFVHPRFGPIKCIRTLRAVEADEELTVAYGYDHSPPEAPEWYQVELKAFQATQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transferase
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| source organism |
Homo sapiens
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| publication title |
SET7/9 catalytic mutants reveal the role of active site water molecules in lysine multiple methylation.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Histone-lysine N-methyltransferase SETD7
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| total genus |
67
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| structure length |
244
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| sequence length |
249
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| ec nomenclature |
ec
2.1.1.43: Histone-lysine N-methyltransferase. |
| pdb deposition date | 2010-03-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00856 | SET | SET domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. | ||
| Mainly Beta | Beta Complex | Beta-clip-like | SET domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3RJW A; 5F59 A; 3M54 A; 5JJ0 A; 2F69 A; 3F9W A; 3N71 A; 5CPR B; 5T0K A; 3OPE A; 5KJN A; 3MO0 A; 4QEO A; 3SW9 A; 3S8P A; 4J7I A; 5LSX A; 4O30 A; 3QWW A; 3EP0 A; 5JIY A; 3QWP A; 4Z4P A; 3PDN A; 3KMT A; 1N6A A; 3HNA A; 2W5Y A; 3K5K A; 1H3I A; 3DB5 A; 3RIB A; 5T5G A; 5EX0 A; 5HQ8 A; 3F9X A; 3S7D A; 4IJ8 A; 1ML9 A; 2BQZ A; 2W5Z A; 5F5E A; 3OXF A; 4NJ5 A; 3F9Y A; 4QEN A; 1PEG A; 2IGQ A; 1N6C A; 4YNM A; 5JIN A; 5F6K C; 4J83 A; 3RAY A; 3OS5 A; 4QEP A; 1MUF A; 5CCM A; 3MO2 A; 3OOI A; 5EX3 A; 4J7F A; 4H12 A; 5HI7 A; 4WUY A; 3OXG A; 3CBO A; 4YPE A; 4BUP A; 4J8O A; 4I51 A; 5KJL A; 4JLG A; 3MO5 A; 1N3J A; 3M58 A; 1ZKK A; 4MI0 A; 5KJK A; 5KJM A; 3M57 A; 4C1Q A; 1MVX A; 5EG2 A; 4MI5 A; 3BO5 A; 3TG4 A; 3S7J A; 3FPD A; 3F9Z A; 5JHN A; 3KMA A; 3CBP A; 3M55 A; 3DAL A; 5CCL A; 5T0M A; 1O9S A; 4O6F A; 3RU0 A; 1MT6 A; 5ARF A; 2QPW A; 3IHX A; 3QWV A; 4E47 A; 3KMJ A; 3S7F A; 4IJD A; 4LDG A; 5TH7 A; 5TEG A; 3M5A A; 4JDS A; 3RQ4 A; 4FMU A; 3VUZ A; 3SWC A; 4NVQ A; 2JV0 A; 5F6L A; 4RZ0 A; 2G46 A; 4YND A; 3S7B A; 2O8J A; 4YPA A; 1MVH A; 5LSZ A; 4AU7 A; 5ARG A; 1XQH A; 2R3A A; 4YPU A; 3OXL A; 5TTF A; 3VV0 A; 3M56 A; 3M59 A; 3M53 A; 3CBM A; 5AYF A; 4YNP A; 3TG5 A; 3MEK A; 2RFI A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2RH2 A; 2HBW A; 1QW1 A; 2DMO A; 3JCM W; 1TOV A; 3CPF A; 4M77 B; 1M90 R; 5KJN A; 1YJN Q; 4MZP A; 4OB2 B; 2HZY A; 2RK1 A; 1Y96 A; 5DM7 R; 2DXU A; 3K5K A; 2MK5 A; 4R56 A; 2EW3 A; 2L3Q A; 2XIC A; 3RIB A; 1K9M R; 1YJN T; 1PKT A; 4C92 B; 1BIB A; 3CD6 A; 3BE3 A; 4JLI A; 1KG1 A; 5EX0 A; 3DB3 A; 3UA7 A; 4IJ8 A; 3LLR A; 4NJ5 A; 4QEN A; 2ESW A; 3N5B B; 2V1R A; 2AHJ B; 3DLL A; 2DE0 X; 3GP8 A; 1TUD A; 3CPW A; 3PGG A; 4LE9 A; 2V26 A; 3NMZ C; 4ZGD B; 2MI6 A; 3RDV A; 2LRQ A; 2QK0 A; 2F2V A; 4B6M A; 2MWO A; 4GY5 A; 4YTL A; 3DLM A; 1W2B S; 2R5A A; 2HSE B; 3CEY A; 4JJN K; 2DD5 A; 3EFR A; 3JB9 H; 1VQ4 Q; 3SHW A; 4MI0 A; 1Y0M A; 4M7D A; 2JS0 A; 2J05 A; 2KDS A; 3L2Z A; 1K8A C; 3KXT A; 2KXD A; 5T0M A; 1VQ4 T; 5I22 A; 1NJI U; 1YCS B; 4AG1 C; 2ZZD A; 1WX6 A; 4LDG A; 5D7U A; 3FJ5 A; 2FG0 A; 3RIR A; 2E65 A; 3SEM A; 2AZV A; 1QCO A; 1VQM Q; 3ULR B; 1OOT A; 4J5Y A; 3OYC A; 4QT7 A; 4QVC A; 4J6Y A; 3GIB A; 2R3A A; 3VRY A; 1R8O B; 4BI8 B; 3I55 A; 3ZEH A; 1VYV A; 1BCM A; 1SHF A; 2XG8 D; 3JRZ A; 2E3H A; 2QA4 A; 1I07 A; 4OP0 A; 3ME9 A; 3H0H A; 3TEE A; 3X20 B; 1C6V X; 4B9W A; 4MZM A; 2YUN A; 1ZUY A; 2OTJ Q; 1ZSG A; 2VKN A; 3TSW A; 2ATC B; 4QQ6 A; 4KBM B; 4C92 E; 7AT1 B; 5GMK h; 1T3L A; 1QMC A; 1T0H A; 5FLX E; 3OYI A; 5A0L A; 2AKL A; 2K2V A; 4JZ3 A; 3JCM d; 4EPC A; 4Y91 A; 1N6C A; 1UGV A; 4M75 C; 1PD1 A; 5EC7 A; 4OMO A; 2E12 A; 4XTX A; 3FIF A; 4JRK A; 1MNE A; 1TU0 B; 4N4I A; 4BB7 A; 4KUL A; 4NOY A; 3HRT A; 2J6O A; 1UHC A; 5J3B A; 2VGM A; 5GAO q; 2KSS A; 1WZO A; 3QDF A; 5KJK A; 3PMT A; 5GAO n; 5KJM A; 1FX7 A; 2A36 A; 5EG2 A; 2O4X A; 1AD5 A; 2X4J A; 4WF2 A; 4QQG A; 1TXQ A; 4K11 A; 4EMK B; 1FMK A; 1PHT A; 2EFI A; 4A4E A; 3O8V A; 1O9S A; 1VYT A; 4DBH A; 1W1F A; 5LJ3 h; 3CXC A; 1JJ2 S; 2FB7 A; 4E7L A; 2RJF A; 4HCC A; 3OYD A; 1Y7X A; 2RK2 A; 4WTO B; 3MHX A; 2NUP B; 3PMI A; 1XOV A; 5F6L A; 3CCL A; 3QO3 A; 3ASK A; 2QTV A; 4J9E A; 4OMM A; 3RUX A; 4XU1 A; 4E7H A; 4DEX A; 1G3Y A; 1Z9Z A; 2KI7 A; 3D7S B; 5LSZ A; 1N8R R; 4M77 A; 2YRC A; 3JV3 A; 4C8Q D; 3CMA A; 1BI2 A; 5AYF A; 2ZPI B; 2MAM A; 1M1K C; 1UGS B; 3LWH A; 2GNC A; 2D8J A; 4F04 B; 2XHC A; 2KMT A; 2DTO A; 4MDW A; 1Q82 C; 1VQO T; 2DXB A; 2XU8 A; 1HJD A; 4C92 A; 4M7D F; 3EHR A; 1ABQ A; 1KQS S; 3QSU A; 5GAM h; 2E70 A; 1SG5 A; 1YIJ A; 3CC7 Q; 2LC4 A; 3I56 Q; 1X6G A; 2DL5 A; 4M7A B; 1AWJ A; 3OYH A; 1M5Q 1; 1S1N A; 1H3Z A; 2CYZ B; 2KRM A; 2R58 A; 1U1T A; 3I56 T; 1VQL A; 1W70 A; 1K9A A; 1N9R A; 4YNM A; 3A98 A; 1KC8 U; 3MP6 A; 3AT1 B; 3MO2 A; 1VQK A; 2LJ3 A; 3CCR A; 1UTI A; 3OYA A; 2EGA A; 4XU3 A; 3A8L B; 2FHD A; 3CBO A; 1HD3 A; 1TSF A; 5KYU B; 2RQU A; 4L5G A; 2RHZ A; 2E5Q A; 1I4K 1; 1MV3 A; 2BKD N; 3S3N A; 4XAX B; 1ZKK A; 2PVO B; 3LYI A; 1RLP C; 1M90 U; 2MF2 A; 1YI2 Q; 4JRP A; 3BO5 A; 1RAI B; 3TG4 A; 1JJ2 P; 3OSS C; 1WQW A; 2RMO A; 3E9F A; 1RAG B; 2IIM A; 2RJC A; 1K9M U; 1GL5 A; 1PM3 A; 1YI2 T; 3S7F A; 4Z88 A; 2K2M A; 1SEM A; 2YRD A; 4A54 A; 4MMK A; 4RTV A; 1UG1 A; 5LJ5 e; 1JQQ A; 2BE9 B; 2CP5 A; 3VS4 A; 3CCQ A; 5HK0 A; 1VQ9 T; 3MJX A; 3V8K A; 4BE1 A; 1NM7 A; 2RI3 A; 3JB9 G; 1ZSZ B; 1MVH A; 2KY9 A; 3QG1 A; 1YWO A; 1ZBX A; 4BY6 B; 4M78 D; 2GFA A; 3O5Z A; 1U8R A; 4BI4 A; 2VB6 A; 3SDZ A; 3CBM A; 1EX4 A; 1R77 A; 4FYX B; 1MMD A; 1QWF A; 2CP7 A; 5T0K A; 4F7U E; 4FU6 A; 1D1A A; 2PVD B; 2BUD A; 3QWP A; 4F17 A; 1OZ3 A; 2NLU A; 1X6B A; 1WI7 A; 5GAN h; 2R57 A; 2XKO C; 5AT1 B; 1GRI A; 4NS5 A; 1EZZ B; 2HQX A; 4Z02 A; 2O2O A; 3OBW A; 3H0I A; 3E9G A; 3L1A A; 3MPU B; 5LJ3 f; 2CUB A; 1BYM A; 1VQO A; 3OYY A; 3QZ5 B; 1WHH A; 1VQ8 A; 3U23 A; 3FB9 A; 5L8R E; 2MOX A; 4F7U G; 3H41 A; 4PFZ A; 2RI2 A; 4C0D B; 3KBG A; 3TSZ A; 3L2U A; 4M77 F; 2ZPF B; 1MGQ A; 3PTA A; 4EMK A; 3CC2 T; 3I9Q A; 1Y96 B; 3DKM A; 1M8M A; 5CKD A; 3OQ5 A; 2V8K A; 1RI0 A; 3QXE B; 1AVZ C; 3C95 A; 2JM8 A; 2P0K A; 4C92 F; 3KMA A; 2F5K A; 3EH2 A; 5A0D A; 2EJG A; 2NUP A; 4LDW A; 2H3J A; 1QVG A; 3HFN A; 4PFP A; 4JJC A; 3RKY A; 2JNG A; 4Z89 A; 1PNJ A; 2E10 A; 3VUB A; 3P8B B; 5GAM f; 5CKH A; 1IRX A; 2L3P A; 3VRZ A; 3ZFJ A; 2DX1 A; 2DRM A; 4NL3 A; 3RBB B; 1S72 A; 4XTU A; 2HEQ A; 1PC0 A; 2DL8 A; 4FW1 A; 2X3X D; 3OW2 A; 2BZX A; 1IB8 A; 4PJO B; 1PKS A; 1NEG A; 3EH1 A; 4C5I A; 1PCX A; 2E3I A; 2LT4 A; 3HL8 A; 2OTL T; 2GTO A; 1WA7 A; 3X25 B; 3VJP A; 5GAN g; 3G71 Q; 3NPF A; 4M7A A; 2JT4 A; 2CT3 A; 3EG9 B; 4OB0 B; 5CPR B; 3HRS A; 2FZG B; 1M1G A; 5FU6 C; 3GLX A; 5ECA A; 2BTT A; 4XTY A; 1VQ9 A; 1ZQ1 A; 2HKQ B; 4XK8 E; 5IHK A; 3JCM c; 1AEY A; 2OAU A; 4MML A; 4HVW A; 2DBK A; 3G71 T; 4F14 A; 1VQ7 A; 2VVK A; 4KH1 B; 3SWN B; 2RHU A; 2YLB A; 2JW4 A; 1G3T A; 1ML9 A; 2BQZ A; 2W5Z A; 1YIT Q; 1NZ9 A; 3G6E Q; 4GLK A; 1VQ6 Q; 2BIV A; 4C8Q C; 4BE0 A; 1FXX A; 5KYU A; 4XTW A; 1JO8 A; 1X01 A; 3M0R A; 2KQW A; 1N8R U; 2WAC A; 3P8D A; 1YIT T; 2VYT A; 4C0G A; 3EG2 A; 1VQ6 T; 3OXG A; 1CKB A; 2DIG A; 2CH4 W; 2AT1 B; 1ABO A; 4CC3 A; 3MEW A; 4JLG A; 5IXB A; 5CQY A; 2DER A; 2GCX A; 5HK3 A; 4AFQ C; 2EQM A; 3MEV A; 3CCV Q; 4IUQ A; 3HSB A; 3S3O A; 5JHN A; 4HCB A; 1UFF A; 1AWX A; 1YN8 A; 2K5F A; 3EFS A; 1D0Z A; 5GMK m; 2QEX Q; 5CK9 A; 4FYV B; 1YJ9 A; 1SSH A; 3PE0 A; 4JRI A; 4IIO A; 1ZHI A; 3CCV T; 3JCM b; 4IJD A; 1SPK A; 1ZSZ A; 2DZC A; 2DFU A; 1D0Y A; 3LH5 A; 3EG3 A; 1PRM C; 1WHM A; 1D1C A; 2EYZ A; 2I0N A; 3BY7 A; 2D9T A; 2QEX T; 1V1C A; 5KYW B; 2COW A; 5IT9 E; 2DKG A; 3CCS A; 2K3Y A; 1M1K R; 4QVD A; 2Y4X A; 4QVZ A; 3NTH A; 2X9H A; 1VOM A; 3JB9 F; 4Z8A A; 1Q82 R; 3CCU T; 4II1 A; 2O4X B; 3J7A F; 3OYG A; 5F59 A; 5L23 A; 2M51 A; 3IQL A; 2QA4 Q; 5KE3 A; 1D09 B; 2O31 A; 4FT4 A; 2RN8 A; 4J7I A; 3NGP A; 3MEU A; 2KVQ G; 4ESR A; 1ZUU A; 3KMT A; 1M9S A; 1VQN A; 2VXF A; 4JS4 A; 1SKU B; 1UB4 A; 4LXC A; 1EFN A; 2QQR A; 1QVP A; 5KYY B; 5KYX B; 3E2U A; 2DRK A; 1RAA B; 1YJW Q; 4LDY A; 1X2K A; 2DM1 A; 2EYQ A; 4M78 C; 1K0X A; 5GAN 7; 3GNG A; 3QHS A; 4PJJ A; 8AT1 B; 2M9U A; 5GAN 4; 3HRU A; 1MHN A; 1YJW T; 1WHK A; 1YHQ Q; 1JU5 C; 1UJY A; 4M7D D; 5LJ5 j; 3L2Q A; 1RAE B; 1AWO A; 3DB4 A; 1OX8 A; 3JCM Q; 3I35 A; 2BE7 D; 2EYY A; 2LDM A; 4M7A F; 2PNI A; 1YHQ T; 1MMA A; 2ZPE B; 3NHN A; 3A8M B; 1JXO A; 3OBY A; 3CCE Q; 2CS7 A; 2FRW A; 5FRM A; 1MT6 A; 5ARF A; 1Y57 A; 2J6F A; 5GAN j; 4J9G A; 3JCM P; 1GXI E; 2JN0 A; 5TEG A; 3JCM J; 1RAB B; 4KH0 B; 2LJ1 A; 4HVV A; 4PJO A; 4N0A A; 1QVF S; 2XDP A; 1CKA A; 1KD1 U; 3EGD A; 2RQV A; 3SD4 A; 2EJ9 A; 1FMW A; 2DYI A; 1Q7Y C; 2QXF A; 5GAO p; 2XD0 A; 2W10 A; 3V8L A; 1OX9 A; 1ZLM A; 2RHY A; 1J3T A; 1XNI A; 3OA6 A; 3CXC P; 1SRM A; 4RUG A; 3EG9 A; 2CH4 A; 2L3R A; 4UC4 A; 2RI5 A; 3CCM A; 2M16 A; 1WFW A; 3LW5 E; 1IHV A; 1B34 A; 2M02 A; 2ZPG B; 3A8H B; 3VS6 A; 1HSQ A; 3SWN A; 1GBR A; 2E5K A; 4X9C A; 2FVU A; 1KSW A; 5GAN 8; 4ATO A; 5JIY A; 1VQ5 Q; 3CCJ A; 3TU4 K; 1UUE A; 3OYF A; 1N6A A; 1D1B A; 2ROL A; 1NEB A; 2C0O A; 3KFV A; 2DYB A; 5HQ8 A; 1ZX6 A; 3REA B; 5FWC A; 1G2B A; 4HT9 A; 2O01 E; 1UDL A; 1VQM T; 1BIA A; 3REB B; 5LJ5 d; 1VQ5 T; 4F16 A; 3G4S A; 5GMK e; 1P92 A; 1GCQ A; 1WQ7 A; 1MMG A; 2CSI A; 2D0Q B; 5IXF A; 4C5E A; 5EX3 A; 1MV0 B; 1NPP A; 2LCC A; 4E7I A; 4WUY A; 2A0F B; 3CME Q; 3OY9 A; 1SSF A; 4EIK A; 1W4S A; 1T3S A; 1BK2 A; 3X28 B; 2CRE A; 2OTJ T; 3CME T; 3T9N A; 1RLQ C; 1BU1 A; 2JMA A; 3JCM X; 3EG1 A; 5CCL A; 1QVF P; 1Q81 R; 2KNB B; 2Y4Y A; 1B3Q A; 3HP9 A; 5KYW A; 1E6G A; 1M3B A; 2EYW A; 3C94 A; 4ZGE B; 4HCK A; 2GFU A; 2XI9 A; 1NLP C; 4OGC A; 3CC4 Q; 1LOJ A; 2CT4 A; 2QQ9 A; 1YJN A; 1HK9 A; 3SWC A; 2DAQ A; 4DOW A; 2FRY A; 1MUZ A; 2G46 A; 3UA6 A; 2HL5 C; 4M77 D; 4YND A; 4BY6 C; 2YUO A; 3LWI A; 2EKO A; 2DIQ A; 9ATC B; 3Q1J A; 3CC4 T; 2Z0W A; 2LJ0 A; 2DK3 A; 1LCK A; 1JB0 E; 2K79 A; 2CP3 A; 5TTF A; 2QDY B; 2OJ2 A; 2YXY A; 2FPD A; 2EWN A; 1H3I A; 5GAN 6; 2ZAE A; 4C92 D; 2PTK A; 1D3B A; 3M0P A; 3M54 A; 2HCK A; 5JJ0 A; 2RF0 A; 5CKE A; 4RTZ A; 2J7I A; 3LH0 A; 3N71 A; 2PZ1 A; 2GQI A; 4BE2 A; 5KYY A; 3OS0 A; 5KYX A; 1BB9 A; 2X35 A; 2D0N A; 3PDN A; 3OMG A; 1K73 R; 1X27 A; 5GAM e; 2FPF A; 4E6R A; 2JTE A; 4E7S A; 1VQ4 A; 4C8Q G; 2MIO A; 2X4X A; 4PJN A; 1SHG A; 1PEG A; 4PJO F; 5CCA A; 2FZK B; 1LVK A; 5F6K C; 1M1K U; 2VXE A; 4F7U B; 1Q86 U; 4QEP A; 3NTI A; 5CCM A; 3EGU A; 1CSK A; 4VUB A; 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