The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
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sequence length |
86
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structure length |
86
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Chain Sequence |
GSMSAEGYQYRALYDYKKEREEDIDLHLGDILTVNKGSLVALGFSDGQEAKPEEIGWLNGYNETTGERGDFPGTYVEYIGRKKISP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
PHOSPHATIDYLINOSITOL 3-KINASE P85-ALPHA SUBUNIT SH3 DOMAIN
|
| publication title |
Solution structure and ligand-binding site of the SH3 domain of the p85 alpha subunit of phosphatidylinositol 3-kinase.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Bos taurus
|
| molecule tags |
Phosphotransferase
|
| total genus |
7
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| structure length |
86
|
| sequence length |
86
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1993-07-19 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5L23 A; 2RF0 A; 5IH2 A; 2X3X D; 2YSQ A; 2AKL A; 1MV0 B; 2VKN A; 3IQL A; 1UJ0 A; 4DEX A; 2O88 A; 1WXB A; 1SSH A; 2DBM A; 2LZ6 B; 2KT1 A; 2RQV A; 5FWC A; 4IIO A; 2A08 A; 3TSW A; 3O5Z A; 1I0C A; 1GBQ A; 1RLQ C; 2D0N A; 1WX6 A; 4R0K A; 2RNA A; 1MUZ A; 4AFS C; 1NYG A; 1W6X A; 2CDT A; 3EG0 A; 1VYT A; 1ABQ A; 4RTV A; 3H0H A; 2J05 A; 2JT4 A; 3M0Q A; 2CRE A; 2YUO A; 1SPK A; 1GBR A; 2D8J A; 1UHC A; 1WA7 A; 2ESW A; 1T3S A; 2FPE A; 4J9G A; 1MV3 A; 4F14 A; 4RTU A; 3VS2 A; 3NPF A; 1M27 C; 3M0S A; 4HCK A; 1PWT A; 2V1R A; 3H0F A; 1V1C A; 4Z8A A; 4QT7 A; 3EG3 A; 3LH5 A; 1ZX6 A; 2DLP A; 2CSQ A; 4LNP A; 1J3T A; 2K79 A; 1AWX A; 2F2V A; 2EGE A; 2O2O A; 1GCQ C; 1SEM A; 1S1N A; 2K7A A; 2OI3 A; 1AOJ A; 3UA7 A; 5IXF A; 2ABL A; 1VYU A; 2DF6 A; 2FG0 A; 2FPF A; 2RQT A; 2PZ1 A; 4X1V A; 2LCS A; 1M3A A; 2GGR A; 1VYV A; 4Z89 A; 2DL8 A; 1ABO A; 2XMF A; 4LE9 A; 3A98 A; 3REA B; 1NEG A; 2DL5 A; 3EHQ A; 2HSP A; 3M0T A; 2VWF A; 4D8D A; 2ED0 A; 4RTW A; 4J9I A; 3U23 A; 2PNI A; 1KFZ A; 2V1Q A; 3VS7 A; 1ZBJ A; 3KFV A; 2JM9 A; 2LQW A; 3CQT A; 2PTK A; 4AFU C; 3EG1 A; 4D8K A; 1NYF A; 1OPK A; 2A37 A; 4M4Z A; 2BZ8 A; 1E6G A; 4CC7 A; 1YP5 A; 2BTT A; 3VS5 A; 1NLP C; 1JU5 C; 3JV3 A; 1K0S A; 2EW3 A; 2KBT A; 2LX7 A; 1WLP B; 1ZSG A; 2CH4 A; 2K6D A; 2IIM A; 1CKA A; 3ULR B; 1Y0M A; 3EHR A; 4HXJ A; 3QWX X; 2HEQ A; 3RNJ A; 2B86 A; 3QWY A; 1M3B A; 2EVR A; 1AWJ A; 4JPB W; 1EFN A; 1XOV A; 3H0I A; 2KE9 A; 4LUD A; 1YWP A; 1M30 A; 2DYB A; 1M3C A; 1BB9 A; 4GLM A; 2DL7 A; 2YUQ A; 2G6F X; 2M51 A; 2KXD A; 2EPD A; 4CC4 B; 2FRY A; 2KGT A; 2L0A A; 3VS1 A; 2RN8 A; 4OMM A; 1JO8 A; 2OAW A; 2D8H A; 4RTY A; 1JEG A; 4J9C A; 1HJD A; 2E5K A; 2MIO A; 2O9V A; 5IHK A; 4GBQ A; 2DMO A; 2AZS A; 2KYM A; 4J9H A; 1YN8 A; 3I5S A; 1PNJ A; 3TSZ A; 2DBK A; 3TVT A; 1K9A A; 1YNZ A; 5IHI A; 2GTO A; 1AZG B; 3VRZ A; 2DL4 A; 1B07 A; 2YT6 A; 1UDL A; 2YUP A; 1K76 A; 2JM8 A; 1QCF A; 4Z88 A; 1X43 A; 2NWM A; 3UF4 A; 4OML A; 2EKH A; 2OJ2 A; 2DA9 A; 2O9S A; 1WI7 A; 2A36 A; 1PKT A; 4HVU A; 4RTZ A; 2RQW A; 2LJ3 A; 1WYX A; 4JZ4 A; 3GBQ A; 4A63 B; 2SEM A; 2L3S A; 2KEA A; 2HBW A; 4LN2 A; 1TUD A; 2GBQ A; 2CUB A; 2RPN A; 2FPD A; 1Z9Q A; 1NG2 A; 2JS2 A; 1WIE A; 2KNB B; 2EQI A; 1BU1 A; 4OMN A; 2K9G A; 1T0H A; 1U06 A; 2DJQ A; 5IXB A; 2L2P A; 1BK2 A; 2DNU A; 4JJD A; 1RUW A; 1TG0 A; 2W10 A; 1CSK A; 1N5Z A; 2I0N A; 4OMO A; 5EC7 A; 2K3B A; 2RQU A; 1QKW A; 2JXB A; 3REB B; 1I1J A; 1QLY A; 1NLO C; 1QKX A; 2CSI A; 4K11 A; 1PKS A; 1JQQ A; 2YDL A; 4AFZ C; 3FJ5 A; 2DM1 A; 2LJ0 A; 2EYY A; 2C0T A; 1UJY A; 2DE0 X; 1UG1 A; 2MOX A; 5GJW B; 4HVV A; 2FRW A; 2DRK A; 2J6F A; 2ROT A; 1SHF A; 1Y57 A; 3UA6 A; 2X3W D; 4ORZ A; 1KJW A; 2JMA A; 1LCK A; 3I5R A; 1PRL C; 2BZY A; 2EYZ A; 2LP5 A; 1QWF A; 2CT3 A; 2GNC A; 1K0X A; 5I11 A; 1RI9 A; 1T0J A; 3RBB B; 4IIM A; 1H92 A; 1H3H A; 2KR3 A; 1WXT A; 4OMP A; 1AWW A; 1IO6 A; 1W70 A; 4E6R A; 2C0O A; 1G83 A; 2JW4 A; 2KYB A; 1E7O A; 2ENM A; 1GCQ A; 4DEY A; 2EGC A; 2MCN A; 2AKK A; 2J06 A; 2JMC A; 2J6K A; 1GL5 A; 1HSQ A; 1SHG A; 4F16 A; 5GJV B; 1X6B A; 1W1F A; 2DRM A; 2FO0 A; 3NGP A; 2W0Z A; 1BBZ A; 1OEB A; 1YCS B; 2ED1 A; 1AD5 A; 1M8M A; 2L3Q A; 4ESR A; 3VRY A; 2AK5 A; 1SRM A; 2RQR A; 1X6G A; 2EYW A; 3C0C A; 5HCK A; 3M0R A; 3VS0 A; 3VS3 A; 1JXO A; 1K4U S; 1K1Z A; 1NM7 A; 2M0Y A; 4J9E A; 5ECA A; 2CT4 A; 1A0N B; 1AEY A; 1UEC A; 1VA7 A; 4LUE A; 4OMQ A; 2RMO A; 5FW9 A; 2AZV A; 4EIK A; 4AG1 C; 2D1X A; 2H8H A; 4J9F A; 2J7I A; 2EYX A; 3I9Q A; 1UTI A; 2KXC A; 1G2B A; 2EGA A; 1X69 A; 4JZ3 A; 2CH4 W; 4ZNX A; 1KSW A; 2KRO A; 4F17 A; 2F2W A; 3I35 A; 1YWO A; 3NMZ C; 1T3L A; 2DVJ A; 1OV3 A; 1QWE A; 1TUC A; 4HVW A; 4WCI A; 3M0P A; 2BZX A; 5IHN A; 2KRS A; 4CC2 A; 2LQN A; 2DX1 A; 1OPL A; 2LJ1 A; 4Y92 A; 2K2M A; 2NUZ A; 3EGU A; 3NHN A; 1UE9 A; 1UHF A; 3THK A; 2KRN A; 1B3Q A; 3UAT A; 2GTJ A; 1I07 A; 4AFQ C; 2LMJ A; 1ZUY A; 2EBP A; 1CKB A; 1PRM C; 2LNH B; 2CUD A; 1GFD A; 5I22 A; 3H41 A; 4J9D A; 1AWO A; 2JS0 A; 3EG2 A; 1NEB A; 1WDX A; 1SRL A; 3R6N A; 2J6O A; 3SHW A; 1X2Q A; 4FSS A; 2HDA A; 2DL3 A; 3VS6 A; 1JXM A; 2FEI A; 4JJB A; 1GCP A; 2KT8 A; 2YUN A; 1H8K A; 4KRT A; 3VS4 A; 2O31 A; 1ZUU A; 4J9B A; 4RTX A; 2HCK A; 1FMK A; 1ZLM A; 2F2X A; 2JTE A; 3PE0 A; 2QDL A; 2L3P A; 2KRM A; 2VVK A; 1GRI A; 1HD3 A; 2ECZ A; 2A28 A; 2P4R A; 3SEM A; 1UFF A; 1FYN A; 1X27 A; 1UUE A; 4RTT A; 4RUG A; 1KIK A; 4JJC A; 1UGV A; 1AZE A; 1E6H A; 1AVZ C; 1U3O A; 2DIL A; 2GQI A; 1OOT A; 3PVQ A; 2C0I A; 4AG2 C; 3M0U A; 1U5S A; 2ROL A; 3PVL A; 1WFW A; 2SRC A; 5FWB A; 1PHT A; 1RLP C; 1X2K A; 4CC3 A; 1GFC A; 1Z9Z A; 1ZUK A; 3ZL7 C; 1ARK A; 1WXU A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3SDZ A; 4A4H A; 2VC8 A; 2RF0 A; 2QEX A; 3CCJ T; 2X3X D; 4QVC A; 1BCM A; 1IHV A; 3IQL A; 4PJO A; 2DBM A; 3QZ9 B; 2MF2 A; 1VQ6 A; 2NUP A; 3WVE B; 3CPW A; 3EFS A; 1YIJ A; 3ZFJ A; 3JCM W; 2E10 A; 2DIQ A; 2V26 A; 3OW2 S; 5CK9 A; 2FZC B; 4PJO G; 1NYG A; 1W6X A; 2CDT A; 2XKO C; 3EG0 A; 3FLG A; 1ABQ A; 3H0H A; 2HZY A; 1RAA B; 3LWH A; 3PMI A; 1VQM A; 4ELZ C; 1T3S A; 1MV3 A; 4KBM B; 3NPF A; 3OBW A; 4N4H A; 2K2V A; 3R6O A; 3EGD B; 3FB9 A; 1M1K R; 1YJN T; 2E12 A; 3RIR A; 2YWW A; 2PUK B; 4M7A B; 2R57 A; 1B7T A; 4KGV B; 4PFO A; 2QQB A; 2CSQ A; 1WJR A; 4QVD A; 4EMK B; 1AWX A; 3OW2 A; 3OYK A; 2QQS A; 2RK2 A; 1SEM A; 1K73 U; 1S1N A; 2K7A A; 4EDU A; 2CP5 A; 3S3N A; 3GNG A; 2DF6 A; 2R5M A; 4PLI A; 5C6S A; 2FG0 A; 2FPF A; 4JS4 A; 4LXC A; 4XTX A; 3EG9 A; 1Q86 C; 2DL8 A; 2X51 A; 2XMF A; 2ZPE B; 3C4S A; 1OX9 A; 3ME9 A; 1WZO A; 1VQP T; 4FYV B; 3U23 A; 2OTL T; 3CME T; 1RAE B; 1MHN A; 1UGS B; 2AIR B; 5KYU B; 3VS7 A; 3PIO A; 2LQW A; 3CCE T; 2BZ8 A; 4CC7 A; 1TU0 B; 3LW5 E; 1YP5 A; 1YBY A; 3CBO A; 3OYL A; 3SWN B; 2L3R A; 2M0O A; 4XTZ A; 2E1H A; 2KBT A; 2XDP A; 4MMK A; 4RMO A; 3G71 T; 3CC2 T; 2K6D A; 4LDU A; 2P0P A; 2IIM A; 4M7A F; 4LD6 A; 3X20 B; 4M77 A; 4R56 A; 3EHR A; 4OGC A; 3MHX A; 3QWX X; 3RMS A; 2B86 A; 4KUL A; 4N4G A; 3JCM V; 3AHU A; 1M3B A; 5KE2 A; 4JPB W; 1M1F A; 2HBP A; 4O6J A; 1HYO A; 1XOV A; 3H0I A; 3QYG B; 2HNI A; 2RJC A; 1FMW A; 1BB9 A; 5GMK e; 4FU6 A; 1K73 R; 2EPD A; 2KGT A; 1O9S A; 1PG5 B; 4M77 G; 2LNV A; 4OMM A; 3GF5 A; 3E19 A; 3KXT A; 1NJI C; 1VQ6 T; 4RTY A; 3HRS A; 1Y96 B; 2PVD B; 4J9C A; 4F7U B; 3VV0 A; 4OB0 B; 4GBQ A; 4HA8 A; 4C0F A; 1PC0 A; 5FU7 C; 1N9S A; 2MK5 A; 4XTW A; 4IUR A; 3OBY A; 3I5S A; 3TSZ A; 1GXI E; 1YNZ A; 5IHI A; 2GTO A; 4NOY A; 3VRZ A; 5CKD A; 2YT6 A; 1UDL A; 2CYZ B; 1Q81 U; 4E47 A; 3D7S B; 2JM8 A; 2EJ9 A; 2E6Z A; 3LX7 A; 5KYW A; 5KCO A; 4OML A; 4ZN3 A; 2D9T A; 2AHJ B; 1G3W A; 2E6N A; 3F70 A; 2DA9 A; 3DKM A; 2MPX C; 2ZGW A; 2A36 A; 2CZ0 B; 2RQW A; 2LJ3 A; 1UGP B; 1QVP A; 5GAN h; 3GBQ A; 2CUB A; 3M5A A; 4M7A D; 1QP3 A; 2FPD A; 1PM3 A; 1Z9Q A; 4DBR A; 3CCS T; 3JB9 F; 2JS2 A; 1NZ9 A; 2GFU A; 1QVG S; 5IXB A; 2X4Y A; 1BI0 A; 3OYE A; 1TG0 A; 2W10 A; 2DET A; 2DXB A; 2RQU A; 2V8I A; 3CBP A; 5FU6 C; 4F7U F; 4M7D D; 2H3J A; 4BD3 A; 1M1K C; 4M78 C; 3V8J A; 4HCB A; 1N8R U; 1PSF A; 4MDX A; 2DM1 A; 1AHJ B; 2CS7 A; 4KUD K; 1QVF S; 1UG1 A; 2QYZ A; 4C92 C; 2MOX A; 3TU4 K; 1ZA1 B; 2MAM A; 2ZPI B; 1SHF A; 4F04 B; 4FYW B; 4C8Q E; 1Q81 R; 3G4S T; 4JJN K; 1QVG A; 2L8D A; 2GCX A; 2BZY A; 2PVG B; 4IKF A; 4C0Z A; 2CT3 A; 3L1A A; 1M2V A; 1T0J A; 3OYD A; 1M2V B; 2NLU A; 5GMK j; 7AT1 B; 3CXC P; 3I56 Q; 1FWZ A; 2C0O A; 1QCN A; 1RL2 A; 1QVF A; 2R58 A; 2MCN A; 2JMC A; 1OZ3 A; 2GFA A; 3JB9 D; 1IHW A; 5I2M A; 2K5I A; 5HY6 A; 4XU1 A; 3M59 A; 1W1F A; 1JBM A; 5I2S A; 2KDS A; 3CCM T; 4BE0 A; 3OS1 A; 1BBZ A; 2P4T A; 2ED1 A; 2QAS A; 5GMK l; 2KMT A; 2G3R A; 5GAM f; 4C0G A; 3VS0 A; 1OU8 A; 2JJ9 A; 3VS3 A; 1JXO A; 3AT1 B; 1K4U S; 1NM7 A; 1K73 C; 2CT4 A; 1A0N B; 1TSF A; 2RD1 A; 4ZTJ A; 4OMQ A; 3LGL A; 1Q82 U; 4AG1 C; 1IGU A; 1UTI A; 3QUI A; 2KSS A; 4ANJ A; 2KK4 A; 4JZ3 A; 1KQ1 A; 2F2W A; 4XTU A; 1YWO A; 2DVJ A; 4WCI A; 1YI2 Q; 4A54 A; 3M0P A; 3OYH A; 1R0C B; 4OGE A; 5IHN A; 2KRS A; 4CC2 A; 2XDD A; 4PJO C; 4PJJ A; 1QP2 A; 1UE9 A; 3QXE B; 1AT1 B; 2LRQ A; 3CCQ Q; 1UB4 A; 1X6O A; 3QBY A; 4AFQ C; 2EBP A; 3OYB A; 5FU7 B; 5I22 A; 3H41 A; 3QKJ A; 1TTH B; 1NEB A; 1WDX A; 1SRL A; 3R6N A; 3G1J A; 2X35 A; 4AMC A; 2FEI A; 3X28 B; 3VYH B; 4QQ6 A; 4D6W A; 5KE3 A; 4KRT A; 5KYY B; 3LYI A; 4OB2 B; 1JRI A; 1ZUU A; 2ZPF B; 1U1T A; 4J9B A; 1KC8 U; 3A8M B; 1RAC B; 1FMK A; 3PE0 A; 2F2X A; 2QDL A; 5GAN 6; 1Q82 R; 2KRM A; 1GRI A; 3OYI A; 3CD6 Q; 1NE8 A; 2A28 A; 2QTV A; 1FYN A; 4EPC A; 4RUG A; 4QKU A; 1UGV A; 2DTI A; 2ROL A; 1RLP C; 1GFC A; 1AWO A; 1W4S A; 1OX8 A; 1OYX A; 3CCV T; 3MO8 A; 1Q81 C; 3JCM X; 2COY A; 2PVO B; 2VKN A; 3JB9 H; 2KT1 A; 1VQ7 Q; 3MEA A; 2AT1 B; 4IIO A; 4M78 B; 5M9O A; 3I56 A; 1KG1 A; 5CKE A; 4C8Q G; 1GBQ A; 2O4X B; 2RNA A; 4XK8 E; 4AFS C; 4C92 A; 2A0F B; 4C92 B; 1K9M U; 4M7A E; 2Y4Y A; 4C5I A; 2CRE A; 2QI2 A; 2YUO A; 3LWI A; 2P0K A; 1GBR A; 1V76 A; 3HPW A; 1UHC A; 2ESW A; 3CCU T; 1ACM B; 4FL6 A; 3M0S A; 1KC8 R; 4ZGD B; 2Y4X A; 4M77 C; 1BIB A; 2RK1 A; 4CI0 C; 3GPL A; 3H0F A; 2VGM A; 4Z8A A; 1G5V A; 4M7D E; 4QT7 A; 2C06 A; 4LDX A; 3JCM Q; 4LNP A; 3HHT B; 2F2V A; 4M75 C; 2O2O A; 1GCQ C; 5CAI A; 2RHY A; 5IXF A; 2ABL A; 3DLM A; 3M57 A; 2LCS A; 2PZ1 A; 2WAC A; 1M3A A; 1VYV A; 1U8R A; 1RAB B; 3A98 A; 3REA B; 1NEG A; 3EHQ A; 5CCA A; 1KHI A; 4RTW A; 4M78 F; 2FYK A; 1JJ2 A; 3J81 E; 4B6M A; 3H9N A; 1YI2 A; 3JCM f; 2E5Q A; 4C92 F; 4BAC A; 4AFU C; 3EG1 A; 1D1A A; 1K9M R; 3MJX A; 1E6G A; 1OU9 A; 3JSC A; 2BTT A; 1XJW B; 3JV3 A; 5J39 A; 2EW3 A; 2RJE A; 4PNO A; 3RKX A; 5DM7 R; 1YJ9 T; 2LX7 A; 2BUD A; 2E41 A; 2LTO A; 2CH4 A; 5A0D A; 2H3E B; 3QDF A; 4EMG A; 1CKA A; 2V8K A; 3ER0 A; 3PMT A; 1Y0M A; 1F1B B; 2EQU A; 3CPW P; 4HKE A; 3OYA A; 1O75 A; 4F7U E; 2EVR A; 2KE9 A; 1M30 A; 4RCB A; 2DYB A; 4BUG A; 3CMA Q; 1UGR B; 2HSE B; 3GLX A; 4J7F A; 2KXD A; 2DD5 A; 4PJO B; 1VQ9 T; 1M5Q 1; 1JO8 A; 1I8F A; 1C1A A; 3NTI A; 5LJ3 f; 1KQ2 A; 2NUP B; 1JEG A; 4RG2 A; 1Q82 C; 3CD6 A; 1SKU B; 2RHX A; 2E5K A; 3VYG A; 2QA4 T; 1G3Y A; 1D1C A; 4IUU A; 2O9V A; 3M4G A; 3HKS A; 3TCJ A; 4CRI A; 1D0Z A; 2RHU A; 3JCM b; 5CQX A; 1MGQ A; 1PNJ A; 3TVT A; 4XTY A; 3UT1 A; 1YHQ T; 4KH1 B; 1B07 A; 1VQ4 Q; 2EYQ A; 3OW2 P; 4Z88 A; 1X43 A; 2EWN A; 5CKB A; 4HT8 A; 5IN1 A; 1KQS S; 4N0A A; 1VQ7 A; 3RKY A; 2ZPH B; 3BDU A; 4E7Z A; 3PIP A; 1IB8 A; 3DB3 A; 2HBW A; 3MKD A; 1TUD A; 2JZ2 A; 1UGQ B; 5GAO p; 1RAH B; 2KNB B; 1KHC A; 4OMN A; 3EG9 B; 2FZK B; 1T0H A; 4PJO F; 2MMP A; 2L2P A; 2LCL A; 1BK2 A; 2DNU A; 1IZ6 A; 4JJD A; 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