The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
69
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structure length |
69
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Chain Sequence |
KDPKFEAAYDFPGSGSSSELPLKKGDIVFISRDEPSGWSLAKLLDGSKEGWVPTAYMTPYKDTRNTVPV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Contractile protein
|
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
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| publication title |
Crystal structure of the SH3 domain from S. cerevisiae Myo3
rcsb |
| molecule keywords |
Myosin-3 isoform
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| total genus |
11
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| structure length |
69
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| sequence length |
69
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-12-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2F2W A; 2EGA A; 2RN8 A; 1T3S A; 1TUD A; 2DBK A; 1NYF A; 2ROT A; 1JXM A; 2FO0 A; 3VS1 A; 4ESR A; 2GGR A; 2K9G A; 2CUB A; 2K6D A; 1VA7 A; 1AWX A; 1HD3 A; 4HCK A; 4JJC A; 2F2X A; 3TVT A; 2PNI A; 1MUZ A; 1RI9 A; 2EQI A; 2DLP A; 2CH4 A; 1W70 A; 2HEQ A; 4IIO A; 2K3B A; 2CT3 A; 2ENM A; 2LJ3 A; 3RNJ A; 2BZX A; 1QLY A; 2LP5 A; 3M0S A; 1H8K A; 1NLO C; 1YWO A; 2CSI A; 4DEX A; 2RMO A; 2VWF A; 5FW9 A; 3VRZ A; 1M3B A; 2B86 A; 1XOV A; 2YUP A; 1BK2 A; 2RQW A; 2CT4 A; 1UJ0 A; 3FJ5 A; 2AK5 A; 2YUQ A; 1BBZ A; 2J7I A; 5IXF A; 2DNU A; 2ABL A; 3M0Q A; 4D8D A; 1PNJ A; 2FG0 A; 2JW4 A; 1B3Q A; 1WXT A; 2OAW A; 2YUO A; 1RUW A; 1UDL A; 3I9Q A; 2CSQ A; 4GLM A; 2BZ8 A; 3VS2 A; 3EG1 A; 2EBP A; 2CH4 W; 2V1Q A; 1ZUK A; 1UHC A; 2RNA A; 1AEY A; 5HCK A; 2NWM A; 2A08 A; 3M0U A; 2ED0 A; 2KRM A; 1ABQ A; 1X2Q A; 2IIM A; 3NPF A; 4K11 A; 1OOT A; 1K0X A; 3M0T A; 1QWE A; 1AOJ A; 4EIK A; 2K7A A; 2HCK A; 2KRO A; 2A36 A; 4J9F A; 4J9H A; 1BB9 A; 3EHQ A; 2JS0 A; 1WI7 A; 2JMA A; 2NUZ A; 2DIL A; 2AKL A; 1WDX A; 2FPE A; 4F14 A; 4IIM A; 1G2B A; 2K79 A; 2JXB A; 1U5S A; 2HSP A; 1G83 A; 2AZV A; 4GBQ A; 1K0S A; 4HXJ A; 1SPK A; 1KFZ A; 2O31 A; 1ZLM A; 1FMK A; 5IHK A; 1T3L A; 1WXB A; 4JPB W; 2DL3 A; 3UAT A; 1PKS A; 2KBT A; 2KT8 A; 2C0O A; 5EC7 A; 1GRI A; 3NMZ C; 4ORZ A; 2JM8 A; 1VYV A; 4J9B A; 1T0H A; 1MV3 A; 3O5Z A; 4AFU C; 1VYT A; 3CQT A; 3H41 A; 5IH2 A; 2RQV A; 2FRW A; 1K4U S; 2EYY A; 2HBW A; 1NG2 A; 4HVV A; 1K76 A; 1RLQ C; 2L2P A; 1X6B A; 2LX7 A; 4AG2 C; 2MIO A; 2YDL A; 1ARK A; 2QDL A; 3VS7 A; 2EYZ A; 1ABO A; 4M4Z A; 1QWF A; 1SSH A; 2RQT A; 1NYG A; 4JZ4 A; 1PKT A; 2FPD A; 1NEB A; 4LUD A; 1OPK A; 4LE9 A; 1H3H A; 1GCQ A; 1CKB A; 4R0K A; 3NHN A; 1J3T A; 2KR3 A; 1HSQ A; 1H92 A; 4OML A; 2X3X D; 2D1X A; 3EG0 A; 2DVJ A; 4LNP A; 1PRM C; 4QT7 A; 3SEM A; 2KRS A; 3H0F A; 1K9A A; 4RTX A; 1GBQ A; 2RQR A; 4WCI A; 1M30 A; 1UTI A; 4HVU A; 2DRM A; 4CC4 B; 2AKK A; 2RPN A; 2EYW A; 3SHW A; 2OJ2 A; 2LJ0 A; 2PTK A; 1ZUY A; 1GFD A; 2GQI A; 3VS0 A; 4CC2 A; 4J9E A; 1QKX A; 4RTV A; 1Z9Q A; 1AD5 A; 4RTY A; 3TSZ A; 2SRC A; 2DX1 A; 2JTE A; 4LN2 A; 2DBM A; 2J6K A; 2JS2 A; 4AFS C; 2ECZ A; 1A0N B; 3VS5 A; 1KJW A; 4E6R A; 2VVK A; 4A63 B; 3M0P A; 3ZL7 C; 1M3C A; 3EG3 A; 2L3S A; 3I5R A; 1Z9Z A; 3JV3 A; 1UGV A; 2H8H A; 2JMC A; 5ECA A; 1YNZ A; 4RUG A; 2JT4 A; 1WLP B; 4RTZ A; 1AWO A; 5I11 A; 4D8K A; 4RTW A; 3VS6 A; 1W1F A; 2F2V A; 1ZUU A; 2SEM A; 4AG1 C; 1Y57 A; 4Z88 A; 1QCF A; 3EHR A; 1NM7 A; 3PE0 A; 1VYU A; 1BU1 A; 2C0I A; 3U23 A; 1M3A A; 2J05 A; 3H0I A; 2FEI A; 2KGT A; 3UA7 A; 2BTT A; 2EKH A; 2E5K A; 1B07 A; 2DL7 A; 1CKA A; 2JM9 A; 2D8H A; 2KT1 A; 2L0A A; 1X27 A; 1U3O A; 2K2M A; 2EGC A; 1WFW A; 1GCQ C; 2YSQ A; 2DYB A; 4AFQ C; 2DJQ A; 2CRE A; 1GFC A; 1KSW A; 3C0C A; 1OV3 A; 1WYX A; 1WX6 A; 2J06 A; 5IHI A; 3VS3 A; 2O9S A; 1GCP A; 1PRL C; 1JEG A; 2DRK A; 1M27 C; 2M0Y A; 2EPD A; 1I07 A; 1EFN A; 5FWB A; 1JQQ A; 3EG2 A; 3REA B; 2EYX A; 1QKW A; 2MCN A; 2CDT A; 1X43 A; 2V1R A; 4Z8A A; 5GJV B; 2LJ1 A; 4OMP A; 2KXC A; 1I1J A; 1UUE A; 1AZG B; 1OPL A; 1E6G A; 3I35 A; 3R6N A; 2KYB A; 3TSW A; 4FSS A; 1S1N A; 4J9D A; 1JXO A; 3QWX X; 3UF4 A; 2GNC A; 2LMJ A; 2L3P A; 2P4R A; 2O9V A; 1WXU A; 2DL4 A; 3ULR B; 1TUC A; 1X2K A; 2LZ6 B; 2L3Q A; 4J9I A; 2C0T A; 2M51 A; 1PWT A; 3THK A; 3VS4 A; 1UE9 A; 4CC3 A; 2D0N A; 2KE9 A; 2DE0 X; 1FYN A; 2I0N A; 2AZS A; 4OMM A; 4DEY A; 4JJB A; 1UG1 A; 1YP5 A; 4X1V A; 4Z89 A; 2LCS A; 4LUE A; 2O88 A; 1AVZ C; 2G6F X; 1AZE A; 1SHF A; 5I22 A; 5FWC A; 2RQU A; 2FPF A; 1AWW A; 1HJD A; 2RF0 A; 2HDA A; 1ZX6 A; 4F16 A; 2ROL A; 1PHT A; 4HVW A; 2VKN A; 2EVR A; 2LNH B; 2J6F A; 1SEM A; 1SRM A; 1AWJ A; 2YUN A; 1UFF A; 1CSK A; 1MV0 B; 5GJW B; 2J6O A; 2DM1 A; 3PVL A; 5L23 A; 4RTT A; 2A37 A; 5IHN A; 1OEB A; 1I0C A; 1UHF A; 2EW3 A; 2GTO A; 3PVQ A; 4J9C A; 1TG0 A; 4JJD A; 1JO8 A; 4J9G A; 3EGU A; 2A28 A; 1KIK A; 1YCS B; 1WA7 A; 2LQN A; 1NLP C; 3M0R A; 4CC7 A; 2W0Z A; 1UJY A; 1X69 A; 3A98 A; 1SRL A; 1E7O A; 3H0H A; 4JZ3 A; 3VRY A; 1GBR A; 4Y92 A; 2ED1 A; 1YN8 A; 3KFV A; 1NEG A; 1Y0M A; 1X6G A; 3I5S A; 4ZNX A; 2DL8 A; 2PZ1 A; 1N5Z A; 4F17 A; 3REB B; 2BZY A; 3GBQ A; 4OMN A; 2KYM A; 1ZSG A; 1GL5 A; 2OI3 A; 2O2O A; 2MOX A; 1K1Z A; 2KEA A; 3LH5 A; 3RBB B; 1IO6 A; 1WIE A; 2W10 A; 4AFZ C; 1SHG A; 2DF6 A; 2KNB B; 2CUD A; 1JU5 C; 2DA9 A; 3NGP A; 2YT6 A; 3QWY A; 2GBQ A; 1W6X A; 1V1C A; 4KRT A; 4OMQ A; 2KRN A; 1YWP A; 1UEC A; 5IXB A; 2LQW A; 2EGE A; 2X3W D; 3UA6 A; 3IQL A; 2DMO A; 2GTJ A; 2DL5 A; 1E6H A; 2ESW A; 2KXD A; 1RLP C; 1ZBJ A; 1U06 A; 1M8M A; 2FRY A; 2D8J A; 1LCK A; 1T0J A; 4OMO A; 4RTU A; 2XMF A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1UGQ B; 2RN8 A; 3C94 A; 2XG8 D; 2COW A; 2FO0 A; 3OW2 S; 3CBO A; 1MMA A; 3L2W A; 1FMW A; 2EQU A; 4PJJ A; 3QHS A; 4OGC A; 3DLM A; 1BIB A; 3JCM e; 4JJC A; 2I2L A; 1RI9 A; 5J3B A; 2COY A; 2CH4 A; 4IIO A; 3G6E T; 1VQN Q; 4EMK B; 2JOY A; 2XID A; 2CT3 A; 3EFO A; 1QLY A; 2V8I A; 4FT2 A; 1NBE B; 4R55 A; 4DEX A; 3VRZ A; 5FW9 A; 2RA2 A; 5KE3 A; 1VQP T; 2B86 A; 4IUR A; 2RB6 A; 3FJ5 A; 3X25 B; 1BBZ A; 3ASK A; 3JCM J; 2ABL A; 3JCM f; 2FG0 A; 3VUZ A; 2OAW A; 4C5H A; 2A0F B; 1VQL T; 3I9Q A; 4CI0 C; 4GLM A; 3VS2 A; 2EBP A; 3MEU A; 3L2R A; 5LJ3 d; 4UC4 A; 2NWM A; 2ED0 A; 1Q82 C; 1KD1 U; 5CQX A; 3OB9 A; 1QWE A; 2CP3 A; 3MPU B; 2ZPB B; 2K7A A; 2HCK A; 2A36 A; 3QDR B; 2ZCF B; 4KUD K; 1RAB B; 3KUF A; 2NUZ A; 2DIL A; 4ZGJ B; 1WJS A; 1G2B A; 2HSP A; 1YJN Q; 3L2Z A; 1SG5 A; 1PSE A; 1KC8 U; 1K8A U; 1WHM A; 1FMK A; 3CCL A; 2GFU A; 3H8Z A; 2DL3 A; 1ZA2 B; 5DLQ E; 1M90 R; 3EFS A; 4BB7 A; 2OTL Q; 4C5G A; 4PJO A; 1N9R A; 1BI0 A; 3CC2 T; 3RR6 A; 5EC7 A; 3CCS Q; 1GRI A; 2RK1 A; 4PFP A; 4E2F B; 2FZK B; 5GAN d; 4AFU C; 4F7U E; 1VYT A; 1QVG P; 1D0Z A; 1K4U S; 4BE2 A; 4KGX B; 5GMK e; 3NTH A; 2CP6 A; 2QG9 B; 1RLQ C; 4OVA A; 1I5O B; 1YIJ Q; 4N4G A; 5IT9 E; 2LX7 A; 4F7U F; 2K5F A; 2QDL A; 1OUL A; 4WTO B; 4PLI A; 4LDX A; 5CKF A; 1I81 A; 2H3E B; 4M78 C; 4MZT A; 4BI3 A; 1NPR A; 3EFO B; 2X35 A; 1YHQ T; 1TUG B; 1PKT A; 2F69 A; 3A8O B; 4J6W A; 4LE9 A; 3L42 A; 4JLI A; 3NHN A; 1VQ8 T; 2QK0 A; 1HSQ A; 2D1X A; 2DVJ A; 4LNP A; 1PC0 A; 4Y28 E; 3LLR A; 4QT7 A; 4QW2 A; 4VUB A; 1VQM Q; 3SEM A; 1LOJ A; 4CRI A; 5FU6 C; 2GFA A; 2L8D A; 4HVU A; 2DRM A; 4LDU A; 2EYW A; 2K3X A; 3SHW A; 4ELZ C; 4FW2 A; 4QKU A; 2H3J A; 4RTY A; 5AT1 B; 3Q1J A; 2DBM A; 4M77 C; 2J6K A; 4AFS C; 3DLL A; 1KJW A; 1LPL A; 1Q82 R; 4MZM A; 1VQ5 Q; 3RKW A; 5HK0 A; 3M9Q A; 2LX9 A; 3I5R A; 2HQX A; 2Y4X A; 2VGN A; 4E7K A; 2A7Y A; 5ECA A; 1PSF A; 2GF7 A; 3OW2 P; 4YTL A; 4C8Q D; 1K9M C; 1N6A A; 5I11 A; 4D8K A; 3L2Q A; 1QVP A; 4PJO B; 1G3Y A; 1Q81 R; 1QCF A; 1I4K 1; 4C92 D; 4N4I A; 2HZY A; 2O4X A; 3MP6 A; 2EKH A; 1O9S A; 1D1C A; 2WSC E; 3HKS A; 2D8H A; 2KT1 A; 1N8R C; 5AYF A; 2RJF A; 3OYY A; 1YJW T; 2AT1 B; 5CAI A; 1EZZ B; 4Y91 A; 2DYB A; 4PJO G; 1GFC A; 3C0C A; 2FVU A; 3VUB A; 1OV3 A; 4HT8 A; 3OS5 A; 3BDU A; 3M4Y A; 2DTI A; 1GCP A; 3EH1 A; 1M27 C; 2M0O A; 1I07 A; 5FWB A; 2DXU A; 2OAU A; 3JB9 G; 2EYX A; 1Y07 A; 3M56 A; 1WQ7 A; 5CK9 A; 3J80 E; 1TOV A; 4OP0 A; 4OMP A; 2KXC A; 5LL6 S; 1D0Y A; 1NPP A; 1OPL A; 1YJN A; 3QO3 A; 1VQO A; 3G1J A; 1S1N A; 3RES A; 4JRQ A; 2R5A A; 2E12 A; 3RMQ A; 3GNF B; 5D7U A; 5D6Y A; 1WXU A; 3ULR B; 1X2K A; 4IUT A; 2LQ8 A; 5CKE A; 4BI4 A; 1HYO A; 2M9U A; 1C0M A; 2OTJ Q; 3G4S Q; 2C0T A; 5HK3 A; 1PWT A; 3CCS A; 4L5G A; 3E9F A; 4QVZ A; 5GAO r; 1G3S A; 2KE9 A; 2DE0 X; 5CIU A; 3CCQ Q; 2YLC A; 2AZS A; 1IRE B; 2QDY B; 2DKG A; 1YIJ A; 1VQ7 Q; 2MF2 A; 1UG1 A; 5GAO q; 5FU7 B; 4NOY A; 1YP5 A; 4A4E A; 5LJ5 j; 4LUE A; 2O88 A; 3QJ6 A; 3LGF A; 4M7D C; 4FYX B; 1MND A; 1YCY A; 1JJ2 A; 2F1L A; 1VQK T; 2CGH A; 5LJ5 g; 2KVQ G; 2VKN A; 1HK9 A; 2X9H A; 3E2U A; 2CP0 A; 2J6F A; 4D6W A; 1VQ6 A; 2O4X B; 1AWJ A; 2J6O A; 5GMK i; 3AHU A; 2LT4 A; 1K9M R; 1G3T A; 5L23 A; 3I56 Q; 1VQM A; 2GTO A; 4E7J A; 2LNV A; 1MGQ A; 3EGU A; 2A28 A; 1YCS B; 1R0C B; 1YBY A; 4M7A D; 4CC7 A; 1UJY A; 1SRL A; 4XTY A; 4HCB A; 1GBR A; 4Y92 A; 3G6E A; 1NJI U; 2YHT A; 4NL3 A; 1NEG A; 2XD0 A; 1W2B S; 2PZ1 A; 5A0L A; 1N9S A; 1VQ4 Q; 4PJN A; 1VQP A; 3PIP A; 3OS0 A; 2XDB A; 3JCM Q; 4LDV A; 2KEA A; 1WIE A; 4LXC A; 2RK2 A; 3CCR Q; 4J7I A; 5GAM d; 5KYY A; 3NGP A; 3QWY A; 1VQL A; 2YT6 A; 4JRK A; 2HBP A; 1GXI E; 2VB6 A; 1W6X A; 2KRN A; 5IXB A; 2Z0W A; 2D6F A; 5CO7 A; 1R8O B; 5CCA A; 2RM4 A; 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1U5S A; 1G83 A; 4M78 E; 4M75 F; 3CCQ A; 3BW1 A; 3FJP A; 4GBQ A; 1VQ8 A; 1NZ9 A; 1K0S A; 5KYY B; 3JCM X; 4C8Q A; 1SPK A; 1T3L A; 1PM3 A; 2ZPI B; 3KXT A; 1YIJ T; 2HD0 A; 2KBT A; 4M78 F; 2KT8 A; 3MJX A; 4C92 A; 3OBW A; 3CME Q; 2C0O A; 4GLK A; 2QGG A; 1ZSZ B; 2JM8 A; 2PUO B; 1D3B B; 1VYV A; 5EG2 A; 1MV3 A; 3CCM Q; 2FL7 A; 3FRN A; 5IH2 A; 2RQV A; 2FRW A; 2K5L A; 5I2M A; 1NG2 A; 3VV0 A; 1S72 Q; 1X6O A; 1IRX A; 5LJ3 g; 1X6B A; 5D6W A; 4NL2 A; 1QP2 A; 2MIO A; 3KBG A; 1LJO A; 2DTO A; 5LJ5 e; 1KD1 R; 2KSS A; 3I56 A; 2YRC A; 1JJ2 S; 1TWB A; 4M77 E; 1VQM T; 2LQK A; 1SSH A; 2ZAE A; 4XU0 A; 2DTH A; 2X4W A; 4XTX A; 1VIE A; 7AT1 B; 1OPK A; 1H3H A; 1GCQ A; 4M77 F; 1CKB A; 5LJ5 f; 1H92 A; 4OML A; 5GAN 7; 2V26 A; 1W2B P; 1PRM C; 4QQG A; 2KRS A; 5GAN 3; 3MHX A; 3OMG A; 2K4Y A; 5KYW A; 1C6V X; 3HL8 A; 4CC4 B; 2AKK A; 2RPN A; 1Q86 C; 2NYS A; 3NFC A; 4O5V A; 5J39 A; 1VQ5 T; 2DXT A; 1UGS B; 2LJ0 A; 2BIV A; 1IHW A; 1YJW A; 2PTK A; 1ZUY A; 1M1K U; 1M2V A; 1D1B A; 3VS0 A; 2DZC A; 4J9E A; 1M2O A; 5GAN g; 4HT9 A; 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