The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
|
sequence length |
58
|
structure length |
58
|
Chain Sequence |
PNLFVALYDFVASGDNTLSITKGEKLRVLGYNQTGEWCEAQTKNGQGWVPSNYITPVN
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Tyrosine-protein kinase ABL1
|
| publication title |
Crystal structure of the Abl-SH3 domain H59Q-N96T mutant
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| molecule tags |
Transferase
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| total genus |
11
|
| structure length |
58
|
| sequence length |
58
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2013-02-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2K3B A; 2OJ2 A; 1BK2 A; 2DRM A; 2J6K A; 4R0K A; 2CDT A; 4Z88 A; 1UHF A; 4J9F A; 1CKA A; 2JM9 A; 2HEQ A; 2JM8 A; 1K76 A; 2F2W A; 2KRS A; 4X1V A; 2CRE A; 1X69 A; 2ROT A; 4LNP A; 4K11 A; 1GBQ A; 2H8H A; 2HBW A; 2DL5 A; 1OPL A; 3PVL A; 4JJB A; 1OPK A; 1MV3 A; 2KBT A; 2RPN A; 2DBK A; 1QKW A; 4RTW A; 2KXD A; 2EPD A; 2EYY A; 1WYX A; 1SRM A; 3KFV A; 2O31 A; 3A98 A; 1I0C A; 3VRZ A; 4CC7 A; 1Y57 A; 2D1X A; 2KR3 A; 1ZLM A; 4J9D A; 1UTI A; 2DL4 A; 4HVW A; 1UE9 A; 2CH4 A; 4F14 A; 2EQI A; 2DJQ A; 5IXF A; 5IH2 A; 2HDA A; 3H0F A; 2J6F A; 2AKK A; 2LMJ A; 4AG1 C; 1TUD A; 2DX1 A; 2G6F X; 1OV3 A; 3I5S A; 5FWC A; 2KXC A; 1NM7 A; 2RQW A; 2D8H A; 2MOX A; 2YUP A; 2LQN A; 1UJ0 A; 2RMO A; 2CT4 A; 1GFC A; 1UHC A; 2FPF A; 1T3L A; 4DEY A; 2EGA A; 2L3S A; 2O88 A; 2HSP A; 2L3P A; 4GLM A; 1VYT A; 4JZ4 A; 1VYV A; 2EGE A; 3PE0 A; 1UJY A; 3M0U A; 2AK5 A; 2EVR A; 2M51 A; 3VS3 A; 1M27 C; 2X3X D; 1SPK A; 4LE9 A; 4J9C A; 2YUN A; 3EG0 A; 3UA6 A; 4AFZ C; 1GCP A; 3H0I A; 4LN2 A; 2VWF A; 4HVU A; 1HJD A; 1U5S A; 3TSW A; 2DIL A; 2K9G A; 1AWW A; 1PRM C; 2LCS A; 1UDL A; 2A08 A; 2E5K A; 3M0Q A; 1SSH A; 2XMF A; 2X3W D; 5IXB A; 1CSK A; 1G2B A; 4IIM A; 2RF0 A; 1NLP C; 1TUC A; 3VS5 A; 1K1Z A; 4KRT A; 2DF6 A; 1WXB A; 4RTV A; 1PNJ A; 2ABL A; 4IIO A; 4JJC A; 1ARK A; 2AKL A; 2BZY A; 3VS6 A; 3VS1 A; 4Z89 A; 2CSI A; 2RQR A; 4ESR A; 3VS2 A; 1FMK A; 3GBQ A; 4Y92 A; 2ECZ A; 4QT7 A; 1K0X A; 1KJW A; 1NYF A; 1T3S A; 2ED0 A; 2M0Y A; 2CSQ A; 2YUO A; 2D0N A; 3THK A; 2PZ1 A; 1ABQ A; 3VS4 A; 2B86 A; 1T0H A; 2DE0 X; 1W6X A; 2AZV A; 5HCK A; 3EG2 A; 1AZG B; 3M0P A; 1AEY A; 1B3Q A; 3REB B; 1A0N B; 2GQI A; 2D8J A; 2KT1 A; 4OMN A; 2DNU A; 1WXU A; 1NLO C; 5I11 A; 1X6G A; 1YN8 A; 1IO6 A; 2V1Q A; 4J9H A; 1AWX A; 1M3C A; 3U23 A; 3QWY A; 2F2X A; 1E7O A; 2RNA A; 4JPB W; 1GCQ A; 2YUQ A; 2EW3 A; 1KIK A; 1X6B A; 2VVK A; 3I35 A; 1K4U S; 3I5R A; 2J7I A; 2J05 A; 2W10 A; 1WLP B; 2A37 A; 2NUZ A; 4AG2 C; 3TVT A; 2DRK A; 3H0H A; 2K79 A; 2O9V A; 4HCK A; 1JEG A; 2SEM A; 1S1N A; 1SRL A; 1WX6 A; 2KRN A; 1GBR A; 1I1J A; 4RUG A; 2JTE A; 2LJ3 A; 1OOT A; 1N5Z A; 2LNH B; 2MIO A; 3EHR A; 1NG2 A; 3VS0 A; 4D8K A; 2LQW A; 2GNC A; 1E6G A; 2GGR A; 1GRI A; 3M0R A; 2DL3 A; 1BU1 A; 1Y0M A; 2DL7 A; 2VKN A; 2KE9 A; 1BBZ A; 2J6O A; 3FJ5 A; 2BTT A; 3TSZ A; 1XOV A; 2DVJ A; 1QCF A; 2DBM A; 1V1C A; 1K9A A; 1U3O A; 2C0O A; 1ZUK A; 2F2V A; 4J9G A; 1G83 A; 2DM1 A; 2DYB A; 5GJW B; 1AOJ A; 5IHI A; 3UAT A; 2CUD A; 2YDL A; 3NHN A; 2RN8 A; 2C0I A; 1WIE A; 1GL5 A; 3EG3 A; 2CUB A; 1I07 A; 1QKX A; 1NEG A; 1WXT A; 2CH4 W; 1ZUU A; 1W70 A; 4J9B A; 4M4Z A; 3VRY A; 5GJV B; 5L23 A; 4F17 A; 3I9Q A; 4LUE A; 2YT6 A; 1ZSG A; 1X43 A; 3SHW A; 1BB9 A; 3PVQ A; 2FEI A; 5FWB A; 2SRC A; 2K7A A; 1AVZ C; 1NYG A; 2L0A A; 1YWP A; 2DL8 A; 2L3Q A; 1YWO A; 2J06 A; 1AWJ A; 1CKB A; 1YCS B; 1PKS A; 1PRL C; 3SEM A; 2BZ8 A; 4E6R A; 2EGC A; 1UFF A; 3EGU A; 2JS2 A; 2L2P A; 1RI9 A; 3EG1 A; 1ABO A; 2EYW A; 2O2O A; 1HSQ A; 2FRW A; 1W1F A; 3ZL7 C; 4AFS C; 2YSQ A; 4A63 B; 1M30 A; 1AWO A; 2FRY A; 2EYX A; 1MV0 B; 1NEB A; 2RQU A; 1JXO A; 2P4R A; 3M0T A; 1GCQ C; 1UEC A; 2CT3 A; 2DA9 A; 2ROL A; 3ULR B; 1UUE A; 1M8M A; 2LZ6 B; 1E6H A; 2RQV A; 2JMC A; 1K0S A; 1JXM A; 1Z9Z A; 2LX7 A; 4OMQ A; 1M3A A; 2HCK A; 2A28 A; 2FPE A; 1WDX A; 1X2K A; 1Z9Q A; 1JQQ A; 2KNB B; 5ECA A; 2EYZ A; 1AD5 A; 3VS7 A; 3O5Z A; 1PHT A; 1WFW A; 2LP5 A; 4CC2 A; 2OI3 A; 2C0T A; 4LUD A; 3RBB B; 2I0N A; 2K2M A; 2KRM A; 3UF4 A; 2BZX A; 1UG1 A; 2ENM A; 5FW9 A; 2LJ0 A; 2KEA A; 3IQL A; 2JW4 A; 2JMA A; 1KSW A; 1QLY A; 3QWX X; 2PNI A; 1RUW A; 2ED1 A; 2JT4 A; 2K6D A; 4FSS A; 1B07 A; 1SEM A; 4CC4 B; 1VA7 A; 2DMO A; 1YNZ A; 1JU5 C; 4JJD A; 2KT8 A; 1AZE A; 4GBQ A; 3NMZ C; 1H8K A; 1OEB A; 1U06 A; 1H3H A; 1HD3 A; 1WA7 A; 4OML A; 1JO8 A; 1SHF A; 4J9I A; 5IHK A; 4ZNX A; 1X2Q A; 4J9E A; 4AFQ C; 4JZ3 A; 2JS0 A; 4D8D A; 5I22 A; 1M3B A; 2KGT A; 4DEX A; 1YP5 A; 3C0C A; 4Z8A A; 1TG0 A; 4HVV A; 2JXB A; 2GBQ A; 3NPF A; 2GTO A; 2FO0 A; 4HXJ A; 2IIM A; 1SHG A; 1QWE A; 4ORZ A; 1QWF A; 1T0J A; 1UGV A; 4CC3 A; 2KYB A; 4RTZ A; 1EFN A; 2LJ1 A; 2RQT A; 4AFU C; 1WI7 A; 2FPD A; 1PKT A; 1ZX6 A; 3NGP A; 4RTX A; 3CQT A; 1H92 A; 1FYN A; 2A36 A; 3LH5 A; 4OMO A; 1LCK A; 1RLQ C; 3JV3 A; 3M0S A; 2FG0 A; 3REA B; 4EIK A; 4WCI A; 1J3T A; 1X27 A; 1PWT A; 2KYM A; 2MCN A; 5IHN A; 4RTT A; 3RNJ A; 3UA7 A; 3EHQ A; 2EKH A; 3H41 A; 4OMM A; 1GFD A; 1KFZ A; 1ZBJ A; 2DLP A; 2O9S A; 2EBP A; 4RTU A; 1MUZ A; 1ZUY A; 2PTK A; 2W0Z A; 4F16 A; 4OMP A; 1VYU A; 1RLP C; 5EC7 A; 2QDL A; 2ESW A; 3R6N A; 2KRO A; 2V1R A; 2GTJ A; 2NWM A; 2OAW A; 4RTY A; 2AZS A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3MP6 A; 3A1P A; 5GAO l; 2RHZ A; 3PNW C; 4B9X A; 1LOJ A; 2HEQ A; 2F2W A; 5KYN A; 2DK3 A; 2CRE A; 2DFU A; 2GFU A; 4XQ3 A; 1X69 A; 2H8H A; 2HBW A; 2HMA A; 4XAX B; 5LJ5 j; 4M7D D; 1MV3 A; 4M78 B; 1VQ8 Q; 1D0Y A; 5KYW A; 4M75 F; 3CC7 Q; 1ZLM A; 4J9D A; 3CCM Q; 1VQ6 T; 2LDM A; 5IH2 A; 3Q1J A; 3H0F A; 3ZEH A; 1VUB A; 1TUD A; 2L5Q A; 2DX1 A; 3I5S A; 1M1K U; 1VQL Q; 2CZ0 B; 4QW2 A; 1VQ7 Q; 1NM7 A; 2YUP A; 1YJN A; 3D7S B; 1ZA2 B; 1ZBX A; 1UJ0 A; 2B8A A; 1T3L A; 1M2V A; 4DEY A; 1WHH A; 2HSP A; 3ZBD A; 2YHT A; 2M16 A; 2BE7 D; 3HL8 A; 2EGE A; 1IGQ A; 3CBM A; 2CP5 A; 1UJY A; 2AK5 A; 1G3W A; 2RJD A; 2EVR A; 2QGF B; 2M51 A; 3VS3 A; 3PFS A; 4A4F A; 2RI3 A; 3CCV A; 4XU2 A; 2OTL Q; 3CCE Q; 1DJ7 B; 5LJ3 h; 1B34 B; 1GCP A; 1D09 B; 3OQ5 A; 1U5S A; 7AT1 B; 4JRP A; 3OYC A; 2K9G A; 1PRM C; 1QW1 A; 2A08 A; 2MAM A; 2PVG B; 1CSK A; 3JCM b; 4FCY A; 2LCL A; 1NLP C; 1TUC A; 2CGH A; 2EKO A; 1VOM A; 3RR6 A; 2DF6 A; 4MZT A; 3JCM e; 2ABL A; 2COW A; 3LGL A; 1WHL A; 3HPW A; 1ZHI A; 4JJC A; 5LJ5 e; 1ARK A; 3CCL Q; 2A3L A; 1K9M U; 3BE3 A; 3RDV A; 3LWI A; 2CSI A; 2RQR A; 4ESR A; 5GAO m; 1YJN T; 3J81 E; 4KGX B; 5CKH A; 3M57 A; 4OB2 B; 1O75 A; 2DD4 A; 1R77 A; 5LJ3 j; 2XI9 A; 4QT7 A; 1JJ2 A; 4E7L A; 1V29 B; 1G3S A; 1KJW A; 1NYF A; 2DET A; 1C6V X; 3JRZ A; 5L8R E; 5GAN h; 4ZTF A; 1T3S A; 4XU0 A; 4N4I A; 1IB8 A; 2YUO A; 2EQJ A; 4E7S A; 1UB4 A; 2EJG A; 3M54 A; 1ABQ A; 3VS4 A; 4A53 A; 2QGG A; 5AT1 B; 3VUB A; 1W6X A; 3WXM B; 1IHW A; 1AZG B; 1M5Q 1; 4PJO G; 1D1C A; 5HKC A; 5LL6 S; 1A0N B; 3MO8 A; 2DO3 A; 1NLO C; 4M7D F; 4F04 B; 2NYS A; 4J9H A; 2PQW A; 1M3C A; 4PJM A; 2H3E B; 2DEQ A; 2EW3 A; 1X6B A; 4OP0 A; 6AT1 B; 5GAN j; 3RIR A; 2ATC B; 1D3B A; 4MML A; 2L8D A; 3H0H A; 4DBH A; 4M7A G; 2K79 A; 1OZ3 A; 3OS2 A; 3M5A A; 5KE2 A; 2VYT A; 1JEG A; 1M2O A; 2SEM A; 1IRX A; 4HCZ A; 1YFN A; 3OMG A; 3OYH A; 1WX6 A; 1GBR A; 3QZ9 B; 4BB7 A; 1I1J A; 1VQ8 A; 1YI2 A; 2FZK B; 5KH6 A; 1LPL A; 2RHX A; 1OOT A; 1N5Z A; 2VGN A; 3CC7 A; 1I5L A; 2MIO A; 3CME A; 4M78 D; 3VS0 A; 4D8K A; 2LQW A; 1E6G A; 1VQ4 Q; 3OYG A; 5GMK h; 3JAM E; 2DL7 A; 4KUD K; 1Y96 A; 2LQK A; 4XU3 A; 2AT1 B; 1BBZ A; 2J6O A; 2YXY A; 2QQA A; 2BTT A; 2BUD A; 1VQL A; 1KQS A; 3M53 A; 1VQ7 A; 1TWB A; 2X4X A; 1VQN T; 2LC4 A; 2JN0 A; 4Z02 A; 1V1C A; 1U3O A; 3H8Z A; 2DM1 A; 1AOJ A; 5IHI A; 4FYV B; 2CP2 A; 3CPW P; 2CUD A; 3NHN A; 2RN8 A; 1WIE A; 3GP8 A; 2X9H A; 1KD1 R; 1QKX A; 4M4Z A; 3VRY A; 5GMK j; 5GJV B; 4F17 A; 2OTL A; 2YT6 A; 4GY5 A; 3EG9 B; 4NL2 A; 2O4X A; 1VQM Q; 1BB9 A; 5FWB A; 2K7A A; 1YI2 T; 4EMK C; 1YWP A; 5GAN e; 3JCM Q; 2J06 A; 1X01 A; 5HK3 A; 1YIT A; 1PRL C; 2K5I A; 3SEM A; 1PD0 A; 1U1S A; 3CME T; 4E6R A; 3RMS A; 2L2P A; 3NTI A; 2EYW A; 3TEE A; 2DTO A; 3EH2 A; 4A4E A; 4PJO B; 4AFS C; 3BY7 A; 1VQL T; 1IZ6 A; 3CCL A; 4PJJ A; 3M0T A; 1Q86 R; 1GCQ C; 3QPH A; 2CT3 A; 3SWN B; 3ULR B; 4J7I A; 1E6H A; 3HFN A; 2WSC E; 1X75 C; 2LX7 A; 1QVF A; 1M3A A; 1UGS B; 2RHY A; 2FPE A; 1D1B A; 1JQQ A; 1Z9Q A; 2DTH A; 1XTD A; 4J6W A; 3L2Z A; 5I21 A; 4M7A B; 1TUG B; 1YJW A; 1I4K 1; 1IXD A; 1WFW A; 4AMC A; 4CC2 A; 2OI3 A; 3I56 Q; 2PVO B; 3PGG A; 3UF4 A; 2EJ9 A; 4BE1 A; 2DPP B; 4XTZ A; 2ZPG B; 3PTA A; 5CKE A; 2LJ0 A; 3CPW S; 1VQ5 Q; 3FIF A; 4L6V 5; 1FXX A; 1RUW A; 1MMG A; 1YIT T; 4FSS A; 2A7Y A; 4M78 F; 4MMK A; 5CKD A; 1SEM A; 4CC4 B; 2DMO A; 2DJZ A; 1YNZ A; 3OBY A; 1OYX A; 3E9G A; 3NMZ C; 2LVM A; 5D6W A; 1H8K A; 3CCL T; 1H3H A; 4J9E A; 4MZP A; 2BKD N; 1IHV A; 4D8D A; 2LT4 A; 1TG0 A; 4HVV A; 1RAD B; 3CCJ T; 5FRN A; 4OVA A; 2ZPH B; 2GBQ A; 1PCX A; 4ZGJ B; 1IGU A; 2FO0 A; 3EGD A; 4HXJ A; 2LT1 A; 1AT1 B; 5J3B A; 2A0F B; 2EJF A; 4NL3 A; 3LWH A; 4JLG A; 1VQ4 A; 3V8L A; 4BY6 C; 3E1S A; 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1C1A A; 4GLM A; 4MZM A; 2E65 A; 2GFA A; 3V7C A; 3OYD A; 2Y4Y A; 3OYK A; 1M27 C; 1G3T A; 2VAS A; 3M55 A; 3AT1 B; 3RER A; 4LE9 A; 2P84 A; 1OQK A; 4J5Y A; 2R5A A; 1BI0 A; 1MNE A; 3A8G B; 2YUN A; 3EG0 A; 3UA6 A; 4AFZ C; 4FU6 A; 3H0I A; 4O6J A; 5A0G A; 1HJD A; 4PFZ A; 1EX4 A; 3TSW A; 3OYJ A; 1UDL A; 2E5K A; 2LQ8 A; 2EQU A; 2X3W D; 1QVP A; 1K73 C; 2DXU A; 2HAX A; 3MP8 A; 1G2B A; 2KI7 A; 5HY6 A; 2RHU A; 3VS5 A; 3G71 Q; 2COZ A; 4KRT A; 2YRD A; 3JB9 H; 1XNI A; 3MP1 A; 3VS6 A; 2NUP B; 4Z89 A; 4J6X A; 3JCM h; 5LJ5 h; 2FZG B; 3NFC A; 5GAM e; 2MK5 A; 4M77 E; 4R56 A; 2WSE E; 5FLX E; 1FMK A; 4Y92 A; 3I56 T; 4GLK A; 1VQO A; 3CC4 T; 5DLQ E; 5CKB A; 4DBF A; 1YHQ Q; 2M0Y A; 4C8Q A; 4PKC C; 1FMW A; 3R6O A; 2CSQ A; 3SD4 A; 3OYL A; 2GCX A; 1VQK Q; 2XDB A; 1KD1 U; 3THK A; 2PZ1 A; 1OX8 A; 2B86 A; 2DE0 X; 1NBE B; 2WAC A; 3N5B B; 2VXF A; 4IUV A; 2IG0 A; 2CZ7 B; 5KCH A; 4BDY A; 1N27 A; 1IO6 A; 4PJO F; 2YWW A; 3RKX A; 3QWY A; 4E2F B; 4RG8 A; 4JPB W; 4LDY A; 3CCS T; 4HKE A; 4BI4 A; 2VVK A; 3CCR Q; 2NUT A; 2QQR A; 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