The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
9
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sequence length |
71
|
structure length |
71
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Chain Sequence |
WKLPSVTVGNPKVSVFGGPFKIEEGKSGYKDVYSSSKGRDLDDGIEVNKKKEKRLVVKDGNPFIIRFKKSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Three-dimensional structure of an unusual Kunitz (STI) type trypsin inhibitor from Copaifera langsdorffii.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Hydrolase inhibitor
|
| molecule keywords |
Kunitz trypsin inhibitor
|
| total genus |
9
|
| structure length |
71
|
| sequence length |
71
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-10-27 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1R8O B; #chains in the Genus database with same CATH topology 1VQM T; 2NUP B; 5CIU A; 3A5Z B; 2VC8 A; 1WZO A; 2Y90 A; 3LWH A; 1UDL A; 4AMC A; 2XDP A; 1SRM A; 2LX7 A; 1TH7 A; 3H0F A; 3G71 T; 1VQO Q; 1M4Z A; 1D0X A; 3RKX A; 2LMJ A; 3C95 A; 4RTU A; 4PFZ A; 1VYU A; 4E7K A; 2AZS A; 5LJ3 h; 2CZ6 B; 2FYK A; 3MO8 A; 1Y71 A; 1AWX A; 2C06 A; 1PRL C; 5I2M A; 4C0G A; 2QA4 T; 4PL6 A; 3SDZ A; 1YJW A; 3UT1 A; 4ZGJ B; 4LDV A; 1YI2 Q; 1G8X A; 1G2B A; 2FB7 A; 2FRW A; 3CC4 A; 1VQL T; 1V76 A; 3H0I A; 5LL6 S; 2LNH B; 5LJ5 g; 1X2K A; 3AT1 B; 1EIF A; 2EGE A; 2JW4 A; 1I81 A; 4F7U G; 4DA4 A; 3PE0 A; 5GAN 5; 3CCV Q; 4OML A; 4MZP A; 4XU1 A; 1LPL A; 3M57 A; 2P0P A; 1B34 A; 2RHU A; 2DMO A; 1WLP B; 5HK3 A; 1RAF B; 1K73 C; 4B6M A; 1W1F A; 3OYB A; 1U06 A; 3QZ9 B; 3EG1 A; 2KI7 A; 2CKK A; 1M1K C; 1GFD A; 2ENM A; 1WX6 A; 4DBH A; 2KXC A; 2R58 A; 2COZ A; 4LD9 K; 2KEA A; 4M78 F; 2K5I A; 2HBP A; 2DEU A; 2KBT A; 3I56 A; 1VQN A; 2F2X A; 3EFO A; 1QQJ A; 4ELZ C; 3DLM A; 2EBP A; 2X4W A; 3CMA A; 2JMA A; 1UFF A; 3LX7 A; 1M2V A; 1I07 A; 2RK1 A; 2E64 A; 2RHX A; 1QVG S; 2KRN A; 4JRQ A; 3RER A; 1BBZ A; 2A3L A; 3CCE T; 2P0K A; 3DKM A; 4HT8 A; 1N6A A; 3C94 A; 1WI7 A; 5HKC A; 2V8I A; 4JS5 A; 4QQ6 A; 3UA7 A; 2DXC A; 5IAY A; 5L23 A; 3HL8 A; 1Q7Y U; 4LDX A; 1NG2 A; 2IPO B; 1S72 Q; 2CP0 A; 2KK4 A; 1QMC A; 3CC2 Q; 1S1N A; 4M78 C; 4D8K A; 3P8D A; 1VQP A; 2FO0 A; 4R56 A; 3HHT B; 4NS5 A; 3H9N A; 3GLX A; 4JLG A; 3OS1 A; 3ASK A; 2NUP A; 2LTO A; 2FHD A; 2DL5 A; 4J9D A; 5GMK e; 4HCZ A; 1QVG A; 3BDU A; 4AFZ C; 2DTO A; 4EDU A; 1G3T A; 1BI3 A; 3HRU A; 1LOJ A; 2SEM A; 4FL6 A; 3CC7 A; 3I5R A; 4DOV A; 4JJC A; 2KNB B; 2MOX A; 1O75 A; 1KQS S; 1YNZ A; 1PCX A; 4JZ3 A; 2LDM A; 3G71 Q; 2O31 A; 4Z02 A; 2RHZ A; 2RHY A; 1AZE A; 3M9Q A; 3JCM b; 4C0F A; 2XU8 A; 2QQS A; 1M8V A; 3C4S A; 3P8H A; 4JS4 A; 3A8O B; 3JCM h; 1JB0 E; 3TEE A; 4Z88 A; 3FEO A; 1MV0 B; 1HK9 A; 3A98 A; 2DTI A; 1QVG P; 3HFN A; 1WXU A; 4RTT A; 4CI0 C; 4KGZ B; 2FL7 A; 2BE7 D; 4J6X A; 1OX8 A; 1KQS A; 3CCR Q; 3LGF A; 3QJY A; 4IUU A; 1CKB A; 4MDX A; 2DE0 X; 3PNW C; 3LLR A; 4AT1 B; 2RPN A; 4CRI A; 4IUR A; 1T0H A; 4M77 C; 1BIB A; 1UEB A; 2X9H A; 2XHC A; 4JJB A; 2QQ9 A; 2XIC A; 2QEX Q; 2RN8 A; 3QYG B; 2DD5 A; 2Y4Y A; 4C92 D; 1J3T A; 2MI6 A; 3M5A A; 4O5V A; 3CXC S; 2CUD A; 2M16 A; 3CPW S; 4M77 D; 5I2S A; 2L89 A; 2QTX A; 5DLO A; 2PVG B; 4AFU C; 3CCQ T; 4ESR A; 3J7A F; 5DY9 A; 3M53 A; 4OVA A; 2GGR A; 3JCM X; 1KQS P; 3CCE Q; 3REB B; 3OYN A; 2ZCF B; 3KXT A; 1WJR A; 1IGU A; 4N0A A; 1RLP C; 3MP8 A; 4JJN K; 4KRT A; 4FM4 B; 5C0M A; 1RAD B; 5FRO A; 2RK2 A; 3VU3 C; 4C8Q C; 3H41 A; 3HTR A; 2PTK A; 4M78 B; 2JNG A; 1QW1 A; 3CXC A; 1NPP A; 3OYA A; 1UTI A; 2FEI A; 3CPW A; 2ZPE B; 1AHJ B; 3VS6 A; 1ZUK A; 3CCS Q; 1YHQ T; 2HL3 A; 4C8Q D; 1RLQ C; 2JTE A; 2LC4 A; 3L1A A; 1NZ9 A; 2DM1 A; 1VQ4 Q; 3PMT A; 1X43 A; 1BI2 A; 1N9R A; 2DF6 A; 4EPC A; 2D0Q B; 4VUB A; 2GNC A; 1X6G A; 1PC0 A; 1T3L A; 2EIF A; 3V8L A; 1OU8 A; 1GL5 A; 5D6X A; 2OI3 A; 3FB9 A; 1ZLM A; 2GCX A; 1GCQ C; 4X1V A; 3CME Q; 3EGX B; 3X28 B; 3CXC P; 4J7F A; 3CPW P; 4M7A D; 1Q81 R; 1VIF A; 2LT4 A; 1OOT A; 4FT4 A; 1AT1 B; 2WAC A; 1TTH B; 2YUQ A; 5GMK h; 2QI2 A; 2OTL Q; 4F14 A; 3OMC A; 2L5Q A; 1C0M A; 5GMK i; 2OX7 A; 2LQN A; 1IB8 A; 5CVI A; 2C0I A; 2KXD A; 2QAZ A; 5GAN f; 1MNE A; 1HD3 A; 2EQU A; 2DLP A; 1VQM A; 1OZ2 A; 1M90 C; 5FU6 C; 3QHS A; 4Z89 A; 2JS2 A; 4N4H A; 4LDW A; 4F7U F; 4A63 B; 4FT2 A; 1SKU B; 3X24 B; 3QZ5 B; 5GAM j; 4XQ3 A; 1ZUY A; 3VRY A; 4M77 B; 2E5K A; 1PD1 A; 3CCJ T; 3M59 A; 3OYJ A; 2A08 A; 3QXE B; 2LCL A; 2E6Z A; 1UGS B; 4Y28 E; 4RTX A; 4ORZ A; 4J9B A; 1KIK A; 1PD0 A; 1UE9 A; 2PVO B; 1D1C A; 1D1A A; 1PRM C; 1AVZ C; 3MP6 A; 5D6Y A; 1ZQ1 A; 3VRZ A; 2DIG A; 4XTW A; 3X20 B; 3A8L B; 1QVF S; 2DYB A; 1FMK A; 3AHU A; 1VQ5 T; 1M2O A; 1VQL A; 2NLU A; 2RM4 A; 1QKX A; 2DO3 A; 1E6G A; 4ZN1 A; 3R6N A; 5LJ5 e; 4BUG A; 1BYM A; 1NEB A; 3CCM T; 4C8Q B; 5IH2 A; 3O5Z A; 4UC4 A; 1UGR B; 4M78 A; 3OS0 A; 5FU7 C; 4J8O A; 2VXE A; 3E2U A; 5GAN j; 2VGM A; 1AWJ A; 1M3A A; 2M02 A; 1I4K 1; 3RMQ A; 1YHQ Q; 2YUN A; 2J7I A; 2HNI A; 5LJ3 f; 1EZZ B; 4ZGE B; 5L8R E; 1WDX A; 4C92 G; 1K73 R; 3M4Y A; 1IRE B; 3FLG A; 1V29 B; 4M77 G; 1QVF A; 3M56 A; 2WSC E; 2RB6 A; 4V2S A; 2L3P A; 4M7D D; 2QGG A; 2MMP A; 1RAE B; 4C5H A; 2DJZ A; 3FIF A; 1PM3 A; 2EKH A; 2DNU A; 2HBW A; 1LNX A; 1PKT A; 3G6E Q; 3EFS A; 1BI1 A; 3EGX A; 2EQK A; 2IG0 A; 3QWY A; 2XDD A; 3I56 Q; 1VQN Q; 5LJ5 d; 2EYZ A; 3TQ7 P; 3CCV T; 4OF1 A; 3VS0 A; 2EKO A; 2E41 A; 5IXF A; 2JN0 A; 1OU9 A; 2ZAE A; 4E7J A; 2BZ8 A; 4F17 A; 2K57 A; 1VYV A; 1QVF P; 4E7S A; 1RAC B; 2GTO A; 4LDY A; 1K8A C; 4OMN A; 4C8Q G; 2CH4 W; 2RJE A; 2EQJ A; 2D8H A; 5FU6 B; 3M4G A; 4FW2 A; 2DEQ A; 3OYY A; 4QVC A; 2YSQ A; 3I9Q A; 2L3R A; 2LQ8 A; 1XJW B; 5FW9 A; 4M77 A; 3OYI A; 2BZX A; 1VQP Q; 3CCJ Q; 3VS4 A; 1B7T A; 1YIJ A; 4D8D A; 3GOX A; 3OBW A; 1WA7 A; 4D6W A; 2P0Q A; 1MV3 A; 2DET A; 2MAM A; 2V8K A; 2BIV A; 3ZFJ A; 1QP2 A; 3LH0 A; 1NYF A; 2YRC A; 4OMQ A; 4XU0 A; 4M7A G; 1UEC A; 5GAN 8; 3CD6 A; 4ZTF A; 1I1J A; 4RMO A; 4BI3 A; 2DKG A; 3G4S A; 1KK7 A; 3CC2 T; 1MMG A; 1NBE B; 3I55 A; 5GAN g; 1VQ9 A; 4FYV B; 4M75 D; 3QBY A; 4OMP A; 4NL2 A; 1IXD A; 2P84 A; 2KRS A; 2H3E B; 4P5N A; 4C8Q A; 1VQ8 A; 2LJ1 A; 3CCM Q; 2J6F A; 1AOJ A; 4J9C A; 5FU7 B; 1WHL A; 2A36 A; 1F1B B; 1ZX6 A; 2CRE A; 2DXU A; 2F5K A; 1VQ6 T; 1MMA A; 4QQD A; 2K9G A; 2RF0 A; 2NYS A; 4DOW A; 4GLM A; 2FPE A; 3SD4 A; 5GAO p; 2NWM A; 2JT4 A; 2JZ2 A; 3NFC A; 4KUI A; 1W4S A; 4J9H A; 2X35 A; 1FWZ A; 4OGC A; 4RTY A; 1WPY A; 3BY7 A; 2JXB A; 2EYX A; 3M0S A; 2LCS A; 1KQ1 A; 2EAY A; 4O6J A; 5LJ5 h; 3JCM f; 4BDY A; 3OS5 A; 1T3S A; 2JMC A; 2F2W A; 2BUD A; 2O88 A; 3QG1 A; 1YJ9 Q; 2E65 A; 2LQW A; 3VS5 A; 3FJ5 A; 3QDR B; 4PJO D; 3QII A; 4ME7 A; 3EGU A; 1GCQ A; 2X4Y A; 1VQK T; 2DBK A; 1G3S A; 2YHT A; 3PGG A; 1PNJ A; 2HQE A; 3JV3 A; 1LCK A; 3BFM A; 5GAN 2; 3A1P A; 4F7U E; 1WXB A; 3CCR T; 3JCM P; 2CSQ A; 5I11 A; 4HCC A; 1I5O B; 4PJM A; 1K73 U; 3A8H B; 1JRI A; 3RNJ A; 3JCM c; 3L2V A; 4J7I A; 4BE0 A; 3HRT A; 1M1K U; 2OAU A; 3MEU A; 3QUI A; 1E6H A; 2E70 A; 1TOV A; 4CC4 B; 2QEX T; 2OTJ A; 1OZ3 A; 1JEG A; 2QK0 A; 3MEA A; 2KY9 A; 2EJG A; 2DD4 A; 2CP3 A; 4KT0 E; 3OW2 P; 2OAW A; 2EW3 A; 3V7S A; 2K5F A; 4KH0 B; 5KE3 A; 4M7D G; 1KFZ A; 3DB4 A; 2GQI A; 2AK5 A; 2JTF A; 3VS2 A; 2ATC B; 4E7I A; 4MZM A; 1Q86 C; 2PZ1 A; 4AG2 C; 1HJD A; 4BY6 C; 4XTY A; 1TUD A; 1TUG B; 4RTZ A; 1WGS A; 4F7U A; 1TU0 B; 1OPK A; 3OYK A; 3OY9 A; 1HYO A; 2LNV A; 3UAT A; 1UG1 A; 4DEY A; 1N8R C; 1K0X A; 1HXD A; 2HCK A; 3PVL A; 2Z0W A; 3OSV A; 4LUD A; 2HSE B; 3OYD A; 2MF2 A; 2QQA A; 3H8Z A; 3CCS T; 3F70 A; 1PHT A; 3EG0 A; 3UWN A; 4AFS C; 2Y4X A; 1EX4 A; 4II1 A; 4FYY B; 4N4G A; 2CS7 A; 1VQ4 T; 3LWI A; 2O9V A; 3EG2 A; 1OEB A; 1VQ6 Q; 1U1T A; 3C12 A; 1JU5 C; 5GAO m; 2M51 A; 4J9E A; 1M90 R; 1SPK A; 5FRM A; 2QQB A; 1M3B A; 2EFI A; 3N5B B; 3EAE A; 1UB4 A; 1X27 A; 1PG5 B; 2K3Y A; 1YIT A; 2YRD A; 1D0Y A; 4C92 F; 2QGF B; 4M77 F; 3CME T; 1KD1 C; 4PLL A; 4XU2 A; 4E7L A; 2F69 A; 3S3O A; 4E7Z A; 2RQR A; 2OTL T; 2RJF A; 4QKU A; 3HRS A; 1VQK Q; 4Y92 A; 2HQH A; 3REA B; 1OV3 A; 4M75 G; 4C0D B; 3CCL T; 3JB9 I; 2M9U A; 1UUE A; 2WSE E; 4JPB W; 3BW1 A; 2DPP B; 3VS7 A; 2K4Y A; 5GAO l; 3U23 A; 1KJW A; 2L2P A; 4NOY A; 3I35 A; 3WVD B; 1YBY A; 4C92 C; 2ABL A; 1OYX A; 2FG0 A; 2KVQ G; 3MPU B; 3J80 E; 2LJ0 A; 1VQO A; 2CZ0 B; 3NMZ C; 4C8Q F; 1YCY A; 3RDV A; 2LCC A; 3JCM g; 4E7H A; 1VQ7 A; 2R57 A; 2A28 A; 2DIL A; 1W2B S; 3M54 A; 2HKQ B; 4ZN3 A; 1FMW A; 5A2Q E; 1KHC A; 2ECZ A; 2DL4 A; 3V8K A; 5GJV B; 3OSS C; 1NJI C; 1YI2 A; 1WYX A; 4PJO G; 5CKB A; 2FZG B; 1SSH A; 2FRY A; 1R8O B; 4RTW A; 4RG8 A; 5CQY A; 4BY6 B; 2RNA A; 4C0Z A; 2DXT A; 1AWW A; 1OUL A; 2I2L A; 4EMH A; 3ZEH A; 2E10 A; 2A7Y A; 2HDA A; 4M7A F; 2CZ1 B; 4HCK A; 1YJW T; 1IHV A; 5GAM e; 3DLL A; 2YLC A; 3E1S A; 2QXF A; 1NYG A; 1IGQ A; 1YN8 A; 2GTJ A; 2P4T A; 4PJL A; 3CC4 T; 1Q82 C; 1ZBX A; 2K2V A; 2C0T A; 4J83 A; 1G5V A; 3EGD B; 1W2B A; 2FZC B; 3OA6 A; 2KT1 A; 4FW1 A; 2K7A A; 4XK8 E; 3LGL A; 1PSF A; 2GBQ A; 3SWN C; 5ECA A; 1K8A R; 2D9T A; 2X4X A; 1AD5 A; 3X26 B; 5DLQ E; 3MCA B; 1HSQ A; 1DJ7 B; 2RO0 A; 2VKN A; 4WTO B; 1KHI A; 2JTM A; 4M7A C; 4QT7 A; 3VS3 A; 1KSW A; 1N27 A; 4KBM B; 3G6E T; 3RKY A; 2E3H A; 1Q95 G; 4L59 A; 2DVJ A; 5CKE A; 3VUZ A; 4BDZ A; 4HCB A; 4ATO A; 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1UGQ B; 4QW2 A; 3CEY A; 1RL2 A; 4PJJ A; 3IQL A; 3OYE A; 4M7D C; 5C6S A; 4IUT A; 1U1S A; 4RKU E; 1C1A A; 3SWN B; 3EG3 A; 2YRV A; 2E1H A; 5CCA A; 4M77 E; 5LJ5 f; 2KRO A; 2C0O A; 4GBQ A; 2DIQ A; 4LUE A; 3EH2 A; 1M1K R; 1SHF A; 1RUW A; 4Y91 A; 2CYZ B; 2KSS A; 4FYX B; 2DTH A; 2ED0 A; 1YP5 A; 4L6V 5; 2QQR A; 4QQG A; 4IIM A; 1YJ9 T; 5KYY B; 1KC8 C; 4M7A B; 1JXM A; 3CCE A; 3L2Q A; 5KH6 A; 2GFU A; 5GAM h; 1WFW A; 1ZA1 B; 2FPF A; 3EFR A; 2LX9 A; 4GY5 A; 2YXY A; 2XD0 A; 1GBR A; 4RCB A; 2DL8 A; 2LP5 A; 5KYX B; 5GAN 7; 3CMA Q; 4LDU A; 3THK A; 1Q86 R; 1G3Y A; 2MPX C; 1XNI A; 4PNO A; 2R5M A; 1Y96 B; 2KQW A; 4KH1 B; 1K8A U; 4M75 F; 4C8Q E; 3VYG A; 5CR2 A; 5EG2 A; 2GF7 A; 1MMN A; 1MND A; 1YWP A; 1UGV A; 4HVW A; 1VIE A; 4Q5W A; 2YUP A; 1N8R R; 4C92 A; 1A0N B; 4CC2 A; 4RUG A; 1I0C A; 4OP0 A; 1VQ4 A; 1GCP A; 3GF5 A; 5LJ3 j; 2ZPF B; 2BTT A; 2D6F A; 3RUX A; 4OB0 B; 2K3X A; 4PFO A; 2ZPG B; 3G7Z A; 2AT1 B; 5IHI A; 2LRQ A; 2NUT A; 1TG0 A; 4X34 A; 1U3O A; 1PSE A; 3A8G B; 3QWX X; 3JCM V; 2EJF A; 3V7C A; 1BCM A; 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