The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
9
|
sequence length |
69
|
structure length |
69
|
Chain Sequence |
GSSGSSGGEEYIALYPYSSVEPGDLTFTEGEEILVTQKDGEWWTGSIGDRSGIFPSNYVKPKDSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution Structure of the third SH3 domain of human intersectin 2(KIAA1256)
rcsb |
| molecule keywords |
INTERSECTIN 2
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
9
|
| structure length |
69
|
| sequence length |
69
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-07-03 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2GBQ A; 3GBQ A; 1SRL A; 5IH2 A; 1QWE A; 2KT1 A; 1E6G A; 2LJ0 A; 4Z8A A; 2K2M A; 2X3X D; 2L3P A; 3UA7 A; 2DRM A; 1OV3 A; 4EIK A; 2KYB A; 1M8M A; 1I07 A; 3O5Z A; 1GRI A; 1AWO A; 2E5K A; 4CC3 A; 2L3S A; 4ZNX A; 2DE0 X; 1AZG B; 1G2B A; 4LUD A; 1VA7 A; 1X2K A; 2KEA A; 1E7O A; 2GGR A; 1K76 A; 3C0C A; 2YUO A; 2ECZ A; 1ARK A; 4RTU A; 3R6N A; 1GBR A; 2JS2 A; 3I9Q A; 2DL4 A; 2DVJ A; 2PNI A; 3UAT A; 2JW4 A; 1U5S A; 1NEB A; 4IIM A; 2EW3 A; 4RUG A; 2OI3 A; 1QLY A; 2A36 A; 1K9A A; 1H8K A; 4OMM A; 2VWF A; 1X6B A; 2KBT A; 3REB B; 1HJD A; 4ESR A; 2MCN A; 3NGP A; 2NUZ A; 3H41 A; 4AFU C; 3UF4 A; 1T0J A; 4CC7 A; 1M3C A; 3M0U A; 1WXT A; 4M4Z A; 3TSW A; 2C0T A; 1ABQ A; 2J6F A; 1ZSG A; 4RTW A; 2F2W A; 2RQW A; 1UHF A; 2HSP A; 2ENM A; 1IO6 A; 1S1N A; 2EGA A; 1VYU A; 1NYF A; 1M3B A; 2RN8 A; 1GCQ A; 1WDX A; 2KRO A; 1JXM A; 2DMO A; 2P4R A; 1BBZ A; 1FMK A; 2F2V A; 3VS2 A; 1GCQ C; 4RTT A; 3CQT A; 1KIK A; 2RQT A; 1NYG A; 2FRY A; 1B07 A; 2LZ6 B; 1OPK A; 2DLP A; 1VYV A; 1RI9 A; 2ED0 A; 1AZE A; 3ZL7 C; 1M3A A; 4QT7 A; 1GFC A; 4Z89 A; 4OMN A; 2LQN A; 2JM9 A; 1G83 A; 2K79 A; 5IXF A; 1NM7 A; 1ZLM A; 2PZ1 A; 1BK2 A; 1I0C A; 1W70 A; 4ORZ A; 3EG2 A; 2LP5 A; 2DBK A; 1NLO C; 1WIE A; 2JT4 A; 4X1V A; 1WI7 A; 1EFN A; 2HCK A; 4JZ4 A; 3ULR B; 2ED1 A; 1UJ0 A; 1ZUK A; 2A08 A; 3KFV A; 3IQL A; 4J9I A; 2X3W D; 4KRT A; 1SPK A; 2EGE A; 3NHN A; 4AFS C; 4JJB A; 3VS4 A; 4HVU A; 1JEG A; 4LNP A; 1X69 A; 1SEM A; 1SSH A; 2FPF A; 2GNC A; 1UUE A; 1AD5 A; 4OMQ A; 1K0X A; 4OML A; 2ESW A; 1T3S A; 1YNZ A; 2G6F X; 1N5Z A; 3EGU A; 2FO0 A; 2XMF A; 4J9E A; 1YWO A; 4AG2 C; 1GL5 A; 2O9S A; 4DEX A; 2CUD A; 4RTY A; 2CUB A; 2KGT A; 1QCF A; 2DRK A; 3VRY A; 2D8H A; 4RTX A; 1JO8 A; 5IXB A; 1LCK A; 2J05 A; 2D0N A; 4J9F A; 2M0Y A; 5FWB A; 5GJW B; 1PKS A; 4F17 A; 2QDL A; 5I22 A; 2FEI A; 1WXB A; 1GFD A; 2DL8 A; 3M0T A; 2KR3 A; 1AWW A; 1H92 A; 3NPF A; 4JJD A; 1CKA A; 4HVW A; 4CC4 B; 2DYB A; 2LMJ A; 1NG2 A; 1JXO A; 1PWT A; 1SHG A; 1AWJ A; 2YUP A; 1TUC A; 1NEG A; 2KXC A; 5FW9 A; 4AFZ C; 2O88 A; 1WA7 A; 3TVT A; 1K4U S; 1PRL C; 1ZX6 A; 2DBM A; 2V1Q A; 1E6H A; 5FWC A; 2EYW A; 1SHF A; 4RTV A; 3RBB B; 3VS1 A; 2J6O A; 2HDA A; 1BB9 A; 3FJ5 A; 4K11 A; 1J3T A; 4HXJ A; 1PHT A; 1QKW A; 2ROL A; 2CSI A; 4HCK A; 1HD3 A; 4D8K A; 1WX6 A; 1PKT A; 2EBP A; 3VS5 A; 2K6D A; 2BZX A; 3TSZ A; 2KNB B; 5I11 A; 4R0K A; 2PTK A; 2F2X A; 2JMA A; 2EYX A; 1U3O A; 1OEB A; 2LCS A; 2L2P A; 2LNH B; 1K1Z A; 2KT8 A; 2J6K A; 3I5R A; 3M0Q A; 3M0P A; 1UJY A; 1V1C A; 5HCK A; 3VRZ A; 2M51 A; 2C0O A; 2DL5 A; 4AG1 C; 2MIO A; 3PVL A; 1UFF A; 1ABO A; 2CT3 A; 4J9D A; 4F14 A; 2AZV A; 1QKX A; 3JV3 A; 2FPE A; 4J9H A; 1WYX A; 4Z88 A; 1PNJ A; 2CRE A; 5IHK A; 1T3L A; 2J7I A; 2RMO A; 4DEY A; 5EC7 A; 1RLQ C; 5GJV B; 1H3H A; 2RQU A; 2B86 A; 2L0A A; 2BTT A; 2D1X A; 1OOT A; 5IHN A; 1JU5 C; 2YDL A; 2BZ8 A; 1JQQ A; 3VS3 A; 2V1R A; 3M0R A; 2DM1 A; 2GTO A; 4GBQ A; 2A37 A; 2EPD A; 2EQI A; 4IIO A; 3RNJ A; 2DA9 A; 2SEM A; 1W1F A; 2KYM A; 2K9G A; 1HSQ A; 1WFW A; 1XOV A; 1I1J A; 4AFQ C; 1CKB A; 2AZS A; 2EGC A; 3EHQ A; 4J9G A; 2K7A A; 2A28 A; 1B3Q A; 4F16 A; 2YUN A; 3VS6 A; 2LQW A; 2DL7 A; 2DL3 A; 2AKK A; 2CH4 A; 2CT4 A; 1RUW A; 4JZ3 A; 3PE0 A; 3QWY A; 2HEQ A; 4RTZ A; 3REA B; 2VVK A; 1CSK A; 2LX7 A; 3H0H A; 3THK A; 3U23 A; 2CH4 W; 1VYT A; 3A98 A; 2JMC A; 2RQR A; 1M27 C; 2DNU A; 1AWX A; 1UE9 A; 1AOJ A; 3EHR A; 4A63 B; 3H0F A; 2DJQ A; 2C0I A; 2MOX A; 4J9C A; 1ZUU A; 2AKL A; 4OMO A; 2CSQ A; 1KJW A; 4HVV A; 2DIL A; 3EG3 A; 4LN2 A; 2RPN A; 3I35 A; 2FPD A; 2IIM A; 1NLP C; 1SRM A; 3VS0 A; 1PRM C; 3H0I A; 3UA6 A; 2YT6 A; 1X43 A; 1K0S A; 1KSW A; 1MV0 B; 1WXU A; 1W6X A; 3VS7 A; 2BZY A; 2KE9 A; 1YN8 A; 4JPB W; 2KRS A; 4Y92 A; 1T0H A; 2RNA A; 2RF0 A; 2O9V A; 2CDT A; 2YUQ A; 2GQI A; 1UGV A; 1UEC A; 5ECA A; 1X2Q A; 1YCS B; 1UDL A; 2DX1 A; 4LUE A; 2VKN A; 1ZBJ A; 2K3B A; 2OJ2 A; 2KRM A; 3EG1 A; 1X27 A; 5IHI A; 1AEY A; 3SHW A; 2GTJ A; 4FSS A; 2FRW A; 2RQV A; 3LH5 A; 1Z9Z A; 2LJ1 A; 2EYY A; 3SEM A; 3M0S A; 3I5S A; 1MUZ A; 4OMP A; 3EG0 A; 2YSQ A; 1A0N B; 4E6R A; 2AK5 A; 2KXD A; 1GCP A; 2HBW A; 1FYN A; 2FG0 A; 4LE9 A; 1Z9Q A; 1OPL A; 1U06 A; 2DF6 A; 2EYZ A; 2O2O A; 1YWP A; 1TG0 A; 1M30 A; 1BU1 A; 2D8J A; 3PVQ A; 1ZUY A; 1WLP B; 1TUD A; 1YP5 A; 1GBQ A; 2LJ3 A; 2I0N A; 2NWM A; 2EVR A; 1Y57 A; 1UG1 A; 2W10 A; 2L3Q A; 4JJC A; 3QWX X; 2J06 A; 2OAW A; 2H8H A; 5L23 A; 2ROT A; 2JXB A; 4D8D A; 2SRC A; 1KFZ A; 1MV3 A; 2W0Z A; 4CC2 A; 2KRN A; 1Y0M A; 1QWF A; 2JM8 A; 1RLP C; 1X6G A; 2JS0 A; 2O31 A; 3NMZ C; 2EKH A; 4J9B A; 4GLM A; 1AVZ C; 2JTE A; 2ABL A; 1UHC A; 4WCI A; 1UTI A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3VV0 A; 1KQS P; 5FRN A; 3JB9 I; 2D6F A; 4IUR A; 1EZZ B; 1LPL A; 2X3X D; 2L3P A; 1YIT T; 4FYX B; 2M1H A; 2DRM A; 3CBM A; 1R8O B; 5DY9 A; 3CCS Q; 4M75 F; 3PTA A; 3O5Z A; 1SF9 A; 3G6E A; 1GRI A; 1WGS A; 2EJG A; 2QAZ A; 4CC3 A; 4F7U G; 2L3S A; 3S3M A; 2ZPG B; 1Q7Y C; 1VA7 A; 3CCU T; 3C0C A; 1WJS A; 2YWW A; 4C0Z A; 4C5H A; 1GBR A; 2JS2 A; 2K57 A; 3I9Q A; 2DL4 A; 2DVJ A; 1U5S A; 4E2F B; 1NEB A; 4IIM A; 2BE7 D; 1K9M C; 2A36 A; 2YRC A; 1OU9 A; 2CP0 A; 1H8K A; 4OMM A; 3HHT B; 1X6B A; 5HK0 A; 4M78 D; 4KBM B; 4LD9 K; 2ZAE A; 4AFU C; 2LT4 A; 4L5G A; 1WXT A; 2J6F A; 2KI7 A; 3C12 A; 3E19 A; 5AYF A; 1AHJ B; 1IO6 A; 3RDV A; 3FEO A; 2LRQ A; 2O4X B; 2XDD A; 3CPW S; 2KRO A; 1JXM A; 1K73 U; 3CCL A; 2DMO A; 5GAO p; 2X4X A; 1BBZ A; 3JRZ A; 3QSU A; 2F2V A; 3VS2 A; 1WJQ A; 4M75 D; 1GCQ C; 2RQT A; 2ZPB B; 3OYA A; 1Y71 A; 1OPK A; 2EQU A; 1KD1 U; 2DLP A; 5KYN A; 2OTJ A; 1RI9 A; 1VQ4 Q; 2FB7 A; 4N4H A; 5IT9 E; 1M3A A; 4QT7 A; 3CCV Q; 4E7S A; 2LT1 A; 2JM9 A; 5A0G A; 4LDY A; 3CC2 A; 2L89 A; 5IXF A; 3FLG A; 1N8R R; 2KVQ G; 4PJJ A; 5D6X A; 4B6M A; 5GAO l; 2QEX Q; 3VJP A; 2BKD N; 1VQO T; 1NLO C; 1MMN A; 1WIE A; 4N0A A; 1RAC B; 3QYG B; 1G3W A; 4JJN K; 3QXE B; 4ANJ A; 3ULR B; 4PJO A; 4FYV B; 4OF1 A; 1TTH B; 4IUT A; 2YRV A; 1VQ5 T; 4J9I A; 2DVE A; 5IN1 A; 1Q81 R; 4PKC C; 2K3Y A; 2EGE A; 2CP3 A; 3NHN A; 4M75 C; 5LJ3 h; 3VS4 A; 4LNP A; 3EGD B; 1VQ8 A; 3X26 B; 2KMT A; 3JB9 D; 1Y7X A; 1UUE A; 4KUL A; 3GP8 A; 4ATO A; 1AD5 A; 3OS2 A; 3CCE A; 4OML A; 4LDX A; 2QA4 A; 1RAI B; 3GF5 A; 4C92 G; 3I55 T; 1NJI C; 2RA2 A; 2G6F X; 2D0Q B; 4J6Y A; 3JCM V; 1FX7 A; 4RTY A; 3EFO A; 1VQ6 T; 3VRY A; 3CCQ T; 2QGF B; 2J05 A; 2M0Y A; 3CME Q; 1N6A A; 5FWB A; 3CCU Q; 3SB2 A; 2HQX A; 4MML A; 1QCN A; 4F17 A; 1IRX A; 1WXB A; 2R5A A; 2M02 A; 3M0T A; 4N4G A; 1AWW A; 3CCR Q; 2OAU A; 5CVI A; 1BKB A; 5IAY A; 1RL2 A; 1JXO A; 1PWT A; 3CD6 A; 4BE0 A; 1Q81 C; 2YUP A; 4AMC A; 1NEG A; 3DKM A; 4XTU A; 2F5T X; 2LQK A; 3A8H B; 1VQL A; 1OU8 A; 1OQK A; 3SWN C; 1SHF A; 4RTV A; 3GOX A; 2J6O A; 2MWO A; 2L5Q A; 4K11 A; 2JN0 A; 3OYY A; 1YJN A; 4QQ6 A; 8ATC B; 1QKW A; 3OW2 S; 3DB4 A; 4LDW A; 2E4H A; 4D8K A; 4VUB A; 2YRD A; 3OA6 A; 3VS5 A; 5I21 A; 3TSZ A; 4DBH A; 5I11 A; 2DD4 A; 5A0D A; 1YHQ Q; 1PCX A; 2F2X A; 2LVM A; 3I56 A; 3QUI A; 4X9D A; 3PIO A; 1V1C A; 5GAN 4; 1ZSZ C; 2M51 A; 4AG1 C; 2MIO A; 2PVG B; 4F14 A; 3CCM A; 2AZV A; 1QKX A; 3JV3 A; 5KE2 A; 1WPY A; 2O01 E; 2XG8 D; 3M59 A; 5IHK A; 1AT1 B; 1UGQ B; 1SG5 A; 2X4J A; 2ZPH B; 2O4X A; 1H3H A; 1KHC A; 1QW1 A; 4FSX A; 1WNL A; 5FU6 C; 2BTT A; 2D1X A; 3HFN A; 5IHN A; 3CC7 Q; 1MMG A; 1JU5 C; 1HYO A; 2BZ8 A; 5CQX A; 1KQ1 A; 3X24 B; 2HL3 A; 3VS3 A; 5CCA A; 5GAN 5; 2DM1 A; 2COY A; 4XU2 A; 2EQI A; 4IIO A; 3E9G A; 3RNJ A; 2DA9 A; 2SEM A; 1W1F A; 3CCV A; 5LJ5 g; 3BDL A; 5CKF A; 4HCB A; 1IGQ A; 3EHQ A; 2DO3 A; 4F16 A; 1VQM Q; 2XK0 A; 1VQ6 Q; 2DL7 A; 4IKF A; 3PE0 A; 3JCM P; 2VVK A; 3THK A; 3ER0 A; 3A98 A; 2ZPE B; 4C0G A; 4QVC A; 4PJO F; 1AWX A; 4C0D B; 3CXC P; 1Q86 R; 4EMK C; 4A63 B; 2C0I A; 2PUO B; 4J9C A; 5LJ3 e; 2B8A A; 2AKL A; 4DBQ A; 2HD0 A; 1LNX A; 2JVV A; 4KT0 E; 4EPC A; 3S3N A; 2EQM A; 3E2U A; 1IXD A; 2DIL A; 3EG3 A; 4LN2 A; 3V8K A; 3EGD A; 3LX7 A; 2V8J A; 1YJ9 T; 1HXD A; 1YIJ T; 3N5B B; 1NLP C; 2IPO B; 3AHU A; 4KGX B; 3HL8 A; 1SRM A; 1M5Q 1; 3VS0 A; 5GMK j; 2PQW A; 1WHH A; 3CPF A; 5L8R E; 2KE9 A; 1YN8 A; 1Q82 C; 3QO3 A; 4JPB W; 3JCM d; 1JJ2 P; 2G3R A; 1B7T A; 4Y92 A; 3CBP A; 2RNA A; 2XD0 A; 3CCU A; 2DIG A; 1RAH B; 1UEC A; 3S6W A; 3BFM A; 2F69 A; 2JTM A; 2MPX C; 3A8O B; 3RMS A; 1D1A A; 5D6Y A; 1QVF A; 4LUE A; 4JS4 A; 3L1A A; 3FDR A; 2X51 A; 2NLU A; 3EG1 A; 2DK3 A; 1AEY A; 1XTD A; 1K8A U; 1VQ9 Q; 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3UF4 A; 4CC7 A; 4M4Z A; 3LGF A; 3TSW A; 4BI3 A; 1JJ2 A; 3OMG A; 3SFM A; 2NUT B; 3X28 B; 2QQB A; 4PLI A; 3OYB A; 1ABQ A; 3VYH B; 5D7U A; 3VU3 C; 2ENM A; 5I2M A; 4BAC A; 1OZ2 A; 4X34 A; 3OYD A; 4M7D E; 3RIR A; 1M3B A; 2RN8 A; 4C5G A; 3V8J A; 4M7A E; 2GF7 A; 2DXU A; 3QBY A; 1FMK A; 1G3S A; 2FZC B; 3CC4 Q; 4RTT A; 3CQT A; 2FRY A; 1BI1 A; 1B07 A; 2LZ6 B; 2MMP A; 1VQ8 Q; 2EJF A; 3C95 A; 3MJX A; 1AZE A; 3ZL7 C; 1C6V X; 5GAM g; 1GFC A; 1V76 A; 2XHC A; 3CCE Q; 1WJR A; 3HP9 A; 3M58 A; 2FZK B; 2LQN A; 5LL6 S; 5FU7 B; 4C8Q B; 1ZLM A; 4M77 G; 3OW2 P; 5LJ5 d; 2QDY B; 1I0C A; 1W70 A; 4ORZ A; 4LDV A; 2DBK A; 1UB4 A; 1KC8 C; 4E47 A; 1IB8 A; 1TSF A; 1D3B B; 1WI7 A; 4M78 F; 1TOV A; 1H64 1; 2CP5 A; 4Z02 A; 5GAN 8; 1VQ9 A; 2LCC A; 2ED1 A; 3NFC A; 1ZUK A; 4L59 A; 3M55 A; 2H3E B; 1OZ3 A; 1VUB A; 4KRT A; 2V8I A; 2E1H A; 4J83 A; 3X20 B; 1RAB B; 4IUU A; 4OB2 B; 1X69 A; 3CD6 Q; 1SSH A; 1NJI U; 3M57 A; 3H6Z A; 1S72 A; 2ESW A; 5FLX E; 1VQL Q; 2LDM A; 1T3S A; 2P84 A; 1N5Z A; 3EGU A; 3D7S B; 4IUV A; 2FO0 A; 4AG2 C; 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