The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
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sequence length |
70
|
structure length |
70
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Chain Sequence |
GSSGSSGDYCKVIFPYEAQNDDELTIKEGDIVTLINKDCIDVGWWEGELNGRRGVFPDNFVKLLSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Apoptosis
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| source organism |
Mus musculus
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| publication title |
Solution structure of the third SH3 domain of SH3-domain kinase binding protein 1 (Regulator of ubiquitous kinase, Ruk)
rcsb |
| molecule keywords |
SH3-domain kinase binding protein 1
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| total genus |
7
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| structure length |
70
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| sequence length |
70
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-12-13 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2FRY A; 4JZ3 A; 2X3X D; 3SHW A; 4AFQ C; 1M3B A; 1I1J A; 1K0X A; 2G6F X; 1Y0M A; 3I9Q A; 1OV3 A; 4OMN A; 2X3W D; 4J9H A; 1M3A A; 4JPB W; 1SPK A; 2BZ8 A; 1ZSG A; 2K2M A; 4LUD A; 1PKT A; 2F2X A; 2DL4 A; 2LQN A; 1WXU A; 2DMO A; 3PVQ A; 1WLP B; 2GTJ A; 2KBT A; 2DYB A; 1UHF A; 4RTX A; 2ABL A; 2DVJ A; 5FWC A; 2YSQ A; 2DIL A; 4ESR A; 2EBP A; 1UEC A; 1SEM A; 1I0C A; 2D8J A; 1XOV A; 1GRI A; 5L23 A; 5IXF A; 2RNA A; 4J9F A; 2LMJ A; 3TSZ A; 2K3B A; 3M0S A; 2I0N A; 4RTT A; 1Z9Z A; 2OJ2 A; 2HDA A; 2ROT A; 1Y57 A; 2GQI A; 4FSS A; 4F17 A; 2RQU A; 1FYN A; 2CH4 W; 1WIE A; 2GBQ A; 1UHC A; 2DL5 A; 1VYT A; 2KNB B; 1VA7 A; 3H0I A; 1BB9 A; 1U5S A; 2FPF A; 2LJ0 A; 2PZ1 A; 1A0N B; 2LZ6 B; 1G2B A; 2O9S A; 1H8K A; 3U23 A; 1GFC A; 2KRM A; 5GJW B; 5FWB A; 1MUZ A; 3C0C A; 2KYB A; 4AFU C; 1CKB A; 1UJ0 A; 1JXM A; 4OMP A; 4RTY A; 4DEY A; 2BZY A; 3GBQ A; 2QDL A; 1LCK A; 2NUZ A; 4IIO A; 1NLP C; 2JS0 A; 2RN8 A; 1M3C A; 2CH4 A; 1NM7 A; 1YN8 A; 1AVZ C; 3I35 A; 3QWY A; 2CRE A; 1PRM C; 1AEY A; 2RQW A; 1E6G A; 1VYU A; 3NHN A; 1RI9 A; 1OOT A; 4J9G A; 2RQT A; 4CC7 A; 3RBB B; 2XMF A; 1CKA A; 4R0K A; 1NYG A; 2ED1 A; 1GFD A; 2DBK A; 1ZUU A; 1X6B A; 1JEG A; 3VRY A; 3EG3 A; 3QWX X; 1ABQ A; 2KRO A; 2AZV A; 3VS3 A; 1K0S A; 4J9E A; 1N5Z A; 1AOJ A; 2FO0 A; 5I11 A; 1GCP A; 1U06 A; 2J6K A; 3PE0 A; 2LX7 A; 2CDT A; 2ROL A; 1WXT A; 3VS7 A; 1AWO A; 3EGU A; 4RTV A; 2HSP A; 1OPL A; 4EIK A; 4M4Z A; 2YDL A; 2KE9 A; 2KT8 A; 4HVW A; 5ECA A; 2C0I A; 3I5R A; 2DX1 A; 2CT3 A; 2OI3 A; 1NEG A; 2CSI A; 1BU1 A; 2O31 A; 4K11 A; 1FMK A; 2VKN A; 2SEM A; 1QKX A; 2FPE A; 1PRL C; 4OML A; 4X1V A; 3H0F A; 3THK A; 1UUE A; 3CQT A; 2F2V A; 4GBQ A; 1ZUY A; 1ZX6 A; 2BZX A; 2ECZ A; 2C0T A; 4GLM A; 3ZL7 C; 1ABO A; 1JXO A; 1H92 A; 3PVL A; 3H0H A; 2EW3 A; 2J6O A; 4AG1 C; 3VS1 A; 4WCI A; 3M0R A; 1PNJ A; 2GGR A; 4D8D A; 1X43 A; 1SSH A; 2DRM A; 2JW4 A; 1J3T A; 3EG0 A; 2EYX A; 1T0J A; 1YP5 A; 2ESW A; 2ED0 A; 3M0Q A; 2JMC A; 2HBW A; 1BK2 A; 1WA7 A; 1WI7 A; 2VWF A; 1PKS A; 2A28 A; 3VRZ A; 1T3S A; 3NPF A; 3O5Z A; 4HCK A; 5I22 A; 1U3O A; 1UGV A; 2L2P A; 2KRN A; 4ORZ A; 3TVT A; 2FEI A; 1MV0 B; 2K9G A; 3SEM A; 1IO6 A; 4KRT A; 1SHF A; 2AZS A; 3M0U A; 2M0Y A; 1SRM A; 2ENM A; 1K1Z A; 1AWW A; 2YT6 A; 1X27 A; 4IIM A; 1NEB A; 1B07 A; 3VS2 A; 2W10 A; 4CC2 A; 3UA6 A; 1KIK A; 1B3Q A; 2O2O A; 5FW9 A; 1PWT A; 2RMO A; 2SRC A; 2BTT A; 2AKL A; 2HCK A; 2JM9 A; 1SRL A; 3JV3 A; 1I07 A; 4HVU A; 4AG2 C; 3H41 A; 2NWM A; 4Z88 A; 3VS6 A; 2KYM A; 1GCQ C; 4HXJ A; 1ARK A; 4HVV A; 2GTO A; 1WDX A; 1K9A A; 2AKK A; 1UG1 A; 1YCS B; 1ZLM A; 2JT4 A; 1CSK A; 1OPK A; 2EQI A; 1JU5 C; 4Z89 A; 1JQQ A; 2KEA A; 4J9B A; 1TUC A; 2DL7 A; 2GNC A; 4CC4 B; 4F16 A; 2KRS A; 2MOX A; 5EC7 A; 2KXD A; 2A37 A; 1Z9Q A; 3FJ5 A; 2E5K A; 2MIO A; 3A98 A; 1X2K A; 2C0O A; 2MCN A; 2YUQ A; 2PTK A; 4Y92 A; 4LN2 A; 2D0N A; 1ZBJ A; 1SHG A; 4JZ4 A; 2LJ1 A; 1S1N A; 1HSQ A; 1ZUK A; 2K6D A; 1WFW A; 1T3L A; 2V1R A; 3EHQ A; 4Z8A A; 1NLO C; 2L0A A; 4RTZ A; 5HCK A; 1K4U S; 2JS2 A; 2RQV A; 1WX6 A; 2FG0 A; 4OMM A; 1X2Q A; 1M27 C; 2EGA A; 1TG0 A; 1WXB A; 4OMQ A; 2W0Z A; 1EFN A; 2RQR A; 4OMO A; 1YNZ A; 4QT7 A; 1AWX A; 2YUN A; 1NG2 A; 1KFZ A; 3EG1 A; 2EYW A; 1T0H A; 2B86 A; 3NGP A; 2DL3 A; 2L3S A; 4RTW A; 1UJY A; 4DEX A; 4F14 A; 2JTE A; 2H8H A; 2JXB A; 2F2W A; 4A63 B; 1GCQ A; 5IHK A; 1RLQ C; 1GBR A; 1W70 A; 2LJ3 A; 1RLP C; 3LH5 A; 2AK5 A; 2FPD A; 1X6G A; 2YUP A; 2EGE A; 3VS4 A; 3RNJ A; 1BBZ A; 2K7A A; 2L3P A; 4CC3 A; 1GL5 A; 2DJQ A; 4E6R A; 1M30 A; 2DA9 A; 5IHI A; 2FRW A; 2LQW A; 5IHN A; 2O88 A; 1W1F A; 4LUE A; 1MV3 A; 2HEQ A; 2YUO A; 1TUD A; 3NMZ C; 1AD5 A; 1UTI A; 2P4R A; 1VYV A; 1QLY A; 2LP5 A; 1X69 A; 3REB B; 4D8K A; 2EYY A; 1AWJ A; 2D1X A; 1QKW A; 2J6F A; 2EYZ A; 3UAT A; 4J9I A; 3KFV A; 3ULR B; 3IQL A; 1NYF A; 2DL8 A; 1AZG B; 4JJD A; 1GBQ A; 4JJB A; 1H3H A; 4AFS C; 2LNH B; 3M0T A; 2DF6 A; 2EPD A; 1M8M A; 2CUD A; 1JO8 A; 2LCS A; 1YWO A; 5IH2 A; 1UDL A; 1W6X A; 2J05 A; 1WYX A; 1HJD A; 2PNI A; 1K76 A; 4AFZ C; 2O9V A; 4ZNX A; 1QWE A; 2K79 A; 3I5S A; 2DBM A; 1E7O A; 2DLP A; 2KXC A; 2L3Q A; 4RTU A; 1E6H A; 3REA B; 2IIM A; 3EHR A; 2V1Q A; 2EKH A; 2DE0 X; 2OAW A; 3VS5 A; 1UE9 A; 2J7I A; 2EVR A; 2VVK A; 1V1C A; 5IXB A; 2A08 A; 2EGC A; 1OEB A; 4RUG A; 1QWF A; 4J9D A; 2JM8 A; 2M51 A; 1KJW A; 2RF0 A; 1PHT A; 3M0P A; 2KT1 A; 2KR3 A; 5GJV B; 2RPN A; 2J06 A; 3R6N A; 2D8H A; 1G83 A; 3UF4 A; 1KSW A; 4LE9 A; 3VS0 A; 3TSW A; 2CT4 A; 2CUB A; 2DNU A; 3EG2 A; 1AZE A; 4J9C A; 1YWP A; 1UFF A; 2JMA A; 1QCF A; 2A36 A; 2CSQ A; 2DRK A; 4JJC A; 2DM1 A; 2KGT A; 3UA7 A; 4LNP A; 1RUW A; 1HD3 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4YTL A; 1N8R U; 1M3B A; 1I1J A; 1K0X A; 2G6F X; 3J81 E; 3CMA T; 4PJO B; 4FL6 A; 2IVW A; 2JUF A; 2WSE E; 2X3W D; 4PJN A; 3EG9 B; 5FU6 C; 5KE2 A; 1SPK A; 2BZ8 A; 3QJY A; 1YBY A; 2EYQ A; 4KH1 B; 1YJW T; 9ATC B; 2DVE A; 3CCS A; 1PKT A; 1WXU A; 3PVQ A; 1WLP B; 1VQN T; 2DYB A; 4RTX A; 2ABL A; 5FWC A; 1K73 C; 4E7Z A; 2CYZ B; 1UEC A; 2DD4 A; 1I0C A; 2QQS A; 1XOV A; 2DTH A; 2L8D A; 1R0C B; 2XD0 A; 1I5O B; 3PT9 A; 2CS7 A; 1VQ7 T; 2I0N A; 1Z9Z A; 2HDA A; 1QVG S; 2X4X A; 1MMG A; 4HA8 A; 4F17 A; 2V8J A; 4UC4 A; 1ZSZ A; 1D0Y A; 1EIF A; 2K3X A; 2KK4 A; 2RK1 A; 3CC7 Q; 3OYH A; 1WIE A; 2X51 A; 2GBQ A; 2MYS A; 1Y07 A; 3OYJ A; 4BY6 C; 3LX7 A; 2OTJ A; 4JUV A; 6AT1 B; 5IT9 E; 3CCJ A; 2PZ1 A; 2P0Q A; 3LH0 A; 2LZ6 B; 1RAG B; 3G4S T; 2RJC A; 4M7A D; 1N9R A; 5GAO q; 2X9H A; 4F7U A; 5KH6 A; 3U23 A; 1VQM A; 2XHC A; 5GJW B; 4PFP A; 3C0C A; 1MMA A; 3V7S A; 4BDY A; 4M75 C; 2CZ0 B; 4OMP A; 4ZN1 A; 3CCM T; 4RTY A; 1MMD A; 1QVF S; 5DM7 R; 4IIO A; 3L2U A; 2EQU A; 3O8V A; 2E70 A; 3HPW A; 3MEW A; 1OI1 A; 1AVZ C; 3I35 A; 3HSB A; 4M77 B; 2RQW A; 1AT1 B; 1E6G A; 1UGS B; 2RQT A; 3RBB B; 5IN1 A; 4QVC A; 4JRQ A; 1M1G A; 2ED1 A; 1GFD A; 3CCU A; 4M7D E; 2QQR A; 1ZUU A; 3VUB A; 1Q82 R; 5J3B A; 4E7S A; 1M9S A; 4FCY A; 2LDM A; 1VQP A; 4VUB A; 2HKN A; 4BE2 A; 2AZV A; 3CCJ Q; 4LXC A; 4HCC A; 1NPP A; 2RJF A; 1P92 A; 4JLI A; 3EGU A; 4RTV A; 1LNX A; 3CCR T; 2YDL A; 3A8O B; 5ECA A; 3JB9 H; 4E7I A; 3OYG A; 5A0G A; 2E6Z A; 2O31 A; 2M1H A; 2YWW A; 4KGV B; 2SEM A; 1IGQ A; 4OML A; 3H0F A; 4M78 C; 4PJM A; 1OZ3 A; 4BD3 A; 2XIC A; 1Y71 A; 4KT0 E; 4GLM A; 1KHI A; 3V7R A; 1IXD A; 3VUZ A; 1VQ4 A; 3C4S A; 5M9O A; 4AG1 C; 3VS1 A; 3QG1 A; 3PMT A; 1JJ2 A; 5GAN g; 1M90 R; 1X43 A; 1SSH A; 1AHJ B; 3M9Q A; 3JB9 J; 2JMC A; 3CCV T; 2X35 A; 3CCE T; 2HBW A; 3HFO A; 3CC4 Q; 1BK2 A; 2C06 A; 2VWF A; 1Q7Y C; 2A28 A; 4BI8 B; 3VRZ A; 5DY9 A; 3HRT A; 1T3S A; 4HCK A; 1U3O A; 2P84 A; 2L2P A; 3OB9 A; 3TVT A; 4ZGE B; 1MV0 B; 3M53 A; 1IO6 A; 2HQX A; 1PCX A; 2AZS A; 1SRM A; 3QZ5 B; 4XU1 A; 1K1Z A; 1KK7 A; 2HBP A; 3D7S B; 1D3B A; 2QK0 A; 1S72 A; 4IIM A; 1OU9 A; 4PJO C; 3QO3 A; 1G8X A; 4CC2 A; 3BW1 A; 1PWT A; 2QGG A; 3X28 B; 2BTT A; 2AKL A; 3CBM A; 3QPH A; 2CP5 A; 3NTH A; 4HVU A; 3JCM V; 1ZA1 B; 3VS6 A; 5D6Y A; 1R77 A; 2RB6 A; 1IRE B; 2DEU A; 1TUG B; 3JB9 I; 3ZEH A; 1G3S A; 4XAX B; 1CSK A; 4M7D G; 3CEY A; 2PU9 B; 4BI4 A; 4A4G A; 4QW2 A; 2DXU A; 2KRS A; 2MOX A; 2QYZ A; 5GAN f; 2KXD A; 1RAA B; 2E5K A; 4O6J A; 3EFO A; 3A98 A; 2RI3 A; 1X2K A; 2DXC A; 1D1B A; 2XU8 A; 3G6E Q; 3JB9 D; 3WXM B; 2PTK A; 4JS4 A; 3MP8 A; 3CBP A; 4JDS A; 2HNI A; 1S72 Q; 1I4K 1; 1FMW A; 1Q86 C; 4C8Q C; 1ACM B; 2LJ1 A; 1M2O A; 4PJJ A; 4FT2 A; 3FEO A; 4M7A E; 1SKU B; 3TRE A; 1NLO C; 2L0A A; 2XG8 D; 2BIV A; 1K73 R; 3LGF A; 1N9S A; 2H3E B; 1VQO T; 2CP2 A; 1WPY A; 3FJP A; 3CME A; 1XJW B; 1X2Q A; 2Y4X A; 1YJ9 Q; 3EGD A; 2OTJ T; 2W0Z A; 1EFN A; 3ER0 A; 2Y90 A; 4PJO F; 1WHJ A; 1NG2 A; 5GAO r; 1KFZ A; 4GY5 A; 2MAM A; 4FYV B; 3CPW P; 3EG1 A; 1KD1 U; 2PUO B; 3QDF A; 2DL3 A; 2L3S A; 4RTW A; 1O9S A; 3F70 A; 1VQM T; 2JTE A; 1TOV A; 2F2W A; 1TU0 B; 2NUT A; 3CBO A; 1RAH B; 1QVG A; 2FPD A; 2HL5 C; 3GLX A; 3RES A; 2HSE B; 3PIP A; 1BBZ A; 2KI7 A; 3L2Z A; 2DJQ A; 3OYB A; 1KQS P; 5GAN h; 2A0F B; 5CR2 A; 3A8M B; 1VQL T; 5HKC A; 5KYU A; 1WQ7 A; 4J6X A; 1HYO A; 2YUO A; 5GAN d; 3J80 E; 3CME Q; 5C6S A; 2COW A; 4IUU A; 1VQ6 Q; 2XI9 A; 4D8K A; 2EYY A; 3G71 A; 5LJ3 g; 1FMV A; 2BE7 D; 4WTO B; 3JCM Q; 3IQL A; 2DYI A; 3S3N A; 2DIQ A; 2DL8 A; 4C8Q F; 1GBQ A; 2YHT A; 1YIJ T; 2K4Y A; 4C0F A; 1BI1 A; 2DF6 A; 1BIB A; 2CUD A; 1G3Y A; 2DZ9 A; 4IUV A; 1K8A U; 4A4F A; 3NTI A; 2COY A; 1VOM A; 5IH2 A; 1UDL A; 1M1K U; 4J6Y A; 2PNI A; 5GAO l; 4FU6 A; 1K76 A; 4RKU E; 4AFZ C; 1QWE A; 5L8R E; 3CC2 A; 3MEA A; 3I5S A; 2DBM A; 5GAN 8; 3EHR A; 2V1Q A; 2EKH A; 2OAW A; 3VS5 A; 3JCM h; 3CCL A; 4J83 A; 5IXB A; 5CQX A; 3OS2 A; 1UGP B; 4FW2 A; 1ZSZ C; 1VQK A; 2LQ8 A; 4J9D A; 2JM8 A; 4LDW A; 4HT8 A; 1DJ7 B; 2DIG A; 4M7A G; 2KR3 A; 2X4W A; 3M4Y A; 4CI0 C; 2QTX A; 3M56 A; 3R6N A; 2D8H A; 1G83 A; 4EMK A; 3WVD B; 5GMK i; 1VQ8 T; 2M16 A; 4XTX A; 4J9C A; 2CZ6 B; 1X01 A; 3H8Z A; 1X6O A; 2JMA A; 2A36 A; 5FU7 B; 2DRK A; 4JJC A; 3I55 A; 2VGN A; 4LNP A; 4PJO A; 2X3X D; 4E7K A; 2PUK B; 2K5F A; 3EG9 A; 1Q7Y R; 2DXB A; 2NYS A; 3E1S A; 3PNW C; 1Y0M A; 5LJ3 f; 3I9Q A; 4LD9 K; 2AT1 B; 1VQN Q; 5GAN e; 4J9H A; 1VQ5 Q; 1BI2 A; 4JPB W; 4NOY A; 3JCM P; 4XTW A; 1ZSG A; 4X9C A; 4PK4 A; 2CP7 A; 2Y4Y A; 2XDD A; 4LUD A; 3CPW S; 4PFO A; 2GTJ A; 1UHF A; 2DVJ A; 4ESR A; 4ZN3 A; 3LWH A; 1SSF A; 2GQV A; 1I8F A; 5IXF A; 2RH2 A; 4J9F A; 5D7U A; 2K3B A; 3M0S A; 4OGE A; 1PD0 A; 2QEX A; 2ROT A; 1Y57 A; 2QQA A; 3G4S Q; 5HK0 A; 2O4X B; 3RKY A; 2LTO A; 3X25 B; 1KQS S; 5CQY A; 3X20 B; 1UHC A; 3A8H B; 4C8Q A; 2DL5 A; 1WHG A; 3TQ7 P; 4MZM A; 1VA7 A; 2HL3 A; 3RIR A; 4M75 G; 3LGL A; 3SB2 A; 2RO0 A; 5GAN 3; 1VIE A; 1YJN A; 1MUZ A; 3P8B B; 2KYB A; 4AFU C; 3GOX A; 1KC8 U; 1PSF A; 4RMO A; 4DEY A; 2BZY A; 2QDL A; 1LCK A; 1Q86 R; 3JRZ A; 1BI0 A; 5LJ3 h; 4ATO A; 4J7F A; 4HT9 A; 4AMC A; 2V26 A; 3OQ5 A; 2AHJ B; 5LJ3 d; 3NHN A; 4JJN K; 1RI9 A; 1G3W A; 4PLI A; 1OOT A; 4CC7 A; 1CKA A; 1NYG A; 1K9M R; 2DBK A; 4C92 C; 1NZ9 A; 3EG3 A; 3CCR Q; 2XDB A; 3QXE B; 1ABQ A; 2GFA A; 4OB2 B; 1YI2 T; 1KHC A; 4LDY A; 1K0S A; 3SWN B; 1N5Z A; 4FW1 A; 2FO0 A; 1GCP A; 1U06 A; 4OB3 B; 3VS7 A; 1NJI U; 2G3R A; 4M78 G; 2IG0 A; 4HVW A; 2C0I A; 3I5R A; 1Q95 G; 2CSI A; 2VB6 A; 3C12 A; 1WHL A; 1FMK A; 1QKX A; 4X1V A; 1WNL A; 3THK A; 1UUE A; 1Y96 B; 1ZUY A; 4EMH A; 1O75 A; 1JXO A; 1H92 A; 3CCV Q; 3CCE Q; 3JB9 G; 3A1P A; 4BI3 A; 4WCI A; 3QKJ A; 2ATC B; 1PNJ A; 1RI0 A; 2RM4 A; 2GGR A; 3P8H A; 2NUP B; 1J3T A; 5KYX B; 5GAO p; 1YP5 A; 2R58 A; 4LDV A; 1PD1 A; 1YIT Q; 1H3Z A; 1I81 A; 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