The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
61
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structure length |
61
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Chain Sequence |
LFVALYDYQADRWTDLSFHKGEKFQILDASPPGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVDSIQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase/de novo protein
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| source organism |
Homo sapiens
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| publication title |
Generation, Characterization and Structural Data of Chymase Binding Proteins Based on the Human Fyn Kinase SH3 Domain.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
CHYMASE
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| total genus |
11
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| structure length |
61
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| sequence length |
61
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-01-23 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1ZUK A; 2DBM A; 2RQV A; 1VYU A; 2FO0 A; 2V1R A; 4QT7 A; 2KRO A; 1VYT A; 2KNB B; 5HCK A; 5L23 A; 2HSP A; 1PHT A; 1ZSG A; 2GQI A; 4JZ3 A; 4HVV A; 1PWT A; 4AFZ C; 1KSW A; 2CT4 A; 1AD5 A; 2FRY A; 2H8H A; 1OPK A; 2ROT A; 1W70 A; 4Z88 A; 1Y57 A; 2OAW A; 3VRY A; 2LJ3 A; 3EGU A; 1G2B A; 1QWE A; 1S1N A; 4RTW A; 3LH5 A; 2K2M A; 1WA7 A; 3REA B; 2O31 A; 3M0S A; 4D8D A; 3M0Q A; 4ZNX A; 4OMO A; 1UDL A; 2ENM A; 3VRZ A; 2C0O A; 2DX1 A; 4HCK A; 1QKX A; 2EYZ A; 3M0R A; 5EC7 A; 1K76 A; 3EHR A; 1ZUY A; 4J9F A; 1UUE A; 4JJB A; 2LCS A; 3VS5 A; 3M0T A; 2CSQ A; 3H41 A; 2HEQ A; 1NLO C; 2D8H A; 4AFU C; 2LMJ A; 1YP5 A; 2KXD A; 1MUZ A; 4M4Z A; 2LNH B; 1GFD A; 1AWO A; 4RTX A; 4ESR A; 2EYX A; 5GJV B; 2LZ6 B; 1JXO A; 3VS6 A; 1U06 A; 2EGE A; 4Z89 A; 1WXU A; 2JM9 A; 2GNC A; 5IXB A; 3H0F A; 4AG2 C; 3VS7 A; 1SPK A; 3EG2 A; 3NGP A; 3ULR B; 4J9I A; 1WFW A; 5IHI A; 1K0X A; 1PKT A; 2YUQ A; 2ROL A; 4ORZ A; 2RMO A; 5GJW B; 1FMK A; 1JU5 C; 2DJQ A; 1WI7 A; 2C0T A; 4J9H A; 2FRW A; 2G6F X; 1M30 A; 1ABO A; 1UE9 A; 2KRN A; 3TVT A; 2DE0 X; 2FG0 A; 1H8K A; 1E7O A; 2C0I A; 3NMZ C; 1WXB A; 3TSW A; 1X2Q A; 1W6X A; 1AWW A; 1TG0 A; 2DNU A; 1G83 A; 1ZUU A; 2J05 A; 2KBT A; 2J6O A; 1M3C A; 2CUD A; 2F2W A; 3H0I A; 1AZG B; 1UHC A; 1X6B A; 2RPN A; 4HVU A; 2DL4 A; 1VA7 A; 1VYV A; 1BK2 A; 3NHN A; 2KYM A; 2JXB A; 2LX7 A; 1QWF A; 1T0J A; 3FJ5 A; 3QWX X; 1KFZ A; 1X43 A; 3UAT A; 2VWF A; 1UEC A; 4Z8A A; 4LN2 A; 4E6R A; 2B86 A; 2AZS A; 2EYW A; 1M3B A; 1WXT A; 1ZX6 A; 2JT4 A; 2DRM A; 2DF6 A; 2VKN A; 1GBQ A; 1XOV A; 1I0C A; 2F2X A; 4F17 A; 1RLP C; 2X3X D; 2DM1 A; 1B07 A; 1IO6 A; 1PRL C; 1NEB A; 2JW4 A; 3REB B; 1W1F A; 4CC2 A; 3SHW A; 2MOX A; 2RQU A; 2FPD A; 4IIM A; 1T0H A; 3NPF A; 2L3P A; 3ZL7 C; 2M0Y A; 1BB9 A; 1Z9Q A; 2YDL A; 3EG1 A; 3M0P A; 5IHK A; 4AFS C; 5IXF A; 2CH4 W; 4DEY A; 1I1J A; 2DL3 A; 1WIE A; 2D0N A; 2GGR A; 4F14 A; 5FWB A; 2HCK A; 2FPE A; 2DLP A; 1X6G A; 2QDL A; 1JXM A; 4JJC A; 3U23 A; 2DL7 A; 2KT1 A; 1CKB A; 1PKS A; 2M51 A; 1AWJ A; 2K3B A; 1U3O A; 4GBQ A; 1Y0M A; 1T3L A; 1BBZ A; 3I5R A; 2L3Q A; 2KEA A; 2DMO A; 3SEM A; 3H0H A; 1FYN A; 4JJD A; 1ZBJ A; 1RI9 A; 2CT3 A; 1UGV A; 4CC3 A; 2BZX A; 2J6F A; 2EYY A; 1RLQ C; 3O5Z A; 2OI3 A; 2DBK A; 4LNP A; 4J9C A; 1UHF A; 2CH4 A; 2EBP A; 2W0Z A; 4K11 A; 4KRT A; 2X3W D; 4CC4 B; 1K4U S; 1SSH A; 2A08 A; 1QKW A; 2YT6 A; 2ED0 A; 3R6N A; 1NEG A; 1OPL A; 4WCI A; 3UA6 A; 1NYG A; 2L2P A; 5I22 A; 2O9S A; 4DEX A; 3QWY A; 2ABL A; 1YN8 A; 3C0C A; 1AZE A; 1JQQ A; 1YWP A; 5ECA A; 3VS3 A; 2A28 A; 2DVJ A; 1OV3 A; 2ESW A; 2JMC A; 2KR3 A; 2FPF A; 2HBW A; 3M0U A; 1AWX A; 2EGC A; 2A36 A; 3UF4 A; 4JZ4 A; 1BU1 A; 3PE0 A; 2VVK A; 2NUZ A; 1JEG A; 1X27 A; 2XMF A; 3I9Q A; 4F16 A; 2KT8 A; 1WDX A; 4EIK A; 1EFN A; 1M27 C; 1UTI A; 5FW9 A; 2RQW A; 4RTT A; 2FEI A; 4X1V A; 1SRM A; 3KFV A; 4RTY A; 3EG0 A; 2BZ8 A; 1K1Z A; 1WLP B; 1K9A A; 1KIK A; 1GBR A; 3PVL A; 4J9D A; 2YSQ A; 1WX6 A; 2K7A A; 2BTT A; 2CSI A; 2DIL A; 1NG2 A; 2HDA A; 4OMP A; 3I35 A; 1MV3 A; 4JPB W; 1LCK A; 1QCF A; 1RUW A; 2E5K A; 1UG1 A; 4J9E A; 1PNJ A; 1ABQ A; 4OMN A; 1NLP C; 1OEB A; 1V1C A; 2JM8 A; 2RNA A; 2YUP A; 2ED1 A; 2MCN A; 2J7I A; 2L0A A; 3RNJ A; 3EHQ A; 2PZ1 A; 1GCQ C; 2EKH A; 2I0N A; 2KXC A; 1YNZ A; 2AKL A; 2EPD A; 2RN8 A; 3VS2 A; 2GBQ A; 1ARK A; 1B3Q A; 2L3S A; 3VS1 A; 2O88 A; 5I11 A; 1H92 A; 2J06 A; 1A0N B; 1UJ0 A; 2ECZ A; 1GL5 A; 1GCQ A; 2RQR A; 1CSK A; 2DA9 A; 3EG3 A; 1AVZ C; 1NM7 A; 1UFF A; 2EQI A; 4AG1 C; 1SHG A; 2W10 A; 4LE9 A; 1U5S A; 4Y92 A; 3RBB B; 4HVW A; 3THK A; 2YUO A; 3UA7 A; 1TUC A; 2D8J A; 2LJ1 A; 2SEM A; 2RF0 A; 2KGT A; 1SEM A; 1TUD A; 4J9B A; 2LQN A; 1CKA A; 2P4R A; 4AFQ C; 4FSS A; 2AK5 A; 2LJ0 A; 1JO8 A; 2V1Q A; 2KRS A; 1YWO A; 1WYX A; 2IIM A; 2PTK A; 2DL5 A; 4J9G A; 2OJ2 A; 2KRM A; 2NWM A; 4RTU A; 4CC7 A; 1NYF A; 2O9V A; 2GTJ A; 1HSQ A; 2JTE A; 1GFC A; 3A98 A; 2D1X A; 1H3H A; 1SRL A; 1PRM C; 2CUB A; 4OMQ A; 1K0S A; 1Z9Z A; 5FWC A; 1N5Z A; 2CDT A; 2K79 A; 4LUE A; 2J6K A; 4OMM A; 1E6G A; 2EVR A; 1OOT A; 2EGA A; 4OML A; 1HJD A; 1AEY A; 2JS0 A; 3PVQ A; 3CQT A; 2KYB A; 2JS2 A; 1QLY A; 4GLM A; 4RTV A; 2GTO A; 4D8K A; 2YUN A; 2LQW A; 4RTZ A; 2DL8 A; 2EW3 A; 3JV3 A; 5IHN A; 2CRE A; 2SRC A; 5IH2 A; 2KE9 A; 1GCP A; 2RQT A; 3GBQ A; 1ZLM A; 1J3T A; 2DYB A; 1X69 A; 2JMA A; 1UJY A; 2O2O A; 1T3S A; 1M8M A; 2DRK A; 3IQL A; 1E6H A; 1MV0 B; 3VS0 A; 2F2V A; 2AKK A; 2K9G A; 1HD3 A; 2LP5 A; 2PNI A; 3VS4 A; 1I07 A; 4IIO A; 2MIO A; 1KJW A; 2BZY A; 2A37 A; 3I5S A; 4A63 B; 1AOJ A; 1YCS B; 2AZV A; 2K6D A; 4R0K A; 1SHF A; 4HXJ A; 4RUG A; 1GRI A; 3TSZ A; 1M3A A; 4LUD A; 1X2K A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2XD0 A; 1OU8 A; 3FLG A; 5KYW B; 3QUI A; 1VQ4 A; 2V1R A; 4ZTF A; 3VUB A; 4KT0 E; 3CPW P; 3HRS A; 4PFZ A; 2E70 A; 3VV0 A; 1VQP A; 4HCB A; 1MGQ A; 1YI2 A; 5CR2 A; 1OPK A; 2ROT A; 5FU7 B; 5CKH A; 5GAN g; 4C92 D; 3TU4 K; 1HYO A; 2YRD A; 1S1N A; 2RHZ A; 4DBQ A; 3INZ A; 3LH5 A; 5LJ3 j; 1VQ9 Q; 3G6E T; 2L5Q A; 3M55 A; 1TU0 B; 5GAN d; 1VQM Q; 4F7U F; 5DLQ E; 3FDR A; 3G71 T; 1QVG P; 3TRE A; 3L2V A; 3OYF A; 3QJY A; 4OMO A; 2HKQ B; 3OYN A; 2DIG A; 2R57 A; 4CI0 C; 3CBO A; 2QK0 A; 5LJ5 g; 3CME Q; 1QKX A; 2Z0W A; 5EC7 A; 3EHR A; 1YIT Q; 4FW1 A; 2LCS A; 2ZGW A; 3VS5 A; 2PVD B; 5LJ5 d; 2E6N A; 3M0T A; 4PJM A; 1S72 T; 5M9O A; 3OS0 A; 5IAY A; 4AFU C; 1QCN A; 3OS2 A; 1XNI A; 4DOV A; 2GFU A; 5DY9 A; 4MDX A; 4MZM A; 4M7A B; 2EYX A; 5GAO r; 3OW2 P; 1YIJ T; 4BAC A; 1Q7Y U; 2LZ6 B; 1OZ3 A; 2EGE A; 2JM9 A; 2QTV A; 3H0F A; 2BE9 B; 5J26 A; 3DLL A; 5GAN 4; 3EG2 A; 4M78 B; 4M75 A; 1IZ6 A; 1PM3 A; 3CCL Q; 1FMK A; 2QEX A; 4J9H A; 2FRW A; 1M30 A; 2COZ A; 2NUP A; 4M7A A; 2DE0 X; 1N8R R; 2C0I A; 1WXB A; 2CP7 A; 1TG0 A; 3G1J A; 3MKD A; 2J05 A; 2KBT A; 1MND A; 1BI0 A; 4M78 A; 2MWP A; 1XJW B; 2X4X A; 2DL4 A; 3OYY A; 1BK2 A; 3N5B B; 3NHN A; 3WVE B; 3FJ5 A; 2DAQ A; 3UAT A; 2VWF A; 3GNF B; 4LN2 A; 2FL7 A; 2EYW A; 2QI2 A; 3CD6 Q; 4C8Q G; 2WSC E; 2QA4 T; 1I0C A; 4F17 A; 2DYI A; 2X3X D; 3C95 A; 1PRL C; 1W1F A; 5I21 A; 4JRK A; 2MOX A; 2DIQ A; 4RG2 A; 2FPD A; 2L89 A; 3KUF A; 2NLU A; 2M0Y A; 3GP8 A; 4EMK A; 3T9N A; 3UDC A; 3LGL A; 2DJZ A; 4M77 E; 4N0A C; 3AHU A; 4RCB A; 2DL3 A; 5GAN f; 1NE8 A; 2E10 A; 4F14 A; 5GAN e; 5LJ3 g; 2FPE A; 2R58 A; 3EGX B; 4JJC A; 3CCR T; 3S3M A; 2KT1 A; 2C06 A; 5LJ3 d; 4GBQ A; 3RIR A; 3I56 T; 3OS5 A; 1FYN A; 4BUG A; 5LJ5 f; 3OYD A; 3QBY A; 2DXT A; 5DM7 R; 3E19 A; 5D6W A; 3S6W A; 6AT1 B; 5LJ5 e; 1ZBJ A; 4CC3 A; 2BZX A; 3OBW A; 2LCC A; 1D09 B; 5CIU A; 8AT1 B; 3A8M B; 3I56 A; 3O5Z A; 3CC7 Q; 4Y91 A; 1SF9 A; 2O01 E; 2Y4X A; 4LNP A; 1FXX A; 2OTL T; 1B34 A; 1UHF A; 2RJD A; 2XI9 A; 4C5H A; 4Z02 A; 1M2V A; 1WNL A; 4CC4 B; 1SSH A; 1OI1 A; 2VAS A; 2VV5 A; 2K5I A; 1OPL A; 5A2Q E; 3UA6 A; 2L2P A; 3LYI A; 4LXC A; 4DEX A; 1U1T A; 3MO8 A; 1YN8 A; 1AZE A; 1I81 A; 5KYN A; 2M02 A; 3JAM E; 1K9M R; 3EAE A; 1Q95 G; 4DBR A; 4O6J A; 1WZO A; 2ZPF B; 2M9U A; 1G3Y A; 2MYS A; 2GQV A; 2FPF A; 4BDZ A; 3M0U A; 3CPF A; 2DER A; 1AWX A; 2G3R A; 3UF4 A; 2HQH A; 1VQ8 A; 4ELY C; 3JCM P; 1JEG A; 2BUD A; 3I9Q A; 3EFO A; 4F16 A; 2QQR A; 4PJO G; 1BI2 A; 2KT8 A; 5GAO n; 1VQ9 T; 1FX7 A; 3OMG A; 1VQM T; 2PVO B; 5GMK h; 2RO0 A; 2FEI A; 2L3R A; 3C94 A; 3G4S Q; 1XQH A; 1SRM A; 3MP1 A; 2BZ8 A; 1K1Z A; 5FLX E; 1K9A A; 3E9F A; 3CME T; 1WX6 A; 4EMK C; 2EQU A; 3QO3 A; 1YJN Q; 1NG2 A; 4A4K A; 3P8H A; 1VQM A; 1YIT T; 4IKF A; 1MV3 A; 4JPB W; 2O4X A; 4DA4 A; 1LCK A; 1QCF A; 2P4T A; 4M7D B; 1RUW A; 2E5K A; 2MAM A; 2JTF A; 4J9E A; 1V1C A; 2RNA A; 2R5M A; 2YUP A; 2HZY A; 1N9R A; 3CME A; 2RH2 A; 2K3X A; 3EHQ A; 4BY6 B; 2KXC A; 4M77 B; 2HQX A; 1ZA2 B; 3VS2 A; 2GBQ A; 3RDV A; 1Q86 U; 2RK1 A; 3VS1 A; 5C0M A; 1H92 A; 2J06 A; 3CC4 A; 1A0N B; 2JN0 A; 4GY5 A; 2RQR A; 3OSV A; 3V8K A; 1TOV A; 2EJ9 A; 2DA9 A; 3L42 A; 2EQI A; 1VQP Q; 3CCL T; 3RBB B; 3QZ9 B; 3CCQ A; 1YI2 Q; 3THK A; 3UA7 A; 4AT1 B; 4C92 A; 1K8A C; 2LQ8 A; 2SEM A; 2P0P A; 2KGT A; 2RHU A; 4XTX A; 1UGS B; 1Q81 U; 1KG1 A; 4OF1 A; 4FSS A; 3H6Z A; 2AK5 A; 2V1Q A; 2KRS A; 4N4G A; 2CP2 A; 2RA2 A; 2CGH A; 1KQS S; 2ZPB B; 3QXE B; 4PKC C; 2OJ2 A; 4RMO A; 2RHX A; 3ME9 A; 4RTU A; 3LWI A; 1IB8 A; 1MNE A; 2D1X A; 4XAX B; 3H9N A; 1H3H A; 2CZ1 B; 2LVM A; 1KHI A; 1OZ2 A; 2NUT B; 1E6G A; 2EVR A; 2DXC A; 2DXB A; 2ZAE A; 1HJD A; 3PVQ A; 4BDY A; 3CD6 T; 4RTV A; 3L2Z A; 2GTO A; 2YUN A; 1ZSZ A; 2LQW A; 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1VQ5 A; 3SWN A; 4C5E A; 5GJV B; 3G4S T; 1JXO A; 4J7F A; 4Y28 E; 2KI7 A; 4Z89 A; 5KE2 A; 1OYX A; 3SB2 A; 1XTD A; 4M78 E; 3A8O B; 1YJN T; 3ULR B; 1WFW A; 1D3B A; 1PKT A; 3NFC A; 2ROL A; 5AT1 B; 4F04 B; 2JJ9 A; 2DFU A; 1IHV A; 4A53 A; 3G4S A; 2DJQ A; 1WI7 A; 1VQN Q; 1Q82 R; 2G6F X; 4XTY A; 3RES A; 1WHJ A; 4R55 A; 1UE9 A; 2KRN A; 2RJE A; 1M8V A; 1YJN A; 1B7T A; 1H8K A; 1WHK A; 4FM4 B; 4BI4 A; 1W6X A; 3I55 A; 1AWW A; 3GLX A; 2DNU A; 1C0M A; 3MEV A; 1G83 A; 4O5V A; 1M3C A; 2F2W A; 3H0I A; 1UHC A; 3VJP A; 2XIC A; 1X6B A; 2RPN A; 4HVU A; 4GLK A; 2DZ9 A; 4OGC A; 1VQP T; 1VYV A; 4L5G A; 2KYM A; 2JXB A; 1YI2 T; 4LDU A; 1D0X A; 1G3T A; 2RI5 A; 4MMK A; 4HA8 A; 1BI3 A; 1VQ8 Q; 3QWX X; 2KQW A; 1X43 A; 3DB3 A; 4ATO A; 4Z8A A; 1D1C A; 2AZS A; 1M3B A; 2EAY A; 5C6S A; 1ZX6 A; 3CCJ A; 2DF6 A; 1TSF A; 4OGE A; 1K9M U; 4CC2 A; 2F1L A; 2QG9 B; 2FVU A; 2RQU A; 3QJ6 A; 1QVF P; 1T0H A; 3NPF A; 2L3P A; 5KYX A; 3ZL7 C; 1RAI B; 2H3E B; 2XDD A; 3EG1 A; 4XU2 A; 3JCM c; 2QAS A; 5IHK A; 3GNG A; 4AFS C; 2P84 A; 2CH4 W; 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