The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
61
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structure length |
61
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Chain Sequence |
LFVALYDYQADRWTDLSFHKGEKFQILDASPPGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVDSIQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
CHYMASE
|
| publication title |
Generation, Characterization and Structural Data of Chymase Binding Proteins Based on the Human Fyn Kinase SH3 Domain.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| molecule tags |
Hydrolase/de novo protein
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| total genus |
11
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| structure length |
61
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| sequence length |
61
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-01-23 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3SHW A; 1JU5 C; 2EYX A; 1K4U S; 1OOT A; 3QWY A; 4CC7 A; 4HVU A; 1PRM C; 1VA7 A; 2A28 A; 2C0I A; 2LP5 A; 2K7A A; 1X27 A; 2VKN A; 2AKL A; 4LN2 A; 4HXJ A; 1K76 A; 1J3T A; 3PVL A; 1H3H A; 4OMM A; 2SEM A; 3REB B; 2FO0 A; 3I5S A; 3H0F A; 1Z9Z A; 1PRL C; 2YSQ A; 2KR3 A; 3VRY A; 2KNB B; 2CSQ A; 2EYY A; 2KYB A; 2X3X D; 4ESR A; 1YCS B; 5GJW B; 1OPK A; 4OMN A; 1SHG A; 1Y57 A; 3PE0 A; 4AG2 C; 4E6R A; 1WFW A; 1I07 A; 2J05 A; 1UDL A; 1AVZ C; 2PTK A; 1T3S A; 1AWW A; 2CH4 A; 2DL7 A; 4RTZ A; 1IO6 A; 3CQT A; 2NWM A; 1AWO A; 1JQQ A; 2EBP A; 2DX1 A; 2EQI A; 5EC7 A; 1HD3 A; 1SEM A; 1UJ0 A; 2MCN A; 2ECZ A; 2RPN A; 1Y0M A; 2JTE A; 4DEX A; 4ORZ A; 1FMK A; 4OMQ A; 2FEI A; 4J9I A; 4KRT A; 1WA7 A; 2M51 A; 2YUN A; 4JZ3 A; 2YUO A; 2W10 A; 4LE9 A; 3SEM A; 2YT6 A; 3M0S A; 2BTT A; 5ECA A; 2F2W A; 1X2Q A; 1UHF A; 5L23 A; 5I22 A; 1W1F A; 4F17 A; 2FRW A; 1GFD A; 2W0Z A; 2GTJ A; 3VS1 A; 4Z8A A; 2EKH A; 2RQW A; 1JEG A; 4RTW A; 1JXO A; 2B86 A; 3M0P A; 1KIK A; 1H8K A; 2DE0 X; 2EGC A; 1VYV A; 1RLQ C; 1BK2 A; 2DLP A; 2EYW A; 1UEC A; 3TSZ A; 1U3O A; 4WCI A; 1CKA A; 5IHI A; 2KT8 A; 1ABQ A; 3EHQ A; 1CSK A; 1MUZ A; 4CC4 B; 1S1N A; 1JXM A; 1AWJ A; 1WXT A; 2D8J A; 3TVT A; 1AZE A; 1T0H A; 2ED0 A; 2JS2 A; 3NPF A; 3NHN A; 5IHN A; 4HVW A; 4M4Z A; 2O88 A; 2AKK A; 2O9V A; 1AEY A; 2FPD A; 2YUP A; 3UA6 A; 3LH5 A; 2D0N A; 4J9F A; 4HVV A; 2ROL A; 3O5Z A; 2VWF A; 1A0N B; 4GLM A; 3I35 A; 1UG1 A; 2KRN A; 2LNH B; 1QKW A; 2HBW A; 2C0O A; 4R0K A; 1ZUU A; 2X3W D; 5FWC A; 2YDL A; 2H8H A; 1X2K A; 1QLY A; 1OPL A; 1AD5 A; 1NG2 A; 4RTU A; 1QCF A; 1VYT A; 2RMO A; 3NGP A; 2BZX A; 5FWB A; 3PVQ A; 4J9B A; 3QWX X; 5FW9 A; 3UAT A; 1BBZ A; 1PNJ A; 2ED1 A; 2JS0 A; 1T3L A; 3EHR A; 2AZS A; 2BZ8 A; 1TG0 A; 1WXB A; 2CRE A; 4RTX A; 4RTT A; 2DL4 A; 1PHT A; 2CH4 W; 4OML A; 4X1V A; 2F2X A; 1K0X A; 2HSP A; 3ULR B; 1QWF A; 3M0R A; 2O9S A; 2EGE A; 1WIE A; 5I11 A; 2L3S A; 3TSW A; 2EW3 A; 1ZX6 A; 1OV3 A; 1NEB A; 1ZBJ A; 2A36 A; 2DVJ A; 1M3C A; 4J9H A; 1RUW A; 2DBM A; 1LCK A; 1GL5 A; 1X6B A; 3JV3 A; 3RNJ A; 4CC2 A; 2NUZ A; 1BB9 A; 1JO8 A; 1GBR A; 2L2P A; 1PKS A; 2BZY A; 1SPK A; 1I1J A; 4AG1 C; 1UFF A; 2SRC A; 3ZL7 C; 2I0N A; 1AZG B; 2ABL A; 2FG0 A; 2CUD A; 1NYG A; 1UGV A; 1M27 C; 2J6O A; 1E7O A; 2LJ0 A; 2CT3 A; 2GGR A; 2GQI A; 4A63 B; 2AK5 A; 5IXB A; 2AZV A; 1SRL A; 1CKB A; 3I5R A; 1FYN A; 4OMP A; 3M0Q A; 2C0T A; 3EG2 A; 2RQV A; 2V1Q A; 1M8M A; 2MIO A; 2V1R A; 2KEA A; 3EG3 A; 1B07 A; 4LUD A; 2LMJ A; 3H41 A; 2E5K A; 2CUB A; 1RI9 A; 1G2B A; 2HDA A; 1NLP C; 4J9G A; 4RTY A; 1TUD A; 4OMO A; 3REA B; 1SHF A; 2G6F X; 2PZ1 A; 2K6D A; 4JZ4 A; 2KYM A; 3U23 A; 4JJC A; 2ENM A; 2PNI A; 1GCQ A; 1ABO A; 4DEY A; 4JPB W; 1SSH A; 1ZSG A; 2J06 A; 2KT1 A; 1AOJ A; 4RTV A; 1ZUK A; 1WDX A; 2A37 A; 2HCK A; 2DM1 A; 3I9Q A; 1T0J A; 2MOX A; 2O31 A; 1X69 A; 2RQT A; 3EG0 A; 1GCQ C; 2ESW A; 1K0S A; 4AFS C; 2D1X A; 1SRM A; 1EFN A; 2DL5 A; 4QT7 A; 2EPD A; 1KJW A; 1QWE A; 2GNC A; 4GBQ A; 2JW4 A; 1HSQ A; 1X43 A; 2RNA A; 2DRK A; 2LZ6 B; 2JT4 A; 4CC3 A; 2DBK A; 1W6X A; 2EYZ A; 4FSS A; 2JM9 A; 4J9D A; 4EIK A; 4HCK A; 4Z88 A; 3NMZ C; 4D8K A; 2OAW A; 4Y92 A; 2OJ2 A; 2IIM A; 2L3P A; 2K79 A; 1UHC A; 3RBB B; 2DMO A; 2RQU A; 2L3Q A; 2RF0 A; 3FJ5 A; 3VS0 A; 2A08 A; 1VYU A; 1M3B A; 1OEB A; 2VVK A; 1PWT A; 1E6H A; 4ZNX A; 1G83 A; 2EGA A; 2KXD A; 1WYX A; 2DF6 A; 2P4R A; 5GJV B; 1BU1 A; 3THK A; 2K9G A; 2DL8 A; 1GRI A; 3R6N A; 4LUE A; 2LJ3 A; 1X6G A; 4F16 A; 1V1C A; 1YWO A; 2DA9 A; 1M3A A; 1K1Z A; 1Z9Q A; 2DL3 A; 2KE9 A; 3GBQ A; 1H92 A; 1YP5 A; 3H0H A; 5IH2 A; 1M30 A; 2CDT A; 2KRM A; 2GBQ A; 4IIM A; 4F14 A; 4Z89 A; 2K3B A; 1MV0 B; 2RQR A; 2LQN A; 2DNU A; 2K2M A; 4RUG A; 2JM8 A; 2QDL A; 3UA7 A; 2LJ1 A; 2DJQ A; 1UE9 A; 1ZLM A; 2F2V A; 3EG1 A; 2ROT A; 3VRZ A; 1HJD A; 1ZUY A; 1UUE A; 2XMF A; 3C0C A; 1GCP A; 1GFC A; 4D8D A; 1K9A A; 1AWX A; 1QKX A; 2D8H A; 1YNZ A; 2YUQ A; 1TUC A; 5HCK A; 1MV3 A; 1U5S A; 2FPE A; 1KFZ A; 1WLP B; 2FPF A; 2CSI A; 1XOV A; 1ARK A; 4AFZ C; 3IQL A; 2DIL A; 4J9E A; 2DYB A; 1NLO C; 1N5Z A; 1NM7 A; 3M0U A; 2KGT A; 2M0Y A; 1KSW A; 2RN8 A; 2HEQ A; 5IXF A; 2CT4 A; 3EGU A; 4IIO A; 3UF4 A; 2LX7 A; 1RLP C; 2J7I A; 2KXC A; 4JJD A; 3VS2 A; 1WXU A; 3VS6 A; 2L0A A; 1GBQ A; 1NEG A; 2FRY A; 1UTI A; 3VS3 A; 4AFU C; 1NYF A; 4AFQ C; 1I0C A; 2JMA A; 4JJB A; 2JMC A; 3VS5 A; 2KBT A; 3M0T A; 2J6K A; 4LNP A; 1YN8 A; 2DRM A; 1B3Q A; 1YWP A; 2J6F A; 2JXB A; 3VS7 A; 2OI3 A; 1E6G A; 4K11 A; 2LQW A; 2KRS A; 3H0I A; 3VS4 A; 1WI7 A; 1UJY A; 2LCS A; 2GTO A; 5IHK A; 3A98 A; 2O2O A; 1W70 A; 2EVR A; 3KFV A; 1PKT A; 1WX6 A; 1U06 A; 2KRO A; 4J9C A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1JU5 C; 3EFS A; 1K4U S; 4CC7 A; 2DO3 A; 4HVU A; 1PRM C; 1PD0 A; 5KYU A; 2EQK A; 1YIT A; 2C0I A; 2LP5 A; 4BI8 B; 2EIF A; 2OTL T; 2KAF A; 2KDS A; 1J3T A; 3NTH A; 3PVL A; 1YJW A; 4HCC A; 3JCM d; 2EKO A; 2QG9 B; 1YFN A; 2K5F A; 1Q86 U; 5IAY A; 4HKE A; 1WJS A; 2E3H A; 1PRL C; 3A8G B; 5CO7 A; 4HCZ A; 4KH0 B; 3GPL A; 2EYY A; 4AMC A; 2X3X D; 1PM3 A; 4M75 C; 2DXC A; 1VQ7 A; 3I55 T; 1SHG A; 3HRS A; 1UDL A; 3EG9 A; 1T3S A; 1AWW A; 1XTD A; 4LDW A; 2DL7 A; 3AT1 B; 4BD3 A; 4OF1 A; 1JQQ A; 2QXF A; 4C8Q G; 3CC2 Q; 5I2M A; 5GAN 8; 4PFO A; 5GAN 6; 5GAO n; 2ECZ A; 3CME Q; 1Y0M A; 3CBM A; 2BUD A; 4FCY A; 1MGQ A; 2RO0 A; 4OMQ A; 1KD1 C; 4BE0 A; 4KRT A; 4B9W A; 1QMC A; 2YUN A; 3O8V A; 4JZ3 A; 2ZPF B; 2VC8 A; 2W10 A; 1VQK Q; 2BTT A; 4Q5W A; 3C12 A; 3WXM B; 1VQO T; 2F1L A; 2F2W A; 2MPX C; 1UHF A; 5L23 A; 3JB9 H; 3GNG A; 3PGG A; 2DIQ A; 3RR6 A; 2DER A; 2VGN A; 2E41 A; 1GFD A; 2GTJ A; 5LJ3 h; 1TS9 A; 3VS1 A; 1VQL Q; 1W2B S; 1Y7X A; 2DK3 A; 4PLI A; 1M1K C; 2RQW A; 4R56 A; 1JEG A; 4RTW A; 3OBY A; 1H8K A; 2EGC A; 3L2V A; 2VXE A; 1UEC A; 5KYU B; 1JBM A; 3PMT A; 3S3M A; 4L6V 5; 3CCQ A; 3EHQ A; 3HTR A; 1CSK A; 1MUZ A; 1S72 A; 1S1N A; 1D1A A; 5FU7 B; 1R8O B; 1WXT A; 1K8A U; 2JS2 A; 3VYH B; 4ZTJ A; 2F5T X; 2QI2 A; 4M4Z A; 2AKK A; 2LVM A; 1Q95 G; 2V8I A; 1PD1 A; 1AEY A; 1OQK A; 2FPD A; 4M77 G; 4HVV A; 2VWF A; 3CC2 T; 2P0P A; 2NLU A; 2MI6 A; 3M56 A; 4AT1 B; 2R5M A; 4Y28 E; 3EFO A; 5GMK m; 3CME T; 1IGU A; 3RDV A; 3CCV Q; 3FRN A; 3EG9 B; 4OB0 B; 3OYF A; 1QLY A; 1AD5 A; 3GLX A; 3CCM Q; 2QQB A; 1QCF A; 1MMN A; 3X26 B; 1VQK T; 8AT1 B; 2HQX A; 1VQ6 A; 2PUK B; 3GIB A; 1U1T A; 2OTJ Q; 3DB3 A; 2JS0 A; 1T3L A; 2AIR B; 2AZS A; 3H9N A; 2PVO B; 2KK4 A; 3QUI A; 1VQL T; 1ZSZ A; 2PQW A; 1YIJ Q; 3EH2 A; 4X1V A; 1RAH B; 3MP8 A; 1W2B P; 3M57 A; 4A4E A; 2HSP A; 1K0X A; 5DLO A; 2R58 A; 2O9S A; 4M7A C; 4M7D G; 2E10 A; 2O4X A; 5I11 A; 1B34 A; 4A4F A; 4M78 C; 2DXB A; 5KE2 A; 1YI2 Q; 1KHI A; 5AYF A; 1UGQ B; 3SDZ A; 1NEB A; 4RCC A; 1M5Q 1; 2RK2 A; 3KUF A; 4NOY A; 1GBR A; 3LH0 A; 2L2P A; 4E7Z A; 1PKS A; 2M0O A; 3BDL A; 3CCU A; 5LJ3 j; 3OYK A; 4E47 A; 4RG2 A; 3BFM A; 4EDU A; 4CRI A; 2SRC A; 1N8R U; 4M75 E; 1IRE B; 2I0N A; 2ABL A; 2FG0 A; 2HZY A; 2FYK A; 1EIF A; 3QDR B; 2DTH A; 2PUO B; 3CXC A; 2CT3 A; 1BCO A; 4LXC A; 3CCV T; 1QQJ A; 4A63 B; 5FU6 C; 2QQ9 A; 2AZV A; 2ZPB B; 3CCM T; 1X75 C; 4LDY A; 1M8V A; 3M0Q A; 1KC8 C; 3JB9 D; 1SF9 A; 2MIO A; 5DLQ E; 2OTJ T; 2AHJ B; 3CPW A; 3V8L A; 4IUV A; 4ELY C; 3MET A; 5J3B A; 3P8B B; 1K73 C; 1VQ8 Q; 2G6F X; 2PZ1 A; 1YIJ T; 1Q82 R; 3QBY A; 4BDY A; 2PNI A; 2DAQ A; 2DVE A; 3VKI A; 1WQ7 A; 4FIB A; 1D0Z A; 2RJD A; 2HD0 A; 3VYG A; 1YI2 T; 2MWP A; 1ZUK A; 2HCK A; 2DM1 A; 3I9Q A; 5HK3 A; 1ZSZ B; 3PIP A; 2RQT A; 3EG0 A; 1QVF S; 1SRM A; 4JRI A; 1EFN A; 2O4X B; 2BE7 D; 1WNL A; 4QT7 A; 2EPD A; 2LCL A; 1WPY A; 1HSQ A; 1X43 A; 2DXU A; 5D7U A; 4CC3 A; 2DBK A; 1W6X A; 2EYZ A; 4D8K A; 4ZGD B; 2JTF A; 3VUB A; 1R77 A; 4PJO A; 2DMO A; 3M4Y A; 2PVD B; 3LX7 A; 4IKF A; 1U8R A; 3VS0 A; 4NL2 A; 4M78 F; 1M3B A; 1OEB A; 4PJO F; 4F7U A; 4ZGJ B; 3OYA A; 1G83 A; 2K2V A; 4XU0 A; 2EAY A; 4O6J A; 2RI2 A; 2XK0 A; 2XU8 A; 1BU1 A; 3THK A; 2A0F B; 2COW A; 4F7U F; 1GRI A; 1BI0 A; 1RI0 A; 5GMK i; 1OI1 A; 3EGX A; 2CGH A; 4QQD A; 5LJ3 d; 3QII A; 5CR2 A; 4FT2 A; 3OQ5 A; 3H0H A; 1VQ9 Q; 4P5N A; 1WHL A; 2CDT A; 2GBQ A; 4F14 A; 3UWN A; 2DJZ A; 2K2M A; 4RUG A; 5GAN j; 2L89 A; 4J6W A; 4ZN1 A; 1UE9 A; 2F2V A; 2DXT A; 1RAA B; 2CZ6 B; 4N0A C; 1HJD A; 1W2B A; 4C5E A; 3C0C A; 4M7A E; 1YJN Q; 2A3L A; 1D0Y A; 4D8D A; 4ZGE B; 3OYI A; 5FRM A; 4A54 A; 4E7J A; 3RER A; 1WLP B; 1EX4 A; 4J8O A; 1JB0 E; 3BDU A; 3SD4 A; 2QAZ A; 4J9E A; 2ZPE B; 4XAX B; 2MAM A; 3QJY A; 3VUZ A; 5KE3 A; 4DOW A; 1BIA A; 2RN8 A; 4OGE A; 3OS5 A; 2CT4 A; 4C8Q A; 4VUB A; 2EYQ A; 4ANJ A; 1ZBX A; 1KHC A; 5CCA A; 3OYG A; 3VS6 A; 4MMK A; 4AFQ C; 3VU3 C; 1EZZ B; 4PFP A; 3OB9 A; 4PJO B; 2KBT A; 2NUP B; 4EMK A; 2XID A; 3SB2 A; 1YWP A; 3X24 B; 2J6F A; 1QVG A; 3HFN A; 3CCR Q; 1IGQ A; 1RAG B; 1WHG A; 4M75 G; 2LRQ A; 2LNV A; 3H0I A; 3CCS Q; 1WI7 A; 4BDZ A; 4MZT A; 3OYE A; 3EGX B; 3A98 A; 2RHZ A; 1Q81 C; 4J9C A; 1N6A A; 2EYX A; 1YJN T; 5CVI A; 3EGD B; 2A28 A; 3JCM P; 1P92 A; 3ZFJ A; 1M90 R; 3KXT A; 4BB7 A; 3REB B; 1WJR A; 1Z9Z A; 1K9M R; 4HT8 A; 4OP0 A; 2QQS A; 1GXI E; 5A0L A; 4M77 A; 5C6S A; 4M7D D; 2KNB B; 3OYJ A; 3CMA A; 1VQ4 T; 5GAN d; 2KQW A; 5FU7 C; 3TEE A; 4JLG A; 2QEX A; 1OX8 A; 2XI9 A; 1Y57 A; 1NJI R; 2MWO A; 1IHV A; 1WHJ A; 2KVQ G; 4X9D A; 4E6R A; 1FMV A; 3OSS C; 3CQT A; 1AWO A; 1BCM A; 4C8Q B; 3CBO A; 2DX1 A; 3CC4 Q; 4QQ6 A; 2XDB A; 4EMG A; 1HD3 A; 3CCR T; 5GAM g; 2MCN A; 2RPN A; 3NTI A; 4C92 A; 4ORZ A; 4II1 A; 3CCS T; 2HMA A; 2FEI A; 4J9I A; 2QA4 A; 4PJM A; 4NL3 A; 4EMK B; 4C92 F; 4LE9 A; 2X9H A; 1SG5 A; 2YT6 A; 2RA2 A; 4N4I A; 1X2Q A; 2X4X A; 3PNW C; 3LYI A; 2HBP A; 1Q86 C; 3JB9 G; 1D3B A; 2XDP A; 2V8K A; 4BAC A; 3TQ7 P; 3CXC S; 3CD6 T; 1M2V A; 3M0P A; 1VYV A; 3PIO A; 4KT0 E; 2X4W A; 1WHH A; 4FL6 A; 1U3O A; 5KYY A; 4WCI A; 3LGL A; 2KT8 A; 1JJ2 P; 2JTM A; 1Q7Y R; 5GAM h; 2KI7 A; 3E19 A; 1R0C B; 4KGZ B; 4CC4 B; 3CPW S; 1VQN A; 1JXM A; 2D8J A; 3NPF A; 2OTL A; 4DBF A; 4ME7 A; 5IHN A; 1YJW Q; 3CCE A; 2LCC A; 4M77 B; 2CS7 A; 4MDW A; 2D0N A; 5CQX A; 3CC4 T; 2ROL A; 2CYZ B; 5GAN 3; 3I35 A; 4A4K A; 1AT1 B; 2LNH B; 4KGV B; 2HBW A; 1MMG A; 2C0O A; 4C5I A; 5FWC A; 2HAX A; 2RM4 A; 4D6W A; 1OPL A; 3NGP A; 4JDS A; 3PVQ A; 2K5L A; 3QWX X; 6AT1 B; 2VB6 A; 3EHR A; 4MZM A; 1WJQ A; 1RAD B; 5CIU A; 1ZA1 B; 4N4G A; 2CRE A; 4RTX A; 4C92 B; 2HNI A; 1XNI A; 2CH4 W; 2FL7 A; 2COZ A; 1D09 B; 5GAM e; 4XU3 A; 3FIF A; 3CXC P; 3M0R A; 2EGE A; 2MMP A; 4BE1 A; 1K8A C; 3OW2 S; 2DYI A; 1KD1 R; 3M9Q A; 3LLR A; 4DOV A; 3OYY A; 1ZSZ C; 1VQO A; 5M9O A; 4OB2 B; 1D3B B; 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