The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
|
sequence length |
59
|
structure length |
59
|
Chain Sequence |
MEAIAKHDFSATADDELSFRKGQILKILNMEDDSNWYRAELDGKEGLIPSNYIEMKNHD
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural Comparison of the Unstable drkN SH3 Domain and a Stable Mutant
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
SH2-SH3 adapter protein drk
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Drosophila melanogaster
|
| total genus |
7
|
| structure length |
59
|
| sequence length |
59
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-09-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1AZE A; 2O2O A; 3VS2 A; 5GJV B; 2LJ1 A; 1X27 A; 1T0J A; 3H0I A; 3REA B; 2FRW A; 1YWP A; 1YP5 A; 2C0O A; 3H0F A; 2XMF A; 1UFF A; 2EYX A; 2MCN A; 4LN2 A; 3A98 A; 3UF4 A; 2CH4 A; 4CC2 A; 2CH4 W; 1UEC A; 1QCF A; 2L3Q A; 1GFC A; 1WXU A; 3VS3 A; 1ZBJ A; 2DE0 X; 2NWM A; 1FYN A; 4OMO A; 1SSH A; 3I5R A; 3I35 A; 3UA6 A; 4AG1 C; 1ZUY A; 2EYY A; 3R6N A; 4Z89 A; 1CSK A; 1AWJ A; 1PKS A; 2K9G A; 2D8J A; 2A36 A; 4AFZ C; 2JMA A; 1G2B A; 1UHC A; 3THK A; 5EC7 A; 4D8D A; 1TUD A; 1NYF A; 2RF0 A; 2KNB B; 1ZX6 A; 3RNJ A; 1VYT A; 1WA7 A; 4DEY A; 1T0H A; 1QKW A; 2KE9 A; 2J6K A; 4CC4 B; 2EPD A; 2P4R A; 2DL7 A; 2K7A A; 1X6G A; 3VRZ A; 1WLP B; 4IIM A; 4OMM A; 2CRE A; 1UG1 A; 1W70 A; 4Z88 A; 4Z8A A; 4J9G A; 1U3O A; 1WX6 A; 2GTJ A; 3C0C A; 4IIO A; 3UAT A; 3PVL A; 1UJ0 A; 3GBQ A; 2J05 A; 2LZ6 B; 2SRC A; 1X6B A; 3NHN A; 3EG1 A; 1OPL A; 1E6G A; 4GLM A; 1U06 A; 2O31 A; 2LMJ A; 1PHT A; 1ZLM A; 2DJQ A; 4JZ4 A; 1UTI A; 1HJD A; 4RTW A; 1KIK A; 2RNA A; 1YN8 A; 2O88 A; 1UUE A; 2DL5 A; 4X1V A; 1MV0 B; 2DVJ A; 4WCI A; 1X2Q A; 4HVV A; 1K76 A; 1YWO A; 2PNI A; 1CKB A; 1GCP A; 2D8H A; 2OJ2 A; 2LP5 A; 3KFV A; 1M3A A; 1M8M A; 3PVQ A; 4RTV A; 2RQW A; 1WDX A; 2FEI A; 1GL5 A; 2GQI A; 1WFW A; 2J7I A; 4RUG A; 2FPE A; 5IHK A; 2JS2 A; 2DMO A; 3NPF A; 2DRM A; 2OAW A; 2RQR A; 3RBB B; 3O5Z A; 1VYV A; 5FWB A; 2EW3 A; 1OPK A; 4Y92 A; 2M0Y A; 1ABO A; 3M0P A; 2CSQ A; 3TSZ A; 2V1Q A; 2JM9 A; 1WYX A; 2HBW A; 4RTY A; 2AKL A; 1NG2 A; 2PZ1 A; 2DBM A; 4A63 B; 4CC7 A; 1GFD A; 4F16 A; 1MV3 A; 2ED0 A; 1GRI A; 4J9D A; 2ROT A; 2DM1 A; 4R0K A; 1UJY A; 2YSQ A; 2FO0 A; 1BB9 A; 3QWY A; 2DRK A; 1GBQ A; 5FWC A; 4EIK A; 2JMC A; 1NLP C; 2YT6 A; 3UA7 A; 4D8K A; 2YUN A; 2KBT A; 2K79 A; 2RQU A; 1H8K A; 3EG3 A; 4JJB A; 1KFZ A; 2IIM A; 2LQW A; 2SEM A; 2L2P A; 1K0S A; 2EGC A; 2F2X A; 1QWF A; 3EGU A; 1JEG A; 4JPB W; 2CT4 A; 1BBZ A; 1LCK A; 1J3T A; 1CKA A; 1W1F A; 4LUD A; 5HCK A; 1T3L A; 4OML A; 1Y57 A; 1OEB A; 2I0N A; 3M0S A; 3I5S A; 3M0U A; 3VS0 A; 3IQL A; 4J9E A; 1AWO A; 2HCK A; 3JV3 A; 3SHW A; 2AK5 A; 3TVT A; 2E5K A; 3EG0 A; 1SRM A; 2ESW A; 2ENM A; 4AFS C; 1TG0 A; 2KXC A; 2DF6 A; 1I0C A; 2RQV A; 1GCQ C; 1ARK A; 1ZUU A; 4RTT A; 4ZNX A; 3H41 A; 2HDA A; 5I22 A; 2EVR A; 2D0N A; 1YCS B; 1BU1 A; 4QT7 A; 3VS6 A; 1JXM A; 2CDT A; 3ZL7 C; 2OI3 A; 2KRM A; 4J9C A; 4ESR A; 1AWX A; 2C0I A; 2VWF A; 3EHQ A; 1Z9Z A; 4J9F A; 2ABL A; 1GCQ A; 4J9H A; 1JU5 C; 1VYU A; 2H8H A; 2LJ3 A; 3PE0 A; 4DEX A; 2KRO A; 2BZX A; 2LQN A; 2YUP A; 2DL4 A; 4J9B A; 1OOT A; 5IHI A; 1UE9 A; 2RMO A; 1RUW A; 2VVK A; 2ED1 A; 5IH2 A; 1OV3 A; 2JW4 A; 3M0R A; 3NGP A; 2V1R A; 1VA7 A; 3VRY A; 2ROL A; 1SEM A; 2O9S A; 3VS4 A; 2L0A A; 1V1C A; 2M51 A; 2KXD A; 2JT4 A; 1I1J A; 1WI7 A; 2F2V A; 1X69 A; 4FSS A; 4JJD A; 2EYW A; 5IXF A; 1UHF A; 4CC3 A; 4RTZ A; 1ABQ A; 2LNH B; 4JJC A; 2CT3 A; 2BZ8 A; 2X3W D; 3LH5 A; 2GTO A; 4OMQ A; 4AFU C; 4M4Z A; 2K2M A; 1I07 A; 2AZV A; 2KGT A; 1T3S A; 2EYZ A; 2QDL A; 2HEQ A; 2VKN A; 2DL8 A; 1KSW A; 2C0T A; 4HVU A; 1AEY A; 1NLO C; 3VS5 A; 1NEG A; 1NYG A; 1ZSG A; 2RQT A; 1PNJ A; 4GBQ A; 2DYB A; 2CSI A; 2F2W A; 2JS0 A; 5L23 A; 2ECZ A; 1GBR A; 2MIO A; 1H3H A; 2GNC A; 4OMP A; 3QWX X; 2KT1 A; 1WXB A; 3EHR A; 1K4U S; 1NM7 A; 3REB B; 2MOX A; 1NEB A; 4OMN A; 2RN8 A; 2GBQ A; 2EKH A; 1A0N B; 2YUO A; 1KJW A; 5I11 A; 1Z9Q A; 1QKX A; 1N5Z A; 2DLP A; 3FJ5 A; 3H0H A; 1X43 A; 5GJW B; 2J6O A; 1H92 A; 1WXT A; 2X3X D; 1RLQ C; 3M0T A; 2CUD A; 1Y0M A; 1AOJ A; 1B3Q A; 2FPD A; 1SHF A; 4LE9 A; 1EFN A; 1K1Z A; 1JXO A; 1QWE A; 4RTU A; 1AWW A; 1RLP C; 1SRL A; 2FG0 A; 2YDL A; 2NUZ A; 1ZUK A; 4E6R A; 2DX1 A; 2AKK A; 2PTK A; 2J06 A; 2A28 A; 2B86 A; 2GGR A; 2L3S A; 4HVW A; 1PKT A; 1XOV A; 2EQI A; 1AZG B; 5FW9 A; 1M3B A; 1X2K A; 3VS7 A; 1M27 C; 3VS1 A; 1AVZ C; 1HD3 A; 4LUE A; 4KRT A; 2JXB A; 4F17 A; 2AZS A; 1UDL A; 4JZ3 A; 2DA9 A; 1B07 A; 5ECA A; 1IO6 A; 2G6F X; 2A37 A; 4K11 A; 1SPK A; 2KYM A; 4AFQ C; 2LX7 A; 2BZY A; 2FPF A; 1UGV A; 1K9A A; 3EG2 A; 2KRS A; 1M30 A; 2EGE A; 2O9V A; 2HSP A; 2KT8 A; 3I9Q A; 2DNU A; 2LJ0 A; 1WIE A; 2D1X A; 2RPN A; 1MUZ A; 4ORZ A; 4AG2 C; 3M0Q A; 3SEM A; 1FMK A; 2K6D A; 2KEA A; 1M3C A; 1G83 A; 2J6F A; 3TSW A; 1E6H A; 1JQQ A; 2L3P A; 1YNZ A; 2KR3 A; 2LCS A; 1TUC A; 5IXB A; 1S1N A; 2W10 A; 2BTT A; 1HSQ A; 4HXJ A; 2YUQ A; 2DL3 A; 1BK2 A; 2CUB A; 1QLY A; 2JM8 A; 1PWT A; 2W0Z A; 2EBP A; 2K3B A; 1SHG A; 4LNP A; 1AD5 A; 2DBK A; 5IHN A; 2DIL A; 2FRY A; 4HCK A; 4RTX A; 2KYB A; 2JTE A; 3ULR B; 1PRL C; 3CQT A; 1W6X A; 1PRM C; 3U23 A; 4F14 A; 2A08 A; 2KRN A; 1RI9 A; 4J9I A; 1U5S A; 3NMZ C; 2EGA A; 1JO8 A; 1K0X A; 1E7O A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2O2O A; 1N9R A; 5GMK j; 1QVG A; 3G71 Q; 1X27 A; 1T0J A; 2CKK A; 3J7A F; 4M77 E; 3REA B; 4E47 A; 3JB9 D; 1YWP A; 5CK9 A; 4KGZ B; 1QP2 A; 3MP1 A; 4NL2 A; 3OYC A; 3QYG B; 2F1L A; 2C0O A; 4M75 A; 3H0F A; 2XMF A; 2CP5 A; 4ATO A; 2CH4 A; 4CC2 A; 2JUF A; 1VQ4 Q; 3PTA A; 4M7D F; 4HCC A; 4OP0 A; 2CS7 A; 2HQX A; 1BKB A; 3UA6 A; 1PKS A; 2D8J A; 2NUP B; 1PD0 A; 3EG9 A; 4AFZ C; 2QQA A; 4M7A D; 3CCJ T; 5J39 A; 1M8V A; 4BE2 A; 4JRI A; 2EJ9 A; 3CME Q; 2CZ7 B; 4F04 B; 2RF0 A; 2KNB B; 1ZX6 A; 3CPF A; 3RNJ A; 2VGN A; 1YIJ Q; 1VYT A; 1UGS B; 1WA7 A; 1T0H A; 4ZTF A; 1Y71 A; 4PFO A; 2P4R A; 2LVM A; 2M16 A; 1UG1 A; 3GPL A; 5KYX A; 1F1B B; 4Z8A A; 5KYW B; 2MPX C; 3C0C A; 2QAZ A; 3PVL A; 1UJ0 A; 3UT1 A; 1MMN A; 2QGF B; 3MEW A; 4XTV A; 2SRC A; 1X6B A; 5GAN 2; 1E6G A; 4M77 C; 2X35 A; 2O31 A; 1M4Z A; 1ZLM A; 2DJQ A; 1JJ2 P; 4MZM A; 4RTW A; 1KIK A; 2RNA A; 1YJN T; 1EZZ B; 2LQ8 A; 2DVJ A; 2D0Q B; 2JZ2 A; 3MP8 A; 1CKB A; 2D8H A; 1OX8 A; 4PFP A; 3X25 B; 4IUP A; 1W2B S; 2JJ9 A; 1YBY A; 2DEQ A; 4Y91 A; 2RO0 A; 1VQL Q; 3GNG A; 4NS5 A; 1M8M A; 3PVQ A; 4ZN3 A; 2FEI A; 5GAO n; 3EGD A; 4KBM B; 1N8R R; 4J6X A; 2FPE A; 4RUG A; 5LJ3 h; 4C92 C; 5D6W A; 1I8F A; 4J7I A; 2WSE E; 4MZP A; 1K9M R; 2DMO A; 2LCC A; 3QII A; 1VQO A; 2E12 A; 1YHQ Q; 1LVK A; 2RQR A; 4YTL A; 1SKU B; 4Y92 A; 1Q7Y U; 4MDX A; 3SWN A; 1ABO A; 2E4H A; 4IUV A; 4M75 F; 2BE9 B; 2XID A; 4C92 A; 4M78 D; 5HK0 A; 2YRC A; 1YIT A; 1D1C A; 3VKI A; 1MV3 A; 1D09 B; 1GRI A; 2CZ1 B; 1VIF A; 2HL3 A; 5LJ5 j; 3M55 A; 4J9D A; 1Y7X A; 2BKD N; 3CCR T; 4R0K A; 1Q81 R; 3G4S T; 1UJY A; 4ZN1 A; 3L2Q A; 3EFR A; 1I4K 1; 3QWY A; 3CC4 T; 1W2B A; 4C8Q G; 3CMA A; 5C0M A; 3UA7 A; 3M53 A; 3SDZ A; 2XG8 D; 2RQU A; 3CCQ T; 3C94 A; 1H8K A; 4JJB A; 4XU0 A; 4Q5W A; 1TOV A; 2KMT A; 3UDC A; 4WF2 A; 5IAY A; 1QWF A; 4FIB A; 4ANJ A; 5A0D A; 2M0O A; 1PCX A; 1RAI B; 3DLM A; 1BBZ A; 5KYU A; 4E7J A; 4Z02 A; 3EGX A; 1M90 R; 5FRM A; 4LUD A; 1Y57 A; 1OEB A; 3CCS A; 2R5A A; 2HCK A; 4M7D B; 4E7Z A; 5GAN 8; 3TVT A; 2E5K A; 2DF6 A; 1GCQ C; 2DD5 A; 3OMC A; 3QHS A; 1LOJ A; 1XJW B; 2KQW A; 2HDA A; 3HRU A; 3RMQ A; 4ZGE B; 3V7S A; 2DZ9 A; 4LD9 K; 2OTL A; 1YCS B; 1TH7 A; 3LX7 A; 3JCM Q; 5LJ3 g; 1RAA B; 4KGX B; 4BDY A; 2C0I A; 1BI0 A; 2EQU A; 1GCQ A; 4J9H A; 5CQY A; 3E2U A; 2Y4X A; 2LQN A; 2RJC A; 1PSF A; 3WXM B; 2DL4 A; 4F7U E; 5IHI A; 1UE9 A; 3BDL A; 2VUB A; 3HKS A; 3PGG A; 3NGP A; 3OYI A; 1N27 A; 2ROL A; 1HXD A; 1NJI R; 4HKE A; 3VYH B; 2ZPE B; 1VQ7 A; 2M51 A; 3CD6 T; 2KXD A; 2JT4 A; 1M2V B; 1XTD A; 3FIF A; 4ZGJ B; 3JRZ A; 2RK1 A; 2EYW A; 4FYV B; 4LDV A; 1ZHI A; 3NTK A; 1D0Y A; 3ZFJ A; 3JB9 I; 2BZ8 A; 5KE3 A; 1QVF P; 4JS5 A; 3QBY A; 4FYW B; 3T9N A; 4OMQ A; 1VQN Q; 4EMK B; 3JCM V; 5KE2 A; 1I07 A; 1VQM T; 2E65 A; 2K57 A; 3FJP A; 1I5L A; 1JJ2 A; 4QQG A; 2ZZD A; 3L2Z A; 2RI2 A; 1NLO C; 3OMG A; 3L2R A; 1NEG A; 2RQT A; 1M2O A; 4XU1 A; 1Q86 R; 4CRI A; 5CVI A; 2GNC A; 1SF9 A; 3QWX X; 4QW2 A; 2NUP A; 4M75 B; 2E3H A; 2OAU A; 2MOX A; 2M1H A; 4OMN A; 1YI2 A; 4N4I A; 2GBQ A; 2EKH A; 2HKQ B; 1G3S A; 1YJN A; 1Y07 A; 2PVG B; 1I5O B; 2L89 A; 2KY9 A; 1Z9Q A; 1QKX A; 2DLP A; 5GJW B; 1WXT A; 3DLL A; 3DKM A; 2FPD A; 2VV5 A; 1K1Z A; 1QWE A; 1C0M A; 3EG9 B; 5KYW A; 3N5B B; 3CCE A; 2RHI A; 2DX1 A; 4FT4 A; 3RUX A; 4XU2 A; 1S72 T; 2AKK A; 3CXC S; 4PJO E; 2PTK A; 2J06 A; 1NBE B; 2LCL A; 2A28 A; 4BD3 A; 1BYM A; 2L3S A; 2QTV A; 1BIA A; 4E7H A; 4XK8 E; 4UC4 A; 3VS7 A; 4LUE A; 2OTJ Q; 4WTO B; 1M1F A; 4KRT A; 5KYX B; 1UDL A; 1B07 A; 3MO8 A; 4M78 A; 2A37 A; 4OMF B; 4AFQ C; 2LX7 A; 2QQB A; 2XU8 A; 2OTL Q; 1M30 A; 2COY A; 2HSP A; 4M7D E; 5CKF A; 3CCR A; 4KUD K; 1WIE A; 3URG A; 1VQP T; 1X6O A; 5LJ3 e; 4AG2 C; 4JLG A; 3M0Q A; 1QVP A; 2MF2 A; 2ZPB B; 1MGQ A; 4BE0 A; 1GXI E; 3CC4 A; 1JQQ A; 2R5M A; 1TUG B; 2KR3 A; 4M7A F; 2LCS A; 1HYO A; 2A7Y A; 3CCL Q; 4J5Y A; 4CI0 C; 1V76 A; 2W10 A; 3EFS A; 2YUQ A; 3BW1 A; 3OQ5 A; 1WHK A; 2XI9 A; 1BK2 A; 3HPW A; 1QLY A; 2JM8 A; 3RR6 A; 3MCA B; 2W0Z A; 3M54 A; 2VGM A; 1YJW Q; 4LNP A; 4E7L A; 2HD0 A; 1KC8 C; 4KT0 E; 1KD1 C; 1QVF S; 3LLR A; 4RG2 A; 3CCJ Q; 2A08 A; 2KRN A; 3P8D A; 2E10 A; 3SWN B; 1MNE A; 1U5S A; 1YCY A; 5KYN A; 2P84 A; 3H9N A; 1JO8 A; 1K0X A; 4A4K A; 4LDW A; 3VS2 A; 5GJV B; 3UWN A; 1TU0 B; 4JDS A; 4C5E A; 3H0I A; 4M77 G; 4OGE A; 2GF7 A; 3RMS A; 1YP5 A; 3C4S A; 1DJ7 B; 3V8L A; 3EH1 A; 3OYK A; 1Q82 R; 4M7D C; 3SB2 A; 1UEC A; 2EQJ A; 5CR2 A; 2FL7 A; 2K5L A; 3LGL A; 1WPY A; 3CCM Q; 1VQO T; 3ME9 A; 3OYM A; 1WHH A; 4OMO A; 1SSH A; 4E7S A; 2KDS A; 1ZUY A; 2E6N A; 2HKN A; 1YJN Q; 5GAN 5; 2PU9 B; 1RAH B; 2RM4 A; 2P0P A; 2MK5 A; 1VQ5 A; 2HQE A; 1UHC A; 4D8D A; 1TUD A; 1NYF A; 2RK2 A; 1YIT T; 1QVF A; 4DEY A; 3CD6 A; 4M75 E; 1KC8 U; 3OSS C; 4JLI A; 1B34 B; 1IRX A; 2EPD A; 3VRZ A; 1WLP B; 2CRE A; 1OI1 A; 5GMK h; 1W70 A; 2Y90 A; 4Z88 A; 1G8X A; 1VUB A; 4J9G A; 1KQ2 A; 1K8A R; 2K5I A; 4EPC A; 3JCM d; 3PFS A; 3GBQ A; 1H3Z A; 2J05 A; 2E3I A; 2LZ6 B; 1PD1 A; 3GOX A; 1VQM A; 3PMI A; 4JZ4 A; 1UTI A; 3L2W A; 1D1A A; 5GAO r; 2CGH A; 3QPH A; 2O88 A; 2DL5 A; 1N9S A; 1IRE B; 3C12 A; 1RAG B; 1NPP A; 3TU4 K; 1YJ9 T; 4HVV A; 3VYG A; 1GCP A; 2L5Q A; 4EMK C; 1M2V A; 2OJ2 A; 2R57 A; 3OY9 A; 3CCR Q; 3OBY A; 5HY6 A; 1M3A A; 2RA2 A; 3DB4 A; 4RTV A; 2IPO B; 2YLB A; 5KCH A; 3G4S Q; 1PSE A; 2DYI A; 3CCS T; 4C8Q F; 2CP2 A; 3V8J A; 1WFW A; 3TCJ A; 4DBF A; 4ZTJ A; 3CCU A; 3CCQ Q; 2HQH A; 2BUD A; 3RES A; 4MDW A; 3O5Z A; 4PJM A; 1R0B G; 5D6Y A; 4OGC A; 3WVD B; 4M75 C; 3E19 A; 5CKE A; 1W4S A; 3HFO A; 2EQK A; 3M56 A; 1SG5 A; 2CP6 A; 2JTM A; 5GAM j; 1M1K R; 2V1Q A; 4GY5 A; 4M7A B; 1WJS A; 1S72 A; 1K9M C; 2K5F A; 2AKL A; 1NG2 A; 5D6X A; 2FZK B; 3FB9 A; 2DBM A; 4IUR A; 4A63 B; 4CC7 A; 1VQ9 A; 3LGF A; 3HFN A; 3JCM c; 2EWN A; 3FDR A; 2ROT A; 3OW2 P; 5IN1 A; 4R55 A; 3BY7 A; 2YSQ A; 2FO0 A; 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