The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
69
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structure length |
69
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Chain Sequence |
b'KDPKFEAAYDFPGSGSSSELPLKKGDIVFISRDEPSGWSLAKLLDGSKEGWVPTAYMTPYKDTRNTVPV'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Myosin-3 isoform
|
| molecule tags |
Contractile protein
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| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
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| publication title |
Crystal structure of the SH3 domain from S. cerevisiae Myo3
rcsb |
| total genus |
11
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| structure length |
69
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| sequence length |
69
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-12-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2KRN A; 4HVW A; 1MV3 A; 4M4Z A; 2QDL A; 5HCK A; 5IXF A; 3VS7 A; 2KYB A; 2DBM A; 3M0P A; 2EVR A; 2KYM A; 2OAW A; 2KR3 A; 2DIL A; 2E5K A; 2HDA A; 2DVJ A; 1VYU A; 1E6G A; 1RI9 A; 2H8H A; 2DRM A; 4EIK A; 1ZX6 A; 3EHQ A; 4RTU A; 4F16 A; 4CC7 A; 2CSI A; 4LN2 A; 1K0S A; 1HSQ A; 2LP5 A; 4GBQ A; 5I11 A; 1ZUY A; 3NMZ C; 4R0K A; 2EGA A; 2ABL A; 1UJ0 A; 1U5S A; 2JTE A; 1NM7 A; 2LJ0 A; 3SEM A; 2CUD A; 4IIM A; 1GCQ A; 3VS1 A; 3ZL7 C; 1T3L A; 3I5R A; 5FWC A; 2BTT A; 2ROT A; 3I9Q A; 1YNZ A; 2DL3 A; 1WDX A; 4X1V A; 4IIO A; 2ESW A; 1OPL A; 2A36 A; 4RTX A; 2LCS A; 2RMO A; 1YN8 A; 4AG1 C; 1T3S A; 2J7I A; 3PVQ A; 3H0F A; 4RTY A; 4A63 B; 2CUB A; 1CSK A; 2V1R A; 2OJ2 A; 2JM8 A; 4J9F A; 3VS4 A; 3PVL A; 4J9H A; 1W70 A; 2AKL A; 2C0T A; 2IIM A; 2J6O A; 1N5Z A; 1UJY A; 2CRE A; 3M0S A; 2K9G A; 1FMK A; 4F17 A; 2W0Z A; 2CH4 W; 1JXO A; 2DJQ A; 2J05 A; 4OMN A; 2LNH B; 2C0O A; 2JM9 A; 1TG0 A; 1PRM C; 2DYB A; 3EHR A; 3EGU A; 1OPK A; 2JMC A; 1NLP C; 1M3B A; 2M51 A; 4ESR A; 2D1X A; 4AG2 C; 2M0Y A; 2RQV A; 1AOJ A; 2B86 A; 2J06 A; 4HVV A; 1KJW A; 2PZ1 A; 2EYW A; 2HEQ A; 4JZ4 A; 2DL5 A; 2MOX A; 1UG1 A; 1GBR A; 1UTI A; 3FJ5 A; 1E7O A; 2HSP A; 1K0X A; 2RN8 A; 1Y57 A; 2J6K A; 4J9D A; 1RLQ C; 3EG3 A; 5IXB A; 2GNC A; 5L23 A; 1YWP A; 3REB B; 1YWO A; 4OMP A; 5IHI A; 2ROL A; 1AWW A; 3H41 A; 1U3O A; 1GFC A; 4RTV A; 3NHN A; 2O31 A; 2DE0 X; 2MIO A; 2EYX A; 4OMO A; 2FPD A; 2DF6 A; 1NEB A; 1AZE A; 2DLP A; 3M0Q A; 4OMQ A; 1AEY A; 1AWX A; 3TVT A; 1GRI A; 2I0N A; 3O5Z A; 2DL7 A; 1RLP C; 2YUP A; 2ENM A; 1OOT A; 2KBT A; 2W10 A; 1PNJ A; 2DNU A; 1MUZ A; 1NG2 A; 2D0N A; 1I0C A; 1K76 A; 3UAT A; 3I35 A; 1HD3 A; 4JJD A; 1ZBJ A; 2DRK A; 1IO6 A; 1OV3 A; 3M0R A; 3R6N A; 1PHT A; 4J9E A; 3C0C A; 3CQT A; 1H8K A; 2RQU A; 2RNA A; 1M3C A; 2RQT A; 4JZ3 A; 2L3Q A; 2RQR A; 4OML A; 1I1J A; 1QKX A; 1X2Q A; 4K11 A; 2A28 A; 4RUG A; 5IHK A; 1G2B A; 5IH2 A; 2F2X A; 2FG0 A; 2CT4 A; 1NLO C; 2KRO A; 2CT3 A; 2FO0 A; 1UUE A; 1PWT A; 1H92 A; 2GBQ A; 2O2O A; 1WFW A; 2EPD A; 2JW4 A; 1SSH A; 1SPK A; 2DM1 A; 3VRY A; 5FWB A; 2MCN A; 4JJC A; 1W1F A; 3VS3 A; 1OEB A; 4LUE A; 4LUD A; 1CKB A; 1QLY A; 1G83 A; 2PTK A; 1ABO A; 1UHC A; 2HBW A; 3RNJ A; 4DEY A; 2BZ8 A; 2RF0 A; 2P4R A; 3EG0 A; 2EKH A; 2O88 A; 1H3H A; 2K79 A; 1WX6 A; 1SHG A; 1GL5 A; 2KXC A; 1JXM A; 5FW9 A; 2LQW A; 1S1N A; 2DMO A; 2OI3 A; 4AFQ C; 4HXJ A; 1KSW A; 1A0N B; 2FPE A; 1UGV A; 2CH4 A; 1ARK A; 4RTZ A; 4D8K A; 2JS0 A; 3UF4 A; 2D8H A; 3JV3 A; 4AFS C; 3VRZ A; 1GCQ C; 2SRC A; 4CC4 B; 5IHN A; 1NEG A; 2KT8 A; 2GTO A; 2YSQ A; 2JMA A; 1Y0M A; 2NWM A; 3NGP A; 1HJD A; 1AZG B; 2AZS A; 1EFN A; 1M27 C; 2KGT A; 3VS6 A; 1KIK A; 1VA7 A; 2LQN A; 1U06 A; 1JO8 A; 1WLP B; 2KE9 A; 2JT4 A; 1PKT A; 1PRL C; 1UDL A; 1MV0 B; 1WA7 A; 2KRM A; 1UE9 A; 1JU5 C; 2HCK A; 4J9C A; 5ECA A; 4E6R A; 1K9A A; 2O9S A; 2X3X D; 1B07 A; 1BBZ A; 1QWF A; 3TSW A; 2KXD A; 5EC7 A; 1K4U S; 2KRS A; 4CC2 A; 2FRW A; 4RTW A; 4LE9 A; 2GTJ A; 2ED1 A; 3SHW A; 4D8D A; 1LCK A; 1TUC A; 4RTT A; 1SEM A; 2K3B A; 3EG2 A; 2K2M A; 2YDL A; 3THK A; 1AWO A; 1VYT A; 4DEX A; 4ZNX A; 1I07 A; 2L2P A; 4ORZ A; 2FRY A; 2SEM A; 4FSS A; 1ABQ A; 4GLM A; 2RPN A; 2A37 A; 2LJ1 A; 2XMF A; 2JXB A; 1ZSG A; 1TUD A; 4WCI A; 1WXT A; 3QWX X; 2O9V A; 1X43 A; 2YUQ A; 1E6H A; 1AD5 A; 1BK2 A; 2KT1 A; 3VS2 A; 4CC3 A; 1T0H A; 2EGE A; 1AVZ C; 1QWE A; 1XOV A; 2F2V A; 1NYF A; 2D8J A; 1X6B A; 2KNB B; 1QCF A; 2V1Q A; 3VS0 A; 1UFF A; 2F2W A; 4JJB A; 3UA6 A; 2CSQ A; 2VKN A; 1GFD A; 2BZX A; 1SHF A; 2EW3 A; 3GBQ A; 3NPF A; 1W6X A; 2JS2 A; 1X6G A; 2LX7 A; 4J9B A; 2L0A A; 2YT6 A; 1WYX A; 5I22 A; 2EBP A; 1JQQ A; 1RUW A; 2BZY A; 2DL4 A; 1BU1 A; 2KEA A; 1WXU A; 2VVK A; 3A98 A; 4LNP A; 3EG1 A; 1WXB A; 4KRT A; 2AKK A; 1VYV A; 2A08 A; 2ED0 A; 1PKS A; 1KFZ A; 5GJV B; 3M0T A; 1J3T A; 1Z9Z A; 3REA B; 4HVU A; 1WI7 A; 2GQI A; 4HCK A; 3H0H A; 2EGC A; 2YUO A; 2EYY A; 2YUN A; 1ZLM A; 2G6F X; 1X69 A; 2AZV A; 1X2K A; 2FPF A; 1T0J A; 1YCS B; 1ZUU A; 3KFV A; 1UHF A; 4Y92 A; 1M30 A; 4Z8A A; 3TSZ A; 1CKA A; 1M8M A; 2L3P A; 1WIE A; 4AFU C; 1SRM A; 1FYN A; 4JPB W; 1SRL A; 4OMM A; 2EQI A; 3RBB B; 4Z89 A; 1K1Z A; 3PE0 A; 2FEI A; 1ZUK A; 2X3W D; 2CDT A; 3ULR B; 3U23 A; 1V1C A; 4QT7 A; 3I5S A; 3IQL A; 2RQW A; 2DBK A; 3M0U A; 2ECZ A; 2DX1 A; 3LH5 A; 2GGR A; 4Z88 A; 3QWY A; 2VWF A; 2DA9 A; 4F14 A; 1QKW A; 2LMJ A; 2DL8 A; 1GBQ A; 1Z9Q A; 3UA7 A; 1UEC A; 2C0I A; 1YP5 A; 1GCP A; 5GJW B; 4J9I A; 2K6D A; 2L3S A; 3H0I A; 4J9G A; 1NYG A; 4AFZ C; 2NUZ A; 1B3Q A; 2EYZ A; 1BB9 A; 2LJ3 A; 2PNI A; 2LZ6 B; 2K7A A; 2J6F A; 1X27 A; 3VS5 A; 1JEG A; 1M3A A; 1AWJ A; 2AK5 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4M4Z A; 5LJ3 e; 5HCK A; 2V8J A; 5IXF A; 3VS7 A; 4RG2 A; 2KYM A; 4J6W A; 3PTA A; 2E5K A; 3RKW A; 3OYM A; 1VYU A; 2H8H A; 3TRE A; 4BDY A; 5CVI A; 2COZ A; 2DRM A; 2K57 A; 5AYF A; 5GAO n; 3OBY A; 4RTU A; 4F16 A; 1Q81 U; 1M1F A; 4JUV A; 4LN2 A; 2LP5 A; 3L2Z A; 5LJ3 j; 1H64 1; 5GAO q; 5I11 A; 4FYX B; 1ZUY A; 4HT8 A; 2EGA A; 1UJ0 A; 1U5S A; 1XJW B; 1NM7 A; 1QVG P; 2CUD A; 1NE8 A; 2Y4X A; 4OB2 B; 1GCQ A; 3VJP A; 1QCN A; 4EMK B; 3INZ A; 3TCJ A; 3MEW A; 1MMG A; 4MML A; 4F7U A; 1S72 A; 1Q7Y C; 5GMK l; 3I9Q A; 2LQ8 A; 4FL6 A; 1KC8 C; 1WDX A; 4BE1 A; 1PG5 B; 4M75 F; 3OW2 A; 2XK0 A; 5LJ5 g; 4E7K A; 1YN8 A; 4XQ3 A; 4AG1 C; 1T3S A; 3A8O B; 1VQ4 Q; 4LD9 K; 4A63 B; 2CUB A; 2DKG A; 1D3B B; 2KY9 A; 1BCM A; 1YJW T; 4J7I A; 1M2O A; 3PGG A; 3PVL A; 3CCE A; 2QQ9 A; 4C8Q A; 4DBQ A; 4KGX B; 4LDV A; 6AT1 B; 2RK2 A; 4MMK A; 5A2Q E; 3M0S A; 4V2S A; 4C0Z A; 4M7D B; 1TWB A; 2DJQ A; 4PJO D; 1YIJ A; 4Z02 A; 1WZO A; 2XKO C; 2EKO A; 4IUP A; 4KH1 B; 3EHR A; 5KYW A; 3X24 B; 1N9S A; 4NOY A; 4ESR A; 4M78 A; 4M7A G; 1QP2 A; 3NFC A; 3HRT A; 4PJJ A; 1Q7Y U; 3KBG A; 5LJ5 e; 2J06 A; 3G1J A; 2HL3 A; 2CYZ B; 3FLG A; 1UG1 A; 1GBR A; 3HTR A; 1KG1 A; 2DEQ A; 1RAA B; 2K3Y A; 3FJ5 A; 3HL8 A; 3DB4 A; 3N5B B; 4XTV A; 3OYH A; 2E41 A; 1Y96 A; 4J9D A; 5FRO A; 1RLQ C; 3CCJ Q; 3REB B; 1YWO A; 4OMP A; 5IHI A; 2ROL A; 3H41 A; 3HHT B; 1Q86 U; 2EYX A; 1ZA2 B; 8ATC B; 2LTO A; 3VU3 C; 1AZE A; 3M0Q A; 1RAI B; 1YJ9 T; 3CCS A; 4O6J A; 1VQ6 T; 2LVM A; 1G3S A; 2I0N A; 3G6E Q; 4HKE A; 2ENM A; 1OOT A; 2COY A; 4B9X A; 3TEE A; 3CCS T; 1ZBJ A; 1OV3 A; 1YI2 T; 4CI0 C; 4C0F A; 2QEX Q; 3CQT A; 2RNA A; 2QDY B; 4JZ3 A; 1IGU A; 2RQR A; 3LGL A; 1VQ7 Q; 1I1J A; 1F1B B; 1WHK A; 2VGM A; 2NUP A; 5IH2 A; 2F2X A; 1RL2 A; 3JCM W; 1OZ3 A; 1G3T A; 2KRO A; 2L3R A; 4NL2 A; 3OBW A; 1H92 A; 4C0G A; 1QVF A; 1SPK A; 2DFU A; 2DM1 A; 2EFI A; 5FWB A; 4N4G A; 5GAO p; 2RO0 A; 2H3E B; 5D7U A; 4O5V A; 1G83 A; 2JOY A; 1ABO A; 1YI2 Q; 4DEY A; 1BI1 A; 4X9D A; 2LC4 A; 2JVV A; 4M77 E; 3PFS A; 2YRV A; 3MO8 A; 1LJO A; 1QVG A; 1WHJ A; 4RCC A; 4D8K A; 2M9U A; 5GAM f; 3EGX A; 4M7A B; 4C5G A; 1QP3 A; 2PVO B; 3L2V A; 5IHN A; 2M02 A; 1QCO A; 2GTO A; 1TTH B; 2JMA A; 2QQS A; 2L5Q A; 1TOV A; 1AZG B; 3EGX B; 3VS6 A; 1Y7X A; 1QVF S; 2EAY A; 1X6O A; 2XDB A; 2HCK A; 4OB1 B; 5ECA A; 4PNO A; 3HPW A; 5GAM h; 3OMG A; 4JJN K; 2VV5 A; 3CCV A; 3DLL A; 1B07 A; 1QMC A; 1BBZ A; 1WHG A; 2KXD A; 5EC7 A; 4JS5 A; 5IN1 A; 3QKJ A; 1RI0 A; 3M58 A; 3I56 T; 3HRU A; 3LWH A; 2BE7 D; 4ZN3 A; 1G5V A; 1KQ2 A; 1OX8 A; 2MMP A; 3G7Z A; 1TUC A; 2BUD A; 4XU1 A; 2COW A; 1VQ5 T; 1R0C B; 2VUB A; 3M54 A; 4DEX A; 3PIO A; 1VQO T; 4M75 G; 4GLM A; 4BI8 B; 3RIR A; 1K73 R; 2CP6 A; 4ME7 A; 1WQ7 A; 1AD5 A; 1YJ9 Q; 3CC4 Q; 3VS2 A; 1S72 Q; 3C95 A; 3RMQ A; 1XOV A; 1RAF B; 1NYF A; 2KNB B; 1QCF A; 4OB3 B; 2FHD A; 3OB9 A; 4ZGJ B; 2V1Q A; 3MJX A; 3UA6 A; 2CSQ A; 3WXM B; 4WF2 A; 3C4S A; 5GAN j; 1W6X A; 3SWN A; 3CCE Q; 3CCU Q; 4J9B A; 4LDU A; 3TU4 K; 1I81 A; 5CKB A; 2JZ2 A; 3JCM c; 1IGQ A; 3CC4 T; 2X9H A; 3A98 A; 3I55 T; 3JB9 G; 2RHI A; 4KRT A; 4C8Q E; 4F7U B; 5GAO l; 5GJV B; 2AIR B; 2GQV A; 3FC3 A; 2CKK A; 1J3T A; 4KGV B; 1DJ7 B; 3REA B; 3A8L B; 2WSC E; 4GLK A; 3JRZ A; 5FLX E; 4OB0 B; 1ZLM A; 2AZV A; 2RK1 A; 2QA4 A; 4M7A D; 3A8G B; 1X2K A; 5LJ3 h; 1O75 A; 4C92 F; 1WJS A; 3JB9 F; 1T0J A; 4M7D A; 4KBM B; 5KYY A; 2E6Z A; 3KFV A; 3G71 Q; 4Y92 A; 3JCM e; 3GF5 A; 3SFM A; 3TSZ A; 1M1K R; 1U8R A; 2X4W A; 8AT1 B; 2QA4 T; 3SWN C; 3OSS C; 1SRM A; 3A8M B; 2EQK A; 3JCM X; 3Q1J A; 1PD1 A; 3JCM d; 4M75 C; 3CCS Q; 3D7S B; 1D1A A; 1Q82 U; 1VQL Q; 1WHL A; 2CDT A; 2CZ0 B; 4M78 D; 4HCC A; 4QW2 A; 1V1C A; 2F5T X; 4QT7 A; 3I5S A; 2KK4 A; 3IQL A; 3DLM A; 2MPX C; 5DM7 R; 1VQ9 A; 1IZ6 A; 4LDW A; 2M16 A; 1KD1 U; 4L6V 5; 1MND A; 2VWF A; 4XTY A; 4EMK A; 3UA7 A; 2DL8 A; 1GBQ A; 2QEX A; 4C92 B; 3CC2 A; 4OGC A; 4C8Q D; 2PU9 B; 4E7H A; 2K6D A; 3S6W A; 3PMI A; 5CQX A; 2NUZ A; 2QTX A; 3GP8 A; 2KAF A; 4RMO A; 2EYZ A; 1U1S A; 2K7A A; 1JEG A; 1M3A A; 2KRN A; 3CCM Q; 2QDL A; 3OSV A; 2EQU A; 4M75 A; 2KYB A; 3PIP A; 4QKU A; 3SD4 A; 2OAW A; 5I2S A; 2KR3 A; 3P8D A; 5DLO A; 2HDA A; 1M1K C; 2P0Q A; 3QO3 A; 1OI1 A; 1VQK A; 2VYT A; 4J7F A; 2LRQ A; 4CC7 A; 3M57 A; 2MWP A; 4GBQ A; 1FX7 A; 1RAB B; 3CXC S; 4R0K A; 4FM4 B; 1KC8 R; 1TXQ A; 2QTV A; 4BUG A; 3VUB A; 3J7A F; 1ACM B; 1T3L A; 4XU3 A; 3JCM Q; 1X75 C; 3ASK A; 2FZG B; 5LJ3 d; 2BTT A; 4LDX A; 1VUB A; 1KQ1 A; 1OPL A; 4M75 D; 1VQ4 A; 4RTX A; 2LCS A; 3UWN A; 1M4Z A; 2X4X A; 2J7I A; 3PVQ A; 5GAN 4; 3FJP A; 1CSK A; 2JUF A; 3RER A; 1U1T A; 2D9T A; 1TUG B; 4FW1 A; 4J9F A; 1Q86 R; 2HL5 C; 4J9H A; 2NUT B; 4HCB A; 3E2U A; 2AKL A; 3SB2 A; 2PVD B; 3OMC A; 1JBM A; 3BW1 A; 3CCV Q; 2DPP B; 2L8D A; 4FIB A; 5KYN A; 1KQS A; 3CMA A; 2CRE A; 4PJO B; 1YIJ Q; 4HT9 A; 1FMK A; 2CH4 W; 4PJO F; 1NJI C; 1VQ6 A; 2J05 A; 4OMN A; 3MP1 A; 2DYB A; 1UGP B; 1N9R A; 1OPK A; 4XU2 A; 4C92 G; 1S72 T; 2M51 A; 2X4J A; 5HK3 A; 4UC4 A; 3F70 A; 2RQV A; 1YCY A; 3JCM V; 5D6X A; 1AOJ A; 3G4S Q; 1C0M A; 2EYW A; 4JZ4 A; 2DL5 A; 3M4Y A; 4E2F B; 3OYC A; 3OW2 S; 3LGF A; 1YIJ T; 2J6K A; 1TS9 A; 3S3N A; 2E3H A; 3RKX A; 1WHM A; 3FEO A; 3CCU T; 3VYG A; 4FYY B; 3WVE B; 5KYX B; 2Z0W A; 3MCA B; 4PJO E; 3AT1 B; 3NHN A; 2O31 A; 4FSX A; 3QBY A; 4IUQ A; 4QQ6 A; 2FPD A; 4XTX A; 1VQM Q; 3G6E A; 2DLP A; 3JAM E; 1AWX A; 1KQS S; 4KUD K; 4X34 A; 2IVW A; 4J83 A; 5A0L A; 4RKU E; 3OYB A; 2RJF A; 1RLP C; 2KBT A; 2W10 A; 1M5Q 1; 3MP8 A; 5KH6 A; 3NTH A; 1MUZ A; 1NG2 A; 1I0C A; 1WQW A; 4XAX B; 2DRK A; 3HKS A; 1IO6 A; 4QQG A; 3R6N A; 3CC7 T; 1PHT A; 4J9E A; 3WVD B; 4PLI A; 1H8K A; 2RQU A; 2FVU A; 1M3C A; 2RQT A; 2JJ9 A; 1M8V A; 4OML A; 1QKX A; 3H6Z A; 4MZM A; 5IHK A; 1QVP A; 1G2B A; 3E9F A; 2FG0 A; 1NLO C; 5EG2 A; 1VQP A; 1UUE A; 2FZC B; 1PWT A; 1UGR B; 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