The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
9
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sequence length |
57
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structure length |
57
|
Chain Sequence |
MEAIAKYDFKATADDELSFKRGDILKVLNEECDQNWYKAELNGKDGFIPKNYIEMKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the Grb2 N-terminal SH3 domain complexed with a ten-residue peptide derived from SOS: direct refinement against NOEs, J-couplings and 1H and 13C chemical shifts.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
GRB2
|
| molecule tags |
Complex (signal transduction/peptide)
|
| source organism |
Mus musculus
|
| total genus |
9
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| structure length |
57
|
| sequence length |
57
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1996-12-23 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1BK2 A; 1JXM A; 2BZY A; 4RTU A; 3RNJ A; 2MIO A; 1NYF A; 3KFV A; 2H8H A; 4JJB A; 1HD3 A; 1SHF A; 1WFW A; 4OMM A; 1AZG B; 2DM1 A; 2F2V A; 2RQT A; 2J06 A; 1QCF A; 1GCP A; 1M30 A; 1GFD A; 2RMO A; 4E6R A; 2BZX A; 3UF4 A; 5IXF A; 1GL5 A; 3VS3 A; 2GBQ A; 1TUD A; 2GGR A; 1ABQ A; 5L23 A; 4RTV A; 3UA7 A; 4FSS A; 2V1R A; 2X3X D; 2DX1 A; 1AD5 A; 1H8K A; 3I35 A; 2KXC A; 1U06 A; 1UUE A; 2KRM A; 2M0Y A; 3NMZ C; 4LUE A; 5HCK A; 1AZE A; 2LJ1 A; 3EG0 A; 4J9E A; 2K79 A; 3I9Q A; 4IIM A; 1CKB A; 2E5K A; 5ECA A; 1RLQ C; 4DEY A; 4LNP A; 3I5R A; 1K0X A; 3A98 A; 3R6N A; 3NHN A; 1FMK A; 2GQI A; 4HCK A; 2RQW A; 2GTJ A; 3M0S A; 4LN2 A; 3ULR B; 2FRY A; 2DLP A; 3VS6 A; 2DRM A; 2LJ0 A; 2ESW A; 1SRL A; 1WA7 A; 2DNU A; 4RUG A; 2A37 A; 2AKK A; 4X1V A; 2K3B A; 1Z9Z A; 1M3A A; 2YSQ A; 2DL5 A; 2O9V A; 2JW4 A; 2RF0 A; 3VS2 A; 2AZS A; 1FYN A; 1YWP A; 1WYX A; 4LUD A; 4Z88 A; 4OMO A; 4D8K A; 2YUP A; 1Z9Q A; 2JS2 A; 2KEA A; 1TUC A; 1GBQ A; 1VYV A; 1JU5 C; 1V1C A; 4AG2 C; 1WDX A; 1U5S A; 1X2K A; 3FJ5 A; 2RN8 A; 3H41 A; 4CC2 A; 2DRK A; 2J6F A; 1ZLM A; 2DL7 A; 2HDA A; 1IO6 A; 3EGU A; 4JZ4 A; 4JJC A; 2M51 A; 1UDL A; 2YUQ A; 2CSQ A; 1QWF A; 1PKT A; 2OJ2 A; 4AFS C; 1BU1 A; 1VYT A; 4R0K A; 2ED0 A; 2JS0 A; 1M27 C; 3UA6 A; 2JXB A; 2KNB B; 3SEM A; 1UHF A; 2HEQ A; 3RBB B; 1UTI A; 2KRS A; 1Y57 A; 1UEC A; 4J9H A; 2EGC A; 2L2P A; 2MOX A; 2NUZ A; 4IIO A; 3EG2 A; 3VS1 A; 2KGT A; 3H0H A; 1NM7 A; 1WX6 A; 2RQR A; 1U3O A; 2FPE A; 2EPD A; 1GCQ C; 4Y92 A; 2ROT A; 1PRM C; 3EG3 A; 2ED1 A; 2CUB A; 3TSW A; 3H0I A; 2DL4 A; 1W1F A; 2DJQ A; 4ORZ A; 1KFZ A; 3PE0 A; 5IH2 A; 2OAW A; 1T0J A; 4ZNX A; 1K4U S; 1X2Q A; 2PZ1 A; 1ZX6 A; 1ZUU A; 3QWY A; 1OPK A; 2A28 A; 4RTT A; 1KSW A; 3EG1 A; 1GCQ A; 2ROL A; 1UJY A; 3EHQ A; 2D1X A; 5FW9 A; 3THK A; 1EFN A; 4J9C A; 1H3H A; 1WXU A; 3M0T A; 2O2O A; 1BBZ A; 2K6D A; 1B3Q A; 1K9A A; 5I11 A; 4AFU C; 2VWF A; 4DEX A; 1NLO C; 3M0R A; 3TVT A; 4ESR A; 1AWJ A; 2J05 A; 2PTK A; 3VS0 A; 2EW3 A; 1NYG A; 4RTX A; 2L0A A; 1UG1 A; 5FWB A; 1YNZ A; 4GLM A; 5FWC A; 2EVR A; 1WLP B; 1K1Z A; 4J9B A; 2C0I A; 2LX7 A; 1NG2 A; 1ARK A; 2DF6 A; 2HBW A; 4J9F A; 1YN8 A; 1G2B A; 2D8J A; 1SSH A; 1PNJ A; 1GBR A; 1XOV A; 2RQU A; 2DIL A; 3M0P A; 1H92 A; 4A63 B; 1MV3 A; 3M0U A; 3C0C A; 3CQT A; 3VRZ A; 2PNI A; 2O9S A; 2ENM A; 1HJD A; 2EYW A; 4K11 A; 3M0Q A; 2CH4 W; 4EIK A; 2CT4 A; 5IHN A; 4J9I A; 3NPF A; 2YUO A; 2VKN A; 1AWX A; 4HVU A; 2W10 A; 3VRY A; 2EGE A; 1NEB A; 2JM9 A; 4Z8A A; 2L3P A; 3H0F A; 2D8H A; 2LNH B; 1OEB A; 1GRI A; 1NLP C; 1TG0 A; 2O88 A; 2AKL A; 2JT4 A; 2F2W A; 2GTO A; 3PVQ A; 2LMJ A; 1N5Z A; 3PVL A; 1X6B A; 2JM8 A; 1B07 A; 2HSP A; 2DA9 A; 1I07 A; 1OOT A; 2L3Q A; 1YWO A; 1KIK A; 1A0N B; 2NWM A; 4WCI A; 3REB B; 2JMA A; 1WI7 A; 2KBT A; 3ZL7 C; 2LQN A; 4CC3 A; 2HCK A; 2KE9 A; 1WXB A; 1I0C A; 4CC4 B; 1M3B A; 1JXO A; 2DBK A; 2KYM A; 1Y0M A; 2EGA A; 2AZV A; 1ZUK A; 1SEM A; 2BZ8 A; 2K7A A; 5EC7 A; 1PWT A; 1M8M A; 3LH5 A; 1HSQ A; 4JZ3 A; 4QT7 A; 1GFC A; 2CRE A; 4Z89 A; 4RTY A; 4J9D A; 2YDL A; 3NGP A; 2C0O A; 1T0H A; 1E6G A; 2KT1 A; 1OPL A; 1AOJ A; 5GJW B; 4CC7 A; 1WXT A; 2FEI A; 4HVW A; 1X69 A; 2FPD A; 2K9G A; 1QWE A; 2LP5 A; 2DE0 X; 2XMF A; 1J3T A; 1RLP C; 2EBP A; 4GBQ A; 4HVV A; 1CSK A; 1ZSG A; 3IQL A; 2RQV A; 5GJV B; 1QLY A; 2YUN A; 1G83 A; 2D0N A; 2X3W D; 3VS7 A; 1RUW A; 1K0S A; 2GNC A; 1AWW A; 1PKS A; 1X43 A; 2KT8 A; 2EYZ A; 1WIE A; 2DYB A; 4F17 A; 2I0N A; 2MCN A; 4JJD A; 2B86 A; 2CSI A; 1W70 A; 2V1Q A; 3I5S A; 3O5Z A; 2FO0 A; 1NEG A; 1SHG A; 2LQW A; 2W0Z A; 1T3L A; 1JEG A; 4J9G A; 5IXB A; 1OV3 A; 2EYX A; 4JPB W; 4RTZ A; 2L3S A; 1W6X A; 2SEM A; 2KRN A; 2P4R A; 2FG0 A; 4OMN A; 1QKW A; 2LZ6 B; 1SRM A; 2FRW A; 2SRC A; 4AFZ C; 4OMP A; 2BTT A; 2JMC A; 3JV3 A; 2O31 A; 2RNA A; 2C0T A; 2VVK A; 3EHR A; 3SHW A; 1AVZ C; 1UJ0 A; 2OI3 A; 1I1J A; 1ZUY A; 4RTW A; 2A36 A; 2DBM A; 1KJW A; 1UGV A; 1VA7 A; 1YP5 A; 1MV0 B; 1T3S A; 1ZBJ A; 2EYY A; 1ABO A; 1PHT A; 1X27 A; 1CKA A; 2ECZ A; 1E7O A; 1M3C A; 1RI9 A; 1BB9 A; 1LCK A; 2K2M A; 3TSZ A; 4KRT A; 2AK5 A; 1K76 A; 2EKH A; 3GBQ A; 2QDL A; 4D8D A; 2F2X A; 1JO8 A; 1S1N A; 2CUD A; 1X6G A; 2A08 A; 2RPN A; 1UE9 A; 3UAT A; 4AFQ C; 3U23 A; 2CH4 A; 2KRO A; 2J7I A; 2KR3 A; 2J6K A; 2KXD A; 3VS5 A; 2EQI A; 2FPF A; 2DMO A; 2G6F X; 3QWX X; 5I22 A; 1AWO A; 1UHC A; 1VYU A; 2LJ3 A; 2LCS A; 2DL8 A; 2KYB A; 2CDT A; 1SPK A; 1E6H A; 4LE9 A; 2J6O A; 4AG1 C; 2JTE A; 2YT6 A; 5IHI A; 1AEY A; 2DVJ A; 5IHK A; 2CT3 A; 1PRL C; 1MUZ A; 2IIM A; 1YCS B; 4F14 A; 2ABL A; 4F16 A; 1QKX A; 4M4Z A; 3REA B; 2DL3 A; 1JQQ A; 1UFF A; 4HXJ A; 3VS4 A; 4OML A; 4OMQ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4M7A E; 1HXD A; 1QVG S; 4XAX B; 3M54 A; 2DD5 A; 1VQO A; 3QG1 A; 3PIP A; 3INZ A; 4XQ3 A; 1NYF A; 1K9M U; 3CEY A; 2O4X B; 4PFP A; 2KDS A; 1HD3 A; 1SHF A; 4QKU A; 4PJO C; 4C92 G; 3OYC A; 2DM1 A; 2F2V A; 2RQT A; 3JCM Q; 1RAI B; 1RAH B; 2RMO A; 1P92 A; 4E6R A; 2BZX A; 2ZZD A; 2DO3 A; 2JZ2 A; 1GL5 A; 2NUP B; 3VS3 A; 4D6W A; 3HRT A; 4OGE A; 5C6S A; 5CR2 A; 1Q95 G; 4BDY A; 1M1F A; 1VQN T; 4E7L A; 2QI2 A; 2VGN A; 1M9S A; 5GAM d; 1Q81 U; 3I35 A; 2KXC A; 1UUE A; 3NMZ C; 4KH0 B; 1FMW A; 3EG0 A; 4J9E A; 3RDV A; 3FEO A; 2E5K A; 2HSE B; 3JCM W; 4LNP A; 3I5R A; 1IZ6 A; 1U1T A; 4DA4 A; 2GQI A; 2GTJ A; 3M0S A; 4LN2 A; 2OTJ T; 5A0L A; 4KUD K; 3JCM h; 2X51 A; 5J39 A; 1VQ9 Q; 2A37 A; 1M1G A; 4X1V A; 2MF2 A; 3TCJ A; 3LH0 A; 3OB9 A; 4OB0 B; 2R57 A; 2DL5 A; 2JW4 A; 3MEV A; 4M78 F; 1YWP A; 2E64 A; 4Z88 A; 1YHQ A; 4OMO A; 4EMK A; 3BDL A; 2E3I A; 4IKF A; 1VYV A; 3N5B B; 1JU5 C; 1X2K A; 4M75 G; 2J6F A; 2K4Y A; 2FZG B; 2HDA A; 4PJL A; 1IO6 A; 2CZ0 B; 1YIT Q; 1UDL A; 2YUQ A; 1WHM A; 1ZHI A; 4FL6 A; 1QWF A; 2YXY A; 1PKT A; 2MK5 A; 3LX7 A; 2OJ2 A; 3CCQ A; 4F7U F; 2WSC E; 4C5I A; 3MP1 A; 3SEM A; 3GP8 A; 2HEQ A; 1YI2 A; 2VAS A; 1MNE A; 5GAM h; 1W2B S; 2JTM A; 1UTI A; 5LJ3 f; 3OYM A; 2FZK B; 2EGC A; 2L2P A; 4IIO A; 2NUZ A; 3EG2 A; 3RR6 A; 1OX9 A; 2KGT A; 2DFU A; 2FB7 A; 4XU1 A; 2EPD A; 2HBP A; 3V7C A; 4RMO A; 3EG3 A; 1Q86 C; 1W1F A; 2Z0W A; 4FCY A; 1H3Z A; 1BCO A; 3C4S A; 2A3L A; 3JRZ A; 1VQ6 Q; 1ZUU A; 3X25 B; 2M9U A; 4RTT A; 4PLI A; 4J7F A; 2ROL A; 2QA4 T; 5FU7 C; 2CP0 A; 1I8F A; 3EHQ A; 3G4S A; 1EFN A; 1ACM B; 2HAX A; 2CP3 A; 4BD3 A; 3M0T A; 3QSU A; 3BW1 A; 1K73 U; 1IHV A; 4C8Q C; 3OYK A; 2G3R A; 4DEX A; 2O4X A; 3M0R A; 3TVT A; 2BUD A; 4ESR A; 2EYQ A; 2D9T A; 5CKD A; 2HKQ B; 1AWJ A; 1YIT T; 3VS0 A; 4RTX A; 3J80 E; 1UG1 A; 4GLM A; 5GAM j; 3EH1 A; 2LX7 A; 2NUP A; 1XTD A; 3RMS A; 3BE3 A; 4M77 C; 3I56 Q; 2HBW A; 4MML A; 3L2Q A; 4N4H A; 3L2U A; 1G2B A; 3WXM B; 1VQ8 T; 1NJI R; 1ZSZ C; 3UDC A; 2DIL A; 4A63 B; 1MV3 A; 1Y07 A; 4ZTF A; 3VRZ A; 4J7I A; 1HJD A; 2EYW A; 4KUL A; 2CKK A; 3ZBD A; 4EIK A; 3CCS Q; 3BFM A; 3SB2 A; 2YUO A; 2VKN A; 1D3B A; 2QGF B; 2VXE A; 4HVU A; 2W10 A; 2JM9 A; 1NEB A; 2L3P A; 3H0F A; 3TRE A; 1VQ6 T; 2D8H A; 4DBH A; 3V8K A; 5GAN g; 4C0D B; 1NLP C; 1TG0 A; 3PMT A; 4PLL A; 2AKL A; 2F2W A; 2GTO A; 5HK0 A; 4XTX A; 1B07 A; 3VYG A; 3OYE A; 2HSP A; 3E19 A; 2ZPF B; 3HHT B; 1VQO Q; 3OA6 A; 4JDS A; 2QEX A; 4FM4 B; 2X35 A; 1KIK A; 4QVD A; 4WCI A; 5I2S A; 2JMA A; 1S72 A; 3ZL7 C; 5KE2 A; 3QYG B; 4M7D E; 4ZGE B; 1WXB A; 1I0C A; 3EGD A; 2MAM A; 4DBR A; 1KD1 R; 4R55 A; 3KXT A; 2KYM A; 5CO7 A; 1RAB B; 2K7A A; 1M8M A; 5GAN 7; 1BCM A; 2DEU A; 4JZ3 A; 2CRE A; 1RAD B; 4IUU A; 4IUV A; 1YBY A; 2YDL A; 5KYU A; 1OPL A; 4LD9 K; 3JB9 J; 1KQ2 A; 2XMF A; 5KE3 A; 4ELZ C; 5CVI A; 2JOY A; 2KQW A; 2ZPH B; 1VOM A; 4C8Q G; 3HTR A; 1RUW A; 2QYZ A; 1PKS A; 1X43 A; 5DLO A; 4XU0 A; 5LJ3 e; 2EYZ A; 1WIE A; 3GF5 A; 4XTZ A; 4JJD A; 1VQN A; 2B86 A; 2CSI A; 1YHQ Q; 1PD0 A; 3O5Z A; 3PT9 A; 4M78 B; 4OVA A; 2YLB A; 1QCO A; 3FB9 A; 5AYF A; 1SHG A; 1T3L A; 4M77 G; 1JEG A; 4J9G A; 5IXB A; 1M90 R; 2K2V A; 1QQJ A; 2NUT B; 1M2V B; 3FRN A; 3JCM V; 2XG8 D; 5LJ5 g; 1MHN A; 1M8V A; 2LZ6 B; 3CCQ Q; 4AFZ C; 1Q7Y R; 4F04 B; 2BTT A; 5I2M A; 4HA8 A; 5D7U A; 3JV3 A; 4F7U B; 2O31 A; 3P8B B; 1M2O A; 1YI2 Q; 1R77 A; 2C0T A; 4FW2 A; 1YJN T; 4BE2 A; 1R0C B; 5LJ5 f; 3X24 B; 4XU3 A; 3CC4 T; 2OI3 A; 1I1J A; 2V8K A; 3RER A; 2A36 A; 1KJW A; 5HY6 A; 1ZBJ A; 1PHT A; 4M7D A; 2DPP B; 1CKA A; 2VV5 A; 1RI9 A; 2DZ9 A; 5KYN A; 2EQJ A; 3LGF A; 2AK5 A; 4FT4 A; 1K76 A; 2CGH A; 1NZ9 A; 2CP5 A; 2P0P A; 1ZBX A; 1HK9 A; 3VUZ A; 5D6W A; 1D1C A; 2DER A; 3A1P A; 2E41 A; 3G4S Q; 2FZC B; 4F7U E; 4B6M A; 1B34 B; 5KYX B; 2KRO A; 2J6K A; 2RA2 A; 3AT1 B; 2RK1 A; 3LWI A; 5A0D A; 2XDD A; 1TOV A; 3DLL A; 1RAG B; 5GAN d; 5IN1 A; 3URG A; 1BI3 A; 2RHU A; 3HL8 A; 2HQH A; 4FYW B; 1VYU A; 3CXC A; 2BE9 B; 1IRE B; 2CDT A; 1Q86 U; 1VQL A; 1EZZ B; 2J6O A; 1N8R R; 2YT6 A; 3CXC S; 1VQ4 T; 1JRI A; 1MUZ A; 2XID A; 5D6Y A; 3MEU A; 2QA4 A; 1QKX A; 1XJW B; 4Y28 E; 4N4I A; 4NS5 A; 1GXI E; 4J5Y A; 2RI5 A; 1QP2 A; 2XIC A; 1JXM A; 2COY A; 4RTU A; 3CME T; 2MIO A; 8AT1 B; 1WFW A; 4OMM A; 5FU6 B; 4N4G A; 2J06 A; 3NTI A; 1GCP A; 3G4S T; 3TEE A; 2X4X A; 1WHL A; 3NTK A; 2QEX Q; 1TXQ A; 1TUD A; 2GBQ A; 4M78 A; 1VQ8 A; 6AT1 B; 1AT1 B; 1KC8 C; 1ABQ A; 2AT1 B; 3EG9 B; 1S72 Q; 1WQ7 A; 1VQP T; 2RH2 A; 1U06 A; 2NUT A; 1M2V A; 2KRM A; 1M1K C; 1Y96 B; 1K8A C; 5HCK A; 1AZE A; 1D1A A; 5GAN h; 2LJ1 A; 4XK8 E; 3OYL A; 4IIM A; 3O8V A; 2E6Z A; 3OW2 S; 4C92 B; 4C0G A; 2E65 A; 2YWW A; 3R6N A; 3NHN A; 2RHY A; 4HCK A; 3ULR B; 3OS5 A; 2DLP A; 4F7U A; 2IPO B; 4RKU E; 4EMK C; 1WZO A; 1X01 A; 2PVG B; 2R5M A; 1WA7 A; 4V2S A; 1M3A A; 3A5Z B; 3OMC A; 2O9V A; 5CQX A; 2RF0 A; 4M78 D; 2AZS A; 3JB9 D; 4LUD A; 4ME7 A; 3TU4 K; 2YRD A; 3A8G B; 4JRI A; 4LDW A; 3QII A; 5GAO m; 1IGQ A; 1TUC A; 2EFI A; 3QHS A; 3OS1 A; 1GBQ A; 2V26 A; 1V1C A; 5LJ5 e; 1U5S A; 3CCL A; 4E7H A; 4M7A C; 4JS5 A; 1VQN Q; 1ZA1 B; 3SFM A; 2KI7 A; 3PMI A; 2I2L A; 2CYZ B; 1BU1 A; 1VYT A; 4R0K A; 3QDF A; 2ED0 A; 5KYX A; 3CD6 T; 1M27 C; 2RI3 A; 2KNB B; 5GAN j; 2PUO B; 4C5G A; 2EWN A; 4JRP A; 1IGU A; 1UEC A; 5CKB A; 3VS1 A; 3H0H A; 2EQK A; 2WSF E; 1U3O A; 2LCL A; 4M75 B; 2FPE A; 3LGL A; 2L89 A; 4Y92 A; 3LWH A; 3CC2 T; 2R58 A; 2ED1 A; 2CUB A; 5GMK e; 5A2Q E; 3A8H B; 4ORZ A; 5CKE A; 3HSB A; 2OAW A; 3JCM X; 1K4U S; 1WNL A; 1OPK A; 2A28 A; 4XU2 A; 4PFZ A; 4ZGJ B; 1XNI A; 1GCQ A; 4KH1 B; 1UJY A; 2EIF A; 5CKF A; 2WAC A; 3CMA A; 2LT4 A; 3ER0 A; 2DAQ A; 3FJP A; 1QMC A; 1OUL A; 5KYY B; 1B3Q A; 2VWF A; 1R0B G; 4IUR A; 1PM3 A; 1OZ2 A; 4MMK A; 2QDY B; 5CKH A; 1VQM T; 5GMK l; 2E1H A; 2KMT A; 1YJN A; 1PG5 B; 5FWB A; 1KQ1 A; 2MYS A; 1K1Z A; 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