The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
|
sequence length |
70
|
structure length |
70
|
Chain Sequence |
GSSGSSGDYCKVIFPYEAQNDDELTIKEGDIVTLINKDCIDVGWWEGELNGRRGVFPDNFVKLLSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
SH3-domain kinase binding protein 1
|
| publication title |
Solution structure of the third SH3 domain of SH3-domain kinase binding protein 1 (Regulator of ubiquitous kinase, Ruk)
rcsb |
| source organism |
Mus musculus
|
| molecule tags |
Apoptosis
|
| total genus |
7
|
| structure length |
70
|
| sequence length |
70
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-12-13 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2CDT A; 4J9H A; 1U06 A; 1M30 A; 2C0I A; 3I5R A; 1X6B A; 4CC2 A; 4IIM A; 2M51 A; 2DM1 A; 1ZBJ A; 1RI9 A; 1KJW A; 2PNI A; 2EGA A; 2LQW A; 4HVW A; 1FYN A; 4E6R A; 1QWF A; 1U5S A; 2JM8 A; 2YUN A; 1LCK A; 2EVR A; 2LJ0 A; 4AG2 C; 1AZG B; 2LQN A; 4RTW A; 1SSH A; 2W0Z A; 1JQQ A; 2KT8 A; 1XOV A; 4AFU C; 2YT6 A; 2LNH B; 1OV3 A; 3SEM A; 1X2Q A; 1RLQ C; 2EYY A; 3M0R A; 2X3X D; 2JTE A; 3EG1 A; 1WA7 A; 2ROL A; 3KFV A; 3R6N A; 2JMA A; 3I5S A; 1YN8 A; 1M3C A; 2K6D A; 1E6G A; 3EG2 A; 4F14 A; 2KRN A; 1T0J A; 2L0A A; 3VS7 A; 1SRM A; 1Y57 A; 2O2O A; 3LH5 A; 1NG2 A; 1ZUY A; 1RLP C; 2D0N A; 4JJC A; 3VS4 A; 2D1X A; 3FJ5 A; 1T0H A; 1X6G A; 3PVQ A; 1WXB A; 2H8H A; 2K9G A; 4EIK A; 1W70 A; 3VS3 A; 2A37 A; 4J9G A; 2DIL A; 2DBM A; 1GRI A; 2L3P A; 2KXD A; 5ECA A; 1NEB A; 1SEM A; 1BU1 A; 4J9F A; 1MV3 A; 1UTI A; 2RMO A; 1X69 A; 3UF4 A; 1PKS A; 1WFW A; 1AWO A; 5EC7 A; 4HCK A; 1SHG A; 4GBQ A; 3GBQ A; 2DNU A; 3H41 A; 5IXF A; 5FW9 A; 2EGC A; 1M27 C; 2BZ8 A; 1ZSG A; 2DL3 A; 4Z88 A; 4RTX A; 2FRW A; 3I9Q A; 2KXC A; 4CC3 A; 5IH2 A; 1I1J A; 5IXB A; 4OMO A; 1ZX6 A; 3M0S A; 4AFQ C; 1E7O A; 2GTJ A; 1IO6 A; 3NGP A; 2ENM A; 2HBW A; 1AVZ C; 5HCK A; 1GCP A; 1PKT A; 2LJ3 A; 1W1F A; 2YDL A; 1GCQ A; 1SPK A; 5GJV B; 2KNB B; 2SEM A; 1WDX A; 1RUW A; 3QWX X; 1YWP A; 2J6K A; 1UUE A; 2O31 A; 2OAW A; 2RNA A; 1Y0M A; 2EW3 A; 2IIM A; 3NHN A; 1G2B A; 1AWW A; 1TUD A; 2V1R A; 1NM7 A; 4F16 A; 3NPF A; 4FSS A; 2FRY A; 2QDL A; 4M4Z A; 2KT1 A; 3A98 A; 3M0U A; 1KSW A; 4HVU A; 1GFD A; 3CQT A; 1GCQ C; 1VYU A; 2LMJ A; 4K11 A; 1SRL A; 1X43 A; 1JXO A; 1TG0 A; 3UA7 A; 2DE0 X; 4KRT A; 2MCN A; 2A28 A; 2OI3 A; 4LUD A; 1T3L A; 1VYT A; 4RTV A; 2EBP A; 1YNZ A; 2LCS A; 2D8J A; 2L2P A; 1UFF A; 2LP5 A; 2DL5 A; 1GBR A; 2RN8 A; 4J9E A; 1NLO C; 2DRK A; 2FEI A; 3EG0 A; 4HXJ A; 2GQI A; 5FWB A; 2D8H A; 4J9D A; 2DL7 A; 4Z89 A; 2CT4 A; 2W10 A; 4JZ4 A; 4DEX A; 1I07 A; 2VKN A; 2EYW A; 2PTK A; 1HSQ A; 1SHF A; 2A36 A; 1B07 A; 2YUP A; 4LN2 A; 2LJ1 A; 1WXU A; 1Z9Q A; 2OJ2 A; 2K7A A; 1MUZ A; 3RNJ A; 2AZV A; 3VS2 A; 2AZS A; 2KRM A; 4JJB A; 2FPF A; 2CUB A; 2MOX A; 1X27 A; 2DYB A; 1K0S A; 2XMF A; 1PWT A; 2DF6 A; 2B86 A; 2J6O A; 4IIO A; 3JV3 A; 4LNP A; 1OEB A; 3UAT A; 1KIK A; 3QWY A; 2FPE A; 1AWJ A; 1GBQ A; 2DJQ A; 2HEQ A; 2EPD A; 3VS1 A; 1BK2 A; 1YP5 A; 2O9V A; 2C0O A; 1NEG A; 1V1C A; 4GLM A; 4WCI A; 3EHQ A; 1UHF A; 2EYX A; 1NYF A; 4CC7 A; 1WYX A; 2J05 A; 2CSQ A; 1JEG A; 2NUZ A; 2J7I A; 1X2K A; 4RTT A; 3H0I A; 1PRM C; 2JM9 A; 3SHW A; 1ABO A; 1CSK A; 2KGT A; 1WX6 A; 1U3O A; 4D8K A; 2I0N A; 3H0H A; 4RTY A; 2YUQ A; 1JU5 C; 1G83 A; 1JXM A; 1BB9 A; 3NMZ C; 3PE0 A; 1QLY A; 2SRC A; 1CKA A; 4OMM A; 2EGE A; 1UHC A; 2O88 A; 1GFC A; 2RQR A; 1PRL C; 2HDA A; 3VS5 A; 1QWE A; 2E5K A; 3EHR A; 4J9B A; 4D8D A; 4AFS C; 4RTZ A; 1M3B A; 1UGV A; 4Y92 A; 1OPL A; 1T3S A; 1WIE A; 2ED1 A; 2A08 A; 4JPB W; 2L3S A; 4ORZ A; 3VS0 A; 1S1N A; 2G6F X; 1QKX A; 2GBQ A; 1HJD A; 4R0K A; 3M0Q A; 3VRY A; 4AFZ C; 4CC4 B; 2RQU A; 1H8K A; 3TSW A; 1AZE A; 4RTU A; 2AKK A; 2BTT A; 3TSZ A; 2GTO A; 1K4U S; 2F2X A; 2AK5 A; 1W6X A; 2ABL A; 2HCK A; 3IQL A; 2CSI A; 2EKH A; 2C0T A; 2VVK A; 1KFZ A; 4J9C A; 2PZ1 A; 2KRS A; 1CKB A; 4DEY A; 2ESW A; 1HD3 A; 2DL4 A; 4RUG A; 4HVV A; 2DX1 A; 1UE9 A; 1AWX A; 2O9S A; 2ROT A; 2KE9 A; 1A0N B; 4LE9 A; 3RBB B; 2JS2 A; 3O5Z A; 2FPD A; 2K79 A; 2JMC A; 4A63 B; 2GNC A; 3PVL A; 2KYB A; 2K2M A; 2KEA A; 1WXT A; 2BZY A; 2EQI A; 1TUC A; 4F17 A; 3REB B; 2RQT A; 4LUE A; 3REA B; 1NLP C; 2CH4 W; 1ZLM A; 2GGR A; 3M0T A; 2CUD A; 1M3A A; 2KR3 A; 4JJD A; 1ZUU A; 2HSP A; 2DLP A; 1BBZ A; 1B3Q A; 1ABQ A; 2JS0 A; 3EGU A; 1UG1 A; 2F2V A; 2J06 A; 1UDL A; 1K9A A; 2DBK A; 4X1V A; 2RQV A; 2V1Q A; 2BZX A; 2KRO A; 2J6F A; 1J3T A; 2L3Q A; 2CT3 A; 2RPN A; 4ESR A; 5IHN A; 2F2W A; 1UEC A; 4JZ3 A; 4Z8A A; 5IHI A; 2JW4 A; 2K3B A; 2VWF A; 2AKL A; 2RF0 A; 1AD5 A; 1UJY A; 2DRM A; 3H0F A; 3ULR B; 1YCS B; 3I35 A; 1NYG A; 2LX7 A; 4OMN A; 1JO8 A; 1AEY A; 3M0P A; 5IHK A; 3ZL7 C; 4OMP A; 1H3H A; 5GJW B; 1N5Z A; 2KBT A; 2FO0 A; 2ED0 A; 4QT7 A; 5FWC A; 1Z9Z A; 2KYM A; 4AG1 C; 1M8M A; 2JT4 A; 2M0Y A; 3U23 A; 4ZNX A; 1VA7 A; 1K76 A; 1I0C A; 3VRZ A; 2NWM A; 1AOJ A; 1ZUK A; 2MIO A; 4OMQ A; 1ARK A; 1WLP B; 2P4R A; 3EG3 A; 2DMO A; 1GL5 A; 1QKW A; 4J9I A; 2YUO A; 1PHT A; 4OML A; 2X3W D; 2CRE A; 2EYZ A; 3THK A; 3C0C A; 1OPK A; 2LZ6 B; 1H92 A; 1E6H A; 5I22 A; 3TVT A; 1QCF A; 3UA6 A; 2JXB A; 5I11 A; 1K1Z A; 1FMK A; 1WI7 A; 2ECZ A; 2FG0 A; 2DVJ A; 1K0X A; 5L23 A; 1PNJ A; 1YWO A; 2DL8 A; 2RQW A; 1UJ0 A; 2YSQ A; 2DA9 A; 1OOT A; 1MV0 B; 1VYV A; 2CH4 A; 1EFN A; 3VS6 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3A8L B; 3V7S A; 5KYW B; 2CDT A; 4J9H A; 2HAX A; 1U06 A; 2C0I A; 3I5R A; 4IIM A; 1RI9 A; 1KJW A; 2EGA A; 9ATC B; 1PCX A; 2LQW A; 5LJ5 h; 4BDY A; 3HFN A; 3A8G B; 4E6R A; 1M2V B; 4M78 D; 1LCK A; 3CCJ T; 1YJW T; 4F7U B; 3CCS Q; 1WQ7 A; 3OYB A; 2W0Z A; 1QVP A; 2KT8 A; 4C8Q D; 4AFU C; 1TOV A; 2LNH B; 1OV3 A; 3SEM A; 2E6Z A; 5CKB A; 1M1K U; 2EYY A; 3M0R A; 3M59 A; 2JN0 A; 2JTE A; 2ROL A; 3KFV A; 3M4G A; 2EWN A; 1YN8 A; 1E6G A; 3CCL Q; 3VS7 A; 1SRM A; 2RJE A; 2O2O A; 3MJX A; 1NG2 A; 1ZUY A; 4M7D F; 1IHW A; 2D0N A; 3H8Z A; 2GCX A; 1K8A R; 4N0A A; 2H8H A; 3ZBD A; 5CO7 A; 3VS3 A; 1ZHI A; 2CZ0 B; 2A37 A; 4QQD A; 2JTF A; 1NEB A; 4M75 G; 5GAN 2; 3X24 B; 3I56 T; 1TWB A; 4OMF B; 4AMC A; 4EMK B; 1BIB A; 1VQP T; 4MZP A; 4YTL A; 3EAE A; 4NS5 A; 5IXF A; 2DPP B; 4C92 E; 3BDL A; 2EGC A; 1OUL A; 3WVD B; 1UGR B; 3NFC A; 3GOX A; 1S72 A; 2V8I A; 4HKE A; 2FRW A; 4OB1 B; 4CC3 A; 5IH2 A; 2DK3 A; 2P84 A; 4OMO A; 1PG5 B; 1ZX6 A; 4P5N A; 4EMK C; 1VQN A; 1AVZ C; 2LX9 A; 4C5G A; 4M77 B; 3LLR A; 1Q7Y R; 1KC8 U; 2QK0 A; 3D7S B; 3QWX X; 3G6E A; 5D7U A; 4DBQ A; 2O31 A; 2OAW A; 4BAC A; 4C0F A; 4KT0 E; 3JB9 J; 1HXD A; 2VC8 A; 1PM3 A; 1YHQ Q; 1BCM A; 3NPF A; 2DXT A; 4FSS A; 2FRY A; 4M4Z A; 2F5K A; 2QXF A; 2CZ1 B; 2EJF A; 3LGL A; 5CKE A; 3A98 A; 3M0U A; 1M1G A; 2LMJ A; 3CD6 A; 3L2U A; 3G71 T; 1JXO A; 1BI3 A; 1QCN A; 2M9U A; 3SDZ A; 4M77 C; 4V2S A; 1KK7 A; 5CVI A; 1IGQ A; 2DEQ A; 1KD1 C; 3OMC A; 2EBP A; 1D0Y A; 1VQO A; 2QEX T; 1QP2 A; 1ZA2 B; 3E2U A; 3KXT A; 2DO3 A; 3X20 B; 4PL6 A; 1GBR A; 1G3T A; 2ZPB B; 2FEI A; 2AHJ B; 3JAM E; 4M78 B; 3JCM V; 3MP1 A; 4HXJ A; 3VUZ A; 5GAO p; 5FWB A; 3OYG A; 4O5V A; 1JJ2 S; 1Y7X A; 4Z89 A; 3HRU A; 4DEX A; 4X34 A; 2HNI A; 2PTK A; 5DM7 R; 1HSQ A; 3CCJ A; 1WXU A; 4JRP A; 2ZPI B; 1MUZ A; 4MZM A; 1Y71 A; 2AZS A; 1TXQ A; 2KRM A; 2FPF A; 3WVE B; 5KYN A; 4M78 C; 4RKU E; 2MOX A; 3FDR A; 2XMF A; 1PWT A; 5GAN 4; 5EG2 A; 5GAN d; 1MMN A; 1XJW B; 2OTJ Q; 4JLI A; 4C8Q C; 2IG0 A; 1GBQ A; 2JUF A; 2OX7 A; 2XI9 A; 1RAA B; 4A4H A; 1VQM Q; 1V29 B; 4M7A E; 1BK2 A; 1G3W A; 1PD0 A; 3CCR T; 3CCV Q; 4M75 E; 4LD6 A; 1KQS S; 3EHQ A; 3CC4 T; 3QUI A; 3CMA Q; 4KUL A; 4CC7 A; 1WYX A; 1RAI B; 1YJN T; 3CCQ Q; 3JCM e; 5GMK h; 3OB9 A; 4M7D G; 1WJQ A; 2XG8 D; 3WXM B; 5KH6 A; 5KYU A; 6AT1 B; 3UDC A; 1LJO A; 4OGC A; 2GF7 A; 3CXC S; 5GMK i; 1U3O A; 1JXM A; 4JRI A; 1QLY A; 3EFR A; 2SRC A; 5A0G A; 4E2F B; 4M75 D; 4OMM A; 3QG1 A; 2E64 A; 2V8K A; 2O88 A; 1GFC A; 2H3J A; 2RQR A; 1M90 C; 3CCS T; 4Y91 A; 3E1S A; 2E5K A; 1ZSZ A; 4MMK A; 4FSX A; 2A08 A; 1VQ9 Q; 1SG5 A; 1VUB A; 3OYJ A; 2XHC A; 3VS0 A; 2L89 A; 4J83 A; 1K9M C; 5I2M A; 4E7K A; 3CC2 Q; 1H8K A; 5CAI A; 2ZCF B; 2BTT A; 1M4Z A; 2F2X A; 2ABL A; 4E7J A; 4XU3 A; 2EKH A; 4XTW A; 4J7I A; 2VVK A; 3PGG A; 3RUX A; 4J9C A; 1KHI A; 1Q81 R; 1M2O A; 3CBM A; 2QA4 A; 1NPR A; 4HT9 A; 4NOY A; 1BYM A; 1AWX A; 3G71 A; 4RCB A; 4C0D B; 2O9S A; 4RMO A; 3S3O A; 1I8F A; 4JLG A; 1PSE A; 1Q86 U; 2QQ9 A; 3PIO A; 2NUT B; 2JMC A; 2YLC A; 4C92 F; 2QEX A; 2D9T A; 2K2M A; 5L8R E; 1TH7 A; 2BZY A; 2EQI A; 2M0O A; 2VGN A; 4FL6 A; 3REA B; 2CP6 A; 4EMG A; 2NLU A; 3RDV A; 4JJD A; 1ZUU A; 1YCY A; 2F2V A; 2J06 A; 1YJW Q; 2QQR A; 5C6S A; 3MEU A; 3OY9 A; 1M9S A; 4PJO E; 4EDU A; 1LVK A; 1FXX A; 4ESR A; 4OB3 B; 2F2W A; 2DET A; 4N4I A; 2X4W A; 1OZ3 A; 2CYZ B; 3M58 A; 3MEW A; 2EQJ A; 3OYA A; 2VWF A; 4HCB A; 2DJZ A; 1UJY A; 2WSC E; 5KCO A; 4VUB A; 1OX9 A; 1VQ6 A; 3I55 A; 2LX7 A; 4ZTF A; 3ASK A; 1JO8 A; 3OYI A; 3M0P A; 4BY6 B; 1YIJ Q; 5IHK A; 5C0M A; 2VXE A; 2JNG A; 3RMQ A; 2MMP A; 4JDS A; 4ME7 A; 2E3I A; 3OYN A; 3J7A F; 4XAX B; 1D09 B; 1Z9Z A; 2GFA A; 2MYS A; 5J3B A; 1TTH B; 3FEO A; 1M8M A; 2JT4 A; 3GNF B; 2P0P A; 4J6X A; 4HCC A; 4FYV B; 1VIF A; 2E70 A; 1YJN A; 1ARK A; 2KDS A; 3I56 Q; 3EG3 A; 1VQP Q; 1YIT T; 4HCZ A; 2YUO A; 1I4K 1; 1PHT A; 4BY6 C; 2PVD B; 3C0C A; 3UA6 A; 2JXB A; 5I11 A; 1K1Z A; 1RAE B; 1Q82 C; 4M7D D; 2ECZ A; 2DVJ A; 1YWO A; 3C95 A; 3RR6 A; 2XDP A; 4QW2 A; 1M1K R; 1OOT A; 1MV0 B; 2COW A; 3ER0 A; 3JCM W; 4CC2 A; 3EH1 A; 2PQW A; 5KYW A; 3S3N A; 4M75 C; 2LT1 A; 3QSU A; 1VQ4 Q; 2VB6 A; 4XQ3 A; 4IUQ A; 1FYN A; 1QWF A; 2YUN A; 4XTU A; 3OYF A; 1W4S A; 4JRK A; 1NE8 A; 1YBY A; 4M7A F; 4MZT A; 5A2Q E; 1M2V A; 1BI0 A; 1SSH A; 1JQQ A; 3CCL A; 4PLL A; 4R56 A; 2PVG B; 3G4S Q; 4O6J A; 3Q1J A; 1RLQ C; 3CMA T; 3QBY A; 4Q5W A; 2QGF B; 1WA7 A; 3CCQ T; 3A5Z B; 3R6N A; 2QQS A; 3OYK A; 3I5S A; 3P8B B; 3ZEH A; 3MEV A; 1K9M U; 2K6D A; 4KH0 B; 4DOW A; 1D0Z A; 3EG2 A; 3OQ5 A; 2RB6 A; 1I5L A; 3LH5 A; 4KUD K; 2K5F A; 3INZ A; 4BE0 A; 2I2L A; 2C06 A; 2D1X A; 2HKQ B; 3OBY A; 2F5T X; 2JOY A; 1W70 A; 4L59 A; 3GF5 A; 1R0B G; 5GAO n; 3V7R A; 2COZ A; 1GRI A; 2KXD A; 3CXC P; 3M55 A; 1BU1 A; 1MV3 A; 4C92 G; 1X69 A; 2VAS A; 4PJN A; 5CK9 A; 1WFW A; 1AWO A; 1KC8 R; 2E3H A; 4GBQ A; 4EMK A; 1NJI U; 3H41 A; 3HRS A; 5HK0 A; 2O4X A; 3VV0 A; 1M8V A; 3MHX A; 4HA8 A; 4ZN3 A; 3FIF A; 1K73 R; 4LXC A; 1X75 C; 1VQ7 Q; 3M53 A; 5GAO m; 3CXC A; 2VGM A; 1I1J A; 1K73 C; 3A1P A; 1XQH A; 1SKU B; 5AYF A; 1WPY A; 1IO6 A; 4A4E A; 5HCK A; 4X9D A; 1YHQ A; 3CCR Q; 1GCP A; 1PKT A; 2YDL A; 4N4G A; 4WF2 A; 3CC4 Q; 3O8V A; 2SEM A; 3KBG A; 3V7C A; 1N6A A; 1YWP A; 1UUE A; 1Y0M A; 2EW3 A; 2IIM A; 5GAN h; 5IT9 E; 1G2B A; 5GAN f; 4QVC A; 1AWW A; 2DYI A; 1B7T A; 1NM7 A; 2CZ7 B; 2YRD A; 4M7D B; 1R8O B; 3MP8 A; 1V76 A; 2KT1 A; 1GFD A; 1KSW A; 2MK5 A; 4K11 A; 2DEU A; 1BCO A; 3JB9 I; 3VYH B; 3H9N A; 4KRT A; 2RI5 A; 1EX4 A; 2MCN A; 5LJ3 f; 4C5E A; 5GAO l; 2CP0 A; 1IGU A; 1T3L A; 4X9C A; 5DY9 A; 3CME T; 2LQ8 A; 2D8J A; 4Z02 A; 2CP2 A; 2LP5 A; 2DL5 A; 1RAC B; 4PJO F; 2YHT A; 4J9E A; 2A7Y A; 2DIG A; 3EG0 A; 1N8R U; 4M7D C; 2GQI A; 1KG1 A; 2FYK A; 4J9D A; 2DZC A; 4M78 A; 2PUK B; 3RMS A; 5KE3 A; 4LN2 A; 4C8Q A; 2WSF E; 3JB9 F; 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