The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
57
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structure length |
57
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Chain Sequence |
VDYIVEYDYDAVHDDELTIRVGEIIRNVKKLQEEGWLEGELNGRRGMFPDNFVKEIK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| publication title |
Atypical Polyproline Recognition by the Cms N- Terminal SH3 Domain.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
CD2-ASSOCIATED PROTEIN
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| total genus |
13
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| structure length |
57
|
| sequence length |
57
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-09-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4ESR A; 3EGU A; 3NHN A; 4E6R A; 2YUO A; 1OPK A; 1GCQ A; 4X1V A; 2ROT A; 3C0C A; 2GNC A; 4OMN A; 2DYB A; 2HDA A; 2SEM A; 3UA7 A; 2RF0 A; 1SRM A; 3UF4 A; 1K4U S; 2DNU A; 2VWF A; 3I9Q A; 2JW4 A; 2L3P A; 2EW3 A; 1UFF A; 2ED1 A; 2DL4 A; 3VS4 A; 2A28 A; 3REA B; 5IHI A; 3ZL7 C; 4RUG A; 1K0X A; 2FRW A; 2OAW A; 1EFN A; 2L3Q A; 3VS5 A; 2LNH B; 1AD5 A; 3VS6 A; 2RNA A; 2DF6 A; 2DBM A; 4J9H A; 2J6F A; 4OMO A; 4D8K A; 2EGE A; 4FSS A; 3VS1 A; 2PZ1 A; 1UEC A; 2KEA A; 1TG0 A; 2X3W D; 3IQL A; 1MUZ A; 1WXT A; 1YN8 A; 4JZ3 A; 4ORZ A; 4AFU C; 1HJD A; 4OMM A; 3M0R A; 4D8D A; 2YUN A; 2IIM A; 1K0S A; 2LX7 A; 2FRY A; 2ROL A; 2DRM A; 2XMF A; 3EG1 A; 1E7O A; 2KYM A; 4K11 A; 1T3S A; 3VS0 A; 1HD3 A; 2KRM A; 2ECZ A; 2RMO A; 2LCS A; 1SRL A; 5L23 A; 1XOV A; 2EYW A; 2EYZ A; 2L3S A; 4GBQ A; 2O31 A; 2CSQ A; 2GTJ A; 2FPE A; 1OV3 A; 5I11 A; 2O2O A; 2SRC A; 5FWC A; 3RBB B; 3EHQ A; 4CC7 A; 3M0S A; 3CQT A; 1PKS A; 4IIM A; 1UJY A; 1ZUK A; 4ZNX A; 3I5S A; 1OEB A; 5FWB A; 1AWX A; 1VYU A; 1AWJ A; 2KR3 A; 1WLP B; 4LN2 A; 2CDT A; 2D1X A; 1ZX6 A; 3LH5 A; 1GBR A; 1OPL A; 1YP5 A; 3EG2 A; 2F2X A; 1AZE A; 1ZLM A; 1JU5 C; 3QWY A; 1WFW A; 2AKK A; 2DM1 A; 3VRY A; 4JJC A; 2JMA A; 2P4R A; 2RQU A; 2M0Y A; 2ENM A; 3PVL A; 2DVJ A; 4J9I A; 4CC4 B; 4RTU A; 2EGC A; 1G83 A; 2JXB A; 5I22 A; 1TUC A; 3H41 A; 1MV0 B; 2DRK A; 1NG2 A; 1Y0M A; 1X2K A; 2JS0 A; 3I35 A; 1U5S A; 2NWM A; 1WIE A; 2W10 A; 4HCK A; 1Z9Z A; 2K3B A; 2HBW A; 4Z88 A; 1QKW A; 2GQI A; 3THK A; 4HVW A; 2A37 A; 1I07 A; 2DLP A; 2FPD A; 1B07 A; 3EG0 A; 1KIK A; 1PWT A; 2AZS A; 1M3A A; 1V1C A; 1UG1 A; 2KNB B; 1RLQ C; 1A0N B; 2YUP A; 1G2B A; 2EVR A; 4EIK A; 2FEI A; 2C0T A; 1CKA A; 2DBK A; 4A63 B; 1UHF A; 3TSW A; 1GRI A; 2KYB A; 3M0Q A; 1GCP A; 1H92 A; 2EPD A; 2RN8 A; 2AKL A; 4J9C A; 2LMJ A; 3NMZ C; 2DL3 A; 2OJ2 A; 2D8J A; 1PKT A; 1YCS B; 3M0T A; 2L0A A; 2RQW A; 4AFQ C; 2EYY A; 3NGP A; 3NPF A; 1AOJ A; 2V1Q A; 1X27 A; 4LUE A; 1K9A A; 1WA7 A; 2OI3 A; 2GTO A; 2LJ3 A; 2EQI A; 1UDL A; 1JXO A; 2GBQ A; 4JJD A; 2GGR A; 2X3X D; 4HVV A; 1RI9 A; 4Z89 A; 2FG0 A; 1PRM C; 2CT3 A; 2J6O A; 3KFV A; 4J9F A; 1SHG A; 2JS2 A; 2KXC A; 1X6B A; 3VS2 A; 4J9E A; 4F14 A; 1I1J A; 4OMQ A; 2BZX A; 4RTV A; 1AWW A; 1Y57 A; 4LNP A; 1AZG B; 1UE9 A; 1FMK A; 1KJW A; 5GJW B; 2YT6 A; 1GFD A; 2DJQ A; 2E5K A; 1E6H A; 2YSQ A; 5IXB A; 5ECA A; 2JMC A; 1NM7 A; 3REB B; 3TVT A; 1NYF A; 1OOT A; 2HSP A; 1X69 A; 2LP5 A; 2JM9 A; 3EHR A; 1WDX A; 2BZY A; 4J9G A; 2A08 A; 1K76 A; 4Y92 A; 2MIO A; 2K9G A; 4HVU A; 2VKN A; 1ZUY A; 1U06 A; 3VS3 A; 2C0I A; 2CH4 A; 3M0U A; 4F16 A; 2YUQ A; 2RQR A; 2DL7 A; 1GCQ C; 4WCI A; 2LJ0 A; 2KBT A; 3SEM A; 4AFS C; 4GLM A; 4JJB A; 1X43 A; 2DX1 A; 1QKX A; 4KRT A; 2F2V A; 5HCK A; 3PE0 A; 1J3T A; 1SPK A; 1M3B A; 1Z9Q A; 2O88 A; 1FYN A; 1VA7 A; 2MOX A; 2F2W A; 5FW9 A; 1UTI A; 3UAT A; 1H8K A; 4RTZ A; 1M8M A; 2I0N A; 2JTE A; 2CRE A; 4RTW A; 2BTT A; 4J9D A; 3A98 A; 2H8H A; 1W1F A; 1T3L A; 1KFZ A; 2K6D A; 2DA9 A; 4RTX A; 2JM8 A; 2ED0 A; 4IIO A; 2RQV A; 2FO0 A; 3VS7 A; 1M3C A; 1TUD A; 1MV3 A; 4OMP A; 3H0H A; 2YDL A; 1I0C A; 2ABL A; 3QWX X; 2AZV A; 4RTY A; 1M27 C; 5IXF A; 2M51 A; 1YWO A; 2ESW A; 3I5R A; 4JPB W; 2LZ6 B; 2J7I A; 2FPF A; 2CSI A; 4LE9 A; 2EYX A; 3U23 A; 1LCK A; 4RTT A; 3H0I A; 2D0N A; 1HSQ A; 3H0F A; 1NEB A; 3UA6 A; 1ABO A; 2DL5 A; 4R0K A; 2KXD A; 2PNI A; 2PTK A; 2JT4 A; 2EGA A; 2CH4 W; 2J06 A; 2VVK A; 1QWF A; 1T0H A; 1NYG A; 1ABQ A; 1JQQ A; 1PRL C; 4AFZ C; 4M4Z A; 1QLY A; 1AEY A; 2A36 A; 1UUE A; 1WXU A; 2DE0 X; 4DEX A; 4OML A; 1T0J A; 1B3Q A; 1SSH A; 2J6K A; 1GFC A; 2LQN A; 2RQT A; 1WI7 A; 4AG1 C; 1JXM A; 1YNZ A; 5IH2 A; 2CT4 A; 1E6G A; 4J9B A; 3EG3 A; 2KT1 A; 1SHF A; 2W0Z A; 2MCN A; 3VRZ A; 1W6X A; 2DIL A; 5EC7 A; 2KRS A; 1WXB A; 1GL5 A; 2QDL A; 2EKH A; 1U3O A; 1ZUU A; 5IHN A; 1QCF A; 4DEY A; 2KRO A; 4F17 A; 1VYV A; 3GBQ A; 1KSW A; 1BU1 A; 1PNJ A; 1SEM A; 4LUD A; 1GBQ A; 2LQW A; 3JV3 A; 2EBP A; 2G6F X; 1CSK A; 3SHW A; 1AVZ C; 1JEG A; 1ZBJ A; 1PHT A; 2DL8 A; 1CKB A; 4AG2 C; 1IO6 A; 5IHK A; 1JO8 A; 1RUW A; 5GJV B; 2KRN A; 4CC3 A; 4CC2 A; 2NUZ A; 2AK5 A; 2C0O A; 4HXJ A; 2HEQ A; 3FJ5 A; 2BZ8 A; 2HCK A; 1ARK A; 3PVQ A; 1NLO C; 2DMO A; 2K7A A; 2O9V A; 2O9S A; 1ZSG A; 1UJ0 A; 2J05 A; 1M30 A; 1S1N A; 2B86 A; 1WX6 A; 4QT7 A; 1K1Z A; 1BB9 A; 2LJ1 A; 3R6N A; 1X2Q A; 3M0P A; 1YWP A; 1W70 A; 1NLP C; 2L2P A; 2RPN A; 2V1R A; 2KT8 A; 3RNJ A; 2K79 A; 2D8H A; 1BBZ A; 3O5Z A; 1VYT A; 1NEG A; 2KE9 A; 1UHC A; 4Z8A A; 4JZ4 A; 2CUD A; 1RLP C; 1X6G A; 1QWE A; 3TSZ A; 1AWO A; 1N5Z A; 1H3H A; 2CUB A; 1BK2 A; 1UGV A; 2KGT A; 3ULR B; 2K2M A; 1WYX A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3CC4 Q; 4R56 A; 3NHN A; 4HCZ A; 5GMK h; 4XTX A; 2DYB A; 4XU0 A; 3RES A; 5A2Q E; 1Q95 G; 3FLG A; 1K4U S; 1WQW A; 2EQU A; 2L3P A; 2EW3 A; 1UFF A; 2DL4 A; 2A28 A; 3REA B; 2E1H A; 5IHI A; 3ZL7 C; 1VQM A; 3CME A; 4QKU A; 4PJO D; 3CCL Q; 2JN0 A; 2LNH B; 4ZN1 A; 3JCM b; 2FZG B; 3S6W A; 1M2V B; 3UDC A; 3JCM c; 1NJI C; 3VS1 A; 2PZ1 A; 5GAN 3; 4EPC A; 2YWW A; 3RUX A; 2E6Z A; 2HSE B; 4PJO F; 2ATC B; 1MUZ A; 1D3B B; 2JNG A; 1YN8 A; 4JZ3 A; 1M1F A; 4FU6 A; 2CP3 A; 4OMM A; 3SWN B; 2IIM A; 4A4G A; 2ROL A; 1NJI R; 1B34 B; 2P4T A; 3EG1 A; 1E7O A; 4N0A C; 3VS0 A; 2YXY A; 3D7S B; 1HD3 A; 4M75 D; 3M55 A; 5L23 A; 2EYW A; 1YHQ T; 1YJW T; 2GTJ A; 2FPE A; 2MYS A; 5I11 A; 3PTA A; 4PJO B; 2EYQ A; 4M7A D; 4CC7 A; 3JCM W; 3M0S A; 5GMK l; 5AYF A; 1UJY A; 4NS5 A; 2MWP A; 3I5S A; 1JJ2 A; 1D09 B; 1AWX A; 1S72 A; 1OZ3 A; 1M4Z A; 4B9X A; 1WLP B; 1BKB A; 4EMK C; 3R6O A; 4M7A F; 1ZX6 A; 2V8I A; 4PK4 A; 3GLX A; 1OPL A; 1YP5 A; 2NUT A; 2F2X A; 2VUB A; 4M78 G; 1YBY A; 1ZLM A; 5LJ3 h; 4M75 B; 2AKK A; 3EG9 B; 2DM1 A; 4DBF A; 1Q86 C; 3VRY A; 2JMA A; 1YIT Q; 2M0Y A; 3FC3 A; 2DVJ A; 4XTU A; 3JB9 I; 2DER A; 4CC4 B; 3MP8 A; 4RTU A; 2RJF A; 4M7A B; 1VQ5 Q; 3H41 A; 1MV0 B; 2DXC A; 2DRK A; 1ZSZ A; 1X2K A; 3QO3 A; 2HBW A; 2GQI A; 1NPR A; 2GCX A; 3AT1 B; 2V8J A; 1QQJ A; 2DLP A; 5GAN h; 4C5I A; 7AT1 B; 2AZS A; 1V1C A; 1XJW B; 5KCH A; 3I55 Q; 1BI0 A; 3HTR A; 2GF7 A; 1CKA A; 1OQK A; 5GAN 7; 4XK8 E; 4X34 A; 1GRI A; 3M0Q A; 1GCP A; 5GAM d; 2EPD A; 4OMF B; 1VQK Q; 1VQL A; 2OJ2 A; 3CD6 Q; 1YCS B; 4DBR A; 4C92 E; 3QYG B; 3N5B B; 2BIV A; 1JJ2 S; 4AFQ C; 2EFI A; 1QVG A; 3GF5 A; 3JSC A; 1N9S A; 1H3Z A; 3M4G A; 2XDB A; 4HCB A; 2QEX Q; 5LJ3 j; 2LJ3 A; 2KMT A; 1NJI U; 1JXO A; 3QDF A; 5GAN 5; 4KT0 E; 3JCM h; 4HVV A; 2CZ6 B; 1GXI E; 5KE3 A; 2CT3 A; 4J9F A; 4PKC C; 2IVW A; 1N6A A; 4OMQ A; 2XG8 D; 2BZX A; 1RAE B; 4DQ2 A; 4IUT A; 1JBM A; 4FL6 A; 4OP0 A; 5LJ3 g; 3CC7 A; 1FMK A; 4IUV A; 5GAN j; 5GJW B; 2ZPF B; 4F04 B; 3G71 A; 1D1B A; 2DJQ A; 4FW1 A; 2E4H A; 2RJC A; 5ECA A; 2NLU A; 4M77 G; 3JCM V; 2HSP A; 1OZ2 A; 1VQ8 T; 4J9G A; 2BZY A; 3RDV A; 4AT1 B; 3G7Z A; 2FL7 A; 5I21 A; 2MIO A; 4A4K A; 4C5E A; 4RCC A; 3OSV A; 2JUF A; 1BIB A; 5GAN g; 2RQR A; 2DL7 A; 1G3W A; 3M54 A; 4WCI A; 2LJ0 A; 3QDR B; 2KBT A; 3SEM A; 4AFS C; 1PSF A; 3QBY A; 3NTI A; 1X43 A; 2DX1 A; 3FJP A; 1EIF A; 3RKW A; 4FCY A; 4PJJ A; 2HD0 A; 2DTI A; 5FU7 B; 5HCK A; 1YJ9 T; 1YHQ Q; 3HRT A; 1YJW Q; 1XNI A; 2E5Q A; 1VA7 A; 2QGF B; 4KBM B; 1UTI A; 4RTZ A; 4FSX A; 1VOM A; 2RHX A; 3A98 A; 2H8H A; 1MND A; 2NUT B; 1W1F A; 1T3L A; 2KDS A; 4C8Q D; 2K6D A; 4GLK A; 3VU3 C; 3CBO A; 3VYH B; 1UEB A; 4M75 G; 3PIO A; 5GAO n; 2FO0 A; 1WZO A; 1TUD A; 3CEY A; 3EAE A; 3CXC P; 2OAU A; 4KUL A; 5CKE A; 1I0C A; 3QWX X; 4RTY A; 2AZV A; 3JCM g; 3MEU A; 4M7A G; 3X24 B; 1ZSZ B; 2LZ6 B; 3PNW C; 3JB9 D; 2EYX A; 4KH0 B; 1YJN A; 1LJO A; 5LJ5 d; 2D0N A; 1F1B B; 1VQ4 A; 4OGC A; 1I5L A; 3JB9 F; 2EGA A; 5I2S A; 3OYI A; 1QWF A; 1YI2 T; 3CCR A; 2K3X A; 4M78 A; 1NYG A; 1JQQ A; 1PRL C; 3OB9 A; 3ZBD A; 1UB4 A; 1WXU A; 5CKD A; 3SD4 A; 2LNV A; 3TU4 K; 1QVF P; 2COY A; 3G4S T; 1YNZ A; 1RAC B; 4EDU A; 3JCM f; 3PIP A; 2K5F A; 1D1A A; 1VQ6 T; 2KT1 A; 2CYZ B; 2HL3 A; 2MCN A; 3VRZ A; 3CCS T; 2WAC A; 3NFC A; 4JRK A; 1U3O A; 5CKB A; 2QTV A; 4DEY A; 1U1S A; 1R0B G; 2M02 A; 2DVE A; 3MHX A; 1VYV A; 2RHU A; 1MMG A; 1I5O B; 2LVM A; 2Z0W A; 5GAM e; 1K8A C; 1RAG B; 3CC4 A; 1SEM A; 4Y91 A; 2OTJ T; 1RL2 A; 3OMC A; 4C0G A; 2EQJ A; 5KYX A; 1AVZ C; 3V8K A; 1TTH B; 1K8A R; 3H8Z A; 1PHT A; 1IO6 A; 5IHK A; 4CC2 A; 2KRN A; 4QQG A; 5FRN A; 3X28 B; 4BE1 A; 2RI5 A; 2AK5 A; 3G6E T; 1X01 A; 2HEQ A; 3FJ5 A; 3CCL A; 1ARK A; 4PL6 A; 1NLO C; 3JCM X; 5D6Y A; 1RI0 A; 4F7U E; 2HL5 C; 5GAO q; 3V8L A; 2DPP B; 3QKJ A; 4JDS A; 3GPL A; 4ATO A; 2NUP A; 2DFU A; 4FIB A; 4QT7 A; 1BB9 A; 2LJ1 A; 3R6N A; 1HK9 A; 1X2Q A; 1VQ7 A; 1VQ8 Q; 2RPN A; 3KUF A; 2X35 A; 2Y90 A; 3C94 A; 3JAM E; 1BBZ A; 1VYT A; 4MML A; 6AT1 B; 2CP0 A; 3E19 A; 2QXF A; 2GQV A; 1PCX A; 3CCU T; 4BY6 B; 3CCV T; 4NL2 A; 1VQP T; 3PGG A; 4XU3 A; 1MGQ A; 1M2V A; 5GAO r; 4M77 A; 1YJ9 Q; 3GIB A; 2HZY A; 5A0G A; 2ZAE A; 3L2R A; 3EGU A; 1D3B A; 1OPK A; 1GCQ A; 2ROT A; 4OMN A; 4M78 D; 2K5I A; 3SWN A; 5IAY A; 1B34 A; 2KY9 A; 5C0M A; 2ED1 A; 3QJ6 A; 1ZBX A; 1G3Y A; 4L6V 5; 4RUG A; 1JB0 E; 4M78 F; 3LW5 E; 2K57 A; 2YLC A; 3VS5 A; 4BDZ A; 3VS6 A; 2RNA A; 2DF6 A; 2J6F A; 1C6V X; 4D8K A; 3GP8 A; 3L2Z A; 1M9S A; 1VQ5 A; 1N9R A; 3VUB A; 1TG0 A; 3IQL A; 1D0Y A; 1O75 A; 4JRQ A; 4MZM A; 3WXM B; 2WSE E; 4E47 A; 3OYA A; 2YUN A; 1K0S A; 4C8Q G; 2FRY A; 2DRM A; 4M78 B; 3CCJ T; 4FYX B; 2KYM A; 2DZ9 A; 3VV0 A; 2KRM A; 3DKM A; 2RMO A; 2LCS A; 3I55 A; 4M75 A; 1KQ2 A; 2O31 A; 5CVI A; 2R5M A; 1K8A U; 5LJ5 e; 1YI2 Q; 1VQ9 A; 2XIC A; 4KUI A; 5FWC A; 3OW2 A; 2QG9 B; 3M56 A; 4LDU A; 1LVK A; 4IIM A; 3CMA T; 4QW2 A; 4KGX B; 1UGS B; 2NYS A; 4M7D E; 3G4S Q; 3UPU A; 3CD6 A; 1KQS S; 1WHM A; 1IZ6 A; 3LH5 A; 5IN1 A; 4DOV A; 1Q82 C; 1GBR A; 1VQ6 Q; 1D1C A; 3EG2 A; 3CCS Q; 2LTO A; 2E10 A; 1I4K 1; 2Y4Y A; 2QA4 A; 2DET A; 3SWN C; 2QEX A; 3MPU B; 1VQO T; 2RQU A; 4C92 A; 3PVL A; 4J9I A; 5DY9 A; 1Q82 R; 3I56 T; 1W2B P; 2EGC A; 2JXB A; 4JLI A; 5KYX B; 2I2L A; 2EIF A; 5KCO A; 3TRE A; 2FZC B; 3DB4 A; 3EH2 A; 2EWN A; 2C06 A; 1U5S A; 4PJO C; 3OYF A; 2W10 A; 1UGQ B; 4HCK A; 1Z9Z A; 2OTJ Q; 1OU8 A; 1RAH B; 4JRI A; 2E65 A; 1QKW A; 2DYI A; 3THK A; 3OYB A; 2A37 A; 1I07 A; 2FPD A; 4C0Z A; 2A7Y A; 5HY6 A; 1KIK A; 1WHH A; 2WSF E; 2VV5 A; 4J7F A; 4LXC A; 4M77 D; 2LC4 A; 4MZT A; 1RLQ C; 2NUP B; 2V8K A; 3BDU A; 1P92 A; 3G6E Q; 2M9U A; 3MKD A; 2XDP A; 2LT1 A; 1YIJ Q; 1BCM A; 2MAM A; 4A63 B; 5GAN 8; 4M77 F; 1UHF A; 5FRM A; 5CQX A; 3OW2 S; 4J9C A; 1XQH A; 2RHZ A; 3NMZ C; 3CPW S; 1R8O B; 4M7A C; 3HKS A; 3CCQ A; 3M0T A; 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