The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
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sequence length |
127
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structure length |
127
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Chain Sequence |
GSSGSSGPIDLITVGSLIELQDSQNPFQYWIVSVIENVGGRLRLRYVGLEDTESYDQWLFYLDYRLRPVGWCQENKYRMDPPSEIYPLKMASEWKCTLEKSLIDAAKFPLPMEVFKDHADLSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the 2nd mbt domain from human KIAA1617 protein
rcsb |
| molecule keywords |
KIAA1617 protein
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| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
19
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| structure length |
127
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| sequence length |
127
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-05-29 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF02820 | MBT | mbt repeat |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4E7J A; 1KHC A; 3MEV A; 3OMC A; 3OQ5 A; 4A4H A; 4PLI A; 2PQW A; 3UT1 A; 1OI1 A; 3OS0 A; 4BE0 A; 4IUV A; 2EQK A; 3DB3 A; 3FDR A; 3MEA A; 4ZTJ A; 1XNI A; 4N4H A; 3NTH A; 3ZEH A; 4CRI A; 2JZ2 A; 2RO0 A; 3DB4 A; 2HQX A; 2DAQ A; 2R58 A; 2EQJ A; 2IG0 A; 3M9Q A; 3QBY A; 2DIQ A; 1WJQ A; 2LDM A; 4B9W A; 5C6S A; 5KH6 A; 4IKF A; 5J26 A; 2RHU A; 3OYN A; 3OYC A; 3L2U A; 2RI2 A; 4QQ6 A; 5FRO A; 3EAE A; 3ME9 A; 5C0M A; 3FC3 A; 2QQR A; 3PMT A; 4X34 A; 3QKJ A; 2F5K A; 3OA6 A; 3FLG A; 2RHX A; 3ASK A; 2X4W A; 1OZ3 A; 2CKK A; 2LTO A; 4PL6 A; 2RJE A; 5D6W A; 2JTF A; 4LD6 A; 2K3Y A; 4BDZ A; 2L8D A; 2K3X A; 3FEO A; 3OMG A; 3OS2 A; 3OYB A; 3L2Q A; 4EDU A; 2X4Y A; 3CEY A; 4RG2 A; 4A4E A; 2X4X A; 3OYM A; 2BIV A; 2HQE A; 3OYH A; 3L2R A; 3BDL A; 2RHY A; 3PNW C; 2M1H A; 2EQU A; 2FHD A; 2R5M A; 4NS5 A; 4QVZ A; 1OZ2 A; 3OY9 A; 1G5V A; 1OYX A; 2RJD A; 2YRV A; 2RJC A; 4ZTF A; 4BDY A; 4E7L A; 4C5E A; 3QJ6 A; 3OB9 A; 3OYL A; 3OYF A; 2G3R A; 2RHZ A; 4HCZ A; 1H3Z A; 3H6Z A; 5IN1 A; 2VYT A; 2O4X A; 3H8Z A; 4BE2 A; 3L42 A; 4IUT A; 2WAC A; 3LGL A; 4FL6 A; 5KE3 A; 4QW2 A; 5KCO A; 3QII A; 3PMI A; 3F70 A; 4II1 A; 3OYE A; 3GOX A; 3P8H A; 4C5G A; 3P8D A; 4Q5W A; 3S3M A; 3E9G A; 3S3N A; 2LVM A; 3PFS A; 4IUR A; 2BUD A; 2P0K A; 3LLR A; 4N4G A; 2XK0 A; 1WJS A; 4E7H A; 2R5A A; 2RI5 A; 4PLL A; 2QQS A; 3KUF A; 3OYD A; 2RI3 A; 4UC4 A; 5CIU A; 5J39 A; 2RJF A; 4C5I A; 2M16 A; 3C4S A; 4E7K A; 3S6W A; 4IUP A; 3OYI A; 2LRQ A; 4B9X A; 3OYJ A; 5KE2 A; 5D6Y A; 1WGS A; 3SD4 A; 1SSF A; 3DLM A; 2RHI A; 3MP8 A; 2GFA A; 3MEW A; 3NTK A; 2MWP A; 3LX7 A; 3MO8 A; 3MP6 A; 3L2V A; 2X35 A; 4IUQ A; 5FRM A; 3MEU A; 5M9O A; 2B8A A; 2EKO A; 4QQG A; 2R57 A; 2L89 A; 4C5H A; 1WJR A; 3MP1 A; 4Z02 A; 3O8V A; 2O4X B; 3E9F A; 1RI0 A; 4IUU A; 2GFU A; 1N27 A; 3Q1J A; 2M0O A; 2E5Q A; 2BKD N; 4N4I A; 4FU6 A; 3OYA A; 3LGF A; 3UWN A; 3S3O A; 4L59 A; 3OS1 A; 4A4G A; 2MWO A; 2XDP A; 5FRN A; 2GF7 A; 5IAY A; 4BAC A; 2L3R A; 3MET A; 2E6N A; 4BE1 A; 4E7I A; 4A4F A; 2EQM A; 2LCC A; 4OVA A; 2DIG A; 2NLU A; 4GY5 A; 3LYI A; 3L2W A; 3OYK A; 4BD3 A; 2D9T A; 2EFI A; 1MHN A; 3LH0 A; 4QQD A; 3OYG A; 3NTI A; 5D6X A; 5KCH A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3EHQ A; 4PJO E; 1MMN A; 1C0M A; 2CT3 A; 4ZTJ A; 1M2V B; 5CQY A; 1VQM T; 2H8H A; 4FW2 A; 1NLO C; 4O6J A; 4MZT A; 3QPH A; 5HKC A; 4MDW A; 1K8A R; 2QQR A; 2CP0 A; 4PJO G; 2DF6 A; 1KG1 A; 2K79 A; 2RHX A; 1YIT Q; 4R0K A; 1AZG B; 4AFS C; 2DL5 A; 2GQI A; 1D0X A; 3OY9 A; 3G4S Q; 2PNI A; 1BCM A; 3CC7 Q; 5GAM d; 2V1R A; 1VQK T; 2O31 A; 4KT0 E; 2EPD A; 2EJ9 A; 2EKH A; 3CCV T; 3H8Z A; 4XU0 A; 3ULR B; 1VQ8 Q; 3VYH B; 1QVF P; 2A3L A; 1VQ6 Q; 1R8O B; 5GAM f; 4AMC A; 3P8H A; 4M77 C; 1OX8 A; 1JO8 A; 3E9G A; 1K9M R; 3SFM A; 2KT1 A; 4RUG A; 4C92 D; 2XD0 A; 1K73 C; 1X6B A; 4E7H A; 3N5B B; 3VKI A; 1ZSZ C; 2RNA A; 3I5S A; 4C92 A; 3G6E Q; 5GAN 4; 1KQS A; 2QYZ A; 2GFA A; 1BB9 A; 1YN8 A; 4F7U F; 1UGV A; 1HJD A; 5GAO r; 2JS2 A; 5FU7 B; 1NZ9 A; 1GXI E; 3MCA B; 2O4X B; 8ATC B; 2JS0 A; 1KHI A; 4LDX A; 2YUN A; 1EX4 A; 5I11 A; 2K2V A; 1TSF A; 1M90 R; 3UWN A; 1AT1 B; 2DFU A; 3QZ5 B; 1VQO Q; 1LVK A; 4HT8 A; 2JTM A; 1Q7Y U; 1G3W A; 3BW1 A; 2ZCF B; 4ZGJ B; 3L2Z A; 2MK5 A; 2VGN A; 3UAT A; 3CME T; 2KYM A; 5IXB A; 2P4R A; 1M1K C; 2V26 A; 1YBY A; 5I22 A; 1ARK A; 2NWM A; 5J3B A; 1TUD A; 3UPU A; 4OB3 B; 4B9W A; 1OPL A; 1Q86 R; 4E6R A; 2HD0 A; 4FW1 A; 5C0M A; 1VQK A; 1YJW Q; 2HKN A; 3CPW S; 2JM8 A; 4RTU A; 3OA6 A; 3CCV A; 1OZ3 A; 5D6W A; 2K3Y A; 2HDA A; 3L2Q A; 2X4Y A; 3GPL A; 2X4X A; 2BIV A; 4C0F A; 4C8Q E; 2F2X A; 3TVT A; 4M77 B; 2RJD A; 2HKQ B; 2E5K A; 3CCR Q; 3SWN C; 5EC7 A; 2HBW A; 4C5E A; 5FLX E; 4K11 A; 3H6Z A; 2OAU A; 3JB9 G; 1ZSZ B; 2DYB A; 1N8R U; 2MI6 A; 4C8Q G; 1K8A U; 3E2U A; 1RAB B; 2D6F A; 4WTO B; 1X2Q A; 3CCU Q; 2E3H A; 2DZ9 A; 1WFW A; 4J6W A; 3VS5 A; 4GLM A; 2M16 A; 3FJ5 A; 5HCK A; 1VYV A; 2J6O A; 2QK0 A; 4BI8 B; 3OYJ A; 2DL4 A; 1VQ8 A; 4CI0 C; 2CYZ B; 1PC0 A; 2RF0 A; 1KD1 C; 3DLM A; 4AFU C; 2HNI A; 3HRT A; 3RIR A; 2CUD A; 3L2V A; 1C1A A; 1PG5 B; 4J7I A; 1QVG A; 4JRQ A; 2D8J A; 1WHH A; 2CZ0 B; 4FCY A; 3CME A; 4RTY A; 2YSQ A; 2KXD A; 2YUP A; 5GAN d; 4PJO D; 3V8J A; 1B7T A; 3G6E A; 3WXM B; 3NHN A; 4A4K A; 2NLU A; 1M8V A; 5GAN f; 5HY6 A; 4PJO A; 1K76 A; 5CKB A; 1GFD A; 2QA4 T; 1W2B A; 1XTD A; 2KYB A; 2EQJ A; 1AWX A; 2CT4 A; 5KH6 A; 1M90 U; 2O9S A; 3SWN B; 3JCM e; 3H9N A; 4PK4 A; 1BI2 A; 2EW3 A; 2F2W A; 3RUX A; 5LJ3 j; 3M5A A; 2FZG B; 4EDU A; 5I2S A; 4RTZ A; 1H92 A; 2X3X D; 2HQE A; 2ZPI B; 2EQU A; 1VQP Q; 2Y90 A; 1PM3 A; 1M30 A; 1JRI A; 2FPE A; 4X1V A; 3EFR A; 4KBM B; 1OUL A; 1JJ2 P; 3URG A; 5CKE A; 4HVV A; 2LJ3 A; 2X4J A; 3QSU A; 4AFZ C; 3OS5 A; 4BI4 A; 3VV0 A; 4IUT A; 1Q86 U; 1SRL A; 3MJX A; 1BKB A; 5CVI A; 4CC7 A; 2C0I A; 1WZO A; 2M51 A; 1UHC A; 1JQQ A; 3PFS A; 4IUR A; 4KGZ B; 4D6W A; 4J9H A; 2JMC A; 2FG0 A; 1VQ7 Q; 2QGG A; 2RJF A; 2FZK B; 1PKT A; 1YHQ T; 3VUB A; 2LRQ A; 2CSI A; 3JCM X; 1QKW A; 3CPF A; 5FWC A; 1MNE A; 1X6O A; 1ZX6 A; 4FSX A; 1NYG A; 2DX1 A; 1IO6 A; 3A1P A; 2ESW A; 1S72 Q; 4ME7 A; 2YRC A; 2DIL A; 2DJQ A; 2GFU A; 3GP8 A; 2VC8 A; 2QA4 A; 1R0C B; 4XK8 E; 4BB7 A; 1M3B A; 1W1F A; 4J6Y A; 3G1J A; 3QZ9 B; 2PZ1 A; 4NL3 A; 1WA7 A; 1IGQ A; 3ZEH A; 1CKA A; 5LJ5 j; 3HFO A; 1J3T A; 1OI1 A; 3NPF A; 1G3T A; 3M59 A; 1MMA A; 3DB3 A; 2RMO A; 2KK4 A; 4M77 G; 4PFP A; 5DY9 A; 3JB9 D; 1GBR A; 2LDM A; 1RAF B; 2DZC A; 4YTL A; 5J26 A; 4E7Z A; 2RHU A; 4C8Q D; 2K6D A; 2KSS A; 3V7C A; 2VAS A; 4RKU E; 1H3H A; 3QKJ A; 5FU6 C; 3UA7 A; 2CKK A; 1RAD B; 4BDZ A; 4XTV A; 2ZPG B; 4C8Q A; 2YWW A; 3L2R A; 4M75 C; 3BE3 A; 4ZN3 A; 3CC2 Q; 1G5V A; 4CC3 A; 3JCM Q; 2YUO A; 2CH4 A; 3KXT A; 3QJ6 A; 1BU1 A; 1WXU A; 4OMM A; 2LQ8 A; 4OMN A; 2C0O A; 3H0H A; 3LGL A; 1YHQ A; 4QW2 A; 2FZC B; 2RB6 A; 3G7Z A; 1VQ5 T; 1R0B G; 4Q5W A; 3CMA T; 5I21 A; 3CCE T; 3A5Z B; 2QAZ A; 4XU2 A; 3CD6 Q; 2JXB A; 2VVK A; 4FYY B; 3QHS A; 1AWO A; 3M0U A; 5J39 A; 3JSC A; 2JOY A; 1YNZ A; 1BCO A; 2COZ A; 1YJN Q; 2V8K A; 1WGS A; 2FPF A; 3SD4 A; 1K0X A; 2DYI A; 1HXD A; 3QWX X; 4ZGE B; 3MP6 A; 1NEB A; 2X35 A; 1QMC A; 2O9V A; 3PTA A; 4TVR A; 5GAN e; 5M9O A; 2RQV A; 4C5H A; 2HQH A; 1V29 B; 2LT4 A; 4WF2 A; 3Q1J A; 1NBE B; 3LH5 A; 4L59 A; 2ENM A; 1TOV A; 2A0F B; 4C92 E; 1ZQ1 A; 4L5G A; 5A0L A; 2AHJ B; 2QQ9 A; 3LWI A; 4E7J A; 4DBR A; 5FU6 B; 2CP7 A; 4A4H A; 3M53 A; 1ZA1 B; 3ZFJ A; 1JEG A; 2AK5 A; 2LC4 A; 1KQS P; 3CCL Q; 1M1K R; 4M75 B; 1LOJ A; 2P0Q A; 2WSF E; 1VUB A; 4M7D F; 3O5Z A; 2FB7 A; 4QKU A; 3H41 A; 4QQ6 A; 5FRO A; 4C0G A; 4J9C A; 3ZBD A; 3PMT A; 4JS4 A; 5IHI A; 2FRY A; 3FLG A; 4HCK A; 2K3X A; 2PVG B; 3OS2 A; 2E70 A; 3IQL A; 4JJC A; 4Z8A A; 4VUB A; 3A98 A; 1VQ5 A; 2M1H A; 2R5M A; 1VQ9 T; 1CSK A; 3QG1 A; 3X28 B; 1QCF A; 3CMA A; 2YLB A; 2L5Q A; 2PU9 B; 2CRE A; 3CCE A; 2KRN A; 1QWE A; 2VV5 A; 1KIK A; 2O4X A; 4ZN1 A; 3R6N A; 1EIF A; 5KCO A; 4XQ3 A; 2XU8 A; 2XID A; 4F14 A; 3PT9 A; 3OYY A; 2DRK A; 4JRK A; 3FJP A; 2QQS A; 4M7A F; 3GNG A; 1E7O A; 1BI0 A; 2XMF A; 3CCS T; 1QVP A; 1TS9 A; 2IVW A; 4OP0 A; 1VQ4 T; 1WLP B; 2FL7 A; 1RUW A; 3MO8 A; 1Q95 G; 5L8R E; 3VRY A; 4M77 D; 2R57 A; 2QI2 A; 4M78 F; 3CCM Q; 2I2L A; 3CD6 A; 4XU3 A; 2E5Q A; 3EGD B; 1IXD A; 4LN2 A; 4M77 A; 1K73 U; 1JB0 E; 1FMV A; 2ATC B; 2L3R A; 4BE1 A; 3M56 A; 5HK0 A; 3BY7 A; 2JW4 A; 5LJ3 g; 3L1A A; 4FYV B; 1YIJ Q; 1PRM C; 5KCH A; 1Q82 R; 4BE0 A; 1VYT A; 1IHV A; 3MEA A; 3VS1 A; 3RR6 A; 2WSE E; 4CRI A; 4DOW A; 1Y07 A; 5GAN 5; 1JBM A; 2IG0 A; 1VQ9 A; 1YJ9 Q; 2DIQ A; 4KGV B; 3OYN A; 3RMQ A; 1QVG P; 3THK A; 1F1B B; 2EGA A; 2L3P A; 1IB8 A; 1WHM A; 2LCL A; 4PL6 A; 2GTJ A; 2JTF A; 3FEO A; 2QEX T; 4F7U B; 3BDL A; 4KH1 B; 1QWF A; 2FHD A; 2CDT A; 4C0Z A; 4J8O A; 1B34 B; 4ZTF A; 3CCL A; 3V7S A; 4E7L A; 3EFO B; 2NUT A; 2G3R A; 1M1K U; 3J80 E; 2LQW A; 1M3A A; 5GAN 8; 2M02 A; 3L42 A; 5KYX A; 5KYU B; 3QO3 A; 3X20 B; 3CCS A; 1SRM A; 3GOX A; 1W2B P; 2C0T A; 2CP6 A; 3P8D A; 1VQ4 A; 2LVM A; 4R55 A; 3EG1 A; 4N4G A; 3JCM d; 1I1J A; 2EYW A; 3KUF A; 1EZZ B; 2WSC E; 2JN0 A; 4RTW A; 5GMK h; 2K7A A; 2JUF A; 1D1C A; 3GIB A; 1VYU A; 3JCM f; 1BIB A; 4LDU A; 3LX7 A; 3SWN A; 1GRI A; 5LJ5 g; 4KUI A; 4EMG A; 2EKO A; 4Z02 A; 2KE9 A; 1QCN A; 1PWT A; 4N4I A; 1X75 C; 5GAN 3; 3OS1 A; 4HVW A; 4M75 G; 1YIT T; 2LJ1 A; 3TCJ A; 2LJ0 A; 3TRE A; 3LH0 A; 2KRM A; 3G4S T; 2EVR A; 3CPW A; 1KHC A; 4FM4 B; 4DQ2 A; 1KD1 U; 3CC7 T; 3FDR A; 2QEX A; 2RO0 A; 3M9Q A; 5D7U A; 5LJ5 e; 1HYO A; 1VQ8 T; 2OTL Q; 4ZGD B; 4B6M A; 2E41 A; 1B3Q A; 1VQ6 T; 1SF9 A; 1BK2 A; 3HSB A; 1WNL A; 2RJE A; 1WHL A; 2LX7 A; 2RM4 A; 3OYM A; 2X9H A; 5FW9 A; 2J06 A; 1I07 A; 2RJC A; 3M58 A; 4BDY A; 1ZUU A; 3M4Y A; 3OB9 A; 3OYL A; 5A2Q E; 1K4U S; 3UDC A; 3G6E T; 2Z0W A; 2RHZ A; 3P8B B; 5GAM h; 1BI1 A; 1ZBJ A; 3G71 Q; 3OBW A; 3F70 A; 4Y28 E; 2K5F A; 5GMK i; 1ZUY A; 4MMK A; 2BUD A; 3LLR A; 3EH2 A; 2R5A A; 4UC4 A; 1FWZ A; 4D8D A; 1VQO T; 2DMO A; 4E7K A; 4MZP A; 3OYI A; 3UF4 A; 1KQ1 A; 4DEY A; 5GJW B; 1GCP A; 3CXC S; 3NTK A; 1YIT A; 4DOV A; 1OU9 A; 4ESR A; 1IRX A; 1PD0 A; 5GAO n; 3FRN A; 3G4S A; 1UEC A; 2JTE A; 3CC7 A; 4OF1 A; 1U5S A; 4JJB A; 1WDX A; 3A8H B; 1YJW T; 3M57 A; 2GF7 A; 4BAC A; 2E6N A; 2EWN A; 4FSS A; 2RH2 A; 2DIG A; 3LYI A; 3OYK A; 2D9T A; 1VQ6 A; 2PQW A; 3CCR T; 1D3B B; 3BDU A; 4F7U G; 1K9M U; 2XG8 D; 3DB4 A; 1Z9Z A; 2R58 A; 4RCB A; 2MAM A; 2IIM A; 2E3I A; 3OW2 S; 2DRM A; 4X34 A; 2XDB A; 1Q82 C; 2COY A; 1FYN A; 1LNX A; 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