The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
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sequence length |
88
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structure length |
88
|
Chain Sequence |
GSSGSSGPLPSTQNGPVFAKAIQKRVPCAYDKTALALEVGDIVKVTRMNINGQWEGEVNGRKGLFPFTHVKIFDPQNPDENESGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Crk-like protein
|
| publication title |
Solution structures of the SH3 domain of human Crk-like protein
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| molecule tags |
Signaling protein
|
| total genus |
5
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| structure length |
88
|
| sequence length |
88
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-12-15 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF07653 | SH3_2 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1ARK A; 1JU5 C; 2VVK A; 2O9V A; 3QWY A; 2LJ0 A; 2DL3 A; 2KRM A; 3I35 A; 1QKX A; 3TSZ A; 2FRW A; 2ECZ A; 2FG0 A; 3REB B; 4CC2 A; 1RI9 A; 2O2O A; 3VS1 A; 1WFW A; 2EGC A; 1N5Z A; 5IHK A; 1TUD A; 2CSI A; 4J9F A; 4AG1 C; 4LNP A; 4J9I A; 2D1X A; 4LUD A; 2J6F A; 3VS6 A; 3M0R A; 1WLP B; 2CT3 A; 5IXF A; 1BK2 A; 1UHC A; 3M0S A; 4M4Z A; 2J06 A; 2KGT A; 2MCN A; 1WX6 A; 2C0O A; 4JJB A; 1ZUY A; 2SRC A; 1ABO A; 2K3B A; 2F2V A; 1AWX A; 2D8H A; 2L3S A; 3QWX X; 1WXT A; 2JXB A; 3SHW A; 1U5S A; 1ZBJ A; 4F16 A; 1AZG B; 1WA7 A; 2F2X A; 3EG3 A; 4J9C A; 1K4U S; 3VRZ A; 2EW3 A; 1UEC A; 2K79 A; 4RTV A; 4D8K A; 4OMM A; 1T0J A; 1PKT A; 1AWJ A; 2K9G A; 4RTY A; 4RTT A; 1JEG A; 2DM1 A; 5IXB A; 1T0H A; 2DBM A; 2DBK A; 5IHI A; 2L2P A; 2KBT A; 4IIO A; 4OMO A; 1S1N A; 1UHF A; 4AFQ C; 2RNA A; 4Y92 A; 2O31 A; 2LJ3 A; 1B07 A; 1PRM C; 1WI7 A; 1K1Z A; 2SEM A; 2F2W A; 1SRM A; 2A28 A; 2V1Q A; 1E6H A; 4KRT A; 4Z89 A; 3THK A; 3UAT A; 2DL5 A; 2RQT A; 1WXU A; 1QLY A; 2RQW A; 4ZNX A; 1ZUU A; 4HXJ A; 1YNZ A; 2RQU A; 1AWO A; 1HJD A; 4RUG A; 2OAW A; 4LE9 A; 1Y0M A; 1NYG A; 5IH2 A; 4QT7 A; 1ZUK A; 2A08 A; 2GBQ A; 2ESW A; 1JXM A; 2KR3 A; 4E6R A; 1MUZ A; 2C0I A; 2HBW A; 4IIM A; 4JZ4 A; 2YUN A; 1OV3 A; 1PKS A; 2ROT A; 1T3S A; 1J3T A; 3TVT A; 3SEM A; 1VA7 A; 1Y57 A; 2CT4 A; 1M3A A; 2I0N A; 1WDX A; 2LJ1 A; 1GCQ C; 1JQQ A; 2JS2 A; 2DJQ A; 2K2M A; 2KYM A; 1I1J A; 1W1F A; 2M0Y A; 3FJ5 A; 4Z8A A; 4R0K A; 2DL7 A; 1H3H A; 2BZY A; 2ENM A; 1BBZ A; 2OI3 A; 1GL5 A; 1Z9Q A; 2JM9 A; 1QKW A; 1X69 A; 1CKB A; 2D0N A; 1WXB A; 2CDT A; 4J9E A; 1GBR A; 1VYV A; 1I07 A; 1U3O A; 2FPD A; 3I5S A; 3I9Q A; 2ABL A; 2KNB B; 5GJW B; 2O88 A; 4HVW A; 3RNJ A; 1AVZ C; 1ABQ A; 5IHN A; 1HD3 A; 1JO8 A; 1WYX A; 1Z9Z A; 2MIO A; 1MV0 B; 2G6F X; 2EPD A; 2L3P A; 2LNH B; 1X6B A; 2ROL A; 3NGP A; 1PNJ A; 1GFD A; 2RF0 A; 1G2B A; 2KXC A; 2DLP A; 2JW4 A; 2AK5 A; 2DIL A; 1K9A A; 1E7O A; 3H0F A; 1CSK A; 2X3W D; 1VYU A; 2BTT A; 3EG2 A; 4RTX A; 4JZ3 A; 1GCP A; 4LUE A; 3EGU A; 1UJ0 A; 2C0T A; 4DEY A; 2J6O A; 2A37 A; 1K76 A; 1M8M A; 3VS5 A; 2KYB A; 1KIK A; 1SHG A; 1KJW A; 1GRI A; 3NHN A; 2EYW A; 1QCF A; 2YUO A; 1RUW A; 3H41 A; 2JMA A; 4K11 A; 1AEY A; 1T3L A; 2KT1 A; 4J9B A; 1M30 A; 1QWF A; 1JXO A; 5FWB A; 2EKH A; 3JV3 A; 1X6G A; 2GTO A; 2KXD A; 4AG2 C; 1X27 A; 2CSQ A; 3KFV A; 1X2K A; 2DYB A; 1YCS B; 2DL8 A; 4JPB W; 2RQV A; 1UGV A; 2P4R A; 2LMJ A; 1H92 A; 2AZS A; 2YT6 A; 1UG1 A; 2HEQ A; 1X43 A; 3EG0 A; 2EYZ A; 2PNI A; 2EVR A; 1ZSG A; 2DVJ A; 2EBP A; 4HCK A; 2GTJ A; 2JS0 A; 1UFF A; 1OEB A; 2ED1 A; 4CC3 A; 1PWT A; 4OMP A; 3VS3 A; 1M3C A; 2X3X D; 2DRM A; 3M0P A; 1TUC A; 4F17 A; 1NEG A; 2RPN A; 2HCK A; 2JMC A; 3GBQ A; 2JM8 A; 3UA7 A; 5HCK A; 1FYN A; 2QDL A; 1BB9 A; 2K7A A; 1ZX6 A; 2NUZ A; 1EFN A; 4OMQ A; 1TG0 A; 3CQT A; 2FRY A; 1SPK A; 5FW9 A; 3H0I A; 2DE0 X; 2DMO A; 1NG2 A; 3UA6 A; 1G83 A; 3VS0 A; 2KEA A; 1GFC A; 2VWF A; 1B3Q A; 2D8J A; 1NLP C; 1I0C A; 2L3Q A; 3PVQ A; 2GGR A; 3H0H A; 2K6D A; 2EGA A; 2A36 A; 2H8H A; 1UTI A; 2YUQ A; 2KRO A; 2LX7 A; 1M27 C; 1OPK A; 1YN8 A; 2EYY A; 1YWO A; 3VRY A; 4GLM A; 4AFU C; 3ULR B; 2J6K A; 3M0Q A; 2KRN A; 1AOJ A; 2XMF A; 3R6N A; 4AFS C; 1VYT A; 3LH5 A; 1BU1 A; 5FWC A; 1NYF A; 1OPL A; 2DNU A; 1W70 A; 3A98 A; 3UF4 A; 3M0U A; 2PTK A; 1UE9 A; 2EGE A; 2CUD A; 2AZV A; 2CH4 A; 2ED0 A; 2BZ8 A; 3NPF A; 2JTE A; 2LCS A; 2B86 A; 1V1C A; 2J05 A; 2CH4 W; 2HSP A; 3PE0 A; 1ZLM A; 4J9H A; 3VS7 A; 1YP5 A; 1IO6 A; 1UUE A; 2LQN A; 3ZL7 C; 2GNC A; 5I11 A; 2JT4 A; 2FO0 A; 2FEI A; 3U23 A; 2RN8 A; 4JJD A; 4LN2 A; 2O9S A; 4JJC A; 2FPF A; 3EHR A; 1FMK A; 1M3B A; 2LP5 A; 3RBB B; 5L23 A; 3VS4 A; 1HSQ A; 2DL4 A; 3EG1 A; 2RMO A; 1A0N B; 1GCQ A; 1OOT A; 2V1R A; 2DA9 A; 1U06 A; 4CC7 A; 2RQR A; 1X2Q A; 4FSS A; 3VS2 A; 5GJV B; 4RTU A; 1NM7 A; 4OML A; 4D8D A; 4CC4 B; 1W6X A; 1AWW A; 1MV3 A; 2EYX A; 4DEX A; 1PHT A; 3IQL A; 1UJY A; 2YSQ A; 1AD5 A; 2VKN A; 2IIM A; 2YDL A; 3TSW A; 3REA B; 1LCK A; 4Z88 A; 4A63 B; 1NEB A; 1K0S A; 4GBQ A; 3NMZ C; 2EQI A; 1QWE A; 2YUP A; 1RLP C; 4ORZ A; 1SRL A; 2W0Z A; 2J7I A; 4J9D A; 2KT8 A; 1K0X A; 3I5R A; 4HVV A; 1RLQ C; 4J9G A; 4RTZ A; 2AKK A; 2BZX A; 3O5Z A; 3EHQ A; 1E6G A; 2DX1 A; 4ESR A; 1PRL C; 2LQW A; 2PZ1 A; 2HDA A; 4AFZ C; 2E5K A; 1GBQ A; 1SHF A; 4WCI A; 1KSW A; 4EIK A; 1H8K A; 1YWP A; 1NLO C; 1KFZ A; 5EC7 A; 3M0T A; 2FPE A; 2L0A A; 2MOX A; 2CUB A; 4F14 A; 1UDL A; 1AZE A; 2KRS A; 2GQI A; 2OJ2 A; 2CRE A; 2W10 A; 2KE9 A; 1CKA A; 2DF6 A; 2M51 A; 2DRK A; 1XOV A; 4X1V A; 5ECA A; 5I22 A; 3C0C A; 2LZ6 B; 2AKL A; 2NWM A; 1SEM A; 4HVU A; 3PVL A; 4OMN A; 4RTW A; 1SSH A; 1WIE A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4LXC A; 1JU5 C; 3MHX A; 4M78 B; 2VVK A; 2YWW A; 4C0Z A; 5KYX A; 4M78 C; 2O9V A; 3QWY A; 3M58 A; 1OU8 A; 1QKX A; 2FRW A; 2QEX A; 4M77 F; 4JJN K; 3REB B; 4RCC A; 4M7D G; 2O2O A; 1NJI U; 5DLO A; 5GAO q; 1VQ4 Q; 2Y4X A; 5LL6 S; 1TUD A; 2CSI A; 4J9F A; 4OB2 B; 4J9I A; 3CXC P; 4PJO A; 2D1X A; 1Q82 U; 1VQ6 T; 1PCX A; 2J6F A; 3M0R A; 4WF2 A; 1WLP B; 2K3Y A; 2ZPI B; 4L5G A; 3LX7 A; 5IXF A; 2EFI A; 4HT8 A; 4JRI A; 3CCL Q; 5GAN h; 2KGT A; 1Q7Y C; 1TOV A; 2C0O A; 2PVG B; 1O9S A; 1OYX A; 3E1S A; 2E65 A; 1ZUY A; 2DZC A; 2K3B A; 5LJ5 j; 2FZG B; 3EGX A; 2PVD B; 2RHU A; 2LT1 A; 3QJ6 A; 3QXE B; 3OBW A; 3P8H A; 5I2S A; 3EG3 A; 2JVV A; 1K4U S; 4NS5 A; 4M7D D; 2K79 A; 1ACM B; 2HQH A; 1G3T A; 4J6W A; 1VQ6 Q; 3S3N A; 5GAO r; 4RTY A; 2EJF A; 1JEG A; 5HY6 A; 5D7U A; 5IXB A; 4F7U A; 1VQ8 Q; 2QGF B; 9ATC B; 2A7Y A; 4C92 A; 1IRX A; 2WSE E; 2KSS A; 3RR6 A; 1S1N A; 4Y92 A; 2E3I A; 1B07 A; 2GCX A; 1VQ5 Q; 1SRM A; 2RK2 A; 1YBY A; 2ZPF B; 3THK A; 2M1H A; 2DL5 A; 1BI1 A; 3M57 A; 1WXU A; 2X35 A; 1D09 B; 3EH2 A; 1JJ2 S; 2VV5 A; 4JRQ A; 2AIR B; 1BIA A; 2XHC A; 4C92 F; 1AWO A; 4OMF B; 3UT1 A; 3C4S A; 3HFN A; 5IH2 A; 1M1F A; 4M75 A; 3JCM h; 1IGQ A; 4X9D A; 2GBQ A; 2YRV A; 2ESW A; 1JXM A; 4E6R A; 3JB9 I; 2C0I A; 1R0C B; 2YUN A; 4MZT A; 2HL3 A; 3LGL A; 1VQ4 A; 1T3S A; 4ELY C; 3TVT A; 3L2R A; 2LCC A; 4KGZ B; 1Y57 A; 3RKY A; 7AT1 B; 1MND A; 4BUG A; 1Q95 G; 2JS2 A; 4HKE A; 8ATC B; 1W1F A; 1PSF A; 4C8Q G; 4Z8A A; 5GAN 8; 2EIF A; 2DL7 A; 4XTV A; 3CCL A; 2XD0 A; 3MEU A; 1GL5 A; 3OB9 A; 1Z9Q A; 2R5A A; 3SWN B; 2DZ9 A; 3SWN C; 1RAH B; 5GMK l; 2CDT A; 4DOW A; 1TTH B; 4WTO B; 2FPD A; 2O4X B; 5GAO m; 2KNB B; 3CC2 Q; 4RKU E; 4KBM B; 2O88 A; 3V8J A; 3JB9 G; 5IHN A; 2E12 A; 1HD3 A; 2MIO A; 1MV0 B; 4PFP A; 3OYI A; 2LNH B; 2BKD N; 1WPY A; 2QXF A; 1GFD A; 1Q86 R; 1YJW Q; 3CMA Q; 2JW4 A; 1I5O B; 2D6F A; 2KVQ G; 1E7O A; 1QVF P; 1VQ6 A; 1VYU A; 5CIU A; 5GAN 4; 4LUE A; 1YCY A; 1K9M U; 1M90 U; 3ZFJ A; 3CCJ T; 2KDS A; 3G4S Q; 1VQ8 A; 1KG1 A; 4ZGJ B; 3L2Q A; 1IGU A; 3NHN A; 4OGE A; 1VQ5 A; 1RUW A; 2F1L A; 1UGS B; 2V8J A; 1AEY A; 5LJ3 f; 3I56 T; 1QWF A; 3MKD A; 2YXY A; 4QVC A; 1Q81 R; 1WHL A; 3CXC A; 4IKF A; 2QYZ A; 2KXD A; 1M2V A; 3JB9 D; 3GOX A; 1JBM A; 4C5E A; 2RH2 A; 3NTI A; 4QKU A; 3CCU Q; 2DIQ A; 5CQX A; 5KYX B; 2WAC A; 1UGR B; 1X43 A; 1WJS A; 1ZSG A; 1UFF A; 2ED1 A; 3MPU B; 2QQR A; 1RAG B; 4E7H A; 1TUC A; 5FU7 C; 4PNO A; 3OSS C; 1NEG A; 4N0A A; 4PJO B; 2HCK A; 1K9M C; 3OS2 A; 4A4E A; 2JM8 A; 4PJO C; 1M90 C; 3QYH B; 1KQS A; 4M78 E; 3A8H B; 2DEU A; 5KYN A; 1ZX6 A; 3GIB A; 1EFN A; 4E7J A; 1YJN Q; 3TU4 K; 3CQT A; 3H6Z A; 3H0I A; 2DMO A; 5DY9 A; 2BIV A; 3CC2 A; 5EG2 A; 3VS0 A; 5LJ5 g; 1GFC A; 1B3Q A; 5GAN e; 5GAN 7; 2RI5 A; 3PVQ A; 3A8O B; 4XTW A; 2QK0 A; 3EGX B; 1VQN T; 1QMC A; 1QQJ A; 5CAI A; 1YJW A; 4PLI A; 3CMA A; 1YHQ T; 1K73 C; 1K8A C; 1S72 T; 2LX7 A; 1OPK A; 2RO0 A; 4AFU C; 2DAQ A; 3ZEH A; 1NZ9 A; 3M0Q A; 5C0M A; 2KRN A; 1I4K 1; 2DKG A; 2KK4 A; 1BCM A; 1KK7 A; 4M77 D; 3G4S A; 4M7A G; 3A98 A; 1WGS A; 1KC8 R; 1D1A A; 1D3B B; 1UE9 A; 1WHH A; 4A54 A; 2EGE A; 2AT1 B; 3DLL A; 4F7U B; 2AZV A; 2CH4 A; 2ED0 A; 1IRE B; 4C92 C; 4FM4 B; 1ZLM A; 2V26 A; 4CI0 C; 4JDS A; 1SSF A; 1IO6 A; 3KXT A; 4M7D A; 4C5G A; 5I11 A; 2FO0 A; 3U23 A; 3CPW P; 2XDB A; 5AYF A; 3FDR A; 1M3B A; 3RBB B; 3CCU A; 1HSQ A; 2HMA A; 4KGV B; 1A0N B; 1G3S A; 3A8G B; 1GCQ A; 1VQ9 T; 1QP2 A; 4FW1 A; 3QYG B; 4M75 B; 4M75 C; 4ELZ C; 5D6W A; 4NL2 A; 2X51 A; 4FSS A; 4JRP A; 3C12 A; 5GJV B; 4M7A D; 2EQJ A; 3C95 A; 2EQK A; 4E47 A; 1AWW A; 2E1H A; 4OB1 B; 4DEX A; 1M9S A; 2JN0 A; 1UJY A; 3DB4 A; 1AD5 A; 3TSW A; 3CC7 Q; 2KMT A; 4A63 B; 5CKB A; 2ZPB B; 1HYO A; 3NMZ C; 1YJN A; 2EQI A; 4EPC A; 1RLP C; 3G6E T; 4J9D A; 3I5R A; 4J9G A; 2RHY A; 3M9Q A; 2BZX A; 4GY5 A; 1E6G A; 1VQ9 Q; 3VYH B; 2DX1 A; 1Y96 A; 3HL8 A; 4WCI A; 1KSW A; 1LPL A; 4QW2 A; 1YWP A; 1N9R A; 4PLL A; 2VXE A; 3JCM V; 5GAO p; 4Q5W A; 2FPE A; 2L0A A; 1O75 A; 2CUB A; 2MOX A; 4F14 A; 5GAM j; 2GQI A; 3CD6 T; 3RMQ A; 2CRE A; 5L8R E; 2W10 A; 5C6S A; 2KE9 A; 1CKA A; 2DD5 A; 4DBH A; 1N8R R; 3JSC A; 1XJW B; 4YTL A; 1WZO A; 1YIJ T; 1G3Y A; 1OU9 A; 4E7Z A; 4V2S A; 4LD6 A; 4R55 A; 3V7S A; 2LJ0 A; 1VIE A; 3I35 A; 2COZ A; 3TSZ A; 2FG0 A; 2H3J A; 3ASK A; 1M2V B; 4JLG A; 1NJI R; 1QVF S; 3PMI A; 2F69 A; 1H3Z A; 1TXQ A; 1Q82 R; 2ZCF B; 2QDY B; 2KI7 A; 4OB0 B; 4DA4 A; 2FB7 A; 4BE1 A; 2CT3 A; 1BK2 A; 1UHC A; 4OGC A; 3M0S A; 1I8F A; 4M4Z A; 4ZGE B; 1M4Z A; 1WX6 A; 4N4H A; 4C8Q F; 1Y71 A; 3CC7 A; 3QUI A; 5GAO n; 2SRC A; 4N0A C; 2QA4 T; 1AWX A; 2VAS A; 4LDV A; 1WXT A; 4O6J A; 2QG9 B; 2CP3 A; 2E6N A; 3SHW A; 1U5S A; 1ZBJ A; 2PUO B; 1NBE B; 4FL6 A; 2COW A; 2CZ6 B; 5CKF A; 1VQ9 A; 3JB9 F; 4J9C A; 1VQO Q; 1UEC A; 5J39 A; 3OS1 A; 5KE2 A; 1M1G A; 3QSU A; 6AT1 B; 4PJO E; 1PKT A; 2P0K A; 4RTT A; 2DK3 A; 2DM1 A; 3CPW A; 4HT9 A; 2KBT A; 2DD4 A; 4OMO A; 4CRI A; 3F70 A; 4AFQ C; 1VQM T; 2H3E B; 2O31 A; 2LJ3 A; 2F2W A; 3BY7 A; 4KRT A; 1VQL T; 2RQT A; 3JB9 H; 2ZGW A; 4IUR A; 1QLY A; 1PD1 A; 5GMK e; 2EAY A; 3J80 E; 1Q7Y U; 4RUG A; 1Y0M A; 3DB3 A; 1MGQ A; 2MWP A; 4M7D B; 4FT4 A; 4QT7 A; 5J3B A; 4M7D C; 4M77 A; 3HRU A; 1MUZ A; 4IIM A; 4JZ4 A; 1VQP Q; 3RKW A; 2KQW A; 2DXB A; 2ROT A; 4F7U E; 3SEM A; 4MMK A; 2CT4 A; 1M3A A; 1WDX A; 3LWI A; 4ZGD B; 1GCQ C; 1JQQ A; 2KYM A; 2DJQ A; 1W2B P; 2ZPG B; 1VQL Q; 3FJ5 A; 3LGF A; 4R0K A; 1H3H A; 2BZY A; 2MWO A; 3RES A; 3FJP A; 1X69 A; 1OQK A; 2D0N A; 3C94 A; 5LJ3 j; 4J9E A; 5CCA A; 3I5S A; 2QAS A; 3I9Q A; 3MP8 A; 2DEQ A; 2FZK B; 2CKK A; 2L89 A; 1AVZ C; 4RMO A; 3MEW A; 1ABQ A; 3A5Z B; 1N6A A; 1JO8 A; 4M75 E; 2NUP B; 3HHT B; 2G6F X; 2EPD A; 2L3P A; 1IB8 A; 5GAM f; 3NGP A; 1VQ7 Q; 2LT4 A; 1OUL A; 2E4H A; 2KXC A; 4M7A A; 4HCB A; 1HK9 A; 1H64 1; 2DIL A; 1VQO A; 2VB6 A; 4KUL A; 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