The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
8
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sequence length |
60
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structure length |
60
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Chain Sequence |
CGAEYVRALFDFNGNDEEDLPFKKGDILRIRDKPEEQWWNAEDSEGKRGMIPVPYVEKYG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Proto-oncogene C-crk
|
| publication title |
Changing protein backbone topology: Structural and dynamic consequences of the backbone cyclization in SH3 domain
rcsb |
| source organism |
Mus musculus
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| molecule tags |
Protein binding
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| total genus |
8
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| structure length |
60
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| sequence length |
60
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-06-27 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2LJ0 A; 4K11 A; 1NEG A; 2EYY A; 2KYM A; 1JQQ A; 2DBK A; 2CUB A; 2FPE A; 2K2M A; 2GTO A; 1IO6 A; 1GCP A; 1H3H A; 2EBP A; 2YT6 A; 1TUC A; 4OMM A; 2FEI A; 2KRN A; 5IHI A; 2ESW A; 2L3Q A; 2VVK A; 2HCK A; 1GCQ C; 4CC2 A; 1QWE A; 2LP5 A; 3TSZ A; 1U5S A; 1CSK A; 1MV3 A; 1Y0M A; 4CC7 A; 1PHT A; 1VYT A; 1WLP B; 3M0U A; 5I11 A; 1NEB A; 1NLO C; 3NMZ C; 1MV0 B; 1N5Z A; 1ABQ A; 1Z9Q A; 3VS6 A; 3SEM A; 3I5R A; 1K76 A; 1TUD A; 4RTU A; 2AK5 A; 1I0C A; 2RQV A; 2ROL A; 1SHG A; 4JPB W; 2EYZ A; 2W10 A; 2KYB A; 4FSS A; 3VRZ A; 2L0A A; 1FYN A; 3M0Q A; 3H0I A; 1W70 A; 2ABL A; 3M0T A; 3M0R A; 2YSQ A; 1BB9 A; 4OMQ A; 1QWF A; 2O31 A; 2A36 A; 2LMJ A; 2ENM A; 2SEM A; 1UFF A; 2IIM A; 2EYX A; 1AZG B; 1GCQ A; 3JV3 A; 2JS0 A; 2JT4 A; 1E7O A; 4JJC A; 2CT4 A; 1T3S A; 2JM9 A; 1NLP C; 5GJW B; 2D0N A; 2FRY A; 4JJB A; 2JW4 A; 4KRT A; 2C0O A; 2YUQ A; 1V1C A; 2EQI A; 1K4U S; 4Z8A A; 2XMF A; 3UA6 A; 1HJD A; 4CC3 A; 4RUG A; 3NHN A; 1UHC A; 3EHQ A; 1T0H A; 1WA7 A; 1QCF A; 2EGC A; 2NWM A; 1X27 A; 3I5S A; 2JM8 A; 2AZS A; 1EFN A; 2C0T A; 2BTT A; 3I9Q A; 5L23 A; 2OJ2 A; 2BZY A; 2X3X D; 1XOV A; 4AFU C; 1K0S A; 2J05 A; 3FJ5 A; 1OEB A; 1X69 A; 1SEM A; 1RLP C; 1S1N A; 5I22 A; 1B07 A; 3O5Z A; 2LZ6 B; 2FPD A; 2DRK A; 4JZ3 A; 2A37 A; 2FRW A; 2GGR A; 2J06 A; 2NUZ A; 2L2P A; 2DL4 A; 2L3P A; 1A0N B; 2EYW A; 4A63 B; 2HDA A; 4AFQ C; 4LUD A; 2KXD A; 2VKN A; 1M8M A; 2DIL A; 1HD3 A; 1M3C A; 1K0X A; 4HVU A; 1AEY A; 3UA7 A; 4F16 A; 3VS2 A; 3A98 A; 3M0P A; 4J9E A; 2KRM A; 1X2K A; 2CT3 A; 1OOT A; 2DVJ A; 1GFC A; 2FO0 A; 2JS2 A; 1AWO A; 2CRE A; 1BU1 A; 1X2Q A; 3H0F A; 3H0H A; 1NYG A; 2DM1 A; 2D8J A; 2KT8 A; 1NYF A; 1WXB A; 4RTX A; 1PWT A; 5EC7 A; 1JO8 A; 3U23 A; 3EG1 A; 4F17 A; 2EGA A; 2LNH B; 4OMN A; 1PRL C; 1WX6 A; 1UHF A; 2KEA A; 1I07 A; 1X6G A; 2SRC A; 3LH5 A; 2EKH A; 4LN2 A; 2CH4 W; 4AFS C; 1J3T A; 4HXJ A; 3VS4 A; 2K79 A; 2KGT A; 1UGV A; 1M30 A; 2DX1 A; 2CUD A; 4J9C A; 2DL8 A; 2M0Y A; 1K9A A; 2F2X A; 5IHN A; 1YWO A; 4D8D A; 3NPF A; 2DL5 A; 1PRM C; 1Z9Z A; 1JEG A; 1K1Z A; 4GBQ A; 4RTV A; 5IXB A; 2JMA A; 1SRL A; 1VYU A; 2M51 A; 4JZ4 A; 2J6F A; 1UDL A; 1G2B A; 1U06 A; 1UTI A; 2O9S A; 1M3B A; 1AD5 A; 2B86 A; 3RNJ A; 2JMC A; 4DEX A; 2PZ1 A; 2YUP A; 1ZLM A; 1SRM A; 1RLQ C; 2LCS A; 2D1X A; 2D8H A; 5FWC A; 3SHW A; 5FWB A; 3C0C A; 4J9F A; 1OPK A; 2DE0 X; 1B3Q A; 2BZ8 A; 2MIO A; 2RQT A; 1ZUU A; 2G6F X; 2DLP A; 1M27 C; 1I1J A; 1ZUY A; 1YCS B; 2A28 A; 4ESR A; 3TVT A; 1ZSG A; 1KIK A; 2O2O A; 4DEY A; 1GBQ A; 1GFD A; 1GL5 A; 5IHK A; 2K3B A; 2KBT A; 1ARK A; 4HVW A; 2EVR A; 1NG2 A; 2J6O A; 2KXC A; 4RTT A; 4CC4 B; 2J6K A; 2AZV A; 4RTZ A; 1KSW A; 2KT1 A; 4R0K A; 3TSW A; 4OMO A; 5HCK A; 4AFZ C; 2YDL A; 2DBM A; 5FW9 A; 1UEC A; 1OV3 A; 2YUN A; 1CKA A; 4IIO A; 3GBQ A; 2MOX A; 2AKK A; 1JXO A; 2DNU A; 2F2V A; 2I0N A; 1AZE A; 2P4R A; 4RTY A; 1AWJ A; 1AOJ A; 3VS5 A; 2FPF A; 3EHR A; 4HVV A; 1PNJ A; 1U3O A; 2RQU A; 2RN8 A; 2LQN A; 4QT7 A; 1KFZ A; 2ROT A; 3VS7 A; 4Y92 A; 2A08 A; 2LJ3 A; 1YNZ A; 1MUZ A; 1VA7 A; 2RPN A; 2JTE A; 1VYV A; 4GLM A; 2O88 A; 2KRO A; 1KJW A; 4F14 A; 1NM7 A; 4LNP A; 3VS3 A; 2GBQ A; 2E5K A; 1T0J A; 1W6X A; 1WDX A; 2CSQ A; 2PTK A; 2FG0 A; 2DF6 A; 1FMK A; 4Z89 A; 3NGP A; 1RI9 A; 1T3L A; 2MCN A; 2OAW A; 2HSP A; 4ORZ A; 2ED1 A; 1E6H A; 3EGU A; 3I35 A; 3PVL A; 2RNA A; 4J9D A; 2K6D A; 2DL7 A; 1BK2 A; 2LX7 A; 4D8K A; 1BBZ A; 4AG2 C; 3CQT A; 1SSH A; 1GRI A; 2GQI A; 2DYB A; 4JJD A; 4ZNX A; 1H8K A; 1RUW A; 1AVZ C; 1WIE A; 3ZL7 C; 1UE9 A; 4LE9 A; 3RBB B; 1ABO A; 1X43 A; 3EG0 A; 2C0I A; 2KR3 A; 1SHF A; 2LJ1 A; 3QWX X; 4RTW A; 4E6R A; 2W0Z A; 2ED0 A; 1X6B A; 2KNB B; 1G83 A; 3REB B; 1Y57 A; 3VRY A; 2CH4 A; 1WXT A; 4J9G A; 1CKB A; 1W1F A; 2YUO A; 2DMO A; 3ULR B; 1WFW A; 4IIM A; 2CDT A; 3REA B; 1GBR A; 2H8H A; 1UG1 A; 1SPK A; 2BZX A; 2EW3 A; 2K7A A; 4X1V A; 3R6N A; 2RF0 A; 2GNC A; 4Z88 A; 3PE0 A; 5GJV B; 2HBW A; 2J7I A; 1WI7 A; 4J9I A; 4LUE A; 2RQR A; 1ZUK A; 4M4Z A; 5ECA A; 1YN8 A; 1ZBJ A; 2ECZ A; 2DL3 A; 4OML A; 2F2W A; 3EG3 A; 3VS1 A; 2OI3 A; 4AG1 C; 2RMO A; 2X3W D; 1UJY A; 1AWW A; 1H92 A; 2DA9 A; 1QKX A; 2L3S A; 1QLY A; 1PKS A; 2EPD A; 3KFV A; 3UAT A; 1AWX A; 2V1Q A; 2EGE A; 4J9B A; 1JXM A; 4WCI A; 2CSI A; 2KE9 A; 2QDL A; 1E6G A; 2KRS A; 1LCK A; 1UJ0 A; 2PNI A; 1QKW A; 3VS0 A; 4J9H A; 1M3A A; 2V1R A; 2AKL A; 3H41 A; 2DJQ A; 3QWY A; 3UF4 A; 2GTJ A; 1WYX A; 1YP5 A; 3PVQ A; 1TG0 A; 3THK A; 4EIK A; 1YWP A; 1WXU A; 4HCK A; 1UUE A; 4OMP A; 2O9V A; 3M0S A; 3EG2 A; 1PKT A; 5IXF A; 1JU5 C; 1OPL A; 2DRM A; 2VWF A; 3IQL A; 5IH2 A; 1ZX6 A; 2JXB A; 2LQW A; 2RQW A; 1HSQ A; 2HEQ A; 2K9G A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3V8J A; 2D9T A; 3CC7 T; 2CUB A; 4RMO A; 1OU8 A; 1IO6 A; 3JB9 I; 2KQW A; 1GCP A; 1TH7 A; 1H3H A; 4C8Q D; 4DBF A; 3OW2 S; 1NPP A; 3CPW S; 4FYX B; 2KRN A; 3RR6 A; 4DBR A; 5IHI A; 2VVK A; 3M5A A; 1Y71 A; 3C12 A; 1QWE A; 1BI0 A; 5IN1 A; 2XK0 A; 1VYT A; 1WLP B; 2QXF A; 5GMK i; 3CD6 Q; 3CCV T; 1LNX A; 2L8D A; 3NMZ C; 1MV0 B; 1G3W A; 1ABQ A; 1BI2 A; 4FYV B; 3I5R A; 1TUD A; 4IUQ A; 4F7U G; 5LJ3 j; 4M75 C; 3BW1 A; 2RQV A; 1YJW T; 4PJO C; 5A0G A; 2L3R A; 3WXM B; 4JPB W; 3FC3 A; 4FSS A; 3RMS A; 3OA6 A; 1WGS A; 1W70 A; 2E64 A; 1EX4 A; 2EIF A; 3M0R A; 3NTI A; 4ANJ A; 1Q82 U; 2YSQ A; 3TRE A; 1BB9 A; 4N4G A; 5J39 A; 3CXC P; 2LMJ A; 3CC4 Q; 3TCJ A; 3OYM A; 1M1K U; 3RKY A; 1GCQ A; 5J3B A; 5CKF A; 1YI2 T; 2JS0 A; 2EQU A; 3A8O B; 4FU6 A; 4JJC A; 3BDL A; 2JM9 A; 1FMV A; 3CCL A; 3MHX A; 4KH1 B; 5GMK j; 2D0N A; 5I21 A; 1JJ2 A; 5GAO p; 1YJN Q; 2DZC A; 2JW4 A; 4KRT A; 5KYW A; 1VQ4 T; 4C92 F; 2EQI A; 4Z8A A; 2XMF A; 3UA6 A; 2LTO A; 5CVI A; 2RK2 A; 5FU7 B; 3QZ9 B; 4ATO A; 1QVG A; 1WA7 A; 1QCF A; 2EGC A; 5GAN f; 3I5S A; 2C0T A; 3NTK A; 2DD5 A; 2VGN A; 3L2Z A; 3CC2 A; 2OJ2 A; 3E19 A; 1MMN A; 5KYW B; 1BYM A; 5EG2 A; 1SEM A; 3O5Z A; 2LZ6 B; 3JCM e; 5LL6 S; 3X25 B; 2A37 A; 1NBE B; 3J81 E; 2COW A; 3JCM c; 3L2W A; 3HSB A; 1UGQ B; 2EYW A; 4ELZ C; 2KXD A; 2QQB A; 5HK0 A; 5FLX E; 3E9F A; 1MMA A; 3QXE B; 3MPU B; 4JLI A; 3M0P A; 4J9E A; 4M77 A; 2M02 A; 4XAX B; 2DVJ A; 1DJ7 B; 4EMK C; 1GFC A; 1K73 U; 4M7A A; 3V7C A; 3HFN A; 2JS2 A; 2MWP A; 4C5G A; 1AWO A; 3QJ6 A; 5GAN 7; 2DK3 A; 1X2Q A; 3H0H A; 1VQ7 T; 4JUV A; 2A7Y A; 2D8J A; 3TEE A; 2KT8 A; 1NYF A; 4PJO F; 1JO8 A; 3U23 A; 4F17 A; 3HRS A; 4OMN A; 4M77 B; 4BI8 B; 1QVF S; 1I07 A; 4E7H A; 4M7A B; 3LH5 A; 4JRQ A; 4LN2 A; 5GAN 2; 1ZHI A; 5CKE A; 2K79 A; 1UGS B; 3JB9 D; 2RI2 A; 2RB6 A; 1IRX A; 4IKF A; 1M1G A; 1K9A A; 3V7S A; 4A4G A; 2XDD A; 4E7K A; 3NPF A; 4PK4 A; 3PTA A; 3C95 A; 1Z9Z A; 3CCM Q; 4XU3 A; 2HAX A; 4RTV A; 5GAM g; 4M7D A; 3X20 B; 3Q1J A; 3C4S A; 4A4E A; 4JZ4 A; 3PMT A; 4PJJ A; 1G2B A; 1U06 A; 2RHI A; 3EGD A; 4HCZ A; 2JMC A; 4DEX A; 2KSS A; 1SRM A; 1RLQ C; 2HQH A; 3OW2 A; 1ZA2 B; 5LJ3 h; 4M7D B; 3CPW A; 1B3Q A; 1N6A A; 2P0P A; 5DM7 R; 1YJN T; 3JCM P; 2AHJ B; 1I1J A; 3EGD B; 1X01 A; 1ZUY A; 2FZC B; 5AT1 B; 3PIP A; 4HA8 A; 4ESR A; 1ZQ1 A; 2CP5 A; 1SSF A; 2E10 A; 3E2U A; 1FWZ A; 4DEY A; 1GBQ A; 5GAN 8; 2KI7 A; 3LYI A; 2K3B A; 2KBT A; 4HVW A; 3JCM Q; 2MYS A; 1LJO A; 2F1L A; 4FIB A; 1JRI A; 3G71 A; 2J6O A; 4RTT A; 4MZM A; 5GMK h; 3I55 T; 1KSW A; 3OYA A; 4F7U F; 1LPL A; 1NPR A; 5FW9 A; 2RH2 A; 1OV3 A; 5CO7 A; 2DNU A; 4BB7 A; 4LD9 K; 4KUI A; 2I0N A; 3FDR A; 3MKD A; 3HP9 A; 2VC8 A; 1SF9 A; 2PVD B; 2P4R A; 1VQK A; 1MNE A; 2E65 A; 4HVV A; 2HSE B; 2VYT A; 1PNJ A; 2ROT A; 2LJ3 A; 4L59 A; 1VQ9 A; 3LGF A; 1VA7 A; 4MDW A; 2RPN A; 1WHM A; 1VYV A; 5AYF A; 4F14 A; 1RAE B; 1NM7 A; 3HL8 A; 3CCQ A; 2GBQ A; 1EZZ B; 3CPF A; 1RAG B; 1T0J A; 4DOV A; 3LW5 E; 1FMK A; 3MEU A; 2QA4 Q; 3NGP A; 4QVZ A; 2X4Y A; 2RNA A; 1ZSZ C; 2EYQ A; 5GAO q; 1OYX A; 4M78 G; 1JBM A; 2DJZ A; 3ZL7 C; 2DYB A; 1RUW A; 1AVZ C; 1O75 A; 3MEV A; 4LE9 A; 1QW1 A; 3CCL T; 1Y7X A; 3KXT A; 2LJ1 A; 4HCC A; 1VOM A; 4FSX A; 4DQ2 A; 3EFR A; 1S72 Q; 2VXE A; 1G83 A; 3REB B; 3OYB A; 3JCM f; 1YJ9 Q; 4J9G A; 1K9M C; 5IAY A; 2E3H A; 2YUO A; 5C6S A; 1UGP B; 3HPW A; 2CDT A; 2FVU A; 3QSU A; 2H8H A; 1UG1 A; 2B8A A; 5GAO m; 4Z88 A; 3CC2 T; 3OYC A; 5GJV B; 2LT1 A; 2E12 A; 4LUE A; 4BI3 A; 3OBY A; 1YI2 A; 1YN8 A; 3QDF A; 4NL3 A; 3T9N A; 4HKE A; 1TTH B; 2P4T A; 3TQ7 P; 2F2W A; 1QVF A; 2RMO A; 1PCX A; 1QVP A; 1AWW A; 1H92 A; 3ZEH A; 1X6O A; 2DA9 A; 2L3S A; 3M59 A; 5GAN j; 1M2O A; 3KFV A; 1R77 A; 3G4S Q; 1M8V A; 2K5I A; 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2LCL A; 2FRY A; 4J6X A; 2VAS A; 2VXF A; 2C0O A; 4M75 A; 4PJO A; 1VQ8 Q; 3M56 A; 4CC3 A; 4PJM A; 4PJO D; 4RUG A; 3CC4 A; 4J8O A; 3EHQ A; 1U1S A; 3CBO A; 2ZGW A; 2NWM A; 4ME7 A; 3FJP A; 2L89 A; 2BTT A; 3I9Q A; 3CXC A; 2BZY A; 4FT2 A; 4AFU C; 1K0S A; 4FW2 A; 3FJ5 A; 4M75 B; 4PJO B; 6AT1 B; 4N4H A; 4M78 F; 1X75 C; 2GGR A; 4LXC A; 3L1A A; 2NUZ A; 2DL4 A; 2L3P A; 2RHU A; 1D3B A; 1A0N B; 4GLK A; 4A63 B; 2HDA A; 4AFQ C; 2LDM A; 3P8B B; 1WNL A; 5KH6 A; 1VQ9 T; 4J5Y A; 2DIL A; 4BD3 A; 5D6W A; 1AEY A; 3CCS Q; 5M9O A; 3CCQ T; 2P0K A; 3LWI A; 5GAN h; 4F16 A; 3VS2 A; 2QEX Q; 3A98 A; 3PNW C; 4XTW A; 2EFI A; 1X2K A; 2HD0 A; 1OOT A; 2GF7 A; 4ELY C; 4C8Q A; 4D6W A; 1XTD A; 5GAO l; 3OS2 A; 1D3B B; 4VUB A; 1BI1 A; 2CRE A; 1YIT T; 2D0Q B; 2GFU A; 1WXB A; 4BUG A; 1TUG B; 4F7U E; 4RTX A; 1OQK A; 2E3I A; 2RJF A; 4E7Z A; 2QQR A; 2LNH B; 1UHF A; 5LJ3 d; 4EMG A; 3H9N A; 4C8Q B; 2CH4 W; 3RIR A; 5LJ3 g; 3VS4 A; 5GAN 6; 5CR2 A; 2Y4X A; 2KGT A; 1JB0 E; 2MMP A; 1M30 A; 2PQW A; 4EMK A; 2L5Q A; 3DB4 A; 3HTR A; 4J9C A; 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