The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
58
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structure length |
58
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Chain Sequence |
GKELVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVADRQGFVPAAYVKKLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
SPECTRIN ALPHA CHAIN
|
| publication title |
Thermodynamic and Structural Characterization of Asn and Ala Residues in the Disallowed II' Region of the Ramachandran Plot
pubmed rcsb |
| source organism |
Gallus gallus
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| molecule tags |
Cytoskeleton
|
| total genus |
12
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| structure length |
58
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| sequence length |
58
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1999-08-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4RTU A; 1SSH A; 3UA6 A; 4J9I A; 2SRC A; 1V1C A; 2CSI A; 1UHF A; 4AFU C; 1ZSG A; 2KR3 A; 4RTW A; 1I1J A; 2FPE A; 1VYV A; 2LQN A; 2EGE A; 3VS3 A; 2QDL A; 3NGP A; 2K79 A; 1RLP C; 1SHF A; 1X27 A; 1VYT A; 3NPF A; 2GTJ A; 2JTE A; 1BK2 A; 4RTV A; 3I9Q A; 3M0T A; 4IIO A; 4E6R A; 1MUZ A; 2G6F X; 1ARK A; 2GBQ A; 2HEQ A; 2E5K A; 2D8H A; 3VS1 A; 4JJC A; 1M27 C; 4OMQ A; 2LZ6 B; 3ZL7 C; 1E6H A; 1K1Z A; 1YCS B; 2HCK A; 4AG2 C; 2OJ2 A; 2DL3 A; 1FMK A; 3RBB B; 3VS6 A; 1SRL A; 3THK A; 2DF6 A; 2JM9 A; 4Z88 A; 1OPK A; 5FWB A; 4LUE A; 2HBW A; 2O31 A; 1UFF A; 3ULR B; 1MV0 B; 2FRW A; 3VRZ A; 1HSQ A; 2F2X A; 1WFW A; 2BZ8 A; 3FJ5 A; 1W70 A; 3EG1 A; 2K6D A; 2DBK A; 2IIM A; 2FEI A; 2HSP A; 3R6N A; 2EBP A; 1YP5 A; 4GBQ A; 1QKW A; 2DM1 A; 3I35 A; 5GJV B; 2DE0 X; 2DRK A; 2DL5 A; 1ABQ A; 1K4U S; 1KIK A; 1SPK A; 3CQT A; 2V1R A; 1K0X A; 2DLP A; 5ECA A; 1EFN A; 3NHN A; 1VYU A; 2KRO A; 3PVQ A; 2A28 A; 2W10 A; 2CSQ A; 2DJQ A; 2J6F A; 2DMO A; 3RNJ A; 2ED0 A; 4KRT A; 2ROL A; 1H92 A; 1AVZ C; 1N5Z A; 1UDL A; 2D8J A; 2FPD A; 4JJB A; 1WXU A; 2LJ0 A; 3REA B; 4AFQ C; 1TUC A; 2F2V A; 1NM7 A; 4RTY A; 1QKX A; 2F2W A; 4F17 A; 2GTO A; 2DL8 A; 2K7A A; 1T0H A; 2KGT A; 3SEM A; 1FYN A; 2CUD A; 2HDA A; 2JW4 A; 1X69 A; 3VRY A; 1AEY A; 1U06 A; 2BZX A; 2J06 A; 2DIL A; 5I11 A; 1CKB A; 1W1F A; 1YNZ A; 2I0N A; 2LJ1 A; 2EYW A; 4K11 A; 1JEG A; 1A0N B; 4J9E A; 2O9S A; 2LCS A; 2ROT A; 1X43 A; 2FG0 A; 2EPD A; 1UE9 A; 2VWF A; 2YUP A; 3EG0 A; 2C0T A; 2RF0 A; 2O88 A; 2KT8 A; 1X6G A; 1BBZ A; 1GCQ C; 5GJW B; 2GNC A; 3UA7 A; 1AWJ A; 1MV3 A; 4OMP A; 2DL7 A; 4OML A; 5IXB A; 4RTZ A; 5IXF A; 1UJY A; 1AWX A; 2H8H A; 1UHC A; 2K3B A; 2EYX A; 1WXT A; 2KEA A; 1JU5 C; 2KBT A; 1E6G A; 4JZ4 A; 1YWO A; 2ESW A; 2X3X D; 3A98 A; 2X3W D; 3VS0 A; 2KRN A; 2VKN A; 1ZUU A; 1CSK A; 2A37 A; 4CC3 A; 4M4Z A; 3IQL A; 1G83 A; 1XOV A; 1WDX A; 3VS4 A; 5IHI A; 2RQV A; 2ED1 A; 1YN8 A; 1GFD A; 3QWY A; 1H3H A; 3EG3 A; 2CDT A; 4Y92 A; 4EIK A; 2CT4 A; 4HVU A; 2AKK A; 2YUQ A; 2DBM A; 3UAT A; 1UGV A; 1OPL A; 2DVJ A; 2EQI A; 5IHN A; 3EHQ A; 1B3Q A; 1LCK A; 2RNA A; 4A63 B; 1X2Q A; 3EGU A; 1I0C A; 1VA7 A; 1BB9 A; 2CT3 A; 2PZ1 A; 2RQW A; 1SRM A; 1PRM C; 4HVV A; 2KE9 A; 2EYZ A; 1NLP C; 2DA9 A; 2LMJ A; 1M8M A; 2DYB A; 2L0A A; 2YSQ A; 1KFZ A; 3PVL A; 1NG2 A; 1PNJ A; 4Z8A A; 2RN8 A; 3M0S A; 4D8K A; 4OMN A; 4RTX A; 1X2K A; 2NUZ A; 4AFZ C; 2P4R A; 2A08 A; 2D1X A; 1H8K A; 1ZX6 A; 4Z89 A; 4J9H A; 2AZS A; 2EW3 A; 1HJD A; 4CC2 A; 1QWE A; 2KXD A; 2OAW A; 1RLQ C; 3I5S A; 1J3T A; 2LP5 A; 2YUN A; 3TVT A; 1NYF A; 1AZG B; 3H41 A; 2GGR A; 4D8D A; 2ECZ A; 3M0P A; 4QT7 A; 2KT1 A; 1NYG A; 4ESR A; 2BZY A; 1CKA A; 1PWT A; 2M51 A; 2RQR A; 5FW9 A; 2CH4 W; 2JS2 A; 4JPB W; 2PNI A; 4OMM A; 4R0K A; 2LJ3 A; 2JM8 A; 1TG0 A; 1TUD A; 2NWM A; 2BTT A; 2K9G A; 1OEB A; 1QWF A; 3LH5 A; 4FSS A; 1UJ0 A; 3O5Z A; 2JMA A; 1WLP B; 2J6O A; 1ZBJ A; 2EGC A; 2KYB A; 2YDL A; 3VS2 A; 5FWC A; 1M3B A; 4LE9 A; 1JXM A; 1GL5 A; 2RQU A; 4RUG A; 5I22 A; 1T0J A; 2KNB B; 1UTI A; 2MIO A; 4F14 A; 2C0O A; 4J9D A; 1Y57 A; 2O9V A; 1JO8 A; 3EHR A; 2CH4 A; 2EKH A; 2DX1 A; 3EG2 A; 3JV3 A; 1KSW A; 1Y0M A; 2L3S A; 3QWX X; 3H0H A; 1SHG A; 2MOX A; 3REB B; 2RMO A; 4JZ3 A; 2DRM A; 1U3O A; 1QLY A; 1PHT A; 4JJD A; 2YUO A; 1PKS A; 1M30 A; 2L3P A; 2ENM A; 1IO6 A; 2J05 A; 3GBQ A; 1JQQ A; 1WX6 A; 1GCQ A; 1WA7 A; 1YWP A; 1I07 A; 1PRL C; 4HXJ A; 2PTK A; 4HCK A; 5HCK A; 2DNU A; 2K2M A; 5L23 A; 2KXC A; 1SEM A; 2AK5 A; 1JXO A; 4HVW A; 1WIE A; 3U23 A; 1Z9Q A; 5EC7 A; 4IIM A; 2JT4 A; 4RTT A; 2RQT A; 1S1N A; 4J9C A; 1B07 A; 4WCI A; 1ABO A; 2M0Y A; 1ZUK A; 3PE0 A; 1QCF A; 2KRS A; 1K9A A; 2J6K A; 4LNP A; 1M3A A; 2FRY A; 1OV3 A; 1Z9Z A; 2J7I A; 1AZE A; 2CRE A; 3H0F A; 5IH2 A; 3M0R A; 4J9G A; 4CC4 B; 1K76 A; 2V1Q A; 4AG1 C; 3TSZ A; 2KRM A; 1WXB A; 4X1V A; 4ZNX A; 1GRI A; 1UUE A; 2KYM A; 1X6B A; 1GBR A; 2AKL A; 3VS5 A; 2LQW A; 1ZUY A; 1AOJ A; 2SEM A; 2ABL A; 1NLO C; 3NMZ C; 4J9B A; 2LNH B; 4AFS C; 2B86 A; 1GFC A; 2FPF A; 2EVR A; 1UEC A; 3KFV A; 2W0Z A; 1ZLM A; 1K0S A; 4OMO A; 2AZV A; 4LN2 A; 2L2P A; 4DEX A; 1WYX A; 2A36 A; 1HD3 A; 1G2B A; 1GCP A; 3H0I A; 2VVK A; 3M0Q A; 1T3S A; 4GLM A; 1KJW A; 3C0C A; 4DEY A; 3TSW A; 1BU1 A; 2YT6 A; 1WI7 A; 4ORZ A; 1AWO A; 2CUB A; 2EGA A; 3I5R A; 2L3Q A; 1NEG A; 2OI3 A; 2FO0 A; 2O2O A; 4CC7 A; 5IHK A; 2LX7 A; 2D0N A; 2XMF A; 1OOT A; 1T3L A; 3SHW A; 1AWW A; 1RUW A; 2JS0 A; 2JMC A; 3VS7 A; 2GQI A; 1PKT A; 1UG1 A; 2DL4 A; 2MCN A; 2C0I A; 1E7O A; 4F16 A; 1AD5 A; 1W6X A; 2JXB A; 2EYY A; 1U5S A; 3UF4 A; 1GBQ A; 1RI9 A; 2RPN A; 4J9F A; 1M3C A; 4LUD A; 3M0U A; 1NEB A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3EFO A; 1OZ3 A; 1B34 A; 1OYX A; 3CME T; 1YJ9 T; 2VUB A; 3MP8 A; 2E6N A; 2EQU A; 3JB9 H; 2COW A; 4V2S A; 1UHF A; 4AFU C; 3CC4 Q; 1IXD A; 1YI2 Q; 1VQ8 T; 4A53 A; 4QQ6 A; 3NGP A; 1RLP C; 1SHF A; 3JCM W; 3O8V A; 1VQ9 A; 2QQR A; 4EMK B; 1WJR A; 2OTL Q; 5KE2 A; 1BK2 A; 3CCE Q; 3I9Q A; 2ZCF B; 2E5K A; 5KCH A; 5C0M A; 1M27 C; 2MK5 A; 4YTL A; 4OMQ A; 1I4K 1; 2LZ6 B; 4C92 C; 2QA4 A; 4C8Q G; 1K1Z A; 4MDX A; 1FWZ A; 3QII A; 1QCN A; 1RI0 A; 3HRS A; 3THK A; 3TCJ A; 2JM9 A; 5LL6 S; 5KYW A; 3G71 Q; 1BIA A; 2HBW A; 1UFF A; 2FRW A; 2IG0 A; 5LJ3 h; 3VRZ A; 3X26 B; 5KCO A; 2DD4 A; 1YJW A; 3V7S A; 3EG1 A; 3ZBD A; 5KYX B; 4J8O A; 2HSP A; 2E12 A; 2LT1 A; 1YP5 A; 2KDS A; 3CCU T; 1ABQ A; 4JDS A; 4IUR A; 1K4U S; 1KIK A; 5ECA A; 1EFN A; 2KRO A; 5D6Y A; 2J6F A; 2VYT A; 2ROL A; 3M9Q A; 1H92 A; 1N5Z A; 3OBW A; 1UDL A; 9ATC B; 3OS0 A; 4ELZ C; 4JJB A; 3CMA A; 3L1A A; 1F1B B; 1QVF P; 3QXE B; 4NL3 A; 4C8Q F; 4M78 C; 1Q82 R; 5CKF A; 1WHM A; 2K5L A; 3I56 T; 4F17 A; 1Q81 C; 2K7A A; 4C92 B; 2JTM A; 4XQ3 A; 4HKE A; 2E5Q A; 2RO0 A; 5GAN 6; 4XTY A; 1RAE B; 1SG5 A; 5A0D A; 3CCS A; 2BZX A; 2RM4 A; 2J06 A; 2DIL A; 3VKI A; 4XU1 A; 3ZFJ A; 2XHC A; 3BW1 A; 2LJ1 A; 1JEG A; 2XID A; 4J9E A; 2O9S A; 3CBM A; 3FEO A; 2OTJ Q; 2ROT A; 4JJN K; 1X43 A; 2FG0 A; 2EPD A; 2RK2 A; 4BUG A; 3OMG A; 1ZA1 B; 4OB0 B; 4XU3 A; 2ZPI B; 5DY9 A; 1Q86 R; 1VQL T; 2MAM A; 1IGQ A; 2Y90 A; 1TSF A; 3V7R A; 2DL7 A; 4OML A; 5IXF A; 5FRN A; 3CCJ Q; 3CCQ A; 1IB8 A; 3QO3 A; 1KHI A; 1AWX A; 1PG5 B; 3G1J A; 2ZZD A; 2ESW A; 2X3W D; 3N5B B; 5HK0 A; 3VS0 A; 4KBM B; 4M78 B; 5D7U A; 4FT2 A; 2VKN A; 1UGS B; 2JOY A; 5GMK j; 3CC4 T; 4CC3 A; 4M4Z A; 1YI2 T; 1RAF B; 3IQL A; 4B9X A; 3RMS A; 4AMC A; 2RJC A; 2FZC B; 2VAS A; 1RAD B; 2OTL T; 2XKO C; 3FB9 A; 3CCE T; 2JTF A; 1TTH B; 1BKB A; 1UGR B; 4HVU A; 2AKK A; 5FRO A; 2DBM A; 2PVO B; 1UGV A; 1Y96 B; 4FL6 A; 4RMO A; 3CCR A; 2DVJ A; 4BY6 C; 2EQI A; 3NTI A; 1B3Q A; 4DBR A; 4A63 B; 1X75 C; 2RI5 A; 2L89 A; 2E3H A; 1BB9 A; 3WXM B; 1QW1 A; 4RCB A; 2CT3 A; 2PZ1 A; 3OW2 A; 3L2Z A; 5GAN f; 1WHG A; 2B8A A; 2RHU A; 1NLP C; 1PD1 A; 2DYB A; 4DBH A; 2XDP A; 2F1L A; 3RER A; 4MMK A; 3SFM A; 3X28 B; 2JJ9 A; 1D09 B; 4OMN A; 4RTX A; 2HNI A; 1X2K A; 2NUZ A; 2VGM A; 2MPX C; 2A08 A; 3SWN A; 1WZO A; 3OYL A; 1BYM A; 2Z0W A; 1H3Z A; 1HJD A; 2HSE B; 2OAW A; 2P0K A; 3CPF A; 2DEU A; 2YUN A; 1PD0 A; 3TVT A; 1NYF A; 2M02 A; 1SF9 A; 4X34 A; 3KBG A; 3H41 A; 4D8D A; 2ECZ A; 5M9O A; 2KT1 A; 1NZ9 A; 2BZY A; 2QTX A; 4JPB W; 1VQK Q; 2PNI A; 1WHL A; 4M75 D; 2EQM A; 2NUT A; 1K9M U; 5J26 A; 3RUX A; 3A1P A; 4M77 D; 5LJ5 g; 4BY6 B; 1QWF A; 1VIE A; 1M1K R; 3LH5 A; 1TUG B; 4DOW A; 2DIQ A; 4XTV A; 3NFC A; 1TH7 A; 1ZBJ A; 1MND A; 2EGC A; 4HA8 A; 2HL3 A; 3L42 A; 4OB3 B; 1NPP A; 3F70 A; 4M78 F; 4E7H A; 1WNL A; 2RHX A; 3AT1 B; 1M3B A; 4LE9 A; 3CXC P; 1UGP B; 1GL5 A; 3RKW A; 2OTJ T; 2HQE A; 5L8R E; 1OI1 A; 1T0J A; 5GAM e; 2C0O A; 4ZTJ A; 4PJO B; 1Y57 A; 2EWN A; 2O9V A; 4ZN3 A; 3A8L B; 5GAM d; 3QWX X; 4JRP A; 4Z02 A; 1SHG A; 3GPL A; 4ANJ A; 2DVE A; 5CVI A; 2RMO A; 1VQM A; 1V29 B; 1R8O B; 2GFU A; 1KG1 A; 1I8F A; 2OAU A; 3CCJ T; 3DKM A; 4KGX B; 4M75 C; 4L5G A; 1I81 A; 3M53 A; 3TU4 K; 1OUL A; 4RCC A; 4JRK A; 3PFS A; 2DIG A; 2PTK A; 4HCK A; 5HCK A; 4QVD A; 2K2M A; 1SEM A; 2KXC A; 4BE1 A; 2AK5 A; 1JXO A; 1WIE A; 2D6F A; 5EC7 A; 1ZSZ C; 3E19 A; 1S1N A; 4J9C A; 1S72 Q; 1O9S A; 2R57 A; 1ABO A; 3SB2 A; 1VQN Q; 3E9F A; 4LNP A; 4XK8 E; 3JB9 I; 2LVM A; 4RKU E; 1B7T A; 1M3A A; 2FRY A; 4FCY A; 1OV3 A; 5KYU B; 2F69 A; 3A8H B; 4PJO G; 3OW2 P; 4C0G A; 4JS4 A; 4M77 A; 4HT9 A; 1KC8 R; 1WXB A; 2QEX Q; 4M7A A; 4ZGE B; 1IRE B; 2GF7 A; 3OYC A; 3CME A; 3VS5 A; 3WVE B; 2LQK A; 3RDV A; 1WQW A; 4A4H A; 2ABL A; 1NLO C; 4M7A E; 3LGL A; 1VQ8 A; 1YIT Q; 2K5I A; 3CD6 A; 2RD1 A; 1M90 R; 2XG8 D; 3G7Z A; 2W0Z A; 1ZLM A; 1K0S A; 4OMO A; 4DEX A; 3RKY A; 4KUI A; 3T9N A; 1YFN A; 1G2B A; 1VQO Q; 2VVK A; 1PM3 A; 1LVK A; 1YIJ Q; 1LNX A; 4GLM A; 5GAN h; 4JS5 A; 3EGD B; 1AWO A; 3I5R A; 2L3Q A; 5A0G A; 1NEG A; 4CC7 A; 4PJO F; 2LX7 A; 4VUB A; 2E64 A; 4E7Z A; 2D0N A; 2NUP B; 2XMF A; 2ATC B; 2CZ7 B; 1VQK T; 4HCC A; 1M1G A; 1OZ2 A; 3GNG A; 4F7U B; 1PKT A; 2MCN A; 2HKQ B; 4PLL A; 4F16 A; 1AD5 A; 1KD1 U; 2YLB A; 2IVW A; 2FZG B; 1RI9 A; 1C1A A; 2RPN A; 4J9F A; 4LUD A; 3M0U A; 1Q81 U; 1Y7X A; 3CCV Q; 4PFZ A; 4RTU A; 4C8Q D; 1SSH A; 3UA6 A; 2DYI A; 1JB0 E; 2L8D A; 3HKS A; 2V8J A; 2FHD A; 2BIV A; 1ZSG A; 2KR3 A; 4PNO A; 5GMK i; 1QP3 A; 3G6E Q; 4LD9 K; 1OQK A; 3MCA B; 2E1H A; 2QDL A; 4J5Y A; 2JVV A; 3NPF A; 4E7I A; 3I56 A; 5GMK l; 3TRE A; 3OYH A; 4RTV A; 2H3J A; 3ZEH A; 3PNW C; 2G6F X; 1ARK A; 2GBQ A; 2D8H A; 3JCM f; 4E7S A; 3ER0 A; 5AT1 B; 3M58 A; 2LT4 A; 4DA4 A; 1YCS B; 2YRV A; 2OJ2 A; 2DL3 A; 3VS6 A; 2DF6 A; 4Q5W A; 4Z88 A; 3M4G A; 2NLU A; 4BI3 A; 4LUE A; 3MEV A; 4C8Q C; 3ULR B; 1MV0 B; 1S72 T; 2FVU A; 1VQN T; 1QP2 A; 2DBK A; 3JSC A; 5KYN A; 4B9W A; 1KQS P; 3FDR A; 3OYM A; 1QKW A; 3P8B B; 5A2Q E; 1SPK A; 3DLM A; 3CCM Q; 4ELY C; 2HMA A; 3PVQ A; 3M59 A; 4LXC A; 2CSQ A; 2DJQ A; 2YWW A; 3MKD A; 4ATO A; 1Q82 C; 3GIB A; 3DB4 A; 3V7C A; 1YI2 A; 2GCX A; 4EMK C; 4IKF A; 1YIT T; 4AFQ C; 3JCM c; 2F2V A; 1QKX A; 2F2W A; 4F7U F; 2HQX A; 3EG9 A; 2GTO A; 3V8J A; 2OTL A; 3CCE A; 5LJ3 e; 2EIF A; 2CUD A; 2HDA A; 2YHT A; 5GAO l; 2HQH A; 1VQO T; 1X69 A; 3QHS A; 3OYF A; 1YIJ T; 5LJ3 d; 4X9D A; 2O4X A; 1YHQ Q; 5I11 A; 2DER A; 4C92 D; 4M7D G; 1A0N B; 2LCS A; 3EAE A; 2AHJ B; 2C0T A; 1IZ6 A; 5GAN 5; 2O88 A; 3QDF A; 3INZ A; 2KT8 A; 3CC7 Q; 1W2B S; 2DTI A; 1GCQ C; 2MWO A; 4L59 A; 4P5N A; 3UA7 A; 1Q7Y R; 3UDC A; 3QYH B; 1AWJ A; 4FYX B; 2CZ6 B; 2ZPE B; 4LDW A; 1U8R A; 4XAX B; 3OQ5 A; 2H8H A; 2QQA A; 3GNF B; 2LQ8 A; 1QVG A; 2EYX A; 1E6G A; 4JZ4 A; 3OYJ A; 3LX7 A; 3RES A; 2DZC A; 1ZUU A; 4C0D B; 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