The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
9
|
sequence length |
69
|
structure length |
69
|
Chain Sequence |
b'GSSGSSGGEEYIALYPYSSVEPGDLTFTEGEEILVTQKDGEWWTGSIGDRSGIFPSNYVKPKDSGPSSG'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution Structure of the third SH3 domain of human intersectin 2(KIAA1256)
rcsb |
| molecule keywords |
INTERSECTIN 2
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| total genus |
9
|
| structure length |
69
|
| sequence length |
69
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-07-03 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2DL3 A; 2YT6 A; 4RTX A; 2RQR A; 1VYU A; 2KYM A; 2EW3 A; 1X43 A; 3TVT A; 4D8K A; 3H0I A; 3VS2 A; 1NLO C; 2LX7 A; 1UUE A; 4RTU A; 2LQW A; 1I1J A; 3CQT A; 1UE9 A; 2DVJ A; 4A63 B; 4F14 A; 2V1R A; 1M8M A; 4LN2 A; 1GCQ C; 2JTE A; 2C0T A; 1I0C A; 1QKW A; 1QKX A; 1RLQ C; 2EGA A; 4AFQ C; 3PVL A; 1WFW A; 2DL7 A; 2BZY A; 1YP5 A; 4CC4 B; 1BK2 A; 1GL5 A; 1JO8 A; 2IIM A; 5IXB A; 4R0K A; 5FW9 A; 1RLP C; 1GCP A; 4CC7 A; 2JMC A; 2JMA A; 3M0P A; 1OEB A; 4F17 A; 3H0F A; 3VRZ A; 3M0S A; 1J3T A; 3EG2 A; 3O5Z A; 1SHF A; 1TUD A; 2AZS A; 4JZ4 A; 3I35 A; 1W1F A; 1PKT A; 1G83 A; 2J6O A; 2GNC A; 1KFZ A; 2YUO A; 4JZ3 A; 2O9V A; 1M3A A; 1NYG A; 1ZUK A; 1GBR A; 3NMZ C; 1FMK A; 1NEG A; 2P4R A; 2DLP A; 2J05 A; 1UHC A; 2L0A A; 2K79 A; 2AKK A; 2YSQ A; 2K6D A; 4J9G A; 2DJQ A; 4QT7 A; 1NM7 A; 4FSS A; 3VS1 A; 2EPD A; 2RQV A; 2YUQ A; 1OPL A; 5IHK A; 2C0O A; 1NYF A; 4GLM A; 2CUD A; 2K7A A; 1K1Z A; 4AFS C; 2HBW A; 4Z89 A; 1BU1 A; 1YWO A; 2W10 A; 2HSP A; 2J06 A; 2PNI A; 5GJV B; 1MV0 B; 2CDT A; 1UEC A; 2CSQ A; 1KJW A; 2L3P A; 4X1V A; 2CRE A; 2JM9 A; 2KR3 A; 1VA7 A; 2GBQ A; 4JJC A; 2KE9 A; 4RTT A; 2LZ6 B; 1AZG B; 1QCF A; 2FPF A; 2SRC A; 1ABO A; 2BZX A; 2XMF A; 3EG0 A; 1PKS A; 2FPD A; 2YUN A; 4IIO A; 4OMN A; 2NUZ A; 1BB9 A; 1GBQ A; 2KT1 A; 1SRM A; 5L23 A; 3VS7 A; 1FYN A; 2O2O A; 2EQI A; 3UAT A; 2EVR A; 2KRS A; 2DYB A; 1CKB A; 1X2K A; 4J9C A; 5I22 A; 1U06 A; 2HEQ A; 3PE0 A; 1B3Q A; 4OML A; 1SEM A; 1X6B A; 5GJW B; 3H0H A; 1OOT A; 3I9Q A; 1YCS B; 1UJY A; 2ESW A; 1WI7 A; 2J6K A; 2AKL A; 4K11 A; 4F16 A; 1YWP A; 2KRN A; 1U5S A; 2I0N A; 2EYY A; 2DE0 X; 3VRY A; 4HCK A; 3SHW A; 4RUG A; 2GGR A; 2LP5 A; 4RTZ A; 2DBM A; 2FG0 A; 2EGC A; 1AVZ C; 3U23 A; 1ZX6 A; 2FRW A; 1W70 A; 4CC3 A; 1ZSG A; 2L3S A; 3QWY A; 3PVQ A; 5EC7 A; 2AK5 A; 1G2B A; 3UF4 A; 3C0C A; 4WCI A; 3NGP A; 1H3H A; 4GBQ A; 4JJB A; 4OMO A; 2FO0 A; 1M3B A; 2LJ1 A; 2RNA A; 1K76 A; 1UDL A; 2YUP A; 1QWF A; 1CKA A; 4LUD A; 2CH4 A; 4HVW A; 2G6F X; 2DA9 A; 4J9F A; 3H41 A; 1JXO A; 1MV3 A; 1VYT A; 2KRO A; 2W0Z A; 1H8K A; 1WLP B; 2DNU A; 2M0Y A; 3GBQ A; 2KXC A; 3VS5 A; 2DL5 A; 1TG0 A; 1HD3 A; 2ABL A; 3REB B; 1T0H A; 1VYV A; 2MOX A; 4LE9 A; 2J6F A; 3FJ5 A; 1NG2 A; 4LUE A; 1GFD A; 1SHG A; 4M4Z A; 1UG1 A; 1UJ0 A; 2ECZ A; 4J9D A; 4LNP A; 4Z88 A; 2DF6 A; 2ROL A; 1AWJ A; 2LNH B; 1U3O A; 2J7I A; 2K3B A; 3EG1 A; 4RTW A; 4OMM A; 1A0N B; 4AG1 C; 2GTJ A; 1SPK A; 2D0N A; 5IHI A; 2JT4 A; 5IXF A; 1AWW A; 1AWO A; 4KRT A; 3M0T A; 2RQU A; 4J9E A; 2EYW A; 2GTO A; 1Z9Q A; 2CH4 W; 2DL8 A; 1JEG A; 1SRL A; 1WXB A; 3EG3 A; 1M3C A; 2BTT A; 4J9B A; 2KXD A; 2A08 A; 2NWM A; 2O31 A; 1JQQ A; 1AZE A; 2SEM A; 1T3S A; 1M30 A; 1OPK A; 2A37 A; 2DBK A; 1ZUU A; 1ZUY A; 2FEI A; 2DRK A; 4E6R A; 1UHF A; 2KNB B; 2YDL A; 2OJ2 A; 2L2P A; 2ENM A; 1YN8 A; 1UTI A; 2FPE A; 4RTY A; 1PHT A; 1UGV A; 1Z9Z A; 1Y57 A; 1KSW A; 2CT3 A; 3TSW A; 1GFC A; 2AZV A; 3I5R A; 3THK A; 3EGU A; 2QDL A; 2MCN A; 1E6H A; 4J9H A; 1X6G A; 3UA7 A; 1K0S A; 1H92 A; 2D8H A; 2ED1 A; 4HVV A; 5HCK A; 1ZBJ A; 5FWC A; 2RN8 A; 1LCK A; 1E6G A; 3EHR A; 2F2X A; 2LMJ A; 1BBZ A; 1X2Q A; 5IH2 A; 2F2W A; 4AFZ C; 2JS2 A; 1QWE A; 2EBP A; 2VKN A; 2EKH A; 1HJD A; 4HXJ A; 4ESR A; 4OMQ A; 2JW4 A; 2LQN A; 3IQL A; 4IIM A; 1X69 A; 2JS0 A; 1K0X A; 2O9S A; 1V1C A; 2BZ8 A; 1B07 A; 4Y92 A; 1QLY A; 2LJ0 A; 3R6N A; 2X3W D; 1WX6 A; 2LCS A; 2CT4 A; 1GRI A; 2A28 A; 2DIL A; 3REA B; 1RUW A; 5ECA A; 2JXB A; 1WDX A; 2KT8 A; 5IHN A; 1AD5 A; 1WA7 A; 2KEA A; 2CSI A; 3I5S A; 4DEY A; 1M27 C; 1Y0M A; 2RMO A; 2RPN A; 1PRL C; 3NHN A; 3VS3 A; 3M0R A; 3LH5 A; 3A98 A; 2C0I A; 2GQI A; 1YNZ A; 3VS0 A; 2DM1 A; 3EHQ A; 3ZL7 C; 1CSK A; 1PRM C; 2EYX A; 1OV3 A; 2DL4 A; 1AWX A; 3KFV A; 1AEY A; 3QWX X; 2EGE A; 1TUC A; 1ABQ A; 1S1N A; 3SEM A; 1UFF A; 1WXT A; 2OAW A; 1ARK A; 5I11 A; 5FWB A; 2DRM A; 1MUZ A; 2ED0 A; 1E7O A; 2H8H A; 1X27 A; 2M51 A; 4D8D A; 2K9G A; 1N5Z A; 4Z8A A; 4JPB W; 4RTV A; 1HSQ A; 1K4U S; 4J9I A; 2K2M A; 2X3X D; 1NEB A; 2HCK A; 2EYZ A; 2RQT A; 2KGT A; 1I07 A; 3RBB B; 4CC2 A; 1K9A A; 1SSH A; 1WYX A; 4JJD A; 2VVK A; 3VS4 A; 2JM8 A; 2KRM A; 1WIE A; 2RF0 A; 1EFN A; 1PWT A; 2KYB A; 1IO6 A; 2FRY A; 1JXM A; 1NLP C; 1T3L A; 4AG2 C; 2PTK A; 2V1Q A; 1WXU A; 2O88 A; 1T0J A; 2LJ3 A; 3JV3 A; 3ULR B; 3NPF A; 1JU5 C; 2ROT A; 2D1X A; 2D8J A; 2RQW A; 4OMP A; 1GCQ A; 2OI3 A; 2B86 A; 3VS6 A; 2MIO A; 1KIK A; 3TSZ A; 4EIK A; 1XOV A; 4ZNX A; 2VWF A; 2KBT A; 4ORZ A; 1AOJ A; 2F2V A; 2DMO A; 3UA6 A; 4AFU C; 1PNJ A; 2E5K A; 1W6X A; 4DEX A; 1ZLM A; 2A36 A; 3M0U A; 2L3Q A; 1RI9 A; 4HVU A; 2CUB A; 3RNJ A; 2DX1 A; 2HDA A; 3M0Q A; 2PZ1 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1PD1 A; 2DL3 A; 1VQO A; 2RQR A; 1VYU A; 3QG1 A; 4BB7 A; 1R8O B; 1ZHI A; 2YLC A; 1N8R C; 1VOM A; 2OTL Q; 1QVG S; 1R0B G; 2K3X A; 3VS2 A; 4PK4 A; 1M1F A; 1UUE A; 4RTU A; 4A63 B; 1I1J A; 4E7L A; 2DVJ A; 3M53 A; 1M8M A; 3LYI A; 4LN2 A; 4MDX A; 3CCJ A; 1YJW T; 4L5G A; 5CKE A; 1QW1 A; 5I2S A; 3M9Q A; 2EGA A; 4J83 A; 1WFW A; 4CC4 B; 1VQN A; 4AT1 B; 2DZ9 A; 3SB2 A; 5KYW A; 4E7K A; 5GAM f; 4BD3 A; 1RI0 A; 2VB6 A; 1Q7Y R; 2O4X A; 2JMA A; 3M0P A; 2NLU A; 1OEB A; 2V26 A; 3H0F A; 1X01 A; 5EG2 A; 3QUI A; 1JJ2 S; 3X25 B; 3S6W A; 4PJJ A; 1SHF A; 4JZ4 A; 1AT1 B; 2PUK B; 3I56 A; 1RL2 A; 1B7T A; 1M4Z A; 2KMT A; 4ELY C; 2HKN A; 3QBY A; 2F5K A; 1OZ3 A; 1RAG B; 2YSQ A; 2JN0 A; 4J9G A; 3GLX A; 2DJQ A; 5D6Y A; 3ZEH A; 4FSS A; 4M75 F; 1W2B P; 3CC4 A; 1OPL A; 2FHD A; 1NYF A; 4AFS C; 1TTH B; 1U8R A; 3M4G A; 5J3B A; 1BU1 A; 2W10 A; 2J06 A; 5GMK j; 1Q81 U; 1N27 A; 4YTL A; 2RH2 A; 1Q86 U; 2JM9 A; 1OZ2 A; 2KR3 A; 4ZTJ A; 4M77 F; 2ZPH B; 2IVW A; 3A8L B; 2BZX A; 1YI2 Q; 2XMF A; 2LQ8 A; 1KHI A; 2MPX C; 2EIF A; 4FYV B; 2KT1 A; 5L23 A; 3VS7 A; 3QXE B; 4PJO F; 1Q86 R; 2NUP B; 1WQ7 A; 2O2O A; 3OYB A; 4JLI A; 3UAT A; 4M7D E; 2DD4 A; 3OW2 P; 5J26 A; 4C92 A; 4KBM B; 3M56 A; 2QTX A; 2HEQ A; 3J7A F; 4IUV A; 4OML A; 2E1H A; 2QA4 A; 3GIB A; 2PQW A; 3H0H A; 2RHI A; 2DTO A; 5KYU A; 1YCS B; 1MNE A; 4C92 B; 3CCM Q; 4PJO B; 4R55 A; 4JDS A; 4ZGJ B; 2KRN A; 3FRN A; 3RIR A; 1RAA B; 2DE0 X; 3QZ5 B; 2DIQ A; 3BFM A; 3SHW A; 1M2O A; 3CCL T; 1VQ7 A; 4XTY A; 4DQ2 A; 4RTZ A; 1AVZ C; 3CME Q; 2FRW A; 4CC3 A; 4C0F A; 2PVG B; 3LLR A; 3PVQ A; 4N0A C; 2I2L A; 5GAM h; 4KH0 B; 3KUF A; 2XDD A; 1LNX A; 3C0C A; 1KK7 A; 5KYN A; 4WTO B; 3J80 E; 4IUT A; 3V8L A; 2FO0 A; 2LJ1 A; 4XTU A; 2RNA A; 1WHK A; 4LUD A; 1D3B B; 1D09 B; 1AHJ B; 3H41 A; 3CCV T; 1VYT A; 2XI9 A; 1VQ4 Q; 2W0Z A; 3CC2 Q; 2M0Y A; 4M78 F; 1BIB A; 3CC7 T; 1PCX A; 3O8V A; 3VS5 A; 2ATC B; 1UGQ B; 1VYV A; 4LE9 A; 2J6F A; 1NG2 A; 1N6A A; 4LUE A; 2YXY A; 3A8O B; 4M4Z A; 1ZSZ A; 3SD4 A; 1W2B A; 1M2V A; 2ZPB B; 4BDY A; 5FU6 B; 4Z88 A; 1D0Y A; 4GY5 A; 1Q7Y C; 1DJ7 B; 2HMA A; 4C0D C; 1AWJ A; 2LNH B; 1U3O A; 1RAE B; 3HRT A; 3EG1 A; 2RI2 A; 3RKW A; 1RAC B; 1M2V B; 1SPK A; 3LX7 A; 3PT9 A; 1IB8 A; 4BI3 A; 5IHI A; 4NS5 A; 2RI5 A; 3M0T A; 3A8G B; 4J9E A; 2HZY A; 3PTA A; 1X6O A; 3G7Z A; 1Z9Q A; 1WXB A; 5CVI A; 2SEM A; 1KQ1 A; 3OS1 A; 4VUB A; 4BI4 A; 4FL6 A; 3OW2 A; 2K5L A; 4M75 D; 4XTX A; 4M7A E; 3ER0 A; 2EFI A; 5GAN 3; 4RTY A; 4PLI A; 4ZN3 A; 1VQM A; 4QVD A; 2CS7 A; 3MP6 A; 1KSW A; 3KXT A; 3G71 T; 2AZV A; 1YIJ Q; 2D0Q B; 3JSC A; 4M7D G; 3EGU A; 4L6V 5; 4M7D C; 1E6H A; 1Y96 B; 3QKJ A; 4HVV A; 5CAI A; 1YJ9 A; 2HQX A; 4M77 D; 1VQ5 A; 1X2Q A; 2AHJ B; 3CCR Q; 2QEX A; 5HK3 A; 4RCC A; 5IH2 A; 2F2W A; 1VQL Q; 2JS2 A; 3CCE Q; 2EBP A; 3G6E Q; 2VKN A; 2EKH A; 3PNW C; 2X4Y A; 4PJO D; 4MZT A; 2MMP A; 4XU2 A; 1Q86 C; 2LQN A; 2OTJ T; 1BYM A; 3A8M B; 4IIM A; 7AT1 B; 1QMC A; 3EGD B; 3P8H A; 5AT1 B; 1K0X A; 2O9S A; 2BZ8 A; 1B07 A; 1P92 A; 3R6N A; 3JCM J; 1XJW B; 1YJW A; 4A4K A; 2KY9 A; 5ECA A; 4DOV A; 1AD5 A; 2KDS A; 5FU7 B; 4BE0 A; 5KYX A; 2XID A; 3NHN A; 3M55 A; 1O9S A; 2GQI A; 1UB4 A; 3NTK A; 3VS0 A; 3EHQ A; 4ELZ C; 3I55 T; 1CSK A; 1WHM A; 4MMK A; 3KFV A; 1AWX A; 1AEY A; 3QWX X; 3QO3 A; 1JB0 E; 1TUC A; 1ABQ A; 2V8J A; 5GAN d; 3GP8 A; 3SEM A; 3CD6 Q; 1UFF A; 3P8D A; 3ASK A; 5I11 A; 2E64 A; 3QYG B; 1MUZ A; 4JUV A; 1VIF A; 1Y71 A; 3M54 A; 1S72 Q; 2E5Q A; 4C5E A; 4M78 D; 2OTL T; 5GAN 6; 4J9I A; 1NEB A; 4II1 A; 1WZO A; 1VQP Q; 1JRI A; 3HTR A; 2L5Q A; 2JM8 A; 3QSU A; 4C8Q G; 4C8Q C; 1WIE A; 2X4X A; 1IHV A; 1M90 R; 2A3L A; 2IPO B; 1JXM A; 1NLP C; 3H9N A; 1K8A R; 2XD0 A; 4JS5 A; 5IN1 A; 3JB9 F; 4M7A G; 4M7A C; 3OYK A; 3JCM V; 3NPF A; 4A53 A; 3JB9 I; 1FX7 A; 2H3J A; 2DZC A; 3OY9 A; 2LDM A; 5A0G A; 2WAC A; 2KBT A; 2DPP B; 2F2V A; 3UA6 A; 4AFU C; 1PNJ A; 1ZLM A; 3S3N A; 2QQ9 A; 4JS4 A; 2L3Q A; 4LDV A; 1N9R A; 4LXC A; 4RTX A; 4ATO A; 1Q82 U; 2KYM A; 2EW3 A; 4DBF A; 3CCL A; 2EQJ A; 1V76 A; 3TVT A; 1NLO C; 3MCA B; 5GAO p; 2CP0 A; 2LQW A; 2V8I A; 1MMN A; 1I4K 1; 5GAO r; 4EMK B; 3LGL A; 4OGE A; 1Q82 R; 2JTE A; 4C92 E; 2ZGW A; 2C0T A; 4PJO E; 2CZ1 B; 1RLQ C; 1U1S A; 2BZY A; 1QVF S; 2YLB A; 3JRZ A; 2DTH A; 1GL5 A; 1ZA2 B; 3M4Y A; 2IIM A; 3MEA A; 2KI7 A; 4R0K A; 1K9M R; 4CC7 A; 2JMC A; 2K3Y A; 3OYE A; 5LJ5 f; 4F17 A; 3CCV A; 4A4G A; 1LPL A; 3CCU Q; 3O5Z A; 4ME7 A; 3CC7 A; 2RD1 A; 1WHG A; 1G3T A; 5HK0 A; 2J6O A; 2GNC A; 1KFZ A; 4DA4 A; 1NYG A; 1GBR A; 4V2S A; 4Q5W A; 2DLP A; 2K4Y A; 2DTI A; 2RK2 A; 3X20 B; 3OYA A; 5CCA A; 4PJM A; 3OYI A; 2AKK A; 3CCM T; 3CCS Q; 3RKX A; 3OS2 A; 2JTF A; 6AT1 B; 3Q1J A; 3SFM A; 4FW2 A; 4DOW A; 3VUB A; 2EPD A; 2YUQ A; 2HQH A; 3HKS A; 3RUX A; 3OMG A; 3QII A; 5KCO A; 5LJ3 f; 4LDU A; 4F7U F; 3J81 E; 2K7A A; 2HBW A; 3EFO A; 3DLM A; 4UC4 A; 4Z89 A; 4RMO A; 3OSV A; 2P0Q A; 2HSP A; 3G1J A; 1TUG B; 1W4S A; 2CDT A; 3MO8 A; 2L3P A; 1B34 B; 3VV0 A; 1VA7 A; 3MEU A; 1FMV A; 2EKO A; 4JJC A; 2KE9 A; 3CCJ Q; 2LZ6 B; 1AZG B; 4OP0 A; 2FPF A; 2JVV A; 4IIO A; 4OMN A; 1VQN Q; 2NUZ A; 1VQ4 T; 3CC2 T; 1MMA A; 1SRM A; 2MI6 A; 3NFC A; 3FIF A; 2HNI A; 1FYN A; 2P4T A; 2RJC A; 3L2W A; 5A0D A; 3G4S Q; 3G71 A; 1CKB A; 3INZ A; 4XQ3 A; 4PFO A; 5I22 A; 1SEM A; 1YHQ Q; 3CCQ Q; 2YRD A; 2OX7 A; 5GJW B; 3I9Q A; 1K8A C; 4DBH A; 2ESW A; 2AKL A; 4K11 A; 1YWP A; 5GMK e; 4ANJ A; 2I0N A; 2EYY A; 2BE7 D; 3KBG A; 3OYY A; 3JB9 D; 3CEY A; 2EQU A; 4HCK A; 2OTJ A; 2LP5 A; 2PUO B; 3UWN A; 2DBM A; 5D6W A; 3FDR A; 1V29 B; 2E4H A; 1YJN A; 2CP3 A; 1KC8 U; 3FJP A; 5EC7 A; 5GAM d; 2XKO C; 2M16 A; 3SDZ A; 5LJ5 h; 4C92 G; 4C92 C; 1M1K U; 1NZ9 A; 2DKG A; 2X4W A; 1K76 A; 4HVW A; 2DA9 A; 5CIU A; 4D6W A; 4J9F A; 3JCM P; 1MV3 A; 2ZPF B; 3JAM E; 3OYG A; 1VQ8 Q; 2DNU A; 4B9X A; 3L1A A; 2DYI A; 1KG1 A; 4IUR A; 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