The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
|
sequence length |
59
|
structure length |
59
|
Chain Sequence |
MEAIAKHDFSATADDELSFRKGQILKILNMEDDSNWYRAELDGKEGLIPSNYIEMKNHD
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural Comparison of the Unstable drkN SH3 Domain and a Stable Mutant
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
SH2-SH3 adapter protein drk
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Drosophila melanogaster
|
| total genus |
7
|
| structure length |
59
|
| sequence length |
59
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-09-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1TG0 A; 4EIK A; 1NYG A; 4D8D A; 4DEX A; 1WXU A; 2LQN A; 3M0R A; 1OPK A; 2OAW A; 3VS3 A; 2DRK A; 1EFN A; 1YCS B; 2ROT A; 2JW4 A; 4RUG A; 1WXT A; 3EHR A; 2RQR A; 2EBP A; 2FG0 A; 3RNJ A; 2C0T A; 1SPK A; 2SRC A; 1NEG A; 2FRW A; 4OMN A; 5I22 A; 1JU5 C; 2MOX A; 2YUN A; 2CH4 A; 1E7O A; 1UG1 A; 2D8H A; 1WYX A; 2VKN A; 2YT6 A; 4RTY A; 4AFS C; 4K11 A; 2EYY A; 2C0I A; 1JO8 A; 2A28 A; 2DVJ A; 1CKA A; 1KSW A; 3H0H A; 4HXJ A; 1E6G A; 2J6K A; 1AWO A; 2X3X D; 2RQU A; 3M0P A; 1AWX A; 2J06 A; 1CSK A; 2DM1 A; 5IXB A; 1QKX A; 3THK A; 1OPL A; 1WFW A; 2GGR A; 4AG2 C; 2RNA A; 1UE9 A; 3R6N A; 2A36 A; 2EYW A; 2F2W A; 4OML A; 4RTZ A; 2O88 A; 2PNI A; 2IIM A; 1NM7 A; 1OV3 A; 4RTT A; 2YSQ A; 4RTX A; 2EPD A; 2A37 A; 4A63 B; 1WIE A; 4HCK A; 2K3B A; 2M51 A; 1YWO A; 1H8K A; 2EVR A; 2PZ1 A; 1UEC A; 1YP5 A; 2FO0 A; 1BK2 A; 1Z9Z A; 2XMF A; 2RPN A; 3PVQ A; 1QWF A; 1AWW A; 3O5Z A; 3RBB B; 1Y57 A; 2DL3 A; 4CC4 B; 2YUP A; 5EC7 A; 2X3W D; 4HVU A; 4HVW A; 2BZ8 A; 2ESW A; 2EW3 A; 1H3H A; 2GTO A; 1QLY A; 2GNC A; 2HBW A; 2I0N A; 2OI3 A; 2RQV A; 1GFC A; 2VWF A; 2DBK A; 2HEQ A; 1WDX A; 3EG2 A; 2EKH A; 1NLO C; 4J9G A; 1I07 A; 4CC3 A; 1SRM A; 1UHC A; 2SEM A; 2KYB A; 4AG1 C; 2V1Q A; 1NYF A; 2RQT A; 3ULR B; 3M0S A; 2BTT A; 2KRM A; 2LZ6 B; 2DL8 A; 4AFZ C; 2W0Z A; 5GJW B; 3UA7 A; 1NLP C; 1W1F A; 2KXD A; 1K9A A; 3VRZ A; 2KE9 A; 2L3S A; 2EGC A; 2CSI A; 1S1N A; 5ECA A; 2RQW A; 2EYX A; 2DL4 A; 3EG3 A; 2EGA A; 4R0K A; 1KJW A; 5IXF A; 1SHG A; 1AEY A; 1NEB A; 2MCN A; 2KT1 A; 2LQW A; 1GCQ A; 1Z9Q A; 2KT8 A; 2M0Y A; 2KR3 A; 2MIO A; 1BU1 A; 4Z88 A; 4OMP A; 4J9C A; 1N5Z A; 4J9E A; 2ABL A; 2L3Q A; 3I5R A; 1I1J A; 2D0N A; 1T3S A; 1OOT A; 4JZ3 A; 1PRL C; 4WCI A; 2DMO A; 4CC7 A; 1I0C A; 1M27 C; 1YWP A; 2D8J A; 2KYM A; 3TSW A; 3VS6 A; 4IIM A; 1QKW A; 4LN2 A; 1AOJ A; 2B86 A; 2VVK A; 1JXO A; 2DX1 A; 3I5S A; 1KFZ A; 4LE9 A; 3M0U A; 4LUE A; 2RN8 A; 4J9D A; 2FPF A; 3ZL7 C; 3I9Q A; 1W6X A; 2AZV A; 3C0C A; 2JMC A; 2KEA A; 2A08 A; 2CRE A; 1TUC A; 1X69 A; 3H41 A; 1RLP C; 1X27 A; 1GBQ A; 4CC2 A; 1BBZ A; 1SEM A; 2BZX A; 4Z8A A; 1AWJ A; 2K79 A; 2DRM A; 2DBM A; 2F2X A; 2JM8 A; 2K6D A; 2JXB A; 2CT4 A; 4RTW A; 2W10 A; 1JQQ A; 3NMZ C; 1PHT A; 1PKT A; 4J9H A; 3VS2 A; 1M3B A; 2J05 A; 4F17 A; 2O2O A; 2DIL A; 2L2P A; 2DJQ A; 2CDT A; 1T0H A; 3I35 A; 4JJB A; 2KRS A; 5GJV B; 3QWX X; 1KIK A; 2AZS A; 2OJ2 A; 2O9S A; 1UDL A; 1GRI A; 3U23 A; 2PTK A; 1HD3 A; 1VA7 A; 2AKK A; 3EHQ A; 1VYU A; 2QDL A; 3LH5 A; 1J3T A; 2J7I A; 1UGV A; 2HDA A; 1WA7 A; 2JS2 A; 1WI7 A; 2ECZ A; 3SEM A; 1MV3 A; 1BB9 A; 1SHF A; 1PWT A; 3FJ5 A; 2YUQ A; 1ZBJ A; 1GBR A; 1GCP A; 2FPE A; 1ABQ A; 1FYN A; 1ABO A; 1JEG A; 2JMA A; 1GL5 A; 3SHW A; 2KXC A; 1MUZ A; 2DL7 A; 1NG2 A; 1OEB A; 1HJD A; 1G2B A; 3UA6 A; 1PNJ A; 2FRY A; 1CKB A; 2LJ3 A; 2L3P A; 1K0S A; 2K7A A; 2J6F A; 3A98 A; 1UJY A; 2C0O A; 2CH4 W; 2CUD A; 5FWB A; 4AFQ C; 4F16 A; 5FWC A; 1ZLM A; 2NUZ A; 2JT4 A; 1U5S A; 1GFD A; 1WXB A; 4KRT A; 2GTJ A; 4D8K A; 1X6G A; 5IHK A; 2LP5 A; 1XOV A; 2KBT A; 3NGP A; 2V1R A; 1B07 A; 4OMQ A; 2DF6 A; 2ED0 A; 3H0F A; 1JXM A; 2FPD A; 2NWM A; 3EG1 A; 1SSH A; 1QWE A; 4M4Z A; 2JTE A; 4ESR A; 3GBQ A; 1E6H A; 2YUO A; 1AZG B; 1UJ0 A; 5I11 A; 3EGU A; 2GQI A; 1AZE A; 4Z89 A; 1PKS A; 2DE0 X; 1MV0 B; 2E5K A; 1UTI A; 2DLP A; 1ZUY A; 3VS0 A; 1M30 A; 1M3C A; 2D1X A; 1UUE A; 1HSQ A; 4ORZ A; 3M0Q A; 1K76 A; 4J9I A; 5FW9 A; 3UF4 A; 3PVL A; 4HVV A; 3REB B; 5IHN A; 2CT3 A; 4LUD A; 2KRN A; 2H8H A; 2HCK A; 3VRY A; 1RI9 A; 4GBQ A; 1W70 A; 2ENM A; 3PE0 A; 3VS7 A; 1AD5 A; 2LMJ A; 1QCF A; 4QT7 A; 1VYT A; 2ED1 A; 1U3O A; 4OMM A; 2AKL A; 3JV3 A; 3NPF A; 3TVT A; 1B3Q A; 2K2M A; 1FMK A; 1LCK A; 1RUW A; 3VS4 A; 1ZSG A; 2RMO A; 4OMO A; 4IIO A; 2J6O A; 3VS1 A; 2JS0 A; 3NHN A; 3TSZ A; 3H0I A; 1RLQ C; 1Y0M A; 2KNB B; 1M8M A; 4DEY A; 1UFF A; 5L23 A; 4RTV A; 2DA9 A; 2EQI A; 2BZY A; 1WLP B; 4AFU C; 2HSP A; 4F14 A; 5IH2 A; 1ZUK A; 2FEI A; 4RTU A; 3UAT A; 2JM9 A; 4JJC A; 2AK5 A; 1X2K A; 1AVZ C; 2DYB A; 2O31 A; 2LJ1 A; 1YN8 A; 2YDL A; 4GLM A; 4JJD A; 2LNH B; 3VS5 A; 1K4U S; 1X6B A; 4JPB W; 4Y92 A; 5HCK A; 1T0J A; 3REA B; 1U06 A; 1K1Z A; 2CSQ A; 1H92 A; 1X2Q A; 5IHI A; 2CUB A; 2EYZ A; 1T3L A; 1SRL A; 4J9B A; 2L0A A; 1WX6 A; 2KRO A; 4LNP A; 2F2V A; 4E6R A; 2ROL A; 2P4R A; 2EGE A; 2RF0 A; 4JZ4 A; 2LJ0 A; 3IQL A; 1V1C A; 3M0T A; 1K0X A; 2K9G A; 1TUD A; 1VYV A; 1ZUU A; 2DL5 A; 1ZX6 A; 3KFV A; 3CQT A; 2DNU A; 1A0N B; 1M3A A; 4X1V A; 3QWY A; 1IO6 A; 1G83 A; 2GBQ A; 2KGT A; 1YNZ A; 3EG0 A; 4FSS A; 1GCQ C; 1UHF A; 4J9F A; 1ARK A; 2LCS A; 2G6F X; 2O9V A; 1PRM C; 2LX7 A; 1X43 A; 4ZNX A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5GAM e; 1ZSZ A; 4N4I A; 1M5Q 1; 2EWN A; 2KK4 A; 5CAI A; 4D8D A; 4C92 C; 4PJO B; 4KGZ B; 4DEX A; 2QQ9 A; 1WXU A; 3QII A; 3JCM b; 2L5Q A; 4F7U F; 3CCS Q; 1OPK A; 2OAW A; 3MPU B; 3VS3 A; 2DXU A; 4AT1 B; 3CCQ T; 1WJR A; 2LCC A; 2DVE A; 1SPK A; 2RHU A; 1NEG A; 1RAH B; 2FRW A; 4OMN A; 4BY6 C; 2P4T A; 5A2Q E; 3SWN C; 2OTJ T; 2CH4 A; 3RER A; 2D8H A; 3QYG B; 2CP5 A; 1VQP A; 2DVJ A; 3HKS A; 4HXJ A; 3CCL A; 1E6G A; 4Q5W A; 4M7D A; 2X3X D; 2ZGW A; 2H3J A; 3M0P A; 1NZ9 A; 4XU3 A; 4HT8 A; 1FWZ A; 5IXB A; 1S72 A; 2X35 A; 1RAE B; 4PJO F; 5LJ3 e; 2DIG A; 4M7D G; 2COZ A; 2RO0 A; 1WFW A; 5GMK i; 2RJE A; 3KUF A; 3G4S T; 3LX7 A; 2KAF A; 5I21 A; 1WHM A; 1M4Z A; 1P92 A; 1YJW Q; 2E10 A; 2JVV A; 5CKF A; 2XI9 A; 2O88 A; 4E7L A; 4ME7 A; 2PNI A; 1NM7 A; 2RHI A; 3OS0 A; 4RTT A; 2EPD A; 3OYI A; 1WIE A; 3BY7 A; 5FU6 C; 1G8X A; 1IRX A; 3OBY A; 3CCM T; 3JCM e; 4BI8 B; 3BFM A; 1YP5 A; 4OVA A; 2ZPE B; 3V7S A; 5CKD A; 2DPP B; 3PVQ A; 2MF2 A; 5KCO A; 2O01 E; 1KG1 A; 4C8Q B; 1Y57 A; 2DL3 A; 2G3R A; 3CD6 Q; 3JCM J; 5DLO A; 3J7A F; 1OQK A; 2M9U A; 5CKE A; 2RHX A; 3G6E A; 2HBW A; 2K2V A; 2LT4 A; 2HAX A; 5FRN A; 3JSC A; 2NUT A; 3G7Z A; 3OYF A; 4ZGJ B; 5GAO r; 1IXD A; 1NLO C; 3DB3 A; 2LDM A; 2YHT A; 3JCM X; 5KYW B; 2SEM A; 2KYB A; 4M7A D; 2HKN A; 1IB8 A; 4X9C A; 1NYF A; 3ULR B; 4M77 C; 1IGQ A; 3OQ5 A; 3UWN A; 2DL8 A; 2W0Z A; 4N0A C; 2OTJ A; 3VYH B; 4LD6 A; 3PNW C; 1I81 A; 3VRZ A; 4C8Q F; 4NL3 A; 5ECA A; 2RQW A; 1QMC A; 3HHT B; 1VQL T; 2DL4 A; 4L59 A; 1SHG A; 3HP9 A; 2CKK A; 1Z9Q A; 5KE2 A; 2KT8 A; 5KYU B; 5GAO l; 2KR3 A; 2MIO A; 3BW1 A; 1NPP A; 1G3S A; 1N5Z A; 1IGU A; 1VQM T; 1EIF A; 1U1S A; 2M1H A; 3A1P A; 3I5R A; 1MMG A; 3RDV A; 3OYD A; 2H3E B; 3G4S A; 1OOT A; 3M58 A; 4JZ3 A; 3GOX A; 3PMT A; 1EZZ B; 2D8J A; 2DKG A; 4OB3 B; 3OY9 A; 1PD1 A; 1ZA2 B; 2DTH A; 3I56 T; 3OMG A; 2ZPI B; 1QKW A; 1TS9 A; 2XIC A; 1XJW B; 3OSS C; 2DX1 A; 1KFZ A; 4LE9 A; 2Y90 A; 4MMK A; 3EFO A; 5GMK m; 3MCA B; 2FPF A; 4M75 B; 3NTI A; 3ZL7 C; 1W6X A; 2AZV A; 5GAO q; 3WVD B; 4C8Q G; 4M7D D; 1GBQ A; 1HYO A; 4Z8A A; 2RI2 A; 1KD1 C; 2LQ8 A; 1QW1 A; 2E1H A; 4FW1 A; 2JM8 A; 3JCM W; 2K6D A; 1KHI A; 4NOY A; 2JXB A; 3SB2 A; 4A4F A; 2W10 A; 1JQQ A; 2LVM A; 4MDW A; 3OYG A; 2HQE A; 1WNL A; 2O2O A; 4BE0 A; 1VQ7 T; 4NL2 A; 3VYG A; 3RR6 A; 2OJ2 A; 2BIV A; 3GIB A; 5LJ5 d; 4OB0 B; 1VYU A; 1J3T A; 4KUL A; 2HDA A; 5HKC A; 1VQK T; 1WA7 A; 1VQ5 T; 3VUB A; 1MV3 A; 4LDU A; 1QVP A; 1W2B A; 2QDY B; 2YUQ A; 1ZBJ A; 2FPE A; 3GNF B; 2F69 A; 2JMA A; 1GL5 A; 5GAN e; 4Y91 A; 1IRE B; 2DL7 A; 3CCJ T; 3UT1 A; 1K8A C; 2QGG A; 2L3P A; 3EH2 A; 4PNO A; 3URG A; 1K0S A; 4J83 A; 2J6F A; 5CR2 A; 3A98 A; 2CH4 W; 2QA4 T; 1Q82 R; 1Y7X A; 3DLM A; 4M7A E; 3DB4 A; 5GAM f; 1OU8 A; 3WVE B; 3I56 A; 4BAC A; 2QQB A; 4RG8 A; 1YIJ Q; 2KBT A; 1VQN T; 1KC8 R; 1B07 A; 2DF6 A; 2ED0 A; 3EG1 A; 1IHW A; 3GPL A; 4BE1 A; 1WHJ A; 1FX7 A; 1QVG P; 1VQ6 Q; 2DXC A; 1AZG B; 1TOV A; 3EGU A; 2QEX T; 5C0M A; 4BI4 A; 2HBP A; 2DLP A; 3EGD A; 3QHS A; 3LWH A; 2ZPG B; 2D0Q B; 3MEU A; 2RHZ A; 4O5V A; 3AHU A; 1HSQ A; 3I55 A; 3RES A; 1KK7 A; 5FW9 A; 1VQ7 A; 4QVC A; 3QJ6 A; 5LJ3 f; 4MZM A; 2CT3 A; 4LUD A; 2H8H A; 3HSB A; 2HCK A; 4LDV A; 5DM7 R; 1W70 A; 3PE0 A; 3OYH A; 3CCV A; 2NUP B; 2E3H A; 4JRI A; 1LPL A; 1VQ5 A; 1U3O A; 3CC2 T; 1B3Q A; 4M7D E; 2K2M A; 3GF5 A; 4PJJ A; 3H9N A; 5CQY A; 1ZSG A; 3OYL A; 4OMO A; 3ZEH A; 2J6O A; 2VYT A; 3VS1 A; 1MHN A; 3NHN A; 3E19 A; 3JCM c; 3MET A; 1Y0M A; 3JCM f; 3CCJ A; 1YI2 A; 4C0G A; 1RAA B; 4EMG A; 1OUL A; 2EQI A; 4OP0 A; 2PUK B; 3CC4 Q; 2LNV A; 4F14 A; 5KYX B; 1KD1 R; 1M1F A; 1I8F A; 1B34 A; 2O4X A; 5FRM A; 2QA4 A; 5D6Y A; 3UAT A; 2JM9 A; 3FEO A; 3A8G B; 1X2K A; 1AVZ C; 5CKB A; 1OX9 A; 3A5Z B; 4ZTJ A; 1QVG S; 3RMQ A; 2YDL A; 1K4U S; 3QG1 A; 1WJS A; 4Y92 A; 1WJQ A; 3DKM A; 1VQ4 Q; 2CSQ A; 1H92 A; 1T3L A; 4MDX A; 1M2V A; 4E6R A; 2EGE A; 2QEX A; 2QTX A; 4JZ4 A; 3EG9 B; 2VV5 A; 1DJ7 B; 4HT9 A; 1ZSZ C; 1WQW A; 5CVI A; 1A0N B; 3EFS A; 2RA2 A; 1IO6 A; 2DIQ A; 1I5O B; 2KGT A; 1K8A R; 1YNZ A; 1YJN A; 1VQ9 A; 1GCQ C; 1ARK A; 1N8R C; 4ZNX A; 1TG0 A; 3M59 A; 4C0D C; 3FJP A; 3ER0 A; 1VQ8 Q; 1M1G A; 2DRK A; 2ROT A; 4RUG A; 3JCM Q; 1WXT A; 3EHR A; 2KY9 A; 2RQR A; 3S3M A; 2EBP A; 2FG0 A; 3CPW P; 4YTL A; 2SRC A; 4M7D C; 3BE3 A; 3J80 E; 2E6N A; 2YRD A; 5J39 A; 1UG1 A; 1WYX A; 2QQS A; 2YT6 A; 1WHK A; 3S3O A; 4K11 A; 2EYY A; 2C0I A; 1JO8 A; 4NS5 A; 3H6Z A; 4J7I A; 4FU6 A; 5I2S A; 4PKC C; 3H0H A; 3EGX A; 3JB9 H; 2J6K A; 4M7A B; 1AWO A; 1R77 A; 3P8H A; 3MEV A; 2K57 A; 3CCE Q; 2J06 A; 1HXD A; 4QVD A; 2DM1 A; 1QKX A; 3UDC A; 5AYF A; 3LYI A; 2ZAE A; 1BI1 A; 1W4S A; 4M78 B; 2XD0 A; 4EPC A; 3MP1 A; 3TCJ A; 1C6V X; 4XTV A; 4OML A; 4QW2 A; 4RTZ A; 5A0L A; 1VQP T; 3CXC P; 3CCL T; 2HZY A; 2A37 A; 1N9R A; 3CPF A; 4HCK A; 1K9M C; 1YBY A; 1ACM B; 3G71 T; 3FRN A; 1VQP Q; 5LJ5 j; 2WAC A; 2FO0 A; 3JAM E; 2DXT A; 1YCY A; 2RPN A; 3OW2 S; 2RD1 A; 5GAN f; 1QWF A; 1AWW A; 1YHQ T; 1UGS B; 3FB9 A; 4M78 F; 4ZGE B; 4XU1 A; 1TH7 A; 5D6X A; 1S72 Q; 3QZ9 B; 4HVW A; 1FMW A; 1WHG A; 2ESW A; 2EW3 A; 1B7T A; 3A8M B; 3X20 B; 3CPW S; 3HL8 A; 2OI3 A; 1GFC A; 3JB9 F; 2P84 A; 2HEQ A; 2IG0 A; 2EKH A; 4J9G A; 3VV0 A; 1UHC A; 4AG1 C; 2V1Q A; 2XID A; 1PD0 A; 2QGF B; 2RQT A; 1LVK A; 1KD1 U; 3F70 A; 2LZ6 B; 2EKO A; 5GJW B; 1NLP C; 1W1F A; 1K9A A; 2EAY A; 3AT1 B; 2KE9 A; 3G6E T; 3EG3 A; 4R0K A; 2ATC B; 1R8O B; 4OB2 B; 1GCQ A; 4M78 G; 4IUR A; 4OMP A; 4J9C A; 3D7S B; 3CXC S; 1VQO A; 4M77 E; 2CP2 A; 1Q86 C; 2L3Q A; 4ELZ C; 1D1C A; 3PT9 A; 1TU0 B; 2D0N A; 3JB9 G; 4C8Q C; 4IUU A; 1N8R R; 1PRL C; 3NTK A; 4WCI A; 4QQD A; 4CC7 A; 1QVF A; 1I0C A; 3TSW A; 3FIF A; 1JJ2 P; 3CCQ Q; 3VS6 A; 4IIM A; 3L42 A; 3ME9 A; 2DXB A; 3TRE A; 3E9F A; 1K8A U; 2OTJ Q; 3BDU A; 3X26 B; 2VC8 A; 2VAS A; 2MWP A; 1M9S A; 3I9Q A; 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