The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
2
|
sequence length |
59
|
structure length |
59
|
Chain Sequence |
VTLFVALYDYEARTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVD
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Inferential Structure Determination
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Proto-oncogene tyrosine-protein kinase FYN
|
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
2
|
| structure length |
59
|
| sequence length |
59
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2005-04-08 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1U5S A; 1B3Q A; 1VYU A; 3VS2 A; 4LE9 A; 3FJ5 A; 4Z88 A; 1UUE A; 2A37 A; 2LZ6 B; 2C0I A; 3REB B; 1GFD A; 3C0C A; 5GJV B; 3TSW A; 1AWO A; 1X43 A; 3SEM A; 1PHT A; 2KBT A; 2FRW A; 3PVL A; 3TSZ A; 2A08 A; 2IIM A; 4A63 B; 1X69 A; 4OMP A; 2RQW A; 3VS3 A; 2G6F X; 2VKN A; 2GGR A; 2CH4 W; 1SRM A; 2CH4 A; 3LH5 A; 2KXD A; 4HVW A; 3VRY A; 4J9C A; 4AFU C; 1CKA A; 1GFC A; 5EC7 A; 1NEB A; 4Y92 A; 4X1V A; 4IIM A; 4GLM A; 1NLP C; 1X2Q A; 2DL5 A; 2ESW A; 1I1J A; 2O9V A; 2LQW A; 1ABQ A; 2PNI A; 1K1Z A; 2SEM A; 2RN8 A; 4DEY A; 1ZUK A; 2LQN A; 2B86 A; 1SSH A; 1RLP C; 2D1X A; 1H8K A; 1X27 A; 1PKS A; 2YUO A; 1BU1 A; 4J9E A; 2LCS A; 3UF4 A; 2DIL A; 4J9H A; 1GL5 A; 2DVJ A; 2O9S A; 2CSI A; 2GTJ A; 1OPK A; 1H3H A; 2BZX A; 1A0N B; 2DMO A; 4CC2 A; 1HSQ A; 2XMF A; 4F14 A; 1ABO A; 2LNH B; 1QKW A; 3H0H A; 3NHN A; 1M8M A; 3VS4 A; 2DJQ A; 2JTE A; 3IQL A; 2P4R A; 3UAT A; 1GBR A; 2KGT A; 3I5S A; 1N5Z A; 1NYF A; 1UGV A; 1K76 A; 2YSQ A; 1SRL A; 1FYN A; 1QWF A; 4RTW A; 2BZY A; 1K0S A; 1K0X A; 1YN8 A; 3VS1 A; 1QLY A; 2BTT A; 2HDA A; 2JM9 A; 1M30 A; 1MUZ A; 1S1N A; 3A98 A; 2NUZ A; 2JS2 A; 5IHN A; 1ZUU A; 2RQU A; 3O5Z A; 1KSW A; 2O2O A; 1PRM C; 1G2B A; 1BBZ A; 3M0T A; 4F16 A; 1AWX A; 2FPE A; 1PWT A; 1TUD A; 3EG3 A; 2J05 A; 1OOT A; 4GBQ A; 2CSQ A; 1SPK A; 3RNJ A; 3R6N A; 1GCP A; 2EGA A; 1AOJ A; 2DRK A; 2J6O A; 1RLQ C; 1G83 A; 2ENM A; 2EYW A; 2SRC A; 4AG1 C; 1YP5 A; 1UEC A; 1ARK A; 1QWE A; 3EG0 A; 1SEM A; 2EYX A; 1JQQ A; 2FPD A; 1BK2 A; 2PTK A; 4OMN A; 2KT1 A; 1NG2 A; 3H0F A; 1AWJ A; 2ABL A; 2CT4 A; 3JV3 A; 1WXB A; 1WLP B; 2DE0 X; 3VRZ A; 1WIE A; 4ZNX A; 3RBB B; 1UJY A; 2K3B A; 1NEG A; 2AZS A; 1AD5 A; 1WYX A; 2M0Y A; 4JPB W; 1V1C A; 2CT3 A; 2DBM A; 2F2V A; 2DF6 A; 1B07 A; 2C0O A; 1OV3 A; 2F2W A; 2KNB B; 1GCQ C; 2KT8 A; 2JW4 A; 1M3B A; 2KXC A; 1WX6 A; 3THK A; 4OMQ A; 3REA B; 2QDL A; 5IHI A; 4AFZ C; 1ZX6 A; 2GTO A; 1W6X A; 4ORZ A; 2W0Z A; 4JJC A; 2VWF A; 3EHR A; 2H8H A; 1M3C A; 2E5K A; 1Y0M A; 5IH2 A; 2KEA A; 2KYB A; 5FWB A; 3NMZ C; 3M0P A; 1GRI A; 2YT6 A; 2DYB A; 2KYM A; 3PVQ A; 2FO0 A; 1Y57 A; 2KR3 A; 5FWC A; 1UDL A; 2MOX A; 1GCQ A; 1NLO C; 1UG1 A; 2EGC A; 4RTV A; 2DRM A; 4AFS C; 4CC7 A; 1OPL A; 1YCS B; 2FEI A; 1WA7 A; 3I35 A; 1CKB A; 2DL7 A; 2J7I A; 3TVT A; 4OMM A; 1PRL C; 4D8K A; 4RTZ A; 4IIO A; 4J9F A; 5IXB A; 1T3L A; 1IO6 A; 1WFW A; 4J9G A; 2CUB A; 3VS0 A; 1VA7 A; 2ROT A; 4FSS A; 2L3S A; 4Z8A A; 2OI3 A; 1VYT A; 2EYZ A; 2RQR A; 2KRO A; 1JXM A; 1NYG A; 1QCF A; 2K6D A; 2C0T A; 3UA6 A; 4RTU A; 5IXF A; 2A36 A; 1KFZ A; 2DLP A; 2YDL A; 1T0J A; 1XOV A; 2D8H A; 2DL4 A; 1U06 A; 2AKK A; 1TG0 A; 1RI9 A; 1E6G A; 1X6G A; 2ED1 A; 2RMO A; 1I07 A; 5ECA A; 2RPN A; 2JM8 A; 4HXJ A; 1WXU A; 1MV0 B; 1X2K A; 3I5R A; 4EIK A; 1JEG A; 1UJ0 A; 1H92 A; 2J06 A; 3VS6 A; 1ZBJ A; 2ED0 A; 2GBQ A; 4OMO A; 4JJB A; 1PKT A; 1W70 A; 4HVU A; 5FW9 A; 1K4U S; 2DBK A; 2BZ8 A; 3U23 A; 2JS0 A; 2FRY A; 2J6K A; 5I11 A; 2HEQ A; 1UHC A; 2KRN A; 4F17 A; 2KRM A; 5L23 A; 2GQI A; 4LUE A; 4AFQ C; 4QT7 A; 2YUP A; 2K9G A; 1YNZ A; 2VVK A; 1E6H A; 2V1Q A; 3M0Q A; 1RUW A; 5GJW B; 2DM1 A; 2DL3 A; 2EPD A; 4M4Z A; 2JMA A; 3GBQ A; 5IHK A; 1YWO A; 4KRT A; 1OEB A; 3VS5 A; 4Z89 A; 1AWW A; 2RF0 A; 3EGU A; 5I22 A; 2EQI A; 3M0S A; 2AKL A; 1M27 C; 1AEY A; 1GBQ A; 1MV3 A; 2L3P A; 3PE0 A; 3VS7 A; 2DNU A; 2FPF A; 2X3W D; 1TUC A; 3M0R A; 2YUQ A; 4RTT A; 1M3A A; 1CSK A; 2W10 A; 3H41 A; 1J3T A; 4RTX A; 2D0N A; 1UFF A; 1K9A A; 3M0U A; 2K79 A; 4JJD A; 2EKH A; 1JXO A; 2OJ2 A; 2EBP A; 1LCK A; 1YWP A; 2AZV A; 1FMK A; 2KE9 A; 2HCK A; 2JT4 A; 2M51 A; 2AK5 A; 2CDT A; 4J9B A; 2L0A A; 2L3Q A; 1T3S A; 1SHF A; 2MIO A; 2X3X D; 3EG2 A; 2LJ1 A; 1E7O A; 1ZLM A; 3KFV A; 2LP5 A; 2FG0 A; 3ULR B; 1Z9Q A; 1WXT A; 2RNA A; 2EW3 A; 4AG2 C; 4CC3 A; 4D8D A; 1AVZ C; 4RUG A; 1UE9 A; 2A28 A; 1I0C A; 2YUN A; 3CQT A; 3UA7 A; 4J9I A; 5HCK A; 4J9D A; 2DX1 A; 2NWM A; 3QWX X; 2HSP A; 3I9Q A; 2KRS A; 1BB9 A; 2V1R A; 4ESR A; 2LMJ A; 3ZL7 C; 1W1F A; 4R0K A; 3NPF A; 3SHW A; 2LJ3 A; 4JZ4 A; 4DEX A; 2LJ0 A; 2O31 A; 4LNP A; 2CUD A; 2CRE A; 2JMC A; 1PNJ A; 2D8J A; 2EVR A; 1AZG B; 3EG1 A; 2EYY A; 2J6F A; 2ROL A; 1ZSG A; 4CC4 B; 4JZ3 A; 3QWY A; 2JXB A; 1JO8 A; 1UHF A; 2K7A A; 2MCN A; 4WCI A; 4E6R A; 2DA9 A; 1Z9Z A; 1AZE A; 4OML A; 2RQV A; 1UTI A; 2EGE A; 1VYV A; 4LUD A; 2LX7 A; 2HBW A; 4HVV A; 1T0H A; 1JU5 C; 1WDX A; 1QKX A; 2ECZ A; 2L2P A; 1ZUY A; 2O88 A; 2I0N A; 1HJD A; 4K11 A; 3EHQ A; 2F2X A; 2GNC A; 2K2M A; 3NGP A; 4HCK A; 3H0I A; 1WI7 A; 1X6B A; 1U3O A; 1KIK A; 2DL8 A; 1NM7 A; 1KJW A; 1HD3 A; 1EFN A; 2OAW A; 4RTY A; 4LN2 A; 2PZ1 A; 2RQT A; 1SHG A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2X35 A; 1B3Q A; 1M8V A; 4M78 D; 3OBW A; 2WSC E; 4Z88 A; 1UUE A; 2X4Y A; 2C0I A; 1YI2 T; 1GFD A; 3BW1 A; 1G5V A; 3TSZ A; 2A08 A; 2IIM A; 3LX7 A; 2CGH A; 3A8H B; 4OMP A; 2QQS A; 2HL3 A; 5LJ3 d; 4EDU A; 5GMK i; 2MMP A; 4M77 G; 1WHG A; 3PNW C; 5DLO A; 4PJJ A; 3VRY A; 4J9C A; 1GFC A; 3D7S B; 5EC7 A; 4IUV A; 4C5G A; 1WPY A; 2CZ6 B; 5KYW A; 5IN1 A; 8AT1 B; 4C8Q E; 3CCR Q; 2ESW A; 2HD0 A; 1K73 C; 2O9V A; 3X25 B; 1QP2 A; 2LQW A; 3CCS T; 2EQU A; 4DEY A; 5EG2 A; 2B86 A; 3EAE A; 4XU3 A; 1RAG B; 4ZN1 A; 3QYH B; 1R0C B; 2FZC B; 1BIB A; 1W2B S; 1H8K A; 1X27 A; 1VQ7 A; 2F69 A; 2P0P A; 1WNL A; 1QCO A; 4J9H A; 1YI2 Q; 3OMG A; 5FU7 B; 1YBY A; 2QEX T; 1A0N B; 1BI2 A; 5HK3 A; 4F7U G; 2JTF A; 2XMF A; 4ZTJ A; 1UB4 A; 1YFN A; 1G3T A; 1N27 A; 3MPU B; 1ACM B; 2HNI A; 4LDY A; 3IQL A; 2P0K A; 1YJ9 T; 3CCE A; 4M7A G; 3S6W A; 1LNX A; 4PJO B; 3WVD B; 3M4Y A; 3MEV A; 1OU9 A; 3MP8 A; 2LCL A; 2YRD A; 1SF9 A; 4ELZ C; 2ZZD A; 3CCS Q; 1RAE B; 1YN8 A; 2FZK B; 3VS1 A; 4HCB A; 3MKD A; 1MMN A; 2CP7 A; 1YJN T; 4PJO F; 3LYI A; 2JS2 A; 1ZUU A; 5CQY A; 3DKM A; 2Y90 A; 2QEX Q; 2V8K A; 2V8J A; 1G2B A; 3OB9 A; 3CBO A; 4F16 A; 1AWX A; 1PWT A; 5J3B A; 1TUD A; 3EGD A; 3EG3 A; 2J05 A; 2KSS A; 4GBQ A; 2MI6 A; 3JCM d; 1V29 B; 1PSF A; 3L2R A; 4C0G A; 2AIR B; 2DRK A; 4TVR A; 1RLQ C; 1K9M C; 4OB2 B; 2PVD B; 2SRC A; 1QWE A; 4BY6 C; 1M1K C; 3CEY A; 1QMC A; 4RG8 A; 2FPD A; 2PTK A; 1NG2 A; 5FU6 C; 2ABL A; 3HPW A; 4PNO A; 1YJN Q; 1WIE A; 1YJW Q; 3V7C A; 1NPR A; 1UJY A; 3KUF A; 3R6O A; 2RI2 A; 5GAM f; 4J5Y A; 2AZS A; 1AD5 A; 3A8O B; 4ATO A; 2CT3 A; 1VQ5 A; 4PJN A; 3CPF A; 2DF6 A; 2FHD A; 1MHN A; 2LTO A; 4M78 C; 2PU9 B; 4PJO E; 1X6O A; 2YHT A; 3HFO A; 4M75 A; 1KK7 A; 2M9U A; 3CCQ A; 4OMQ A; 1M90 R; 1M9S A; 2GTO A; 1Q7Y R; 2H3E B; 3JB9 I; 2K57 A; 2XID A; 4D6W A; 3FLG A; 5GMK m; 1FX7 A; 1M3C A; 2E5K A; 1NJI C; 2YWW A; 3NMZ C; 1QVG S; 5KH6 A; 3M0P A; 1OYX A; 1TWB A; 2DYB A; 3QZ5 B; 2E10 A; 1TTH B; 2FO0 A; 1Y57 A; 1FXX A; 3BY7 A; 1VQ8 T; 1UDL A; 5GAO l; 2MOX A; 4CI0 C; 3JB9 D; 3G71 A; 1Y96 B; 3OS2 A; 1UG1 A; 1QCN A; 4M77 F; 1YCS B; 4C92 C; 2E70 A; 3HFN A; 3I35 A; 2RI5 A; 2DL7 A; 4E47 A; 4PJL A; 3J7A F; 4J9F A; 4N4G A; 2OTJ T; 1T3L A; 1VQM A; 2VC8 A; 3OS5 A; 2CUB A; 2OI3 A; 1VQ6 Q; 4AT1 B; 2RQR A; 1JXM A; 4HKE A; 3SD4 A; 3T9N A; 1KC8 R; 2XDD A; 4C8Q D; 2MWO A; 1O75 A; 5GMK e; 3RKX A; 1G3S A; 3JCM Q; 2DLP A; 2YXY A; 4J7F A; 1IGU A; 4YTL A; 2K3Y A; 2V8I A; 4M7A B; 1VQ8 Q; 4IUU A; 4F7U F; 3E2U A; 1X6G A; 1Q81 U; 2ED1 A; 4QQD A; 3GNG A; 1FMW A; 2DKG A; 2RPN A; 1S72 T; 4FYX B; 5LJ3 h; 4EIK A; 4FU6 A; 3QDR B; 4OMF B; 5HY6 A; 4BY6 B; 1UJ0 A; 1JEG A; 1H92 A; 2J06 A; 5I21 A; 1M2V B; 1W70 A; 4ZGD B; 4M7A F; 2HKQ B; 1D3B A; 1K4U S; 4AMC A; 2OTL T; 3U23 A; 2JS0 A; 4ZGJ B; 3H6Z A; 5I11 A; 4L5G A; 1D0X A; 1JJ2 S; 3CC2 T; 2CP2 A; 3PMI A; 3RR6 A; 4HCZ A; 3G4S A; 4M78 B; 5LJ3 j; 4AFQ C; 2YUP A; 4FW1 A; 2K9G A; 3UPU A; 3MO8 A; 2V1Q A; 3M0Q A; 3EG9 A; 3CXC P; 4II1 A; 4M4Z A; 2JMA A; 2MF2 A; 3OYG A; 4ZN3 A; 4KRT A; 1S72 Q; 1BKB A; 5GAO p; 2DXU A; 1AWW A; 5FLX E; 2EQI A; 2XDP A; 3M0S A; 5FRM A; 4R56 A; 2ZPB B; 3DB3 A; 3CCV A; 4HT8 A; 2FPF A; 1D1A A; 3NTI A; 5C0M A; 3VJP A; 3EFR A; 2X4X A; 4EMK A; 3G6E A; 3CC2 Q; 1K9A A; 3M0U A; 4BE1 A; 2EKH A; 4XK8 E; 1V76 A; 2OJ2 A; 2EQM A; 2EBP A; 1QP3 A; 5CQX A; 2HCK A; 4BD3 A; 2AK5 A; 2LNV A; 2CDT A; 1M1G A; 4J9B A; 3CME A; 1DJ7 B; 1IGQ A; 1ZSZ C; 1PD0 A; 1Y07 A; 3KFV A; 5J39 A; 2RNA A; 4AG2 C; 1VQL T; 3OSV A; 4D8D A; 1AVZ C; 4RUG A; 4M7D A; 3V8K A; 3JCM h; 4FT4 A; 2A28 A; 1I0C A; 2DK3 A; 2YUN A; 3CQT A; 3C12 A; 3PFS A; 1KHC A; 2QXF A; 4J9D A; 1I4K 1; 3I9Q A; 1ZA1 B; 5CVI A; 4M78 E; 1EZZ B; 1BB9 A; 2LMJ A; 1W1F A; 3DLL A; 4JZ4 A; 2EYY A; 4JDS A; 5LJ5 e; 1JO8 A; 2MCN A; 2DXC A; 5GAO m; 5D6X A; 1VQN A; 1BCO A; 2LQK A; 1AZE A; 3ME9 A; 1UTI A; 2EGE A; 4LUD A; 1T0H A; 3OYL A; 4C8Q C; 2A0F B; 3CCM A; 1IXD A; 3LGL A; 4FIB A; 3OA6 A; 2QA4 T; 3FC3 A; 5AYF A; 3JB9 J; 4K11 A; 5CCA A; 3L42 A; 3FDR A; 3OW2 A; 3HKS A; 2GNC A; 3NGP A; 1WHH A; 1WI7 A; 4IUP A; 1X6B A; 4PLL A; 4QVD A; 3OYM A; 2DL8 A; 4BI3 A; 4VUB A; 1HD3 A; 1EFN A; 3URG A; 2CP0 A; 2PZ1 A; 1BCM A; 3SFM A; 1U5S A; 1SKU B; 3VS2 A; 1Q82 U; 1VQ7 Q; 2LC4 A; 3CC4 T; 2A37 A; 2ZAE A; 1W4S A; 3C0C A; 3M54 A; 3X26 B; 3PVL A; 4ELY C; 1X69 A; 3L2W A; 1IZ6 A; 3M57 A; 2ZPE B; 2ZCF B; 5CR2 A; 2QA4 Q; 3CC7 A; 2CH4 W; 2KXD A; 1QVF P; 1KD1 R; 4XTV A; 4RKU E; 1NEB A; 4X1V A; 1M4Z A; 5FRO A; 5GAM d; 1WJS A; 1MMD A; 4GLM A; 2DFU A; 2P0Q A; 2RJC A; 2PNI A; 1YIT A; 2L8D A; 2XK0 A; 2SEM A; 1ZUK A; 2DZC A; 2LQN A; 4M77 D; 3VV0 A; 3CCL T; 3OYD A; 1NE8 A; 2D1X A; 3NTH A; 2XU8 A; 3QDF A; 5LJ5 g; 4PFP A; 3CC4 Q; 2GFU A; 4PFO A; 3UF4 A; 2DIL A; 2CSI A; 1H3H A; 1G3W A; 2DMO A; 2RHZ A; 2DEU A; 1M90 U; 2CZ0 B; 1Q7Y U; 4F14 A; 1ABO A; 1VQO A; 3SWN C; 5D7U A; 1RL2 A; 5HKC A; 2COZ A; 3ASK A; 3SDZ A; 2KY9 A; 2DJQ A; 3GIB A; 3UAT A; 1GBR A; 3I5S A; 3RKY A; 2L5Q A; 4O6J A; 1K76 A; 1I5O B; 1SRL A; 1FYN A; 1QW1 A; 1QWF A; 3L2U A; 2BZY A; 1VQ4 T; 3CCL Q; 1HYO A; 1VIF A; 4WF2 A; 3M5A A; 5GAO q; 2HDA A; 1M30 A; 1S1N A; 4PJO C; 4M7A D; 5IHN A; 2XD0 A; 2WAC A; 3CMA A; 3BFM A; 3EG9 B; 1KSW A; 3EGX A; 2FL7 A; 4Z02 A; 2AT1 B; 4Y28 E; 1BBZ A; 2XG8 D; 3P8D A; 3OW2 P; 2FPE A; 4N0A C; 2VXE A; 3Q1J A; 3PIP A; 3RNJ A; 3RKW A; 3CCU A; 1GCP A; 3V8J A; 2EGA A; 1AOJ A; 1NBE B; 4A4G A; 2HZY A; 3BDU A; 4J83 A; 4EMK B; 1Q81 C; 1BK2 A; 1VQ4 Q; 4IUT A; 3H0F A; 3L1A A; 5I2S A; 2YRV A; 2EQK A; 3RBB B; 3HP9 A; 1WQ7 A; 2NUT A; 2K3B A; 4JPB W; 1FWZ A; 1N9S A; 3JCM b; 4MZT A; 2F2V A; 1B07 A; 4J6X A; 4E2F B; 2VV5 A; 3LW5 E; 1MGQ A; 1GCQ C; 3JCM J; 2KXC A; 2XKO C; 4MZP A; 1WX6 A; 3ZBD A; 5IHI A; 4AFZ C; 4NL3 A; 4MML A; 2DD5 A; 2CKK A; 2W0Z A; 1PC0 A; 4FSX A; 4KH1 B; 5KYX B; 5D6W A; 1MMA A; 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