The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
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sequence length |
64
|
structure length |
64
|
Chain Sequence |
GAMGAKEYCRTLFPYTGTNEDELTFREGEIIHLISKETGEAGWWKGELNGKEGVFPDNFAVQIS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The high resolution NMR structure of the third SH3 domain of CD2AP.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
CD2-associated protein
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Mus musculus
|
| total genus |
14
|
| structure length |
64
|
| sequence length |
64
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-07-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1UEC A; 1E7O A; 2JT4 A; 4LE9 A; 2BZX A; 2PNI A; 2KGT A; 2JMA A; 1AWW A; 1UUE A; 1TUD A; 4AFQ C; 3VS2 A; 1LCK A; 1AZE A; 1NYF A; 2JS0 A; 2K79 A; 2L3Q A; 1AZG B; 5FWC A; 1H92 A; 2YDL A; 2FRY A; 3NMZ C; 3SHW A; 3QWX X; 1RUW A; 1SSH A; 1ZUK A; 1K1Z A; 2KYM A; 5HCK A; 1NLO C; 1I07 A; 1QKW A; 2CSI A; 4Z89 A; 2IIM A; 3PVL A; 1ZSG A; 2KRM A; 2DX1 A; 1MV0 B; 1PNJ A; 2FO0 A; 2VWF A; 4CC7 A; 1AWJ A; 2FPD A; 3VS1 A; 4CC2 A; 4J9I A; 4ESR A; 2JM9 A; 1UTI A; 1TUC A; 2KYB A; 1CSK A; 2DL8 A; 2AK5 A; 4X1V A; 2ESW A; 3M0P A; 1NG2 A; 3NHN A; 1OV3 A; 2JXB A; 4RTZ A; 4F17 A; 2HEQ A; 2LX7 A; 2J7I A; 3M0Q A; 1GFC A; 1GCQ C; 3U23 A; 2A08 A; 2BZY A; 2GTJ A; 5IHN A; 5I22 A; 3LH5 A; 2YUO A; 3VS0 A; 1Z9Q A; 2EVR A; 4JJB A; 2DRM A; 2NUZ A; 4J9F A; 4RUG A; 2MCN A; 4OMP A; 1X43 A; 1HSQ A; 4JZ3 A; 1X6G A; 1JXM A; 1HJD A; 2W10 A; 1ABO A; 1PRM C; 4ORZ A; 1G83 A; 2GTO A; 3VS3 A; 1UFF A; 1ABQ A; 3FJ5 A; 2YUN A; 1RLP C; 1KJW A; 1X2Q A; 2C0O A; 4A63 B; 2CUD A; 2A36 A; 2O88 A; 2DA9 A; 4OMN A; 2PZ1 A; 2O2O A; 2RQV A; 2CH4 W; 3EHR A; 4D8D A; 1WX6 A; 1ZX6 A; 4J9B A; 1X69 A; 1W70 A; 2DL7 A; 2KRO A; 1X6B A; 2DJQ A; 1JXO A; 1BU1 A; 3VS7 A; 1WYX A; 2DF6 A; 4F16 A; 2DBM A; 2KBT A; 2MOX A; 1MV3 A; 1AOJ A; 1PRL C; 1OPK A; 5ECA A; 4Y92 A; 2G6F X; 4J9G A; 1ARK A; 2F2W A; 2YUQ A; 1UJ0 A; 2LQW A; 2CT4 A; 2LZ6 B; 4HVV A; 5FWB A; 4HCK A; 1AEY A; 2P4R A; 2W0Z A; 3ZL7 C; 4F14 A; 1JEG A; 4JPB W; 3EG3 A; 3O5Z A; 3GBQ A; 2DLP A; 2JS2 A; 4LUD A; 1WFW A; 2EYX A; 1I0C A; 2GBQ A; 1YCS B; 2GQI A; 1VYV A; 1WXB A; 3H0H A; 5FW9 A; 1BB9 A; 4AG2 C; 2KT1 A; 4OMM A; 3C0C A; 2LCS A; 2D1X A; 2V1R A; 1Y0M A; 4J9D A; 2DYB A; 2HCK A; 1JO8 A; 4IIM A; 2FEI A; 2KRN A; 3R6N A; 4GLM A; 1M3A A; 2RMO A; 4CC4 B; 3H0F A; 2LP5 A; 3I35 A; 1A0N B; 4R0K A; 2EYZ A; 2DE0 X; 1GCQ A; 1ZLM A; 2LMJ A; 1PKT A; 1NEB A; 2KNB B; 2FPF A; 2D8J A; 2JTE A; 4WCI A; 4AFS C; 2XMF A; 2K9G A; 1GRI A; 2A37 A; 1OOT A; 2DMO A; 2VVK A; 4KRT A; 1EFN A; 1N5Z A; 1TG0 A; 2ECZ A; 2O9S A; 2M51 A; 1ZUY A; 2I0N A; 4HVU A; 1QWE A; 2KR3 A; 2F2V A; 5IXF A; 2RN8 A; 1K0X A; 1W1F A; 4FSS A; 3I9Q A; 1I1J A; 3SEM A; 2KEA A; 2FPE A; 4DEX A; 3TSZ A; 4JJD A; 5L23 A; 1MUZ A; 2GNC A; 1Y57 A; 3VRY A; 3M0T A; 2YSQ A; 3KFV A; 4E6R A; 4LUE A; 2RNA A; 2B86 A; 1U06 A; 4RTT A; 2OJ2 A; 1RLQ C; 1QWF A; 1GBQ A; 1T3S A; 4IIO A; 1U3O A; 2OAW A; 3I5S A; 1FYN A; 2DNU A; 2L3S A; 4HVW A; 3NGP A; 1WXU A; 2YUP A; 1IO6 A; 2L0A A; 2ED0 A; 3CQT A; 2K2M A; 3EG1 A; 2DBK A; 1J3T A; 2L3P A; 2F2X A; 1K76 A; 3EHQ A; 3UAT A; 5I11 A; 1PHT A; 1YWO A; 2KT8 A; 4RTW A; 2EKH A; 2C0I A; 2DIL A; 4ZNX A; 1GFD A; 2K7A A; 2EYY A; 3H41 A; 1WXT A; 2ABL A; 2EGE A; 4Z8A A; 2AKL A; 2DL3 A; 1CKB A; 3VRZ A; 2EBP A; 5IHI A; 1RI9 A; 1ZBJ A; 1H8K A; 1QKX A; 2EQI A; 2YT6 A; 3VS6 A; 2DRK A; 2DL4 A; 2LJ1 A; 3NPF A; 1E6G A; 1PKS A; 1AD5 A; 2L2P A; 1AWO A; 1PWT A; 2X3X D; 3UA7 A; 4EIK A; 1K0S A; 3RNJ A; 1YWP A; 1WIE A; 3VS4 A; 2LJ0 A; 2AZV A; 1WA7 A; 2C0T A; 4K11 A; 2BZ8 A; 2EGC A; 2RQW A; 2HSP A; 4OML A; 2K3B A; 1GL5 A; 2BTT A; 2J6O A; 2DL5 A; 2KXD A; 4AFZ C; 2CT3 A; 3QWY A; 4JZ4 A; 2KXC A; 1CKA A; 1FMK A; 2CUB A; 2FG0 A; 2O31 A; 1AWX A; 1WDX A; 2CRE A; 4CC3 A; 1VA7 A; 2J6F A; 2GGR A; 1NEG A; 4AG1 C; 4QT7 A; 3A98 A; 3TSW A; 2NWM A; 1BBZ A; 1M27 C; 2HDA A; 1V1C A; 2JMC A; 3PE0 A; 1QCF A; 1BK2 A; 3EGU A; 3UF4 A; 2LNH B; 2EGA A; 1JU5 C; 3ULR B; 1SRM A; 4AFU C; 4RTY A; 2JW4 A; 2CSQ A; 2D0N A; 5IHK A; 1YNZ A; 2CDT A; 1YP5 A; 2KE9 A; 2LQN A; 1UHF A; 3THK A; 3TVT A; 4RTX A; 1NM7 A; 1G2B A; 1E6H A; 2HBW A; 5IXB A; 4RTV A; 4Z88 A; 2K6D A; 1GCP A; 1KSW A; 1UHC A; 2ROL A; 2RQR A; 3UA6 A; 2ED1 A; 2MIO A; 2PTK A; 3JV3 A; 1JQQ A; 1M3C A; 1UGV A; 1WI7 A; 2DVJ A; 1YN8 A; 2J6K A; 1T0H A; 2RQT A; 2M0Y A; 2QDL A; 1NYG A; 4D8K A; 1SRL A; 3REA B; 1UG1 A; 2EW3 A; 2JM8 A; 3M0U A; 3PVQ A; 2V1Q A; 4M4Z A; 4DEY A; 2X3W D; 4OMO A; 3VS5 A; 1QLY A; 1AVZ C; 1UE9 A; 1B3Q A; 1SHG A; 2FRW A; 2OI3 A; 3REB B; 1Z9Z A; 1OPL A; 2J06 A; 4JJC A; 1KIK A; 1VYT A; 1X27 A; 2SEM A; 3I5R A; 1NLP C; 2AKK A; 1S1N A; 2D8H A; 4J9H A; 2VKN A; 2H8H A; 2EPD A; 1UDL A; 5EC7 A; 1HD3 A; 2LJ3 A; 2EYW A; 2SRC A; 1OEB A; 3IQL A; 1ZUU A; 3H0I A; 1SHF A; 1K4U S; 2RPN A; 1H3H A; 2A28 A; 1K9A A; 1UJY A; 2KRS A; 1U5S A; 3EG0 A; 4HXJ A; 4OMQ A; 3RBB B; 4J9C A; 2RF0 A; 4GBQ A; 1WLP B; 1T0J A; 2ROT A; 1GBR A; 2RQU A; 1XOV A; 2AZS A; 5GJV B; 3M0R A; 2E5K A; 1KFZ A; 2CH4 A; 2O9V A; 4J9E A; 1M8M A; 3M0S A; 1VYU A; 4RTU A; 1T3L A; 3EG2 A; 1SPK A; 5GJW B; 1M30 A; 1B07 A; 4LN2 A; 4LNP A; 2ENM A; 5IH2 A; 1X2K A; 1SEM A; 2DM1 A; 1W6X A; 2J05 A; 1M3B A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1E7O A; 1NPP A; 2JMA A; 5A0L A; 1ZBX A; 4IUP A; 1YHQ Q; 3CCR A; 3X20 B; 3JCM V; 2JNG A; 3LH0 A; 2NUT B; 1NYF A; 2K79 A; 2RJF A; 3OYL A; 5KYY B; 3QJY A; 3QPH A; 1OUL A; 3OYG A; 2C06 A; 2OTL A; 2OTJ A; 3LX7 A; 3OYM A; 1WHG A; 1WHL A; 3BE3 A; 1NLO C; 1I07 A; 3GP8 A; 2IIM A; 3H6Z A; 2XI9 A; 3PVL A; 2VAS A; 3OSV A; 2FO0 A; 2VWF A; 2DTO A; 4CC7 A; 5C6S A; 4J6X A; 2A0F B; 3CCR Q; 2JM9 A; 1WHM A; 4QQ6 A; 2KYB A; 3SWN B; 3ME9 A; 2AK5 A; 2ESW A; 2V26 A; 2OTL Q; 2OTJ Q; 2E64 A; 2JXB A; 2RI2 A; 4F17 A; 2VXF A; 4E7I A; 2J7I A; 4HCZ A; 1D3B A; 1M4Z A; 1GCQ C; 3JCM d; 2YUO A; 4C5H A; 3VS0 A; 4JJB A; 4UC4 A; 4PKC C; 2NUZ A; 3SD4 A; 5CR2 A; 3DB4 A; 4RUG A; 1XTD A; 5A0G A; 4JZ3 A; 3EGD A; 4N0A C; 1G83 A; 1WQW A; 1WZO A; 2GTO A; 3VS3 A; 3HRS A; 1ABQ A; 4M7D E; 1WGS A; 5GAO n; 2QXF A; 2NUP B; 5CCA A; 2QQ9 A; 2OAU A; 1NJI C; 1Q7Y R; 2O88 A; 2DD4 A; 4OMN A; 2ZGW A; 2CH4 W; 3FC3 A; 5KE3 A; 4J9B A; 1X69 A; 4LDX A; 5GMK j; 1W70 A; 1VQ7 A; 2DL7 A; 2EFI A; 1X6B A; 3HHT B; 1JXO A; 1BU1 A; 2DF6 A; 2P0P A; 2HD0 A; 3FJP A; 1MV3 A; 3NFC A; 4FIB A; 1QVF S; 1ARK A; 4DOW A; 3OW2 S; 2F5K A; 3OQ5 A; 2CT4 A; 3GNG A; 2IG0 A; 3CPW A; 5FWB A; 4M7A B; 3A8H B; 1AEY A; 1N27 A; 2DJZ A; 2EWN A; 2HBP A; 2P4R A; 1YIT T; 2W0Z A; 4KGV B; 4F14 A; 1VQ7 Q; 1YJW A; 3PIP A; 4J83 A; 3GBQ A; 4LUD A; 1BKB A; 2EYX A; 2WAC A; 1WXB A; 5HK0 A; 2EQM A; 5KYW A; 5GAM f; 4OMM A; 3HPW A; 3C0C A; 2D1X A; 3L2U A; 2V1R A; 1I5O B; 2DYB A; 3L2V A; 4IUR A; 4KUD K; 4PJO G; 1YJW Q; 4CC4 B; 5LJ5 d; 2CP2 A; 3RR6 A; 4XQ3 A; 5FRN A; 1JRI A; 3CC2 Q; 2EYZ A; 3EFR A; 1ZLM A; 2LMJ A; 3CCQ A; 1D0X A; 1G3T A; 4C8Q B; 3CCU A; 2D8J A; 4BY6 C; 2H3E B; 3PIO A; 4M78 E; 4JRQ A; 1N8R R; 1IZ6 A; 3CME A; 1N5Z A; 2FL7 A; 4Y91 A; 4QKU A; 2VGN A; 2PVD B; 1ZUY A; 2I0N A; 4C92 C; 3CXC S; 2HL5 C; 1Y07 A; 4N4I A; 2KR3 A; 1IHV A; 4MZM A; 5HKC A; 4BUG A; 1X6O A; 1KHI A; 1UGR B; 2LDM A; 2KEA A; 2FPE A; 2JZ2 A; 4VUB A; 1RAC B; 4RKU E; 4DEX A; 3CCQ Q; 3AHU A; 4HA8 A; 5LJ5 f; 2GF7 A; 3CCU Q; 3PMI A; 2B86 A; 4HCC A; 4XAX B; 1OQK A; 1YJ9 A; 2HSE B; 1GBQ A; 3X26 B; 4JLG A; 4XTV A; 4IIO A; 3VU3 C; 5IAY A; 1KD1 R; 3I5S A; 5CVI A; 4AT1 B; 3C94 A; 2L3S A; 1P92 A; 1IO6 A; 5GAN e; 2DIQ A; 3CQT A; 2K2M A; 5FU6 C; 3EG1 A; 2X4J A; 1KC8 R; 1J3T A; 5CKE A; 3UAT A; 4E7S A; 1VQ8 A; 5D6Y A; 1YWO A; 3F70 A; 1YJ9 Q; 5GAM j; 1M2V A; 2QAZ A; 1UGS B; 2EYY A; 3H41 A; 2ABL A; 4Z8A A; 2AKL A; 1LPL A; 4OB3 B; 2HL3 A; 3RKY A; 3E2U A; 2CP3 A; 1RAB B; 3E9G A; 3MPU B; 1OX9 A; 2Y4X A; 4LDW A; 1VQM T; 3V7R A; 1HK9 A; 1QVG P; 1VQ8 Q; 2DZ9 A; 4PJN A; 3VJP A; 3NPF A; 1E6G A; 1MMD A; 2O4X A; 3HSB A; 1PKS A; 1AD5 A; 1D3B B; 1Y96 B; 1AWO A; 3EFO A; 4M7A F; 1FMW A; 1PWT A; 3UA7 A; 1K0S A; 3RNJ A; 1YWP A; 2DIG A; 1VQ4 A; 2COW A; 1WIE A; 4M7A D; 1M1K R; 4E47 A; 4PK4 A; 1WJR A; 2K2V A; 2RO0 A; 2EQK A; 2EIF A; 3OY9 A; 2RQW A; 3FIF A; 4OML A; 3CMA A; 2K3B A; 1GL5 A; 3JRZ A; 1QP3 A; 2CZ0 B; 5CAI A; 4M7D G; 3CCR T; 4AFZ C; 2CT3 A; 4HT9 A; 4J7I A; 4BDZ A; 2XKO C; 2O31 A; 3WXM B; 1AWX A; 1WHJ A; 2DXC A; 1PD0 A; 2GCX A; 2Y4Y A; 1VOM A; 5GAO l; 2HZY A; 5FRO A; 1VQ4 Q; 3TSW A; 2NWM A; 2XK0 A; 4C0F A; 2HDA A; 2PQW A; 1OI1 A; 3EGU A; 3UF4 A; 2MYS A; 3CMA Q; 3I55 A; 1YI2 A; 3MP1 A; 3MKD A; 4FW1 A; 3JCM c; 3ULR B; 1VQN A; 4C8Q F; 2A7Y A; 2IPO B; 4EDU A; 2E12 A; 2EKO A; 2D0N A; 2LCC A; 4C8Q D; 3QJ6 A; 2CDT A; 1PD1 A; 2KE9 A; 2LQN A; 3OYC A; 4QQG A; 4M77 E; 2MWO A; 2HBW A; 5IXB A; 4L5G A; 5AYF A; 2RQR A; 4EMH A; 4FW2 A; 1OX8 A; 4EPC A; 4OGE A; 2J6K A; 2E70 A; 1T0H A; 3I55 Q; 1YI2 Q; 1R0B G; 3OYK A; 1VQN Q; 1SRL A; 2HKN A; 2NUT A; 1UG1 A; 2JM8 A; 3JCM X; 1R0C B; 4OP0 A; 4RCB A; 5KYY A; 4BDY A; 2Z0W A; 4BI8 B; 4JDS A; 1Q81 C; 4ME7 A; 5KYW B; 5KYX B; 4JLI A; 4F7U B; 3DLM A; 4IUU A; 1D0Z A; 2FZG B; 1OZ2 A; 4OMF B; 3L1A A; 3CEY A; 3JCM e; 3TU4 K; 4BY6 B; 3QZ5 B; 3REB B; 2CYZ B; 2J06 A; 1K8A C; 2EYQ A; 3C12 A; 5DY9 A; 1KIK A; 4IUT A; 2CP7 A; 1VYT A; 4C92 B; 3M4G A; 1X27 A; 3INZ A; 4FT4 A; 3I5R A; 1PCX A; 3QYH B; 1K9M R; 2CZ7 B; 3SWN A; 4M75 E; 1HD3 A; 2IVW A; 2R5A A; 2MMP A; 1D1C A; 1ZUU A; 2PVG B; 2A28 A; 1VQK A; 4FYX B; 3JCM J; 1UJY A; 1U5S A; 3EG0 A; 1M1F A; 5EG2 A; 4J9C A; 1RAD B; 4J6Y A; 2ROT A; 3PNW C; 5IT9 E; 3M0R A; 3CBO A; 3SWN C; 1KFZ A; 2O9V A; 3A8O B; 2X9H A; 5GAM g; 5CQX A; 3EG2 A; 4ZN1 A; 2K3Y A; 4LNP A; 5IH2 A; 4IKF A; 1UEC A; 1VQK Q; 2PNI A; 2KGT A; 1BIA A; 2XDP A; 2XDD A; 1AWW A; 2NUP A; 4C5I A; 1TUD A; 3LWH A; 4P5N A; 5J26 A; 4J8O A; 2LRQ A; 2L3Q A; 3OYA A; 3CCS A; 3VKI A; 3NMZ C; 3SHW A; 3QWX X; 4II1 A; 4DBH A; 3J7A F; 3QG1 A; 3OW2 P; 1ZUK A; 2H3J A; 3M9Q A; 5HCK A; 1B34 B; 3HKS A; 2ZPF B; 3CCL A; 2PU9 B; 1U1S A; 5KCH A; 1PNJ A; 4J6W A; 3MCA B; 4FL6 A; 4LD9 K; 2FPD A; 3VS1 A; 3JAM E; 1YJN A; 2CS7 A; 1LJO A; 3CME T; 3AT1 B; 1K73 R; 4KH1 B; 1UTI A; 4M7A A; 5LJ5 e; 4NL3 A; 4X1V A; 3M0P A; 2K3X A; 3CCS Q; 2F1L A; 1OV3 A; 1KQ2 A; 3N5B B; 2HEQ A; 5GAO m; 1GFC A; 2YLC A; 3CCL Q; 2A08 A; 1BCO A; 2BZY A; 2DXU A; 5IHN A; 1Z9Q A; 5GAN 7; 3S6W A; 4C0D C; 5GMK h; 1YJN Q; 4XTX A; 1YJ9 T; 3C4S A; 4LXC A; 3RER A; 2BIV A; 4OMP A; 1X43 A; 1HSQ A; 1X6G A; 1HJD A; 3MEA A; 3HRU A; 2W10 A; 1ABO A; 3QDR B; 2LT4 A; 3MEW A; 4X9C A; 1VQ5 A; 1PSF A; 1UFF A; 1XJW B; 2KAF A; 4BI4 A; 5M9O A; 3M53 A; 9ATC B; 2YUN A; 1RLP C; 1KJW A; 2QTV A; 3CXC P; 4C8Q A; 4A63 B; 4PNO A; 2CUD A; 5GAN f; 2EJ9 A; 1VQ8 T; 4M78 B; 3OSS C; 3LGF A; 4FYY B; 1VUB A; 3JB9 G; 4C92 F; 1UB4 A; 3QSU A; 4F16 A; 2DBM A; 1B7T A; 1YBY A; 4C92 D; 2WSE E; 2MOX A; 1VQ5 Q; 1AOJ A; 1PRL C; 1LVK A; 5ECA A; 2PUO B; 4M77 G; 1VQ6 T; 2G6F X; 2LQK A; 3P8D A; 2LQW A; 2DVE A; 4HVV A; 3TCJ A; 1IXD A; 4ZN3 A; 2L89 A; 5GAO q; 3ZL7 C; 4WTO B; 1JEG A; 1FMV A; 2RJC A; 4DBR A; 2JS2 A; 1WFW A; 2D0Q B; 1QCO A; 1NJI U; 2ZPG B; 3CMA T; 1Q86 R; 3HTR A; 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