The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
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sequence length |
64
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structure length |
64
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Chain Sequence |
GAMGAKEYCRTLFPYTGTNEDELTFREGEIIHLISKETGEAGWWKGELNGKEGVFPDNFAVQIS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Mus musculus
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| publication title |
The high resolution NMR structure of the third SH3 domain of CD2AP.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
CD2-associated protein
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| total genus |
14
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| structure length |
64
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| sequence length |
64
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-07-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1LCK A; 2FRY A; 4M4Z A; 3VS2 A; 4CC7 A; 2KYB A; 2NWM A; 1Z9Z A; 2H8H A; 1NG2 A; 2JMC A; 4J9I A; 4D8D A; 2KGT A; 3VS1 A; 2CH4 W; 2X3W D; 3IQL A; 4J9D A; 1X6G A; 3RBB B; 2AKK A; 2LX7 A; 1VYU A; 4J9E A; 1BBZ A; 4OMP A; 2KEA A; 1EFN A; 2ROT A; 3JV3 A; 1OPK A; 2D1X A; 1JXO A; 2J06 A; 5HCK A; 4E6R A; 2J6O A; 5FWC A; 2XMF A; 2BZ8 A; 2FPF A; 3I5S A; 4J9G A; 2YUO A; 3H0F A; 4RTZ A; 2KT1 A; 2X3X D; 1PNJ A; 2KXC A; 3VRY A; 1OEB A; 1WYX A; 1Z9Q A; 4ESR A; 3EGU A; 3I9Q A; 1B3Q A; 2JM8 A; 2DRM A; 3UAT A; 4J9B A; 1M3A A; 1WI7 A; 1AWX A; 5I11 A; 3EHR A; 1AZG B; 2M0Y A; 4LE9 A; 3M0R A; 3EG3 A; 2DA9 A; 4AFZ C; 4IIM A; 4X1V A; 2RN8 A; 1UHF A; 5IHK A; 1X2Q A; 4D8K A; 1TG0 A; 4AG2 C; 1H92 A; 2KRN A; 1UGV A; 2VVK A; 1QWF A; 2DLP A; 1WLP B; 4JJD A; 1GCQ A; 1K0S A; 2KE9 A; 2RNA A; 1RI9 A; 1RUW A; 2DL4 A; 1SPK A; 1GCP A; 1YWP A; 4KRT A; 2VKN A; 4RTW A; 1NEB A; 2GBQ A; 1AWJ A; 1X2K A; 2I0N A; 2RQV A; 3VS5 A; 1PRM C; 1UFF A; 4RTY A; 4ORZ A; 2AK5 A; 3VRZ A; 1KJW A; 1CKA A; 2J6F A; 2F2W A; 1GFD A; 2PZ1 A; 2YUN A; 1NYG A; 3NMZ C; 5L23 A; 2SEM A; 1SEM A; 1BU1 A; 2JT4 A; 3VS6 A; 1ZUU A; 1U3O A; 1T3S A; 2EGC A; 2FEI A; 3A98 A; 1PRL C; 1SHG A; 4J9H A; 4HXJ A; 1AOJ A; 3ZL7 C; 2RMO A; 1Y57 A; 1ZUK A; 3EHQ A; 2FO0 A; 1GBR A; 2KRS A; 4J9C A; 4LNP A; 3M0S A; 3M0T A; 2LQN A; 1QKW A; 1T0H A; 3NPF A; 2DNU A; 3KFV A; 2PNI A; 2NUZ A; 2DE0 X; 1ZX6 A; 2K6D A; 2CSI A; 1VA7 A; 4AFS C; 1G83 A; 2J7I A; 1VYT A; 3R6N A; 2EBP A; 4HCK A; 2LCS A; 4Y92 A; 1UJY A; 1W6X A; 2LMJ A; 2LQW A; 2BZY A; 4HVW A; 2CH4 A; 2K3B A; 2M51 A; 1M3B A; 2EPD A; 1HD3 A; 2ED0 A; 2CDT A; 3VS7 A; 3EG0 A; 1KFZ A; 2KRO A; 4LUD A; 1YNZ A; 2LP5 A; 1JO8 A; 4AFQ C; 1WXB A; 1WXU A; 1E6G A; 1GL5 A; 2DM1 A; 1ARK A; 3EG2 A; 5FW9 A; 3UA6 A; 1AVZ C; 1FMK A; 4AG1 C; 4WCI A; 2KNB B; 1E6H A; 2EYZ A; 2EW3 A; 5I22 A; 1RLQ C; 3NHN A; 2FPD A; 2GGR A; 2O9S A; 2K2M A; 1H3H A; 2L2P A; 4OML A; 4RTU A; 2JXB A; 1AD5 A; 2DF6 A; 3I35 A; 2GTO A; 2EYW A; 1WIE A; 1T3L A; 4LN2 A; 2JMA A; 2O2O A; 2KXD A; 3PE0 A; 2YUQ A; 1K9A A; 1YCS B; 1YWO A; 1W1F A; 3QWY A; 2C0O A; 1NLO C; 4J9F A; 3VS0 A; 2J6K A; 1I07 A; 1PKT A; 2P4R A; 2A28 A; 2ED1 A; 1H8K A; 1QKX A; 2D0N A; 2HBW A; 3CQT A; 4JJB A; 2SRC A; 1B07 A; 2LJ1 A; 3TVT A; 3C0C A; 1JU5 C; 2EYY A; 1GBQ A; 1MUZ A; 1IO6 A; 2L0A A; 4CC3 A; 5IXF A; 2EYX A; 1HSQ A; 2JM9 A; 1K4U S; 2JW4 A; 1HJD A; 1AEY A; 1WX6 A; 3REB B; 1M3C A; 2ECZ A; 4Z88 A; 1SRL A; 2V1R A; 4DEX A; 3RNJ A; 4RTT A; 1ABO A; 1UUE A; 2JTE A; 1G2B A; 4JJC A; 2F2V A; 1NLP C; 2EVR A; 2FG0 A; 2D8J A; 2E5K A; 1J3T A; 1AWO A; 1M30 A; 1ZLM A; 4RTV A; 2HCK A; 2HSP A; 1ZUY A; 2LJ3 A; 2RQU A; 2KYM A; 2DL5 A; 2RPN A; 1AZE A; 1I0C A; 1XOV A; 1YP5 A; 4FSS A; 4OMO A; 1JQQ A; 1U5S A; 5IHN A; 4DEY A; 4GLM A; 4A63 B; 1KIK A; 3UF4 A; 1SSH A; 1GFC A; 4EIK A; 4F17 A; 2CSQ A; 4AFU C; 3THK A; 1K76 A; 2YSQ A; 5FWB A; 1GCQ C; 2L3S A; 2C0I A; 1OOT A; 1WA7 A; 1ABQ A; 1BK2 A; 2DYB A; 4OMQ A; 1WXT A; 3FJ5 A; 2CRE A; 1KSW A; 2KRM A; 2DRK A; 1UG1 A; 2O31 A; 1TUD A; 2OJ2 A; 2EQI A; 3I5R A; 1QLY A; 1QCF A; 2K7A A; 4QT7 A; 2EGA A; 2KBT A; 2AZS A; 4OMN A; 2J05 A; 2OAW A; 1JEG A; 2DBM A; 2GTJ A; 4Z8A A; 1X27 A; 2A08 A; 1M8M A; 2ESW A; 2D8H A; 1JXM A; 1W70 A; 4HVU A; 2A36 A; 2YT6 A; 4R0K A; 2MOX A; 3M0Q A; 3SEM A; 1WFW A; 3GBQ A; 1MV3 A; 1S1N A; 1K0X A; 1T0J A; 5IH2 A; 1I1J A; 1PKS A; 2K79 A; 2O88 A; 1M27 C; 1NEG A; 4Z89 A; 2BTT A; 2BZX A; 4HVV A; 2RQW A; 2FRW A; 2W0Z A; 4LUE A; 4ZNX A; 3UA7 A; 3VS3 A; 2YDL A; 2EKH A; 4CC2 A; 1PHT A; 2LZ6 B; 1UJ0 A; 2KR3 A; 1AWW A; 1ZBJ A; 2A37 A; 1NYF A; 1X6B A; 3PVL A; 1FYN A; 2DIL A; 1VYV A; 3REA B; 2EGE A; 2CUB A; 2DL8 A; 2K9G A; 2RQR A; 2DL7 A; 3EG1 A; 3NGP A; 4JZ4 A; 4RTX A; 3M0U A; 4K11 A; 2DBK A; 1CSK A; 2DVJ A; 1BB9 A; 2ABL A; 1UTI A; 4F16 A; 2CUD A; 2FPE A; 1Y0M A; 2JS2 A; 4RUG A; 2KT8 A; 1SRM A; 2AKL A; 4JZ3 A; 2DX1 A; 2ENM A; 1A0N B; 3M0P A; 2VWF A; 2CT3 A; 2HDA A; 1MV0 B; 1UHC A; 2LJ0 A; 5GJW B; 2GNC A; 1PWT A; 1E7O A; 1N5Z A; 1U06 A; 2B86 A; 5IXB A; 2IIM A; 2MCN A; 3H41 A; 1QWE A; 2W10 A; 3VS4 A; 2JS0 A; 1OPL A; 2C0T A; 2LNH B; 1RLP C; 4F14 A; 1K1Z A; 1UE9 A; 2L3P A; 3TSW A; 1OV3 A; 2DMO A; 3O5Z A; 2QDL A; 3LH5 A; 2YUP A; 2CT4 A; 2PTK A; 1V1C A; 1YN8 A; 3H0H A; 2L3Q A; 1NM7 A; 2G6F X; 2AZV A; 2F2X A; 4JPB W; 1SHF A; 3ULR B; 5GJV B; 2O9V A; 3QWX X; 4OMM A; 1CKB A; 1TUC A; 2OI3 A; 2RQT A; 3PVQ A; 2DL3 A; 3U23 A; 4CC4 B; 1UDL A; 2HEQ A; 5EC7 A; 3SHW A; 3H0I A; 2DJQ A; 5ECA A; 4GBQ A; 1UEC A; 2GQI A; 3TSZ A; 2MIO A; 1X43 A; 4IIO A; 2ROL A; 2V1Q A; 1ZSG A; 1WDX A; 1GRI A; 2RF0 A; 5IHI A; 1X69 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2FRY A; 2QQS A; 4C5E A; 3GP8 A; 1YJW Q; 1BCM A; 4C8Q E; 3NTI A; 1QW1 A; 1D3B B; 3OW2 S; 1ZBX A; 4IUU A; 4D8D A; 3DKM A; 3VS1 A; 3IQL A; 1X6G A; 3M54 A; 4BDY A; 1KQ1 A; 1VYU A; 1KQS A; 4OMP A; 2KEA A; 3VV0 A; 2D1X A; 2H3J A; 3PFS A; 2J6O A; 1YHQ T; 3QYH B; 2M9U A; 2O4X A; 1I5L A; 4E7J A; 4J9G A; 4ELZ C; 4BDZ A; 3EFO A; 4RTZ A; 5GAN 7; 1NJI R; 3VRY A; 1OEB A; 4ESR A; 4DOV A; 3Q1J A; 5GAN e; 2A3L A; 2QQR A; 1Q81 R; 1NZ9 A; 1AZG B; 4X34 A; 3M0R A; 2JZ2 A; 2KSS A; 5IHK A; 4JRI A; 4AG2 C; 5GAM j; 1H92 A; 2HQX A; 3WVD B; 2MF2 A; 3TRE A; 2VVK A; 3QG1 A; 4JJD A; 2HZY A; 2RNA A; 5HK3 A; 3PGG A; 5LJ5 j; 3MO8 A; 3FLG A; 3CPF A; 2LT1 A; 1NEB A; 1K9M R; 5GAN 3; 1X2K A; 2RQV A; 1PRM C; 5GAO n; 3CCS A; 1CKA A; 4C8Q D; 4X9D A; 4BI8 B; 1VIF A; 2SEM A; 1SEM A; 5CKH A; 2JT4 A; 3MP6 A; 4M75 C; 3VS6 A; 4C0Z A; 4N4H A; 1PRL C; 1JBM A; 1SHG A; 3M9Q A; 1VQN A; 4C5I A; 3RKY A; 4J8O A; 4OGE A; 2HSE B; 2FO0 A; 1PC0 A; 3GLX A; 4ANJ A; 2LQN A; 4F04 B; 3J81 E; 3RDV A; 2BE7 D; 4KT0 E; 5D6W A; 2QDY B; 1KG1 A; 2V8J A; 2J7I A; 3JB9 H; 1UB4 A; 2DD5 A; 3JB9 I; 3R6N A; 2CZ1 B; 2EBP A; 4RG8 A; 2LCS A; 1VQP Q; 1D0X A; 1JB0 E; 2LMJ A; 2KK4 A; 1S72 T; 3CME Q; 4MZT A; 4HVW A; 3E1S A; 1VQ5 Q; 1M3B A; 3VS7 A; 1U1S A; 2PVD B; 1N9S A; 2CZ6 B; 2KRO A; 3BFM A; 5M9O A; 4M7D E; 1H64 1; 1QMC A; 3OYC A; 2ZPE B; 2K5L A; 1WXB A; 1IHW A; 5KYX A; 2JVV A; 3UA6 A; 3JCM b; 3LYI A; 1AVZ C; 3P8B B; 3FEO A; 1FMK A; 1N8R U; 1M90 U; 2CP3 A; 1Q7Y C; 5GAM f; 4FYW B; 4M77 C; 1NBE B; 1VQ8 Q; 3CBM A; 3NHN A; 2FPD A; 3LWI A; 2L3R A; 2XDP A; 3I56 Q; 2OX7 A; 2K2M A; 5LJ5 f; 4OML A; 5FU7 C; 3CCE Q; 3V7S A; 2GTO A; 4M75 E; 1IB8 A; 3CPW A; 2JMA A; 2DTH A; 4C5H A; 2O2O A; 2KXD A; 2ATC B; 5GAN j; 3CBO A; 4OB1 B; 1W1F A; 1HXD A; 3SFM A; 2OTL Q; 2R58 A; 4OB2 B; 5GAN 6; 3CBP A; 3VS0 A; 2J6K A; 1I07 A; 2P4R A; 2A28 A; 4QVD A; 1QKX A; 1VQO T; 3L2W A; 4J6W A; 3GPL A; 4JJB A; 4L5G A; 5GAO p; 2EYY A; 2QI2 A; 4CC3 A; 8AT1 B; 2RHI A; 1WHL A; 4FIB A; 4XTU A; 1AEY A; 1VQ9 Q; 1RAB B; 3RKW A; 5GAM h; 1SG5 A; 4RTT A; 1UUE A; 2JTE A; 3CCR T; 3PMI A; 3SWN B; 3CPW S; 2D8J A; 2E5K A; 2GFU A; 5LJ5 h; 1AWO A; 1D09 B; 3E9F A; 1ZLM A; 2GFA A; 1K9M C; 1D1A A; 2BIV A; 2DK3 A; 2RQU A; 3VYG A; 1QVF P; 4J6Y A; 3G7Z A; 1I0C A; 3H6Z A; 4M77 E; 3CCL A; 4GLM A; 4A63 B; 3UF4 A; 1GFC A; 1K8A U; 2CSQ A; 2D0Q B; 4ZGD B; 1Y96 B; 2YSQ A; 2DTO A; 5FWB A; 1IHV A; 2PVG B; 4C92 G; 5AT1 B; 2XU8 A; 3EGD A; 3GNF B; 4KUL A; 2QEX T; 1OOT A; 4KGX B; 4C8Q B; 2COY A; 4ZN3 A; 1V76 A; 4VUB A; 3QDR B; 3EAE A; 3FJ5 A; 5GAM d; 3CCQ A; 3OYI A; 1C0M A; 4F7U E; 2DRK A; 3RKX A; 3MKD A; 3SWN A; 2OTJ T; 4PFO A; 2OJ2 A; 1R0B G; 1RL2 A; 1QLY A; 1QCF A; 4QT7 A; 5LJ5 d; 3HTR A; 1UEB A; 1IGU A; 1NPR A; 3I55 Q; 2GTJ A; 3WVE B; 1V29 B; 4XTW A; 1M8M A; 2ESW A; 1JXM A; 3CCU A; 2YT6 A; 2IG0 A; 2QG9 B; 4R0K A; 3M0Q A; 5A2Q E; 2QQ9 A; 3OW2 P; 3EGX B; 3HRS A; 4EMG A; 1K0X A; 4C8Q F; 5IH2 A; 4OB0 B; 2E5Q A; 1B34 B; 4BY6 C; 1PKS A; 4C8Q A; 2YRD A; 3TCJ A; 1YIT A; 1VQL T; 2O88 A; 5GAN 2; 2YDL A; 2XHC A; 4CC2 A; 5C6S A; 1PHT A; 3JSC A; 2LZ6 B; 1TWB A; 2A37 A; 1WHM A; 1FYN A; 3EG9 A; 4M77 D; 2CKK A; 4KH1 B; 2QGF B; 3EG1 A; 9ATC B; 1Q82 U; 1QVG A; 3HP9 A; 2DBK A; 3L1A A; 2DVJ A; 2KVQ G; 3ZBD A; 5D6X A; 3CD6 A; 3M56 A; 1B34 A; 1ZSZ A; 1VQ7 A; 2FPE A; 4RG2 A; 4ME7 A; 3SB2 A; 5GAN h; 1Y0M A; 2MWO A; 4RUG A; 1JJ2 A; 1SRM A; 1G5V A; 4JZ3 A; 3LWH A; 2ENM A; 1KQS P; 4BB7 A; 1U8R A; 4YTL A; 2CT3 A; 1RAH B; 2GCX A; 1MV0 B; 2GNC A; 2E1H A; 3L42 A; 1M1K R; 6AT1 B; 2IIM A; 3HRU A; 1Q81 U; 1LPL A; 4M7A A; 1QP2 A; 3H41 A; 1QWE A; 3QZ9 B; 2W10 A; 4KGV B; 3F70 A; 4J83 A; 1UE9 A; 4F14 A; 1XTD A; 3MJX A; 3RUX A; 3DLL A; 1OV3 A; 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4FYY B; 1GCP A; 4RTW A; 4V2S A; 2GBQ A; 3X28 B; 2FL7 A; 1NPP A; 3VS5 A; 1VQM Q; 2CP2 A; 3BDL A; 4RTY A; 3CPW P; 1M2V A; 1OZ2 A; 5KYU A; 2ZPH B; 1NYG A; 4F7U B; 5L23 A; 3CCV T; 2RM4 A; 2HKQ B; 1T3S A; 2EGC A; 2FEI A; 2EKO A; 3A98 A; 2E3H A; 1EZZ B; 1FXX A; 1ZSZ C; 3MEV A; 4LNP A; 1TUG B; 2LQK A; 4M77 F; 4RMO A; 3M0T A; 1Y71 A; 4M77 A; 1WJR A; 4FT4 A; 2EJG A; 2DNU A; 1JRI A; 3CC7 T; 3KFV A; 1VA7 A; 1OU9 A; 5DLO A; 1N9R A; 4AFS C; 1G83 A; 4HCC A; 2O4X B; 4X9C A; 4J7F A; 1UJY A; 2QA4 A; 5DY9 A; 4B6M A; 2LQW A; 1N8R C; 1M90 C; 2BZY A; 4M7A C; 2CH4 A; 2FB7 A; 4RCB A; 4F7U F; 3RMQ A; 4F7U A; 3EG0 A; 2CP5 A; 3D7S B; 1VQO Q; 2LP5 A; 1JO8 A; 3BDU A; 1WXU A; 1E6G A; 1GL5 A; 4FW1 A; 1Q82 R; 3HHT B; 2L89 A; 2VUB A; 3OSS C; 1X6O A; 2RJF A; 4AG1 C; 2VGM A; 3MHX A; 3KBG A; 2KQW A; 1E6H A; 3JB9 D; 3JCM P; 4A4K A; 4C8Q G; 3CCR Q; 2GGR A; 3NFC A; 2F69 A; 2WSC E; 2JXB A; 1AD5 A; 2DF6 A; 3I56 A; 4PFP A; 3P8D A; 1Q86 C; 1WIE A; 3OYE A; 1T3L A; 1RAG B; 4LN2 A; 3CCQ T; 1G3T A; 2YUQ A; 1YCS B; 1YWO A; 4JDS A; 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