The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
69
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structure length |
69
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Chain Sequence |
KDPKFEAAYDFPGSGSSSELPLKKGDIVFISRDEPSGWSLAKLLDGSKEGWVPTAYMTPYKDTRNTVPV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Myosin-3 isoform
|
| publication title |
Crystal structure of the SH3 domain from S. cerevisiae Myo3
rcsb |
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| molecule tags |
Contractile protein
|
| total genus |
11
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| structure length |
69
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| sequence length |
69
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-12-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1UGV A; 4LE9 A; 2DRM A; 2JXB A; 1M3A A; 1T0H A; 1GFC A; 1UTI A; 2BZY A; 2RQT A; 2K3B A; 1SPK A; 4OML A; 1M30 A; 2GTO A; 2KRN A; 1PRM C; 2LJ1 A; 5L23 A; 2YDL A; 2O2O A; 5GJW B; 1G83 A; 1K0X A; 2C0I A; 1UG1 A; 1NLO C; 1JU5 C; 3EGU A; 2FO0 A; 2JS0 A; 1LCK A; 3GBQ A; 3TVT A; 4RTV A; 2FPF A; 1AZG B; 2FG0 A; 2RPN A; 5IXF A; 1ZX6 A; 1RLQ C; 4J9I A; 1ABQ A; 4OMM A; 1M27 C; 2HBW A; 4AFQ C; 2KYM A; 3M0T A; 3VS3 A; 2QDL A; 2DBK A; 4ESR A; 1GFD A; 2EGE A; 1YCS B; 1KFZ A; 1AOJ A; 1Z9Z A; 1YWP A; 2DNU A; 2LP5 A; 2L3P A; 1QKW A; 1WFW A; 3NHN A; 1U5S A; 4RTT A; 2JM9 A; 5FW9 A; 1K4U S; 2BTT A; 2YT6 A; 2OAW A; 2J6K A; 2DRK A; 2AZS A; 1SSH A; 2KR3 A; 4F14 A; 1AWW A; 1KJW A; 4IIO A; 2BZX A; 5IH2 A; 4LUD A; 1JXO A; 2KXD A; 2KRO A; 2X3W D; 1K0S A; 1S1N A; 2KEA A; 1V1C A; 1NM7 A; 4J9E A; 1OV3 A; 4OMQ A; 2ROL A; 1M3C A; 5IXB A; 2GGR A; 2CH4 W; 1WLP B; 1UHC A; 2YUO A; 1T3L A; 4RTY A; 4CC7 A; 1HJD A; 1ZUY A; 3UAT A; 3H41 A; 1ZLM A; 1UEC A; 3UA7 A; 1PWT A; 2EPD A; 1WYX A; 3REA B; 4FSS A; 4LUE A; 4J9G A; 1SRM A; 1G2B A; 1I07 A; 2AK5 A; 1UFF A; 2LQW A; 3IQL A; 2OJ2 A; 1GBR A; 3VS0 A; 2DL3 A; 2SEM A; 2D0N A; 1XOV A; 2FPE A; 2AZV A; 1ZSG A; 2YSQ A; 1JXM A; 1Y57 A; 4OMO A; 3KFV A; 3EG1 A; 1UJ0 A; 1X6B A; 4LN2 A; 2CUB A; 2RQR A; 4RTW A; 1M8M A; 5FWB A; 1E6H A; 1UDL A; 2C0T A; 2CUD A; 1YNZ A; 2L3S A; 2J6O A; 2JMA A; 2EYW A; 1ZUU A; 2J05 A; 2MCN A; 1WXT A; 1NEG A; 2J6F A; 1U06 A; 1X2K A; 4HVW A; 4CC2 A; 1CKA A; 2ESW A; 1BBZ A; 3VRY A; 2A08 A; 2YUN A; 2C0O A; 2LMJ A; 1KSW A; 2LZ6 B; 4RUG A; 2GTJ A; 2KRM A; 2KRS A; 1KIK A; 2RQU A; 2W0Z A; 1AZE A; 2PZ1 A; 2CRE A; 2HDA A; 3EHQ A; 2DVJ A; 4CC3 A; 1AWX A; 1A0N B; 3JV3 A; 1K76 A; 2F2W A; 4J9C A; 2KBT A; 4DEY A; 2HSP A; 1H3H A; 2DA9 A; 2HCK A; 2PNI A; 4IIM A; 3NGP A; 2EQI A; 2RMO A; 1PNJ A; 4GBQ A; 2M0Y A; 2K7A A; 1WX6 A; 1PKS A; 2K9G A; 4J9F A; 1VA7 A; 2EKH A; 4X1V A; 2RN8 A; 4ORZ A; 5I11 A; 2JTE A; 1MV0 B; 4F16 A; 2DL8 A; 1VYT A; 3THK A; 1OPK A; 2DYB A; 4LNP A; 1ARK A; 1X2Q A; 3VS1 A; 2AKK A; 3EG0 A; 2KNB B; 2LJ0 A; 4RTZ A; 1X69 A; 1UE9 A; 1J3T A; 2E5K A; 2JMC A; 2V1Q A; 1Z9Q A; 2JW4 A; 4JZ4 A; 1E6G A; 2RQW A; 3FJ5 A; 1NG2 A; 1WI7 A; 3NPF A; 1GBQ A; 1QWE A; 2H8H A; 5IHN A; 3SHW A; 2DL4 A; 2KE9 A; 2LCS A; 3VS7 A; 1WDX A; 2DIL A; 4AFU C; 1FYN A; 2LJ3 A; 5GJV B; 2ENM A; 4Y92 A; 1WXB A; 1I1J A; 5IHI A; 1EFN A; 1AEY A; 1W6X A; 2EGA A; 2A28 A; 1CKB A; 2I0N A; 2L2P A; 4D8D A; 3M0U A; 2X3X D; 1H8K A; 1JO8 A; 1PRL C; 2NWM A; 3I5S A; 2D1X A; 1Y0M A; 1B3Q A; 2A37 A; 2JT4 A; 1OPL A; 2OI3 A; 2DE0 X; 1NEB A; 4ZNX A; 2EBP A; 3H0H A; 2RQV A; 1H92 A; 4EIK A; 2HEQ A; 1WIE A; 1U3O A; 1W1F A; 2LX7 A; 1TUC A; 2DL7 A; 3UF4 A; 2DBM A; 4RTX A; 3ZL7 C; 1AD5 A; 1X6G A; 2CDT A; 1BB9 A; 1SHG A; 2EGC A; 3VS2 A; 4E6R A; 1QCF A; 2YUQ A; 1TG0 A; 1YN8 A; 1JEG A; 5FWC A; 1HSQ A; 3RNJ A; 1ZUK A; 2P4R A; 2O31 A; 3RBB B; 4JJC A; 2LQN A; 4AFZ C; 1X43 A; 3PVQ A; 2CH4 A; 3VS6 A; 1B07 A; 1GL5 A; 1WXU A; 1W70 A; 2J7I A; 2CT4 A; 2O88 A; 2KT8 A; 2EW3 A; 2GNC A; 1OOT A; 2DL5 A; 5I22 A; 2LNH B; 2ED0 A; 1CSK A; 4KRT A; 5ECA A; 4HCK A; 1GCQ A; 1GRI A; 2DX1 A; 1X27 A; 3PVL A; 1OEB A; 1UUE A; 2VVK A; 3REB B; 1SEM A; 1VYU A; 4Z89 A; 4AG1 C; 2D8J A; 2DM1 A; 2J06 A; 3SEM A; 1NLP C; 2SRC A; 1RLP C; 4R0K A; 3I35 A; 1GCQ C; 2F2V A; 3CQT A; 2CT3 A; 4HVV A; 2ABL A; 3M0Q A; 1YWO A; 4JZ3 A; 4OMN A; 4CC4 B; 1E7O A; 4D8K A; 3I5R A; 2K79 A; 2L0A A; 2IIM A; 4WCI A; 4QT7 A; 3EG3 A; 1AVZ C; 1BK2 A; 1M3B A; 4Z8A A; 2CSI A; 3LH5 A; 1K1Z A; 2KGT A; 2MIO A; 4RTU A; 1YP5 A; 1MV3 A; 2ROT A; 2NUZ A; 2PTK A; 2EVR A; 2VKN A; 1RUW A; 5HCK A; 1AWO A; 1JQQ A; 2B86 A; 2O9V A; 2JM8 A; 2DF6 A; 2YUP A; 4HVU A; 2F2X A; 3C0C A; 4HXJ A; 3H0F A; 2GBQ A; 2L3Q A; 1UJY A; 3EG2 A; 2G6F X; 2D8H A; 4Z88 A; 2ED1 A; 2FPD A; 3QWY A; 3QWX X; 1BU1 A; 1SRL A; 3VS5 A; 2FRY A; 3TSZ A; 1IO6 A; 4J9B A; 3M0P A; 4DEX A; 1T0J A; 1I0C A; 1TUD A; 3TSW A; 2A36 A; 2DLP A; 3R6N A; 4JJD A; 1VYV A; 3U23 A; 2VWF A; 4AG2 C; 1QKX A; 3H0I A; 1GCP A; 4K11 A; 4JJB A; 2MOX A; 2W10 A; 2FRW A; 1WA7 A; 2KXC A; 4OMP A; 1PKT A; 2V1R A; 3O5Z A; 4J9H A; 1ABO A; 2ECZ A; 5IHK A; 2DMO A; 3A98 A; 1QLY A; 2EYX A; 2KYB A; 2RNA A; 1ZBJ A; 3NMZ C; 2K6D A; 3I9Q A; 4M4Z A; 2CSQ A; 1K9A A; 2KT1 A; 2AKL A; 1FMK A; 2DJQ A; 2FEI A; 1HD3 A; 2M51 A; 1PHT A; 2K2M A; 3M0R A; 1N5Z A; 2GQI A; 1RI9 A; 1SHF A; 4GLM A; 4AFS C; 1NYG A; 3M0S A; 4J9D A; 5EC7 A; 2O9S A; 2EYZ A; 1T3S A; 4F17 A; 1QWF A; 4JPB W; 4A63 B; 3VRZ A; 1NYF A; 1MUZ A; 2RF0 A; 3PE0 A; 2JS2 A; 2EYY A; 3EHR A; 3ULR B; 3UA6 A; 1AWJ A; 3VS4 A; 1UHF A; 2BZ8 A; 2XMF A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3O8V A; 1R8O B; 1UTI A; 4B9W A; 2QYZ A; 4M78 C; 2M0O A; 2GTO A; 3DB4 A; 4DBH A; 5L23 A; 1D3B A; 5GJW B; 3WVD B; 3CEY A; 1JU5 C; 4X9C A; 5GAM j; 2JS0 A; 3EG9 B; 4A4F A; 1LCK A; 5KYX A; 3RMS A; 3LGL A; 1N9R A; 4PJL A; 1Q81 C; 2K5L A; 3CPW A; 3M0T A; 3VS3 A; 2DVE A; 3DLL A; 1RAH B; 5GAM f; 4DBF A; 2F5T X; 5LJ5 d; 3CPW S; 1Z9Z A; 2DPP B; 3DB3 A; 1YJW T; 5HK0 A; 3FIF A; 2L3P A; 3NHN A; 1XQH A; 3KBG A; 1HYO A; 3OS5 A; 4M77 A; 2HD0 A; 3LYI A; 2OAW A; 2J6K A; 5C6S A; 3CCU A; 1TXQ A; 4OGC A; 4BI3 A; 1ZA1 B; 2RHI A; 3CC2 T; 4F14 A; 1AWW A; 2P0P A; 1KJW A; 2K4Y A; 4M78 G; 5GAN 6; 1QQJ A; 1JXO A; 4ZGD B; 3CCM T; 4M77 D; 1Q81 U; 4DBQ A; 1IRX A; 4OMQ A; 1M3C A; 4OB2 B; 2GGR A; 3M58 A; 1ZLM A; 1Q86 C; 1TUG B; 3OSV A; 4LD9 K; 1PWT A; 3CD6 T; 5FU6 C; 3QJY A; 1VQ6 A; 3OYI A; 2JN0 A; 4XU2 A; 4RKU E; 1YI2 T; 2QAZ A; 1BIB A; 1YJ9 T; 1G2B A; 2X4J A; 3OYY A; 3CCR Q; 4M7D E; 1I07 A; 3A8G B; 2QQA A; 2OJ2 A; 1VQ4 T; 1AHJ B; 2V8J A; 2DZC A; 3S6W A; 4GLK A; 2D0N A; 4OB1 B; 3FLG A; 2YSQ A; 5HK3 A; 4OMO A; 1UGR B; 1M8V A; 4LN2 A; 1PD1 A; 4II1 A; 1M8M A; 3QUI A; 5FWB A; 1M90 R; 2CUD A; 3BDL A; 1YNZ A; 4HKE A; 4M7A C; 2JMA A; 2EYW A; 1RAA B; 3OS2 A; 4CC2 A; 2ESW A; 1VQN A; 4BY6 B; 2A08 A; 1M2O A; 2LMJ A; 4N4G A; 4ZTF A; 1GXI E; 3QJ6 A; 5GAN 2; 2RQU A; 4B9X A; 1RAG B; 4A54 A; 2DD5 A; 3QDR B; 4CC3 A; 3CPF A; 1B34 A; 1I5L A; 1MHN A; 3OYB A; 3LW5 E; 4JRI A; 4BDY A; 2R5A A; 3CMA T; 2RI2 A; 3H6Z A; 4IIM A; 2DIQ A; 3NGP A; 4J6Y A; 1QW1 A; 2ZPH B; 1PNJ A; 4GBQ A; 2K7A A; 1WX6 A; 2QA4 T; 4J9F A; 1RAD B; 2EKH A; 4FYV B; 2RN8 A; 4ORZ A; 5I11 A; 2DXU A; 4JS5 A; 2JTE A; 4F16 A; 1VYT A; 3OMG A; 4LNP A; 4PJN A; 4HT9 A; 2HMA A; 4KH0 B; 3VS1 A; 2JUF A; 2K3X A; 1KQ2 A; 3L1A A; 2EFI A; 4E7L A; 2O4X A; 1M2V B; 3VUB A; 4M7A G; 4F7U A; 5D6W A; 3EG0 A; 5LJ5 e; 1RAC B; 1UB4 A; 3OYL A; 2JMC A; 1C0M A; 5LJ5 j; 1RAB B; 3OW2 A; 4M7D B; 2LVM A; 1W2B A; 3R6O A; 2C06 A; 1VQ5 A; 2F5K A; 4M77 C; 3NPF A; 2DEQ A; 3AT1 B; 5IHN A; 1D1A A; 2WSC E; 2KE9 A; 4PFP A; 4C8Q D; 5D7U A; 3M53 A; 5LJ5 f; 4M7D F; 3WVE B; 3OW2 S; 2JOY A; 3V7S A; 4DBR A; 3RIR A; 1KQ1 A; 2BIV A; 1W2B S; 1SKU B; 1N9S A; 1AEY A; 3WXM B; 3G1J A; 1H3Z A; 1CKB A; 2PUO B; 2JTM A; 3M0U A; 1KC8 U; 1H8K A; 2RHZ A; 1PRL C; 2DK3 A; 2QG9 B; 2NWM A; 2OTL Q; 1VQM A; 1O75 A; 2DFU A; 2CP6 A; 1B3Q A; 2PU9 B; 5CKB A; 2A37 A; 2CP0 A; 3L2W A; 2OI3 A; 2DE0 X; 4ATO A; 4ELY C; 5A0L A; 3CCQ T; 1WIE A; 5A0D A; 3OA6 A; 2EQK A; 4RTX A; 3ZL7 C; 1AD5 A; 1X6G A; 2JTF A; 3M59 A; 1TG0 A; 1U1S A; 1JEG A; 4A4G A; 4M77 G; 3E2U A; 1ZQ1 A; 2LRQ A; 1ZUK A; 1V76 A; 2P0K A; 5AT1 B; 1VQ8 A; 2FZC B; 3UWN A; 3MO8 A; 1TWB A; 3VS6 A; 5CKF A; 1WXU A; 4QW2 A; 1SF9 A; 3VV0 A; 1W70 A; 2KT8 A; 1KD1 C; 2EW3 A; 2PVD B; 2NUP B; 1RL2 A; 3SFM A; 3RER A; 3JB9 D; 2NUT A; 2L89 A; 3SWN B; 3HP9 A; 3M55 A; 1JBM A; 4AG1 C; 4EMK C; 3J81 E; 2A3L A; 3HHT B; 1U8R A; 3CC4 A; 5GAO l; 1C6V X; 4R0K A; 2RB6 A; 2RHX A; 3JB9 I; 1GCQ C; 2F2V A; 2CT3 A; 4FCY A; 1I5O B; 2ABL A; 3OYA A; 4OMN A; 4D8K A; 2Y90 A; 1ZHI A; 3I56 T; 1Q82 U; 4Y28 E; 2JVV A; 3I55 A; 4WCI A; 1M3B A; 4Z8A A; 1R0B G; 3LH5 A; 1KQS A; 1TU0 B; 2MIO A; 2IG0 A; 2PTK A; 2P0Q A; 5GAO r; 4ZGE B; 2XI9 A; 1AWO A; 4IUV A; 2YUP A; 4HVU A; 1Q81 R; 1MNE A; 3CBO A; 3RUX A; 3C0C A; 1KQS S; 3H0F A; 5GMK e; 4C5H A; 2L3Q A; 4C8Q C; 2D8H A; 1OZ3 A; 1SRL A; 4N4I A; 2FRY A; 5GAN d; 1IO6 A; 4E7H A; 1FX7 A; 3CCE T; 4BAC A; 1T0J A; 4XTU A; 1TUD A; 3TSW A; 1BI0 A; 4KGX B; 4C0F A; 3CPW P; 2OTJ T; 3CCV A; 1OI1 A; 1WJS A; 5GAN 5; 4JJB A; 2G3R A; 1WA7 A; 1VQ9 Q; 3X24 B; 1PKT A; 2B8A A; 4VUB A; 2L3R A; 4J9H A; 1BYM A; 1ABO A; 5IHK A; 2EYX A; 1G3S A; 4A4E A; 5I21 A; 1SG5 A; 3TEE A; 2CSQ A; 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5J3B A; 1T3L A; 3OYN A; 1ZUY A; 3FRN A; 2YWW A; 3UAT A; 3H41 A; 2RHU A; 1YI2 Q; 2QEX A; 1M1F A; 5D6Y A; 2KK4 A; 1YJ9 Q; 3UA7 A; 3VYG A; 1YHQ T; 3Q1J A; 1K9M U; 1WYX A; 5GAN f; 5DLO A; 3S3M A; 1BI2 A; 3JCM X; 4FSS A; 4LUE A; 5J39 A; 1VQ4 Q; 3MEA A; 2F1L A; 2CP5 A; 4M75 F; 2VYT A; 4J9G A; 2M16 A; 1WQ7 A; 5CQY A; 2DZ9 A; 2K3Y A; 2RJF A; 4XTX A; 3GLX A; 3MP8 A; 3OW2 P; 3G6E A; 3VS0 A; 1KG1 A; 1W2B P; 2SEM A; 1JJ2 A; 3EAE A; 4M7A A; 1QMC A; 2FPE A; 1LJO A; 1M1G A; 2VUB A; 1JXM A; 1Y57 A; 3KFV A; 3EG1 A; 1X6B A; 2CUB A; 1WZO A; 2NLU A; 1JJ2 S; 1QP2 A; 3HSB A; 4PJM A; 2C0T A; 2EQM A; 2J6O A; 2YRC A; 4M7A D; 2J05 A; 1WXT A; 5GAM h; 4HVW A; 3NTH A; 1AT1 B; 3VRY A; 3QII A; 2E5Q A; 4C0D C; 3N5B B; 2LZ6 B; 2GTJ A; 2KRM A; 4DQ2 A; 4OF1 A; 1KIK A; 3MJX A; 2EQJ A; 1AZE A; 2PZ1 A; 2HDA A; 2DVJ A; 2VAS A; 2DTO A; 3CMA Q; 5CIU A; 1Q82 R; 1XNI A; 2F2W A; 3OBY A; 4J9C A; 2QA4 Q; 2KBT A; 1FMW A; 1YIJ T; 3JCM V; 3M4G A; 1TOV A; 3C4S A; 3JCM c; 2RMO A; 4FSX A; 4V2S A; 3JCM P; 1VA7 A; 3HRS A; 3MHX A; 4PJO E; 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