The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
20
|
sequence length |
95
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structure length |
95
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Chain Sequence |
PSSNGPLEGTRGKLKNKPRDRGTSPPQRAVEEFDDGEKVHLKIDPSVPNGRFHPRFDGQTGTVEGKQGDAYKVDIVDGGKEKTIIVTAAHLRRQE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Ribosome
|
| publication title |
Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
50S ribosomal protein L2P
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| total genus |
20
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| structure length |
95
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| sequence length |
95
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-02-25 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| Q | PF01157 | Ribosomal_L21e | Ribosomal protein L21e |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | Ribosomal protein L21 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1VQ4 Q; 3CCV Q; 1YHQ Q; 1Q82 R; 3OW2 P; 3I55 Q; 3CME Q; 3CCE Q; 2OTL Q; 1K8A R; 2QA4 Q; 1VQ7 Q; 1N8R R; 1YIT Q; 1Q81 R; 3CCM Q; 1KD1 R; 1K73 R; 1VQN Q; 1VQL Q; 1QVF P; 3CC4 Q; 1YJN Q; 1K9M R; 1VQ5 Q; 2QEX Q; 3CCU Q; 1VQ8 Q; 3I56 Q; 3CPW P; 3CXC P; 1YI2 Q; 1Q86 R; 1YJ9 Q; 3G4S Q; 1NJI R; 3G6E Q; 1VQ6 Q; 1QVG P; 3CD6 Q; 3CCR Q; 1VQK Q; 1S72 Q; 1M90 R; 3G71 Q; 1KQS P; 1KC8 R; 3CC7 Q; 3CCQ Q; 1VQM Q; 3CC2 Q; 1VQP Q; 1VQO Q; 1W2B P; 1Q7Y R; 1VQ9 Q; 3CMA Q; 1M1K R; 1YIJ Q; 1YJW Q; 2OTJ Q; 1JJ2 P; 3CCS Q; 3CCL Q; 3CCJ Q; #chains in the Genus database with same CATH topology 1UHC A; 1KQ1 A; 1RLQ C; 3DKM A; 4FT2 A; 1M30 A; 2JXB A; 1G3W A; 2NUT B; 1GBQ A; 1TUG B; 3MEW A; 3QDF A; 1NYG A; 2SRC A; 3I55 A; 1V76 A; 4PJO G; 1Q7Y U; 5J39 A; 2GFU A; 2K79 A; 4QT7 A; 1K73 C; 5GAN h; 2NUP A; 4C92 E; 4LDU A; 3G7Z A; 1QVF S; 2RJE A; 4QQG A; 1M3A A; 2RPN A; 1WIE A; 1ZX6 A; 3RER A; 3DLM A; 4AG2 C; 4E7I A; 2HSP A; 2E4H A; 1PRL C; 1WQ7 A; 4F7U E; 1FWZ A; 2J06 A; 2FPE A; 1UHF A; 2EJF A; 4XTY A; 1GCQ C; 2RHZ A; 3QXE B; 5FU6 C; 2EQM A; 5GAO q; 4C8Q D; 2RHI A; 5GAN j; 1RAD B; 3CCS Q; 2DZ9 A; 2DPP B; 2LNV A; 3LWI A; 3X28 B; 3NTI A; 3RMS A; 3EGD B; 2VXE A; 2RNA A; 4M4Z A; 3BY7 A; 2KR3 A; 3CCV T; 3NPF A; 4GY5 A; 2KI7 A; 1JO8 A; 1RUW A; 4C92 G; 2RQU A; 1PM3 A; 4C0F A; 2DFU A; 2AT1 B; 1EZZ B; 3HFN A; 2P0K A; 1M4Z A; 5GAN f; 1KSW A; 2K3B A; 4IUR A; 4R56 A; 2PZ1 A; 4HCC A; 3CCV Q; 1Q82 R; 2ROL A; 4BY6 B; 5LJ5 j; 2W0Z A; 1VQ9 T; 4F7U G; 4KGX B; 4XTX A; 1UGQ B; 4BD3 A; 1VQO A; 3OYJ A; 3M57 A; 1U3O A; 3CPW P; 4XAX B; 3E1S A; 1XQH A; 5KCO A; 2YUQ A; 1RAC B; 1ZSG A; 4JJN K; 3JB9 F; 2JTF A; 3O5Z A; 2M0Y A; 4MZP A; 1VQ7 A; 4F14 A; 4N4G A; 5IHK A; 1K9M C; 2LQW A; 2OAW A; 4M75 E; 2IG0 A; 3UF4 A; 3M0U A; 3G4S A; 1FYN A; 4LD6 A; 1MMD A; 2EGE A; 4ELY C; 1EX4 A; 2EGC A; 5LJ3 e; 4Z8A A; 1VYV A; 2HNI A; 1QMC A; 1SEM A; 3CC4 T; 2RD1 A; 5LJ5 g; 3EAE A; 2OTJ Q; 2RQT A; 3PE0 A; 2K4Y A; 1ABQ A; 5CAI A; 4PNO A; 5I2M A; 3CC2 T; 3E2U A; 1KD1 U; 3PVQ A; 2RMO A; 1ZA2 B; 2M1H A; 1T3L A; 5CIU A; 3OB9 A; 4M75 G; 2EW3 A; 2A0F B; 3HRS A; 2D0N A; 4D6W A; 3HKS A; 3A1P A; 5FWC A; 3CC2 Q; 3SHW A; 1OU9 A; 2J6O A; 1VQL A; 3MP6 A; 2PU9 B; 1Q81 U; 5IN1 A; 5KE2 A; 1MHN A; 2A28 A; 2DKG A; 2COZ A; 4N4I A; 2XMF A; 1WX6 A; 1PRM C; 2HL3 A; 2YUO A; 1U06 A; 2D9T A; 1BCO A; 3V8L A; 2MWP A; 1CKB A; 4O6J A; 2HD0 A; 5J26 A; 1K73 U; 1M3B A; 3UPU A; 3CBM A; 1YIJ A; 1OI1 A; 4HVV A; 4DOV A; 1MV3 A; 1B7T A; 3GBQ A; 2IIM A; 2LNH B; 4R55 A; 4D8K A; 1V29 B; 2PVD B; 2LZ6 B; 5HCK A; 1ZBJ A; 2I2L A; 3MEU A; 5D6X A; 2QDY B; 5LJ3 d; 2RB6 A; 3GNG A; 4N4H A; 2DA9 A; 1IZ6 A; 1OZ3 A; 1RAB B; 4OB0 B; 2P0P A; 1AT1 B; 2CUD A; 4J6X A; 3M9Q A; 1W70 A; 1NJI R; 2E6N A; 2PUO B; 4FM4 B; 2A7Y A; 3PGG A; 3RES A; 1O75 A; 3MKD A; 2LRQ A; 2QEX T; 2G6F X; 1UEC A; 1ZSZ A; 3MJX A; 3M4G A; 1ZQ1 A; 4IKF A; 1VIE A; 2NUP B; 3G71 A; 4XQ3 A; 4EMK C; 1PNJ A; 2ABL A; 2QTX A; 1R0C B; 4CC4 B; 1WHK A; 1M2O A; 2FRY A; 4KT0 E; 2MIO A; 3E9G A; 2DL8 A; 1J3T A; 1MGQ A; 4PJL A; 3SEM A; 4J7I A; 1WHH A; 4XTW A; 1W4S A; 2YWW A; 5HK0 A; 3JCM d; 3KBG A; 5FRM A; 3VRY A; 1K9M U; 2O4X B; 1KC8 C; 1TUD A; 3EFO A; 3GLX A; 4CC2 A; 1YN8 A; 1YWO A; 1G5V A; 4E7J A; 3VYH B; 2KXC A; 2RN8 A; 4M78 D; 1M9S A; 4PFP A; 2ZCF B; 2EVR A; 3MCA B; 2E41 A; 2J7I A; 4M7D A; 2KNB B; 3NGP A; 3CME Q; 4LXC A; 4IUT A; 5GAO m; 3L2V A; 2R5A A; 4J6Y A; 3VS0 A; 4F04 B; 2ZPE B; 4A4G A; 1X01 A; 4XU0 A; 1M90 R; 2DVJ A; 4FU6 A; 1CKA A; 1Z9Q A; 4Y92 A; 4J9F A; 4Z88 A; 5GAN 8; 3GPL A; 4KGV B; 2FEI A; 3RBB B; 1QP3 A; 4FSX A; 2DLP A; 4LUD A; 4HA8 A; 3SWN B; 2HZY A; 3JRZ A; 3H8Z A; 2O31 A; 4FIB A; 3JB9 G; 3E9F A; 3JSC A; 3CD6 Q; 4IUQ A; 3ZEH A; 1GFC A; 4JPB W; 4DBQ A; 3DLL A; 3JB9 H; 4QVD A; 5DLQ E; 2LT1 A; 2KVQ G; 1JQQ A; 3OYF A; 3NHN A; 1PSF A; 4EIK A; 1JJ2 A; 2F5T X; 1TXQ A; 3PNW C; 4RG8 A; 1UGR B; 1SG5 A; 5IXF A; 1H8K A; 1VQ5 Q; 2MYS A; 2EQI A; 1LCK A; 1VQ4 A; 2XG8 D; 3OYY A; 2C06 A; 4BE0 A; 5KYU A; 3M54 A; 2YUP A; 1G3S A; 4WTO B; 1QKX A; 2KSS A; 2YSQ A; 3ULR B; 1AHJ B; 4L6V 5; 2MPX C; 2LMJ A; 3Q1J A; 3PTA A; 4NS5 A; 2HQX A; 1YJW A; 2P0Q A; 1AD5 A; 5IHN A; 1OPK A; 3JCM J; 1Q86 R; 3A98 A; 1E6G A; 1X27 A; 2V8I A; 1YJ9 T; 1VQK T; 1VQ6 T; 1M2V B; 3MEV A; 5KYX A; 2DJQ A; 3QDR B; 4MML A; 2A3L A; 4KH0 B; 1Q7Y C; 2RM4 A; 3LLR A; 2CP7 A; 1I4K 1; 4M7A B; 1VQ6 Q; 2MF2 A; 2ZGW A; 5GAN 6; 5LJ3 g; 4PFO A; 5IXB A; 4RTV A; 4AFU C; 1I0C A; 1I07 A; 3SDZ A; 2GBQ A; 1VQ8 A; 4Z02 A; 1VA7 A; 4P5N A; 2OTL Q; 2EFI A; 1PD1 A; 5GMK e; 1AWW A; 5KYN A; 1WA7 A; 1ZUU A; 1ZBX A; 4BY6 C; 1RAF B; 2LCS A; 2GTJ A; 2DK3 A; 4BDY A; 2QQ9 A; 1I1J A; 1M3C A; 1KC8 U; 4C92 A; 2D0Q B; 1AWJ A; 4PJM A; 3OYL A; 1OV3 A; 2CZ0 B; 4A53 A; 5D6Y A; 3U23 A; 1N9S A; 1IXD A; 1CSK A; 2M0O A; 2XIC A; 3JB9 I; 3EGX A; 3VS7 A; 4OML A; 2WAC A; 4F7U A; 1R0B G; 4HVW A; 2H8H A; 3QG1 A; 3QKJ A; 1JBM A; 4ELZ C; 1MND A; 3JCM Q; 2LX9 A; 1KQS A; 1YJN A; 3VUZ A; 1SHG A; 3CCU A; 5GAN d; 2YXY A; 2XDD A; 2J6F A; 2QQB A; 1K8A R; 3PMT A; 1WJR A; 2AKK A; 2CZ7 B; 3RKX A; 2FL7 A; 3FDR A; 1ZUY A; 3EG3 A; 4PL6 A; 3OA6 A; 4ZGD B; 1NYF A; 3DB4 A; 1JU5 C; 3G1J A; 2J6K A; 2DTI A; 3FB9 A; 2ZPG B; 3L2Q A; 2X35 A; 3V7C A; 3I5R A; 3INZ A; 2KRO A; 2MOX A; 2BE7 D; 2DX1 A; 4E47 A; 4J5Y A; 2BKD N; 4C8Q B; 1AVZ C; 2GGR A; 4JZ4 A; 1JXO A; 3CBP A; 3CCE Q; 3RDV A; 4ZNX A; 5GAN 2; 4ORZ A; 4HT8 A; 2CT3 A; 3I55 T; 2FPD A; 1PD0 A; 4MDX A; 4QVZ A; 3H41 A; 3QJ6 A; 2QA4 T; 2MAM A; 2HMA A; 2JM9 A; 5I2S A; 2CKK A; 3QPH A; 5GAO l; 4KUD K; 2B86 A; 1WPY A; 2F69 A; 4M75 A; 2FHD A; 8AT1 B; 1IGU A; 1S72 A; 1D1A A; 2QA4 Q; 1RL2 A; 1VQM A; 5CK9 A; 2EQK A; 1M27 C; 2K3Y A; 1UDL A; 1IHV A; 3CCJ T; 1U1T A; 2KDS A; 3WVE B; 1YI2 Q; 3C12 A; 3EHR A; 2CT4 A; 1UEB A; 2DAQ A; 2EAY A; 1UE9 A; 4XU1 A; 1N8R C; 1N5Z A; 3CCJ Q; 2DL7 A; 5CQY A; 3G6E A; 3CC7 A; 1YFN A; 1X69 A; 3VS1 A; 2I0N A; 1WNL A; 1B07 A; 4EPC A; 2KRN A; 1QP2 A; 4ZN1 A; 2X4Y A; 4Y28 E; 5GAM f; 2YT6 A; 1QVG P; 4JRK A; 3ZFJ A; 2KT8 A; 1RI9 A; 1PG5 B; 2LQN A; 4C0G A; 1ZHI A; 4GBQ A; 5M9O A; 3CCM A; 1PKS A; 2CS7 A; 2EJG A; 5KYW B; 1MUZ A; 4FW2 A; 1VQO T; 3ZBD A; 2CP5 A; 3X25 B; 1T0H A; 1YHQ T; 1X6G A; 2E12 A; 3THK A; 2CZ6 B; 4FSS A; 2K6D A; 1VQ7 T; 4DA4 A; 1FMW A; 1UJ0 A; 3I35 A; 1PCX A; 2PNI A; 4J9I A; 2QXF A; 3L42 A; 3G4S T; 1GCQ A; 2BZY A; 3L1A A; 1YHQ Q; 4OGC A; 1C1A A; 5LJ5 h; 4M7D D; 2ATC B; 3OW2 A; 3TQ7 P; 2DBK A; 1BKB A; 2LVM A; 2MK5 A; 4ANJ A; 1TWB A; 4L5G A; 1ARK A; 4BI3 A; 2CH4 A; 2ED0 A; 2QAS A; 1W6X A; 5ECA A; 4JDS A; 4DBF A; 1WHJ A; 2X4W A; 1WDX A; 2XKO C; 2FB7 A; 3A8H B; 1K1Z A; 3M0R A; 3OQ5 A; 3OYB A; 1HSQ A; 1SRL A; 1BI0 A; 1WJS A; 4LDX A; 5AYF A; 2FZC B; 2GQV A; 4JLG A; 4C5E A; 2CH4 W; 1RAE B; 2HEQ A; 4GLM A; 4FW1 A; 1VQL T; 2JZ2 A; 4LDV A; 2L3R A; 1VQ9 Q; 5FLX E; 2VB6 A; 2DJZ A; 4HXJ A; 1AZG B; 1TUC A; 3CCR T; 1UG1 A; 1NLO C; 4RTX A; 5LJ5 f; 2E70 A; 2EGA A; 2LTO A; 1ABO A; 1UB4 A; 4XTV A; 2JMC A; 1D09 B; 3CCS A; 1QVF A; 2NYS A; 3X24 B; 3PIO A; 3CCR Q; 4BI4 A; 3SWN C; 3WVD B; 3H6Z A; 2K5I A; 3SB2 A; 3JCM X; 3OSV A; 4BE1 A; 3TRE A; 2YDL A; 2J05 A; 3KUF A; 1HD3 A; 3ASK A; 1M90 C; 4LN2 A; 1X6B A; 3GIB A; 1YIJ T; 2X4X A; 2JW4 A; 1RI0 A; 4RTY A; 2COW A; 3CC4 Q; 2QG9 B; 1VYU A; 4PJJ A; 3CCV A; 1XTD A; 1TH7 A; 5L8R E; 1XOV A; 3QHS A; 2XDB A; 4FT4 A; 3OYE A; 2C0T A; 4M7A F; 3VS5 A; 1D3B A; 1MNE A; 1OX9 A; 3CPW S; 4PJO D; 1D0Z A; 2O88 A; 1GBR A; 2A37 A; 1N8R U; 2HCK A; 2JT4 A; 1PWT A; 2XU8 A; 4JUV A; 1KD1 R; 1AWO A; 5KYY A; 3JCM e; 3UA7 A; 4J6W A; 2FYK A; 2MCN A; 3HRU A; 2RI5 A; 3BDU A; 2JOY A; 2FPF A; 3GNF B; 2XDP A; 1G83 A; 2HQH A; 3G71 T; 2K3X A; 2PVG B; 4M78 B; 2R5M A; 3OYD A; 4VUB A; 1Q81 R; 3CCQ A; 1NPR A; 1N6A A; 2EYQ A; 1ACM B; 3RNJ A; 2OTJ A; 4LDW A; 2C0I A; 2PQW A; 3CXC P; 2QK0 A; 3P8D A; 4V2S A; 3JCM c; 3KFV A; 2DE0 X; 5A0L A; 4KUL A; 3TEE A; 2FZK B; 4M7A C; 1JJ2 P; 2JUF A; 1Q86 C; 2JNG A; 4C92 D; 2YRD A; 2DXC A; 4OMQ A; 3SD4 A; 3OYM A; 3CC2 A; 1K73 R; 2YRC A; 3EH2 A; 1N9R A; 3LH0 A; 4JJD A; 1OZ2 A; 5GMK l; 2EYY A; 3LGL A; 2GCX A; 1BI3 A; 4LDY A; 4AMC A; 4AG1 C; 1E6H A; 2RO0 A; 3OY9 A; 1B34 A; 1M1G A; 4GLK A; 1QQJ A; 4BB7 A; 3HL8 A; 1GFD A; 5CVI A; 2JS2 A; 2HSE B; 2QEX Q; 4XTU A; 2CDT A; 2DTH A; 4C8Q F; 4EMK A; 2BTT A; 2JTE A; 1Y96 A; 1TS9 A; 2R57 A; 3P8H A; 4UC4 A; 1IO6 A; 2L8D A; 1WJQ A; 1I81 A; 1D0Y A; 1JB0 E; 2FZG B; 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2KBT A; 3OYH A; 1D3B B; 2BZX A; 5GAN e; 1Q86 U; 4FCY A; 4J9E A; 2GQI A; 1YWP A; 3M55 A; 1QKW A; 2BUD A; 3IQL A; 3RIR A; 1WGS A; 4ZGE B; 3BDL A; 2QDL A; 1KFZ A; 4Y91 A; 2K2V A; 3FJP A; 3LGF A; 5CO7 A; 4M7A G; 4J9G A; 2EIF A; 2HKQ B; 2L89 A; 2NWM A; 4PJO A; 2QGG A; 5LJ3 f; 3CD6 A; 4JRP A; 3VS6 A; 4CC7 A; 4QQD A; 1P92 A; 2CP0 A; 3OBY A; 1U5S A; 5A0G A; 1YJ9 Q; 2G3R A; 1AWX A; 1OYX A; 4KBM B; 1VQK Q; 1G3Y A; 2XID A; 5GAM d; 2O01 E; 5FU7 B; 1KHC A; 1YJN T; 4LUE A; 4AFZ C; 3CCU T; 3HPW A; 2K5F A; 2CP6 A; 2EYX A; 4X1V A; 4A4H A; 1VQ5 A; 1UTI A; 3BW1 A; 1E7O A; 4BUG A; 1OX8 A; 2ENM A; 3GF5 A; 2X3W D; 3MEA A; 5I22 A; 2L0A A; 1BU1 A; 2DBM A; 2D6F A; 1EIF A; 4C8Q E; 1KHI A; 1YP5 A; 2HKN A; 5CR2 A; 3M0P A; 2KYB A; 3D7S B; 3QSU A; 4E7Z A; 2E1H A; 2X51 A; 1Q95 G; 5GAO p; 2YLB A; 3NFC A; 1ZSZ B; 4X9C A; 3QZ5 B; 3X26 B; 4XU2 A; 4DBR A; 1W2B S; 1Q82 C; 3HTR A; 2BIV A; 4KGZ B; 3JCM g; 4CC3 A; 1M1K U; 1JRI A; 5DY9 A; 2YLC A; 1WI7 A; 1RAH B; 3JB9 D; 4DEY A; 2SEM A; 1S72 T; 4E6R A; 2L3S A; 4PJN A; 1VQM T; 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