3OYAA

Crystal structure of the prototype foamy virus (pfv) intasome in complex with magnesium and raltegravir at 2.65 resolution
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
368
structure length
368
Chain Sequence
LDAELDQLLQGHYIKGYPKQYTYFLEDGKVKVSRPEGVKIIPPQSDRQKIVLQAHNLAHTGREATLLKIANLYWWPNMRKDVVKQLGRCQQCLITNASNKASGPILRPDRPQKPFDKFFIDYIGPLPPSQGYLYVLVVVDGMTGFTWLYPTKAPSTSATVKSLNVLTSIAIPKVIHSDQGAAFTSSTFAEWAKERGIHLEFSTPYHPQSSGKVERKNSDIKRLLTKLLVGRPTKWYDLLPVVQLALNNTYSPVLKYTPHQLLFGIDSNTPFANQDTLDLTREEELSLLQEIRTSLYHPSTPPASSRSWSPVVGQLVQERVARPASLRPRWHKPSTVLKVLNPRTVVILDHLGNNRTVSIDNLKPTSHQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Molecular mechanisms of retroviral integrase inhibition and the evolution of viral resistance.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PFV integrase
molecule tags Recombination,viral protein/dna
source organism Human spumaretrovirus
total genus 106
structure length 368
sequence length 368
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.7.49: RNA-directed DNA polymerase.
pdb deposition date 2010-09-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00665 rve Integrase core domain
A PF17921 Integrase_H2C2 Integrase zinc binding domain
A PF18103 SH3_11 Retroviral integrase C-terminal SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.2300 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Arc Repressor Mutant, subunit A 3oyaA04
1.10.340.70 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Endonuclease III; domain 1 Endonuclease III; domain 1 3oyaA01
2.30.30.140 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 type barrels. 3oyaA02
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 3oyaA03
2FBYA 3AVCA 5T7BA 1OZ3A 3VQ9A 1RT5A 3LWLA 5J39A 4CF8A 4N4HA 2HVHA 4BWMA 2RHXA 3I8DA 4FLYA 3T19A 4HUGA 3META 1C1CA 1NK8A 3P8DA 1QS4A 4KTQA 5J2QA 2X74A 4HHTA 1FXXA 3LP2A 4IG0A 4N76A 4AHVA 5CY4A 3OS2A 1LV5A 2YNFA 4QW2A 3DRPA 4E7KA 1J9AA 1RT7A 3NTHA 1EP4A 3K5MA 2Z1HA 4AH9A 3NCIA 4CJLA 1UOCA 2L3RA 2X6NA 1QQCA 2KW4A 4W5QA 2RHZA 1L5UA 3AVJA 1N27A 4C8LA 4HVJA 4TSXA 1C0TA 1WJQA 1RBUA 2KFZA 1VSEA 1BQMA 4Z4EA 1S6QA 3ZCMA 3V1OA 1NK5A 2RJFA 3S3MA 2R5AA 3KD5E 4W5TA 1RBVA 1ITGA 2OPQA 3NDKA 4DQSA 3TWHA 1B9FA 3TABA 2LRQA 4LD0A 3ULDA 4FJJA 4F4KA 3KUFA 3AO3A 3CM5A 1HQEA 4I2PA 3SYZA 4IFYA 2FBVA 4DU4A 3V9XA 3SPYA 3ISNC 4FVMA 2YNGA 4Z02A 3WNHA 1WSGA 4QQDA 2XY8A 3EY1A 4CHQA 3ZSWA 1RDAA 3SQ0A 5SWMA 2QK9A 4KTWA 3RMAA 2OPSA 2MWPA 1VSMA 4B9VA 4ID1A 1IKXA 3D0PA 5HRSA 2K3XA 4O0JA 4IUVA 4E7HA 3NTKA 4CJFA 4PQUA 3LP3A 4Z4GA 4FZXC 2ZD1A 3SQ2A 1KVBA 1JXEA 1VK0A 4O55A 4Q5VA 1RBSA 1C0MA 2BE2A 3JYTA 4B9MA 3RRHA 3SCXA 3UT1A 2D9TA 1JLQA 3MP8A 1WN7A 2OA8A 4KHQA 4DLGA 1JLCA 4B9NA 3HVRA 3PO5A 4AHSA 2VWJA 4C5IA 1SSFA 4DQQA 1BCOA 2YNHA 3SUNA 1GOCA 3K2PA 1NJXA 4FK2A 1ZBIA 4HCZA 3SNNA 1OZ2A 3LZIA 4FJXA 2E6LA 2XHBA 3ZSVA 3QIPA 3SZ2A 1JLGA 3HYFA 5CZ2A 1D8YA 1Y97A 2WONA 3L3UA 3QIIA 4DQPA 2RI2A 1RDCA 4KKOA 3E9FA 1TL3A 3DLMA 3L2QA 3VQEA 1WJRA 3LLRA 2HB5A 4O0IA 4O4GA 3SUPA 3OQ5A 2CKKA 4B3OA 1NK9A 5DK5A 3ZSRA 2RPIA 4FJIA 1D9DA 4L59A 1A5WA 1L3UA 3BDLA 2L8DA 4CJUA 1RT4A 1LWCA 2Y1JA 4PUOA 3PNWC 3C6TA 2AJQA 3OYJA 5KH6A 4FM2A 2XK0A 4F3OA 1IKWA 2ITGA 2RHYA 1HPZA 1NKCA 3THVA 1SL2A 2L89A 3LPTA 4F3TA 5HRRA 4LH5A 3T1AA 3D45A 3VA3A 3KIOA 1XHXA 3HT3A 4CHOA 1MHNA 4CJ4A 5D3GA 3UIQA 4CIFA 4AHUA 5J2MA 2DAQA 4QQ6A 1KLNA 3ZSYA 1J54A 4IDKA 1I39A 3NE6A 4FJHA 2LVMA 4ID5A 1VSHA 2VG6A 1Q9XA 4DFMA 5KGXA 5JS1A 4UC4A 3QEXA 4DSJA 2DFFA 4NCGA 1CLQA 1H3ZA 2EHGA 1RCHA 4UQGA 3AO5A 1Q8IA 4KI6A 2VYTA 4N47A 1X1PA 3QINA 3CEYA 5KI6A 4B9UA 2HQXA 4CGDA 3L42A 1JLBA 3IRXA 3K57A 5KCHA 3OYMA 1WSIA 4GW6A 4LY7A 4ELUA 1ASUA 1S1TA 3VN5A 3OYEA 3HPOA 3LYIA 4M3WA 4C8NA 1BIUA 4I9LA 1OI1A 4KAZA 2Z1IA 2IC3A 3AO2A 2QXFA 3MO8A 3AVMA 2IS3A 1QSYA 1YVUA 1OYXA 3UWNA 5HRNA 1LW0A 3ZSZA 2HMIA 2RHIA 5KGWA 4FXDA 1WSFA 4J2EA 1CZBA 4JLHA 2F8SA 4B08A 3U3GA 3LZJA 2A1SA 1VSKA 2XO7A 1TK8A 4G1QA 2K3YA 2LCCA 3KK2A 4CF1A 4KHNA 2GBZA 2F8TA 5D6YA 4M3TA 3P8HA 2Z1JA 1Q9YA 4QVZA 4Y1DA 4DG1A 4BE2A 3O4NA 3AVNA 1NOYA 1N5YA 4DTSA 3FEOA 3OY9A 3H8ZA 4LSNA 4A4GA 1KSPA 1XC9A 4CEOA 1T8EA 3KTQA 4E1NA 1TKZA 4W5RA 3AA3A 2R7YA 4M45A 2YKNA 3QETA 1U04A 4E7IA 4CJSA 3RR7A 3MEUA 3TAQA 4PY5A 3DLRA 4W5OA 1UWBA 1BIZA 4CEZA 4J2AA 3L2VA 3DRSA 4DTPA 1SKRA 4DTXA 4H4OA 3ZT0A 1IKYA 3PFSA 4PWDA 4DTOA 3MXMA 3H6ZA 4DSLA 3AVKA 4OLAA 3DLEA 4CFAA 3EZ5A 3KLIA 4N4GA 5J26A 3C94A 4IUQA 4OPJA 2O4IA 3HM9A 2RHUA 1MU2A 4KHYA 3FC3A 2P51A 4OJRA 4Q0BA 1J5OA 1BQNA 1FK9A 1VSIA 3QNNA 4QQGA 1A5VA 2DY4A 1RBRA 3Q1JA 4CF9A 3BGRA 3QKJA 1HYVA 4KPYA 4KHUA 4CJVA 3DB4A 4DTNA 3NFAA 1UAXA 2VG5A 1FKPA 4NZGA 1JLFA 5JS2A 3SD4A 3VQ6A 2XY6A 2X6SA 3RMBA 4AHTA 3ZSOA 4KHSA 1WSEA 5D6WA 2X35A 3PUFA 4M3UA 1RTHA 4ZHRA 2HHSA 2R5MA 4CF0A 3MECA 2G8VA 5FRNA 1KTQA 1NK4A 2B5JA 3DOKA 1JKHA 4OGEA 3ZEHA 4NYFA 1BI4A 1EXQA 2HVIA 2E4LA 3HO1A 1KVAA 4BE1A 3B6PA 4IURA 3CG7A 5I3UA 1XNIA 2EX3A 2P5GA 1ZBFA 4F2RA 3OJSA 4CERA 3IG1A 2X4XA 3TAMA 3AVIA 2KZMA 3U6FA 4A4EA 2KFNA 3ZT4A 1DLOA 3KKSA 3PMTA 3DM2A 3M8QA 5CIUA 4KTZA 1TV6A 1REVA 1KRPA 4DTMA 4CK1A 2HQEA 4E3SA 2NLUA 4RW9A 3KLGA 3GOXA 3P83D 3KLEA 1RNHA 3VQDA 3AVHA 4CIGA 2G8HA 5DMRA 2A1RA 4J2DA 3EAEA 3ME9A 2F5KA 1VSDA 4HTUA 4FJGA 4CGFA 4M3XA 4DMNA 4FCYA 1S1VA 2PQWA 5HROA 3KLFA 5KTQA 4M42A 1Z25A 4CHPA 2O4GA 3PMIA 3LAKA 3DLGA 1QSLA 4A4HA 1LW2A 1T05A 4OVAA 2D0CA 4XIUA 1RDDA 1C1BA 3TAGA 2RI5A 1RT2A 3VQ5A 4M3ZA 1EKEA 4BD3A 1BGXT 2OPRA 3ASKA 3KKRA 3VQ4A 4NYNA 4CGIA 3OMGA 3HP9A 4CEQA 2DIQA 3VQCA 3O3HA 4RW4A 1TK0A 2GFAA 5HRPA 3PX6A 2RJCA 1TKTA 4DSEA 3NTIA 1WSHA 4I2QA 3RMCA 4KFBA 3L2RA 3ZT3A 4RW7A 4CF2A 3AA2A 2PY5A 4I7FA 1WSJA 4DTUA 3NNQA 3ASMA 4RW6A 2BANA 1KHCA 4FK0A 4JRPA 3OVNA 4MQ3A 4C5GA 5EU7A 2Z1GA 4CGGA 4M3YA 2YNIA 3AVBA 3NGYA 2OPPA 2RKIA 1K6YA 3QEVA 4IUUA 4Z4IA 2R57A 4K8ZA 1LWEA 2IAJA 3SUQA 1BHLA 3LX7A 4KV8A 2OZMA 3K5OA 3LGFA 3LAMA 4F2SA 1B92A 4N56A 5HLFA 3QEIA 2VG7A 1I3AA 3C6UA 1XI1A 1BI4B 1NK6A 3TARA 4NS5A 1D5AA 3ZT1A 2BKDN 1T7PA 1ZBLA 4PLIA 3V9UA 2WACA 4FW1A 1A5XA 4EDUA 3HK2A 1NK7A 3MP1A 3G0ZA 4DTJA 4FJ8A 1DTQA 1VRTA 1TKXA 5CYQA 4CHNA 1XWLA 3HJFA 4B8CA 3NF7A 4H8KA 4FLVA 1ZBHA 4N41A 3HXMA 1U49A 1YTUA 5D6XA 1TKDA 3LH0A 2MWOA 1KFDA 1D9FA 3NBPA 4IFVA 4MFBA 3B6OA 4C8MA 3VQQA 4ELVA 4EP5A 1RILA 3DB3A 3PX4A 1W0HA 1TGOA 2QKKA 3S3NA 1YT3A 4HCCA 3HP6A 4B8AB 4CJKA 1NKEA 4RG2A 3LPUA 5E41A 3TR8A 4LSLA 1TAQA 3CQ8A 4CK2A 4HUFA 4FJ5A 1C1AA 4CESA 1S1WA 2BIVA 3DRRA 4BWJA 1S6PA 2EQUA 4L8RB 3OYIA 3A2FA 4CIEA 2O4XA 3G10A 4O44A 2IDOA 1QSSA 1JLAA 4BDYA 4ICLA 4BDZA 1C0UA 4O5BA 1WNSA 1EETA 4CCHA 5HBMA 1R0AA 4FJLA 4RW8A 2HHUA 2X4YA 1S5JA 4JS4A 3ZT2A 4ELTA 2XY5A 4FZYA 2B8AA 1KFSA 3V1RA 4DWIA 3SUOA 4H4MA 5HP1A 4CRIA 3QNOA 2IOCA 5KRSA 1JXBA 3LGLA 3LP0A 4FJMA 1HNVA 2RN2A 1UA0A 4R5PA 4CFBA 2RF2A 1HYSA 4FU6A 4FLZA 4IKFA 2HNDA 3AVAA 4DFJA 4CEAA 1G15A 5SZTA 2FC0A 5FRMA 4JS5A 2XRIA 1SKWA 2DIGA 2PZSA 4E89A 3P5JA 3RWUA 4CFCA 3OYBA 3OYDA 4GMJB 1RT3A 4FK4A 1L3VA 1L3TA 2E6MA 2FBTA 3DLBA 2HHTA 2EKOA 1QHTA 1T03A 3SV4A 3V9SA 2I5JA 4PL6A 5I42A 1L3SA 1G5VA 2Q3SA 3OB9A 1S9EA 4GVMA 2RO0A 3V6DA 3L2UA 4Z0UA 2RJDA 2HHWA 4FJ7A 3NAEA 4CEEA 4PA1A 2VWKA 1VSFA 4B9LA 1EX4A 1RBTA 3PX0A 3DOLA 4WE1A 1IO2A 3O3GA 3PO4A 3NGIA 4B9WA 3EYZA 3KLHA 3OYNA 4I9QA 1HMVA 4CJ3A 3MEEA 3AA5X 4YNQA 1NK0A 1X9MA 3TAEA 1NJWA 1RDBA 1FKOA 1NKBA 4Y1CA 3U3YA 1X9SA 2M16A 4DF4A 1IH7A 3MEVA 5KCOA 4CEFA 4W5NA 4FLTA 4II1A 4K8XA 2HHVA 3DI6A 3NF6A 1WAJA 4JRQA 1GOBA 3PV8A 3F70A 5FDLA 3I0SA 4DQIA 4CJEA 3OA6A 3RTVA 3K58A 1ZBUA 3OMCA 4Z4CA 3OJUA 3SV3A 4CECA 1HJRA 4E1MA 1N6QA 3TAPA 2D0AA 2M1HA 2BGGA 1X9WA 4ZTJA 3LDSA 2DTUA 1WLJA 3OYGA 4LD6A 4FW2A 5C6SA 4A4FA 2G8KA 4KREA 3OYHA 3OS1A 4HCBA 1HQUA 4FLXA 1WJSA 2P0KA 2W42A 4CJQA 2IGIA 4KB0A 1RTIA 3V9ZA 1RT6A 2O4XB 4C5EA 3NH0A 1WGSA 2HNYA 4CEBA 4CK3A 2YV0X 2F96A 4PLLA 3MXJA 4DSKA 3NH2A 1JL1A 3OYAA 1UA1A 2X4WA 3DLHA 4DSIA 3RRGA 2D5RA 1WAFA 1TAUA 3FFIA 3OYLA 4N5SA 2KQ2A 2ETJA 2HNZA 4B9TA 3T3FA 2YHAA 2JTFA 1KLMA 4DU1A 4FJKA 2JGUA 4C8OA 1HRHA 3SQ1A 4FM1A 3V81A 1LAVA 4EP4A 4DS4A 3MEGA 3QIOA 4B9XA 3VQ7A 3LWMA 4GY5A 3QEPA 2EQMA 3HL8A 3V1QA 1VRUA 3MP6A 2YHBA 3P1GA 5C24A 5M9OA 2WOMA 1YTAA 1LWFA 2ZQBA 2XY7A 3C95A 4J2BA 4DFKA 2GV9A 3QO9A 5KRTA 3TANA 5IN1A 2EQJA 3H08A 4FLWA 3RMDA 1U48A 3QJ6A 5KE3A 1ZYQA 4CFDA 3VQAA 4IUPA 3ITHA 4CJ5A 3LP1A 3M9QA 2NUBA 3C4SA 3CFRA 2XDPA 4OKEA 2G3RA 3L8BA 2P5OA 2RJEA 1F21A 4BE0A 1TL1A 3MEAA 3AVFA 4OKKA 3SPZA 2OZSA 3LANA 4CJTA 4F8RA 2BUDA 2ZE2A 4Q5WA 3M8SA 1RTJA 4NCBA 3VA0A 4DS5A 2HHXA 1JL2A 4E7JA 1VSJA 1BL3A 2LTOA 5J2NA 5FROA 3VQPA 2P1JA 4HUEA 2G8UA 2BDPA 1SUQA 2X78A 3S3OA 1S1UA 4FYDA 3LALA 2G8WA 5J2PA 4FZZA 3WNFA 2YRVA 3MAQA 3JSMA 5C42A 4NCAA 1TVRA 4ZTFA 2FBXA 4Z4FA 1J53A 1SKSA 1U47A 4QCLA 4FL6A 2EFIA 4CJPA 2ATQA 3CFPA 3SQ4A 5C0MA 3NF9A 4AHCA 5J1EA 3WNGA 4E0DA 4N4IA 2E6NA 3NHGA 2YKMA 5K14A 1C6VA 3MEDA 5C25A 3K59A 4B9SA 4C8KA 4DLEA 3TAFA 1JLEA 3NF8A 1U4BA 2G8FA 4CHZA 4DTRA 3CFOA 3KK1A 1RT1A 3PY8A 5CYMA 2RI3A 1CZ9A 2E5QA 3IS9A 4IG3A 4KI4A 1NJZA 1LAWA 4OGCA 4IUTA 3AA4A 2GFUA 4DF8A 2B4JA 1KCFA 4DSFA 4CGHA 3QLHA 4EZ9A 4E7LA 3OYKA 4OKJA 3DYAA 4Z4HA 2DFEA 4KO0A 2JLEA 1ASWA 2D0BA 2HHQA 1RTDA 1QE1A 3IAYA 3VQ8A 4CEDA 4FM0A 2R58A 4QAGA 3E9GA 1CXUA 2GUIA 3O3FA 1TK5A 2QQSA 1S1XA 2LSNA 3M8PA 4KHWA 4OVLA 3ZSQA 1B9DA 3SI6A 3O4QA 1GOAA 3AVLA 2FHDA 4OPKA 4CHYA 5KE2A 3QEWA 4BACA 4CGJA 2QQRA 3F9KA 4IBNA 3DMJA 3M8RA 3V4IA 1O1WA 3FLGA 1IKVA 3KJVA 3MXIA 2M0OA 3MEWA 4M41A 1HYZA 3CYMA 1SL0A 3L3VA 3WNEA 3AVGA 3E01A 3AV9A 3OS0A 3K5NA 1ASVA 4BDPA 4KB1A 3VQBA 4FLUA 3QERA 3DLKA 4AILC 3AO4A 1SV5A 3V9WA 1W9HA 3TI0A 2EQKA 2HW3A 3QBYA 2DFHA 4LH4A 1NOZA 1RI0A 4C5HA 3CM6A 3S9HA 3F73A 4OLBA 3OYFA 2G8IA 2GF7A 3KK3A 1IG9A 5CZ1A 3KD1E 1QTMA 3ZSXA 1U45A 4E19A 2QKBA 2B6AA 3RR8A 1NJYA 5IAYA 4CE9A 3BDPA 4RG8A 2PYLA 3HSTB 1BISA 1KVCA 3OYCA 3O8VA 3FDRA 2IG0A 3L2WA 2PYJA 3HPHA 1DTTA 3K5LA 2LDMA 3I0RA 1Z26A 4DFPA 3NGZA 1S9GA 3SJJA 2KZZA 1VSLA 4YFUA 3S6WA 4CJWA 1CXQA 4KRFA 2OYQA 4M3RA 3ALYA 4X34A 4DU3A 4DQRA 3AO1A 4QOZB 4FJNA 3NH1A 4EZ6A 4FJ9A 2Y1IA 4CJRA 1XHZA 3HVTA 3QESA 2KTQA 1BCMA 3HPGA 2JZ2A 1SL1A 4AHRA 1HNIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2FBYA 5T7BA 1W97L 3FXOA 3FHNA 3W6VA 2EWNA 5DTDA 4PGHA 1SEUA 3OHRA 3FF5A 3FBIB 3RKWA 4GRIA 5J39A 3A8YA 2WBNA 2JVVA 2RHXA 4FLYA 4QVCA 1WUAA 2LQWA 1OCPA 1WKMA 3D7EO 1HNZK 3GLXA 5J2QA 4A54A 1FXXA 4H0VB 3ZX3A 1WB9A 1ZYRF 4DV4K 5JHFA 4N76A 1J6ZA 3CMAI 4OO1J 1LV5A 1HKBA 2BV6A 2OI3A 3G4ST 1I1SA 1EP4A 4M7AG 2Z1HA 4L5GA 1Z05A 2GQVA 4LF7K 3IV5A 2L3RA 4A12A 1UG1A 4KUMA 1L5UA 3AVJA 3FXQA 3F22A 1VI0A 2E70A 4TSXA 3RPQA 1RBUA 2K57A 4ZGEB 2E2HJ 3CC7A 3ZQGA 1NK5A 2HVQA 1A6IA 2DVEA 3SBGA 2AA4A 4BXXJ 5AZJB 4FWQA 2MCNA 4W5TA 4IQ4A 1BC7C 1RBVA 2DTHA 1AOJA 2OPQA 2DDAA 4M77E 4CDGA 3ZXSA 3TWHA 1SFKA 2VB6A 1JO8A 1MSEC 1N33K 4S04A 3ULDA 2CQNA 4HVVA 3U4LA 3KUFA 4F4KA 1VQLN 2WSFE 2HQNA 2LJ3A 4A3FJ 1WJCA 1FYMA 3DKXA 2CFOA 2YNGA 2CQQA 3G4SI 2HQ5A 5CVIA 2I5WA 3I0TA 1WJ5A 4EM2A 2RNJA 1S8NA 1T0FC 4CCKA 2CJJA 2WUSA 1I1GA 5IY5H 1XC3A 1M3BA 2LOOA 2W40A 5BRHA 3ZSWA 3DPLC 4OX9K 2LX7A 3SQ0A 5BNGA 2QK9A 2W57A 1HCRA 1JTXA 3K0SA 2MWPA 1WX6A 1KQ0A 4M72A 1RAHB 1AT1B 1DKGD 4B1RA 4W97A 4L18B 2K3XA 2KYBA 2HL5C 3FDYA 3O08A 3RJPA 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 1C6V A;  3MED A;  5C25 A;  3K59 A;  4B9S A;  4C8K A;  4DLE A;  3TAF A;  1JLE A;  3NF8 A;  1U4B A;  2G8F A;  4CHZ A;  4DTR A;  3CFO A;  3KK1 A;  1RT1 A;  3PY8 A;  5CYM A;  2RI3 A;  1CZ9 A;  2E5Q A;  3IS9 A;  4IG3 A;  4KI4 A;  1NJZ A;  1LAW A;  4OGC A;  4IUT A;  3AA4 A;  2GFU A;  4DF8 A;  2B4J A;  1KCF A;  4DSF A;  4CGH A;  3QLH A;  4EZ9 A;  4E7L A;  3OYK A;  4OKJ A;  3DYA A;  4Z4H A;  2DFE A;  4KO0 A;  2JLE A;  1ASW A;  2D0B A;  2HHQ A;  1RTD A;  1QE1 A;  3IAY A;  3VQ8 A;  4CED A;  4FM0 A;  2R58 A;  4QAG A;  3E9G A;  1CXU A;  2GUI A;  3O3F A;  1TK5 A;  2QQS A;  1S1X A;  2LSN A;  3M8P A;  4KHW A;  4OVL A;  3ZSQ A;  1B9D A;  3SI6 A;  3O4Q A;  1GOA A;  3AVL A;  2FHD A;  4OPK A;  4CHY A;  5KE2 A;  3QEW A;  4BAC A;  4CGJ A;  2QQR A;  3F9K A;  4IBN A;  3DMJ A;  3M8R A;  3V4I A;  1O1W A;  3FLG A;  1IKV A;  3KJV A;  3MXI A;  2M0O A;  3MEW A;  4M41 A;  1HYZ A;  3CYM A;  1SL0 A;  3L3V A;  3WNE A;  3AVG A;  3E01 A;  3AV9 A;  3OS0 A;  3K5N A;  1ASV A;  4BDP A;  4KB1 A;  3VQB A;  4FLU A;  3QER A;  3DLK A;  4AIL C;  3AO4 A;  1SV5 A;  3V9W A;  1W9H A;  3TI0 A;  2EQK A;  2HW3 A;  3QBY A;  2DFH A;  4LH4 A;  1NOZ A;  1RI0 A;  4C5H A;  3CM6 A;  3S9H A;  3F73 A;  4OLB A;  3OYF A;  2G8I A;  2GF7 A;  3KK3 A;  1IG9 A;  5CZ1 A;  3KD1 E;  1QTM A;  3ZSX A;  1U45 A;  4E19 A;  2QKB A;  2B6A A;  3RR8 A;  1NJY A;  5IAY A;  4CE9 A;  3BDP A;  4RG8 A;  2PYL A;  3HST B;  1BIS A;  1KVC A;  3OYC A;  3O8V A;  3FDR A;  2IG0 A;  3L2W A;  2PYJ A;  3HPH A;  1DTT A;  3K5L A;  2LDM A;  3I0R A;  1Z26 A;  4DFP A;  3NGZ A;  1S9G A;  3SJJ A;  2KZZ A;  1VSL A;  4YFU A;  3S6W A;  4CJW A;  1CXQ A;  4KRF A;  2OYQ A;  4M3R A;  3ALY A;  4X34 A;  4DU3 A;  4DQR A;  3AO1 A;  4QOZ B;  4FJN A;  3NH1 A;  4EZ6 A;  4FJ9 A;  2Y1I A;  4CJR A;  1XHZ A;  3HVT A;  3QES A;  2KTQ A;  1BCM A;  3HPG A;  2JZ2 A;  1SL1 A;  4AHR A;  1HNI A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4A3F J;  1WJC A;  1FYM A;  3DKX A;  2CFO A;  2YNG A;  2CQQ A;  3G4S I;  2HQ5 A;  5CVI A;  2I5W A;  3I0T A;  1WJ5 A;  4EM2 A;  2RNJ A;  1S8N A;  1T0F C;  4CCK A;  2CJJ A;  2WUS A;  1I1G A;  5IY5 H;  1XC3 A;  1M3B A;  2LOO A;  2W40 A;  5BRH A;  3ZSW A;  3DPL C;  4OX9 K;  2LX7 A;  3SQ0 A;  5BNG A;  2QK9 A;  2W57 A;  1HCR A;  1JTX A;  3K0S A;  2MWP A;  1WX6 A;  1KQ0 A;  4M72 A;  1RAH B;  1AT1 B;  1DKG D;  4B1R A;  4W97 A;  4L18 B;  2K3X A;  2KYB A;  2HL5 C;  3FDY A;  3O08 A;  3RJP A;  2JTM A;  3PSI A;  1JXE A;  3O5B A;  2KQW A;  1VK0 A;  4J6W A;  2BE2 A;  4B9M A;  5FU6 C;  1H8K A;  1VQ5 A;  1VQ8 Q;  1HD3 A;  5FKL A;  1OYW A;  4AF1 A;  2GAU A;  4OFE A;  2LY2 A;  4XRS A;  4JK1 X;  2OA8 A;  3KBG A;  2L2O A;  1JLC A;  1TUC A;  2PZ1 A;  3PO5 A;  2ELH A;  1OYI A;  2FSW A;  1SSF A;  4DQQ A;  3SUN A;  3K2P A;  1TUY A;  3ZGK A;  1OZ2 A;  3LZI A;  3JSO A;  4KH0 B;  4M3G A;  3ZSV A;  2B63 J;  3IHU A;  3B8A X;  4CZK A;  5L3D A;  1Y97 A;  4NL2 A;  2XAU A;  1N32 K;  3MKL A;  3J81 K;  2DKG A;  1U9O A;  4KKO A; 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 3W3C A;  3ZMV A;  4C0D B;  1HW2 A;  2RE2 A;  2NVQ J;  3C12 A;  4CCM A;  2F5F A;  1M1K R;  3I3L A;  1YHQ A;  2IS4 A;  3M4Y A;  1RT1 A;  5J40 A;  2R3S A;  5CYM A;  1QU3 A;  4M63 C;  2DZC A;  2WAD A;  1LCU A;  2EA2 A;  3CDH A;  5C10 A;  3JCM P;  5CR2 A;  3CC2 Q;  5KPT A;  2YX4 A;  3CCM Q;  4IUT A;  3AA4 A;  1MMN A;  1KCF A;  1YFH A;  3A5O C;  1PWT A;  5KQ8 A;  4CI6 A;  3OYK A;  3IKV A;  3M55 A;  3EN9 A;  2D8J A;  3CD6 Q;  3K4B A;  2L9V A;  3VQ8 A;  3OW2 A;  4CED A;  1VQP I;  4DEX A;  5BRE A;  1CXU A;  1TK5 A;  2EV5 A;  2DQL A;  3BY6 A;  1JXS A;  3TP3 A;  2DL5 A;  5LJV A;  4YOY A;  3QUI A;  4DYR A;  5GAN f;  5FFZ A;  4C8Q F;  1HJD A;  4OPK A;  5KE2 A;  4GV6 A;  4RS8 A;  2DIL A;  2FPF A;  3QEW A;  4M77 C;  2H8W A;  3LFU A;  2M0M A;  1KC8 C;  3EGD A;  1A0N B;  4Z88 A;  3DMJ A;  3V4I A;  4C3I J;  1MMA A;  1PD0 A;  2ZFU A;  1ZQ3 P;  2FOK A;  1HSJ A;  2LVS A;  2R7V A;  3JXU A;  2P81 A;  5AZJ A;  1Q82 C;  4M78 G;  3CQY A;  3NAU A;  4C92 E;  4M41 A;  2D6F A;  4H0E A;  2CSQ A;  2JVH A;  1SL0 A;  5CKT A;  3J80 Z;  3L3V A;  1R36 A;  3WNE A;  1KQ2 A;  2FBI A;  2VWF A;  3NWS A;  3FFK B;  1KU7 A;  3L4Q A;  2NOF A;  3M59 A;  4F7U B;  2QWO A;  1FBU A;  1U1S A;  4KH5 A;  4G94 A;  1JUP A;  4RB3 C;  3JCU C;  5BPM A;  4JI1 K;  2DA7 A;  3EH2 A;  3CCU T;  3DLK A;  3E9O A;  3HG9 A;  4HNU A;  1PU8 A;  3N5B B;  3TW6 A;  1TWG J;  3PIP F;  5HK3 A;  3WUH A;  3FX3 A;  2COY A;  1HW1 A;  4PJ0 C;  1YP5 A;  2KP6 A;  3E7L A;  2CW8 A;  1E0E A;  5IT3 A;  4BHP A;  3J7A F;  2A08 A;  2HW3 A;  4LH4 A;  3U23 A;  1NOZ A;  1UDL A;  4M7D G;  4XOP A;  1O75 A;  2QW9 A;  5K5O A;  2G8I A;  1EO1 A;  4WFA L;  3OIO A;  2DO7 A;  4W1U A;  3M6G A;  4NBQ A;  3KD1 E;  4LUE A;  5M3F J;  3ZSX A;  3CMM A;  1WYX A;  4HF1 A;  3M1C A;  2DA5 A;  3QFP A;  4YPR A;  1BIS A;  3O9S A;  1I5L A;  4UV9 A;  3DBR B;  2L3P A;  2EFQ A;  3JB9 J;  3AKZ A;  4BKX A;  3ABL H;  2P9P B;  3DBH B;  2O8D B;  1I1J A;  3ZQ7 A;  2MLG A;  2DBM A;  3O6W A;  3WGG A;  3CPE A;  2L7M P;  4AYB N;  2L5Q A;  1Z26 A;  3CCU I;  1BG3 A;  1B9N A;  1JE8 A;  3NGZ A;  1HU0 A;  3HOY J;  1W2B A;  4CJW A;  1SMT A;  1OJL A;  3PQJ A;  2EAY A;  1QVF S;  3SXY A;  4PKG A;  3CMA T;  3AFH A;  3M07 A;  4ZYG A;  2H09 A;  4M74 A;  4YG2 F;  5ELZ A;  3CXC P;  3SAG A;  3V7C A;  3X26 B;  4BI4 A;  3S2D J;  4MFD A;  4JP0 A;  1NGB A;  1XSD A;  3CCQ Q;  3KZZ A;  3BG9 A;  2HNH A;  1VQM T;  2ZGW A;  1YRN B;  2O01 E;  3HVT A;  5A0G A;  2G7H A;  4ESF A;  1SL1 A;  1G83 A;  2HVR A;  1HNI A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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 4TSX A;  1C0T A;  4YRV A;  4KIS A;  1WJQ A;  2K57 A;  1RBU A;  2KFZ A;  3UPU A;  1VSE A;  1BQM A;  4ZGE B;  5KHD A;  2R7O A;  1S6Q A;  4Z4E A;  3TL4 X;  3CC7 A;  3VWB A;  3ZCM A;  3V1O A;  1NK5 A;  2HVQ A;  2RJF A;  2DVE A;  1JJ2 S;  3S3M A;  2R5A A;  1LKX A;  4Y28 E;  3KD5 E;  4M7A B;  3K70 D;  4W5T A;  4IQ4 A;  1N75 A;  1RBV A;  1ITG A;  2DTH A;  2EJ9 A;  2OPQ A;  4M77 E;  5GMK e;  3NDK A;  3ZXS A;  4DQS A;  3TWH A;  1B9F A;  3TAB A;  1SFK A;  2VB6 A;  2LRQ A;  4BJT A;  4LD0 A;  3ULD A;  2LX9 A;  4FJJ A;  4F4K A;  3KUF A;  2FYK A;  3AO3 A;  3CM5 A;  2V4J C;  1HQE A;  4I2P A;  3SYZ A;  2WSF E;  4IFY A;  2FBV A;  4HNT A;  1M90 U;  4EMK C;  3LCN A;  4DU4 A;  1WJC A;  2QDY B;  3V9X A;  3CC4 A;  1Z21 A;  3SPY A;  3DKX A;  3ISN C;  2I2L A;  3VV0 A;  2CFO A;  3JCM b;  4FVM A;  2YNG A;  1N9R A;  5CVI A;  4Z02 A;  1WJ5 A;  5I21 A;  3PNV A;  3WNH A;  1T0F C;  1WSG A;  4CCK A;  1G8X A;  2LNV A;  4QQD A;  2R7T A;  3QZ9 B;  3LSM A;  4AYB A;  1QHG A;  2LOO A;  4P5O A;  2XY8 A;  2CW7 A;  3EY1 A;  4CHQ A; 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