The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
69
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structure length |
69
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Chain Sequence |
b'KDPKFEAAYDFPGSGSSSELPLKKGDIVFISRDEPSGWSLAKLLDGSKEGWVPTAYMTPYKDTRNTVPV'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Myosin-3 isoform
|
| publication title |
Crystal structure of the SH3 domain from S. cerevisiae Myo3
rcsb |
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
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| molecule tags |
Contractile protein
|
| total genus |
11
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| structure length |
69
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| sequence length |
69
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-12-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2YSQ A; 1Z9Q A; 2VWF A; 2CT4 A; 3VS5 A; 2EGC A; 2YUN A; 1I1J A; 1U06 A; 2L0A A; 2DVJ A; 3NHN A; 3M0S A; 3VS3 A; 2K79 A; 1E6H A; 4LE9 A; 5IHN A; 1WXT A; 2O9V A; 1QWF A; 4J9D A; 1NLO C; 2L2P A; 2ESW A; 3EHQ A; 2X3W D; 2K9G A; 1K4U S; 1UDL A; 1YNZ A; 2FPD A; 4J9H A; 1PKS A; 1WX6 A; 4KRT A; 1YP5 A; 1K9A A; 5IXB A; 4JZ3 A; 1RLQ C; 2LJ3 A; 3H0F A; 1BB9 A; 2C0O A; 3M0T A; 1M3C A; 1M30 A; 2X3X D; 1UE9 A; 3EG2 A; 2HSP A; 1UJY A; 1NG2 A; 1GL5 A; 2KNB B; 3NGP A; 1M3B A; 1RI9 A; 3JV3 A; 1UG1 A; 1LCK A; 1UHF A; 3VS7 A; 4CC2 A; 1HJD A; 2DL8 A; 2RPN A; 4HVU A; 1RLP C; 1E6G A; 4IIM A; 2KYB A; 4HVW A; 2EBP A; 2YUQ A; 5FW9 A; 1QWE A; 2EQI A; 2KE9 A; 2LNH B; 1WLP B; 5IH2 A; 1AOJ A; 2FRW A; 4D8D A; 1SHG A; 1X27 A; 3ULR B; 1T0J A; 1MV0 B; 2CH4 A; 3M0Q A; 2HCK A; 3SEM A; 2YT6 A; 1JO8 A; 4JJC A; 2CDT A; 2O9S A; 4F14 A; 2DYB A; 4GLM A; 4RTU A; 3NMZ C; 1ZBJ A; 2GNC A; 1M27 C; 1UHC A; 2DL4 A; 3EG3 A; 2IIM A; 1Y0M A; 4CC7 A; 1W6X A; 4AG2 C; 1EFN A; 1GRI A; 3EHR A; 3CQT A; 1I0C A; 2FPF A; 1K0S A; 1KJW A; 1SHF A; 3H41 A; 4RTZ A; 3I5S A; 2CT3 A; 2F2V A; 2H8H A; 3M0R A; 2LZ6 B; 3M0P A; 2CUB A; 2SRC A; 5EC7 A; 2KR3 A; 3VS0 A; 2HBW A; 2ED1 A; 4J9C A; 2NWM A; 2GGR A; 4OMP A; 2KRN A; 1AZE A; 2ED0 A; 3EGU A; 4HCK A; 2ROL A; 3VS6 A; 3PVL A; 1H8K A; 1NYG A; 1ABO A; 1QKW A; 5FWC A; 3PE0 A; 1QLY A; 2EYW A; 4M4Z A; 1SEM A; 2JXB A; 1NYF A; 1RUW A; 3NPF A; 1WA7 A; 4RTT A; 1YWP A; 2C0T A; 1X6G A; 1GFC A; 4JJD A; 1ZUK A; 2O31 A; 3FJ5 A; 5FWB A; 2BZY A; 2HEQ A; 3QWY A; 4WCI A; 2DBK A; 2JMA A; 1X2K A; 2J6O A; 2ABL A; 1X6B A; 2LQN A; 3H0H A; 2W0Z A; 1TG0 A; 2FG0 A; 1HD3 A; 2EGE A; 2K6D A; 2O2O A; 5GJV B; 4J9G A; 1JU5 C; 2I0N A; 4RTX A; 1PRL C; 1NEG A; 2J06 A; 5GJW B; 3SHW A; 2RQU A; 1CKB A; 1UTI A; 4Y92 A; 3M0U A; 2OAW A; 1K0X A; 2RQW A; 4J9E A; 4HVV A; 1I07 A; 2PNI A; 2DRM A; 1WI7 A; 2A36 A; 3LH5 A; 2D1X A; 1H92 A; 1K1Z A; 1AZG B; 1YN8 A; 4RTV A; 2DL7 A; 1BK2 A; 1BU1 A; 1NEB A; 4F16 A; 2D0N A; 1G2B A; 5L23 A; 3EG0 A; 1VYU A; 4RUG A; 2EGA A; 1WIE A; 2EW3 A; 1X2Q A; 1OEB A; 2DBM A; 4Z88 A; 4LUD A; 3EG1 A; 2KBT A; 2DF6 A; 2JS0 A; 2L3Q A; 1YWO A; 1U5S A; 1ZUY A; 2KXD A; 2OI3 A; 4GBQ A; 4OML A; 2V1Q A; 2KYM A; 1PHT A; 1ZSG A; 2JT4 A; 2XMF A; 2M51 A; 2CSI A; 2FO0 A; 2GTO A; 2SEM A; 2CUD A; 1UFF A; 2JTE A; 1S1N A; 4DEX A; 1VYV A; 2KT1 A; 4A63 B; 2M0Y A; 5I22 A; 4Z89 A; 2LQW A; 3UF4 A; 3RBB B; 1AVZ C; 3VRY A; 2PZ1 A; 1WXB A; 2YUO A; 3THK A; 2KRM A; 2QDL A; 3O5Z A; 1WYX A; 1W1F A; 2JMC A; 1T0H A; 2VKN A; 2PTK A; 1GCQ A; 2LJ0 A; 1SSH A; 1T3S A; 1Y57 A; 2RQV A; 4CC4 B; 1WDX A; 2EVR A; 2LP5 A; 2RQT A; 4ORZ A; 3I35 A; 1UEC A; 4J9I A; 2BTT A; 4QT7 A; 4OMM A; 5I11 A; 1ARK A; 4HXJ A; 1QCF A; 1UJ0 A; 2JW4 A; 1GCQ C; 3A98 A; 3U23 A; 4J9F A; 4LNP A; 3ZL7 C; 1PWT A; 1GBR A; 2KRO A; 1KIK A; 2J6F A; 2DMO A; 3VS2 A; 4F17 A; 1VA7 A; 3VS4 A; 2DL3 A; 1TUD A; 4AFS C; 2RN8 A; 2ENM A; 1MV3 A; 2JM8 A; 5IHI A; 1G83 A; 2KEA A; 4AFZ C; 2DA9 A; 1JXO A; 2G6F X; 1H3H A; 1B3Q A; 2LMJ A; 1WXU A; 2AKK A; 1IO6 A; 2J6K A; 4CC3 A; 1SRL A; 2K2M A; 2W10 A; 2YUP A; 2AKL A; 4RTW A; 1ABQ A; 4Z8A A; 2YDL A; 2DJQ A; 3UA6 A; 4X1V A; 4JPB W; 1UUE A; 1HSQ A; 2L3S A; 2LX7 A; 2D8J A; 3KFV A; 2RQR A; 2P4R A; 2CRE A; 2EPD A; 2JS2 A; 1GCP A; 1E7O A; 1SPK A; 2GTJ A; 2NUZ A; 4J9B A; 4AFU C; 2AZV A; 3I9Q A; 4RTY A; 1J3T A; 1VYT A; 2KRS A; 2O88 A; 2DM1 A; 3REA B; 1AEY A; 4E6R A; 1X43 A; 1KSW A; 3UA7 A; 2MIO A; 2DX1 A; 1W70 A; 2J7I A; 2KXC A; 1ZUU A; 1ZX6 A; 2EYY A; 1T3L A; 3UAT A; 3GBQ A; 1YCS B; 2DE0 X; 5ECA A; 1NM7 A; 1UGV A; 2OJ2 A; 3QWX X; 1GBQ A; 1GFD A; 1B07 A; 2EKH A; 1X69 A; 2KT8 A; 1JEG A; 4OMQ A; 2FPE A; 5IXF A; 3IQL A; 1OV3 A; 1PNJ A; 1JXM A; 1V1C A; 5IHK A; 2KGT A; 1OPL A; 2VVK A; 4IIO A; 1PRM C; 2BZ8 A; 1QKX A; 1AWJ A; 2K7A A; 3RNJ A; 1CKA A; 2L3P A; 2FEI A; 2A08 A; 2CH4 W; 2J05 A; 2RMO A; 4OMN A; 3H0I A; 2A28 A; 2ECZ A; 2B86 A; 3TVT A; 2LCS A; 2F2W A; 1M8M A; 2DRK A; 2BZX A; 3VS1 A; 1ZLM A; 2DIL A; 2MCN A; 3REB B; 1M3A A; 1NLP C; 1AD5 A; 1OOT A; 1OPK A; 2RF0 A; 4AFQ C; 2C0I A; 3I5R A; 1JQQ A; 4K11 A; 1XOV A; 2F2X A; 4D8K A; 1Z9Z A; 2A37 A; 1AWW A; 2ROT A; 5HCK A; 1BBZ A; 2FRY A; 1A0N B; 1U3O A; 2EYZ A; 2V1R A; 4JZ4 A; 3R6N A; 2DL5 A; 1MUZ A; 4AG1 C; 1K76 A; 4EIK A; 1FYN A; 1CSK A; 1KFZ A; 2CSQ A; 2E5K A; 4JJB A; 4FSS A; 3TSZ A; 3TSW A; 2EYX A; 4LN2 A; 2DNU A; 2JM9 A; 3PVQ A; 4ZNX A; 1AWO A; 2MOX A; 2LJ1 A; 1N5Z A; 2K3B A; 1SRM A; 2AK5 A; 1AWX A; 1TUC A; 4ESR A; 2GBQ A; 3C0C A; 4R0K A; 1FMK A; 1PKT A; 4OMO A; 4DEY A; 3VRZ A; 1WFW A; 2HDA A; 2DLP A; 2RNA A; 4LUE A; 2AZS A; 2GQI A; 2D8H A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2VWF A; 1VOM A; 1X6O A; 2EGC A; 1VQL Q; 2CP7 A; 1U06 A; 3NHN A; 3OQ5 A; 1G3T A; 3CXC A; 2X51 A; 3CCL T; 1QWF A; 2AIR B; 4J9D A; 2ESW A; 2WAC A; 1K4U S; 1IB8 A; 3M59 A; 4KRT A; 3M56 A; 1YI2 Q; 3CCL A; 3CCM T; 1K9A A; 4TVR A; 3H0F A; 1BB9 A; 2C0O A; 1M3C A; 2PUK B; 1JBM A; 1M30 A; 3RKY A; 2QQB A; 1BI0 A; 3EG2 A; 5CAI A; 1TUG B; 3CCM A; 3MEU A; 4OP0 A; 3GNG A; 3OYK A; 1D3B A; 3HL8 A; 1VQ9 Q; 4WF2 A; 1LCK A; 3M4G A; 4M7A E; 4CC2 A; 2CP3 A; 1RLP C; 2E10 A; 3HRT A; 2CP5 A; 2KYB A; 1K73 R; 5FW9 A; 2KE9 A; 1WLP B; 2XK0 A; 2QYZ A; 3CME Q; 1HYO A; 1SHG A; 4M7D D; 2CZ6 B; 4YTL A; 3KUF A; 1T0J A; 1BI3 A; 4XU0 A; 2DTI A; 5C0M A; 2MYS A; 2YT6 A; 3CBP A; 5KE3 A; 3CCE T; 2AT1 B; 2O9S A; 4F7U F; 2DIQ A; 4MML A; 1ZBJ A; 4XTV A; 4BE1 A; 5AT1 B; 1W6X A; 3CCE A; 4AG2 C; 2VYT A; 3ZEH A; 4B9W A; 2HQE A; 3EHR A; 3CQT A; 3CCQ A; 2VXF A; 1Y71 A; 4RTZ A; 2CT3 A; 3JSC A; 1I5L A; 1RAD B; 4M78 E; 3M0R A; 3M0P A; 3E19 A; 3J81 E; 1M1K R; 2DPP B; 2SRC A; 3CCR Q; 4C0G A; 2KR3 A; 5GAN h; 4QQD A; 1VQ5 Q; 1TSF A; 4J9C A; 1VQ8 Q; 4A54 A; 1M5Q 1; 3EGU A; 4HCK A; 2ROL A; 3VS6 A; 4M77 F; 1H8K A; 4M7A G; 3JB9 J; 1YHQ T; 3PE0 A; 3RER A; 1SEM A; 1G3S A; 4BDZ A; 2X35 A; 1RUW A; 2K2V A; 1R8O B; 4JUV A; 2DO3 A; 1X6G A; 2NYS A; 1YHQ A; 3V7C A; 4C92 B; 2ZPB B; 4EMG A; 4UC4 A; 1KC8 U; 1VQN Q; 1ZUK A; 1RL2 A; 2BZY A; 2CZ0 B; 5I2M A; 1X6B A; 2LQN A; 1VUB A; 2DET A; 4C8Q D; 1SG5 A; 2CYZ B; 2FG0 A; 2DKG A; 1HD3 A; 1KHC A; 2O2O A; 4QVZ A; 4J9G A; 2I0N A; 1NEG A; 2J06 A; 4M78 G; 1ZA2 B; 3OYH A; 4BY6 C; 1M2V B; 3SHW A; 2RQU A; 5I21 A; 4ATO A; 3M0U A; 5CKF A; 5KYY A; 4N4I A; 4HT8 A; 3LH5 A; 1YN8 A; 4RTV A; 3G6E T; 4BD3 A; 3T9N A; 1BI2 A; 2PUO B; 4FT4 A; 2HQH A; 3UT1 A; 4F16 A; 5EG2 A; 1MMG A; 2ZPG B; 3QII A; 4PJO F; 2DXB A; 3LX7 A; 1IHV A; 4FW1 A; 5KYY B; 1IRE B; 1OEB A; 2DBM A; 3PMI A; 4Z88 A; 3EG1 A; 3G6E A; 3MET A; 4IUR A; 1RAG B; 2VXE A; 3E9G A; 2JS0 A; 4HKE A; 2L3Q A; 1VQ4 T; 2V8K A; 3QHS A; 3C94 A; 3V8J A; 1WQ7 A; 3I56 Q; 4GBQ A; 4OML A; 1M90 C; 1VQ4 A; 4E47 A; 5GAM h; 3DB3 A; 1ZSG A; 1RAE B; 2CSI A; 2QA4 T; 3JB9 F; 2GTO A; 1QCO A; 2CUD A; 4J5Y A; 4KUL A; 2JTE A; 1S1N A; 2L8D A; 2EQK A; 4JRP A; 2VV5 A; 4PFO A; 2HD0 A; 4Q5W A; 3JCM f; 3V8K A; 3VRY A; 2MAM A; 4IUP A; 5DLQ E; 5LJ3 f; 4OF1 A; 3QKJ A; 1W1F A; 1OU8 A; 4M75 A; 1T0H A; 4MZM A; 3QO3 A; 2RQV A; 2RQT A; 4ORZ A; 4QT7 A; 5I11 A; 3A8H B; 2QI2 A; 3BFM A; 1RAI B; 4MZT A; 4M75 B; 3LLR A; 3MP6 A; 1N8R C; 2DL3 A; 2GFA A; 5FU7 C; 2ENM A; 1MV3 A; 2HQX A; 4N0A C; 5IHI A; 3RKW A; 3X28 B; 4EMK B; 2G6F X; 2LMJ A; 3ZBD A; 3PT9 A; 2AKK A; 3QZ9 B; 5GMK l; 5GAN 4; 4ME7 A; 4XU3 A; 2W10 A; 2YUP A; 4E7J A; 4RTW A; 1W2B S; 4R55 A; 2DEU A; 4A4E A; 4R56 A; 3OS5 A; 3SD4 A; 4JS5 A; 1VQL T; 2P4R A; 2RK2 A; 1GCP A; 1E7O A; 1SPK A; 2NUZ A; 1PCX A; 1MNE A; 1OZ2 A; 1VQL A; 4C5I A; 5GAO m; 2O88 A; 2V8I A; 3JCM g; 1I5O B; 2Y4X A; 5LJ3 g; 2J7I A; 3EFR A; 1QVG P; 1TXQ A; 1ZUU A; 3GF5 A; 1T3L A; 4XTU A; 4XTX A; 1YI2 A; 2XG8 D; 3S6W A; 1YCS B; 1FXX A; 2CP2 A; 1I4K 1; 1QQJ A; 5J26 A; 1PD0 A; 3OYC A; 2EKH A; 2M0O A; 4C92 F; 4OB2 B; 4BI3 A; 5CKB A; 2XKO C; 1VQ9 A; 2K3Y A; 5CR2 A; 1PNJ A; 3JAM E; 3CME T; 5LJ3 j; 4M7A D; 1ZBX A; 2VVK A; 2BKD N; 2K5L A; 4IIO A; 3JCM c; 1PRM C; 5KYW A; 1AWJ A; 1WPY A; 4M7D A; 1IZ6 A; 1NE8 A; 1IHW A; 1BYM A; 2F2W A; 5CKE A; 2K5I A; 4E7H A; 4M7D C; 1PSF A; 3QDF A; 4OVA A; 1M3A A; 5KYW B; 3LYI A; 2COW A; 1AD5 A; 1OPK A; 1MND A; 4KH1 B; 2C0I A; 5GAN d; 3CCV Q; 4A4G A; 4ELZ C; 3JCM Q; 5C6S A; 2LC4 A; 2COY A; 1VQ5 T; 1Y96 B; 2VGN A; 4KGV B; 1WGS A; 1VQ8 T; 4PK4 A; 3DLL A; 1AWW A; 2COZ A; 3QDR B; 3QPH A; 4JZ4 A; 2V8J A; 4RG8 A; 3V8L A; 3R6N A; 3CCR A; 3SWN A; 1VQ5 A; 1K76 A; 4LDW A; 1VQ8 A; 1KFZ A; 2CSQ A; 3AT1 B; 2K3X A; 4JJB A; 4FSS A; 3MEA A; 1K8A U; 2HAX A; 2JM9 A; 3O8V A; 4F7U E; 3PIO A; 2K3B A; 4E2F B; 1AWX A; 1TUC A; 3QYG B; 1M9S A; 1G5V A; 3SWN B; 1S72 Q; 5I2S A; 2RI5 A; 3VUZ A; 1M90 R; 1VQN A; 3L2V A; 1WFW A; 2RNA A; 2AZS A; 1YIJ Q; 1Z9Q A; 2JNG A; 2RH2 A; 2XHC A; 2E41 A; 2O9V A; 3RIR A; 4M77 E; 2EWN A; 3EGD B; 5A0D A; 3HKS A; 2K9G A; 4C8Q C; 3JB9 H; 2EJG A; 1OI1 A; 1YNZ A; 4C5E A; 3HTR A; 1K9M U; 1N9R A; 3CEY A; 5IXB A; 4JZ3 A; 3PGG A; 4DA4 A; 3M54 A; 4J7F A; 1Q95 G; 2MPX C; 2X3X D; 1UE9 A; 2KI7 A; 3JCM V; 5J39 A; 2FYK A; 4FT2 A; 4M75 F; 4C0F A; 1GL5 A; 2FL7 A; 4F7U G; 3GOX A; 1MMN A; 1RI9 A; 3CBM A; 3VS7 A; 1UHF A; 4RMO A; 1HJD A; 3X20 B; 2DL8 A; 1N8R R; 4IUT A; 5GAM d; 4MZP A; 3DLM A; 3EGX B; 4HVW A; 3I56 T; 2EBP A; 2YUQ A; 3JCM P; 3QJY A; 4PJN A; 5CKH A; 1VIE A; 2LNH B; 2K57 A; 2ZPI B; 1AOJ A; 4D8D A; 4JS4 A; 1Q82 U; 1YJW Q; 1ZSZ B; 3OB9 A; 3I56 A; 5IAY A; 3OSV A; 3SEM A; 4ZTF A; 1QVG A; 4DBR A; 3FLG A; 2EFI A; 3ZFJ A; 1TH7 A; 3NMZ C; 2L89 A; 3OYN A; 4M77 G; 1IGQ A; 1R0B G; 3EG3 A; 4N4G A; 4J7I A; 2O4X B; 4PNO A; 1GRI A; 5FU6 C; 3PTA A; 3M57 A; 1I0C A; 4NL2 A; 4PJO E; 1SHF A; 3H41 A; 3OSS C; 5FRO A; 5LJ5 f; 3I5S A; 2OX7 A; 2MWO A; 2O01 E; 3G4S A; 2CUB A; 1K73 U; 3JCM X; 2NUP A; 3JCM W; 1FMV A; 4XTY A; 4ZGE B; 2NWM A; 4OMP A; 3E2U A; 3LGL A; 1Q81 C; 3DKM A; 3PVL A; 2E1H A; 1NYG A; 1MMD A; 3CXC S; 2H3E B; 1V29 B; 4M4Z A; 3OS1 A; 1M1F A; 5CVI A; 3CCJ Q; 1TOV A; 1NZ9 A; 4RTT A; 4QKU A; 4LDX A; 1F1B B; 3V7S A; 4RCC A; 2MMP A; 1TS9 A; 4C0D C; 1VQM T; 3BY7 A; 1NJI U; 2WSE E; 4C0Z A; 5FWB A; 3C4S A; 2DBK A; 2J6O A; 2BE9 B; 4L5G A; 1M1K U; 4A4K A; 1ZHI A; 3RES A; 2W0Z A; 2A3L A; 3M53 A; 4PJO G; 2K6D A; 5GJV B; 4M7D F; 3CCU Q; 2CP0 A; 4RTX A; 3CMA Q; 2JUF A; 4FYY B; 2KVQ G; 3CC4 Q; 3I55 Q; 1KC8 C; 5GJW B; 4N4H A; 1CKB A; 2RO0 A; 1K0X A; 4BB7 A; 2RQW A; 5LJ5 g; 4J9E A; 1VQ6 Q; 2K4Y A; 2DRM A; 2A36 A; 4EDU A; 4PJJ A; 1N9S A; 2D1X A; 4DBH A; 4DQ2 A; 2DL7 A; 4BE0 A; 1NEB A; 3JB9 G; 3EG0 A; 5GAM e; 2LNV A; 2EGA A; 1WIE A; 4LDY A; 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