The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
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sequence length |
127
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structure length |
127
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Chain Sequence |
GSSGSSGPIDLITVGSLIELQDSQNPFQYWIVSVIENVGGRLRLRYVGLEDTESYDQWLFYLDYRLRPVGWCQENKYRMDPPSEIYPLKMASEWKCTLEKSLIDAAKFPLPMEVFKDHADLSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the 2nd mbt domain from human KIAA1617 protein
rcsb |
| molecule keywords |
KIAA1617 protein
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| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
19
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| structure length |
127
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| sequence length |
127
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-05-29 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF02820 | MBT | mbt repeat |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3L2V A; 1OZ3 A; 4QW2 A; 5C6S A; 4QVZ A; 4C5E A; 4QQD A; 5KCO A; 3OS1 A; 2O4X B; 3MEW A; 4LD6 A; 5IAY A; 2HQE A; 3PFS A; 5D6X A; 2WAC A; 3MEV A; 5FRO A; 2RHX A; 4IUQ A; 4BE2 A; 4BE0 A; 3NTK A; 3L42 A; 3P8H A; 2R5A A; 2LRQ A; 4A4E A; 4BDZ A; 2LDM A; 3PMI A; 3FEO A; 3Q1J A; 2P0K A; 3MP8 A; 2L8D A; 2RJC A; 4BDY A; 3QII A; 3FLG A; 2E6N A; 2BKD N; 2PQW A; 3EAE A; 5KE2 A; 2RHU A; 4IUU A; 4QQG A; 3UT1 A; 4UC4 A; 2DIG A; 3MET A; 3DB4 A; 4IUR A; 4E7I A; 4E7L A; 3MEA A; 2X35 A; 3MP6 A; 3QBY A; 2L89 A; 4A4H A; 2RI3 A; 3OYB A; 3OYE A; 3E9F A; 2F5K A; 2BIV A; 1N27 A; 2RHY A; 3M9Q A; 2RO0 A; 4BD3 A; 3OYF A; 2LTO A; 4L59 A; 4X34 A; 3L2W A; 2MWO A; 4FU6 A; 1OI1 A; 4II1 A; 3L2R A; 2RJF A; 3BDL A; 3MEU A; 3OY9 A; 2JTF A; 2RHZ A; 3OYK A; 3S3M A; 2X4Y A; 2RJD A; 2EQJ A; 2FHD A; 3FDR A; 3LH0 A; 2EFI A; 2DIQ A; 3LGL A; 3LYI A; 3OMG A; 1RI0 A; 2O4X A; 3CEY A; 3NTH A; 3OS2 A; 2M16 A; 3OS0 A; 2L3R A; 3OMC A; 2LCC A; 2R57 A; 1G5V A; 2RJE A; 2NLU A; 3O8V A; 1WJQ A; 3DB3 A; 4CRI A; 5C0M A; 3KUF A; 3DLM A; 3L2U A; 2JZ2 A; 2YRV A; 3PNW C; 2GFA A; 4PL6 A; 5J39 A; 1MHN A; 3OYM A; 5KH6 A; 1WJS A; 1H3Z A; 2MWP A; 4E7H A; 4FL6 A; 2EQK A; 4RG2 A; 3OYJ A; 3LLR A; 4IUV A; 3OYI A; 4BAC A; 4QQ6 A; 5KE3 A; 4A4F A; 2K3Y A; 2EQM A; 4GY5 A; 2LVM A; 3OB9 A; 4B9W A; 4E7J A; 4C5G A; 3LX7 A; 2QQR A; 3S6W A; 2G3R A; 2DAQ A; 4Z02 A; 2CKK A; 3PMT A; 3OYC A; 5J26 A; 2GFU A; 4IUP A; 2EQU A; 5M9O A; 2E5Q A; 4E7K A; 3P8D A; 4A4G A; 4C5H A; 1OZ2 A; 5FRM A; 4EDU A; 2EKO A; 4PLL A; 2K3X A; 4ZTJ A; 2R58 A; 3OQ5 A; 4N4H A; 3LGF A; 3ASK A; 4N4I A; 2VYT A; 3OYN A; 2D9T A; 3SD4 A; 3L2Q A; 2BUD A; 2RI2 A; 4C5I A; 1WJR A; 5FRN A; 1XNI A; 2GF7 A; 4N4G A; 5IN1 A; 3OYG A; 1OYX A; 3S3N A; 1SSF A; 3F70 A; 5D6W A; 3OYA A; 3E9G A; 3MP1 A; 2M1H A; 3ME9 A; 4NS5 A; 1WGS A; 3FC3 A; 3H8Z A; 2RI5 A; 4OVA A; 4ZTF A; 4IUT A; 4B9X A; 3OYD A; 3C4S A; 1KHC A; 2RHI A; 3NTI A; 4PLI A; 5D6Y A; 2IG0 A; 3H6Z A; 4HCZ A; 3ZEH A; 3MO8 A; 4IKF A; 2HQX A; 2XK0 A; 4Q5W A; 5CIU A; 5KCH A; 3UWN A; 2M0O A; 3OA6 A; 3S3O A; 3OYH A; 4BE1 A; 2QQS A; 2X4W A; 2B8A A; 3QJ6 A; 3QKJ A; 2X4X A; 3GOX A; 2R5M A; 3OYL A; 2XDP A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1B7T A; 1ZBX A; 4M75 B; 5KCO A; 3MHX A; 3JCM P; 1TH7 A; 1Y96 A; 1VQ7 T; 1RAA B; 1W4S A; 1WXU A; 1PRM C; 1VQK T; 4A4E A; 5GMK l; 4CC2 A; 1C6V X; 4BDY A; 2PQW A; 1K9M C; 2KXC A; 2OTJ T; 3JCM d; 4PJO G; 5GAO q; 4TVR A; 2D0N A; 3A8L B; 1YI2 T; 5DLO A; 3M9Q A; 3G4S T; 3NFC A; 3MEU A; 4R56 A; 3LH0 A; 2QAZ A; 4LDW A; 1K73 U; 4PJO F; 3G1J A; 2X51 A; 3O8V A; 1WJQ A; 2E3H A; 1WI7 A; 4BY6 C; 4M75 D; 5HCK A; 1JU5 C; 4M7D B; 1YHQ Q; 4D6W A; 4J9H A; 1VQ5 A; 2YRC A; 4KH1 B; 2L2P A; 1M1K U; 2K7A A; 3OYC A; 2ECZ A; 1KC8 C; 1YJN A; 4OMF B; 3KXT A; 5M9O A; 5AT1 B; 2OJ2 A; 3M5A A; 4ZGD B; 1AHJ B; 4ORZ A; 1QWF A; 3G71 T; 3OQ5 A; 1G2B A; 2VYT A; 4C92 F; 4RTX A; 4Y92 A; 2ABL A; 5CQY A; 2KYM A; 4M78 B; 3M4Y A; 1LPL A; 7AT1 B; 5DM7 R; 1WFW A; 4ATO A; 1UDL A; 4Y91 A; 1GCQ C; 4A4K A; 1UJ0 A; 1QVF A; 1WIE A; 4OP0 A; 4CC7 A; 1MUZ A; 3JRZ A; 1KK7 A; 5GMK e; 2CH4 W; 2GTO A; 1I81 A; 2FZG B; 5GAN 8; 4X1V A; 5CQX A; 3CCE Q; 1ZX6 A; 2QQS A; 1VYV A; 1M5Q 1; 5GAM g; 3A5Z B; 1Y71 A; 5D7U A; 4E7S A; 3JSC A; 5CO7 A; 3EFO B; 2O4X B; 4XU2 A; 2QI2 A; 3QUI A; 3I55 Q; 2H3J A; 1I8F A; 1IGQ A; 3OBY A; 3FB9 A; 2DBK A; 1RAE B; 1VQ7 A; 2CUB A; 4LNP A; 1VYU A; 3CC4 T; 1LOJ A; 4J9I A; 1VQK A; 2RJC A; 1JJ2 S; 2E6N A; 1S72 T; 4RTT A; 5IXF A; 4M78 D; 4JDS A; 2OTJ A; 3V7R A; 1I5L A; 2FYK A; 2DK3 A; 1YI2 A; 3V8K A; 3G4S A; 3PIO A; 1D0X A; 2ZPG B; 2RJD A; 2K9G A; 2YRD A; 3LGL A; 2EFI A; 1IRX A; 1RI0 A; 5HK0 A; 1K9M R; 3QYH B; 1VQP Q; 2C0I A; 3CME T; 2K2M A; 3CCV Q; 3GF5 A; 1WJS A; 2EQK A; 4RG2 A; 5KE3 A; 1VQ8 Q; 1AWJ A; 3CC2 Q; 1PKS A; 1TG0 A; 3S6W A; 2K5L A; 3PIP A; 4IUP A; 1M1F A; 1PM3 A; 2RQR A; 2K2V A; 3M0T A; 3CPW A; 3G71 A; 4HCC A; 5FRN A; 4N4G A; 1OYX A; 2CSI A; 4RCB A; 5DLQ E; 3E9G A; 2M1H A; 2FL7 A; 5GAN 2; 2AZV A; 3CC7 T; 2FPE A; 2YXY A; 3A8G B; 1C1A A; 1KC8 R; 2PVG B; 3I9Q A; 3QJY A; 2E6Z A; 2GNC A; 2ED1 A; 4PLI A; 2IG0 A; 1ZA2 B; 2LQ8 A; 1O9S A; 2Y90 A; 2PTK A; 4JRP A; 2JM9 A; 2DO3 A; 4AFQ C; 1U1S A; 2H8H A; 2QGF B; 1AWX A; 4DEX A; 3GNG A; 3CCJ T; 4HXJ A; 2A36 A; 1NYF A; 1GRI A; 2RNA A; 3PVL A; 3A8M B; 4ESR A; 2FVU A; 4M77 F; 1WQ7 A; 1PHT A; 4M7D C; 1UHF A; 1AD5 A; 2W0Z A; 1SHF A; 4FSX A; 1VQ6 T; 2VAS A; 3X26 B; 1LVK A; 1M8M A; 3PMI A; 4KT0 E; 4M7A C; 3CC4 A; 1IXD A; 4KH0 B; 1H8K A; 1K1Z A; 4XTU A; 3QII A; 1YJ9 T; 5KYY B; 3MET A; 2JJ9 A; 1KQ1 A; 2F1L A; 3EGU A; 4E7I A; 3OS5 A; 3E9F A; 2VC8 A; 4RUG A; 1OOT A; 2KGT A; 3M59 A; 2EVR A; 3TVT A; 3CXC A; 4M75 A; 1K8A C; 3OMG A; 2L3R A; 3CCQ Q; 2R57 A; 1HK9 A; 2PUK B; 2RQW A; 1O75 A; 3DLM A; 1Y0M A; 2PVO B; 2DIL A; 3CME A; 3SWN C; 1QP3 A; 1GFC A; 1AZE A; 2DET A; 2L3Q A; 5GAM f; 2D0Q B; 2EQM A; 4B9W A; 1OX9 A; 6AT1 B; 3CCU T; 1Q95 G; 2DAQ A; 3QDR B; 1PWT A; 3N5B B; 2XIC A; 3G6E T; 2G6F X; 2VXF A; 2EQU A; 3A98 A; 4ZTJ A; 4J9D A; 2AHJ B; 2GGR A; 3TSW A; 3EG9 A; 4PFZ A; 3VKI A; 3MCA B; 4MDX A; 3PT9 A; 4N0A C; 1FMW A; 2KEA A; 3H8Z A; 4KBM B; 3CC7 A; 2J6F A; 1VOM A; 4R0K A; 1TU0 B; 2ZCF B; 3H0H A; 2HBW A; 2RPN A; 5GAM e; 2RK1 A; 3RKW A; 1OX8 A; 3WVD B; 4IIO A; 1WHG A; 3GPL A; 2VXE A; 5GAN 7; 2XDP A; 2EYQ A; 1OZ3 A; 3CCJ A; 3HP9 A; 3JCM Q; 3MEW A; 4M78 A; 2QG9 B; 1A0N B; 3VS3 A; 3NTK A; 4J6Y A; 4RTW A; 3REB B; 2DD5 A; 2QDY B; 4ZNX A; 1TXQ A; 1NLO C; 5GMK i; 4GLK A; 2DX1 A; 1KIK A; 3UDC A; 1YJ9 A; 4JS4 A; 3OYY A; 3INZ A; 1MV0 B; 1ZQ1 A; 4EMH A; 1N8R C; 5GAN g; 1OV3 A; 2MWO A; 4M77 C; 1NPP A; 3L2R A; 1SRL A; 3OY9 A; 1Z9Z A; 3M56 A; 1VQM T; 1YWO A; 2DIQ A; 3EFO A; 2O4X A; 2AT1 B; 2LJ0 A; 1WHK A; 4RMO A; 4CRI A; 1WXB A; 1H64 1; 3PNW C; 3UAT A; 1UGR B; 2MWP A; 2ENM A; 4FT4 A; 1ZBJ A; 1UG1 A; 2K4Y A; 2DJZ A; 3OW2 A; 2RQU A; 3SB2 A; 3CCU A; 1K8A R; 1N5Z A; 5J26 A; 1XQH A; 2GFU A; 4KUI A; 1MGQ A; 1I1J A; 3VS0 A; 2E5Q A; 3CXC P; 5FRM A; 3G6E A; 2QDL A; 1YNZ A; 5LJ3 d; 3VYH B; 2D6F A; 4N4I A; 3JAM E; 4XU3 A; 2V8J A; 1VQO T; 3EGD B; 1SSF A; 2HKN A; 2EQI A; 3ME9 A; 2RK2 A; 4J6W A; 4YTL A; 1X27 A; 2A08 A; 1OUL A; 2LZ6 B; 2LQW A; 1BB9 A; 3I35 A; 5L8R E; 3ZEH A; 1GBQ A; 4DA4 A; 4LUE A; 2HQX A; 3FRN A; 1VIE A; 4XQ3 A; 1QCN A; 4EMK A; 2BZY A; 4J9C A; 3VS1 A; 2QA4 Q; 4QQD A; 3CCS T; 3TU4 K; 1VQ9 Q; 1VQL Q; 3HHT B; 1R77 A; 2QXF A; 2OAU A; 4KGX B; 4IUQ A; 2HNI A; 1AZG B; 2LQN A; 2K3B A; 4OB0 B; 4BY6 B; 1LNX A; 3M54 A; 4E2F B; 1DJ7 B; 3HTR A; 3NHN A; 2ROL A; 4QQG A; 3QZ5 B; 1JXM A; 2DMO A; 4E7L A; 2CDT A; 5I2M A; 2DYI A; 3A8H B; 2KAF A; 3RDV A; 2F5K A; 4HKE A; 4XTZ A; 2RHY A; 3ZBD A; 3JB9 G; 2E65 A; 1I4K 1; 1BI2 A; 2GQI A; 5GJV B; 3BDL A; 4LN2 A; 1YIT T; 1M3C A; 1VQM A; 1SHG A; 1YCS B; 4AG1 C; 3JB9 D; 1FX7 A; 1N8R R; 5GAN 4; 3UA6 A; 2E3I A; 2MOX A; 5GMK j; 4M75 E; 5A0G A; 1AVZ C; 2G3R A; 4P5N A; 3CMA T; 2LNV A; 4XU1 A; 4JRQ A; 3RER A; 1GFD A; 1PRL C; 5KYN A; 2NWM A; 1HD3 A; 3ASK A; 3OYN A; 1UTI A; 3RBB B; 2RI2 A; 5J3B A; 2NUP B; 1XNI A; 1M8V A; 1E7O A; 1KSW A; 2V1Q A; 1VQO A; 3JCM c; 2O01 E; 5GAN f; 1IHV A; 4M4Z A; 2QYZ A; 1SG5 A; 1VQ5 Q; 3JCM g; 1KHC A; 3M55 A; 2YUQ A; 3VRY A; 2DJQ A; 2CZ6 B; 4J7I A; 1TUG B; 1YJN Q; 2EKH A; 1D0Y A; 4RTY A; 1ZHI A; 4XTW A; 2JUF A; 5C6S A; 1JXO A; 2KRN A; 1QKW A; 3CCS A; 5CKB A; 2RHX A; 2DPP B; 1CSK A; 2JMC A; 2YDL A; 2JM8 A; 3TSZ A; 4F17 A; 2HDA A; 5GAN e; 3QSU A; 3UT1 A; 2MIO A; 1QVG P; 4M78 E; 3QZ9 B; 5CKH A; 1M2V B; 2VUB A; 2BIV A; 3VS2 A; 1EIF A; 2V8I A; 2LTO A; 1M9S A; 3L1A A; 1X6G A; 1K0X A; 1RAD B; 1D0Z A; 2YSQ A; 1YIT A; 4E6R A; 2DTO A; 1OU8 A; 3OS2 A; 2KI7 A; 2RN8 A; 1VQ7 Q; 3PVQ A; 3I56 T; 1ABQ A; 2P4T A; 3DB3 A; 1BIA A; 3VU3 C; 1UFF A; 3RR6 A; 2E5K A; 1VQK Q; 5CKE A; 3BW1 A; 5LJ5 d; 3FJP A; 3QO3 A; 2DL7 A; 3OYI A; 2EJG A; 2K3Y A; 2OTJ Q; 2KBT A; 2XMF A; 1M1G A; 1UEB A; 1QCF A; 4EMG A; 4Z02 A; 2QEX T; 1YI2 Q; 3PMT A; 2L3S A; 4M75 G; 1NPR A; 5CVI A; 2QTV A; 3G4S Q; 2AIR B; 1BI3 A; 4E7K A; 2GBQ A; 3CMA A; 4JRK A; 2K3X A; 4C92 B; 2ATC B; 3U23 A; 4AFU C; 1JQQ A; 2LNH B; 1EZZ B; 1RAG B; 3EG1 A; 1WGS A; 3ULR B; 5HK3 A; 4PJJ A; 4PK4 A; 4M75 F; 3E1S A; 3MPU B; 4M7A B; 3CCL T; 1WHJ A; 2KRO A; 3C4S A; 3RKY A; 3JB9 J; 2CT4 A; 1B3Q A; 1MMD A; 1KFZ A; 5DY9 A; 4FW2 A; 3EFR A; 2FO0 A; 3HL8 A; 1KG1 A; 2ZGW A; 3OA6 A; 4WF2 A; 5IT9 E; 2C0T A; 3G71 Q; 3FJ5 A; 5CR2 A; 2VGN A; 2CP0 A; 4M7D G; 2VB6 A; 3JCM V; 3EGD A; 2K5F A; 3J80 E; 4FYW B; 2HMA A; 1H92 A; 4M7A G; 3Q1J A; 3HFN A; 2P0K A; 3A1P A; 3JCM W; 2DZC A; 1PNJ A; 3SWN B; 1SEM A; 2EYZ A; 2MMP A; 2L5Q A; 2DIG A; 4M7D D; 1CKB A; 2XDD A; 1D09 B; 2L89 A; 4A4H A; 2RI3 A; 2EYY A; 4C8Q C; 2O2O A; 3PE0 A; 4PFO A; 3VS6 A; 3DLL A; 3EH2 A; 4BD3 A; 4M7A D; 4M78 G; 4PKC C; 1TSF A; 1ACM B; 1OI1 A; 3SHW A; 2E64 A; 2W10 A; 5GAO m; 3JCM f; 3LYI A; 1VQ4 T; 4E47 A; 3OS0 A; 2E1H A; 1Y57 A; 2JS0 A; 2NLU A; 4AT1 B; 3EFS A; 1Q81 U; 2JS2 A; 2D1X A; 3I56 A; 3ZFJ A; 2JZ2 A; 5J39 A; 3CC4 Q; 1U5S A; 2OTL T; 4M78 F; 1S72 Q; 2DEU A; 1K8A U; 3LWI A; 2DKG A; 2PVD B; 1W1F A; 2CYZ B; 1N6A A; 2COW A; 5GAM j; 4ZGE B; 1KQ2 A; 1Z9Q A; 2QEX A; 3GNF B; 5L23 A; 1UGS B; 2B86 A; 4N4H A; 3LGF A; 3P8B B; 1M90 U; 1G83 A; 1OQK A; 2GQV A; 2NYS A; 1UB4 A; 3QHS A; 1W2B A; 1MND A; 2CUD A; 2DXT A; 5IN1 A; 2KE9 A; 1RLQ C; 4GLM A; 3JCM e; 1NG2 A; 2F69 A; 3CME Q; 3REA B; 2KXD A; 1GCQ A; 4IUT A; 4B9X A; 2XDB A; 2RHI A; 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