The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
8
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sequence length |
60
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structure length |
60
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Chain Sequence |
b'CGAEYVRALFDFNGNDEEDLPFKKGDILRIRDKPEEQWWNAEDSEGKRGMIPVPYVEKYG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Proto-oncogene C-crk
|
| publication title |
Changing protein backbone topology: Structural and dynamic consequences of the backbone cyclization in SH3 domain
rcsb |
| source organism |
Mus musculus
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| molecule tags |
Protein binding
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| total genus |
8
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| structure length |
60
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| sequence length |
60
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-06-27 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2L2P A; 3VS7 A; 4AFZ C; 4CC4 B; 1K76 A; 2BZY A; 1QLY A; 2O9V A; 3REA B; 4LNP A; 2YUQ A; 5GJW B; 2CUD A; 4RTX A; 2A36 A; 4AG2 C; 2AKK A; 2RQR A; 2PTK A; 1W6X A; 2KXD A; 2A08 A; 2DJQ A; 2ED1 A; 1CKB A; 2O88 A; 4HVW A; 5IXF A; 2CRE A; 2KR3 A; 2J6O A; 2L0A A; 4J9I A; 2O9S A; 1PNJ A; 2HCK A; 4CC7 A; 3PE0 A; 1AZE A; 2EYZ A; 2L3Q A; 2C0I A; 1M3B A; 1RI9 A; 2JS2 A; 4A63 B; 1ZUK A; 3LH5 A; 1V1C A; 3QWX X; 2K3B A; 2J06 A; 2AKL A; 1OEB A; 1ZBJ A; 1ZLM A; 1NEG A; 1AVZ C; 1U5S A; 1YCS B; 4D8D A; 2DBK A; 2VVK A; 1HD3 A; 1T3L A; 1VYU A; 1KIK A; 4OML A; 4K11 A; 2FPE A; 3VS1 A; 2DL4 A; 1E6G A; 4AFS C; 2SEM A; 2DIL A; 3NMZ C; 1UJ0 A; 2K6D A; 2EPD A; 1GBR A; 2DRK A; 4HVU A; 3VRZ A; 4J9G A; 3H41 A; 2FPD A; 2QDL A; 1I0C A; 2DX1 A; 4RTZ A; 1SSH A; 4JZ3 A; 3RBB B; 4JJB A; 2P4R A; 4AFU C; 2K2M A; 2HDA A; 2KE9 A; 1ZUY A; 1JQQ A; 2M0Y A; 2OAW A; 2EGC A; 1M3C A; 2CT4 A; 2DRM A; 3SEM A; 1GCQ A; 4RTV A; 1SEM A; 4JJC A; 3NPF A; 1K9A A; 4LN2 A; 2MOX A; 4RUG A; 2J7I A; 3VS5 A; 1UE9 A; 2RQW A; 2D8J A; 1SHF A; 1WXU A; 3ULR B; 4J9B A; 4DEY A; 2O2O A; 1WIE A; 2DA9 A; 2EW3 A; 2JTE A; 2KRO A; 3PVL A; 1M3A A; 3M0R A; 2RQT A; 4RTW A; 1U3O A; 1AWO A; 2KT1 A; 1UFF A; 2KRS A; 2GTO A; 2LX7 A; 3RNJ A; 5GJV B; 1QWF A; 3H0H A; 2DL7 A; 3H0I A; 3PVQ A; 3EG0 A; 2LQW A; 1OOT A; 2W10 A; 2ED0 A; 2DMO A; 4ORZ A; 5FWC A; 1YN8 A; 1I07 A; 2YUN A; 3M0Q A; 1IO6 A; 2EQI A; 2V1R A; 1WDX A; 4HXJ A; 5IHN A; 3VS0 A; 4KRT A; 2NUZ A; 2BZX A; 2F2V A; 2DYB A; 2LJ1 A; 2A37 A; 1WX6 A; 2W0Z A; 1PRL C; 1QCF A; 4JPB W; 2JW4 A; 2CSQ A; 4HVV A; 4RTU A; 1OPL A; 2GGR A; 1TUC A; 1SPK A; 1WFW A; 1GCP A; 2G6F X; 1UG1 A; 2GBQ A; 2SRC A; 4X1V A; 1JXO A; 1VA7 A; 3U23 A; 1AD5 A; 1G83 A; 2L3S A; 2OI3 A; 1H8K A; 1NG2 A; 2MIO A; 1WLP B; 2DL5 A; 1JO8 A; 2YUO A; 2EKH A; 1A0N B; 2CUB A; 1LCK A; 2FRW A; 2FEI A; 4FSS A; 3NGP A; 2CDT A; 4F16 A; 2CH4 A; 2CT3 A; 2YUP A; 4F17 A; 1N5Z A; 2AZS A; 1BB9 A; 2H8H A; 5FW9 A; 1FMK A; 1NLO C; 3EG2 A; 2JT4 A; 2RQU A; 3EHQ A; 5L23 A; 3I5S A; 4Z88 A; 2GTJ A; 2E5K A; 1YWP A; 4LUD A; 1Y57 A; 1QWE A; 1KFZ A; 2LZ6 B; 2HSP A; 2JXB A; 4Z8A A; 1GRI A; 3VS4 A; 1TG0 A; 2KYB A; 5ECA A; 4F14 A; 1SHG A; 2KBT A; 4ZNX A; 1UEC A; 3H0F A; 1X43 A; 2EYX A; 3I5R A; 2DLP A; 2I0N A; 2J6K A; 2RN8 A; 1X27 A; 1M27 C; 2RNA A; 3M0U A; 3THK A; 2X3W D; 4QT7 A; 2DE0 X; 4J9F A; 1ABQ A; 1GCQ C; 2FO0 A; 1GBQ A; 1M30 A; 1AOJ A; 2J6F A; 1AWJ A; 2JS0 A; 2K7A A; 1NM7 A; 1M8M A; 3I35 A; 2D8H A; 2LP5 A; 2KNB B; 1UGV A; 1T3S A; 4WCI A; 1ABO A; 1W70 A; 2F2W A; 3VS6 A; 1J3T A; 3GBQ A; 1SRL A; 2F2X A; 1VYT A; 2KEA A; 1ZX6 A; 4CC2 A; 1WI7 A; 1WXB A; 1UTI A; 1AEY A; 2DL8 A; 4AG1 C; 1JU5 C; 2DF6 A; 3VS2 A; 3EGU A; 2O31 A; 1Z9Q A; 2A28 A; 4OMN A; 3O5Z A; 1HSQ A; 4OMM A; 1RLP C; 2LQN A; 3I9Q A; 1ZUU A; 4IIO A; 1QKW A; 1MV0 B; 2V1Q A; 2X3X D; 1AWX A; 1BK2 A; 2RQV A; 5FWB A; 1UHC A; 2CH4 W; 2AK5 A; 4OMQ A; 1GFC A; 2DBM A; 2HEQ A; 3R6N A; 2KRN A; 4Z89 A; 1TUD A; 2C0O A; 1G2B A; 3JV3 A; 5EC7 A; 1K1Z A; 1QKX A; 2B86 A; 2J05 A; 1YNZ A; 4J9C A; 3EHR A; 2D0N A; 3VS3 A; 2JM8 A; 2PNI A; 3C0C A; 3EG3 A; 1PRM C; 1CSK A; 2YDL A; 1NEB A; 2C0T A; 1AZG B; 3KFV A; 2AZV A; 1FYN A; 4J9D A; 4J9H A; 4M4Z A; 2EYY A; 3QWY A; 4J9E A; 4GBQ A; 2GNC A; 5I11 A; 1GFD A; 1B3Q A; 3UF4 A; 2EVR A; 2DM1 A; 1PHT A; 4OMP A; 1AWW A; 5HCK A; 3M0S A; 1BBZ A; 1OPK A; 1Y0M A; 3FJ5 A; 1NYF A; 4IIM A; 1Z9Z A; 2XMF A; 1U06 A; 1X6B A; 2FPF A; 5IHK A; 5IXB A; 2EYW A; 2RF0 A; 5I22 A; 3IQL A; 1VYV A; 2D1X A; 4Y92 A; 3TVT A; 2KT8 A; 1E7O A; 1MUZ A; 3EG1 A; 5IHI A; 1T0H A; 4R0K A; 1EFN A; 2LCS A; 3ZL7 C; 2NWM A; 3UAT A; 2RMO A; 3M0T A; 4JJD A; 3TSZ A; 2YT6 A; 1KJW A; 4DEX A; 2ENM A; 4LUE A; 3REB B; 2ESW A; 1HJD A; 1BU1 A; 1K0S A; 2EBP A; 1ZSG A; 1UUE A; 4RTT A; 1CKA A; 3TSW A; 1W1F A; 2DNU A; 3UA6 A; 1PWT A; 1PKS A; 2YSQ A; 1UDL A; 4D8K A; 1ARK A; 1OV3 A; 4AFQ C; 1XOV A; 1JXM A; 2KGT A; 1T0J A; 2FRY A; 2KRM A; 1K4U S; 1NLP C; 1X2Q A; 1H3H A; 4GLM A; 2LMJ A; 2JMC A; 2JMA A; 3SHW A; 1WYX A; 2MCN A; 3M0P A; 2K79 A; 2M51 A; 4RTY A; 2CSI A; 2GQI A; 1RLQ C; 2BTT A; 4EIK A; 1GL5 A; 1S1N A; 2VKN A; 1X6G A; 1H92 A; 2ROL A; 1B07 A; 1PKT A; 2ROT A; 2EGE A; 2FG0 A; 2HBW A; 2ECZ A; 1UHF A; 2OJ2 A; 2LJ0 A; 3A98 A; 2RPN A; 4HCK A; 4LE9 A; 1JEG A; 1WA7 A; 2K9G A; 1E6H A; 1MV3 A; 2DL3 A; 2JM9 A; 3CQT A; 1UJY A; 1NYG A; 2KXC A; 4JZ4 A; 4E6R A; 1SRM A; 2ABL A; 2KYM A; 3VRY A; 5IH2 A; 2LNH B; 1KSW A; 2L3P A; 1X69 A; 2BZ8 A; 3UA7 A; 2EGA A; 2PZ1 A; 1YWO A; 2IIM A; 3NHN A; 4CC3 A; 2LJ3 A; 1RUW A; 1X2K A; 4ESR A; 1YP5 A; 1WXT A; 1K0X A; 1I1J A; 4OMO A; 2DVJ A; 2VWF A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2L2P A; 1VQN A; 5GAO q; 2JTM A; 5KYU A; 2O9V A; 4M78 E; 1TTH B; 3X24 B; 3CPF A; 1TS9 A; 2YUQ A; 1N27 A; 5GAN 8; 3OYI A; 3CCU A; 2CUD A; 4RTX A; 2PTK A; 5GAO m; 1G8X A; 3S3N A; 3OYN A; 3PIP A; 2HBP A; 2A08 A; 2ED1 A; 2O88 A; 2WSF E; 4OB0 B; 4OB3 B; 2J6O A; 2RHU A; 2L0A A; 4DBH A; 4EMK B; 3V7C A; 2NUT A; 4BI3 A; 1NJI R; 4BE2 A; 2PUK B; 3OYY A; 2EFI A; 1AZE A; 1JJ2 P; 2C0I A; 2DXC A; 2DZ9 A; 3Q1J A; 3LH5 A; 1V1C A; 1IGU A; 3CC2 T; 2ZGW A; 2J06 A; 2AKL A; 2ZPE B; 1OEB A; 1ZLM A; 2COZ A; 1NEG A; 4ZGE B; 2QTV A; 1VQN T; 3M54 A; 4MDW A; 3FJP A; 1HYO A; 3MHX A; 4QVC A; 5CKD A; 2DBK A; 3CCU T; 1VYU A; 4EMK A; 3GOX A; 3LGL A; 4OML A; 4FCY A; 2LDM A; 1Y07 A; 5C6S A; 1W2B P; 2P0K A; 3PMI A; 1M2O A; 2SEM A; 3H6Z A; 1UJ0 A; 4N4I A; 1D0X A; 3CC4 A; 4EPC A; 1GBR A; 4EDU A; 2OTJ Q; 4HVU A; 3VRZ A; 1K9M C; 5KCO A; 4M77 E; 2LCC A; 1WPY A; 2QDL A; 1I0C A; 3M58 A; 4JZ3 A; 3FB9 A; 4UC4 A; 2CS7 A; 2K2M A; 2F69 A; 3M59 A; 3VYG A; 4WF2 A; 2M0Y A; 1YIT A; 4C5H A; 3BDL A; 3P8B B; 2YRV A; 2DRM A; 4XTU A; 3AHU A; 1SEM A; 3NPF A; 3L2Z A; 1BCO A; 3VS5 A; 3JAM E; 1KD1 R; 2RQW A; 5GAN j; 5GAM e; 4HCB A; 4J9B A; 2YWW A; 2O2O A; 2E3I A; 2B8A A; 2KRO A; 2XU8 A; 1M3A A; 2KY9 A; 3M0R A; 4RTW A; 4RKU E; 4NOY A; 3EFO B; 2GTO A; 2FZK B; 2VGN A; 4QQG A; 1K73 C; 2FYK A; 2QEX Q; 1QWF A; 2IG0 A; 2LRQ A; 3WVD B; 3H0I A; 3JCM b; 1QVG A; 1AHJ B; 1OOT A; 1ZA2 B; 3V8K A; 3QKJ A; 2GQV A; 4VUB A; 2DMO A; 5FWC A; 2VGM A; 5KCH A; 1M5Q 1; 3VS0 A; 4E7J A; 2NUZ A; 3CCV Q; 2LJ1 A; 4M75 G; 4MMK A; 3X20 B; 3QDR B; 3QBY A; 3LWH A; 3EFO A; 1C1A A; 2DZC A; 3GLX A; 3I55 A; 4XU0 A; 1OPL A; 2GGR A; 4J6W A; 1WFW A; 2SRC A; 4C5G A; 1Q95 G; 3C12 A; 3ASK A; 2CZ1 B; 4JRP A; 1JXO A; 3CBP A; 3CCM Q; 1YHQ T; 2DAQ A; 2H3E B; 2OI3 A; 2MIO A; 4BY6 C; 1WJQ A; 2RH2 A; 4FYV B; 5GMK j; 2EKH A; 3OYF A; 4KH1 B; 2CDT A; 4M7D G; 2XG8 D; 2YUP A; 5CCA A; 5J39 A; 4F17 A; 1N5Z A; 2AZS A; 1MND A; 1OU9 A; 3E9G A; 4AMC A; 4GLK A; 2EQM A; 2VB6 A; 1K9M U; 3EHQ A; 3I5S A; 3I55 T; 1JRI A; 2GTJ A; 1VQ6 T; 1VQO Q; 1KFZ A; 2LZ6 B; 2HSP A; 2CZ6 B; 2E1H A; 3G71 A; 1GRI A; 2KYB A; 3CEY A; 4JLG A; 3OSS C; 4FIB A; 2KSS A; 2NLU A; 2DLP A; 1JJ2 A; 4C8Q C; 2RN8 A; 2RO0 A; 2HL3 A; 1YJN A; 1HK9 A; 3THK A; 3L2U A; 1ABQ A; 2J6F A; 5A0D A; 1AWJ A; 1IZ6 A; 2JS0 A; 2K7A A; 2CP0 A; 1Q81 C; 4IKF A; 3I35 A; 1SF9 A; 2LP5 A; 3QJY A; 4WCI A; 1T3S A; 4PJL A; 1JBM A; 2F2W A; 3GBQ A; 1UB4 A; 4LDX A; 4LXC A; 1K73 U; 1PSF A; 1W2B A; 1OZ3 A; 3SD4 A; 2K3X A; 1VQ4 T; 1WXB A; 3PMT A; 1S72 Q; 4M75 E; 4AG1 C; 2HNI A; 5LJ5 g; 2DTO A; 2KQW A; 4C92 F; 4IUT A; 1Z9Q A; 2LC4 A; 4B6M A; 1UGQ B; 1HSQ A; 5AYF A; 4N4H A; 1KQS P; 3G4S T; 1YJN T; 3JSC A; 4BAC A; 1RAB B; 3CMA A; 4KUI A; 2KAF A; 3JB9 H; 1BI1 A; 1WQW A; 2O4X B; 3LYI A; 4Q5W A; 1ZUU A; 1Y71 A; 5HK3 A; 4QQ6 A; 1MV0 B; 4FW2 A; 3FRN A; 1X01 A; 2PVD B; 4M7D E; 3V8L A; 4N4G A; 4KH0 B; 4F7U F; 3JCM c; 2HEQ A; 4FT2 A; 2KRN A; 4Z89 A; 5EC7 A; 4J9C A; 3EHR A; 3E9F A; 3VS3 A; 3P8D A; 2O4X A; 1BIA A; 1K9M R; 1WQ7 A; 1AZG B; 3KFV A; 1LPL A; 2QQS A; 3CMA T; 1FYN A; 1VQL Q; 4J9H A; 4BY6 B; 2RA2 A; 4M7A C; 1TH7 A; 2QQB A; 4OMP A; 1PHT A; 2VC8 A; 1BBZ A; 3FJ5 A; 3BW1 A; 1YIJ Q; 3G6E Q; 2JVV A; 1R0C B; 1YCY A; 1HXD A; 4J6Y A; 3NTH A; 1X6B A; 2ZPG B; 3INZ A; 4BI8 B; 3A1P A; 3CCL Q; 5FLX E; 3I56 Q; 3IQL A; 5GAN 3; 5CKB A; 1PCX A; 2KT8 A; 1E7O A; 1MUZ A; 3EG1 A; 4C0F A; 1YFN A; 1Q81 U; 1EFN A; 2K2V A; 3FIF A; 2RMO A; 3M0T A; 4M77 D; 1I4K 1; 5D6X A; 3ZEH A; 3CD6 Q; 2QGF B; 4JJD A; 4KGV B; 3TSZ A; 2MI6 A; 4C8Q B; 1D3B A; 1RAD B; 3RKY A; 1K73 R; 3REB B; 1K0S A; 4PFP A; 5KE2 A; 1UUE A; 1CKA A; 1W4S A; 2NUP B; 3LGF A; 2QI2 A; 1W1F A; 2YSQ A; 2E65 A; 2KRM A; 5LJ3 j; 1NLP C; 1X2Q A; 4QKU A; 1H3H A; 1M9S A; 4XU3 A; 4XAX B; 1VQP T; 1G3W A; 4YTL A; 2DJZ A; 2CSI A; 3A8M B; 4C8Q A; 1TUG B; 1RLQ C; 3CC7 A; 2DKG A; 1X6G A; 2NUP A; 8AT1 B; 4E7H A; 3EAE A; 1H92 A; 1PKT A; 1WHK A; 5J26 A; 3A98 A; 4LE9 A; 4JJN K; 2X4X A; 2K9G A; 1E6H A; 3QZ9 B; 3X25 B; 2QAS A; 1UJY A; 2KXC A; 4JZ4 A; 2M16 A; 3GIB A; 1WHH A; 2KYM A; 4XTX A; 3VRY A; 4OF1 A; 2X9H A; 2EGA A; 2RHY A; 3JRZ A; 2QG9 B; 3TEE A; 5GAO n; 4M7A F; 1YI2 T; 3CC7 T; 5CKH A; 2VWF A; 5GMK i; 1KQS A; 4HT8 A; 5GMK l; 4AFZ C; 1RAF B; 2JN0 A; 1RI0 A; 3H9N A; 2BZY A; 3VUZ A; 3CCQ Q; 1PC0 A; 5GAM f; 1VIF A; 4M7A B; 1I5L A; 4GY5 A; 2RQR A; 4PFO A; 2P0P A; 1RAE B; 4B9W A; 3JCM Q; 5LJ5 e; 4Y91 A; 1Q81 R; 5IXF A; 2D6F A; 2CRE A; 1D1C A; 3UPU A; 1K8A C; 4PLL A; 1X75 C; 2RD1 A; 1OI1 A; 2AHJ B; 4PJO F; 2EYZ A; 3HSB A; 3JCM g; 3OBY A; 2BIV A; 1ZUK A; 1KK7 A; 5CKF A; 3QWX X; 2LT4 A; 2P4T A; 2K3B A; 2PUO B; 1IRX A; 1ZBJ A; 2ZZD A; 1YCS B; 1C0M A; 4BI4 A; 1MGQ A; 2VVK A; 1HD3 A; 4K11 A; 2RB6 A; 1U1S A; 2DL4 A; 5GAM d; 4AFS C; 4FL6 A; 3DLL A; 5CK9 A; 5GAO l; 1FMW A; 2DIL A; 4E47 A; 2K6D A; 2DRK A; 3RER A; 2DPP B; 2R5A A; 3RKX A; 4OB2 B; 3OQ5 A; 3CCU Q; 2FPD A; 4RTZ A; 4C0D C; 1SSH A; 3QG1 A; 1UGR B; 3E1S A; 3JB9 D; 4M75 D; 4AFU C; 1ZBX A; 2DD4 A; 2KE9 A; 1BI0 A; 3OYL A; 1D1A A; 2QXF A; 1M3C A; 2K3Y A; 2XI9 A; 5KH6 A; 3HPW A; 3SEM A; 4RTV A; 4JJC A; 4E7S A; 2OX7 A; 2M9U A; 2CZ7 B; 3R6O A; 2J7I A; 3RIR A; 1SHF A; 1WXU A; 5J3B A; 3CBO A; 2R57 A; 3D7S B; 4ZN3 A; 3MCA B; 4M7D D; 2KDS A; 3OA6 A; 1VQ8 A; 2AT1 B; 1OYX A; 2KRS A; 5DY9 A; 4PL6 A; 4HCZ A; 4MDX A; 2COY A; 1N8R C; 2XIC A; 2EJG A; 1UGP B; 3MKD A; 3EH2 A; 3EG0 A; 3CCJ T; 3NTI A; 2D0Q B; 3QII A; 3QXE B; 2DD5 A; 1O75 A; 2XDB A; 5FRO A; 2EQI A; 2RK2 A; 1WDX A; 4HXJ A; 5IHN A; 1D1B A; 4L6V 5; 5GAN 6; 2BZX A; 2X35 A; 1K8A U; 2HSE B; 1M2V B; 1WX6 A; 2W0Z A; 4PNO A; 5A2Q E; 1VQ9 A; 2JW4 A; 3T9N A; 4FU6 A; 2CSQ A; 2XKO C; 4RTU A; 2EQU A; 2X4Y A; 3M57 A; 3CCE A; 4LDU A; 2GBQ A; 1VQK A; 1UG1 A; 2F1L A; 3G7Z A; 3CCS A; 4ZTF A; 1G83 A; 2L3S A; 4Y28 E; 3OYJ A; 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