The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
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sequence length |
64
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structure length |
64
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Chain Sequence |
GAMGAKEYCRTLFPYTGTNEDELTFREGEIIHLISKETGEAGWWKGELNGKEGVFPDNFAVQIS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
CD2-associated protein
|
| publication title |
The high resolution NMR structure of the third SH3 domain of CD2AP.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Mus musculus
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| molecule tags |
Signaling protein
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| total genus |
14
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| structure length |
64
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| sequence length |
64
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-07-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2L2P A; 4J9H A; 1X69 A; 2W10 A; 4JJD A; 2EYY A; 3THK A; 1WXU A; 1UJ0 A; 1V1C A; 1Y0M A; 1Z9Z A; 4GLM A; 1HJD A; 1PNJ A; 1G2B A; 1JQQ A; 1UHF A; 1ZLM A; 2O9V A; 1VYT A; 1GCQ C; 3U23 A; 2AK5 A; 1PHT A; 3ULR B; 1GBR A; 2BZX A; 2CUB A; 3EG2 A; 1X43 A; 1FMK A; 1SEM A; 2CSI A; 2O88 A; 3H0H A; 1JO8 A; 2JTE A; 2LQN A; 3VS3 A; 2EKH A; 1UFF A; 2EYX A; 2ECZ A; 5FWB A; 1MUZ A; 2CT4 A; 4AFZ C; 3EG3 A; 1BU1 A; 1K0X A; 1E6H A; 1YNZ A; 1NYF A; 1QWF A; 5EC7 A; 1CKA A; 1BBZ A; 4OML A; 3CQT A; 4OMM A; 4OMP A; 2F2V A; 2LCS A; 2ROL A; 2EPD A; 3VRZ A; 2J6F A; 5IHK A; 3VS6 A; 2ESW A; 2JXB A; 2M0Y A; 1K76 A; 4RTV A; 1GCQ A; 2DLP A; 4AFQ C; 2DL5 A; 2GNC A; 2KRO A; 2SRC A; 4RUG A; 3VS7 A; 2DIL A; 2EGC A; 3TVT A; 1H3H A; 2RQW A; 2FRY A; 1PWT A; 2H8H A; 1GRI A; 4D8D A; 1PKT A; 2F2W A; 2VVK A; 2V1Q A; 2RQV A; 1JXO A; 1ARK A; 1X6G A; 2HBW A; 2MCN A; 1UGV A; 4DEY A; 1B07 A; 2DNU A; 2CRE A; 2LMJ A; 2L3P A; 5GJW B; 1RI9 A; 1WX6 A; 2QDL A; 1J3T A; 1AD5 A; 4OMQ A; 2ENM A; 3TSZ A; 2J7I A; 4LUE A; 1RUW A; 3EHR A; 1WFW A; 3VRY A; 4CC7 A; 1TUC A; 2RNA A; 2BTT A; 3JV3 A; 2A08 A; 5IH2 A; 2J05 A; 4WCI A; 4HXJ A; 2D1X A; 3M0Q A; 1RLQ C; 4JJB A; 3H0I A; 3H41 A; 2LP5 A; 1HD3 A; 3VS4 A; 3SEM A; 1OPL A; 1AZG B; 5FWC A; 1GFD A; 2O9S A; 1UHC A; 2DL4 A; 2DRM A; 2YUP A; 1AVZ C; 2YUN A; 1OPK A; 2CH4 A; 2DYB A; 2FEI A; 2G6F X; 2K2M A; 2KXC A; 4D8K A; 4ESR A; 1K0S A; 1OEB A; 1W1F A; 3M0T A; 1AWJ A; 3PE0 A; 2GGR A; 4F14 A; 4LN2 A; 2KT8 A; 4HVW A; 1M8M A; 2PTK A; 4JJC A; 1BK2 A; 3IQL A; 4K11 A; 1I07 A; 2ABL A; 2GTO A; 1WYX A; 1TUD A; 1U3O A; 1CSK A; 1NLO C; 2VWF A; 2DMO A; 1Y57 A; 2V1R A; 1NEB A; 2ED0 A; 2JT4 A; 2K3B A; 2I0N A; 4CC3 A; 1YN8 A; 2L0A A; 1T0H A; 1GCP A; 2AZV A; 4RTX A; 5IXB A; 2LZ6 B; 5IHI A; 3C0C A; 4X1V A; 3NHN A; 2EYZ A; 2DJQ A; 1ABQ A; 4IIO A; 1MV3 A; 1OV3 A; 2FPD A; 1X27 A; 3NPF A; 1ABO A; 1JU5 C; 1K1Z A; 4LE9 A; 1AWX A; 2KR3 A; 1NLP C; 3RBB B; 1UEC A; 1U06 A; 1GBQ A; 4JZ3 A; 2K6D A; 2J06 A; 1AZE A; 1NYG A; 2RN8 A; 2DL3 A; 4J9C A; 2YUQ A; 5HCK A; 4RTU A; 2LJ3 A; 1UG1 A; 4OMN A; 2A28 A; 4AG2 C; 1QKX A; 3EG0 A; 1SHF A; 1T0J A; 1I0C A; 1UDL A; 2X3W D; 4RTT A; 4J9B A; 1YWO A; 2MIO A; 1YWP A; 2JMA A; 1IO6 A; 1UTI A; 2CT3 A; 4OMO A; 1UE9 A; 2C0T A; 3VS5 A; 1A0N B; 4ZNX A; 2JMC A; 3A98 A; 3FJ5 A; 1ZUU A; 4LUD A; 1KFZ A; 2DL8 A; 4AG1 C; 1YCS B; 2K7A A; 4CC4 B; 5IXF A; 3TSW A; 1SRL A; 2KEA A; 2KGT A; 3LH5 A; 2BZ8 A; 1OOT A; 3EGU A; 2L3Q A; 2L3S A; 2GBQ A; 3RNJ A; 2RQR A; 1PKS A; 2AZS A; 2XMF A; 2HDA A; 4HVV A; 3I5S A; 2F2X A; 3R6N A; 1X2Q A; 1JEG A; 1TG0 A; 1SHG A; 1GFC A; 2JM8 A; 3REB B; 3EG1 A; 2DL7 A; 1XOV A; 2J6K A; 3M0P A; 1VYV A; 2D0N A; 2FPE A; 2LJ1 A; 2JS2 A; 3SHW A; 2C0I A; 2LX7 A; 1JXM A; 2A37 A; 2X3X D; 3EHQ A; 2JW4 A; 1EFN A; 4E6R A; 2FG0 A; 1K9A A; 2RPN A; 2KYM A; 2K9G A; 2EGE A; 4M4Z A; 1UJY A; 2K79 A; 1VA7 A; 2LQW A; 3UA6 A; 2PNI A; 1ZUK A; 2J6O A; 2KNB B; 1N5Z A; 1QKW A; 1WI7 A; 2PZ1 A; 3VS2 A; 1SPK A; 2DBK A; 3O5Z A; 2RQU A; 2CUD A; 2FPF A; 4IIM A; 4CC2 A; 1AWO A; 2DVJ A; 3PVL A; 4HCK A; 3UA7 A; 4Y92 A; 2M51 A; 2CSQ A; 2E5K A; 4FSS A; 1QLY A; 5I22 A; 1KJW A; 2YDL A; 4F16 A; 2NUZ A; 1H8K A; 4HVU A; 2EBP A; 2FO0 A; 3I35 A; 1W70 A; 4Z89 A; 1HSQ A; 1I1J A; 1WXT A; 1B3Q A; 1X6B A; 2HSP A; 1WLP B; 2KRM A; 3UAT A; 2O2O A; 2MOX A; 2P4R A; 1T3L A; 1W6X A; 2CH4 W; 4J9D A; 2D8H A; 1M30 A; 3NGP A; 4JZ4 A; 1S1N A; 1U5S A; 2DX1 A; 4RTZ A; 3I5R A; 1LCK A; 2EQI A; 2O31 A; 2HEQ A; 1M27 C; 1NG2 A; 2DRK A; 2DM1 A; 1E7O A; 2HCK A; 3QWX X; 4J9G A; 2EVR A; 3KFV A; 2YT6 A; 2SEM A; 3QWY A; 1RLP C; 1T3S A; 2BZY A; 5ECA A; 2KXD A; 2KE9 A; 1K4U S; 1E6G A; 1AEY A; 1UUE A; 1NEG A; 1SRM A; 1QWE A; 2B86 A; 5I11 A; 2GTJ A; 1M3C A; 2W0Z A; 1VYU A; 1X2K A; 2IIM A; 1AOJ A; 3VS1 A; 2EGA A; 5GJV B; 1GL5 A; 1Z9Q A; 2CDT A; 1WXB A; 3M0S A; 2VKN A; 2FRW A; 1ZX6 A; 2KRS A; 4KRT A; 4JPB W; 1BB9 A; 2YUO A; 4AFU C; 1CKB A; 4F17 A; 2OAW A; 2RQT A; 3GBQ A; 3M0R A; 4A63 B; 2KRN A; 1WA7 A; 2JM9 A; 1H92 A; 1ZBJ A; 2A36 A; 5L23 A; 1NM7 A; 2OJ2 A; 2AKL A; 1PRM C; 3H0F A; 4DEX A; 2RF0 A; 1KIK A; 1QCF A; 2GQI A; 3NMZ C; 1WIE A; 2RMO A; 2C0O A; 2JS0 A; 4J9I A; 4EIK A; 3UF4 A; 2DA9 A; 2EYW A; 4AFS C; 1KSW A; 1G83 A; 4Z88 A; 2KYB A; 2DE0 X; 3REA B; 2OI3 A; 1PRL C; 2DBM A; 4QT7 A; 3ZL7 C; 5FW9 A; 4RTW A; 2ED1 A; 3I9Q A; 1YP5 A; 1M3B A; 1M3A A; 2D8J A; 2KT1 A; 4RTY A; 2KBT A; 4J9E A; 5IHN A; 2AKK A; 4J9F A; 4R0K A; 4Z8A A; 1FYN A; 4ORZ A; 2ROT A; 1SSH A; 2EW3 A; 2LNH B; 1ZSG A; 1WDX A; 3M0U A; 3VS0 A; 1MV0 B; 4GBQ A; 2DF6 A; 4LNP A; 2NWM A; 2LJ0 A; 1ZUY A; 3PVQ A; 1AWW A; 2YSQ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4E7L A; 4L5G A; 4EMK B; 1WXU A; 1YIJ A; 1Z9Z A; 3MHX A; 4XTX A; 1AT1 B; 1G2B A; 1ZLM A; 2O9V A; 3A1P A; 3UPU A; 1VQO Q; 3L2Z A; 2AK5 A; 2OAU A; 4M7D G; 4M75 B; 5KCH A; 2FVU A; 1YIT T; 2HNI A; 2KI7 A; 2WSF E; 3H0H A; 1TH7 A; 2EJF A; 3QKJ A; 4XTV A; 4HT9 A; 3MJX A; 1YJ9 T; 2CT4 A; 4AFZ C; 1NJI U; 3UT1 A; 3EH2 A; 4XTZ A; 1V76 A; 1YNZ A; 4C0Z A; 3OBY A; 1IXD A; 3UWN A; 2DO3 A; 4F7U F; 4RG8 A; 3GLX A; 4NS5 A; 1B7T A; 4L6V 5; 1WHM A; 3OS5 A; 1CKA A; 1PSE A; 3CQT A; 5GAN 4; 4E7Z A; 3TQ7 P; 3EG9 A; 2AT1 B; 5M9O A; 2EPD A; 3G71 T; 1TS9 A; 4BE0 A; 1JJ2 A; 3M53 A; 5IHK A; 4M7A G; 2GFU A; 5GMK j; 4BD3 A; 1VQ7 Q; 1GCQ A; 3NTH A; 2DL5 A; 2GNC A; 3M9Q A; 3ZBD A; 1H3H A; 2OTL A; 1PWT A; 1VQK T; 3RES A; 4PJO F; 2JTF A; 5DY9 A; 3OW2 P; 1FWZ A; 1X6G A; 2HBW A; 3FDR A; 3VU3 C; 1OZ2 A; 2EKO A; 4DEY A; 3BY7 A; 4M78 E; 2L3P A; 5GAM e; 3OYL A; 2VXE A; 3CCU A; 2F1L A; 2LQK A; 4OMQ A; 2ENM A; 3QBY A; 1XQH A; 1RUW A; 3HRU A; 1WFW A; 4M75 D; 3PMT A; 5LJ3 e; 2IPO B; 3VRY A; 4CC7 A; 1PD0 A; 2M16 A; 2RNA A; 5KYY A; 1S72 Q; 5IH2 A; 2LP5 A; 1HD3 A; 3VS4 A; 3SEM A; 3CMA A; 1M2O A; 4FCY A; 2X4W A; 3H9N A; 2XDD A; 3RER A; 5I2M A; 1FX7 A; 2DL4 A; 5KYX B; 1R0C B; 1AVZ C; 2YUN A; 4C0F A; 1G5V A; 2K2M A; 4JRQ A; 4QQG A; 1K8A R; 4A4G A; 1BCM A; 4LN2 A; 5GAO l; 5KYW A; 2KMT A; 2PTK A; 3JRZ A; 1VQP A; 3QUI A; 4C92 F; 3OW2 A; 2NUT B; 4J7F A; 4QVD A; 3FC3 A; 2GTO A; 3S3N A; 1EX4 A; 1WYX A; 5KE2 A; 1U3O A; 1CSK A; 3DLL A; 2VWF A; 4O6J A; 2DMO A; 2K5L A; 2GCX A; 2K2V A; 1YN8 A; 1Q81 C; 3M59 A; 2ZCF B; 2LTO A; 1W2B S; 2LZ6 B; 3SWN C; 2FZC B; 1OYX A; 3NHN A; 1N8R R; 2COY A; 2EYZ A; 2DJQ A; 3CPW S; 1Q95 G; 4PFO A; 1JU5 C; 1K1Z A; 2YLC A; 2KR3 A; 1IRX A; 4OB1 B; 4PLL A; 2J06 A; 1NYG A; 1M2V A; 3QXE B; 3CCQ Q; 3HPW A; 2YUQ A; 5HCK A; 1VQO A; 4RTU A; 2HKN A; 1UG1 A; 2VUB A; 1MHN A; 3EG0 A; 1IGU A; 2QA4 T; 3I56 T; 2R57 A; 1I0C A; 3L2R A; 3OYJ A; 4RTT A; 3TU4 K; 2M0O A; 1YWP A; 2JMA A; 1A0N B; 2C0T A; 3OS2 A; 1RAF B; 2E12 A; 3DB4 A; 1ZA2 B; 1RAB B; 4M77 F; 4MZT A; 4HCZ A; 1YCS B; 5GAN h; 3JCM f; 1X75 C; 2YHT A; 2BZ8 A; 1OOT A; 1VIF A; 4RG2 A; 1NPR A; 2RQR A; 1PKS A; 2AZS A; 4ZN1 A; 2CYZ B; 1O75 A; 3BDL A; 1HK9 A; 2HDA A; 4LXC A; 4WTO B; 2COZ A; 1VQ7 A; 1ZA1 B; 2JM8 A; 1UGP B; 4A4K A; 2R58 A; 4OGE A; 1FXX A; 2J6K A; 3JCM g; 3M0P A; 3A8M B; 2D0N A; 2LX7 A; 1K9A A; 1TWB A; 2K57 A; 3ASK A; 1B34 A; 3MEW A; 2F5K A; 1G3S A; 5CKD A; 4C8Q B; 2J6O A; 3RKW A; 2PZ1 A; 5HK3 A; 5FU7 B; 4E7J A; 3CXC S; 1VQL T; 3G6E T; 3PT9 A; 2CUD A; 2DER A; 4IUR A; 1MMD A; 4Y92 A; 2E3H A; 2E5K A; 2OTJ Q; 3CCE T; 1N6A A; 4FSS A; 3RKX A; 2YDL A; 4F16 A; 5GAN d; 5CQY A; 4RCC A; 4MMK A; 1S72 A; 1KC8 U; 1HSQ A; 1WXT A; 1M90 U; 1O9S A; 1WLP B; 2A3L A; 3OYH A; 2DYI A; 4CI0 C; 1QMC A; 3M58 A; 3UAT A; 2O2O A; 4FW2 A; 2P4R A; 1T3L A; 1TSF A; 2LC4 A; 4BUG A; 1KK7 A; 1W6X A; 2D8H A; 3CBP A; 3V8J A; 5CVI A; 4IUV A; 3V8L A; 5GMK h; 3I56 A; 3QYG B; 4M78 G; 3EGX B; 1LCK A; 1BCO A; 4PJO C; 2EIF A; 4OF1 A; 3JCM X; 1M27 C; 4WF2 A; 2G3R A; 2QQ9 A; 4ANJ A; 1VQ8 T; 1E7O A; 2E6N A; 2HCK A; 1M1K R; 3OYG A; 2YT6 A; 4A53 A; 3OMC A; 4BB7 A; 3QPH A; 4KBM B; 5A0D A; 3S3O A; 2BZY A; 4Y28 E; 2CP6 A; 2EAY A; 9ATC B; 2DTI A; 1MNE A; 1VYU A; 3X20 B; 1VUB A; 3VS1 A; 3OY9 A; 1PC0 A; 3ZFJ A; 2RJF A; 2KRS A; 4MML A; 2R5M A; 4KRT A; 2M9U A; 1CKB A; 3S3M A; 4D6W A; 1ZBJ A; 4BDZ A; 5L23 A; 3FLG A; 1I5L A; 4KH0 B; 4JDS A; 2OJ2 A; 3VYH B; 5CAI A; 3AT1 B; 3H0F A; 3HTR A; 5GAN 2; 3A5Z B; 3CCQ A; 2GQI A; 1QVF P; 5A0G A; 2DXB A; 2P0K A; 2YXY A; 1G3Y A; 2C0O A; 1M5Q 1; 2JS0 A; 4J8O A; 2E4H A; 4AFS C; 4C92 C; 2CP5 A; 1G83 A; 3REA B; 2DE0 X; 3MP6 A; 1VQL A; 1M1G A; 4QT7 A; 3CD6 T; 2KY9 A; 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1PKT A; 3L2W A; 2X9H A; 5GAM f; 4PJO A; 2VVK A; 3HFN A; 2V1Q A; 1JXO A; 5LJ5 f; 3FIF A; 2EQK A; 3NTI A; 5DLO A; 2DXU A; 1Q82 U; 2DNU A; 5LJ3 f; 2CRE A; 2LMJ A; 3JCM Q; 2NUP B; 5GJW B; 1YIT Q; 4BDY A; 4FT2 A; 2QDL A; 3Q1J A; 1AD5 A; 2KQW A; 5GAO m; 2PUK B; 2HQE A; 5GMK e; 1YJ9 Q; 3E2U A; 5GAM g; 1JB0 E; 4VUB A; 2QEX T; 2A08 A; 2O4X B; 5KYU A; 5LJ5 g; 1SSF A; 4BY6 C; 4HXJ A; 2FB7 A; 3LX7 A; 1Y71 A; 2PUO B; 4FL6 A; 2Y4X A; 5LJ3 g; 2E10 A; 4X9C A; 4M7D D; 1AZG B; 4E2F B; 3G71 Q; 1VQN T; 1GFD A; 4NL3 A; 4ZTF A; 3CC7 T; 2YUP A; 1VQ9 T; 3JAM E; 1OPK A; 2CH4 A; 1VQ6 T; 1UB4 A; 1KD1 C; 4JLG A; 1K0S A; 1W1F A; 2HL5 C; 1AWJ A; 3TCJ A; 2VB6 A; 3QSU A; 1G3T A; 2KT8 A; 1MMA A; 2QQA A; 3P8H A; 2Y4Y A; 1VQK Q; 2NYS A; 1NBE B; 4C92 A; 4K11 A; 4DBF A; 2HAX A; 2QK0 A; 4R56 A; 3JCM W; 2E5Q A; 1NEB A; 2JT4 A; 1OX9 A; 3RR6 A; 3A8O B; 4M7A D; 2L0A A; 2AZV A; 1GCP A; 3SWN B; 5IXB A; 5IHI A; 1WHH A; 4F04 B; 1WQW A; 4DA4 A; 4X1V A; 1K9M C; 3A8G B; 4OB3 B; 4F7U E; 1ABQ A; 2E41 A; 3JB9 I; 2X35 A; 2XHC A; 1OV3 A; 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