The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
61
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structure length |
61
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Chain Sequence |
LFVALYDYQADRWTDLSFHKGEKFQILDASPPGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVDSIQ
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Generation, Characterization and Structural Data of Chymase Binding Proteins Based on the Human Fyn Kinase SH3 Domain.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
CHYMASE
|
| molecule tags |
Hydrolase/de novo protein
|
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
11
|
| structure length |
61
|
| sequence length |
61
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-01-23 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2YT6 A; 4F16 A; 5FWB A; 3REB B; 2LQW A; 1JXO A; 1A0N B; 2EVR A; 2KYM A; 2A36 A; 3EG2 A; 4JJD A; 4FSS A; 2A08 A; 1NYG A; 1WX6 A; 5EC7 A; 1WA7 A; 4CC3 A; 1UE9 A; 1MV3 A; 1YP5 A; 2JS0 A; 4HVV A; 1CKA A; 4RTU A; 2KXC A; 3VS2 A; 1KJW A; 1WXB A; 2BZY A; 2DA9 A; 4J9I A; 1UHF A; 1UTI A; 2KBT A; 1ZUK A; 4R0K A; 3PVL A; 2BZX A; 5IXF A; 1GL5 A; 2J6K A; 3VS0 A; 1QKW A; 1G83 A; 5FW9 A; 1H3H A; 2AK5 A; 1WXU A; 3VS6 A; 2DRM A; 2LNH B; 2EGA A; 1YWP A; 3UA6 A; 1I1J A; 2O9S A; 1WYX A; 2FPE A; 2LCS A; 3VS1 A; 2EPD A; 1AOJ A; 2GQI A; 1OPL A; 3LH5 A; 3M0R A; 3VS4 A; 3IQL A; 3QWY A; 1YWO A; 4RTY A; 2AKL A; 3A98 A; 2DRK A; 3EHR A; 2BZ8 A; 1B3Q A; 4J9F A; 5IH2 A; 2KGT A; 4J9H A; 1AEY A; 1BBZ A; 1I07 A; 1BU1 A; 4J9E A; 1UUE A; 3QWX X; 1JQQ A; 2HDA A; 2LQN A; 2AZV A; 1U3O A; 2JS2 A; 1WI7 A; 3REA B; 2AZS A; 4M4Z A; 4RUG A; 2EYX A; 2DIL A; 3O5Z A; 3H0F A; 2KRN A; 1GCQ A; 1AD5 A; 1ABO A; 1ZUY A; 2YSQ A; 4CC4 B; 2ECZ A; 1X6G A; 3NGP A; 4AFQ C; 1BK2 A; 1M3A A; 2L3Q A; 4OMP A; 1W6X A; 1RUW A; 1U06 A; 4EIK A; 1QLY A; 1M8M A; 2PZ1 A; 2EW3 A; 2YDL A; 4AG1 C; 2NUZ A; 1M3C A; 1CSK A; 3TSZ A; 2H8H A; 4JZ4 A; 3JV3 A; 2C0I A; 2VWF A; 3EHQ A; 4DEX A; 1NM7 A; 2A37 A; 3VS7 A; 1X2Q A; 3GBQ A; 1VYU A; 1SSH A; 2ESW A; 1RLP C; 2I0N A; 3M0P A; 1W1F A; 2CH4 W; 4OMO A; 2CUD A; 1CKB A; 2J06 A; 2K6D A; 4LNP A; 2HCK A; 2K79 A; 2CSI A; 1KIK A; 2MCN A; 3UA7 A; 5L23 A; 4OMN A; 2HSP A; 2CH4 A; 4RTT A; 1GRI A; 1Y57 A; 1J3T A; 3CQT A; 1AWX A; 1M30 A; 4RTW A; 4AFZ C; 1VYV A; 4K11 A; 4AFS C; 2CSQ A; 2J7I A; 1BB9 A; 2RPN A; 2VVK A; 1W70 A; 1Z9Q A; 1GBR A; 2BTT A; 2DL5 A; 1ABQ A; 1KSW A; 2D8J A; 2KYB A; 2EYZ A; 2GBQ A; 2CUB A; 5IHN A; 2KEA A; 2DBK A; 2M51 A; 1Y0M A; 3VRY A; 1VA7 A; 1LCK A; 4JPB W; 4J9B A; 1MUZ A; 5IHK A; 2EYY A; 1ZBJ A; 2F2X A; 1K0S A; 2DE0 X; 1NEB A; 3VS5 A; 2V1R A; 1IO6 A; 2O9V A; 1ZX6 A; 1SPK A; 1ZUU A; 2OI3 A; 5HCK A; 3ULR B; 1QKX A; 1AZG B; 2NWM A; 4J9G A; 3PE0 A; 2PNI A; 2J6O A; 1JO8 A; 2DLP A; 1YCS B; 3EGU A; 1E6G A; 2KNB B; 1PKS A; 2YUN A; 4JZ3 A; 2MOX A; 4QT7 A; 1K9A A; 2MIO A; 1JEG A; 2K9G A; 1YNZ A; 3NMZ C; 2FO0 A; 2ABL A; 4J9D A; 1QWF A; 1X2K A; 2G6F X; 2KR3 A; 1ZLM A; 1G2B A; 2B86 A; 2DF6 A; 1S1N A; 1UGV A; 2JW4 A; 3EG3 A; 1WIE A; 1I0C A; 1KFZ A; 1SRL A; 2LP5 A; 1AVZ C; 3RBB B; 4HCK A; 1WFW A; 2GTJ A; 4Z89 A; 2ENM A; 1OEB A; 2V1Q A; 2SRC A; 1WLP B; 1T0J A; 3I35 A; 1SHF A; 1GFC A; 3M0S A; 1VYT A; 5GJW B; 2JMA A; 2OAW A; 3H0I A; 1GCP A; 2GNC A; 3I5R A; 3NPF A; 2PTK A; 4LN2 A; 2VKN A; 1H92 A; 1T3S A; 1E7O A; 2RQW A; 2J05 A; 2KE9 A; 2FPD A; 2CT3 A; 1FMK A; 1Z9Z A; 2L0A A; 4JJB A; 4KRT A; 1EFN A; 4E6R A; 3H0H A; 3UF4 A; 2ED0 A; 4D8K A; 2SEM A; 2RQV A; 2DL7 A; 1RI9 A; 3THK A; 1T0H A; 1GBQ A; 1NEG A; 2FPF A; 2KRO A; 3C0C A; 4D8D A; 4F14 A; 2L2P A; 4RTV A; 2FRW A; 2FG0 A; 2RF0 A; 4CC2 A; 4WCI A; 4OMQ A; 4Z8A A; 2CRE A; 4IIM A; 2FEI A; 1UDL A; 2RQU A; 4HVU A; 2JM9 A; 1TUD A; 1RLQ C; 1WDX A; 2EYW A; 2XMF A; 5IXB A; 1PRM C; 2DL4 A; 1FYN A; 1K76 A; 3VS3 A; 1UJY A; 1K4U S; 2DBM A; 2OJ2 A; 1AWW A; 3VRZ A; 4ORZ A; 2X3W D; 1UFF A; 2A28 A; 3FJ5 A; 2YUQ A; 1PNJ A; 3NHN A; 1HD3 A; 1NG2 A; 2KXD A; 2FRY A; 5I22 A; 3M0U A; 2YUP A; 2L3P A; 2LX7 A; 1M27 C; 2CDT A; 1UJ0 A; 1NYF A; 1OV3 A; 2DYB A; 1QWE A; 2CT4 A; 1T3L A; 1PWT A; 2RNA A; 2DL3 A; 4ESR A; 2D0N A; 4RTX A; 2DM1 A; 3KFV A; 2L3S A; 1X69 A; 2D8H A; 1V1C A; 1N5Z A; 4J9C A; 1SEM A; 1UEC A; 2RQT A; 2LJ1 A; 1PRL C; 3H41 A; 2EGC A; 2W0Z A; 2X3X D; 2KRS A; 1XOV A; 2LMJ A; 1E6H A; 2DNU A; 4IIO A; 1NLO C; 2O88 A; 1UHC A; 4DEY A; 2LZ6 B; 2F2W A; 2JMC A; 1PHT A; 3M0T A; 1JXM A; 2KT1 A; 1X27 A; 1ZSG A; 2K2M A; 2LJ0 A; 2DX1 A; 1NLP C; 2YUO A; 4GLM A; 1AWO A; 2AKK A; 2KT8 A; 2ROT A; 4F17 A; 1PKT A; 1MV0 B; 1GFD A; 1WXT A; 3I9Q A; 3SHW A; 2M0Y A; 1K1Z A; 1K0X A; 1B07 A; 5ECA A; 1AZE A; 1H8K A; 2JM8 A; 1YN8 A; 2DMO A; 2P4R A; 4AG2 C; 2GTO A; 1OPK A; 2C0O A; 1TUC A; 2IIM A; 4AFU C; 1OOT A; 3TVT A; 4RTZ A; 4LUE A; 3PVQ A; 2EQI A; 3TSW A; 2K7A A; 2DVJ A; 1AWJ A; 2RMO A; 3R6N A; 2E5K A; 4CC7 A; 2KRM A; 2EBP A; 1X6B A; 2K3B A; 2C0T A; 1U5S A; 3I5S A; 2J6F A; 4LUD A; 2HBW A; 3U23 A; 2DJQ A; 2GGR A; 2EGE A; 3RNJ A; 4JJC A; 2JT4 A; 5GJV B; 3ZL7 C; 2D1X A; 2RQR A; 4A63 B; 2O2O A; 1HJD A; 4X1V A; 4HXJ A; 5FWC A; 3M0Q A; 5IHI A; 2W10 A; 1M3B A; 2DL8 A; 4ZNX A; 2LJ3 A; 2JTE A; 2EKH A; 3SEM A; 4OML A; 3EG1 A; 1GCQ C; 4Y92 A; 4Z88 A; 1QCF A; 4GBQ A; 5I11 A; 1SRM A; 4HVW A; 3UAT A; 1HSQ A; 1X43 A; 2JXB A; 2QDL A; 1JU5 C; 2RN8 A; 2ROL A; 2F2V A; 4OMM A; 2ED1 A; 1SHG A; 1ARK A; 3EG0 A; 2HEQ A; 1TG0 A; 2O31 A; 4LE9 A; 1UG1 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5CIU A; 3CCE T; 1YIJ A; 4Q5W A; 1FMV A; 4JJN K; 2QQR A; 5FWB A; 3L1A A; 1F1B B; 3E19 A; 1NPR A; 2LQW A; 1JXO A; 2EVR A; 1M2V A; 2KYM A; 4ZTJ A; 2QQ9 A; 1UGP B; 3EG2 A; 4JJD A; 4M78 A; 4FSS A; 2Y90 A; 1C6V X; 1NYG A; 4A4G A; 3DLM A; 3CCE A; 2QA4 T; 3CPW S; 2JS0 A; 5AT1 B; 2YWW A; 1VQ7 Q; 2BZY A; 1W2B S; 4R0K A; 1S72 Q; 1G83 A; 1G3Y A; 1OU8 A; 5FW9 A; 3VS6 A; 1M90 U; 2HMA A; 3Q1J A; 2LNH B; 2EGA A; 2QA4 A; 4M7D A; 1RL2 A; 1TU0 B; 4FCY A; 2LCS A; 2R58 A; 2EPD A; 5GAO q; 3WVD B; 3EGD A; 1OPL A; 1OX9 A; 3HHT B; 3M0R A; 5CK9 A; 1K9M C; 3QWY A; 3I56 Q; 3A98 A; 2DRK A; 4B9W A; 1WQW A; 3JCM h; 3V7R A; 2KGT A; 4J9H A; 5KYW B; 3JB9 D; 2EKO A; 1I07 A; 3FRN A; 4F7U A; 5GAN 7; 4J9E A; 3SDZ A; 3JCM e; 3I55 Q; 4C8Q C; 4IUP A; 2RB6 A; 3OQ5 A; 1VQO A; 2AZV A; 3GP8 A; 3CCU Q; 4C5H A; 3QDR B; 2IG0 A; 1QQJ A; 4M4Z A; 4RUG A; 3JB9 G; 2XDP A; 1ABO A; 1NZ9 A; 1ZUY A; 1KD1 R; 2IPO B; 3M53 A; 2E65 A; 3PMT A; 2K3X A; 4QVD A; 3BFM A; 2BE9 B; 4AFQ C; 3L2Q A; 2RHX A; 4OMP A; 1W6X A; 2QQS A; 2YDL A; 5IT9 E; 1CSK A; 2P0P A; 2EYQ A; 2C0I A; 2CZ6 B; 2VC8 A; 1NM7 A; 2A37 A; 2LDM A; 3DKM A; 5KH6 A; 3TU4 K; 4E7H A; 1SSH A; 1XQH A; 1RLP C; 4MDW A; 4OMF B; 3CCS T; 2CUD A; 1D1B A; 2J06 A; 1MMG A; 2KMT A; 2YLC A; 4QKU A; 2DKG A; 2K79 A; 3EGX A; 1H64 1; 2ZPB B; 2GCX A; 1KIK A; 2MCN A; 4MZT A; 4OMN A; 5GAN h; 1QCO A; 4RTT A; 1GRI A; 4OF1 A; 4LD9 K; 1J3T A; 2FHD A; 3OYE A; 4RTW A; 5GAN e; 5LJ5 f; 1LNX A; 2VUB A; 3NTH A; 5LJ5 d; 4DOW A; 2J7I A; 2D6F A; 2RPN A; 4EMH A; 3CME Q; 1M1K C; 1GBR A; 3UDC A; 5A0G A; 3JCM V; 1RAA B; 2BUD A; 2NUP B; 2BTT A; 4C5I A; 2DL5 A; 1G5V A; 5GAN j; 3O8V A; 2NUT A; 1YCY A; 3CMA Q; 1WGS A; 2EYZ A; 3SWN C; 2X4J A; 4M7A D; 3OBY A; 2KEA A; 3GLX A; 3QO3 A; 3PIP A; 2CYZ B; 1VA7 A; 1I5O B; 3JCM d; 2MWP A; 5I21 A; 2RI2 A; 5IHK A; 4PJN A; 1ZBJ A; 4PJO D; 1NEB A; 1PSF A; 5FLX E; 1KQS A; 1ZUU A; 4BAC A; 2DYI A; 1QKX A; 1AZG B; 3EG9 A; 4N4I A; 2DLP A; 3EGU A; 3QJ6 A; 3M59 A; 2YUN A; 2JZ2 A; 1KQS P; 4QT7 A; 1K9A A; 2OX7 A; 2QAS A; 2K9G A; 1YNZ A; 3NMZ C; 3ZBD A; 2G6F X; 3G4S A; 4FM4 B; 5GAO p; 1S1N A; 4M78 D; 5KYY B; 5HK3 A; 1Q82 U; 1UGV A; 2DXU A; 2NLU A; 1WIE A; 1ZA2 B; 1I0C A; 2DXB A; 3CC7 A; 1KFZ A; 3H9N A; 3OBW A; 1D3B B; 2LP5 A; 3RBB B; 1EIF A; 2HAX A; 4HCK A; 1Q86 R; 1WFW A; 3DB4 A; 4J6X A; 4M78 G; 4Z89 A; 3JRZ A; 1D0X A; 4JRI A; 1T0J A; 3OY9 A; 1D0Z A; 1SHF A; 2JTM A; 1QVF S; 3OW2 A; 1KC8 U; 4ATO A; 3LWH A; 1KQS S; 3H8Z A; 3ASK A; 3C4S A; 2GNC A; 3NPF A; 2PTK A; 4LN2 A; 1U1S A; 3L2U A; 3CCS Q; 1T3S A; 3OW2 P; 2RQW A; 4KGX B; 5KE3 A; 5GMK m; 2WSE E; 1C0M A; 1TS9 A; 1Z9Z A; 2DXT A; 2ED0 A; 4GY5 A; 1VQL T; 1VIF A; 2QEX T; 2VXE A; 1T0H A; 1K8A U; 1YJW Q; 2RK2 A; 4F14 A; 3NFC A; 2QI2 A; 2RF0 A; 4M78 E; 4IIM A; 5LJ3 h; 9ATC B; 2K5I A; 1C1A A; 4F7U G; 4QW2 A; 5LJ3 e; 2LQK A; 1WZO A; 4JRK A; 2XMF A; 5D7U A; 3AHU A; 5GAN 3; 2QQB A; 1K76 A; 3LLR A; 4CRI A; 1UJY A; 3OW2 S; 1K4U S; 4O6J A; 1RAI B; 3CBM A; 1AWW A; 4ORZ A; 3RIR A; 2PQW A; 4JDS A; 4L59 A; 4X9D A; 1UFF A; 2A28 A; 3FJ5 A; 5LJ3 j; 3CEY A; 4FW1 A; 5KYX A; 3A1P A; 3URG A; 3WXM B; 4ZN1 A; 1YIT T; 1XTD A; 3CCL A; 4JS4 A; 1Q95 G; 2PVO B; 2L3P A; 1M27 C; 3A8M B; 3X20 B; 2CT4 A; 4BDY A; 1YIT A; 1M2O A; 5CKD A; 3KFV A; 4HT9 A; 2D8H A; 2P0Q A; 4JRP A; 1UEC A; 1PRL C; 4F7U E; 2X3X D; 2LMJ A; 3MJX A; 3FIF A; 4PJO B; 3EFR A; 2O88 A; 5GAN 6; 1V29 B; 3QYG B; 2F2W A; 2CP0 A; 2PUK B; 3M0T A; 3N5B B; 1JXM A; 1Q7Y U; 1QP2 A; 4EMK C; 1ZSG A; 2DO3 A; 4J83 A; 2DX1 A; 1YHQ Q; 1D09 B; 4GLM A; 4XU1 A; 5GAM f; 4PFO A; 1K73 U; 1P92 A; 1VQK Q; 1PKT A; 5GAM d; 3CCQ A; 1GFD A; 1Q81 C; 3I9Q A; 3SHW A; 2M0Y A; 3UPU A; 3RKY A; 4AG2 C; 3OYL A; 2IIM A; 1TUC A; 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1R0B G; 2K4Y A; 2X4W A; 1WYX A; 2HQE A; 1WJS A; 4C5G A; 3VS1 A; 3CBP A; 5C0M A; 4R56 A; 4E7L A; 3JB9 I; 2RHY A; 2A7Y A; 1S72 A; 4RTY A; 3EHR A; 2BZ8 A; 4RCC A; 2K5F A; 3QZ9 B; 4J9F A; 4PLL A; 1IB8 A; 5IH2 A; 3QG1 A; 3CXC A; 4JRQ A; 3I56 T; 4DBF A; 3CCV T; 3RR6 A; 4RCB A; 4N0A C; 3M56 A; 3CXC P; 1WI7 A; 3REA B; 3P8B B; 4F04 B; 3SB2 A; 2BKD N; 2COZ A; 3I56 A; 1U1T A; 4C0F A; 1VQ8 Q; 2ECZ A; 4GLK A; 1X6G A; 3CCV A; 1TUG B; 2QQA A; 5CKF A; 2K5L A; 1PD1 A; 4M75 G; 1U06 A; 4EIK A; 2KDS A; 3PTA A; 3I55 A; 4M77 B; 3EG9 B; 1ZSZ C; 2H8H A; 1UGQ B; 1PSE A; 3EHQ A; 4IUT A; 3CCU A; 3A8O B; 4NL3 A; 3EFS A; 3L2W A; 3GBQ A; 5CR2 A; 1VYU A; 5I2M A; 3M0P A; 2XU8 A; 1W1F A; 2CH4 W; 4OMO A; 3S3O A; 4FIB A; 3G6E T; 1CKB A; 4KH1 B; 4LNP A; 4A4F A; 1Q86 C; 3OS5 A; 4PJL A; 4QVZ A; 2CSI A; 3FB9 A; 3M9Q A; 3UA7 A; 3HRU A; 4LDV A; 3CC2 T; 3M55 A; 4FT4 A; 4C8Q F; 1AWX A; 3VJP A; 1B34 B; 2LRQ A; 2CP5 A; 5CO7 A; 3PIO A; 3MP8 A; 4K11 A; 2QTX A; 4AFS C; 4L5G A; 1BB9 A; 2VVK A; 2RJF A; 2DZ9 A; 4M75 E; 4ME7 A; 1ZBX A; 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