The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
b'KELVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVADRQGFVPAAYVKKL'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1
|
| molecule tags |
Structural protein
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| source organism |
Gallus gallus
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| publication title |
Crystal Structure of the alpha spectrin SH3 domain mutant N47A
rcsb |
| total genus |
12
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| structure length |
56
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| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2016-02-29 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2AZV A; 1SHF A; 2JTE A; 5GJV B; 1PKT A; 1AWO A; 4F14 A; 2DE0 X; 1U06 A; 1ZUU A; 2EYW A; 3PE0 A; 2EQI A; 3GBQ A; 3SHW A; 2SRC A; 4RTY A; 1ZUY A; 1ABQ A; 4OMP A; 2CT3 A; 4CC7 A; 1MV3 A; 4AG1 C; 4JJB A; 2RQV A; 4LUD A; 1KFZ A; 2J6O A; 1YWP A; 2ED0 A; 1GFC A; 1WFW A; 3A98 A; 2EGA A; 1NLO C; 4E6R A; 2HDA A; 3TSZ A; 2BZ8 A; 1W1F A; 2C0I A; 1YNZ A; 2F2X A; 2NUZ A; 2YT6 A; 1VYV A; 1M3B A; 2RMO A; 3VRY A; 1BK2 A; 1TUD A; 1K0S A; 2BZX A; 2DVJ A; 2BZY A; 3UF4 A; 1TG0 A; 2DX1 A; 2VKN A; 2RQU A; 1BBZ A; 1RI9 A; 4RTW A; 1GCQ A; 3EG1 A; 2B86 A; 2EVR A; 1OPK A; 2HSP A; 1UFF A; 3H0I A; 4LE9 A; 4ZNX A; 3VS2 A; 3VS1 A; 2KRM A; 2X3W D; 5FW9 A; 2EGE A; 3QWX X; 1W70 A; 3I5R A; 1NEB A; 4OMO A; 5I11 A; 2L0A A; 3H0H A; 1JO8 A; 1AZE A; 1FMK A; 1ZLM A; 2KXD A; 4RTT A; 3IQL A; 2F2V A; 1T3S A; 1Y0M A; 2F2W A; 2KXC A; 1NM7 A; 1PNJ A; 2J6F A; 1RLP C; 1V1C A; 2K79 A; 3M0Q A; 3VS5 A; 4CC3 A; 3I35 A; 2M51 A; 1NEG A; 1HSQ A; 4A63 B; 1T3L A; 4HCK A; 1SEM A; 2KYM A; 2NWM A; 1PWT A; 1X43 A; 3EG2 A; 4X1V A; 3U23 A; 4JJC A; 1WXT A; 2D8H A; 1PRM C; 2LJ3 A; 1CSK A; 2C0O A; 3EG0 A; 2K3B A; 2O2O A; 1HD3 A; 3THK A; 1ABO A; 2L3Q A; 1Z9Q A; 3CQT A; 1PKS A; 2EBP A; 2KT1 A; 3M0R A; 1WIE A; 3REB B; 4WCI A; 1GFD A; 1LCK A; 3VRZ A; 1K0X A; 1WXU A; 2HCK A; 3NHN A; 1VYT A; 1OOT A; 2JS0 A; 2KNB B; 1U5S A; 2YDL A; 2LJ1 A; 2PNI A; 1KIK A; 5FWB A; 2J6K A; 1QKX A; 1QKW A; 2EW3 A; 2KEA A; 2JM8 A; 2LJ0 A; 1NYG A; 1QWE A; 1YCS B; 2W10 A; 4EIK A; 3SEM A; 1AWW A; 2LZ6 B; 2ESW A; 1EFN A; 1MUZ A; 2QDL A; 2LQN A; 1CKB A; 3VS3 A; 2DL7 A; 2LX7 A; 1AWX A; 2A37 A; 4Z8A A; 2GTJ A; 1X2K A; 2GGR A; 2VWF A; 4J9E A; 5IHN A; 2DJQ A; 3VS4 A; 1GRI A; 3O5Z A; 2KGT A; 1FYN A; 2DMO A; 2RQW A; 1M30 A; 2FG0 A; 4JZ3 A; 1X6B A; 1UJY A; 2J06 A; 2FPE A; 5EC7 A; 4HVU A; 1VYU A; 3M0U A; 2RF0 A; 4Y92 A; 5ECA A; 3TSW A; 1H92 A; 1JXO A; 2JS2 A; 2ECZ A; 2RQR A; 1SHG A; 3REA B; 2FPF A; 5HCK A; 1YWO A; 2OJ2 A; 1SPK A; 1W6X A; 2O9S A; 2EYY A; 2D0N A; 2YUO A; 3PVQ A; 4RTX A; 2A28 A; 1K1Z A; 1SRM A; 1X27 A; 2EYZ A; 4LNP A; 4RTU A; 1ZX6 A; 1NYF A; 2A36 A; 2GBQ A; 4D8K A; 4LN2 A; 2OI3 A; 1PRL C; 2I0N A; 2P4R A; 1AVZ C; 4OMN A; 1M3C A; 3EG3 A; 4HVW A; 2FEI A; 4KRT A; 4IIO A; 3EHR A; 2DLP A; 4LUE A; 2L2P A; 2FRY A; 1OPL A; 2H8H A; 5IXF A; 2KRO A; 1WX6 A; 2KT8 A; 2MIO A; 2HEQ A; 2GNC A; 3LH5 A; 4AG2 C; 3UA6 A; 2CUB A; 1UJ0 A; 1A0N B; 1IO6 A; 2DL8 A; 2FRW A; 2M0Y A; 2BTT A; 4RTZ A; 1AZG B; 1WI7 A; 2DF6 A; 3RNJ A; 1AEY A; 2V1Q A; 1X69 A; 4M4Z A; 4J9H A; 4JPB W; 3M0S A; 1JQQ A; 1UUE A; 3QWY A; 2DYB A; 1QWF A; 1I0C A; 2CT4 A; 2FPD A; 4DEX A; 2AZS A; 1B3Q A; 1MV0 B; 2G6F X; 2JW4 A; 2L3S A; 3JV3 A; 4J9F A; 2KBT A; 4K11 A; 1UHC A; 2O9V A; 1ZUK A; 2CDT A; 2DBK A; 4CC2 A; 1BU1 A; 2EPD A; 2HBW A; 1B07 A; 1T0H A; 2K6D A; 1T0J A; 1H3H A; 3NGP A; 3I9Q A; 2AKK A; 1HJD A; 2CUD A; 4AFS C; 2LQW A; 2OAW A; 1K9A A; 3H41 A; 2GQI A; 4J9G A; 2CSQ A; 4ORZ A; 1KSW A; 3NPF A; 5IXB A; 2RN8 A; 2JT4 A; 2ABL A; 4AFZ C; 1OEB A; 4JZ4 A; 1GBQ A; 1X2Q A; 2MOX A; 1NG2 A; 3I5S A; 4ESR A; 1WXB A; 2EYX A; 2CH4 A; 2J05 A; 1G2B A; 4Z89 A; 3FJ5 A; 2D1X A; 2CRE A; 2O88 A; 1H8K A; 2L3P A; 1UGV A; 3KFV A; 1WDX A; 1XOV A; 2DNU A; 1SSH A; 2KYB A; 3C0C A; 2MCN A; 5IHK A; 2LMJ A; 2EGC A; 4RTV A; 1YP5 A; 1AOJ A; 4GLM A; 1I1J A; 2YUQ A; 4OMQ A; 2JMC A; 2CH4 W; 2C0T A; 2K9G A; 1I07 A; 1QLY A; 3RBB B; 2SEM A; 1VA7 A; 4R0K A; 5L23 A; 3UAT A; 1G83 A; 1J3T A; 1WYX A; 5IH2 A; 4AFU C; 2E5K A; 2GTO A; 2KRS A; 4OMM A; 4F16 A; 1QCF A; 1GCQ C; 5I22 A; 2RPN A; 1WLP B; 3M0T A; 2D8J A; 5GJW B; 1UG1 A; 1UE9 A; 3TVT A; 3R6N A; 2DBM A; 2K7A A; 2KE9 A; 2YUP A; 2ROT A; 1PHT A; 1Y57 A; 4OML A; 2LP5 A; 4JJD A; 1AD5 A; 1RLQ C; 1M3A A; 1GCP A; 1CKA A; 4IIM A; 1UDL A; 2DRK A; 2YSQ A; 1OV3 A; 3ZL7 C; 3VS0 A; 1E6G A; 2DL4 A; 4D8D A; 1U3O A; 2LCS A; 1S1N A; 4J9D A; 1JEG A; 2DM1 A; 2RQT A; 1GL5 A; 2JM9 A; 3VS7 A; 4HXJ A; 1AWJ A; 3EHQ A; 4J9B A; 4Z88 A; 1SRL A; 2ENM A; 2O31 A; 1BB9 A; 1TUC A; 2KR3 A; 1M27 C; 2ED1 A; 2YUN A; 4AFQ C; 4GBQ A; 5IHI A; 5FWC A; 2KRN A; 2XMF A; 1ARK A; 1Z9Z A; 2FO0 A; 2V1R A; 2AKL A; 2DIL A; 3NMZ C; 1E6H A; 1X6G A; 2DRM A; 1ZSG A; 3EGU A; 3VS6 A; 1GBR A; 1UEC A; 2A08 A; 2JXB A; 2PZ1 A; 2ROL A; 4HVV A; 1NLP C; 1N5Z A; 4F17 A; 2EKH A; 1E7O A; 4RUG A; 2DL5 A; 1KJW A; 2J7I A; 3ULR B; 1UHF A; 2DA9 A; 4J9C A; 1JXM A; 1K4U S; 2JMA A; 1WA7 A; 4CC4 B; 2LNH B; 4FSS A; 1M8M A; 3M0P A; 3UA7 A; 2AK5 A; 2CSI A; 2IIM A; 3H0F A; 1JU5 C; 1YN8 A; 1K76 A; 2W0Z A; 4DEY A; 4QT7 A; 2DL3 A; 2VVK A; 1ZBJ A; 3PVL A; 1UTI A; 2PTK A; 2K2M A; 1RUW A; 4J9I A; 2RNA A; 2X3X D; #chains in the Genus database with same CATH topology 2YXY A; 2HQE A; 2BUD A; 2MPX C; 1QVF A; 1D0Z A; 3CC7 Q; 4F14 A; 1SSF A; 4BD3 A; 2DE0 X; 1OI1 A; 3CCJ Q; 1D1C A; 3J81 E; 1YJN T; 5FU7 C; 5D6X A; 2QYZ A; 4XAX B; 1ZUY A; 4J5Y A; 2XHC A; 3EH1 A; 1MV3 A; 1WGS A; 4OVA A; 5CVI A; 4AG1 C; 4JLI A; 2RHI A; 2FL7 A; 2J6O A; 1YWP A; 3OYB A; 4ZN3 A; 1D0Y A; 3A98 A; 4O6J A; 3H6Z A; 2HDA A; 2BZ8 A; 5GAO q; 4OF1 A; 3MCA B; 4J83 A; 2C0I A; 4KH1 B; 2YT6 A; 3KBG A; 4E7S A; 3CC2 A; 3J7A F; 2RMO A; 5GAM h; 3VRY A; 1BK2 A; 2BZY A; 2H3J A; 2EJ9 A; 4C0D B; 4PJN A; 1OUL A; 3NTH A; 4JUV A; 2DX1 A; 1C1A A; 3EG1 A; 3C4S A; 1U1S A; 4M7A A; 4LE9 A; 2QQR A; 3G1J A; 4M7A F; 2KRM A; 3TU4 K; 3QII A; 3QKJ A; 1W70 A; 1NEB A; 1YBY A; 2L0A A; 3OYN A; 3HP9 A; 3S6W A; 2OTJ A; 2OTL T; 2KXD A; 4RG2 A; 4PFP A; 5LL6 S; 2F2W A; 1OYX A; 1H3Z A; 1V1C A; 4C92 C; 3ME9 A; 4DBH A; 1YIJ T; 4A63 B; 1Q82 C; 8AT1 B; 2EQU A; 1K9M U; 2H3E B; 1WJQ A; 1VOM A; 5LJ3 g; 1TH7 A; 4J6X A; 4JJC A; 2FZK B; 1WXT A; 1M1K C; 1PRM C; 3QSU A; 1EIF A; 1G3T A; 2O2O A; 2DEU A; 3QZ9 B; 1Z9Q A; 3CQT A; 5J39 A; 2ZCF B; 4E7J A; 3X24 B; 1NZ9 A; 3VRZ A; 3EFO B; 3TQ7 P; 1U5S A; 2BE7 D; 2QEX T; 4F7U G; 1QKX A; 4CI0 C; 2EW3 A; 4RG8 A; 2KEA A; 3S3M A; 4C5I A; 3JCM h; 4E7Z A; 3JB9 G; 1YCS B; 4EIK A; 2ZAE A; 3SEM A; 5D6Y A; 2ESW A; 1LPL A; 1MUZ A; 2HAX A; 4FYW B; 5GAO m; 2LX7 A; 4ZGD B; 2GTJ A; 3RKY A; 2O4X A; 3AT1 B; 2BIV A; 2GGR A; 5HY6 A; 4J9E A; 5IHN A; 5IAY A; 2RI5 A; 3VS4 A; 3T9N A; 3O5Z A; 4YTL A; 1IGU A; 1M30 A; 1NJI C; 4JZ3 A; 5GMK l; 3OQ5 A; 4II1 A; 5KCH A; 4HVU A; 1VQM A; 5GAN f; 3DB3 A; 2RF0 A; 3TSW A; 2RQR A; 2FPF A; 1W6X A; 2VC8 A; 3CPF A; 3PVQ A; 2A28 A; 4DBQ A; 1K1Z A; 2ATC B; 3AHU A; 4A4F A; 4PKC C; 2EYZ A; 5GAN 3; 2GBQ A; 4X9C A; 1XNI A; 1PRL C; 1N8R U; 2P4R A; 2PQW A; 3QDR B; 2FEI A; 3KUF A; 3EHR A; 4XU0 A; 4JRK A; 1VQ4 T; 1O9S A; 2L2P A; 4LUE A; 3JCM d; 1QVG P; 2FRY A; 3M53 A; 5GMK h; 2MIO A; 2GNC A; 4AG2 C; 3UA6 A; 4BE0 A; 3OYF A; 2KDS A; 2M1H A; 4M7D D; 1R0C B; 1Q86 C; 4C5E A; 4RTZ A; 3DB4 A; 5A0D A; 4JPB W; 2X4W A; 2DYB A; 1KQ2 A; 2CT4 A; 2FPD A; 2DER A; 2AZS A; 3OSV A; 1MV0 B; 1RAB B; 4M75 C; 1ZSZ A; 2DEQ A; 3VV0 A; 2L3S A; 2XD0 A; 4Z02 A; 2DPP B; 2KBT A; 1UHC A; 3E1S A; 1WPY A; 2CP3 A; 2LDM A; 1JJ2 A; 1YI2 T; 2LVM A; 2HBW A; 3OYK A; 2K6D A; 4LD6 A; 1T0J A; 3NGP A; 4C8Q C; 3S3N A; 3CC2 T; 1HJD A; 1Q82 R; 2LQW A; 2G3R A; 3MHX A; 1M1K R; 3CCE Q; 2E5Q A; 4PJO E; 3RER A; 3NPF A; 4BAC A; 5IXB A; 3M4Y A; 2ABL A; 4AFZ C; 1X2Q A; 1GBQ A; 2YLB A; 3CCM A; 1NG2 A; 3VKI A; 3DKM A; 1WXB A; 4J7I A; 2EYX A; 4E2F B; 3EG9 B; 1JB0 E; 1K9M R; 2O4X B; 1VQ9 T; 2PU9 B; 3OYA A; 4F7U F; 3I56 Q; 1VQN A; 2O88 A; 2DTH A; 3BFM A; 1UGV A; 1WDX A; 2QA4 A; 9ATC B; 1M1F A; 5L8R E; 3C0C A; 1KD1 C; 4ZN1 A; 3VUB A; 2R57 A; 4M7D B; 3CMA T; 1FWZ A; 3FRN A; 3G71 A; 1YP5 A; 3JSC A; 1KC8 R; 4GLM A; 2K2V A; 3V7R A; 1QCO A; 2DIQ A; 1V29 B; 1I07 A; 2SEM A; 2DXC A; 1G83 A; 3CCL Q; 2HMA A; 1OZ2 A; 2KRS A; 3I56 A; 2XKO C; 5I22 A; 5GAN e; 2RPN A; 3ER0 A; 3M0T A; 5GJW B; 1UG1 A; 2XDD A; 1YHQ Q; 3R6N A; 3OYE A; 2DBM A; 4OP0 A; 3A5Z B; 1KK7 A; 3CEY A; 3UT1 A; 4OML A; 5CK9 A; 2FHD A; 3JCM W; 2KY9 A; 1BCM A; 2DO3 A; 5GAN d; 4PFO A; 2QGG A; 4PJO F; 5GAM f; 1QVF P; 2CS7 A; 1VQ7 A; 1UDL A; 2DRK A; 4V2S A; 3C12 A; 2Z0W A; 3SDZ A; 2EJG A; 2LCS A; 1WJS A; 2ZPE B; 1JEG A; 1VQL T; 2OX7 A; 1WHK A; 3CXC P; 2JM9 A; 2RH2 A; 4F7U A; 3G4S Q; 3FB9 A; 1SRL A; 2ENM A; 2O31 A; 1TUC A; 2KR3 A; 1M27 C; 2E65 A; 5IHI A; 5FWC A; 5CR2 A; 3C95 A; 2NUT B; 3JCM b; 4EMK B; 1X01 A; 2DIL A; 3NMZ C; 1TTH B; 3PMI A; 1ZSG A; 3EGU A; 4OB3 B; 3JB9 H; 3OYI A; 4F17 A; 3PMT A; 3I55 T; 4RKU E; 4MZP A; 4RUG A; 2DL5 A; 3V7C A; 1KJW A; 1UHF A; 2GFU A; 1K4U S; 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4CRI A; 2J6F A; 1RLP C; 2AHJ B; 2YRD A; 3DLL A; 2JNG A; 3I35 A; 2M51 A; 1NEG A; 4HCK A; 1SEM A; 4WTO B; 1ACM B; 2MWO A; 2C06 A; 1WZO A; 1KG1 A; 4X1V A; 4KT0 E; 4JS5 A; 1M2V A; 1G3S A; 3LWH A; 1BI0 A; 3CME A; 4FYY B; 1F1B B; 3CCS Q; 2DK3 A; 5LJ3 e; 1TSF A; 2PVO B; 1I81 A; 5CKF A; 1VQK T; 1Q81 R; 3C94 A; 4C0D C; 1CSK A; 2C0O A; 2MF2 A; 3PIP A; 3I55 A; 5GAN h; 2CKK A; 3EGX B; 4XQ3 A; 2L5Q A; 3H9N A; 3HL8 A; 1QCN A; 1KC8 C; 4B9X A; 3KXT A; 2VB6 A; 4E47 A; 3EGD B; 3REB B; 2K5L A; 4Q5W A; 3LX7 A; 4PK4 A; 1LCK A; 2P0P A; 1K8A R; 2KQW A; 3NHN A; 3OMC A; 2FYK A; 3DLM A; 5KCO A; 1YI2 Q; 4ELY C; 1TUG B; 2LJ0 A; 4XU1 A; 3BE3 A; 4UC4 A; 3SFM A; 1NPP A; 1YJ9 A; 2DXU A; 1AWW A; 4MML A; 2LZ6 B; 4VUB A; 1Y07 A; 2QDL A; 1CKB A; 1M9S A; 2A37 A; 4Z8A A; 1X2K A; 4DBR A; 4BI4 A; 4KGV B; 2DJQ A; 1QVF S; 1GRI A; 3MPU B; 1G3Y A; 2KGT A; 3E9G A; 2FG0 A; 3INZ A; 3N5B B; 1UJY A; 1S72 Q; 2FPE A; 5EC7 A; 3M55 A; 2E70 A; 3M0U A; 1H92 A; 1JXO A; 4PLL A; 5GAN 5; 5FU7 B; 3CBM A; 1Q95 G; 2OJ2 A; 1SPK A; 2O9S A; 4JRP A; 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