The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
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sequence length |
57
|
structure length |
57
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Chain Sequence |
IPAFVKFAYVAEREDELSLVKGSRVTVMEKCSDGWWRGSYNGQIGWFPSNYVLEEVD
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural Insight into the Binding Diversity between the Human Nck2 SH3 Domains and Proline-Rich Proteins
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Cytoplasmic protein NCK2
|
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
5
|
| structure length |
57
|
| sequence length |
57
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-01-20 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2J6K A; 1CKB A; 3TVT A; 1GFC A; 3TSZ A; 5I22 A; 4AG2 C; 1QLY A; 2LJ1 A; 2LJ3 A; 2LQW A; 2O9V A; 1OPL A; 2FRY A; 2H8H A; 2DMO A; 2MOX A; 3ZL7 C; 2CT4 A; 1WIE A; 2IIM A; 1UEC A; 4R0K A; 5IHI A; 3UF4 A; 1WXU A; 2LCS A; 3H0F A; 5HCK A; 1BK2 A; 2CH4 A; 4ORZ A; 1H3H A; 1UG1 A; 1H92 A; 2J05 A; 2DA9 A; 4OMQ A; 1K0S A; 2KR3 A; 1ABO A; 1M3C A; 1HD3 A; 2DL4 A; 4CC4 B; 1JXO A; 2OAW A; 2DYB A; 4JJB A; 2BTT A; 1M3B A; 3VS0 A; 1YNZ A; 1HSQ A; 3VS6 A; 4EIK A; 2GNC A; 3UAT A; 1U3O A; 1RLQ C; 1X27 A; 3VRZ A; 1PRL C; 3JV3 A; 2GGR A; 2DNU A; 1SSH A; 2QDL A; 1ZUU A; 1X2K A; 4LUD A; 4JZ4 A; 1WI7 A; 3IQL A; 4X1V A; 2RPN A; 2B86 A; 2K3B A; 1SPK A; 1PKT A; 2DJQ A; 4AG1 C; 1T3L A; 2D0N A; 2ED0 A; 1QWE A; 2RQW A; 2PTK A; 1VYV A; 4OML A; 1OPK A; 1B07 A; 1VYU A; 3EG1 A; 3TSW A; 1GRI A; 1YP5 A; 2EGA A; 1GBQ A; 2ENM A; 1HJD A; 2GTJ A; 2X3W D; 2F2W A; 2DL3 A; 2O88 A; 3NMZ C; 1I0C A; 2RQT A; 3CQT A; 2EQI A; 2KGT A; 2JT4 A; 2LP5 A; 2ROT A; 3R6N A; 1Y57 A; 2M51 A; 1QCF A; 4HVU A; 1YWP A; 2KRN A; 2F2X A; 1U5S A; 4OMO A; 1J3T A; 2KXC A; 2MCN A; 4CC7 A; 1NEG A; 2EGC A; 1GBR A; 3KFV A; 3EG2 A; 2LZ6 B; 2LQN A; 4J9I A; 5GJV B; 1UFF A; 3C0C A; 2L3P A; 4HXJ A; 1UTI A; 1KIK A; 3VS1 A; 1GFD A; 4RTZ A; 2KXD A; 1ZX6 A; 1ABQ A; 1AWJ A; 1UHF A; 1E6H A; 2AKL A; 1KJW A; 1ZUY A; 2J6F A; 2EW3 A; 1NLO C; 4JZ3 A; 3VS5 A; 4AFU C; 1OOT A; 2JMC A; 2SRC A; 1AOJ A; 2CT3 A; 3PVQ A; 2J6O A; 1UUE A; 1U06 A; 1Z9Q A; 2V1Q A; 3VS3 A; 5I11 A; 1VA7 A; 4LNP A; 1NYG A; 2NUZ A; 2PNI A; 3REA B; 4F16 A; 1RI9 A; 1W1F A; 5IHN A; 1JXM A; 1X2Q A; 2A28 A; 3QWY A; 2P4R A; 4Z88 A; 2M0Y A; 1T3S A; 3NHN A; 3M0U A; 2KBT A; 2DL8 A; 2O2O A; 3ULR B; 3EHQ A; 3UA7 A; 2J06 A; 5IXB A; 1ARK A; 1IO6 A; 1EFN A; 1T0J A; 3I9Q A; 4FSS A; 3NGP A; 5IHK A; 2EYX A; 1H8K A; 4RTW A; 1K76 A; 3M0T A; 4LUE A; 4RTU A; 4RTY A; 4GBQ A; 4AFS C; 2RMO A; 2YUN A; 2C0I A; 2ROL A; 2EYZ A; 4AFZ C; 2LMJ A; 1X43 A; 4GLM A; 1I07 A; 4IIM A; 2O9S A; 3M0P A; 4J9C A; 4Z8A A; 3U23 A; 2W10 A; 2LJ0 A; 1UJY A; 2JS2 A; 2J7I A; 2DM1 A; 1CKA A; 2EGE A; 3H41 A; 2BZ8 A; 1AWO A; 2DE0 X; 5EC7 A; 4HVW A; 3SEM A; 4M4Z A; 1SHF A; 3EG3 A; 2YDL A; 4OMP A; 1GL5 A; 1LCK A; 5IH2 A; 2GQI A; 1QWF A; 4ZNX A; 2GBQ A; 3PE0 A; 2C0O A; 2VVK A; 1K0X A; 2YUQ A; 2EKH A; 2OJ2 A; 1ZBJ A; 1AVZ C; 2ECZ A; 1AZG B; 4D8D A; 1PKS A; 1Y0M A; 2HBW A; 4D8K A; 2L3Q A; 2L3S A; 4A63 B; 2HDA A; 2RN8 A; 4QT7 A; 3THK A; 1QKW A; 2XMF A; 2CSI A; 1WX6 A; 3H0I A; 2KRS A; 1TUC A; 2EVR A; 3A98 A; 2CSQ A; 4AFQ C; 4RTV A; 3VS4 A; 1K4U S; 1A0N B; 1TUD A; 1ZUK A; 4RTT A; 2AZV A; 4IIO A; 2D1X A; 2K6D A; 2DX1 A; 1K1Z A; 1M8M A; 2JM8 A; 2DBM A; 2K79 A; 2I0N A; 4K11 A; 2RQR A; 1PNJ A; 1MV3 A; 1AWW A; 1Z9Z A; 4J9F A; 4J9H A; 1E6G A; 2CUD A; 4CC2 A; 1SRL A; 4F14 A; 4J9G A; 1RLP C; 1AD5 A; 1PHT A; 2A37 A; 1E7O A; 1WDX A; 1W6X A; 4KRT A; 3NPF A; 2YUP A; 5FWB A; 2L0A A; 2L2P A; 2CDT A; 2FPD A; 1GCQ A; 2V1R A; 1PWT A; 3I5R A; 2DRM A; 2AK5 A; 4J9B A; 1I1J A; 2FPE A; 3M0Q A; 4RTX A; 4HVV A; 2JS0 A; 1V1C A; 1W70 A; 2EYY A; 1FMK A; 4F17 A; 1RUW A; 2JXB A; 5IXF A; 1AZE A; 3RBB B; 2O31 A; 3I5S A; 2DL5 A; 1ZSG A; 3I35 A; 1UJ0 A; 4DEX A; 2BZY A; 4OMN A; 2DBK A; 1SRM A; 2D8J A; 1X6G A; 3H0H A; 2JM9 A; 3QWX X; 1K9A A; 1MUZ A; 3O5Z A; 5GJW B; 2GTO A; 1OV3 A; 4WCI A; 2KE9 A; 3PVL A; 2SEM A; 1SEM A; 2F2V A; 1NYF A; 2RF0 A; 5ECA A; 2DVJ A; 1SHG A; 2ED1 A; 2A36 A; 1YN8 A; 2VKN A; 1BB9 A; 2HSP A; 2FRW A; 1G83 A; 1FYN A; 4JJC A; 1JQQ A; 2PZ1 A; 1G2B A; 3LH5 A; 2DLP A; 2AKK A; 2EBP A; 2K9G A; 2K2M A; 2KT1 A; 2KRM A; 2HCK A; 2ABL A; 2EYW A; 1YWO A; 1WFW A; 2DF6 A; 1S1N A; 1X6B A; 1B3Q A; 2W0Z A; 3EHR A; 2G6F X; 2FO0 A; 4Z89 A; 1T0H A; 1WYX A; 2LX7 A; 1PRM C; 2RNA A; 3EG0 A; 2X3X D; 5L23 A; 1JEG A; 2RQV A; 1TG0 A; 1UGV A; 3UA6 A; 1OEB A; 1NEB A; 1KFZ A; 3VS7 A; 3RNJ A; 3VS2 A; 1JU5 C; 2A08 A; 4HCK A; 1UE9 A; 4CC3 A; 2DRK A; 1NG2 A; 2DIL A; 1GCQ C; 2YSQ A; 1M3A A; 1KSW A; 1WLP B; 2LNH B; 5FWC A; 3REB B; 1CSK A; 2BZX A; 1N5Z A; 1MV0 B; 3M0R A; 2RQU A; 1NM7 A; 1NLP C; 2K7A A; 2NWM A; 2KNB B; 3EGU A; 3FJ5 A; 2JW4 A; 2JMA A; 2YUO A; 1WXT A; 4ESR A; 4E6R A; 1JO8 A; 1AWX A; 1BBZ A; 1XOV A; 4OMM A; 2EPD A; 2HEQ A; 2D8H A; 3GBQ A; 2AZS A; 2FEI A; 4LE9 A; 1AEY A; 1M27 C; 1M30 A; 4JJD A; 1UDL A; 2MIO A; 4LN2 A; 2KRO A; 4DEY A; 1WXB A; 2VWF A; 2ESW A; 2CRE A; 3M0S A; 4RUG A; 1QKX A; 2FG0 A; 5FW9 A; 2FPF A; 1GCP A; 2DL7 A; 2JTE A; 4J9E A; 2CUB A; 2KYB A; 2KEA A; 2KYM A; 1BU1 A; 3VRY A; 1YCS B; 2CH4 W; 1ZLM A; 4JPB W; 2E5K A; 4Y92 A; 4J9D A; 2OI3 A; 2KT8 A; 2YT6 A; 1UHC A; 1WA7 A; 1X69 A; 1VYT A; 2C0T A; 3SHW A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5LJ5 h; 2LNV A; 2YLC A; 3MEA A; 3TSZ A; 1LOJ A; 3KBG A; 4AG2 C; 5I21 A; 2LJ3 A; 2O9V A; 5GAO q; 2JJ9 A; 2FRY A; 3SFM A; 2DMO A; 1KQ1 A; 2G3R A; 3ZL7 C; 5LJ5 f; 1WIE A; 4R0K A; 5LJ5 e; 5CQX A; 3JAM E; 1OQK A; 2X51 A; 2J05 A; 2M9U A; 3PMT A; 3RMS A; 2B8A A; 1W2B A; 1ABO A; 3BDL A; 1IHW A; 3CCU T; 3G6E T; 4YTL A; 4ZGE B; 3SDZ A; 2MF2 A; 2M0O A; 3MEW A; 4TVR A; 1PD0 A; 3VS0 A; 4M7D F; 1YNZ A; 1HSQ A; 3VS6 A; 3GNF B; 4A4G A; 3AHU A; 2HD0 A; 1Q81 R; 1RAH B; 1U3O A; 4M78 G; 1D0Y A; 3OYN A; 3VRZ A; 2QGF B; 5LJ5 g; 1PRL C; 2GGR A; 2QDL A; 3MPU B; 3NTK A; 3CCV Q; 1ZUU A; 2R58 A; 1X2K A; 4LUD A; 2DTO A; 2B86 A; 3KUF A; 2PVO B; 1QVG A; 1V76 A; 3Q1J A; 4BDY A; 4BI8 B; 2XID A; 1QWE A; 4C92 D; 2PTK A; 4HCZ A; 1K8A C; 1OX9 A; 1UB4 A; 2EGA A; 1GBQ A; 2FB7 A; 5DLO A; 1I0C A; 4J6W A; 2EQI A; 4C92 C; 2LP5 A; 2AHJ B; 1QCF A; 2DD5 A; 4HVU A; 2DTI A; 1PG5 B; 2DFU A; 2V8K A; 4DBQ A; 3I56 T; 2KXC A; 4CC7 A; 1WJS A; 2ZPG B; 1N9S A; 1NEG A; 5M9O A; 1X75 C; 2D6F A; 2CS7 A; 4Y28 E; 3EG2 A; 2LZ6 B; 3URG A; 1Q82 R; 4DBH A; 2CP6 A; 2PUK B; 2DXB A; 4F04 B; 4LDV A; 2L3P A; 1KIK A; 9ATC B; 1ZX6 A; 3JB9 G; 1AWJ A; 4M7A E; 3CCE Q; 1KJW A; 2EW3 A; 1OOT A; 1MMD A; 2COZ A; 5DLQ E; 2J6O A; 2O4X A; 3CCE A; 1X6O A; 2HKN A; 5GMK h; 3FJP A; 2V1Q A; 1D3B A; 4CRI A; 2P0P A; 1O9S A; 5GAM d; 4F16 A; 2NYS A; 1JXM A; 5FU6 C; 3QWY A; 4M78 E; 3MHX A; 4MZM A; 1NJI C; 3QO3 A; 1D0Z A; 3CCM T; 3ULR B; 2DL8 A; 2O2O A; 5GMK e; 3RDV A; 3CCS Q; 2X4W A; 1S72 T; 1KD1 C; 1EFN A; 4KUL A; 4KBM B; 4PNO A; 1AT1 B; 2MPX C; 1KC8 C; 3VYH B; 4ZN3 A; 2E5Q A; 2EAY A; 4LUE A; 4RTU A; 4GBQ A; 4BI3 A; 3QYH B; 4AFZ C; 2EYQ A; 2O9S A; 3M0P A; 1H3Z A; 3OYH A; 4Z8A A; 3LLR A; 1UJY A; 2Z0W A; 2JZ2 A; 2J7I A; 2DM1 A; 2XKO C; 3OBY A; 3L2V A; 2I2L A; 2K5F A; 3P8H A; 4A4F A; 5CO7 A; 5FU7 B; 4M4Z A; 1SHF A; 2YDL A; 4OMP A; 2DK3 A; 1LCK A; 2QI2 A; 3EH2 A; 3PE0 A; 5FLX E; 1WHH A; 3FEO A; 1K0X A; 1YFN A; 3JB9 I; 5GAN d; 3E1S A; 3V8J A; 3KXT A; 4KH0 B; 2E6N A; 1AZG B; 4C0D B; 2QQB A; 5LJ3 h; 5D7U A; 3HHT B; 5FRM A; 2L3S A; 5DY9 A; 2RN8 A; 3OMG A; 2XMF A; 2CSI A; 4QVZ A; 2RH2 A; 1TUC A; 3CMA A; 4RTV A; 4IIO A; 3OYB A; 2K6D A; 4FYV B; 5LJ3 e; 4C92 F; 4P5N A; 3CCV T; 4E7H A; 1M2V B; 2DO3 A; 2L3R A; 1MMN A; 1ZBX A; 3M57 A; 1KQS P; 1KQS S; 1TH7 A; 3CCQ A; 1PD1 A; 1Y96 A; 2EQK A; 2HAX A; 2KVQ G; 4J9H A; 1E6G A; 1K73 R; 3UPU A; 3BFM A; 4MMK A; 4Z02 A; 3OS1 A; 2KSS A; 1W6X A; 3MCA B; 4D6W A; 5FWB A; 2KY9 A; 1M9S A; 2IG0 A; 1GCQ A; 5LJ3 g; 2V1R A; 4M7A A; 4IUU A; 2DRM A; 3WVD B; 2FPE A; 2JS0 A; 1V1C A; 2EYY A; 1RUW A; 3RBB B; 2BUD A; 3LYI A; 4OB3 B; 3I35 A; 1UJ0 A; 4DEX A; 2WSE E; 4MZT A; 1MMG A; 4OMN A; 3LWI A; 1X6G A; 2DXC A; 3H0H A; 3QWX X; 1K9A A; 1MUZ A; 3M56 A; 4N0A C; 4B9W A; 3PMI A; 3HFN A; 1VQK Q; 1YIJ A; 2L5Q A; 2YXY A; 1VQ4 T; 4GY5 A; 3CCE T; 1GXI E; 1NYF A; 1FWZ A; 2HSP A; 2OAU A; 4JRI A; 3C95 A; 1G2B A; 3LW5 E; 4EMK A; 2EBP A; 3E9F A; 3S3O A; 2A0F B; 4OF1 A; 3EFO B; 2HCK A; 2EYW A; 5GAO l; 3CCS T; 4FYW B; 1BI0 A; 1X6B A; 5GAM g; 2RHU A; 2G6F X; 5HY6 A; 4Z89 A; 4BE1 A; 1KQS A; 1UGR B; 4M7A D; 5GAN h; 1PRM C; 3EG0 A; 4BY6 B; 2X3X D; 5L23 A; 1JEG A; 3CC7 A; 1TG0 A; 3VU3 C; 2E3H A; 4E7L A; 3ZFJ A; 1OEB A; 1K8A R; 2RK1 A; 1IRE B; 4PJO G; 1JU5 C; 2DZ9 A; 2A08 A; 5KYU B; 3CD6 Q; 4M75 B; 1YBY A; 1GCQ C; 5GAN e; 4M7A C; 1VIF A; 1WGS A; 2LNH B; 4M78 D; 4OB0 B; 2XIC A; 1N5Z A; 1MV0 B; 2RQU A; 1NM7 A; 1YJW Q; 2CZ0 B; 2YWW A; 3X20 B; 3H8Z A; 2DJZ A; 3EGU A; 3FJ5 A; 5CIU A; 2JMA A; 2YUO A; 4ESR A; 4E6R A; 2X4X A; 4PK4 A; 1JO8 A; 1AWX A; 1YI2 Q; 2YRC A; 1YJW A; 3ZBD A; 4X34 A; 1AEY A; 1N6A A; 3TEE A; 4IUV A; 4JJD A; 5D6W A; 4C8Q B; 1YI2 A; 4LN2 A; 5GAN g; 3CC4 Q; 2XK0 A; 4L59 A; 2VWF A; 4KGX B; 2ESW A; 5EG2 A; 2EQM A; 1FX7 A; 2FPF A; 5GAO r; 1GCP A; 2DL7 A; 2CP0 A; 4J9E A; 2CUB A; 3PTA A; 2KEA A; 2K5I A; 4EMH A; 3CC4 A; 1YCS B; 2F5K A; 1PC0 A; 2DET A; 3JCM P; 2OI3 A; 2KT8 A; 3PIO A; 2YT6 A; 1NJI R; 1UHC A; 4BUG A; 4J7I A; 1ACM B; 2V26 A; 3OS2 A; 1CKB A; 3TVT A; 4HCC A; 4M75 G; 1GFC A; 1Y07 A; 3CCU A; 3G6E A; 1NPR A; 2LJ1 A; 2LQW A; 1OPL A; 1KG1 A; 5IAY A; 3SB2 A; 2MOX A; 3EH1 A; 2CT4 A; 1BIB A; 2IIM A; 5IHI A; 3OYE A; 3ER0 A; 1XQH A; 2LCS A; 5GAO m; 1IB8 A; 5HCK A; 1BK2 A; 3L2W A; 4ORZ A; 1B34 B; 1SF9 A; 4A4E A; 5KCH A; 1M3C A; 3AT1 B; 1HD3 A; 3PFS A; 1VQK T; 4C8Q G; 5KYY A; 1JXO A; 3CCR Q; 5IT9 E; 4XTZ A; 3CCJ Q; 2HQE A; 4JJB A; 3OW2 P; 4A4H A; 3EFR A; 4OMF B; 4EIK A; 2GNC A; 3CCR A; 1RI0 A; 3UAT A; 1X27 A; 1OU8 A; 1OI1 A; 2RHZ A; 1TTH B; 2P84 A; 1WI7 A; 4JZ4 A; 1PM3 A; 2LT1 A; 1IGQ A; 2KI7 A; 4ZGD B; 2RPN A; 4M7A F; 4B6M A; 3MO8 A; 2K3B A; 1PKT A; 2IPO B; 2A3L A; 4JDS A; 3M58 A; 2JTF A; 2DXT A; 2RQW A; 4C5G A; 4C0G A; 1NE8 A; 3JCM Q; 1VQ7 Q; 4LXC A; 1Q7Y R; 3MP6 A; 4E47 A; 2GFA A; 1VQM Q; 3SWN B; 1C0M A; 2LX9 A; 4JLI A; 1B07 A; 1OU9 A; 3TSW A; 4O6J A; 1YP5 A; 3QZ9 B; 2ENM A; 3MP1 A; 2Y4X A; 2K3X A; 5FRO A; 1VQL Q; 1HJD A; 3OYJ A; 2X3W D; 3CPF A; 2DL3 A; 2O88 A; 3NMZ C; 1Y57 A; 3QG1 A; 4M75 E; 2HQH A; 1VQL A; 2VB6 A; 3CD6 T; 3NTI A; 4VUB A; 2CGH A; 2EGC A; 1PSE A; 1D09 B; 1GBR A; 2QTX A; 2ZPB B; 3CBM A; 1I5L A; 4J9I A; 5GJV B; 1EX4 A; 4BI4 A; 1Y7X A; 5A0G A; 4F7U A; 2L89 A; 1YJW T; 4IUQ A; 2GQV A; 1ABQ A; 1E6H A; 2AKL A; 1YI2 T; 1ZUY A; 1NLO C; 4M77 A; 3VS5 A; 4JJN K; 2SRC A; 1S72 A; 4C8Q E; 2F1L A; 3M55 A; 2PVD B; 4PJM A; 5GAO p; 2MK5 A; 3NFC A; 1Z9Q A; 5I11 A; 3CC4 T; 3CEY A; 1NYG A; 2NUZ A; 2PNI A; 3REA B; 3OW2 A; 2QK0 A; 3FB9 A; 5KE3 A; 2A28 A; 2P4R A; 2M0Y A; 3CXC A; 2DYI A; 4XU2 A; 1T3S A; 4WTO B; 2QQA A; 3UA7 A; 1UGS B; 5LL6 S; 5IXB A; 5AYF A; 3I9Q A; 4FSS A; 5IHK A; 1BI1 A; 2EYX A; 1H8K A; 3PGG A; 4RTW A; 3M0T A; 2ZPI B; 4RTY A; 1D1B A; 2RJF A; 1SSF A; 2C0I A; 2EYZ A; 3MKD A; 1LVK A; 2LMJ A; 4GLM A; 4IUR A; 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