The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
2
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sequence length |
59
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structure length |
59
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Chain Sequence |
VTLFVALYDYEARTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transferase
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| source organism |
Homo sapiens
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| publication title |
Inferential Structure Determination
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Proto-oncogene tyrosine-protein kinase FYN
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| total genus |
2
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| structure length |
59
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| sequence length |
59
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2005-04-08 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2CT3 A; 1GRI A; 2V1Q A; 1Z9Z A; 3NGP A; 4X1V A; 5I22 A; 2DYB A; 2AZV A; 1JU5 C; 2DVJ A; 2L3S A; 2EGC A; 1CKB A; 4AG1 C; 1BBZ A; 1PWT A; 3M0R A; 2DJQ A; 2PZ1 A; 1VYV A; 3VRZ A; 1NM7 A; 1UHC A; 3UA6 A; 1YWP A; 3VS6 A; 2DL7 A; 1RI9 A; 1K0X A; 4RUG A; 5FW9 A; 1E6G A; 3UAT A; 1WXB A; 4D8K A; 1A0N B; 4CC3 A; 2K2M A; 2I0N A; 1AWO A; 4RTW A; 1VYT A; 2KNB B; 1WDX A; 4RTX A; 3VS7 A; 1OPK A; 1Z9Q A; 2EBP A; 1ZBJ A; 2LJ1 A; 1NLO C; 1QKX A; 4LNP A; 1PNJ A; 4QT7 A; 2DRM A; 2YUQ A; 2EGA A; 4DEY A; 5IH2 A; 4J9I A; 5IHK A; 1KSW A; 2L2P A; 1AZE A; 2ABL A; 2JTE A; 3NMZ C; 3R6N A; 1JXO A; 1N5Z A; 2HDA A; 2RQU A; 1UHF A; 3H41 A; 1X6G A; 1FMK A; 1U3O A; 2F2W A; 2YUN A; 4OMN A; 2KYM A; 2JMA A; 2DL5 A; 1GCQ C; 2EYY A; 3EG0 A; 4HVW A; 3H0H A; 4GLM A; 4OMO A; 2GGR A; 2BZY A; 3I9Q A; 2O31 A; 2A36 A; 1BK2 A; 1UG1 A; 2CUB A; 1HJD A; 2KRO A; 4RTY A; 2KR3 A; 1WLP B; 2GQI A; 2JS0 A; 1NEB A; 1YCS B; 2DNU A; 2MCN A; 5I11 A; 4LE9 A; 3VS0 A; 1PRM C; 2JMC A; 2ROL A; 1KIK A; 2CSQ A; 3PVL A; 1W6X A; 4IIO A; 2MIO A; 4F16 A; 3THK A; 2CDT A; 2EGE A; 4Z8A A; 2P4R A; 2HSP A; 1GCQ A; 1I07 A; 2DF6 A; 3RBB B; 2CH4 W; 1ZX6 A; 2LCS A; 3I35 A; 2O88 A; 1M3A A; 1TUC A; 1ZUY A; 2D8H A; 1K76 A; 1TG0 A; 1IO6 A; 1NYF A; 1UJY A; 4K11 A; 2EPD A; 2FG0 A; 2FRW A; 2LP5 A; 1AEY A; 3JV3 A; 4AFU C; 5IXF A; 1JXM A; 2GTJ A; 4J9D A; 1UGV A; 2EVR A; 2FPE A; 2JT4 A; 2J05 A; 2KXD A; 4EIK A; 2A28 A; 4OMQ A; 4ESR A; 4CC7 A; 2A08 A; 1MV3 A; 1W70 A; 1EFN A; 2KYB A; 2JS2 A; 1PKS A; 2W10 A; 4F14 A; 2A37 A; 1T3L A; 1YNZ A; 4CC2 A; 1OPL A; 4WCI A; 2CSI A; 1KFZ A; 2EYW A; 2FPD A; 1WXT A; 2AKK A; 4J9B A; 2DL8 A; 2D0N A; 4OML A; 4JZ4 A; 2XMF A; 2V1R A; 2KGT A; 1SSH A; 3U23 A; 2GNC A; 2L0A A; 2B86 A; 3VRY A; 1K4U S; 1UUE A; 3EG1 A; 1GFD A; 1XOV A; 4JJB A; 1UTI A; 3O5Z A; 1NG2 A; 2RNA A; 1X2K A; 2KRS A; 4J9C A; 2K9G A; 3FJ5 A; 2SRC A; 1QWE A; 2DBK A; 2LX7 A; 2KXC A; 1I0C A; 2LMJ A; 1Y57 A; 2VWF A; 1BU1 A; 2CRE A; 2DM1 A; 2K79 A; 2YSQ A; 2FPF A; 3LH5 A; 2L3P A; 1UJ0 A; 2MOX A; 1AD5 A; 1YP5 A; 2HEQ A; 2RQR A; 4IIM A; 2EKH A; 2KEA A; 1G83 A; 2M51 A; 1GBQ A; 1U5S A; 1I1J A; 3VS3 A; 1QKW A; 2D8J A; 1NEG A; 4HVV A; 2W0Z A; 4AFS C; 4HCK A; 2RN8 A; 3UF4 A; 1T0H A; 2LJ0 A; 1AWX A; 2RMO A; 2KE9 A; 1K1Z A; 3CQT A; 1LCK A; 1M3C A; 2DMO A; 4AFQ C; 4JJC A; 2IIM A; 1AWW A; 4J9E A; 2AKL A; 2DE0 X; 1GFC A; 2K6D A; 3H0F A; 4JZ3 A; 4LUE A; 3M0Q A; 2ESW A; 2O9V A; 4KRT A; 1RLQ C; 1B3Q A; 2BZ8 A; 1QCF A; 5ECA A; 2ECZ A; 2EW3 A; 3UA7 A; 1SEM A; 1JQQ A; 1ABQ A; 2F2V A; 2DL3 A; 2SEM A; 3C0C A; 1AVZ C; 2KRM A; 2CT4 A; 1ARK A; 4ORZ A; 3I5R A; 2DIL A; 3KFV A; 1M30 A; 2GTO A; 3EG3 A; 1SRL A; 2VVK A; 1VA7 A; 2RQV A; 1OEB A; 1WXU A; 1AZG B; 1WIE A; 3VS1 A; 2LZ6 B; 2LQN A; 1WA7 A; 1OOT A; 3NPF A; 4HXJ A; 2YDL A; 3I5S A; 5GJW B; 4LUD A; 2D1X A; 3SEM A; 2K7A A; 4Y92 A; 2FO0 A; 3EG2 A; 1E6H A; 4R0K A; 3EHR A; 4F17 A; 2RPN A; 5HCK A; 2LNH B; 1JEG A; 2EQI A; 4JJD A; 4OMM A; 4ZNX A; 2KRN A; 3PE0 A; 2DRK A; 1TUD A; 4HVU A; 1VYU A; 5IXB A; 2F2X A; 2NWM A; 2C0I A; 2FRY A; 5GJV B; 1ZSG A; 1GBR A; 2YT6 A; 2LQW A; 3SHW A; 4J9G A; 2X3X D; 5EC7 A; 2NUZ A; 2DBM A; 2OJ2 A; 1UDL A; 1WFW A; 1PRL C; 1ZUK A; 4GBQ A; 1SHF A; 2FEI A; 2J6K A; 2KT1 A; 2AZS A; 1X6B A; 2ROT A; 2JXB A; 1J3T A; 4OMP A; 5FWC A; 3M0T A; 2OI3 A; 2DLP A; 2CH4 A; 1PHT A; 2ENM A; 2J06 A; 2C0T A; 2DX1 A; 2LJ3 A; 1UFF A; 3VS4 A; 2YUO A; 4FSS A; 1CKA A; 2PTK A; 2EYZ A; 2JM9 A; 1GL5 A; 1MUZ A; 1QLY A; 1K0S A; 2RF0 A; 1QWF A; 2HCK A; 1HSQ A; 2ED0 A; 2VKN A; 4A63 B; 2EYX A; 3ULR B; 1BB9 A; 2GBQ A; 2L3Q A; 1YN8 A; 2RQT A; 1GCP A; 2JM8 A; 1E7O A; 3IQL A; 3QWX X; 1V1C A; 4J9H A; 1RUW A; 4RTZ A; 3M0S A; 2ED1 A; 1ZLM A; 2QDL A; 1MV0 B; 3QWY A; 5IHN A; 3VS2 A; 1JO8 A; 1UEC A; 1W1F A; 4M4Z A; 2M0Y A; 3EGU A; 2G6F X; 4RTT A; 3M0U A; 4Z89 A; 1X43 A; 1Y0M A; 4RTV A; 1G2B A; 4AFZ C; 2O2O A; 1K9A A; 1T0J A; 2AK5 A; 1PKT A; 1X2Q A; 2RQW A; 2BZX A; 3RNJ A; 1NLP C; 4DEX A; 2J6O A; 1AOJ A; 1WI7 A; 1FYN A; 2H8H A; 2J7I A; 2X3W D; 4CC4 B; 2BTT A; 2CUD A; 2DL4 A; 3TSW A; 1AWJ A; 3REA B; 1OV3 A; 4J9F A; 3ZL7 C; 1UE9 A; 2E5K A; 1T3S A; 4RTU A; 2HBW A; 1RLP C; 1M27 C; 1NYG A; 3VS5 A; 1ZUU A; 1HD3 A; 3TVT A; 3PVQ A; 5IHI A; 3NHN A; 2YUP A; 3REB B; 2OAW A; 1H3H A; 1ABO A; 4JPB W; 1B07 A; 1WYX A; 1H8K A; 1M3B A; 3EHQ A; 2KBT A; 3M0P A; 1X69 A; 2O9S A; 1M8M A; 5FWB A; 1CSK A; 1YWO A; 2KT8 A; 4E6R A; 1X27 A; 4AG2 C; 4LN2 A; 1SRM A; 2K3B A; 1SPK A; 2JW4 A; 3GBQ A; 1H92 A; 1SHG A; 1WX6 A; 5L23 A; 3H0I A; 2DA9 A; 2C0O A; 2J6F A; 2PNI A; 3A98 A; 4D8D A; 1U06 A; 4Z88 A; 1S1N A; 3TSZ A; 1KJW A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4FYX B; 1OYX A; 1IB8 A; 2AZV A; 2DVJ A; 4PFP A; 3QHS A; 2QGF B; 2RJE A; 2PZ1 A; 2E1H A; 1VYV A; 1N9R A; 1NPR A; 1QCO A; 1RI9 A; 4OF1 A; 4RUG A; 1KD1 R; 3M53 A; 1E6G A; 2HZY A; 3S3O A; 1XTD A; 2K2M A; 3F70 A; 3JCM X; 4HT9 A; 1VYT A; 2KNB B; 2E4H A; 3PGG A; 3RUX A; 4YTL A; 1Z9Q A; 3HPW A; 3CCE Q; 4FW2 A; 3CCV T; 2QYZ A; 2AT1 B; 4M7A C; 1QKX A; 2BE9 B; 4QT7 A; 2DRM A; 2EGA A; 2XU8 A; 3OYA A; 3M57 A; 2L2P A; 1AZE A; 4MML A; 4F7U F; 3CCR Q; 2JZ2 A; 2NUT B; 4X34 A; 1JXO A; 4HA8 A; 4C8Q G; 1UHF A; 5LJ5 f; 1U3O A; 1G3T A; 2KAF A; 4HCB A; 4LDU A; 1NJI C; 2EYY A; 1G5V A; 4HVW A; 1AT1 B; 4OMO A; 3GIB A; 1AHJ B; 1NZ9 A; 2CUB A; 5LJ3 h; 1I81 A; 4ZTF A; 2V8K A; 2KR3 A; 1LOJ A; 3G71 Q; 3P8B B; 2GQI A; 2JS0 A; 1WJR A; 1MND A; 3MO8 A; 4LE9 A; 3VS0 A; 3PVL A; 1RAE B; 2QQB A; 4IIO A; 2R58 A; 1RAD B; 3DKM A; 3QDF A; 4QW2 A; 1I07 A; 1D1C A; 2CH4 W; 2KY9 A; 3I35 A; 2O88 A; 4C92 D; 4A4H A; 2D8H A; 3JCM g; 1IO6 A; 2X4W A; 1TWB A; 2CZ6 B; 3JSC A; 5GAM g; 1H3Z A; 2LP5 A; 3LX7 A; 1AEY A; 3JV3 A; 2QAZ A; 3QKJ A; 2M0O A; 3M58 A; 2JJ9 A; 1YIT Q; 4M77 G; 4FW1 A; 4J9D A; 2FPE A; 3GLX A; 3S3M A; 2FL7 A; 2A08 A; 4BDY A; 6AT1 B; 2JS2 A; 4PLL A; 4F14 A; 2A37 A; 1ZSZ B; 2O01 E; 2EYW A; 1KQS A; 5KE3 A; 3CCU Q; 2DL8 A; 2XMF A; 2KGT A; 3CC2 T; 3RKW A; 2E10 A; 2B86 A; 4JRP A; 3V7C A; 3EG1 A; 1XQH A; 2QI2 A; 4C8Q C; 1UTI A; 3HKS A; 3O5Z A; 4B6M A; 2RNA A; 2XDB A; 3A1P A; 1D0Y A; 1X01 A; 5LJ5 j; 4J9C A; 3RKX A; 2K9G A; 1VQ5 Q; 2SRC A; 3EFR A; 1O75 A; 2DBK A; 4M7D C; 2KXC A; 3CD6 Q; 1M2V B; 4XTU A; 3CCQ Q; 1Y57 A; 2PVD B; 2DM1 A; 2K79 A; 2AHJ B; 2FZK B; 2LT1 A; 3QYH B; 3MEW A; 1AD5 A; 2OTL Q; 4IIM A; 2EKH A; 5EG2 A; 1GBQ A; 1U5S A; 5HKC A; 1QKW A; 2DVE A; 3BDL A; 4M78 C; 5GAN 7; 4HVV A; 5FU6 B; 2VXF A; 4J8O A; 4KH1 B; 2RO0 A; 2JUF A; 3UF4 A; 1T0H A; 3PMT A; 3OYG A; 1I8F A; 5DY9 A; 3SDZ A; 1QW1 A; 4P5N A; 3CQT A; 4Y28 E; 4AFQ C; 3LYI A; 3CCE A; 2DFU A; 2V26 A; 4J9E A; 2AKL A; 2DE0 X; 5L8R E; 3H0F A; 4JZ3 A; 3EFO A; 5CKB A; 3OB9 A; 1WHJ A; 1QCF A; 5ECA A; 1M1F A; 1SEM A; 3TCJ A; 1YJW Q; 3CCR A; 3BY7 A; 2EJG A; 4FT4 A; 2OX7 A; 5GAM j; 4BUG A; 2EYQ A; 3DLM A; 3C0C A; 5A0D A; 1G3Y A; 2KRM A; 4ORZ A; 3I5R A; 1C1A A; 3KFV A; 1M30 A; 2RJD A; 2RQV A; 2LZ6 B; 3J80 E; 3OYY A; 1DJ7 B; 3VUB A; 3QZ5 B; 4HXJ A; 1QCN A; 4LUD A; 3TU4 K; 4Y92 A; 2BIV A; 5GAO l; 3G71 A; 4KUI A; 2JN0 A; 3RES A; 1XNI A; 3PMI A; 4F17 A; 5KYU A; 5HCK A; 1X75 C; 1GXI E; 4OMM A; 4ZNX A; 2KRN A; 3WVD B; 2DRK A; 3CC7 T; 1VYU A; 3JCM e; 1IXD A; 2OTJ Q; 3I56 Q; 7AT1 B; 1OU9 A; 1VQ8 A; 2RA2 A; 1GBR A; 2LQW A; 1WHL A; 2DKG A; 5EC7 A; 5GMK l; 1YHQ Q; 4GBQ A; 1Q81 U; 2DPP B; 1PM3 A; 2F5T X; 2QDY B; 2ZGW A; 2FVU A; 3CPW A; 5HK0 A; 3JB9 H; 2AZS A; 3OYH A; 4KBM B; 1OU8 A; 3ER0 A; 4KT0 E; 3A8M B; 2CH4 A; 1M9S A; 2ENM A; 1P92 A; 2KSS A; 2RHY A; 3HSB A; 4N4G A; 1UFF A; 3OYN A; 1VQO T; 1EZZ B; 4ZTJ A; 1CKA A; 5GAN h; 1FX7 A; 1OI1 A; 3ZBD A; 2YRV A; 3JCM d; 3CCU A; 3CCS Q; 4PJO D; 1VQN Q; 1HSQ A; 4JS4 A; 5KYN A; 3OBW A; 4O5V A; 2HKN A; 3GP8 A; 2C06 A; 2H3E B; 1YN8 A; 3PTA A; 4L6V 5; 1Y7X A; 1E7O A; 1YI2 T; 3CMA T; 4E47 A; 4OGE A; 2ED1 A; 3L1A A; 2QDL A; 3VS2 A; 2QA4 T; 5A0L A; 4PLI A; 1UEC A; 3EGU A; 2NYS A; 1VQ4 Q; 3FEO A; 4M7D B; 2O2O A; 1IRX A; 5GAN 8; 4ME7 A; 1HK9 A; 1RAA B; 1X6O A; 4M7A E; 4IKF A; 1FXX A; 4M75 D; 1C0M A; 2J6O A; 5CO7 A; 4BD3 A; 3I55 T; 2X3W D; 2O4X A; 2VXE A; 2DL4 A; 2CUD A; 2D0Q B; 2CP7 A; 4C0G A; 4J9F A; 5GMK h; 3ZL7 C; 3S6W A; 2K4Y A; 2E5K A; 2K5I A; 3FRN A; 2HBW A; 1M27 C; 4DQ2 A; 5M9O A; 1ZUU A; 2ZPB B; 1QVF S; 2E6N A; 2YUP A; 2OAW A; 1D0X A; 1EIF A; 1IRE B; 2P4T A; 2E6Z A; 1C6V X; 2EJF A; 2ZZD A; 4FT2 A; 1VQP T; 1CSK A; 1YWO A; 4AG2 C; 4LN2 A; 3PFS A; 1YJW A; 1SPK A; 3OYC A; 3CXC S; 2JNG A; 1D1A A; 4RG2 A; 4XAX B; 4XTX A; 5L23 A; 2DA9 A; 1VQM T; 1W2B S; 1EX4 A; 3FJP A; 1U06 A; 4Z88 A; 1S1N A; 3QYG B; 4EMK B; 2LX9 A; 1TU0 B; 2ZPI B; 5I22 A; 3S3N A; 1CKB A; 5KYY A; 3C12 A; 1RAC B; 1WPY A; 2DJQ A; 5FRO A; 4FU6 A; 4BI4 A; 1UHC A; 3UA6 A; 1YWP A; 4EDU A; 3G6E T; 3JCM Q; 1PC0 A; 5DLQ E; 2X4X A; 4BDZ A; 1MMA A; 3G1J A; 1WXB A; 1VQ7 A; 1A0N B; 3PNW C; 1KC8 U; 5I2S A; 3UPU A; 4HKE A; 1Q81 R; 2QGG A; 3D7S B; 1JB0 E; 3GF5 A; 4E2F B; 1Q86 U; 3I56 A; 4LNP A; 4C0F A; 4DEY A; 4A4F A; 3OW2 P; 3VYG A; 1Q81 C; 2DXB A; 2LQK A; 2D9T A; 1SG5 A; 1VQ6 A; 1ZA1 B; 4BB7 A; 2GFU A; 1VOM A; 3SWN B; 3H41 A; 4C8Q A; 1LVK A; 4OMN A; 4E7L A; 1QVG S; 3JB9 G; 1GCQ C; 2L5Q A; 4M7D E; 4X9D A; 4M7A G; 5HY6 A; 2EQK A; 3I9Q A; 2E70 A; 1YBY A; 2FZG B; 1UG1 A; 2KRO A; 3QJ6 A; 4C92 B; 1WLP B; 2D6F A; 2MAM A; 3O8V A; 1M1K U; 1RL2 A; 1PSF A; 1NEB A; 1YCS B; 2YHT A; 3QII A; 2DNU A; 1YIJ A; 1ZSZ C; 1KIK A; 4N0A C; 1W6X A; 4KGX B; 4M78 E; 3THK A; 2EGE A; 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