The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
8
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sequence length |
60
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structure length |
60
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Chain Sequence |
CGAEYVRALFDFNGNDEEDLPFKKGDILRIRDKPEEQWWNAEDSEGKRGMIPVPYVEKYG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Mus musculus
|
| publication title |
Changing protein backbone topology: Structural and dynamic consequences of the backbone cyclization in SH3 domain
rcsb |
| molecule keywords |
Proto-oncogene C-crk
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| total genus |
8
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| structure length |
60
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| sequence length |
60
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-06-27 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2DYB A; 3M0P A; 5IHI A; 2HDA A; 2KBT A; 1M8M A; 1JO8 A; 3REA B; 1GCQ A; 1YP5 A; 2EGC A; 1SRL A; 2DNU A; 3PVL A; 1QWF A; 1SHF A; 2JTE A; 1X6B A; 2V1Q A; 2KEA A; 1MUZ A; 3TSW A; 1JU5 C; 4D8K A; 2DBM A; 1OV3 A; 2AZS A; 4JJD A; 2FPE A; 2YDL A; 2ROL A; 3EHR A; 3EHQ A; 1BK2 A; 4CC2 A; 1CKA A; 1NYF A; 3A98 A; 2CH4 W; 2QDL A; 2AKK A; 2RQR A; 2E5K A; 5IXB A; 1ARK A; 2O88 A; 4OMN A; 2BZX A; 4GLM A; 2HCK A; 4A63 B; 2OI3 A; 2KYB A; 4QT7 A; 2CT3 A; 2DVJ A; 1BB9 A; 1JQQ A; 2DM1 A; 2EYX A; 4KRT A; 1K76 A; 1WYX A; 2KT1 A; 1AWX A; 4RTW A; 1UDL A; 2JS0 A; 2EPD A; 1WLP B; 1GBQ A; 1FMK A; 1WXB A; 1ZLM A; 1SEM A; 2K2M A; 1SRM A; 1VYT A; 1OPL A; 3VS7 A; 2D1X A; 4JJC A; 5HCK A; 4RUG A; 1CSK A; 5I11 A; 1AWO A; 1GRI A; 1JEG A; 3VS6 A; 2FPF A; 2BZ8 A; 1J3T A; 2CSI A; 2GNC A; 4DEY A; 3CQT A; 2LJ3 A; 3THK A; 1FYN A; 1ZBJ A; 1M3A A; 4LUD A; 4RTZ A; 2W0Z A; 1RI9 A; 3R6N A; 1W70 A; 3VS1 A; 3U23 A; 1MV0 B; 2PNI A; 1WXU A; 2FO0 A; 1H92 A; 4AG2 C; 5FW9 A; 2LQW A; 4OMP A; 4Y92 A; 1PNJ A; 1NYG A; 2KGT A; 1K9A A; 1M27 C; 2L3Q A; 2EVR A; 4F17 A; 1AWJ A; 3H0I A; 3UAT A; 1AVZ C; 2DL3 A; 2J06 A; 2A28 A; 3TVT A; 1UGV A; 1ZSG A; 3NPF A; 2ED0 A; 1PKS A; 2FG0 A; 1A0N B; 2A08 A; 2RQT A; 4F16 A; 1E6G A; 1SSH A; 2M51 A; 4HVV A; 2F2X A; 1E6H A; 4F14 A; 1NEB A; 1PRM C; 4JJB A; 2LNH B; 4J9F A; 2CDT A; 2YSQ A; 2JM9 A; 3PVQ A; 4D8D A; 1TG0 A; 2FPD A; 4E6R A; 1XOV A; 1NLP C; 4HCK A; 2JT4 A; 4JZ3 A; 4X1V A; 1OPK A; 1LCK A; 2DE0 X; 3VS5 A; 3M0U A; 4RTX A; 1AD5 A; 3GBQ A; 4RTY A; 4J9D A; 2GGR A; 1GBR A; 2JW4 A; 1T0J A; 3IQL A; 1U3O A; 1UHF A; 2KRM A; 1H3H A; 4ORZ A; 2F2W A; 1UEC A; 1ZX6 A; 1N5Z A; 1K0X A; 3I9Q A; 2RMO A; 2J6K A; 3UF4 A; 3EG0 A; 3TSZ A; 2ECZ A; 4DEX A; 2K6D A; 2MOX A; 2DIL A; 2DL4 A; 2F2V A; 1YNZ A; 1YWP A; 4J9C A; 3UA6 A; 1ZUY A; 2FEI A; 1WA7 A; 1X69 A; 1K0S A; 2A36 A; 3M0T A; 1AWW A; 2VWF A; 1HJD A; 2RQV A; 3VRZ A; 1X6G A; 1UJ0 A; 2RPN A; 4EIK A; 5I22 A; 1K1Z A; 1K4U S; 2CRE A; 2LJ1 A; 2X3X D; 1X2Q A; 1JXO A; 1U06 A; 2DL7 A; 2RNA A; 1PKT A; 2EYZ A; 2KXD A; 1BBZ A; 4CC7 A; 3RNJ A; 2EBP A; 1HSQ A; 2A37 A; 4AFQ C; 1M3B A; 4CC4 B; 2RF0 A; 1QKX A; 1QKW A; 2EQI A; 5ECA A; 2XMF A; 2D8J A; 2CH4 A; 4IIM A; 2SEM A; 1GCP A; 1I07 A; 2O2O A; 5FWC A; 2I0N A; 2ENM A; 1NM7 A; 1TUC A; 3JV3 A; 2ED1 A; 5GJV B; 4ZNX A; 3VS0 A; 2JMC A; 2EGE A; 1UTI A; 4HVU A; 1OEB A; 1U5S A; 3EG1 A; 2G6F X; 4LN2 A; 2W10 A; 4IIO A; 1KSW A; 4CC3 A; 1QWE A; 2VKN A; 1M30 A; 1WFW A; 1UFF A; 2VVK A; 1H8K A; 1AZE A; 1AOJ A; 2RN8 A; 2KXC A; 1UUE A; 2SRC A; 3H41 A; 4AG1 C; 2YUP A; 3EGU A; 3I5S A; 5EC7 A; 1ZUU A; 1RLQ C; 1HD3 A; 2V1R A; 1WX6 A; 2JXB A; 2L0A A; 3H0H A; 1V1C A; 1SHG A; 4OML A; 3VS3 A; 2CUB A; 4J9H A; 2IIM A; 4K11 A; 1AEY A; 4OMO A; 1GCQ C; 2YUO A; 4LNP A; 2OJ2 A; 2BZY A; 2K3B A; 2L3S A; 2DRM A; 1IO6 A; 1BU1 A; 4LE9 A; 2B86 A; 3O5Z A; 4FSS A; 1ABO A; 1YWO A; 3H0F A; 4J9G A; 2KRS A; 4J9E A; 1PHT A; 2KRO A; 2DX1 A; 2KE9 A; 4R0K A; 3NHN A; 3I5R A; 3NMZ C; 1G2B A; 2CUD A; 2DL8 A; 4JZ4 A; 2EYW A; 2LMJ A; 2FRY A; 2LX7 A; 3M0S A; 4J9B A; 2J7I A; 2CSQ A; 2DMO A; 5L23 A; 2AZV A; 2NUZ A; 1G83 A; 2J05 A; 2BTT A; 1NEG A; 4ESR A; 1ABQ A; 2K9G A; 3M0Q A; 1NG2 A; 4Z88 A; 1RUW A; 2K7A A; 4GBQ A; 3ZL7 C; 2MCN A; 2FRW A; 1KIK A; 2JM8 A; 1TUD A; 2EW3 A; 2GTJ A; 1Y57 A; 1RLP C; 1M3C A; 4RTT A; 2D0N A; 3VS4 A; 4AFS C; 1X43 A; 1QCF A; 1B07 A; 5FWB A; 1AZG B; 2JMA A; 3C0C A; 2LP5 A; 1S1N A; 2JS2 A; 2J6O A; 4Z89 A; 2LJ0 A; 3NGP A; 1UG1 A; 2KYM A; 1KFZ A; 2C0T A; 2GQI A; 2DF6 A; 2YUQ A; 2YT6 A; 2DLP A; 1B3Q A; 2J6F A; 2MIO A; 3REB B; 2PTK A; 2GTO A; 1WXT A; 1NLO C; 1E7O A; 3SEM A; 2LZ6 B; 4JPB W; 2DBK A; 2M0Y A; 1X2K A; 2P4R A; 5IHN A; 1KJW A; 2KRN A; 2K79 A; 4RTU A; 1EFN A; 2DL5 A; 4Z8A A; 1PWT A; 3LH5 A; 2GBQ A; 3ULR B; 2DJQ A; 2EKH A; 2LQN A; 3SHW A; 1I0C A; 1I1J A; 2KR3 A; 1OOT A; 1UE9 A; 2EYY A; 3EG3 A; 2HEQ A; 1GFC A; 1X27 A; 2O9V A; 3PE0 A; 1GFD A; 2X3W D; 1Z9Q A; 4OMM A; 1GL5 A; 1ZUK A; 3M0R A; 5IHK A; 2C0O A; 1VYV A; 2CT4 A; 5IH2 A; 1T3L A; 5GJW B; 2D8H A; 3FJ5 A; 4J9I A; 1UJY A; 1JXM A; 1WDX A; 3I35 A; 1T3S A; 2YUN A; 2EGA A; 2NWM A; 2HBW A; 1UHC A; 4HXJ A; 2L2P A; 3VRY A; 1YN8 A; 2AKL A; 2DA9 A; 1WI7 A; 3VS2 A; 4AFZ C; 2RQU A; 2KT8 A; 4OMQ A; 3QWX X; 1VYU A; 2PZ1 A; 5IXF A; 2ESW A; 3KFV A; 2RQW A; 1YCS B; 3QWY A; 2O9S A; 2HSP A; 1WIE A; 4AFU C; 3RBB B; 2L3P A; 1VA7 A; 1QLY A; 1W1F A; 1MV3 A; 2LCS A; 2KNB B; 4M4Z A; 4RTV A; 1Y0M A; 3UA7 A; 1Z9Z A; 1CKB A; 4HVW A; 2C0I A; 1SPK A; 2AK5 A; 1T0H A; 2ROT A; 4LUE A; 2OAW A; 1PRL C; 2H8H A; 3EG2 A; 4WCI A; 2ABL A; 2O31 A; 2DRK A; 1W6X A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3NTK A; 2B8A A; 2GF7 A; 5GAM h; 4M7D B; 3EFR A; 5IHI A; 2KBT A; 1TUG B; 4NOY A; 1VQ5 T; 1SRL A; 2HQH A; 4EMG A; 1X6B A; 1AT1 B; 2V1Q A; 2LQK A; 4ZN1 A; 1LPL A; 4A53 A; 3I55 Q; 2NYS A; 2CGH A; 5CKE A; 2ROL A; 3UWN A; 3QXE B; 3EHR A; 4CC2 A; 2QDL A; 3CC2 T; 4Q5W A; 4C8Q D; 2VB6 A; 5LJ3 e; 1ARK A; 1VQ9 A; 1M9S A; 2KYB A; 2OTJ Q; 2DVJ A; 4OB2 B; 4XTV A; 1VQP Q; 4KRT A; 1WYX A; 1AWX A; 2JS0 A; 3VV0 A; 1GBQ A; 4ZGD B; 1FMK A; 3CC4 Q; 4M75 D; 5A0G A; 1SRM A; 3QJ6 A; 1RAG B; 3GP8 A; 1FMV A; 3JB9 I; 4M77 D; 4M7A B; 3L42 A; 1IXD A; 4JJC A; 2VXE A; 5GAN 7; 3MEA A; 3A8H B; 3CCQ Q; 1GRI A; 2DVE A; 3A8L B; 4LD6 A; 4PLI A; 1AWO A; 1J3T A; 2RI3 A; 3LYI A; 4DEY A; 4C92 G; 1R8O B; 1SF9 A; 3M4G A; 1FYN A; 4KUL A; 3M54 A; 2LX9 A; 4ME7 A; 1W70 A; 3VS1 A; 3OBY A; 2XHC A; 5LJ3 f; 4QQD A; 2DD5 A; 3OBW A; 2FO0 A; 1YIJ Q; 2XI9 A; 1YBY A; 3I56 Q; 3HRS A; 4II1 A; 4OMP A; 3CXC A; 1PNJ A; 2KGT A; 5FU7 C; 4M7D E; 3C95 A; 1MMA A; 4LDX A; 1ZSG A; 1RAC B; 2ED0 A; 4MZP A; 2PUO B; 4BE2 A; 1PKS A; 1BI2 A; 4BY6 C; 3SFM A; 1VQN A; 2RJE A; 2M51 A; 1E6H A; 4F14 A; 4C0D B; 4PJL A; 3CBP A; 2YSQ A; 1G5V A; 1U1T A; 1WQW A; 5GAM j; 3V8K A; 3GBQ A; 3RER A; 2OTL T; 3CCS A; 4C92 B; 2GGR A; 2JJ9 A; 4QVC A; 1U3O A; 2KRM A; 2QDY B; 1JJ2 S; 4N4G A; 4PNO A; 4R56 A; 1UEC A; 2E6Z A; 3V7R A; 7AT1 B; 4TVR A; 3QZ9 B; 2E10 A; 3I9Q A; 4NS5 A; 4P5N A; 4DQ2 A; 2DZC A; 2J6K A; 2DFU A; 1IHV A; 4JLI A; 2HL3 A; 2K6D A; 3JB9 G; 2DIL A; 4M7A E; 1DJ7 B; 3HKS A; 3OYM A; 1ZUY A; 4PJN A; 4PJJ A; 2DTI A; 3A5Z B; 2M9U A; 3OW2 S; 5I22 A; 1K1Z A; 2M0O A; 3CMA T; 2X3X D; 3QDR B; 1I4K 1; 1JXO A; 1U06 A; 2DL7 A; 2V8J A; 1PKT A; 4XU0 A; 1FXX A; 2JNG A; 2KXD A; 1YHQ T; 2CP3 A; 1HSQ A; 4EMH A; 4QVD A; 3DLL A; 3JCM W; 4PJO C; 1M3B A; 4M77 G; 3JB9 J; 1QKX A; 1JBM A; 5ECA A; 3VU3 C; 5KE2 A; 4IIM A; 3OS2 A; 4JS4 A; 3TQ7 P; 1YFN A; 2WSE E; 2O2O A; 3OA6 A; 2I0N A; 2M02 A; 5CR2 A; 1M1K R; 3JV3 A; 3JCM b; 3EFS A; 2EGE A; 3FDR A; 4HVU A; 2MMP A; 1BI0 A; 3ZBD A; 4VUB A; 1KSW A; 1VQ7 T; 1RAE B; 2K5L A; 4M7D F; 4N0A C; 5KYX B; 3CCL T; 1M90 C; 3M53 A; 4C8Q B; 1M1K U; 2QQA A; 3J81 E; 4CI0 C; 3H41 A; 4JRQ A; 1Y96 B; 4AG1 C; 3I5S A; 4JRP A; 2KDS A; 1ZUU A; 1RLQ C; 3RUX A; 3KXT A; 2HQX A; 5GMK l; 3FIF A; 2JXB A; 3H0H A; 2QQS A; 2ZCF B; 1SHG A; 4OML A; 1XTD A; 2XU8 A; 4J9H A; 4OMO A; 4M75 B; 2OJ2 A; 2BZY A; 2L3S A; 1IO6 A; 4FSS A; 1PSE A; 2F1L A; 4M77 B; 5A0D A; 3BDU A; 1JRI A; 1NE8 A; 2DD4 A; 4L6V 5; 5J26 A; 2KE9 A; 3NHN A; 3MHX A; 1VQM Q; 4GLK A; 2RD1 A; 3X28 B; 3OSS C; 1RAD B; 1S72 A; 3I5R A; 2CS7 A; 2E41 A; 2CUD A; 3HL8 A; 4JZ4 A; 2CZ0 B; 2DXT A; 4L59 A; 1VQ8 A; 3RR6 A; 2COZ A; 2DMO A; 2RK2 A; 3CCV A; 1KC8 U; 4M7A F; 2NUZ A; 2J05 A; 1LJO A; 4ESR A; 1NPR A; 2K9G A; 3M0Q A; 2MYS A; 1NG2 A; 3EGX B; 4XU3 A; 5A0L A; 1RUW A; 2K7A A; 4GBQ A; 1XNI A; 3EH2 A; 2JM8 A; 2EJF A; 5GAM g; 4RTT A; 3VS4 A; 3G71 T; 3L2V A; 4MMK A; 1AZG B; 3CCM Q; 4FYW B; 1YJ9 T; 2PVG B; 1S1N A; 2JS2 A; 4Z89 A; 1N9R A; 2LJ0 A; 1Q81 U; 3TRE A; 3QBY A; 1UG1 A; 2QAZ A; 1KQS S; 2KYM A; 2GQI A; 5GAN h; 2DF6 A; 2YT6 A; 2DLP A; 2DER A; 4ELY C; 2J6F A; 2PTK A; 5GMK m; 3H6Z A; 4QW2 A; 4PFO A; 3PFS A; 1E7O A; 2LZ6 B; 2DJZ A; 1KG1 A; 4C8Q E; 5D6Y A; 3J80 E; 3CBM A; 4OGC A; 2FZC B; 1PD0 A; 4LDU A; 1I81 A; 2BIV A; 1F1B B; 3RES A; 4Z8A A; 1PWT A; 1VQ9 Q; 2GBQ A; 5KYW B; 3OYH A; 1VQ7 A; 4AT1 B; 1JJ2 P; 4QQ6 A; 5GMK i; 2LQN A; 3UDC A; 3SHW A; 5CCA A; 1I0C A; 4EPC A; 2CZ6 B; 4M75 E; 1GFD A; 5KYU A; 1Z9Q A; 1GL5 A; 1ZUK A; 3M0R A; 3L2W A; 4C92 F; 5LJ5 f; 2X35 A; 2CT4 A; 1T3L A; 2CZ7 B; 4J9I A; 3OYG A; 1JXM A; 2X4Y A; 1RL2 A; 4HT9 A; 4PJO A; 1BIA A; 3I35 A; 1VQ4 T; 3ZEH A; 2YUN A; 1YJW T; 2RHU A; 1YJN T; 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3FJP A; 1C0M A; 5CKH A; 3HSB A; 1QMC A; 2R5A A; 4M7D G; 2P0K A; 2LJ3 A; 1IZ6 A; 2F5T X; 1LVK A; 4ANJ A; 4LUD A; 4IKF A; 3QSU A; 4RTZ A; 4HA8 A; 2WAC A; 2L89 A; 3OY9 A; 3CD6 A; 1MV0 B; 1H3Z A; 1P92 A; 5FU6 B; 1WJQ A; 1H92 A; 3PGG A; 5GAN 2; 1KQS P; 2E65 A; 1XQH A; 1NYG A; 4Y92 A; 2KI7 A; 2EVR A; 4E7J A; 5KYY B; 3H0I A; 2A28 A; 3TVT A; 3NPF A; 2A7Y A; 2XD0 A; 2K5F A; 2X4W A; 2RQT A; 4F16 A; 4C5H A; 2QA4 T; 4HVV A; 1MND A; 2ZZD A; 3VJP A; 1D0Y A; 4J9F A; 2G3R A; 2CDT A; 3A1P A; 2JM9 A; 1QVF S; 1TG0 A; 2FPD A; 4X1V A; 1D09 B; 3Q1J A; 5GAO n; 1QVG S; 1OPK A; 1PCX A; 5GMK e; 1LCK A; 1NBE B; 3QO3 A; 2HQE A; 3L1A A; 3M0U A; 3NTH A; 1N27 A; 4KGV B; 2NUT A; 3G6E T; 3EFO A; 1YIT A; 4M7A G; 2Y4X A; 4J9D A; 1RAI B; 2MI6 A; 3TCJ A; 2CYZ B; 3GOX A; 3CCR T; 1VQK T; 1YI2 A; 1T0J A; 4WF2 A; 4M78 C; 3IQL A; 3RKY A; 1FWZ A; 2F2W A; 2VV5 A; 4B9X A; 2P0P A; 2CP2 A; 1S72 Q; 2IG0 A; 2RH2 A; 1M5Q 1; 2EQK A; 3EG0 A; 2ECZ A; 2DL4 A; 1VQ8 Q; 2F2V A; 1K73 R; 3QZ5 B; 4MDX A; 3L2U A; 3CC7 Q; 3P8H A; 4F7U A; 2VWF A; 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