The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
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sequence length |
98
|
structure length |
98
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Chain Sequence |
GSSGSSGQKGWFPASHVKLLGPSSERATPAFHPVCQVIAMYDYAANNEDELSFSKGQLINVMNKDDPDWWQGEINGVTGLFPSNYVKMTTDSSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The solution structure of the fifth SH3 domain of intersectin 2 (KIAA1256)
rcsb |
| molecule tags |
Endocytosis/exocytosis
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule keywords |
intersectin 2
|
| total genus |
6
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| structure length |
98
|
| sequence length |
98
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-05-01 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1AWW A; 4JZ4 A; 1YNZ A; 1QKW A; 1RLP C; 2RN8 A; 3NMZ C; 1SHG A; 1K0S A; 1SRM A; 1EFN A; 1PNJ A; 4J9G A; 3UA6 A; 1FMK A; 3EG3 A; 4LUE A; 1GFD A; 3M0U A; 2ED1 A; 1QCF A; 5HCK A; 2A36 A; 5L23 A; 1CKA A; 2DL8 A; 3FJ5 A; 2OI3 A; 4OMP A; 2JM9 A; 2RQU A; 1WDX A; 1J3T A; 2DL7 A; 2JW4 A; 2J6F A; 2YSQ A; 2K2M A; 4JJC A; 1GL5 A; 2ED0 A; 1H8K A; 2KEA A; 1W6X A; 4F16 A; 1U3O A; 2CDT A; 2JMC A; 1NM7 A; 1Z9Q A; 1GBR A; 1MV3 A; 3VS4 A; 1M3B A; 5IXF A; 2RPN A; 2YUO A; 2EYZ A; 3I5S A; 2LX7 A; 2NWM A; 1PHT A; 2EVR A; 2JS0 A; 5IHI A; 4E6R A; 1K0X A; 2C0I A; 1HD3 A; 2RQT A; 4DEY A; 2DVJ A; 1X43 A; 4JJB A; 1WLP B; 4OMM A; 1I0C A; 1H3H A; 2SEM A; 3VS2 A; 2L3P A; 1KFZ A; 3VS0 A; 5I11 A; 1SSH A; 2HCK A; 4EIK A; 2J06 A; 1NLP C; 1G2B A; 1KJW A; 1OOT A; 2JTE A; 2DJQ A; 4D8D A; 1E6G A; 2FO0 A; 4HVU A; 3THK A; 1Y0M A; 4HVW A; 2AKL A; 3NPF A; 1TG0 A; 1M30 A; 2D1X A; 1E7O A; 2DE0 X; 4J9F A; 1VYV A; 2JS2 A; 2O2O A; 1RI9 A; 5GJV B; 1PRM C; 2CT3 A; 4OML A; 2K9G A; 3UAT A; 1T0H A; 4RTT A; 1YWP A; 3H0I A; 4CC2 A; 3H41 A; 2EYY A; 2FPF A; 3REB B; 1ABO A; 2EPD A; 5I22 A; 1NLO C; 2MCN A; 1B07 A; 2GBQ A; 1PKT A; 5IHK A; 4R0K A; 1CSK A; 2KRS A; 1TUD A; 1NG2 A; 4HVV A; 4IIM A; 1AD5 A; 2DBM A; 1IO6 A; 2EW3 A; 1YN8 A; 4AFU C; 3H0H A; 1LCK A; 1QWE A; 4IIO A; 2L3Q A; 3SEM A; 2LJ0 A; 1X6G A; 2FRY A; 1ZUK A; 4J9B A; 1MV0 B; 4LE9 A; 1UEC A; 3VRZ A; 4F17 A; 4AFQ C; 2GNC A; 4JJD A; 3NHN A; 4RTZ A; 1HSQ A; 1WYX A; 2P4R A; 4D8K A; 2HSP A; 4M4Z A; 1UJ0 A; 2DM1 A; 2KYM A; 4GBQ A; 4J9C A; 5EC7 A; 3JV3 A; 1UHF A; 1AWX A; 2KR3 A; 2CUD A; 3VS3 A; 1M27 C; 1JQQ A; 3EG1 A; 1UG1 A; 2F2W A; 3O5Z A; 1VYT A; 2OJ2 A; 1Z9Z A; 2BZY A; 2MIO A; 2XMF A; 4Z88 A; 2LNH B; 2CSQ A; 2YDL A; 1PWT A; 2RNA A; 3H0F A; 1K76 A; 2F2X A; 3U23 A; 4K11 A; 1OEB A; 1VYU A; 2YT6 A; 2GGR A; 1QKX A; 3CQT A; 2FRW A; 1I07 A; 1X69 A; 2DBK A; 2ENM A; 2AK5 A; 2CRE A; 2ROT A; 1WXB A; 4OMQ A; 2C0T A; 1V1C A; 2SRC A; 2J6K A; 2W0Z A; 2GQI A; 1H92 A; 5FWC A; 4F14 A; 2KXC A; 4RTW A; 1OPL A; 2HDA A; 1JO8 A; 2KNB B; 2A37 A; 1YCS B; 2LP5 A; 3RBB B; 2YUP A; 1BBZ A; 1OPK A; 1SRL A; 2J7I A; 2EYW A; 1ZLM A; 1UFF A; 1AOJ A; 2CH4 W; 4DEX A; 1GFC A; 1WXU A; 1I1J A; 2L2P A; 2EGA A; 1ZBJ A; 1YP5 A; 1RLQ C; 2O9S A; 1X27 A; 2O88 A; 1ZUY A; 4LUD A; 1SPK A; 2ABL A; 1TUC A; 4WCI A; 2M0Y A; 4J9E A; 2K6D A; 1T3S A; 2V1R A; 2DMO A; 4AG2 C; 4LNP A; 2LJ3 A; 2LMJ A; 1X2Q A; 2EQI A; 2NUZ A; 1U06 A; 2KXD A; 1S1N A; 2KT1 A; 3NGP A; 2EGE A; 1M3A A; 3RNJ A; 3IQL A; 3M0Q A; 3ZL7 C; 2KT8 A; 2GTO A; 4QT7 A; 3PE0 A; 3REA B; 1BK2 A; 1T3L A; 4LN2 A; 1ABQ A; 2KRN A; 3ULR B; 4GLM A; 1SHF A; 3LH5 A; 2F2V A; 3I5R A; 2W10 A; 2EGC A; 1G83 A; 2E5K A; 2ECZ A; 3C0C A; 1WIE A; 4AFS C; 4RTY A; 3EG2 A; 3I9Q A; 2DRK A; 2PZ1 A; 2EKH A; 1KIK A; 3I35 A; 2QDL A; 2BZX A; 3KFV A; 2D8H A; 4ORZ A; 2C0O A; 1RUW A; 1NEG A; 2KE9 A; 2AZS A; 1X2K A; 2B86 A; 2EBP A; 2HEQ A; 3TSW A; 2L0A A; 3EHQ A; 5FW9 A; 1X6B A; 1K4U S; 1M3C A; 2BTT A; 1U5S A; 4A63 B; 2DL3 A; 1GCQ C; 2RQV A; 2CSI A; 2YUQ A; 2AZV A; 1AZG B; 1ZX6 A; 1WX6 A; 2H8H A; 3M0P A; 4Y92 A; 2BZ8 A; 3GBQ A; 4OMO A; 3UA7 A; 2G6F X; 5IHN A; 1JXO A; 1UUE A; 4X1V A; 1GCQ A; 1UDL A; 4OMN A; 2J6O A; 1KSW A; 1K1Z A; 1YWO A; 1UE9 A; 4KRT A; 3SHW A; 2O9V A; 1NEB A; 1WXT A; 4HCK A; 2X3W D; 2HBW A; 2DF6 A; 2KYB A; 2DL4 A; 2LJ1 A; 1UTI A; 2RQW A; 1QWF A; 2M51 A; 4ESR A; 4J9D A; 2CH4 A; 4HXJ A; 2PTK A; 1CKB A; 2KRO A; 2DNU A; 2KGT A; 2OAW A; 4Z8A A; 4Z89 A; 2V1Q A; 3M0S A; 1ZSG A; 2FG0 A; 2X3X D; 2CUB A; 1NYF A; 1UJY A; 2K3B A; 4RTV A; 2K7A A; 2D8J A; 2JM8 A; 4J9I A; 2JT4 A; 2J05 A; 5FWB A; 3VS5 A; 1HJD A; 1WA7 A; 2A28 A; 2L3S A; 2GTJ A; 4AG1 C; 2RMO A; 3QWY A; 2AKK A; 2DL5 A; 3M0T A; 1SEM A; 1AWO A; 1PKS A; 1JXM A; 2LQN A; 2DA9 A; 5GJW B; 2JXB A; 3TVT A; 2ESW A; 5ECA A; 2RQR A; 1N5Z A; 1AWJ A; 2IIM A; 3VS1 A; 2KBT A; 1M8M A; 1ZUU A; 1GRI A; 2RF0 A; 1GCP A; 4JPB W; 3VRY A; 1UHC A; 2FPE A; 3M0R A; 1E6H A; 1A0N B; 3VS7 A; 2A08 A; 1JU5 C; 3QWX X; 3VS6 A; 5IH2 A; 2YUN A; 2D0N A; 2EYX A; 1MUZ A; 4J9H A; 1ARK A; 2FPD A; 4CC3 A; 1K9A A; 2FEI A; 1AVZ C; 1WFW A; 3PVL A; 2VVK A; 1PRL C; 3A98 A; 4CC7 A; 1FYN A; 1Y57 A; 4JZ3 A; 4RTU A; 2VKN A; 4AFZ C; 2CT4 A; 2O31 A; 2DRM A; 1GBQ A; 1OV3 A; 3PVQ A; 1UGV A; 2KRM A; 3R6N A; 2LZ6 B; 2DLP A; 4FSS A; 2JMA A; 1AEY A; 1W70 A; 2PNI A; 2DIL A; 1JEG A; 1XOV A; 2I0N A; 3EGU A; 3EG0 A; 1T0J A; 1WI7 A; 3UF4 A; 2LQW A; 4ZNX A; 4CC4 B; 2ROL A; 2MOX A; 3EHR A; 4RUG A; 1BU1 A; 2DYB A; 1NYG A; 2VWF A; 3TSZ A; 1VA7 A; 5IXB A; 1AZE A; 1B3Q A; 1W1F A; 2DX1 A; 2K79 A; 1BB9 A; 1QLY A; 4RTX A; 2LCS A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4PL6 A; 3MP8 A; 4JZ4 A; 3UWN A; 5FU6 B; 3OYL A; 1RLP C; 1KHC A; 4PFZ A; 1SHG A; 3OSV A; 1SRM A; 3UDC A; 1KG1 A; 1EFN A; 1D0X A; 7AT1 B; 4JJN K; 4M75 E; 4Q5W A; 4F7U E; 2FB7 A; 4JRQ A; 1VQK T; 5HCK A; 4E7J A; 2A36 A; 2HZY A; 4OMP A; 1NJI R; 2QQB A; 3OYY A; 4PJO G; 1K73 R; 2DL7 A; 3CC7 Q; 1GL5 A; 1UEB A; 2ED0 A; 3CXC S; 4ELZ C; 4DBH A; 1U3O A; 4JS4 A; 2JMC A; 2FVU A; 1M3B A; 1TSF A; 5IXF A; 2DK3 A; 5D6Y A; 2EVR A; 2JS0 A; 4E6R A; 5HY6 A; 3RER A; 4RCC A; 3MCA B; 1QP2 A; 1KFZ A; 1Y71 A; 5I11 A; 3GF5 A; 1PSE A; 5GAO q; 4DBQ A; 3E1S A; 2ZCF B; 3EFO B; 1EIF A; 2DJQ A; 1E6G A; 2FL7 A; 3CC7 T; 4HVU A; 3LYI A; 1MMN A; 2LVM A; 3THK A; 1BI2 A; 4HVW A; 2DTI A; 2EWN A; 4J9F A; 2O2O A; 1YJN A; 1PRM C; 2CT3 A; 3A8L B; 1ZA2 B; 2CZ6 B; 3EGX B; 3UAT A; 2FZG B; 1Q95 G; 1SKU B; 2HSE B; 3H41 A; 3CC4 A; 3CD6 Q; 2EYY A; 4QKU A; 4M7D G; 2M9U A; 3OYK A; 4A53 A; 2A0F B; 4HT8 A; 3TEE A; 3LGL A; 4M78 E; 1FX7 A; 3CEY A; 1NG2 A; 2EKO A; 2F5T X; 3VUZ A; 5IAY A; 2QQR A; 4IIM A; 2XDP A; 1AD5 A; 3J7A F; 4N4G A; 1C0M A; 1U1T A; 1R0C B; 3CBO A; 1LCK A; 4IIO A; 3QO3 A; 2ATC B; 2FRY A; 4J9B A; 2CZ1 B; 3CC2 Q; 2PVG B; 2O4X B; 4C5E A; 2AHJ B; 2RO0 A; 4M7A B; 4F17 A; 4AFQ C; 2GNC A; 1ACM B; 1F1B B; 1VQ8 A; 2P4R A; 5A0D A; 4M4Z A; 2I2L A; 3OY9 A; 4PJO F; 2DM1 A; 2GFU A; 2RD1 A; 4ZTJ A; 3CD6 T; 3OYA A; 5FRN A; 4KGV B; 2QAZ A; 2B8A A; 2KR3 A; 4PFO A; 4EMK B; 4LDV A; 1M27 C; 3CCM A; 3WXM B; 2EQM A; 3EG1 A; 1UG1 A; 3ZEH A; 4J6Y A; 2XMF A; 2VGM A; 4Z88 A; 2LNH B; 1NJI C; 2CSQ A; 1S72 Q; 2YDL A; 1PWT A; 1R77 A; 3HFO A; 4DBF A; 1K76 A; 5GMK h; 5I2M A; 1K73 C; 2GGR A; 3CC2 T; 1QKX A; 2OTL Q; 4QQG A; 4MDW A; 4X34 A; 1X69 A; 4HA8 A; 2ENM A; 4L6V 5; 1NE8 A; 1X01 A; 2C06 A; 2M16 A; 2MF2 A; 4J8O A; 4C8Q C; 2GQI A; 3LLR A; 2KXC A; 3CPF A; 3BE3 A; 1JO8 A; 3QG1 A; 2DZC A; 1LVK A; 2X4X A; 2P0Q A; 2LP5 A; 1SRL A; 2ZAE A; 5KYX A; 4A4E A; 1WJS A; 1ZLM A; 2NUP A; 1S72 T; 1VQL A; 1AOJ A; 2CH4 W; 1WXU A; 2L2P A; 2AT1 B; 3JB9 H; 1YP5 A; 2O9S A; 2OTL T; 2F5K A; 3D7S B; 3S3N A; 3X25 B; 3G4S Q; 3E9G A; 3MJX A; 1UGP B; 3CCR Q; 1ZSZ B; 1Q81 R; 5FU7 C; 4P5N A; 2M0Y A; 1T3S A; 2DMO A; 2V8K A; 2LJ3 A; 2CKK A; 4XAX B; 4RG8 A; 4XTV A; 1D3B A; 1UGQ B; 2YXY A; 1Q82 U; 1KHI A; 1RAA B; 3RNJ A; 1Q7Y U; 4NS5 A; 2DFU A; 3REA B; 1BK2 A; 2PUO B; 1JJ2 P; 4PJO B; 1ABQ A; 2KRN A; 3ULR B; 5CAI A; 4GLM A; 4C92 A; 2F2V A; 4FYY B; 2COZ A; 4M77 A; 1KQS S; 1G83 A; 1WIE A; 4RTY A; 2ZZD A; 2GQV A; 2EKH A; 3G4S T; 1KIK A; 2QDL A; 5C0M A; 2D8H A; 2C0O A; 1RUW A; 1P92 A; 3CCR T; 1WQW A; 4DOW A; 5LJ5 g; 3TSW A; 1I5L A; 2L0A A; 4JRK A; 4QVZ A; 5FW9 A; 1BIA A; 1VQM A; 1M3C A; 2BTT A; 1OX8 A; 4JLG A; 2VV5 A; 3H6Z A; 5CQY A; 3GOX A; 4EPC A; 1ZX6 A; 5KYW B; 3M53 A; 2RI3 A; 2G6F X; 3A8O B; 5IHN A; 1JXO A; 1UUE A; 1GCQ A; 5A0L A; 4RG2 A; 3FC3 A; 1KSW A; 1ZHI A; 2JNG A; 2QA4 Q; 4XU2 A; 2MI6 A; 3SHW A; 1NEB A; 1D1A A; 4HCK A; 2HBW A; 4QW2 A; 1UTI A; 1QWF A; 4PK4 A; 4OB0 B; 4E7L A; 2DXT A; 4V2S A; 3C4S A; 1CKB A; 1JJ2 A; 2KRO A; 2DNU A; 2KGT A; 4M7D B; 3L2R A; 3OYH A; 4BAC A; 5CR2 A; 3TCJ A; 1RAH B; 1UJY A; 3M54 A; 2COY A; 1ZBX A; 1M2V B; 2JT4 A; 3FB9 A; 1BKB A; 1U8R A; 1HJD A; 1WA7 A; 2WSF E; 2KK4 A; 4BUG A; 1G5V A; 5GAO p; 3JCM h; 2HL5 C; 2L3S A; 3KUF A; 2QA4 T; 9ATC B; 2CS7 A; 5GAN 7; 1PKS A; 2KAF A; 3LGF A; 1N8R U; 3TU4 K; 4ANJ A; 4OGC A; 5DM7 R; 2JXB A; 4BI3 A; 1Q81 C; 1OZ3 A; 3EFO A; 3CMA A; 5FRM A; 1YJ9 Q; 4TVR A; 1ZUU A; 3MP1 A; 1AT1 B; 1GCP A; 4JPB W; 4M75 G; 3SD4 A; 3EH2 A; 2QQ9 A; 3ZFJ A; 4F7U G; 3TRE A; 4QVC A; 3KXT A; 2A08 A; 3EGX A; 2Z0W A; 2K3X A; 2X35 A; 4J9H A; 3RUX A; 3VV0 A; 2NLU A; 5GAM h; 3S6W A; 2ZGW A; 2CP2 A; 4BY6 B; 3P8D A; 2D0Q B; 4Z02 A; 4MDX A; 2LQ8 A; 1WFW A; 2XHC A; 4IUP A; 4JZ3 A; 1Y57 A; 3MEW A; 3JCM b; 4N0A A; 3M57 A; 1PG5 B; 3QJ6 A; 4ZGD B; 1YJW A; 5CKD A; 3G7Z A; 2O31 A; 3UPU A; 1YJ9 T; 4C0F A; 1OV3 A; 2JTF A; 2R58 A; 2L8D A; 3VYG A; 2OTL A; 3R6N A; 3CCL A; 1YHQ A; 2ZPE B; 1AEY A; 2O4X A; 2P0P A; 1MMD A; 1WHJ A; 4M7A A; 3L1A A; 2VC8 A; 2Y90 A; 3EG0 A; 4AMC A; 1WHK A; 1M90 U; 1VQO A; 3UF4 A; 2LQW A; 5KH6 A; 4ZNX A; 2ZPH B; 3HRS A; 4CC4 B; 5J39 A; 4EMK A; 2DAQ A; 2DEQ A; 3OYE A; 4ZTF A; 4ZGE B; 2K79 A; 2HAX A; 3CCE A; 1AWW A; 1MMA A; 1YNZ A; 2EJF A; 2RN8 A; 1K0S A; 1PNJ A; 1MND A; 3EG3 A; 2AIR B; 4KUD K; 4LUE A; 4C5G A; 4IKF A; 3CCR A; 1G3S A; 2DZ9 A; 3BDU A; 5L23 A; 5GAN h; 1CKA A; 1N9S A; 1VQP A; 3ASK A; 3L42 A; 4BE1 A; 3OS2 A; 3PT9 A; 4M78 G; 2RQU A; 5KYY A; 1WDX A; 1J3T A; 2E4H A; 3BFM A; 3PIO A; 4M75 F; 1M4Z A; 1VQ7 A; 2DXU A; 1H8K A; 2KEA A; 5C6S A; 1M1K R; 4F7U F; 5GMK e; 4KGX B; 1NM7 A; 1GBR A; 2DER A; 1MV3 A; 3VS4 A; 3FEO A; 2DYI A; 2KMT A; 3MO8 A; 3M4G A; 4XU3 A; 4DEY A; 1VQ6 Q; 4M7A G; 3CCJ A; 3V8K A; 1LJO A; 4L59 A; 1RAI B; 1K8A R; 1M5Q 1; 1I0C A; 1EX4 A; 2DVE A; 4OB3 B; 3HFN A; 1SSH A; 2QYZ A; 4C92 D; 4EIK A; 1NLP C; 1G2B A; 1ZSZ A; 2HD0 A; 4D8D A; 3BY7 A; 2BIV A; 1Y0M A; 3QHS A; 3NPF A; 2RH2 A; 1E7O A; 4JRI A; 2DE0 X; 2P0K A; 2M0O A; 5HK3 A; 4DBR A; 2NYS A; 5GJV B; 2JN0 A; 4OML A; 1T0H A; 2RI2 A; 3CCQ A; 4RTT A; 4PJO A; 2MWO A; 2PUK B; 2FPF A; 2KY9 A; 3REB B; 1VQ9 Q; 1ABO A; 1VQ6 T; 5I22 A; 2GBQ A; 4FIB A; 2OTJ Q; 2K3Y A; 4M75 D; 1CSK A; 2CP6 A; 4HVV A; 4FW2 A; 3OMG A; 2GFA A; 1Y96 B; 4DA4 A; 3VYH B; 4AFU C; 1QWE A; 1KC8 C; 3HL8 A; 2QXF A; 3SEM A; 1MHN A; 2X9H A; 1V29 B; 4LE9 A; 4BI4 A; 1UEC A; 2JZ2 A; 3QKJ A; 4M78 F; 4JJD A; 2XIC A; 5KYW A; 4RTZ A; 1HSQ A; 1Q86 U; 1HK9 A; 2HSP A; 1UJ0 A; 1VQ5 A; 4GBQ A; 2KYM A; 4J6X A; 1VQ9 T; 1LOJ A; 2IG0 A; 2HBP A; 3JCM d; 4M75 B; 4JDS A; 1G3Y A; 4F7U B; 2OTJ T; 2K5L A; 4FL6 A; 2F2W A; 2MIO A; 5GAN 8; 4M7D A; 4E7H A; 4M7A F; 2RNA A; 3H0F A; 2FHD A; 2EFI A; 3FLG A; 3U23 A; 1OEB A; 2E10 A; 1YI2 Q; 1M2V A; 1M1F A; 1M1K C; 3CPW S; 2DBK A; 3I56 Q; 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