The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
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sequence length |
73
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structure length |
73
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Chain Sequence |
GSSGSSGVCFVKALYDYEGQTDDELSFPEGAIIRILNKENQDDDGFWEGEFNGRIGVFPSVLVEELSSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
|
| source organism |
Homo sapiens
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| publication title |
Solution structure of the second SH3 domain of human KIAA0769 protein
rcsb |
| molecule keywords |
KIAA0769 protein
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| total genus |
5
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| structure length |
73
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| sequence length |
73
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-04-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1VYT A; 1KSW A; 4JJD A; 2QDL A; 1NLP C; 3ZL7 C; 2XMF A; 1B07 A; 2PTK A; 2EYZ A; 1SRL A; 2EYX A; 3REA B; 4Z89 A; 1WXU A; 1QWF A; 4KRT A; 1ZBJ A; 1QKX A; 2CH4 W; 1I07 A; 1X2K A; 2GBQ A; 2A36 A; 1I1J A; 2GGR A; 2M0Y A; 5GJV B; 1YWO A; 3I9Q A; 4JZ4 A; 1UUE A; 3NPF A; 1M3A A; 2BTT A; 5HCK A; 2I0N A; 2KGT A; 1ZX6 A; 1U5S A; 2DX1 A; 4HVU A; 1OOT A; 1UG1 A; 2BZ8 A; 4J9E A; 1G83 A; 2GNC A; 5IXB A; 1H92 A; 4RTZ A; 2KT1 A; 3VRY A; 1AEY A; 1M30 A; 4QT7 A; 2AZV A; 1FMK A; 3EG2 A; 2YUP A; 4E6R A; 1UGV A; 2FG0 A; 3C0C A; 2G6F X; 4J9I A; 2K3B A; 2YUQ A; 2FRW A; 3VS7 A; 2O88 A; 2SRC A; 1E6H A; 2DE0 X; 1AWO A; 3PVL A; 5IH2 A; 3EHQ A; 2DRK A; 1SHG A; 2O9S A; 1UE9 A; 2FEI A; 4ZNX A; 1QKW A; 1TG0 A; 1PRL C; 5ECA A; 4F16 A; 1ZUY A; 2HBW A; 4JPB W; 1OV3 A; 2J6K A; 1UJY A; 1SHF A; 3QWX X; 1BK2 A; 3M0S A; 4OMP A; 3VS5 A; 1PKS A; 1J3T A; 2D1X A; 2DBK A; 5IHI A; 4AG1 C; 2ENM A; 5FWB A; 2O9V A; 4DEX A; 4X1V A; 2ABL A; 3CQT A; 1WFW A; 1M8M A; 2CT4 A; 4OMM A; 5FW9 A; 1VYV A; 1OPL A; 3UA7 A; 2RQV A; 2JM8 A; 1AWW A; 4RTT A; 1WI7 A; 1MUZ A; 2AK5 A; 1JEG A; 2J7I A; 1GBQ A; 2DMO A; 4J9B A; 1NEG A; 1SPK A; 2DNU A; 1GCQ A; 2DF6 A; 1WDX A; 1YCS B; 2EW3 A; 2F2X A; 2OI3 A; 1V1C A; 2J06 A; 4AFQ C; 4IIO A; 2JXB A; 2GTO A; 1K1Z A; 2KNB B; 1GCP A; 3I35 A; 3TSZ A; 1NYG A; 2JS0 A; 2JM9 A; 1HD3 A; 2A37 A; 2KRO A; 3UAT A; 2RQW A; 1K4U S; 2CSQ A; 2FPE A; 1M3B A; 1UHF A; 4M4Z A; 2EPD A; 1W6X A; 2A08 A; 1AVZ C; 1W70 A; 1Y57 A; 2EGE A; 3VS6 A; 1Y0M A; 2L2P A; 4LNP A; 1ZUU A; 3KFV A; 2V1R A; 1GRI A; 4HVW A; 4LN2 A; 1BBZ A; 1XOV A; 4RTX A; 2A28 A; 2KYM A; 2L3P A; 2LNH B; 1X69 A; 2DLP A; 2KR3 A; 2O31 A; 2KRN A; 4RTV A; 1JXO A; 2J6F A; 4OMO A; 3VS0 A; 5GJW B; 4RTU A; 1G2B A; 1K0S A; 2D8H A; 2KE9 A; 2ROT A; 2AKL A; 2K6D A; 2PNI A; 3UF4 A; 5IXF A; 2RNA A; 1X6G A; 2MIO A; 2W10 A; 2LP5 A; 5EC7 A; 1K0X A; 4Z88 A; 4D8D A; 2YUO A; 4OMN A; 1AZG B; 2E5K A; 4LUD A; 2KEA A; 1CKA A; 2NWM A; 3EHR A; 2CT3 A; 3M0T A; 1K9A A; 1M27 C; 4LE9 A; 3H0I A; 1T0H A; 3JV3 A; 5I11 A; 3PE0 A; 2PZ1 A; 2DRM A; 2C0I A; 2IIM A; 4GBQ A; 3ULR B; 1PWT A; 1ZSG A; 2DBM A; 2LMJ A; 2NUZ A; 3U23 A; 4J9C A; 4WCI A; 1NLO C; 2JMC A; 4D8K A; 2C0O A; 1UHC A; 1AWX A; 1VA7 A; 3H41 A; 1WA7 A; 2F2V A; 1BU1 A; 3M0Q A; 4IIM A; 2L3S A; 2KBT A; 4J9G A; 1NM7 A; 1AWJ A; 1KFZ A; 2L0A A; 1OPK A; 2LJ3 A; 1U3O A; 2LCS A; 2EKH A; 3UA6 A; 2VWF A; 2MOX A; 1WYX A; 2CH4 A; 1MV0 B; 1QLY A; 1KIK A; 2EGA A; 4CC7 A; 1N5Z A; 1PNJ A; 4F17 A; 3VS2 A; 2DJQ A; 4J9D A; 1SSH A; 1GCQ C; 1M3C A; 1WLP B; 2O2O A; 1RLP C; 2FO0 A; 2P4R A; 2KRS A; 3M0P A; 2YT6 A; 1JXM A; 4F14 A; 1E7O A; 2EVR A; 2FPD A; 4RTW A; 4CC4 B; 1Z9Z A; 2H8H A; 2EBP A; 2JW4 A; 2K2M A; 1RUW A; 2EGC A; 2OAW A; 2AKK A; 1UEC A; 3RNJ A; 1TUC A; 3EG3 A; 1OEB A; 3QWY A; 3I5R A; 2YUN A; 2CSI A; 2LZ6 B; 1PHT A; 5IHK A; 1KJW A; 3VS4 A; 1VYU A; 4J9F A; 4OMQ A; 3IQL A; 2B86 A; 2RN8 A; 1UJ0 A; 3RBB B; 1X27 A; 2K7A A; 2RQR A; 4GLM A; 4Z8A A; 4AFZ C; 2YSQ A; 2JTE A; 4RUG A; 1AOJ A; 4JJC A; 2ESW A; 3LH5 A; 1RLQ C; 1UDL A; 1HJD A; 3EG0 A; 2L3Q A; 2D8J A; 1ABQ A; 4AG2 C; 1H3H A; 2RF0 A; 4A63 B; 1YWP A; 2DL7 A; 1H8K A; 2KXD A; 1ABO A; 1I0C A; 1JU5 C; 2D0N A; 1SEM A; 2FRY A; 2KRM A; 4CC2 A; 2YDL A; 4AFU C; 1WX6 A; 1IO6 A; 2J05 A; 1K76 A; 1AD5 A; 1MV3 A; 2K9G A; 2X3X D; 4JZ3 A; 3EG1 A; 1T3S A; 2BZX A; 3REB B; 1LCK A; 2DM1 A; 2ED1 A; 3PVQ A; 5IHN A; 1T3L A; 2DL8 A; 4AFS C; 2KT8 A; 1B3Q A; 3O5Z A; 2CUB A; 1GBR A; 3TSW A; 1UTI A; 1YNZ A; 2VVK A; 2FPF A; 2K79 A; 2HEQ A; 1X6B A; 4HXJ A; 1QCF A; 2BZY A; 1AZE A; 3R6N A; 3H0F A; 1FYN A; 3VS3 A; 4OML A; 1E6G A; 2JMA A; 1NEB A; 4FSS A; 1HSQ A; 2RMO A; 4ORZ A; 2VKN A; 2F2W A; 1CSK A; 2DYB A; 2LQN A; 2LQW A; 4CC3 A; 2KXC A; 2MCN A; 1W1F A; 3TVT A; 1WIE A; 2CUD A; 2DL5 A; 3SEM A; 1ZLM A; 1ZUK A; 2LJ0 A; 3GBQ A; 1NYF A; 1UFF A; 2GTJ A; 2RPN A; 2X3W D; 2SEM A; 3SHW A; 4EIK A; 1ARK A; 4DEY A; 2HSP A; 2EYW A; 2RQT A; 2DL3 A; 1YP5 A; 4K11 A; 3EGU A; 1SRM A; 1WXB A; 2HDA A; 2AZS A; 2DIL A; 2V1Q A; 2DA9 A; 2HCK A; 3VRZ A; 2W0Z A; 2ROL A; 4JJB A; 1RI9 A; 3M0U A; 3NGP A; 1PRM C; 2KYB A; 2DL4 A; 4LUE A; 3M0R A; 3VS1 A; 3I5S A; 1NG2 A; 2JS2 A; 4R0K A; 3THK A; 1T0J A; 1X43 A; 2EYY A; 2RQU A; 2EQI A; 2JT4 A; 3NMZ C; 3H0H A; 2LJ1 A; 1BB9 A; 1GFC A; 1JO8 A; 2LX7 A; 2ECZ A; 4RTY A; 2DVJ A; 2J6O A; 1X2Q A; 4Y92 A; 3FJ5 A; 1S1N A; 1GL5 A; 3NHN A; 1U06 A; 5I22 A; 5FWC A; 4J9H A; 1A0N B; 1PKT A; 4HVV A; 1QWE A; 4HCK A; 1WXT A; 3A98 A; 2CDT A; 1EFN A; 1YN8 A; 2CRE A; 2M51 A; 2GQI A; 2ED0 A; 1CKB A; 1JQQ A; 5L23 A; 1GFD A; 1TUD A; 2C0T A; 2OJ2 A; 1Z9Q A; 4ESR A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3G4S T; 3JAM E; 1Y71 A; 4FT2 A; 5LJ3 f; 2LRQ A; 3HTR A; 3RMS A; 1B07 A; 1VQ9 Q; 2EYZ A; 5HK3 A; 5LJ5 d; 2EYX A; 3E19 A; 3QII A; 4KRT A; 5GMK h; 4FW1 A; 2P84 A; 2DXC A; 1YWO A; 2K57 A; 3I9Q A; 3QJ6 A; 2K5F A; 1TUG B; 2BIV A; 3NPF A; 5HKC A; 3I56 A; 4C8Q A; 3OW2 P; 3SWN C; 4HVU A; 2E10 A; 1OOT A; 3VV0 A; 2HSE B; 2HQX A; 2BZ8 A; 2LCL A; 1YI2 Q; 2RK2 A; 4RTZ A; 1TTH B; 3OQ5 A; 1VQ6 T; 1M30 A; 4OB3 B; 3EG2 A; 2QG9 B; 1I81 A; 4PJL A; 1ZQ1 A; 1U1S A; 4M78 E; 1K9M U; 2GCX A; 2LCC A; 3CC7 T; 2K3B A; 2FRW A; 4Y91 A; 3CBP A; 3VS7 A; 2O88 A; 1ZSZ B; 4J8O A; 2SRC A; 1E6H A; 4IUT A; 1M1K U; 1BI0 A; 2E64 A; 3PVL A; 3JB9 J; 3VUZ A; 2LT4 A; 4F04 B; 5GAN h; 3CCL Q; 4ZNX A; 4UC4 A; 5CKD A; 5LJ5 f; 1C0M A; 4F16 A; 3GP8 A; 1ZUY A; 2J6K A; 1KQS A; 3RKY A; 3J7A F; 3VS5 A; 3CCQ T; 1YHQ T; 3J81 E; 1J3T A; 3NTH A; 3GIB A; 3OYH A; 4M77 D; 2DBK A; 4AG1 C; 1YIT T; 4C0D C; 2Y4Y A; 2K4Y A; 4Q5W A; 4PFP A; 1VQM A; 1MND A; 3BY7 A; 4BE0 A; 1OPL A; 1IZ6 A; 2JM8 A; 4RTT A; 2V26 A; 2EIF A; 1M5Q 1; 1MUZ A; 2AK5 A; 3EFO B; 2K2V A; 4RCC A; 2E3I A; 1UGS B; 4J9B A; 2DEU A; 2MAM A; 3BW1 A; 3A1P A; 1ZA2 B; 1WDX A; 3RR6 A; 2JXB A; 3CCM A; 2XIC A; 5CQY A; 2ZPG B; 1MNE A; 4C0G A; 3CBM A; 4PFZ A; 3TSZ A; 3M53 A; 3AT1 B; 1NYG A; 4HCC A; 1ACM B; 2A37 A; 3X25 B; 4IUR A; 4CI0 C; 4M75 F; 2MWO A; 4C8Q E; 4M4Z A; 4JUV A; 1AVZ C; 1B7T A; 2PU9 B; 3FJP A; 1ZUU A; 3KFV A; 2DK3 A; 4M75 B; 2XID A; 1BBZ A; 4RTX A; 2DER A; 3CCR A; 5KE3 A; 1X69 A; 2KRN A; 4RTV A; 4A4K A; 4F7U A; 4OB1 B; 4OMO A; 1FX7 A; 5GJW B; 5L8R E; 2OTL Q; 2M16 A; 2PUK B; 5FU6 C; 1K0S A; 2D8H A; 2KE9 A; 4X34 A; 2K6D A; 2RO0 A; 5FRN A; 3UF4 A; 5IXF A; 3M5A A; 3EG9 A; 2YUO A; 3OBY A; 3E9F A; 2NUP B; 1CKA A; 1V76 A; 4N4H A; 2X35 A; 4NOY A; 2CT3 A; 4LDY A; 1K9A A; 1M27 C; 4R56 A; 1NJI C; 2LTO A; 4X9D A; 1Q81 C; 4M7A D; 5I11 A; 3ULR B; 1ZSG A; 3CCJ Q; 3C94 A; 4HT9 A; 3U23 A; 4WCI A; 3LYI A; 5GAO q; 2RHI A; 4D8K A; 4EMH A; 1AWX A; 2MPX C; 1QVG S; 3H41 A; 1WA7 A; 1BU1 A; 1TS9 A; 1I8F A; 5GAN 4; 4LD6 A; 1V29 B; 4PJJ A; 3CBO A; 4PJO D; 5FLX E; 2LJ3 A; 4F7U F; 1QP2 A; 2MOX A; 2E4H A; 3MET A; 3G71 A; 2QGF B; 5GAO l; 3CC2 A; 2DXB A; 3LGL A; 1N5Z A; 5FU7 C; 1BCO A; 1PNJ A; 4QQG A; 1M4Z A; 3HRS A; 4F17 A; 2R57 A; 3CXC P; 3G6E T; 3VS2 A; 2ZAE A; 4J9D A; 3LH0 A; 4XU0 A; 3FB9 A; 3M0P A; 4BE2 A; 4HKE A; 1K73 U; 4DBH A; 2A3L A; 1Z9Z A; 2H8H A; 4XTY A; 2AT1 B; 2DTH A; 2EGC A; 2OAW A; 4RMO A; 4RG8 A; 3QYH B; 1UEC A; 3RNJ A; 1ZSZ C; 2LNV A; 3JCM d; 2DD5 A; 3G7Z A; 2CSI A; 2LZ6 B; 4J9F A; 4OMQ A; 2DYI A; 4BD3 A; 1G3Y A; 4XTV A; 1M1K C; 3A8O B; 1BI3 A; 1NBE B; 2YSQ A; 5DM7 R; 3OW2 S; 1RAG B; 1N8R R; 4C92 B; 1NPR A; 3OYF A; 5C0M A; 1HJD A; 3FIF A; 4F7U E; 3EG0 A; 1D09 B; 2D8J A; 2QQA A; 4YTL A; 5D7U A; 3CCS T; 5J26 A; 1TH7 A; 2VYT A; 4B6M A; 1M2V A; 3R6O A; 1IGU A; 2OTJ A; 2EFI A; 1RAB B; 4PKC C; 2D0N A; 3E1S A; 2FRY A; 1KD1 U; 1W2B A; 2HQH A; 1MV3 A; 2XG8 D; 1T3S A; 4IUQ A; 4ELZ C; 1T3L A; 3JCM f; 1VQM Q; 2RHY A; 4AFS C; 4XU3 A; 3HRU A; 2HQE A; 4BUG A; 3EGD B; 3CCQ A; 3TSW A; 1WJS A; 2PVG B; 3H9N A; 1YNZ A; 4M77 C; 5KYX B; 2EJF A; 2RHU A; 4J7I A; 4PFO A; 3X24 B; 3L2Z A; 2JJ9 A; 1VQ8 T; 1QCF A; 2P0Q A; 3MEV A; 1AZE A; 1BI1 A; 4KUI A; 1RI0 A; 4BY6 B; 4XU2 A; 3CC4 T; 2QAZ A; 5KE2 A; 4HA8 A; 4ORZ A; 1HSQ A; 3PMI A; 2EQJ A; 4KH0 B; 5IAY A; 1UEB A; 1VQ5 T; 3LWI A; 2QQR A; 4CC3 A; 2KXC A; 3MKD A; 1W1F A; 1AT1 B; 4DBF A; 3SWN A; 3OYJ A; 4R55 A; 5CCA A; 4ZGJ B; 2CGH A; 2LJ0 A; 1NYF A; 3RER A; 4JDS A; 3GLX A; 2E65 A; 3H8Z A; 4DEY A; 2EYW A; 4BI4 A; 1VQ7 T; 2YRC A; 5GAM d; 4JS4 A; 4K11 A; 2MYS A; 4IUP A; 3VYG A; 2DIL A; 1Q86 R; 1N27 A; 2DIG A; 4A4G A; 1QVF S; 1WJR A; 3M0U A; 3NGP A; 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5CKE A; 2RB6 A; 4J5Y A; 3EHQ A; 2DRK A; 4PJN A; 1SHG A; 2O9S A; 2EWN A; 3UT1 A; 2RJD A; 4JJN K; 5ECA A; 4IUV A; 4KGX B; 1OV3 A; 4JLI A; 2DXU A; 3JCM b; 2X4W A; 2AHJ B; 1DJ7 B; 3SFM A; 5IHI A; 4ATO A; 1MMD A; 2ATC B; 3LW5 E; 5FWB A; 1Q95 G; 2O9V A; 4QW2 A; 3WVE B; 5FW9 A; 4N4I A; 4OF1 A; 2DD4 A; 4NL3 A; 3UA7 A; 2RQV A; 3NTI A; 1MMN A; 1AWW A; 1VQL Q; 1JEG A; 1M8V A; 3A8H B; 3HHT B; 3EAE A; 1WHJ A; 5LJ3 g; 2DET A; 4EDU A; 2DF6 A; 2YRD A; 2EW3 A; 2F2X A; 4JLG A; 1V1C A; 2J06 A; 3MEA A; 3RMQ A; 2GTO A; 3DB3 A; 3X26 B; 1K1Z A; 2KNB B; 4M78 D; 2P0P A; 2JM9 A; 3M4Y A; 1ZSZ A; 1VQ8 A; 3OW2 A; 3S3N A; 1M3B A; 4A54 A; 5I21 A; 5GMK m; 4ZGD B; 1W70 A; 1Y0M A; 2E70 A; 1D1B A; 3D7S B; 4C92 G; 1VQ5 A; 4DOW A; 1D0Z A; 2HKQ B; 3LWH A; 5GAN 7; 2XI9 A; 2KYM A; 1YJW Q; 2K5L A; 3OBW A; 4CRI A; 4BI8 B; 5FU7 B; 2AKL A; 2IPO B; 3DLL A; 2FZK B; 2RNA A; 2W10 A; 4E7L A; 5LJ5 g; 4Z88 A; 2K5I A; 3EFO A; 3E2U A; 1VQO Q; 2V8J A; 4OMN A; 5GAO p; 5GAO n; 5LJ3 e; 2NWM A; 3EHR A; 5GMK i; 1KG1 A; 2PVD B; 4D6W A; 4LE9 A; 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